Spelling suggestions: "subject:"math"" "subject:"mata""
241 |
Ungdomars tankar kring vegetariska livsmedel : Fokusgruppsintervjuer med elever i årskurs 9 / Youth thoughts on vegetarian food : Focus group interviews with 9th-grade studentsGustavsson, Mikaela, Sandberg Sörlin, Amanda January 2021 (has links)
Bakgrund: Tidigt i livet socialiseras barn in i tankar och normer kring mat och måltider och dess betydelse för hälsan, dessa följer med dem under hela livet. Köttproduktionen i Sverige har negativ påverkan på miljön och vår köttkonsumtion har ökat med 40% sedan 90-talet. En samhällsomställning måste ske där fler börjar äta vegetarisk mat. Lärare, föräldrar och samhället i övrigt har ett gemensamt ansvar för att undervisa och inspirera barn och unga till att testa vegetarisk mat. Syfte: Syftet med studien var att undersöka hur ungdomar resonerar kring vegetarisk mat. Vi utgick från frågeställningarna: Hur resonerar ungdomar kring vegetarisk mat där köttet ersatts med ersättningsprodukter till kött, vad är avgörande för ungdomar när det kommer till att testa nya livsmedel samt vad påverkar ungdomars syn på vegetarisk mat? Metod: Studien genomfördes med hjälp av en kvalitativ intervjustudie baserad på fokusgruppsinterjuver med ungdomar som gick i årskurs 9 vid två skolor i Mellansverige. Totalt intervjuades 21 respondenter fördelade på sju grupper. Intervjuerna spelades in för att sedan transkriberas och analyserades genom en innehållsanalys. Resultat: Analysen av den insamlade datan resulterade i fyra huvudkategorier: Om ungdomar vill testa ny mat avgörs av flera olika faktorer, Ungdomars inställning till vegetarisk mat, Ungdomars erfarenheter kring vegetarisk mat förvärvas till största del i skolan eller hemmet samt Ungdomars åsikter kring vegetarisk mat varierar. Ungdomars inställning till ny mat avgjordes av olika faktorer så som matens uppläggning, smak och utseende. Även influensers, kompisar och närståendes inställning till vegetarisk mat kunde till viss del påverka ungdomarna. Ungdomars åsikter kring vegetarisk mat varierade. Slutsats: Studiens resultat tyder på att ungdomar som ska äta vegetarisk mat föredrar den vegetariska maten som består av grönsaker framför den vegetariska maten som består av ersättningsprodukter till kött. Ungdomarna i studien upplever det svårt att testa nya livsmedel och maträtter eftersom de är ovana och osäkra på hur det kommer att smaka. Studien visar att personer i ungdomars omgivning samt egen inre motivation är avgörande för att ungdomar ska testa ny mat. En slutsats man skulle kunna dra av studien är att hem och skola tillsammans spelar en viktig roll för att öka konsumtionen av vegetarisk mat. / Background: Early in life, children are socialized into thoughts and norms about food and meals and their significance for health, which stay with them throughout their lives. Meat production in Sweden has a negative impact on the environment, and our meat consumption has increased by 40% since the 1990s. A societal change must occur where more people start eating vegetarian food. Teachers, parents, and society have a shared responsibility to educate and inspire children and young people to try vegetarian food. Objective: The aim of the study was to investigate how youths' reason around vegetarian food. We started from the research questions: How do youths' reason around vegetarian food where the meat has been replaced with substitute products for meat, what is crucial for youths when it comes to testing new foods and dishes and also what influences youths’ views on vegetarian food? Method(s): The study was conducted with the help of a qualitative interview study based on focus groups interviews with youths in year 9 at two schools in the middle of Sweden. In total 21 participants were interviewed divided into seven groups. Interviews were recorded to be transcribed and analyzed with content analysis. Results The analysis of the collected data resulted in four main categories: Factors influencing adolescents' willingness to try new food, Adolescents' attitudes towards vegetarian food, Adolescents' acquisition of experiences with vegetarian food primarily in school or at home, and Variations in adolescents' opinions about vegetarian food. Adolescents' attitudes towards trying new food were determined by various factors such as the presentation, taste, and appearance of the food. The attitudes of influencers, friends, and family members towards vegetarian food could also partially influence adolescents. Adolescents' opinions about vegetarian food varied. Conclusion: The results of the study suggest that adolescents who are supposed to eat vegetarian food prefer the vegetarian food consisting of vegetables over the vegetarian food made with meat substitutes. The adolescents in the study find it difficult to try new food and dishes because they are unfamiliar with them and unsure of how they will taste. The study indicates that people in the adolescents' environment, as well as their own internal motivation, are crucial factors in determining whether they will try new food. One conclusion that can be drawn from the study is that both home and school play important roles in increasing the consumption of vegetarian food.
|
242 |
Barn med psykisk ohälsa på somatisk akutvårdsavdelning : -En intervjustudie om sjuksköterskors upplevelseChristensen, Henrik, Okawa Ericson, Kanako January 2023 (has links)
Bakgrund: Förekomsten av psykisk ohälsa bland barn och ungdomar ökar i Sverige. BUP(barn- och ungdomspsykiatrin) är ansvarig för barn och ungdomar som lider av psykiskaproblem, ibland behöver de även vårdas på en somatisk vårdavdelning. Det anses utmanandeför sjuksköterskor inom somatisk vård att vårda patienter med psykisk ohälsa, vilket inte ärderas vanliga arbetsområde. Syfte: Syftet var att undersöka sjuksköterskors upplevelser av tillfällig vård av barn medpsykisk ohälsa inom somatisk barnsjukvård, där omvårdnaden av barnen planeras att övergåtill BUP. Metod: Kvalitativ metod med induktiv ansats tillämpades vid studiens genomförande.Semistrukturerade intervjuer med 11 sjuksköterskor vid två olika barnavdelningar på ettuniversitetssjukhus i Mellansverige utgjorde datainsamlingen. Dataanalysen genomfördesmed en innehållsanalys enligt Elo & Kyngäs. Resultat: Deltagarnas upplevelser delades in i tre kategorier: Otillräcklig omvårdnad därpatientsäkerheten riskeras, Otillräckliga färdigheter inom psykiatrisk vård blandsjuksköterskor och Att befinna sig i en utmanande arbetsmiljö. Kategorierna utmynnade i enövergripande huvudkategori: Vi behandlar det somatiska och står ut med det psykiatriska.Sjuksköterskorna gavs begränsade möjligheter att ge en helhetsvård till barnet på grund avbristande förutsättningar, vilket resulterade i otillräcklig omvårdnad och patientsäkerhet samten utmanande arbetsmiljö för sjuksköterskorna. Som en konsekvens av detta var dethuvudsakligen fokus på de somatiska aspekterna av barnens hälsa, trots att de också led avpsykisk ohälsa. Slutsats: Omständigheterna på de somatiska avdelningarna försvårar för sjuksköterskorna attkunna ge den omvårdnad som behövs för barn med psykisk ohälsa. För att förbättra lägetskulle en översyn av samverkansrutiner, personalens utbildning och tillgängliga resurser varagynnsam. / Background: Mental health issues among children and adolescents are increasing in Sweden.They are primarily managed by child and adolescent psychiatry BUP. Occasionally theyrequire inpatient care at a medical ward. The care of psychiatric patients is challenging forpediatric nurses. Aim: Investigate the experiences that pediatric nurses have when caring for children withpsychiatric conditions who are planned to be transferred to BUP. Method: A qualitative method with an inductive approach was used. The data collectionconsisted of semi structured interviews with seven nurses specialized in pediatrics and fournon-specialized nurses at two pediatric wards at a university hospital in central Sweden. Results: The experiences of the participants were split in three categories: Insufficient carewhere patient safety is put at risk, Insufficient psychiatric care skills among nurses, and Beingin a challenging work environment. These categories culminated in a main category: We treatthe somatic and tolerate the psychiatric aspects. Nurses were given limited opportunities toprovide comprehensive care for the child due to inadequate conditions, which resulted ininsufficient care and compromised patient safety, as well as creating a challenging workenvironment for the nurses. As a consequence of this, the focus was solely on the somaticaspects of children's health, despite them also suffering from mental health issues. Conclusion: The nurses at the somatic pediatric wards face circumstances that prevent themfrom giving proper care to psychiatric patients. An overview of the staff's education,collaboration procedures and available resources would be helpful.
|
243 |
Kristineberg- Centrum för Blå mat / Kristineberg- Centre of Blue foodKitti, Karolina January 2021 (has links)
Forskningsstationen Kristineberg ligger vid Gullmarsfjordens inlopp i Bohuslän. Gullmarsfjorden har formen av en skål, vilket betyder att arter som vanligtvis lever längre ut till havs blir kvar när de sköljs in med vågorna då de har svårt att ta sig tillbaka över skålkanten igen. Det gör det till en bra plats att studera marint liv här och forskare kommer hit från hela världen. Det Bohuslänska landskapet har präglats av de karga bergen och havet genom historien, sillperioder har ökat befolkningen vid kustbandet och däremellan har befolkningen minskat. Idag är målet för forskningsstationen att utveckla svenskarnas marina kosthållning och på Kristineberg forskar man bland annat på alger, kravbor och annan marin odling och förädling. De ingår i organisationen Blå mat som i år har fått ett stort anslag från EU för att utvecklas och mitt examensprojekt har handlat om att utforska de arkitektoniska möjligheterna att göra Kristineberg till Blå mats fysiska centrum. / The Kristineberg research station is located at the inlet of the Gullmarsfjord in Bohuslän. The Gullmarsfjord has the shape of a bowl, which means that species that usually live further out to sea remain when they are washed in with the waves as they have difficulty getting back over the edge again. This makes it a great place to study marine life and researchers come here from all over the world to study here. The Bohuslän landscape has been characterized by the rough mountains and sea throughout history, herring periods have increased the population along the coastline and in between the population has decreased. Today, the goal for the research station is to develop the Swedes' marine diet, and at Kristineberg they are researching algae, crayfish and other marine cultivation, among other things. They are part of the organization Blue Food, which recently have received a large grant from the EU to reach their goal on develop marine diet in Sweden. My degree project explores the architectural possibilities of making Kristineberg the physical centre of Blue Food.
|
244 |
Elevers upplevelser av hur hälsoperspektiv kopplat till MAT tas upp i hem- och konsumentkunskap / Pupils' experiences of how health perspectives linked to FOOD are taken up in home and consumer STUDIESAlessandra, Ingargiola, Pua, Övergaard January 2023 (has links)
SAMMANFATTNING Bakgrund Hem- och konsumentkunskap (HKK) är ett viktigt skolämne som syftar till att ge elever nödvändiga verktyg för att bli medvetna konsumenter. Livsmedelsverkets nya kostråd innebär att äta mer mat från växtriket och mindre från djurriket, att äta lagom mycket och att röra på sig. Flera studier om hem- och konsumentkunskapsundervisning visar att majoriteten av eleverna prioriterar smak framför hälsa samt att ungdomar under tonåren är mycket lättpåverkade av sina kamrater, reklam och förändringar i samhället. Ungdomars ohälsosamma matvanor beskrivs utgöra en av de största riskfaktorerna för sjuklighet i Sverige idag. Skolan med dess hem- och konsumentkunskapsundervisning har således möjlighet att främja hälsosamma matvanor. Syfte Syftet med uppsatsen var att utforska elevers upplevelser av hälsoperspektivet kopplat till mat i undervisningen i hem- och konsumentkunskap. Metod I studien har en kvalitativ forskningsmetod använts. Elva semistrukturerade intervjuer av elever i årskurs 9 har genomförts. Intervjumaterialet transkriberades, bröts ner i meningsenheter och kodades. Sedan delades materialet i subkategorier och kategorier vilka användes i resultatanalysen. Resultat Analysen resulterade i fem kategorier som byggdes upp av elva subkategorier. Kategorierna handlade om hälsa och livsstil, hantering av livsmedel, hur maten påverkar kropp och hälsa, vad det innebär att göra hälsosamma val samt elevers önskan av variation och tydlighet i undervisningen. Slutsats Eleverna visade sig ha svårigheter med att omvandla hälsokunskap till handling i vardagslivet. De behöver praktiska och konkreta övningar för att göra hälsosamma val i vardagen så att inte smak, kompisinflytande och ohälsosamma matvanor prioriteras före reflektion av hälsosam livsstil. Rekommendationen blir att läraren behöver vara mer tydlig och hälsoperspektivet behöver genomsyra undervisningen genom att visa på vad som är hälsosamt och inte. Detta medför att HKK-läraren behöver ha goda kunskaper om ämnet hälsa för att kunna förmedla detta på ett intressant och varierande sätt för eleverna.
|
245 |
Hur ser pedagoger på barn och mat i förskolan?- ett etnografiskt perspektiv / Children and food- Viewed by Pre-shool Pedagogues from an Ethnographic perspectiveNicklasson, Annika January 2006 (has links)
På regeringens uppdrag har Livsmedelsverket och Statens Folkhälsoinstitut tagit fram ett underlag till en handlingsplan för goda matvanor och ökad fysisk aktivitet i befolkningen eftersom det har blivit ett samhällsproblem med fetma och ökad vikt bland barn och vuxna. Syftet med detta arbete är att undersöka och beskriva hur pedagoger ser på barn och mat. Finns det olika tankar och synsätt? Hur viktigt är det med regler när det gäller mat? Hur mycket ansvar ska pedagogerna ha när det gäller vad barnen ska äta på förskolan. Hur mycket inflytande ska föräldrarna ha när det gäller vad det serveras för mat till deras barn? Jag tog kontakt med en förskola i Malmös stadsdel centrum och intervjuade åtta pedagoger om deras syn på barn och mat. Jag tolkar resultatet så att i förskolans kultur ingår en stark tilltro till fasta regler och det är viktigt i samarbete med kollegor, kontakten med föräldrar och barn. Regeltilltron är dock laddad pga. att pedagogerna har olika uppfattningar vilket kan beskrivas som en dold konflikt i förskolan. I min slutsats har jag kommit fram till att det finns många olika tankar och synsätt hos pedagogerna. Arbetslaget behöver tid för regelbundna diskussioner om hur de ska arbeta med förhållandet kring barn och mat. Förskolan skulle kunna arbeta med tema utifrån ett hälsoperspektiv där barnen får en medvetenhet om sin hälsa förknippat till mat.
|
246 |
Complexity in Infinite Games on Graphs and Temporal Constraint NetworksComin, Carlo January 2017 (has links)
This dissertation deals with a number of algorithmic problems motivated by automated temporal planning and formal verification of reactive and finite state systems. Particularly, we shall focus on game theoretical methods in order to obtain improved complexity bounds and faster algorithms for the following models: Hyper Temporal Networks, Conditional Simple/Hyper Temporal Networks, Conditional Simple Temporal Networks with Instantaneous Reaction Time, Update Games, Explicit McNaughton-Muller Games, Mean Payoff Games.
|
247 |
HUR SER KOST- OCH MOTIONSVANOR UT HOS UNGDOMAR I UMEÅ? / What are the food habits and physical activity levels of adolescents in Umeå?Vinefur, Carolina, Larsson, Julia January 2024 (has links)
Bakgrund Prevalensen av obesitas har ökat i samhället och flertalet trender med en negativ påverkan på hälsan har observerats hos ungdomar. I jämförelse med de nordiska näringsrekommendationerna äter ungdomar idag för lite frukt och grönsaker och istället för mycket tillsatt socker och mättat fett. Samtidigt har en stor minskning av den fysiska aktivitetsnivån observerats till förmån för ett ökat stillasittande och ökad skärmtid vilket dessutom associerats med ohälsosamma matvanor. Syfte Syftet med studien var att undersöka eventuella samband och skillnader mellan kostvanor och fysisk aktivitet hos ungdomar i Umeå kommun. Metod Studien genomfördes med en digital kvantitativ enkätundersökning under hösten 2023. Målgruppen för studien var ungdomar i åldrarna 15–20 år i Umeå. Data samlades in genom att besöka gymnasieskolor med en QR-kod till enkäten. All insamlade data analyserades med de statistiska testerna Spearman rangkorrelation, Chi-2-test, Fischer's exact test, Mann-Whitney-U test och logistisk regression. Resultat Totalt inkluderades 209 respondenter med en jämn fördelning mellan tjejer och killar. Respondenterna hade i genomsnitt ”lite” alternativt ”någorlunda koll” på rekommendationerna för kost och fysisk aktivitet. Denna självupplevda medvetenhet visade sig ha ett samband till följsamheten för rekommendationerna. I genomsnitt rapporterade respondenterna att de åt 3–4 måltider per dag varav frukost var det minst vanligaste huvudmålet. De flesta uppgav att de åt fisk en gång per vecka eller mindre och i genomsnitt 100–200 gram frukt och grönsaker per dag. Det fanns ett signifikant samband där ungdomar som utförde fysisk aktivitet hade högre följsamhet till näringsrekommendationerna. Dessutom observerades ett signifikant samband där de som åt regelbundet samt de som åt frukost hade en högre följsamhet till rekommendationerna för pulshöjande aktivitet. Slutsats Utifrån det undersökta stickprovet av ungdomar i Umeå verkade följsamheten till rekommendationerna för kost och fysisk aktivitet vara låg. Det observerades ett möjligt samband mellan medvetenheten och följsamhet till rekommendationerna för kost och fysisk aktivitet samt en möjlig korrelation mellan en regelbunden måltidsordning och fysisk aktivitetsnivå. / Background The prevalence of obesity has increased in society and several trends with a negative impact on health have been observed in adolescents. In comparison to the Nordic Nutrition Recommendations, young people today do not eat enough fruit and vegetables and instead eat too much added sugar and saturated fat. Meanwhile a grand decrease in the physical activity level has been observed in favor of an increased sedentary time and screen time which has also been associated with unhealthy food habits. Objective The purpose of the study is to investigate the possible connection and differences between food habits and physical activity level in adolescents in Umeå. Method The study was conducted with a digital quantitative survey during the autumn of 2023. The target group for the study was adolescents in the ages 15-20 years in Umeå. Data was collected by visiting upper secondary classes with a QR-code to the survey. All the collected data was then analyzed using the statistical tests Spearman´s rank correlation, Chi-square test, Fischer's exact test, Mann-Whitney-U test, and logistic regression. Results In total 209 respondents were included in the analysis with an equal distribution between girls and boys. The respondents had on average “little” or “fair” knowledge of the recommendations for nutrition and physical activity. This self-perceived awareness was shown to have a positive relation to the compliance of the recommendations. In average the respondents estimated that they ate 3-4 meals per day whereof breakfast was the least common main meal. Most reported that they ate fish once a week or less frequently and on average 100-200 grams of fruit and vegetables daily. There was a significant relationship showing that those who exercised had a higher compliance to the Nordic Nutrition Recommendations. Furthermore, a significant relationship between regular eating patterns and aerobic exercise showed that those who ate regularly, as well as those who ate breakfast, had a higher compliance to the recommendations for aerobic exercise. Conclusion Based on the investigated sample of adolescents in Umeå the compliance to the recommendations for nutrition and physical activity appeared to be low. A possible connection was observed between awareness and compliance to the recommendations for nutrition and physical activity as well as a possible correlation between a regular meal pattern and physical activity level.
|
248 |
Brain Decoding for Brain Mapping: Definition, Heuristic Quantification, and Improvement of Interpretability in Group MEG DecodingKia, Seyed Mostafa January 2017 (has links)
In the last century, a huge multi-disciplinary scientific endeavor is devoted to answer the historical questions in understanding the brain functions. Among the statistical methods used for this purpose, brain decoding provides a tool to predict the mental state of a human subject based on the recorded brain signal. Brain decoding is widely applied in the contexts of brain-computer interfacing, medical diagnosis, and multivariate hypothesis testing on neuroimaging data. In the latest case, linear classifiers are generally employed to discriminate between experimental conditions. Then, the derived weights are visualized in the form of brain maps to further study the spatio-temporal patterns of the underlying neurophysiological activity. It is well known that the brain maps derived from weights of linear classifiers are hard to interpret because of high correlations between predictors, low signal-to-noise ratio, across-subject variability, and the high dimensionality of the neuroimaging data. Therefore, improving the interpretability of brain decoding approaches is of primary interest in many neuroimaging studies. Despite extensive studies of this type, at present, there is no formal definition for interpretability of multivariate brain maps. As a consequence, there is no quantitative measure for evaluating the interpretability of different brain decoding methods. In this thesis, as the primary contribution, we propose a theoretical definition of interpretability in linear brain decoding; we show that the interpretability of multivariate brain maps can be decomposed into their reproducibility and representativeness. As an application of the proposed definition, we exemplify a heuristic for approximating the interpretability in multivariate analysis of evoked magnetoencephalography (MEG) responses. We propose to combine the approximated interpretability and the generalization performance of the model into a new multi-objective criterion for model selection. Our results, for the simulated and real MEG data, show that optimizing the hyper-parameters of the regularized linear classifier based on the proposed criterion results in more informative multivariate brain maps. More importantly, the presented definition provides the theoretical background for quantitative evaluation of interpretability, and hence, facilitates the development of more effective brain decoding algorithms in the future. As the secondary contribution, we present an application of multi-task joint feature learning for group-level multivariate pattern recovery in single-trial MEG decoding. The proposed method allows for recovering sparse yet consistent patterns across different subjects, and therefore enhances the interpretability of the decoding model. We evaluated the performance of the multi-task joint feature learning in terms of generalization, reproducibility, and quality of pattern recovery against traditional single-subject and pooling approaches on both simulated and real MEG datasets. Our experimental results demonstrate that the multi-task joint feature learning framework is capable of recovering meaningful patterns of varying spatio-temporally distributed brain activity across individuals while still maintaining excellent generalization performance. The presented methodology facilitates the application of brain decoding for characterizing the fine-level distinctive patterns of brain activity in group-level inference on neuroimaging data.
|
249 |
Predictive networks for multi meta-omics data integrationZandonà, Alessandro January 2017 (has links)
The role of microbiome in disease onset and in equilibrium is being exposed by a wealth of high-throughput omics methods. All key research directions, e.g., the study of gut microbiome dysbiosis in IBD/IBS, indicate the need for bioinformatics methods that can model the complexity of the microbial communities ecology and unravel its disease-associated perturbations. A most promising direction is the “meta-omics” approach, that allows a profiling based on various biological molecules at the metagenomic scale (e.g., metaproteomics, metametabolomics) as well as different “microbial” omes (eukaryotes and viruses) within a system biology approach. This thesis introduces a bioinformatic framework for microbiota datasets that combines predictive profiling, differential network analysis and meta-omics integration. In detail, the framework identifies biomarkers discriminating amongst clinical phenotypes, through machine learning techniques (Random Forest or SVM) based on a complete Data Analysis Protocol derived by two initiatives funded by FDA: the MicroArray Quality Control-II and Sequencing Quality Control projects. The biomarkers are interpreted in terms of biological networks: the framework provides a setup for networks inference, quantification of networks differences based on the glocal Hamming and Ipsen-Mikhailov (HIM) distance and detection of network communities. The differential analysis of networks allows the study of microbiota structural organization as well as the evolving trajectories of microbial communities associated to the dynamics of the target phenotypes. Moreover, the framework combines a novel similarity network fusion method and machine learning to identify biomarkers from the integration of multiple meta-omics data. The framework implementation requires only standard open source computational biology tools, as a combination of R/Bioconductor and Python functions. In particular, full scripts for meta-omics integration are available in a GitHub repository to ease reuse (https://github.com/AleZandona/INF). The pipeline has been validated on original data from three different clinical datasets. First, the predictive profiling and the network differential analysis have been applied on a pediatric Inflammatory Bowel Disease (IBD) cohort (in faecal vs biopsy environments) and controls, in collaboration with a multidisciplinary team at the Ospedale Pediatrico Bambino Gesú (Rome, I). Then, the meta-omics integration has been tested on a paired bacterial and fungal gut microbiota human IBD datasets from the Gastroenterology Department of the Saint Antoine Hospital (Paris, F), thanks to the collaboration with “Commensals and Probiotics-Host Interactions” team at INRA (Jouy-en-Josas, F). Finally, the framework has been validated on a bacterial-fungal gut microbiota dataset from children affected by Rett syndrome. The different nature of datasets used for validation naturally supports the extension of the framework on different omics datasets. Besides, clinical practice can take advantage of our framework, given the reproducibility and robustness of results, ensured by the adopted Data Analysis Protocol, as well as the biological relevance of the findings, confirmed by the clinical collaborators. Specifically, the omics-based dysbiosis profiles and the inferred biological networks can support the current diagnostic tools to reveal disease-associated perturbations at a much prodromal earlier stage of disease and may be used for disease prevention, diagnosis and prognosis.
|
250 |
Influence of landscape-variation in geochemistry on taxonomic and functional composition of microbial mat communities in the McMurdo Dry Valleys, AntarcticaRisteca, Paul Joseph 08 June 2023 (has links)
Microbial communities play critical roles in biogeochemical cycles of aquatic and terrestrial ecosystems, but studies of soil microbial communities have been limited by the diversity and complexity found in most ecosystems. Here we report on work investigating the functional diversity of microbial mat and underlying soil communities in the McMurdo Dry Valleys of Antarctica across a gradient of phosphorus availability on glacial tills of distinct age and mineral composition in Taylor Valley, Antarctica. Microbial mat and soil DNA were extracted and sequenced on an Illumina NextSeq500 in a 150 bp paired end format. Raw sequences were uploaded to the MG-RAST server for processing and annotation. Community taxonomic and functional annotation were determined using the RefSeq and SEED Subsystem databases, respectively. The results revealed significant variation in microbial mat community taxonomic composition between the two tills, strongly associated with visual assessment of mat morphology, e.g., "black" and "orange" mats, and soil N:P ratios. The underlying soil microbial communities did not exhibit significant differences in diversity between the two tills, but community composition varied significantly across gradients of soil chemistry, particularly extractable-phosphate content even within tills. The relative abundance of biogeochemistry-relevant pathways determined from the SEED database varied amongst soil microbial communities between the two tills. For example, microbial mat communities exhibited significant variation in the relative abundance of key nitrogen and phosphorus metabolism associated genes strongly associated with the underlying soil N:P. These results suggest that spatial variation in geochemistry influences the distribution and activity of microbial mats, but that the microbial mats themselves also exert a significant homogenizing effect on the underlying soil communities and some of the key biogeochemical processes they facilitate. / Master of Science / Microbial communities play critical roles in the processes of aquatic and terrestrial ecosystems. Still, studies of soil microbial communities have been limited by the complex nature of the ecosystems we study. This study examined the diversity of microbial communities in the McMurdo Dry Valleys of Antarctica, specifically looking at how different levels of phosphorus availability in the soil affected microbial function. We used DNA sequencing and databases to determine the taxonomic and functional makeup of these communities. We found that while the microbial mat communities varied significantly based on soil chemistry and appearance, the underlying soil microbial communities did not. We also found evidence suggesting that the microbial mats played a role in regulating some of the key ecosystem processes in the soil. Overall, this study sheds light on how microbial communities are impacted by their environment and how they, in turn, impact their surroundings.
|
Page generated in 0.0543 seconds