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Redes neurais residuais profundas e autômatos celulares como modelos para predição que fornecem informação sobre a formação de estruturas secundárias proteicas / Residual neural networks and cellular automata as protein secondary structure prediction models with information about folding

Pereira, José Geraldo de Carvalho 15 March 2018 (has links)
O processo de auto-organização da estrutura proteica a partir da cadeia de aminoácidos é conhecido como enovelamento. Apesar de conhecermos a estrutura tridimencional de muitas proteínas, para a maioria delas, não possuímos uma compreensão suficiente para descrever em detalhes como a estrutura se organiza a partir da sequência de aminoácidos. É bem conhecido que a formação de núcleos de estruturas locais, conhecida como estrutura secundária, apresenta papel fundamental no enovelamento final da proteína. Desta forma, o desenvolvimento de métodos que permitam não somente predizer a estrutura secundária adotada por um dado resíduo, mas também, a maneira como esse processo deve ocorrer ao longo do tempo é muito relevante em várias áreas da biologia estrutural. Neste trabalho, desenvolvemos dois métodos de predição de estruturas secundárias utilizando modelos com o potencial de fornecer informações mais detalhadas sobre o processo de predição. Um desses modelos foi construído utilizando autômatos celulares, um tipo de modelo dinâmico onde é possível obtermos informações espaciais e temporais. O outro modelo foi desenvolvido utilizando redes neurais residuais profundas. Com este modelo é possível extrair informações espaciais e probabilísticas de suas múltiplas camadas internas de convolução, o que parece refletir, em algum sentido, os estados de formação da estrutura secundária durante o enovelamento. A acurácia da predição obtida por esse modelo foi de ~78% para os resíduos que apresentaram consenso na estrutura atribuída pelos métodos DSSP, STRIDE, KAKSI e PROSS. Tal acurácia, apesar de inferior à obtida pelo PSIPRED, o qual utiliza matrizes PSSM como entrada, é superior à obtida por outros métodos que realizam a predição de estruturas secundárias diretamente a partir da sequência de aminoácidos. / The process of self-organization of the protein structure is known as folding. Although we know the structure of many proteins, for a majority of them, we do not have enough understanding to describe in details how the structure is organized from its amino acid sequence. In this work, we developed two methods for secondary structure prediction using models that have the potential to provide detailed information about the prediction process. One of these models was constructed using cellular automata, a type of dynamic model where it is possible to obtain spatial and temporal information. The other model was developed using deep residual neural networks. With this model it is possible to extract spatial and probabilistic information from its multiple internal layers of convolution. The accuracy of the prediction obtained by this model was ~ 78% for residues that showed consensus in the structure assigned by the DSSP, STRIDE, KAKSI and PROSS methods. Such value is higher than that obtained by other methods which perform the prediction of secondary structures from the amino acid sequence only.
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Efectes de la suplementació dietètica amb proteïnes plasmàtiques sobre les propietats de barrera i de defensa de la mucosa intestinal en un model d'inflamació

Pérez Bosque, Anna 05 February 2005 (has links)
Els concentrats de plasma (SDAP) i d'immunoglobulines (IC) són suplements dietètics destinats als animals de granja i que han estat proposats com alternativa a l'ús dels antibiòtics com a promotors del creixement. Un dels primers efectes descrits en els animals alimentats amb aquests suplements va ser l'increment de la taxa de creixement. Aquesta millora del creixement és deguda, en part, a que hi ha un augment del consum de pinso i a que es produeix una menor estimulació del sistema immunitari. Aquesta hipòtesi està recolzada per estudis que demostren que una activació immunitària produeix una reducció en la ingesta d'aliments, així com un increment de la utilització dels nutrients per part de les cèl·lules del sistema immunitari.En aquest treball, s'ha estudiat els efectes de la suplementació dietètica amb proteïnes plasmàtiques (concentrat de plasma i concentrat d'immunoglobulines) sobre diferents aspectes de la fisiologia intestinal en rates inflamades amb l'enterotoxina B d'Staphylococcus aureus (SEB). Els animals utilitzats han estat rates Wistar-Lewis mascles de 21 dies d'edat (deslletament). Aquests animals han estat alimentats durant 14 dies amb pinsos suplementats amb un 8% de concentrat de plasma (SDAP) o bé amb 4,7% de concentrat d'immunoglobulina (IC). Les rates han estat administrades intraperitonealment amb 50 μg de SEB els dies 30 i 33 i s'han sacrificat al cap de 48 h (35 dies).El SEB no modifica cap de les variables sistèmiques analitzades: ni immunoglobulina G (IgG) ni la IgA sèriques així com tampoc diferents variables hematològiques ni les diferents poblacions limfocitàries analitzades a la melsa. En canvi, les rates inflamades presenten un increment important en l'activació dels limfòcits T col·laboradors, tant a les plaques de Peyer (PP) com a ganglis limfàtics mesentèrics (GLM). Ambdós teixits estan implicats en la inducció de la resposta immunitària. Els animals inflamats amb SEB també mostren un increment del contingut d'aigua en femtes, infiltració de neutròfils a la mucosa intestinal i un increment de la permeabilitat capil·lar a la zona.El SEB també altera les funcions de barrera i d'absorció de nutrients. L'enterotoxina redueix l'expressió de proteïnes de la unió estreta i de la unió adherent (ZO-1 i β-catenina, respectivament), així com del transportador de la D-glucosa, afectant així tant la funció de permeabilitat com la d'absorció de nutrients.L'alimentació amb pinsos suplementats amb SDAP o IC evita l'efecte de l'enterotoxina sobre l'activació dels limfòcits T col·laboradors de les plaques de Peyer, sense prevenir l'activació dels limfòcits T dels ganglis limfàtics mesentèrics, ni la infiltració de neutròfils a la zona mucosal ni l'increment de la permeabilitat capil·lar de la zona. La suplementació dietètica amb SDAP (i en menor grau el IC) redueix el contingut d'aigua en femtes i atenua els efectes del SEB sobre l'epiteli, tant sobre l'absorció de nutrients com sobre l'expressió de proteïnes de les unions estreta i adherent.En resum, l'addició de concentrats de plasma a la dieta en l'etapa que segueix el deslletament afecta la distribució d'algunes poblacions limfocitàries durant la resposta a la inflamació induïda per una enterotoxina de S. aureus, que impedeix una activació exagerada del sistema immunitari; alhora, l'SDAP afavoreix l'absorció d'alguns nutrients energètics i la integritat de l'epiteli. Tot plegat recolza la hipòtesi que la suplementació dietètica amb SDAP millora l'aprofitament energètic dels nutrients i redueix la probabilitat que agents químics i infecciosos puguin penetrar a la circulació sanguínia a través de la barrera epitelial. / The aim of this study was to determine the potential modulatory effects of diets supplemented with spray-dried animal plasma (SDAP) or immunoglobulin concentrates (IC) on the of intestinal physiology of rats challenged with "Staphylococcus aureus enterotoxin B" (SEB). Lewis rats were fed diets containing 8% of SDAP, 4.7% of IC or milk proteins (Control diet) from postnatal day 21 (weaning) for 14 days. On days 30 and 33, rats were given SEB (50 μg; i.p.). SEB induced an intestinal inflammation characterized by effects on intestinal immune system, on barrier function and on nutrient absorption. SEB administered rats showed an increase in T lymphocytes activation (in particular T helper lymphocytes) in Peyer's Patches and in mesenteric lymph nodes, both responsible of immune response induction. Inflamed rats also showed an increase in water content in feces, neutrophil infiltration in intestinal mucosa, as well as an increase in local capillary permeability.SEB also alter barrier and nutrient absorption functions. The enterotoxin reduces the expression of proteins of the tight junction and of the adherent junction (ZO-1 and β-catenina, respectively), as well as the transporter of D-glucosa.Feeding with SDAP or IC supplementation prevents the effect of the enterotoxin on the activation of T helper lymphocytes in Peyer's patches. The dietary supplementation with SDAP (and in lower extent IC) reduces water content in feces and attenuates SEB effects on the epithelium, as well as on nutrients absorption and on the expression of proteins from tight and adherent junctions.In conclusion, the addition of plasma concentrates on feeding in the weaning period affects the distribution of some lymphocyte populations in the immune response to S. aureus, which prevents an overstimulation of intestinal immune system; at the same time, SDAP enhances the absorption of different energetic nutrients and the integrity of the epithelium. All in all supports the hypothesis that dietary supplementation with SDAP improves the nutrient intake and reduces the probability that chemic and infectious agents can enter to blood stream across the epithelial barrier. KEY WORDS: "Staphylococcus aureus", rat, intestinal inflammation, permeability, gut-associated immune tissue, SGLT-1, tight junction, spray-dried animal plasma, immunoglobulin concentrate, protein supplementation.
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Identificação de motivos relevantes para a função do fator de iniciação da tradução EIF4E3 de Leishmania sp / Identification of relevant motifs to translation initiation factor EIF4E3 function in Leishmania sp

Moraes, Rômulo Murilo do Nascimento January 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-05-19T13:08:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) 2015moraes-rmn.pdf: 2690273 bytes, checksum: ed5beefae2ad836171467014e6c521e1 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil / Os tripanossomatídeos são organismos caracterizados pelo controle póstranscricional da expressão gênica, principalmente em nível de tradução. Na tradução em eucariotos, tem grande destaque o complexo eIF4F, sendo um de seus principais componentes o fator de iniciação da tradução eIF4E. Já foram descritos em tripanossomatídeos seis homólogos para o eIF4E, nomeados EIF4E1 a 6. Em um estudo com Leishmania amazonensis, focado no EIF4E3, percebeu-se que seu perfil de expressão se alterava rapidamente numa curva de crescimento, com este apresentando ao menos duas bandas. As mudanças observadas sugeriam modificações pós-traducionais do tipo fosforilação, algo posteriormente confirmado. Analisando-se a sequência do EIF4E3 de Leishmania, foi possível identificar a presença de possíveis sítios de fosforilação e de ligação a parceiros funcionais como homólogos do eIF4G, outro componente do complexo eIF4F, e da proteína de ligação á cauda poli-A (PABP). No presente estudo foi analisado o perfil de expressão e a capacidade de ligação a parceiros funcionais do EIF4E3 de Leishmania superexpresso em células transfectadas e no qual foram introduzidas mutações em motivos específicos. Os resultados mostraram um perfil de expressão de ao menos três bandas para o EIF4E3 de L. amazonensis e duas para L. infantum, com o sítio S75, presente apenas na primeira, sendo o responsável por esta diferença. Em ensaios de imunoprecipitação, foi identificado um motivo que, quando mutado, aboliu a ligação do EIF4E3 com a PABP3, sugerindo este como o sítio de interação entre os fatores. Com a análise do efeito de mutações no EIF4E3 de L. amazonensis, foi percebido que ao se mutar três motivos implicados na à PABP e o possível sítio de ligação ao EIF4G, sua fosforilação diminuiu drasticamente, sugerindo a necessidade destas interações para que a fosforilação ocorra. Estes resultados indicam um complexo mecanismo de modificações pós-traducionais responsáveis pela regulação do EIF4E3 e contribuem a para a caracterização da sua função em Leishmania
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Terapia nutricional enteral intermitente : interrupção diurna ou noturna? : estudo clínico randomizado

Pegoraro, Vanessa Alvarenga 18 July 2014 (has links)
Submitted by Simone Souza (simonecgsouza@hotmail.com) on 2017-09-25T13:35:26Z No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Vanessa Alvarenga Pegoraro.pdf: 1921327 bytes, checksum: dcf3ca8d3afb38e3634a7d5402c157e0 (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2017-09-26T14:29:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Vanessa Alvarenga Pegoraro.pdf: 1921327 bytes, checksum: dcf3ca8d3afb38e3634a7d5402c157e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-26T14:29:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Vanessa Alvarenga Pegoraro.pdf: 1921327 bytes, checksum: dcf3ca8d3afb38e3634a7d5402c157e0 (MD5) Previous issue date: 2014-07-18 / Introdução: Independente da administração continua ou intermitente, nas Unidades de Terapia Intensiva (UTI)geralmente o paciente recebe as suas necessidades nutricionais calculadas para a terapia nutricional enteral (TNE) em volume inferior ao programado, comprometendo sua recuperação. Assim, a interrupção programada da TNE em turno de realização das atividades de rotina diária dessas unidades, pode contribuir para diminuir este déficit. Objetivos:Avaliar em que período, diurno ou noturno, a interrupção na administração da terapia nutricional enteral no paciente crítico é mais eficaz para garantir as necessidades calculadas. Métodos:Estudo clínico, prospectivo, randomizado de abordagem quantitativa, em pacientes críticos internados em uma UTI Geral. Foram incluídos pacientes com idade maior que 18 anos, em uso de TNE exclusiva, observados nos primeiros cinco dias de dieta. Os pacientes no ato da indicação da TNE foram randomizados em dois grupos: Grupo I (18 horas de infusão de TNE – interrupção de 6h no período de 8h as 14h), e Grupo II (18 horas de infusão de TNE - com interrupção de 6h no período de 2h as 8h). Foram comparadas entre os grupos as seguintes variáveis: sexo, idade, Apache II, ASG, peso, necessidades calóricas, proteicas, volumes de dieta prescritos e infundidos. As variáveis quantitativas foram representadas por médias e desvio padrão. A normalidade dos dados pelo teste de Kolmogorov-Smirnov e sua homogeneidade pelo teste de Levene. A análise de dados foi realizada através do teste de análise de variância (ANOVA) e teste Post Hoc de Tukey. Para variáveis categóricas, o teste de qui-quadrado de Mantel-Haenszel ou Teste Exato de Fisher. Foi utilizado o programa SPSS versão 18.0 (α= 5%). Resultados: Os dados demográficos avaliados foram semelhantes entre os dois grupos. A avaliação de gravidade usando o APACHE II evidenciou grupos semelhantes (p=0,168). Na avaliação nutricional pela ASG, nenhum paciente dos dois grupos foi ASG- A, ASG-B 66,7% no grupo I e 86,7 % no grupo II, ASG-C 33,3 % e 13,3%, respectivamente, no grupos I e II (p=0,389). Peso médio idênticos em ambos os grupos (p=0,978). Comparando o volume infundido >60 % entre os grupos, no grupo I a infusão de dieta foi de 66,7 % versus 53,3%, no grupo II (p=0,463). E quanto ao alcance das metas de NC até o 3º dia de infusão, o grupo I obteve 13,3 % comparado ao grupo II com 6,7 % (p=0,549). E o alcance da NP no mesmo período, foi no grupo I comparado ao grupo II (20,0% versus 6,7%, p=0,290). Conclusão: Baseado nos resultados, podemos concluir que as necessidades de terapia nutricional enteral calculadas no paciente crítico são atingidas de forma semelhante tanto para interrupção diurna quanto noturna. / Introduction: Regardless of continuous or intermittent administration in the Intensive Care Unit (ICU) patients usually receive their nutritional requirements calculated for enteral nutrition therapy (ENT) in less than planned volume, hindering their recovery. Thus, the interruption of scheduled shift ENT in performing daily routine activities of these units can contribute to reduce this deficit. Objectives: To assess the period, day or night, the interruption in the administration of enteral nutritional therapy in critically ill patients is more effective to ensure the calculated requirements. Methods: clinical, prospective , randomized study of quantitative approach in critically ill patients hospitalized to a general ICU . Patients over 18 years old were included in the exclusive use of ENT, observed in the first five days of diet. Patients in the act of nomination of ENT were randomized into two groups: Group I (18 hours ENT infusion – break of 6 hours in the period of 8 a.m. to 2 p.m.) and Group II (18 hours ENT infusion - break of 6 hours in the period of 2 a.m. to 8 a.m.). Among the groups the following variables were compared: sex, age, Apache II, ASG, weight, calorie needs, protein, diet prescribed volumes and infused. The quantitative variables were represented by medium-sized and standard deviation. The normality of the data by the Kolmogorov-Smirnov test and its homogeneity by Levene's test. Data analysis was performed by testing analysis of variance (ANOVA) and Tukey test Post Hoc. For categorical variables, the Chi-square test of Mantel-Haenszel or Fisher's Exact Test. We used the program SPSS version 18.0 (α = 5%). Results: the demographics data assessed were similar between the two groups. The assessment of severity using APACHE II showed similar groups (p = 0.168). In nutritional evaluation by ASG, none of the patients of both groups was ASG-A, ASG-B, 66.7% in Group I and 86.7% in Group II, ASG-C 33.3% and 13.3%, respectively, in groups I and II (p = 0.389). There were average weight identical in both groups (p = 0.978). Comparing the volume infused > 60% between the groups, in the Group I the infusion of diet was 66.7% versus 53.3% in Group II (p = 0.463). And, as for achieving the goals of NC until the 3rd day of infusion, group I obtained 13.3% compared with 6.7% in Group II (p = 0.549). And, the achieving of the NP in the same period, was in Group I compared to group II (20.0% vs. 6.7%, p = 0.290). Conclusion: Based on the results, we can conclude that the needs of enteral nutrition therapy calculated in critical patient are affected in a similar manner for both daytime and nighttime interruption.
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Dano ao DNA no diabetes tipo 2 e sua associação com inflamação, estresse oxidativo, disfunção endotelial, resistência à insulina e à ocorrência de complicações crônicas microvasculares / DNA damage in type 2 diabetes and its association with inflammation, oxidative stress, endothelial dysfunction, insulin resistance and the occurrence of microvascular chronic complications

Tatsch, Etiane 15 March 2016 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Several pathophysiological mechanisms are associated with type 2 diabetes mellitus (type 2 DM), such as glucotoxicity, insulin resistance, inflammation, oxidative stress and endothelial dysfunction, which can result in DNA strand breakage and changes in the nitrogenous bases. In this manner, DNA damage biomarkers may be useful in elucidating the pathophysiology of diabetes, as well as serving as an alternative to better evaluate its chronic complications. However, a great number of pathophysiological mechanisms related to increased DNA damage in diabetes need to be clarified. Thus, the objective of this study was to evaluate DNA damage in type 2 diabetes and its association with inflammation, oxidative stress, endothelial dysfunction, resistance towards insulin and the occurrence of chronic microvascular complications. The DNA damage was evaluated through the comet assay and the levels of 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine (8-OHdG) urinary, the inflammatory process through the serum levels of interleukin (IL) 1, 6 and 10 and the alpha tumor necrosis factor (TNF-α), protein oxidation through plasma levels of advanced oxidation protein products (AOPPs), endothelial dysfunction by serum levels of NOx (nitrite/nitrate) and urinary albumin and insulin resistance through the index HOMA-IR. The present study was carried out in two phases. In the first phase, 32 patients with type 2 DM and 30 healthy individuals (control) were investigated. In the second phase, 54 patients with type 2 DM and 22 healthy individuals (control) were recruited from the University Hospital of Santa Maria (HUSM). This study found that patients with type 2 diabetes showed increased DNA fragmentation, assessed by comet assay, and increased oxidative DNA damage, assessed by 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine (8-OhdG) urinary levels, compared to healthy control subjects. Additionally, increased DNA damage was observed in the type 2 DM group with inadequate glycemic control. When the areas obtained under the ROC curve were analyzed, 8-OHdG urinary presented higher diagnostic ability in identifying microvascular chronic complications compared with urinary albumin in the type 2 DM group. Furthermore, it was demonstrated that type 2 diabetic patients with microvascular complications had higher levels of oxidative DNA damage compared to patients without such complications. Interestingly enough, it was observed that type 2 diabetic patients with increased DNA damage had higher levels of proinflammatory cytokines such as IL-1, IL-6 and TNF-α, and a decrease in IL-10 levels, which is considered an anti-inflammatory cytokine. An association between increased DNA damage in type 2 diabetes and the index HOMA-IR, AOPPs levels and NOx levels and urinary albumin was also verified. Patients with type 2 diabetes exhibited factors that can directly contribute to the increase of DNA damage, such as insulin resistance, inflammation, endothelial dysfunction and increased generation of reactive species. / Diversos mecanismos fisiopatológicos estão associados ao Diabetes Mellitus (DM) tipo 2, como glicotoxicidade, resistência à insulina, inflamação, estresse oxidativo e disfunção endotelial, podendo resultar em quebras nos filamentos de DNA e modificações nas bases nitrogenadas. Desta maneira, biomarcadores de dano ao DNA podem ser úteis na elucidação da fisiopatologia do DM, bem como uma alternativa para a melhor avaliação de suas complicações crônicas. No entanto, muitos destes mecanismos fisiopatológicos relacionados ao aumento do dano ao DNA no diabetes precisam ser esclarecidos. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar o dano ao DNA no DM tipo 2 e sua associação com inflamação, oxidação proteica, disfunção endotelial, resistência à insulina e à ocorrência de complicações crônicas microvasculares. O dano ao DNA foi avaliado através do ensaio cometa e dos níveis de 8-hidroxi-2'-desoxiguanosina (8-OHdG) urinário, o processo inflamatório através dos níveis séricos das interleucinas (IL) 1, 6 e 10 e do fator de necrose tumoral alfa (TNF-α) , a oxidação proteica através dos níveis plasmáticos dos produtos proteicos de oxidação avançada (AOPPs), a disfunção endotelial através dos níveis séricos de NOx (nitrito/nitrato) e albumina urinária e a resistência insulínica através do índice HOMA-IR. O presente estudo foi conduzido em duas fases. Na primeira fase 32 pacientes com DM tipo 2 e 30 controles saudáveis foram investigados. Na segunda fase 54 pacientes com DM tipo 2 e 22 indivíduos controle foram recrutados no Hospital Universitário de Santa Maria (HUSM). Neste estudo, foi verificado que os pacientes com DM tipo 2 apresentaram aumento na fragmentação do DNA, avaliado pelo ensaio cometa, e um maior dano oxidativo ao DNA, avaliado pelos níveis urinários de 8-OHdG, comparados com indivíduos controles saudáveis. Também foi verificado no grupo DM tipo 2 com controle glicêmico inadequado um maior dano ao DNA. Quando foram analisadas as áreas sob a curva ROC obtidas, verificamos que o 8-OHdG urinário apresentou uma maior capacidade diagnóstica em identificar as complicações crônicas microvasculares, quando comparada com a albumina urinária no grupo DM tipo 2. Além disso, foi demonstrado que os pacientes diabéticos tipo 2 com complicações microvasculares apresentaram maiores níveis de dano oxidativo ao DNA, comparado aos pacientes que não apresentavam estas complicações. Interessantemente, foi observado que os pacientes DM tipo 2 com maior dano ao DNA apresentaram maiores níveis de citocinas pró-inflamatórias, como IL-1, IL-6 e TNF-α, além de um decréscimo nos níveis de IL-10, considerada um citocina anti-inflamatória. Também foi verificada uma associação entre o aumento do dano ao DNA no DM tipo 2 e o índice HOMA-IR, os níveis de AOPPs e os níveis de NOx e albumina urinária. Desta forma, nós especulamos que os pacientes com DM tipo 2 apresentaram uma cascata de eventos como, resistência à insulina, processo inflamatório, disfunção endotelial e aumento da geração de espécies reativas, fatores que podem contribuir diretamente para o aumento do dano ao DNA.
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QUALIDADE DE SOBRECOXAS DE FRANGOS SUBMETIDAS À RADIAÇÃO UV-C / CHICKEN DRUMSTICKS QUALITY SUBJECTED TO UV-C RADIATION

Dugatto, Jonas Simon 21 December 2012 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / During the chicken slaughter line, some steps are considered critical, due to the possibility of cross-contamination among carcasses, which directly influence in the shelf-life of the carcasses. New technologies that reduce the microbial counts, leading to an increase of the quality and shelf-life are very welcome. The ultraviolet-C (UV-C) radiation appears as an alternative, because is a non-thermal method, of low cost and of easy implementation, which has already proved to be lethal to many microorganisms in food surfaces. Thus, this work aimed to evaluate the use of doses of UV-C radiation of 5,4 and 9,46 kJ/m2, applied at two temperatures near the slaughter steps (5 and 25 °C), on the physicochemical parameters (color, pH, conjugated dienes content, peroxide value, thiobarbituric acid reactive substances and fatty acid profile) and microbiological (total aerobic mesophilic bacteria, psychrotrophic, yeasts and molds) of chicken drumsticks. The analyses were performed immediately after the doses were applied (zero day) and every 3 days, during 12 days of storage at 5 °C, but the fatty acid profile was analyzed after the doses were applied, and on sixth and twelfth days. The number of colonies of total aerobic mesophilic bacteria had significant reductions (p < 0,05) on the third, sixth and ninth days of storage, at both temperatures of application and after the doses were applied (zero day) for the application at 25 °C. Regarding the total aerobic mesophilic bacteria, application of UV-C radiation at 5 °C, provided shelf-life of carcasses of 9 days of storage, whereas at 25 °C, the shelf-life was 6 days. The number of colonies of psychrotrophic bacteria had significant decreases (p < 0,05) in all days of storage when applied the dose of 9,46 kJ/m2 at 5 °C, and only on the third and on the twelfth days when applied at 25 °C. At the sixth day, the number of colonies of psychrotrophic bacteria was characteristic of deterioration, regardless the treatment applied. The molds and yeasts were not affected by UV-C radiation. Generally, in a same temperature of application, the UV-C radiation doses didn t cause significant changes (p > 0,05) compared to the samples from the control group (without irradiation) in any of the physicochemical parameters, independent of the day of storage. The application of UV-C radiation at 25 °C compared to 5 °C, promoted higher formation of conjugated dienes and lower amount of omega-6 and omega-3 polyunsaturated fatty acids. Thus, the UV-C radiation could be applied in industry after the step of cooling carcass (at 5 °C) due to the non-acceleration of initiation of lipid oxidation, the non-diminishing of essential fatty acids and being effective on the reduction of aerobic mesophilic and psychrotrophic bacteria. / Durante a linha de abate de frangos, algumas etapas são consideradas críticas, devido à possibilidade de contaminação cruzada entre as carcaças, o que influencia diretamente na vida útil das mesmas. Novas tecnologias que venham a reduzir as contagens microbianas, levando ao aumento da qualidade e vida útil das carcaças são muito bem-vindas. A radiação ultravioleta-C (UV-C) aparece como uma alternativa, pois é um método não térmico, de baixo custo e de fácil aplicação, que já se mostrou letal para vários micro-organismos em superfícies de alimentos. Desta forma, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o uso de doses de radiação UV-C de 5,4 e 9,46 kJ/m2, aplicadas em duas temperaturas próximas as de etapas do abate (5 e 25 °C), sobre os parâmetros físico-químicos (cor, pH, teor de dienos conjugados, índice de peróxidos, substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico e perfil de ácidos graxos) e microbiológicos (bactérias mesófilas aeróbias totais, psicrotróficas e bolores e leveduras) em sobrecoxas de frangos. As análises foram realizadas logo depois de aplicadas as doses (zero dia) e de 3 em 3 dias, durante 12 dias de armazenamento a 5 °C, sendo que o perfil de ácidos graxos foi analisado logo depois de aplicadas as doses e no 6º e 12º dias. O número de colônias das bactérias mesófilas aeróbias totais teve reduções significativas (p < 0,05) no 3º, 6º e 9º dias de armazenamento, em ambas as temperaturas de aplicação e logo depois de aplicadas as doses (zero dia) para a aplicação a 25 °C. Em relação às bactérias mesófilas aeróbias totais, a aplicação da radiação UV-C a 5 °C proporcionou tempo de vida útil das carcaças de 9 dias de armazenamento, enquanto que na aplicação a 25 °C, o tempo de vida útil foi de 6 dias. O número de colônias de bactérias psicrotróficas teve reduções significativas (p < 0,05) em todos os dias de armazenamento quando aplicada a dose de 9,46 kJ/m2 a 5 °C, e somente no 3° e 12° dias, quando aplicada a 25 °C. A partir do 6° dia de armazenamento, o número de colônias de bactérias psicrotróficas foi característico de deterioração, independente do tratamento aplicado. Os bolores e leveduras não foram afetados pela radiação UV-C. De maneira geral, em uma mesma temperatura de aplicação, as doses de radiação UV-C não causaram modificações significativas (p > 0,05) em relação às amostras pertencentes ao grupo controle (sem irradiação) em nenhum dos parâmetros físico-químicos, independente do dia de armazenamento. A aplicação da radiação UV-C a 25 °C em relação a 5 °C, promoveu maior formação de dienos conjugados e um menor teor de ácidos graxos poli-insaturados ômega-6 e ômega-3. Dessa forma, a radiação UV-C poderia ser aplicada na indústria após a etapa de resfriamento das carcaças (a 5 °C), devido a não acelerar o início da oxidação lipídica, não diminuir os teores dos ácidos graxos essenciais, e sim apresentar eficiência na redução de bactérias mesófilas aeróbias e psicrotróficas.
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Efeito da suplementação proteica em bovinos consumindo forragens tropicais sobre a degradação da fibra insolúvel, atividade de enzimas fibrolíticas e perfil da comunidade microbiana ruminal / Effect of protein supplementation in cattle fed tropical forages on the degradation of insoluble fiber, activity of fibrolytic enzymes, and rumen microbial communities profile

Reis, William Lima Santiago dos 26 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 614632 bytes, checksum: eac726a0efd1eec87578c9745a474e81 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This work aimed to evaluate the effects of ruminal and/or abomasal protein supplementation in cattle fed tropical forages on nutritional variables, degradation of insoluble fiber, activity of fibrolytic enzymes and rumen bacterial communities profile. Two experiments were carried out sequentially, and in the same way, differing only on the forage quality that was defined based on crude protein content: medium quality (784 g of crude protein/ kg of dry matter) and high quality (986 g of crude protein/ kg of dry matter). Four Nellore young bulls, averaging 227±11 kg body weight and fitted with ruminal and abomasal cannullas, were used. The following treatments were evaluated: control (only forage), ruminal nitrogenous compounds supplementation (daily supply of 230 g of crude protein in the rumen), abomasal nitrogenous compounds supplementation (daily supply of 230 g of crude protein in the abomasum), and ruminal and abomasal nitrogenous compounds supplementation (daily supply of 230 g of protein, being 115 g in the rumen and 115 g in the abomasum). Casein was used as protein source for supplementation and basal diet consisted of Tifton 85 (Cynodon spp) hay. Two 4 x 4 Latin squares experimental trials, balanced for residual effects, with four treatments, four animals and four experimental periods lasting 29 days each, were implemented sequentially, one for each forage as stated above. There were no effects (P>0.05) of supplementation scheme or forage quality on organic matter (OM) intake. On the other hand, neutral detergent fiber (NDF) intake was higher (P<0.05) when animals were fed high quality forage. The total digestibility of OM was increased (P<0.05) by supplementation and by increasing forage quality. The digestibility coefficient of NDF was not affected by supplementation scheme (P>0.05), but was increased by the enhancing in forage quality. The apparent ruminal nitrogen balance (RNB) was increased (P<0.05) when animals were supplemented in rumen or in both rumen and abomasum cannula. It is worth highlighting that no supplementation or exclusively abomasal supplementation led to negative values of RNB. The apparent nitrogen balance (NB) was increased (P>0.05) when high quality forage was fed to the animals and by supplementation, no matter if the supplement was infused into rumen, abomasum or both. Ruminal supplementation enhanced (P<0.05) the concentration of rumen ammonia nitrogen (RAN). Although, animals supplemented in rumen and abomasum or exclusively in abomasum did not exhibit increase in RAN concentrations (P>0.05) when compared to no supplemented animals. The bacterial richness and diversity (Shannon-Wiener index) associated with the solid phase of rumen digesta were not affected (P>0.05). However, richness and diversity associated with the liquid phase were increased (P<0.05) by the improvement in forage quality. NDF degradation rate (kp) was enhanced (P<0.05) by ruminal supplementation. Carboximetilcellulase activity was decreased (P<0.05) by the abomasal and ruminal/abomasal supplementation. Xylanase activity was decreased (P<0.05) by both post-ruminal supplementation schemes, when high quality forage was fed to the animals. It was not detected correlations among variables associated with bacterial diversity and activity and variables associated with nutritional performance, excepted for the positive correlation between kp and RNB Clustering analyses based on the Unweighted Pair Group Method (UPGMA) evidenced that distinct bacterial communities are associated with liquid and solid fraction, independently of the forage quality. Clustering analyses also showed that forage quality affects the diversity of liquid phase associated bacteria, even though, effects on solid phase was not clear. None of the evaluations related to the microbial community were able to detect clear effects of supplementation on the microbial community diversity. Improving forage quality enhances fiber digestibility, nitrogen balance and modifies the bacterial community associated with liquid phase. On the other hand, protein supplementation enhances the nitrogen retention in animal body. / Objetivou-se avaliar os efeitos da suplementação proteica ruminal e/ou abomasal em bovinos consumindo forragens tropicais sobre as características nutricionais, a atividade enzimática fibrolítica, a degradação in vitro da fibra insolúvel e o perfil da comunidade bacteriana ruminal. Dois experimentos foram realizados sequencialmente diferindo apenas na qualidade do feno ofertado, sendo de média qualidade (78,4 g de proteína bruta/kg de matéria seca) e alta qualidade (98,6 g de proteína bruta/kg de matéria seca), respectivamente. Os procedimentos experimentais foram os mesmos para ambas as forragens. Foram utilizados quatro novilhos Nelore, não castrados, com peso corporal médio de 227±11 kg, fistulados no rúmen e no abomaso. Foram avaliados os seguintes esquemas de suplementação: controle (somente forragem); suplementação nitrogenada ruminal (fornecimento diário de 230 g de proteína suplementar no rúmen); suplementação nitrogenada abomasal (fornecimento diário de 230 g de proteína suplementar no abomaso) e suplementação nitrogenada ruminal e abomasal (fornecimento diário de 230 g de proteína suplementar, sendo 115 g no rúmen e 115 g no abomaso). A alimentação volumosa basal foi constituída por feno de tifton 85 (Cynodon spp) e como fonte de compostos nitrogenados suplementares foi utilizada a caseína (caseína pura, Labsynth). O experimento foi conduzido segundo delineamento em quadrado latino 4 x 4 balanceado para efeitos residuais, sendo dois quadrados sequenciais, um para cada forragem, com quatro esquemas de suplementação, quatro animais e quatro períodos experimentais com 29 dias em cada quadrado. Não foram observados efeitos (P>0,05) da qualidade da foragem ou do esquema de suplementação sobre o consumo de matéria orgânica (MO). Por outro lado, o consumo de fibra em detergente neutro (FDN) foi superior (P<0,05) quando forragem de alta qualidade foi ofertada aos animais. O coeficiente de digestibilidade total da MO foi incrementado (P>0,05) pela suplementação e pela melhoria na qualidade da forragem. O coeficiente de digestibilidade da FDN não foi afetado pelo esquema de suplementação (P>0,05), mas foi superior quando os animais receberam forragem de alta qualidade (P<0,05). O balanço aparente de compostos nitrogenados no rúmen (BNR) foi ampliado (P<0,05) pela suplementação no rúmen e no rúmen-abomaso. Ressalta-se que a ausência de suplementação ou a suplementação exclusiva no abomaso proporcionam valores negativos de BNR. O balaço aparente de compostos nitrogenados no organismo animal foi ampliado (P<0,05) pelo fornecimento de suplemento, independentemente do local de suplementação, e pelo fornecimento de forragem de melhor qualidade A suplementação no rúmen incrementou (P<0,05) a concentração de nitrogênio amoniacal ruminal (NAR). Por outro lado, animais recebendo suplementação no rúmen e abomaso ou exclusivamente no abomaso apresentaram concentrações de NAR similares (P>0,05) a animais não suplementados. A riqueza e a diversidade microbiana da fase sólida da digesta ruminal não foram afetadas (P>0,05). Entretanto, a riqueza e a diversidade bacteriana associada à fase líquida da digesta ruminal foram incrementadas (P<0,05) pela melhoria na qualidade da forragem. A taxa de degradação da FDN foi ampliada (P<0,05) pela suplementação no rúmen. A atividade da carboximetilcelulase foi reduzida (P<0,05) pela suplementação no abomaso e rúmen-abomaso. A atividade da xilanase foi deprimida (P<0,05) pela suplementação pós-ruminal somente quando forragem de alta qualidade foi fornecida aos animais. Não foi observada correlação (P>0,05) entre as variáveis associadas à atividade enzimática e diversidade microbiana e as características ligadas ao desempenho nutricional, exceção feita à correlação positiva (P<0,05) entre a taxa de degradação da FDN e o BNR. A avaliação multivariada da diversidade permitiu evidenciar que comunidades bacterianas distintas estão associadas às frações líquida e sólida, independente da qualidade da forragem ofertada. Percebeu- se que a variação na qualidade da forragem influencia a diversidade microbiana associada à fração líquida do fluido ruminal, embora não tenha exercido tal efeito sobre a fração sólida. Em nenhuma avaliação percebeu-se efeito claro do esquema de suplementação sobre o perfil da comunidade microbiana ruminal. A melhoria da qualidade da forragem amplia a digestibilidade da fibrae a retenção de nitrogênio e é capaz de modificar a comunidade bacteriana associada à fração liquida do conteúdo ruminal. A suplementação proteica, por sua vez, independentemente do local de suplementação, amplia a retenção de nitrogênio no organismo animal.
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Avaliação da qualidade da Apitoxina de Apis mellifera e sua estabilidade na formulação de uso tópico. / Evaluation of Apis mellifera Apitoxin quality and its stability in topical formulation.

ABRANTES, Allyson Fortunato de. 25 April 2018 (has links)
Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-04-25T14:31:12Z No. of bitstreams: 1 ALLYSSON FORTUNATO DE ABRANTES - DISSERTAÇÃO PPGSA 2015..pdf: 1275565 bytes, checksum: 5e0019b5b460441a322e5e237b8eac1c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-25T14:31:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ALLYSSON FORTUNATO DE ABRANTES - DISSERTAÇÃO PPGSA 2015..pdf: 1275565 bytes, checksum: 5e0019b5b460441a322e5e237b8eac1c (MD5) Previous issue date: 2015 / O veneno da abelha, a apitoxina, consiste de uma mistura complexa de compostos nitrogenados, constando de uma maior parte proteica(Melitina) e menor fração por: Apamina, adolapina, fosfolipase A2, hialuronidase e peptídeos MCD. Trata-se de um líquido transparente, com odor característico, amargo e que apresenta pH básico (4,5 a 5,5), usado pelas abelhas como elemento de defesa e que seca facilmente em temperatura ambiente. A Melitina é o componente predominante no veneno apresentando, aproximadamente, 50 % da matéria seca, trata-se de uma proteína de elevado potencial anti-inflamatório, sendo considerada o principal agente da apitoxina na terapia da artrite reumática. Junto com a apamina, a melitina estimula os sistemas adrenal e pituitário a produzirem cortisol e outros esteroides naturais, que tem relevante papel na terapia da artrite, bem como na indústria cosmecêutica. A apitoxina foi coletada no apiário El-Shaday, Assentamento Rosário, Agrovila Canudos do município de Ceará-Mirim/RN, a coleta da amostra se deu utilizando o método de choques elétricos através de eletrodos de aço inox conectados a uma bateria e lâminas de vidro posicionado no alvado da colmeia que retêm a apitoxina após a picada da abelha. O apiário produz dois tipos de apitoxina, classificada como tipo 01, pura, e tipo 02, beneficiada. Foram realizados testes de citotoxicidade, quantificação proteica e eletroforese, em ambas as amostras, a fim de avaliá-las e comparar os dois tipos de apitoxina.Na apitoxina 01 foi realizada a concentração inibitória mínima. As amostras também foram incorporadas em duas bases dermatológicas, Gel carbopol® e Emulsão aniônica para que fossem avaliadas a estabilidade Preliminar e Acelerada das formulações.A apitoxina tipo 01, apresentou 77,83% de proteínas, uma concentração inibitória mínima a partir de 1,0% e toxicidade de 962,60 µg/mL; Os testes na apitoxina 02 apresentaram um teor proteico de 51,87% e uma citotoxicidade 154,82 µg/mL resultados possivelmente afetados pela contaminação ainda presente neste tipo de amostra após o beneficiamento. A eletroforese demonstrou que a apitoxina apresenta o mesmo perfil proteico, independente do processo de extração. Porém, a apitoxina tipo 02, aponta a diferença de uma unidade que não se revelou neste produto. As formulações mantiveram-se estáveis durante todo período de avaliação de sua estabilidade, 90 dias, onde foram avaliados pH, viscosidade, caracteres organolépticos, espalhabilidade, nas três diferentes condições de armazenamento: temperatura ambiente, 5 °C e 40 °C, exceção feita à emulsão aniônica conservada à 40 °C em que perdeu estabilidade a partir do trigésimo dia. / The bee venom, the apitoxin, is a complex mixture of nitrogenous compounds, having largely represented by melittin protein and a smaller fraction consisting of: Apamin, adolapina, phospholipase A2, hyaluronidase and peptides MCD. It is a transparent liquid, with characteristic odour, bitter and that presents basic pH (4.5 to 5.5), used by bees as a defense and that dry easily at room temperature. The Melittin is the predominant component in poison showing approximately 50% of the dry matter, it is a high protein anti-inflammatory potential, being considered the main agent of apitoxin on rheumatic arthritis therapy. Along with the apamin, melittin stimulates the adrenal and pituitary systems to produce cortisol and other steroids, which has important role in arthritis therapy, as well as in the cosmeceutical industry. The apitoxin was collected in the Apiary El-Shaday, Settlement, Agrovila Straws of municipality of Ceara – Mirin/ RN. sample collection occurred using the method of electric shocks through electrodes of stainless steel connected to a battery and glass blades positioned at the hive entrance of the hive that retain the apitoxin after bee sting. The Apiary produces two types of apitoxin, classified as type 01, pure, and type 02 milled. Cytotoxicity tests were performed, and protein quantification in both samples in order to evaluate them and compare the two types of apitoxin, on 01 was still held the apitoxin minimum inhibitory concentration. The samples were also incorporated into two bases, carbopol Gel ® skin and anionic emulsion for primary and Accelerated stability evaluated formulations. The apitoxin type 01, 77.83% protein, introduced a minimum inhibitory concentration from 1% and toxicity of 962.60 µ g/mL; Tests on apitoxin 02 presented a protein content of 51.87% and a cytotoxicity 154.82 µ/mL results possibly affected by the contamination still present in this sample type after the processing. Electrophoresis showed that apitoxin features the same protein profile, regardless of the extraction process. However, the apitoxin 02 type, presents the difference in a unit that didn't report revealed in this product. The wording remained stable throughout assessment period of its stability, 90 days, where they were evaluated pH, viscosity, organoleptic characters, spreadability, in three different storage conditions: room temperature 5° C and 40° C, except the anionic emulsion stored at 40° C that lost stability from the 30th day.
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Estudo proteômico de variedades de milho (Zea mays L.) obtidas por melhoramento clássico e por recombinação genética / Proteomic study of maize (Zea mays L.) varieties obtained by classical breeding and genetic recombination.

Priscila Robertina dos Santos-Donado 16 December 2016 (has links)
O melhoramento genético clássico de sementes milho (Zea mays L.) permitiu desenvolver inúmeras variedades, incluindo o milho com qualidade proteica melhorada (Quality Protein Maize, QPM), que visava aumentar os teores proteicos e as propriedades nutricionais. Por outro lado, novas variedades comerciais foram obtidas por vegetais geneticamente modificados (GM), com foco em parâmetros agronômicos. Em ambos os casos, a segurança dessas variedades para uso como alimento é uma das principais preocupações dos desenvolvedores e dos órgãos de regulamentação. A Equivalência Substancial é a base do sistema de avaliação da segurança de culturas geneticamente modificadas, no entanto alterações na expressão de proteínas não são devidamente analisadas e esclarecidas. As abordagens proteômicas complementam as técnicas de avaliação de biossegurança para alimentos GM, bem como permitem investigar possíveis efeitos indesejáveis derivados do melhoramento clássico. Os objetivos do presente estudo foram caracterizar e comparar os perfis proteicos de variedades de milhos convencionais melhorados (QPM) e geneticamente modificados (GMs), contra suas respectivas linhas convencionais utilizando técnicas proteômicas como eletroforese bidimensional (2-DE) e bottom up shotgun (gel-free). Num primeiro estudo, foram utilizadas três amostras de milho, sendo duas variedades convencionais com QPM (QP1 e QP2) e uma variedade convencional normal (CN). No segundo estudo, foram analisadas duas cultivares de milho GM (GM1 e GM2) e seus respectivos convencionais genitores (CG1 e CG2). As composições químicas de todas as amostras também foram avaliadas quanto a Equivalência Substancial. O extrato bruto proteico foi submetido à análise de eletroforese unidimensional (1-DE), bidimensional (2-DE) e bottom up shotgun (gel-free). As imagens dos mapas proteicos foram analisadas pelo software Image Master 2D Platinum 7.0 (GE). Os spots diferencialmente expressos e selecionados foram sequenciados por MS. Pela composição química das principais frações das amostras de milho foi possível identificar a equivalência substancial entre as amostras convencionais e GMs, bem como QPMs e sua convencional dentro das faixas de variabilidade esperadas da espécie. Nos géis 1-DE foram observadas bandas proteicas com perfis similares entre os grupos de amostras avaliadas para ambos estudos. Nas imagens dos géis 2-DE não houveram alterações extremas entre as amostras de milhos GMs e seus respectivos convencionais genitores (CGs), mas apenas diferenças na intensidade dos spots proteicos. As variedades QPMs e CN apresentaram diferenças devido à distribuição dos spots. Os mapas proteicos das amostras CG1 x GM1 e CG2 x GM2 apresentaram maior semelhança com porcentagens de matchings superiores a 70 %, enquanto as porcentagens de matchings entre variedades diferentes (QPMs e CN) foram menores. No total foram identificadas 219 proteínas das amostras CGs x GMs e QPMs x CN, classificadas quanto aos seus processos biológicos e função molecular. Em conclusão, foram encontradas diferenças entre os cultivares GMs e CGs, indicando uma variação normal entre variedades de milho, que não comprometem a segurança alimentar das amostras estudadas. Quanto às amostras com QPM e CN as diferenças encontradas são devido à sua distância nas linhagens ou germoplasma. / The classic genetic breeding of corn seeds (Zea mays) has enabled the development of many varieties, including corn with improved protein quality (Quality Protein Maize, QPM), which aimed to increase protein levels and nutritional properties. On the other hand, new commercial varieties have been obtained out of genetically modified (GM) vegetables, with a focus in agronomic parameters. In both cases, the safety of these varieties for food use is one of the main concerns for the developers and for the regulatory agencies. Substantial Equivalence is the basis of the safety evaluation system for genetically modified crops, however, alterations in the protein expressions are not been properly analyzed and clarified. The protein approaches complement the techniques of biosafety evaluation for GM foods, as well as allow for possible undesirable effects derived from classic improvement to be investigated. The goals of the current studies were to characterize and compare the protein profiles of the different varieties of conventionally improved (QPM) and genetically modified (GM) corn, against their respective conventional lines using proteomic techniques, such as, two-dimensional electrophoresis (2-DE), bottom up shotgun (gel-free) and masses spectrometry (MS). In a first instance of the study, three samples of corn were used, two of conventional varieties with QPM (QP1 and QP2) and one conventional normal variety (CN). In a second instance of the study, two cultures of GM corn (GM1 and GM2) were analyzed and their respective conventional genitors (CG1 and CG2). The chemical compositions of all the samples were also evaluated for their Substantial Equivalence. The protein raw extract was submitted to analysis of one-dimensional (1-DE), two-dimensional (2-DE) electrophoresis, and bottom up shotgun (gel-free). The protein image maps were analyzed by the Image Master 2D Platinum 7.0 (GE) software. The spots which were expressed and selected differentially were sequenced by MS. By the chemical composition of the main fractions of the samples of corn, it was possible to identify the substantial equivalence between the conventional samples and GMs, likewise with OPMs and their conventional in the ranges of variability which were expected for the species. On the 1-DE gel, it was observed protein bands with similar profiles amongst the groups of evaluated samples for both studies. In the images of the 2-DE gel, there were no alterations between the GM corn and their respective conventional genitors (CGs), but only differences in intensity of the protein spots. The OPM and CN varieties presented differences due to the distribution of the spots. The protein maps of samples CG1 vs. GM1 and CG2 vs. GM2 presented greater similarities with the percentages of matchings superior to 70%, while the percentage of matchings among different varieties (QPMs and CN) were smaller. In total, there were 219 proteins identified in the samples CGs vs. GMs and QPMs vs. CN, classified by the biologic processes and molecular function. In conclusion, there were found differences between the cultures of GMs and CGs, indicating a normal variation among the corn varieties, which do not affect the food security of the studied samples. As per the samples with QPM and CN, the differences found were due to the line distances or germplasm.
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RELAÇÃO DA METIONINA MAIS CISTINA COM A LISINA EM RAÇÕES PARA ALEVINOS DE TAMBAQUI (Colossoma macropomum) / RELATION OF THE METHIONINE PLUS CYSTINE WITH LYSINE IN FEED FOR TAMBAQUI (Colossoma Macropomum) FINGERLINGS

Souza, Flávio Oliveira 27 March 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-17T17:11:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_FLAVIO OLIVEIRA SOUZA.pdf: 1270083 bytes, checksum: 64eb72657a650bd6843728d330a5761e (MD5) Previous issue date: 2014-03-27 / The aim was to determine the methionine plus cystine with lysine ratio in diets for tambaqui (Colossoma macropomum) fingerlings. Six hundred tambaqui fingerlings of two distinct initial weights, 0.28 ± 0.08g and 0.94 ± 0.33g, were used in an experiment with randomised block design (criterion dependent upon initial average weight) composed of six treatments, five repetitions in two blocks and twenty fish per experimental unit. The treatments consisted of six experimental diets isolysinic digestible (1.45%), isoenergetic, isophosphorus and isocalcium containing different methionine plus cystine with digestible lysine ratio (50, 55, 60, 65, 70 and 75%). The fish were kept in 1,000 litre polyethylene tanks, equipped with individual aeration and water supplies, and were fed ad libitum in six daily meals for 45 days. Performance parameters, body composition, protein and body fat deposition and the efficiency nitrogen retention of the fishes were evaluated. The increase of the dietary digestible methionine plus cystine:lysine ratio in the diet affected the specific growth rate, feed:gain ratio, digestible methionine plus cystine intake and the body fat of the fishes. The effects were quadratic for the first two, with these variables improving up to methionine plus cystine:lysine ratio of 64.4% and 64.8%. The digestible methionine plus cystine intake increased and body fat decreased linearly with increase of methionine plus cystine:lysine ratio. The methionine plus cystine with lysine digestible ratio recommended in diets for tambaqui fingerlings is 64.8%, which corresponds the level of digestible methionine plus cystine of 0.94% (0.313% Mcal of ED). / Objetivou-se determinar a relação da metionina mais cistina com a lisina em rações para alevinos de tambaqui (Colossoma macropomum). Foram utilizados 600 alevinos de tambaqui de dois pesos iniciais distintos, 0,28 ± 0,08g e 0,94 ± 0,33g, em experimento com delineamento em blocos ao acaso (critério em função do peso médio inicial), composto por seis tratamentos, cinco repetições em dois blocos, e vinte peixes por unidade experimental. Os tratamentos consistiram de seis rações experimentais isolisínicas digestíveis (1,45%), isoenergéticas, isofosfóricas e isocálcicas, contendo diferentes relações de metionina mais cistina com a lisina digestível (50, 55, 60, 65, 70 e 75%). Os peixes foram mantidos em caixas de polietileno de 1.000 litros dotados de abastecimento de água e aeração individuais, e foram alimentados ad libitum em seis refeições diárias durante 45 dias. Avaliaram-se parâmetros de desempenho, composição corporal, deposição de proteína e gordura corporais e eficiência de retenção de nitrogênio dos peixes. O aumento da relação de metionina mais cistina:lisina digestível da dieta influenciaram na taxa de crescimento específico, na conversão alimentar, no consumo de metionina mais cistina digestíveis e no teor de gordura corporal dos peixes. Os efeitos foram quadráticos para as duas primeiras, melhorando essas variáveis até a relação metionina mais cistina:lisina digestível de 64,4% e 64,8%. O consumo de metionina mais cistina digestível aumentou e o teor de gordura corporal reduziu linearmente com a elevação da relação metionina mais cistina:lisina digestível. A relação metionina mais cistina com a lisina digestível recomendada nas rações para alevinos de tambaqui é de 64,8%, que corresponde ao nível de metionina mais cistina digestível de 0,94% (0,313% Mcal de ED).

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