Orientador: Marileda Bonafim Carvalho / Banca: Alceu Afonso Jordão Júnior / Banca: Thiago Demarchi Munhoz / Banca: Márcia Mery Kogika / Banca: Mirela Tinucci Costa / Resumo: A doença renal crônica (DRC) apresenta caráter progressivo e irreversível e muitos dos fatores envolvidos na sua progressão, comprometem primariamente os túbulos renais. Com finalidade de detectar precocemente as lesões tubulares, novos biomarcadores têm sido pesquisados. Dentre estes, destaca-se a Lipocalina Associada à Gelatinase de Neutrófilos (NGAL). Este estudo teve por objetivo avaliar a excreção urinária de NGAL com o propósito de identificar a ocorrência de lesão tubular ativa (LTA) em cães com DRC naturalmente adquirida. Foram estudados 87 cães adultos, sem distinção de gênero ou de raça (15 sadios, 18 em risco de desenvolver DRC e 54 com DRC nos estádios 1, 2, 3 e 4 - IRIS staging of CKD - 2015), atendidos no Hospital Veterinário - Unesp - campus de Jaboticabal. Foram avaliados biomarcadores tradicionais e as concentrações de NGAL urinária (uNGAL) e sérica (sNGAL). Os resultados de uNGAL foram ajustados pelos respectivos fatores de concentração urinária (uNGAL.FCU). Os resultados foram inicialmente analisados considerando os seis grupos e posteriormente para comparação entre os 15 sadios, os 41 DRC e os 13 DRC com uNGAL.FCU sugestivo de LTA (LTADRC). Os resultados indicaram que a uNGAL ajustada (uNGAL.FCU), pode servir como indicador de agravamento das lesões renais precocemente em relação à concentração sérica de creatinina, que é o mais utilizado dentre os biomarcadores tradicionais. Quanto à sNGAL, houve aumento gradativo relacionado à progressão da DRC em oposiç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Chronic kidney disease (CKD) is a progressive and irreversible condition, and many of the factors involved in its progression, primarily compromise the renal tubules. To detect tubular injury, new early biomarkers have been investigated. Among them, Neutrophil Gelatinase-associated Lipocalin (NGAL) stands out. The aim of this study was to evaluate the urinary excretion of NGAL, to identify the occurrence of active tubular injury (ATI) in dogs with naturally acquired CKD. A total of 87 adult dogs, regardless of gender or breed (15 healthy, 18 at risk of developing CKD and 54 with CKD stages 1, 2, 3 or 4 - IRIS staging of CKD - 2015), were studied at the Veterinary Hospital - Unesp - Jaboticabal campus. Traditional biomarkers and NGAL concentrations in urine (uNGAL) and serum (sNGAL) were evaluated. The results of uNGAL were adjusted by the respective urinary concentration factors (uNGAL.UCF). The results were initially analyzed considering the six groups, and later for comparison between the 15 healthy, 41 DRC and 13 DRC with uNGAL.UCF suggestive of ATI (ATICKD). The results indicated that adjusted uNGAL (uNGAL.UCF) may serve as an indicator of aggravation of renal damage early in relation to serum creatinine concentration, which is the most used among the traditional biomarkers. Regarding sNGAL, there was a gradual increase related to the progression of CKD, in opposition to uNGAL.UCF, which decreased. Thus, sNGAL appears to be more relevant as an indicator of the extrarenal complications associated with severe chronic uremia. Patients with increased uNGAL.UCF (ATICKD group), compared to CKD group (non-significant changes in uNGAL.UCF), are notable for the higher occurrence of severe proteinuria and hypertension, without significant increases in other indicators or biomarkers of CKD. These findings reinforce the importance of pro... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Maria José Soares Mendes Giannini / Coorientador: Francisco Javier Enguita / Banca: Daniel de Assis Santos / Banca: Nádia Rezende Barbosa Raposo / Banca: Cláudia Viana Maurer Morelli / Banca: Valéria Valente / Resumo: A paracoccidioidomicose (PCM) é uma micose sistêmica causada por fungos do gênero Paracoccidioides e endêmica na América Latina. Três aspectos são de grande importância nessa doença: o desenvolvimento de antifúngicos e modelos alternativos para estudo dos mesmos e a busca de biomarcadores para o diagnóstico. O número de antifúngicos disponíveis é restrito, e problemas como efeitos adversos, interações medicamentosas e a ocorrência de isolados fúngicos resistentes são descritos. Neste contexto, a busca por novos compostos tem aumentado. Adicionalmente, modelos animais alternativos como Caenorhabditis elegans, zebrafish (Danio rerio) e Galleria mellonella são utilizados para o estudo de novos fármacos de forma simples e em grande escala. Neste trabalho, utilizou-se desses modelos para avaliação da eficácia antifúngica e toxicidade do ácido gálico e seus derivados ésteres de alquila (galatos). O composto com melhor atividade nesses modelos foi testado em camundongos. O galato de dodecila apresentou melhor eficácia e menor toxicidade no modelo C. elegans - C. albicans e menor efeito tóxico em embriões de zebrafish. Entretanto, em G. mellonella e camundongos infectados com Paracoccidioides, o composto não apresentou eficácia antifúngica, o que pode ser decorrente de sua baixa biodisponibilidade. Para resolver tal problema, os galatos foram associados a um sistema lipídico nanoestruturado. Tal associação foi benéfica, resultando em menor toxicidade em fibroblastos pulmonares e em z... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Paracoccidioidomycosis (PCM) is a systemic mycosis caused by the fungi of the genus Paracoccidioides, which is endemic in Latin America. Three aspects are of great importance in this disease: the development of new antifungals and the use of alternative models for their study and also, the search of biomarkers for diagnosis. The number of antifungal agents available is restricted, and problems such as adverse effects, drug interactions and the development of resistance are related to them. In this context, the search for new compounds has increased. In addition, alternative animal models such as Caenorhabditis elegans, zebrafish (Danio rerio) and Galleria mellonella have been used for the study of new drugs in a simple and large scale manner. In this work, these models were used to evaluate the antifungal efficacy and toxicity of gallic acid and its alkyl esters derivatives (gallates). The compound with the best activity in these models was tested in mice. Dodecyl gallate presented better efficacy and lower toxicity in the C. elegans - C. albicans model and lower toxic effect in zebrafish embryos. However, in G. mellonella and in mice infected with Paracoccidioides sp., the compound showed no antifungal efficacy, which may be explained due to its low bioavailability. To resolve such a problem, gallates were associated with a nanostructured lipid system. Such association was beneficial, resulting in lower toxicity in lung fibroblasts and zebrafish, as well as in greater efficacy in the murine model. Another aspect of this study concerns the investigation of microRNAs for PCM. MicroRNAs are small non-coding RNAs that perform functions in biological processes and diseases. Thus, with the aid of RT-qPCR, eight microRNAs were differentially expressed in the serum of patients with chronic PCM. In the lung cells, distinct microRNAs were observed according to... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2016-07-01T13:10:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-06. Added 1 bitstream(s) on 2016-07-01T13:13:40Z : No. of bitstreams: 1 000865889_20171231.pdf: 749599 bytes, checksum: 81531bb77bdb0eed1fd80de96c4e0a0c (MD5) Bitstreams deleted on 2018-01-02T17:04:38Z: 000865889_20171231.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-01-02T17:05:43Z : No. of bitstreams: 1 000865889.pdf: 1473615 bytes, checksum: 9a69428cca0ee06125bf3ea1f0609bd1 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The purpose of this study was to investigate hypoxia and oxidative stress markers in the blood and liver of diabetic rats and their offspring. Mild diabetes (D) was induced in the newborn rats using streptozotocin-STZ. Non-diabetic newborns (control-C) received the buffer. The newborn were distributed randomly into groups according to their euthanasia (5, 15, 30, 60, or 90 days of life). Female rats (C and D groups) were weighed and lethally anesthetized to obtain blood samples for measurement glucose and insulin levels, and evaluate oxidative stress markers (SOD, catalase, MDA, GSH-Px, and thiol groups) in washed erythrocytes and in the liver. A group of C and D adult rats were mated, and at term pregnancy washed erythrocytes and liver were sampled from the dams and their fetuses to evaluate the same markers before pregnancy. Another group of dams was also assembled to obtain offspring (Days 5 and Day 15 of life) to study same markers. The HIF-1α and PGC-1 gene and protein expression was analyzed in all experimental groups. There was higher glycemia on Days 5, 30, 90 in the life and pregnancy and lower insulin levels on Day 15, 60 and 90 of the diabetic dams. The 5 days old-diabetic rats presented increased SOD, GSH-Px and thiol in washed erythrocytes, and increased MDA concentration in the liver, while at term pregnant animals showed higher MDA concentration, and decreased SOD and catalase activities. The 15 days old offspring from diabetic dams presented higher insulin levels and antioxidant enzymes. These results suggest that glycemic alterations at different moments in the life of rats stimulate an antioxidant defense system in these rats and in their offspring in the first days of life / FAPESP: 11/16241-1

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:55Z : No. of bitstreams: 1 000865111.pdf: 1312003 bytes, checksum: 38fab956c6701f8def4faf35f56489ff (MD5) / Justificativa e Objetivo: a lesão renal aguda(LRA) determina um aumento na morbidade e na mortalidade de pacientes hospitalizados. O diagnóstico precoce e a realização de medidas de proteção renal são essenciais. Foi observado que o pantoprazol possui efeito similar ao précondicionamento isquêmico em corações de ratos, promovendo efeito protetor. O objetivo deste experimento foi analisar o emprego do pantoprazol na proteção de rins submetidos à lesão de isquemia e reperfusão em ratos sob anestesia geral inalatória com isoflurano. Método: quarenta ratos, Wistar, machos, foram distribuídos aleatoriamente em quatro grupos: PIR (pantoprazol + isquemia artéria renal esquerda), P (pantoprazol), IR (isquemia renal esquerda) e Sham. O tempo de isquemia renal foi de 20 minutos e o de reperfusão, 30 minutos. Anestesia inalatória com isoflurano foi a técnica anestésica realizada. A dose administrada de pantoprazol foi de 192 mcg/kg. Todos os animais foram submetidos à nefrectomia direita e ao final do experimento procedeu-se nefrectomia esquerda, para posterior avaliação histológica e classificação por meio de escala de necrose tubular. Os atributos estudados foram: pressão arterial média (PAM), temperatura retal, os critérios de RIFLE e AKIN, dosagem urinária dos biomarcadores NGAL, KIM-1 e IL-8 e avaliação histológica. A creatinina sérica foi coletada em três momentos: M1, após monitorização; M2, após a reperfusão; e M3, 24 horas após o inicio do experimento. As coletas de urina para dosagem dos biomarcadores ocorreram antes (Urina 1) e após o experimento (Urina 2). Os atributos foram submetidos à análise estatística e as diferenças foram consideradas estatisticamente significativas quando p<0,05. Resultados: diferenças estatisticamente significativas foram observadas entre os grupos com aplicação dos critérios de RIFLE (p=0,007) e AKIN (p-0,003). Os grupos PIR e IR evoluíram com maior incidência de... / Background and Objective: acute kidney injury (AKI) determines an increase in morbidity and mortality of hospitalized patients. Early diagnosis and the realization of renal protection measures are essential. It was observed that pantoprazole has effect similar to ischemic preconditioning in rat hearts, promoting protective effect. The objective was to analyze the use of pantoprazole in protecting kidneys subjected to ischemia and reperfusion in rats under inhalation anesthesia with isoflurane. Method: forty rats, Wistar male rats, were randomly divided into four groups: RIP (pantoprazole + left renal ischemia), P (pantoprazole), IR (left renal ischemia) and Sham. Renal ischemia time was 20 minutes and reperfusion 30 minutes. The anesthetic technique performed: inhalation anesthesia with isoflurane. The pantoprazole dose was 192 mcg/kg. All animals underwent right nephrectomy and at the end of the experiment proceeded to left nephrectomy for subsequent histological evaluation and classification through tubular necrosis scale. The parameters were: mean arterial pressure (MAP), rectal temperature, the criteria of RIFLE and AKIN, urinary dosage of biomarkers NGAL, KIM-1 and IL-8 and histological evaluation. Serum creatinine was collected in three moments: M1, after monitoring, M2, and M3 after reperfusion, 24 hours after the beginning of the experiment. The urine samples to test for biomarkers occurred before (Urine 1) and after the experiment (Urine 2). The attributes were subjected to statistical analysis and differences were considered statistically significant when p <0,05. Results: significant differences were observed between the groups with application of RIFLE criteria (p=0.007) and AKIN (p=0.003). The PIR and IR groups evolved with higher incidence of AKI. The NGAL and KIM-1 biomarkers increased in all groups throughout the experiment, but with higher values in the PIR and IR groups. IL-18 revealed no group effect (p=0.38) nor the ...

Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:59Z : No. of bitstreams: 1 000865026_20170630.pdf: 273101 bytes, checksum: e5a5a5667f507250348f9f5e033e3592 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-06-30T13:45:02Z: 000865026_20170630.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-06-30T13:45:54Z : No. of bitstreams: 1 000865026.pdf: 3966043 bytes, checksum: 80e8fb03cce4c8b7011fe2af3b66663a (MD5) Bitstreams deleted on 2017-08-24T16:16:59Z: 000865026.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-08-24T16:17:47Z : No. of bitstreams: 1 000865026.pdf: 3966043 bytes, checksum: 80e8fb03cce4c8b7011fe2af3b66663a (MD5) / O presente estudo teve o objetivo de avaliar os efeitos toxicológicos em ratos Wistar expostos ao fipronil no período perinatal. Os animais utilizados foram adquiridos do Biotério Central da UNESP, campus de Botucatu e os testes foram realizados em seus descendentes. Foi avaliado o desenvolvimento físico e sensório-motor e aplicados testes de comportamento, como a Arena de Campo aberto, para avaliar atividade geral; o Labirinto em Cruz Elevado, para avaliação do comportamento de ansiedade; o Hole-Board, para coordenação motora; os testes Reconhecimento de Novo Objeto e Labirinto Octogonal, para avaliar memória cognitiva e espacial, respectivamente; e o teste de agressividade, de acordo com o paradigma do animal residente/intruso. Por espectrofotometria, foram dosados os níveis de Acetilcolinesterase, de Cortisol, de Alanina Aminotransferase e de Aspartato Aminotransferase, e quantificado, através de análise cromatográfica, o fipronil e seus metabólitos nos cérebros dos ratos. Fragmentos dos órgãos cérebro e fígado foram coletados e avaliados por técnica de histopatologia. De acordo com os resultados obtidos, o fipronil alterou o desenvolvimento físico, aumentou a ansiedade e agressividade, prejudicou a memória e a coordenação motora, induziu aumento na atividade da enzima acetilcolinesterase, causou alterações histopatológicas no cérebro e fígado dos animais. O fipronil é considerado tóxico para o sistema nevoso central e fígado de ratos, jovens e adultos, expostos ao praguicida no período perinatal / This study aimed to evaluate the toxicological effects in rats Wistar exposed to fipronil in the perinatal period. The animals used were acquired from the Biotério Central of UNESP, Botucatu and the tests were performed on their offspring. Were evaluated the physical and sensory-motor development and applied behavioral tests, such as the Open Field test, to assess general activity; the Plus Maze Elevated to assess the anxiety behavior; Hole-Board for motor coordination; tests Recognition New Object and Octagonal Labyrinth, to assess cognitive and spatial memory, respectively; and Aggressivity test, according to the resident/intruder animal paradigm. Were measured levels of Acetylcholinesterase, Cortisol, Alanine aminotransferase and Aspartate aminotransferase by spectrophotometry, and quantified fipronil and metabolites in the brains of rats, by chromatographic analysis. Fragments of organs as brain and liver were collected and evaluated by histopathology technique. According to the results, fipronil alter the physical development, increased anxiety and aggression, impaired memory and motor coordination, induced increase in the Acetylcholinesterase activity, caused histological changes in the brain and liver of these animals. Fipronil is considered toxic to the central nervous system and liver of rats, young and adults, exposed to pesticide in the perinatal period

Made available in DSpace on 2016-09-27T13:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-21. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:13Z : No. of bitstreams: 1 000869206.pdf: 1021410 bytes, checksum: f183acbdffb2ad0ddb24e51f8eabd122 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Tubarões e raias estão atualmente entre os vertebrados mais ameaçados de extinção. Tal fato se deve principalmente à exploração pesqueira que permanece sem medidas eficientes de controle em quase todo o planeta, inclusive no Brasil. Considerando-se que cada espécie responde de forma independente às pressões ambientais e principalmente às ações humanas, é de fundamental importância para o desenvolvimento de planos de manejo adequado das suas populações e o ordenamento da exploração sustentável destes recursos que se proceda à caracterização da biodiversidade local, a avaliação das espécies mais capturadas e identificação dos táxons e populações mais suscetíveis à pesca. Contudo, especialmente para os elasmobrânquios, tais parâmetros são de difícil acesso, sobretudo devido às similaridades morfológicas entre as espécies e ainda, devido à prática pesqueira de remoção de partes dos animais como a cabeça e nadadeiras antes dos desembarques, inviabilizando a identificação da maioria das espécies. Segundo os registros de captura de elasmobrânquios elaborados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas cerca de 20% dos indivíduos recebem alguma menção quanto à espécie, muitas vezes um nome popular que pode estar relacionado a mais de uma espécie biológica em diversos casos, sendo o restante do produto classificado apenas como cações. A utilização de ferramentas moleculares nos estudos da composição da biodiversidade tem proporcionado sua aplicação em diversas áreas, incluindo na identificação das espécies, no estudo de suas relações evolutivas e no auxílio de programas para a sua conservação. A identificação molecular com a utilização de técnicas do tipo PCR-multiplex e sequências barcode, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento das espécies, possibilitando a identificação... / Sharks and rays are currently among the most threatened vertebrate to extinction. This is due mainly to the fact that overfishing remains without effective control measures in almost the entire planet, including Brazil. Considering that each species responds independently to environmental pressures, and mainly to human actions, it is of fundamental importance for the development of appropriate management plans and programming the sustainable exploitation of these resources, to proceed to the characterization of local biodiversity, in the assessment of the species caught, in the correct identification of taxa and the most susceptible populations to fishing activities. However, especially for elasmobranches, such parameters are difficult to access, especially due to morphological similarities between species and also because of the fishing practice of removing parts such as the head and fins before landings, making it impossible to identify the most species. According elasmobranches capture records prepared by IBAMA in recent years, only about 20% of individuals receiving some identification indication, often only a popular name that can be related to more than one biological species, with the remainder fishing product classified just as sharks. The use of molecular tools in studies of the composition of biodiversity has provided its application in various areas, including in the identification of the species, in the study of their evolutionary relationships, and in assisting programs for their conservation. The use of molecular identification techniques as the PCR-multiplex type, and barcode sequences using part of the mitochondrial gene sequence Cytochrome Oxidase subunit I that permit to identify particular genetic characteristics of each taxon, are currently being used in the species recognition allowing simultaneous identification of different samples. In the present work, the objective of the study was to identify the species occurring...

Diversas alterações de expressão proteica decorrentes do desenvolvimento canceroso cervical e dependentes do papilomavírus humano (HPV) vêm sendo apontadas na literatura, dentre elas destacam-se proteínas diretamente influenciadas pela ação de oncoproteínas do HPV, como: transglutaminase 2 (TG2) e p53 e proteínas com expressão modificada relacionada a alterações de controle de ciclo celular, como: p16INK4a, ki-67 e bcl-2. Neste estudo, objetivou-se analisar níveis expressionais de TG2, p16INK4a, p53, Ki-67 e bcl-2 em amostras de lesões escamosas intraepiteliais de baixo (LEIBG) e alto grau (LEIAG), precursoras do carcinoma escamoso de colo uterino e relacionar esta expressão a diferentes tipos virais do HPV. Foram utilizadas amostras histológicas obtidas por biópsia dirigida do colo uterino de pacientes, previamente confirmadas quanto à presença do HPV-DNA por reação em cadeia da polimerase (PCR) e tipagem viral. A quantificação da expressão ocorreu por meio da técnica de imunohistoquímica. Observou-se em LEIBG a elevada expressão de TG2 (p<0.05) e diminuída expressão de p16INK4a (p<0.05) enquanto que em LEIAG, esta proporção inverteu-se (Pearson value = -0.269). A expressão de p53 demonstrou-se variável em relação aos graus de lesão. As expressões de Ki-67 e bcl-2 variaram conforme os níveis teciduais das biópsias coletadas. A proteína p16INK4a apresentou sua expressão associada a HPV considerados de alto risco oncogênico (p<0.001), TG2 teve sua expressão associada ao HPV tipo 11 (p<0.05). Não foram evidenciadas associações significantes entre a expressão de p53, Ki-67 e bcl-2 e os tipos virais. Conclui-se que a expressão dos marcadores estudados foi influenciada pelo processo canceroso no colo uterino e pela infecção do HPV. / Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2016-12-01T15:25:28Z No. of bitstreams: 1 Tese Karen Olivia Bazzo.pdf: 1961310 bytes, checksum: 63b5807c5c5cf317075c1e19cf0f168c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-01T15:25:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Karen Olivia Bazzo.pdf: 1961310 bytes, checksum: 63b5807c5c5cf317075c1e19cf0f168c (MD5) Previous issue date: 2016-12-01 / Universidade de Caxias do Sul, UCS. / Changes in protein expression resulting from cervical cancer development and dependent on human papillomavirus (HPV) have been indicated in the literature, among them there are proteins directly influenced by HPV oncoproteins, such as transglutaminase 2 (TG2), p53; and proteins with modified expression related to cell cycle control changes, such as p16 INK4a a, ki-67 and bcl-2. This study aimed to analyze expressionais levels of TG2, p16INK4a, p53, ki-67 and bcl-2 in High-grade (HSIL) and low-grade (LSIL) squamous intraepithelial lesion and relate this expression to different viral types of HPV. Tissue samples obtained by biopsy were used directed cervical patients, previously genotyped HPV-DNA. Expression quantification were performed by immunohistochemical technique. It was observed in LSIL the overexpression of TG2 (p<0.05) and decreased expression of p16INK4a (p<0.05) although in HSIL, the proportion was reversed (Pearson value = -0.269). P53 expression was variable in relation to the degree of injury. The expression of ki-67 and bcl-2 levels varied depending beyond the basal layer. p16INK4a presented its expression associated with high-risk types of HPV (p<0.001) and TG2 expression was associated with HPV 11 (p<0.05). No significant associations were found between the viral types and the ki-67, p53 and bcl-2 expression. In conclusion, the expression of the marker is affected by cancerous process and by HPV infection, and expression analysis of these markers may reveal new biomarkers associated with cervical cancer process.

Orientador: Cláudia Apaecida Rainho / Banca: Wellerson Rodrigo Scarano / Banca: Erika Cristina Pavarino / Banca: Adriana Camargo Ferrasi / Banca: Sandro José Conde / Resumo: A endometriose é uma doença crônica multifatorial, inflamatória, estrógeno-dependente, que afeta entre 8 a 10% das mulheres em idade reprodutiva e caracterizada por tecido similar ao endométrio (glândula e estroma) fora da cavidade uterina. Embora a sua etiologia seja pouco conhecida, evidências recentes indicam que alterações epigenéticas estão envolvidas na sua patofisiologia. Esta hipótese é apoiada pelos achados envolvendo padrões alterados de metilação do DNA em genes específicos, bem como pelos níveis alterados de expressão de componentes da maquinaria epigenética nas lesões endometrióticas, quando comparadas ao endométrio eutópico da mesma paciente ou ao endométrio de mulheres que não apresentam a doença. Assim, um melhor entendimento do papel dos mecanismos epigenéticos na patogênese e progressão da endometriose tem se tornado necessário, podendo contribuir para a identificação de marcadores diagnósticos e para o delineamento de novas abordagens terapêuticas, que trariam benefícios e melhor qualidade de vida para as mulheres que apresentam esta condição. Neste contexto, este estudo buscou a identificação de genes diferencialmente metilados candidatos a biomarcadores na endometriose. Os resultados obtidos foram organizados em dois artigos científicos. O primeiro artigo teve como objetivo investigar o perfil diferencial de metilação do DNA na endometriose intestinal em comparação com amostras pareadas de endométrio eutópico da mesma paciente. Para isso, foi empregada uma abordagem em larga escala baseada em microarranjos contendo 27.800 ilhas CpG, que resultou na identificação de 546 genes hipermetilados e 871 genes hipometilados. A análise in silico para a classificação funcional dos genes diferencialmente metilados permitiu identificar conjuntos de genes com funções de fatores de transcrição, remodeladores da cromatina entre outras classes funcionais. Após a realização de uma ... / Abstract: The endometriosis is a multi-factorial and chronic disease affecting 5% to 10% of women in reproductive age characterized by endometrium-like tissue (gland and stromma) outside uterine cavity. Although its etiology is poorly understood, recent evidences have indicated that epigenetic alterations are implicated in the pathophysiology. This hypothesis has been supported by findings surrounding altered DNA methylation pattern of specific genes, as well as by altered levels of expression of epigenetic machinery components in endometriotic lesions compared to eutopic endometrium from the same patient or endometrium of women free of disease. Thus, a better understanding of the role of epigenetic mechanisms in the pathogenesis and progression of endometriosis has become necessary and may contribute to the identification of diagnostic markers and for designing new therapeutic approaches that could benefit and improve the quality of life of women with this condition. In this context, this study aimed to identify differentially methylated genes as candidate biomarkers in endometriosis. The results could be organized in two papers. The first study aimed to investigate the profile of differential DNA methylation in intestinal endometriosis compared to eutopic endometrium of paired samples from the same patient. For this, we carried out a large-scale approach based on microarray containing 27,800 CpG islands, resulting in the identification of 546 genes as hypermethylated and 871 genes as hipomethylated. In silico analysis for the functional classification of differentially methylated genes enabled us to identify sets of genes with functions of transcription factors, chromatin remodeling, besides other functional classes. After conducting a comparative assessment with data available in other large-scale studies of literature, it was possible to recognize recurrent alteratons evolving 227 hypermethylated and 322 hypomethylated ... / Doutor

Orientador: Thais Borges Cesar / Banca: Vivian Marques Miguel Suen / Banca: Ellen Cristini de Freitas / Resumo: Objetivo: verificar se a combinação de uma dieta baixa em calorias e o consumo de suco de laranja podem contribuir para a perda de peso e modificar positivamente os biomarcadores metabólicos nos indivíduos obesos. Métodos: 78 indivíduos obesos, com idade entre 36 ± 1 anos, e IMC de 33 ± 3 kg foram divididos aleatoriamente em dois grupos paralelos: (1) suco de laranja (n = 39), composto por indivíduos submetidos a uma dieta baixa em calorias concomitante a ingestão diária de 500 ml de suco de laranja; (2) controle (n=39) composto por indivíduos submetidos a uma dieta baixa em calorias. A avaliação da composição corporal, dos biomarcadores metabólicos e do consumo alimentar foram analisados ao longo de 12 semanas de intervenção. Resultados: Ambas as intervenções mostraram redução similar no peso corporal (6,5 kg; p = 0,363), IMC (2,5 kg / m2; p = 0,336), massa livre de gordura (1 kg; p = 0,296), massa gorda (5 kg; p = 0,580),percentual de gordura corporal (3%; p = 0,154), relação cintura / quadril (0,1%; p = 0,786), glicose (5 mg/dL; p = 0,525), não HDL-C ( 26,5 mg/dL; p =0,326), triglicerídeos (30 mg/dL; p = 0,740), fosfatase alcalina (5 UL; p = 0,989), AST (2,0 UL; p = 0,690), ALT (1,0 UL; p = 0,969) e GT (2,5 UL; p = 0,302). Entretanto, indivíduos do grupo suco de laranja tiveram maior diminuição nos níveis de insulina em 18% (p = 0,050), HOMA-IR de 33% (p = 0,042), colesterol total de 6% (P = 0,004), LDL-C em 24% (p = <0,001), e de PCR-US em 33% (p = 0,001) em compara... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Objective: To determine whether the combination of a low calorie diet and orange juice consumption can contribute to weight loss and modify positively the metabolic biomarkers in obese individuals. Methods: 78 obese subjects aged 36 ± 1 years and BMI of 33 ± 3 kg were randomly divided into two parallel groups: (1) orange juice (n = 39), composed of individuals subjected to a diet low caloric diet and plus intake of 500 ml orange juice; (2) control (n = 39) composed of individuals subjected to a diet low in calories. The assessment of body composition, metabolic biomarkers and food intake were analyzed over a 12-week intervention. Results: Both interventions showed similar reduction in body weight (6.5 kg; p = 0.363), BMI (2.5 kg / m2, p = 0.336), fat-free mass (1 kg; p = 0.296), mass fat (5 kg; p = 0.580), body fat percentage (3%; p = 0.154), waist / hip ratio (0.1%; p = 0.786), glucose (5 mg / dL, p = 0.525) non-HDL-C (26.5 mg / dl; p = 0.326), triglycerides (30 mg / dl; p = 0.740), alkaline phosphatase (5 UL, p = 0.989), AST (UL 2.0, p = 0.690 ), ALT (UL 1.0; p = 0.969) and GT (UL 2.5; p = 0.302). However, individuals orange juice group had greater reduced in insulin levels by 18% (p = 0.050), HOMA-IR 33% (p = 0.042), total cholesterol 6% (P = 0.004), LDL-C by 24% (p = <0.001), and hsCRP by 33% (p = 0.001) compared to control subjects. The consumption of energy and nutrients was similar in both interventions, except for vitamin C and folic acid increased by 62% (p = <0.015... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Antonio de Goes / Coorientador: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos / Coorientador: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Banca: Marcel Bellato Spósito / Banca: Vitor Fernandes Oliveira de Miranda / Banca: Janete Apparecida Desiderio / Banca: Sérgio Florentino Pascholati / Resumo: A Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Phyllosticta citricarpa, encontra-se espalhada pelos continentes do mundo. Seus sintomas ocasionam a depreciação dos frutos e a queda prematura daqueles severamente infectados. Dada a importância econômica desta doença, realizamos a análise da estrutura genética de duas coleções de isolados de P. citricarpa, obtidas de uma única propriedade citrícola, em um intervalo de sete anos. Os frutos foram coletados de laranjeiras 'Pera 'e 'Valência' nos anos de 2005 e 2012. Os isolados obtidos foram identificados mediante a análise de sequências da região ITS e genes GPDH e TEF1. Assim, 80 isolados da coleção de 2005 e 115 de 2012 foram identificados como P. citricarpa. Apenas seis isolados de Phyllosticta capitalensis foram encontrados em meio aos de 2012. Maior quantidade de sequências com variações genéticas foram identificadas nos isolados obtidos na última amostragem de frutos, principalmente nas populações oriundas de 'Valência'. A diferenciação genética entre as populações de P. citricarpa de laranjeiras 'Valência', de 2005 e 2012, foi evidenciada mediante o emprego de marcadores AFLP, sendo o genótipo predominante em 2012 aquele identificado nas populações de 'Pera', de ambos os períodos. Pela análise da relação genética entre os isolados, presumiu-se que indivíduos cujo genótipo tenha sido favorecido apareceram primeiramente entre as populações de P. citricarpa que abrigavam as plantas de 'Pera', e posteriormente, migraram para os pomares de 'Valência'. Esta uniformização populacional ao longo dos sete anos e o baixo polimorfismo notado entre os isolados ao longo de gerações são indicativos de baixa recombinação genética entre os indivíduos. Sequências das bandas polimórficas entre os isolados de 'Valência' de 2005 e 2012 apresentaram similaridade com aquelas de proteínas da família de ABC transporters ... / Abstract: Citrus Black Spot (CBS), caused by the fungus Phyllosticta citricarpa, is spread over continents in the world. Its symptoms cause fruit depreciation and those severely infected fall prematurely. Given the economic importance of this disease, we carried out analysis of the genetic structure of two P. citricarpa isolates collections, obtained from a single citrus farm in a seven years interval. Fruits were collected from Pera and Valencia orange varieties in 2005 and 2012. The isolates obtained were identified by sequences analysis of ITS region and GPDH and TEF1 genes. Thus, 80 and 115 isolates of the 2005 and 2012 collections, respectively, were identified as P. citricarpa. Among the 2012 collection only six Phyllosticta capitalensis isolates were found. Higher amount of sequences containing genetic variations were identified in the isolates from the last fruits sampling, especially in populations derived from Valencia oranges. By applying AFLP markers it was evidenced genetic differentiation among P. citricarpa populations from Valencia oranges obtained between 2005 and 2012, whose predominant genotype in 2012 was that found in Pera populations from both periods. Through analysis of genetic relationship among isolates, it was assumed that individuals with favored genotypes have first appeared among P. citricarpa populations of Pera plants, and further migrated to Valencia orchards. Genetic populations uniformity over the seven years and low polymorphism observed among them, over generations, are indicative of low genetic recombination between individuals. Sequences of polymorphic bands between isolates of 2005 and 2012 Valencia collections presented similarity with those of ABC transporters Family proteins, which act as efflux pumps of cytotoxic compounds, as fungicides, and to NADH dehydrogenase proteins. Such gene modifications might be responsible for variability of sensibility responses of the isolates to strobilurins, which ... / Doutor