Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciencias Agrarias / Made available in DSpace on 2012-10-16T05:19:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Em piscicultura intensiva é necessário se fazer a segunda alevinagem para garantir um maior índice de sobrevivência no período de engorda. O presente trabalho procurou determinar a densidade de estocagem, neste período de alevinagem onde foram testadas quatro densidades 24, 34, 44 e 54 alevinos por 1,6 m3 nos períodos de estiagem e chuvoso durante 50 dias. Utilizou-se o método estatístico de parcelas subdivididas por um delineamento em blocos com quatro tratamentos e quatro repetições. Estimou-se também as relações para cada densidade entre: peso total médio e comprimento total médio , fator de condição com o tempo; taxa de crescimento específico de Ricker em função dos parâmetros químicos da água, a taxa de crescimento instantânea em função do tempo e a estimativa de densidade ótima na segunda fase do crescimento através de interseção gráfica.

The activity of creation of aquatic organisms in the country is hopeful and caring for the environment provide the best quality production. The objective this study was to evaluate water quality in supply channels with cultured tambaqui (Colossoma macropomum). We used a supply channel 35 meters long, which has a trapezoidal shape, cut with wire mesh and PVC coated zinc. Two studies, the initial experiment determined the rates of stocking density on tambaqui culture system (duration of 40 days), then the characterization of the effluent arising from the cultivation of tambaqui in channels using biofilters containing E. crassipes lasting 60 days. In both experiments, were monitored physico-chemical water. In the first experiment, the analysis performed by an ANOVA and Tukey test (p <0.05) showed that water quality in the supply channels were not influenced by planting densities, so little tangible changes have occurred in the parameters of fish in different treatments of the study. While the second experiment fori significant differences (p <0.05) between ammonia, alkalinity and hardness of the effluent treatment systems of the two, however it was proven the efficiency of water hyacinth in the removal of nutrients such as phosphorus, which recommended the its use in farming systems. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / A atividade de criação de organismos aquáticos é bastante promissora e necessita de certos cuidados a fim de produzir alimento de melhor qualidade, com menor custo e em áreas onde se emprega as boas práticas de manejo. Com o intuito de diminuir as lacunas existentes entre o setor produtivo do pescado em relação ao meio de cultivo ambientalmente sustentável, o presente trabalho tratou de avaliar e proporcionar uma melhor qualidade de água em canais de abastecimento com cultivo de tambaqui (Colossoma macropomum). Inicialmente foi utilizado um canal com 35 metros de extensão, que apresenta um formato trapezoidal, seccionado com telas de arame revestido por zinco e PVC. Os estudos foram conduzidos em duas etapas; o experimento inicial determinou as taxas de densidade de estocagem do tambaqui com duração de 40 dias. Em etapa posterior, foi testada a inclusão de biofiltros contendo E. crassipes com intuito de caracterizar o efluente decorrente do cultivo, este último com duração de 60 dias. Em ambos experimentos, foram monitoradas as variáveis físico-química da água. No primeiro experimento as análises realizadas por meio de uma ANOVA e teste de Tukey (p<0,05) comprovaram que a qualidade de água nos canais de abastecimento não foram influenciadas pelas densidades de cultivo, tão pouco ocorreram mudanças nos parâmetros corpóreos dos peixes nos diferentes tratamentos do estudo. Enquanto que o segundo experimento foi constatadas diferenças significativas (p<0,05) entre a amônia, alcalinidade e dureza do efluente dos dois sistemas de tratamento, contudo foi comprovado a eficiência do aguapé na remoção de nutrientes como o fósforo, sendo recomendado, o seu uso em sistemas de criação.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:23:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6679.pdf: 3490417 bytes, checksum: 3ca7a309845b565437be8c6bf262582c (MD5) Previous issue date: 2015-03-05 / Financiadora de Estudos e Projetos / The cardiovascular system plays the fundamental role of supplying the needs of the animals bodily tissues. It both provides the cells with a variety of elements that are essential to their functioning and drains potentially harmful substances, such as metabolites. All of these items are transported through the blood, the propulsion of which is determined by the pressure gradient created by the heart. In addition to promoting circulation, blood pressure is also directly involved in the maintenance of many other physiological processes, making the preservation of this variable at satisfactory levels a prerequisite for an organism s vitality. In light of this need for ideal pressure levels, important mechanisms for blood pressure regulation have been selected during the evolutionary history of vertebrates, and the baroreflex serves as a clear example. These reflexes begin with the monitoring of arterial pressure by baroreceptors, which constantly inform the central nervous system (CNS) of the condition of this variable. The CNS is thus able to change heart rate and systemic vascular resistance in order to normalize arterial pressure when necessary. Though the operation of the baroreflex is already widely understood and though baroreceptors have been located in mammals, these issues are not elucidated and remain quite controversial when it comes to fishes. Thus, the objective of this work was to locate the baroreceptors and their afferences in a teleost, the Colossoma macropomum. To do so, the occurrence and efficiency of the baroreflex were analyzed when this mechanism was induced by pressure imbalancements in intact fish (IN), fish with the first pair of gill arches denervated (G1) and fish with all four pairs of gill arches denervated (G4). The pressure imbalancements were promoted by the administration of the &#945;1-adrenergic agonist phenylephrine and the &#945;1-adrenergic antagonist prazosin, and the baroreflex was assessed using an electrocardiogram that measured heart rate (bpm), relation between pre- and post-pharmacological manipulation heart rates (%), the time required to reach maximum chronotropic baroreflex response, and total heart rate variability (ms). The results revealed that the barostatic reflex was attenuated in the G1 group and nonexistent in G4 group indicating that baroreceptors may be exclusively located in the gill arches of teleosts. / O sistema cardiovascular possui a fundamental função de suprir as necessidades dos tecidos corporais dos animais, fornecendo às células diversos elementos essenciais a seu funcionamento e drenando substâncias potencialmente nocivas (metabólitos). Todos esses fatores são transportados por meio do sangue, o qual tem sua propulsão determinada por um gradiente de pressão criado pelo coração. Além de promover a circulação, a pressão sanguínea também é diretamente relacionada à manutenção de vários outros processos fisiológicos, fazendo com que a preservação dessa variável em níveis satisfatórios seja pré-requisito para a vitalidade de um organismo. Frente a essa necessidade de valores pressóricos ideais, importantes mecanismos reguladores da pressão sanguínea foram selecionados durante a história evolutiva dos vertebrados, e como importante exemplo temos o barorreflexo. Tal reflexo se inicia com o monitoramento da pressão arterial pelos barorreceptores, os quais informam constantemente a condição dessa variável ao sistema nervoso central, o qual é capaz de alterar a frequência cardíaca e a resistência vascular sistêmica de modo a normalizar rapidamente a pressão arterial caso seja necessário. Enquanto o funcionamento do barorreflexo já foi amplamente entendido e os barorreceptores pontualmente localizados em mamíferos, essas questões encontram-se pouco elucidadas e controversas em peixes, originando o objetivo do presente trabalho: localizar os barorreceptores e suas aferências em um teleósteo, o Colossoma macropomum. Para isso, foram analisadas a ocorrência e a eficiência do barorreflexo induzido por desbalanceamentos pressóricos em peixes intactos (IN), com o primeiro par de arcos branquiais desnervados (G1) e com os quatro pares de arcos branquiais desnervados (G4). Os desbalanceamentos pressóricos foram promovidos por meio da administração do agonista &#945;1-adrenérgico fenilefrina e do antagonista &#945;1-adrenérgico prazosina, e o barorreflexo foi avaliado utilizando-se um eletrocardiograma que permitiu a derivação da frequência cardíaca (bpm), da relação entre a frequência cardíaca pré- e pósadministração farmacológica (%), do tempo decorrido até a resposta barorreflexa cronotrópica máxima (s) e da variabilidade total da frequência cardíaca (ms). Os resultados evidenciaram que o reflexo barostático encontrava-se atenuado no grupo G1, ao passo que inexistia no grupo G4 indicando que os barorreceptores localizam-se exclusivamente nos arcos branquiais dos tambaquis e estão distribuídos por todos eles.

The analysis of sperm subpopulations is a relatively new approach that consists of evaluating the coexistence of different sperm grouped by similarity. This characterization allows us to explore the heterogeneity of existing sperm in a semen sample, so it is revealed your fertility potential. The aim of this study was to identify and characterize sperm subpopulations in semen tambaqui (C. macropomum) regarding the kinetics and evaluate its correlation with fertility, as well as analyzing the changes arising from the cryopreservation process in the distribution of sperm subpopulations. 59 767 sperm semen in natura and 50,680 of the thawed sperm of 61 fish through analysis in a computerized system (CASA) were evaluated. The kinetic data generated sperm were tabulated, analyzed, and evaluated relativized by the method of analysis of two-step cluster grouping. For correlation with fertilization, 15 animals with distinct sperm qualities were selected and evaluated for their performance in fertilization from seminal fresh samples. These procedures allowed the identification of three sperm subpopulations in semen in natura tambaqui, two of which are highly correlated with fertility. The first subpopulation corresponded to 28.81% of the total analyzed sperm and it was less abundant. Low values of curvilinear velocity - VCL: 58.92 mM / s, linearity - LIN: 23.15%, straightness - STR: 40.01% and beat cross frequency - BCF: 6.79 Hz characterized the sperm of this subpopulation as slow progressive non-linear and not, where no significant correlation was observed with fertility (r = 0.28). The second subpopulation represented 31.61% of the examined spermatozoa which were classified as rapid, non-linear, non-progressive and high beat cross frequency (LCV: 114.10 mM / s, LIN: 46.77% STR: BCF and 59.17%: 21.49 Hz), high positive correlation was observed with fertility (r = 0.93). Already a subpopulation 3, had a higher percentage of sperm analyzed (39.58%), characterized as fast, linear, progressive and high beat cross frequency (VCL: 134.11 mM / s, LIN: 81.41%, STR : BCF and 86.57%: 26.73 Hz), being also observed high positive correlation with fertility (r = 0.79). After thawing semen tambaqui, we could identify only two sperm subpopulations with distinct heterogeneity. The first subpopulation, representing 33.24% of the analyzed sperm which were characterized as slow, non-linear, non-progressive and low beat cross frequency (VCL: 52.96 mM / s, LIN: 20.70%, STR: and 41.70% BCF: 5,61Hz). The second subpopulation corresponded to 66.76% of the analyzed sperm which were characterized as fast, linear, progressive and high beat cross frequency (VCL: 121.57 mM / s, LIN: 69.02%, STR: 77, and 09% BCF: 26.00 Hz). It is concluded that semen tambaqui has three sperm subpopulations characterized by movement pattern, two of which are represented by rapid sperm directly related to fertility. The cryopreservation process reduces the number of sperm subpopulations and alters the pattern of linearity and progressivity of spermatozoa. / A analise de subpopulacoes espermaticas e uma abordagem relativamente nova que consiste na avaliacao da coexistencia de diferentes espermatozoides agrupados por similaridade. Essa caracterizacao permite explorar a heterogeneidade dos espermatozoides existentes em uma amostra seminal, de forma que seja revelado o seu potencial de fertilidade. O objetivo do presente estudo foi identificar e caracterizar as subpopulacoes espermaticas no semen de tambaqui (C. macropomum) quanto a cinetica e avaliar sua correlacao com a fertilidade, bem como analisar as alteracoes decorrentes do processo de criopreservacao na distribuicao das subpopulacoes espermaticas. Foram avaliados 59.767 espermatozoides do semen in natura e 50.680 espermatozoides do semen descongelado de 61 peixes por meio da analise em sistema computadorizado (CASA). Os dados de cinetica espermatica gerados foram tabulados, analisados, relativizados e avaliados pelo metodo de analise de agrupamento two-step cluster. Para a correlacao com a fertilizacao, 15 animais com qualidades espermaticas distintas, foram selecionados e avaliados quanto ao seu desempenho na fertilizacao a partir de amostras seminais in natura. Esses procedimentos permitiram a identificacao de tres subpopulacoes espermaticas no semen in natura de tambaqui, sendo duas delas, altamente correlacionadas com a fertilidade. A subpopulacao 1 correspondeu a 28,81% do total de espermatozoides analisados e foi a menos abundante. Baixos valores de velocidade curvilinear . VCL: 58,92 Êm/s, linearidade . LIN: 23,15%, retilinearidade . STR: 40,01% e de frequencia de batimento flagelar . BCF: 6,79 Hz caracterizaram os espermatozoides desta subpopulacao como lentos, nao lineares e nao progressivos, onde nao foi observada correlacao significativa com a fertilidade (r= 0,28). A subpopulacao 2, representou 31,61% do total de espermatozoides analisados os quais foram classificados como rapidos, nao lineares, nao progressivos e com alta frequencia de batimento flagelar (VCL: 114,10 Êm/s, LIN: 46,77%, STR: 59,17% e BCF: 21,49 Hz), sendo observada alta correlacao positiva com a fertilidade (r= 0,93). Ja a subpopulacao 3, apresentou maior percentual de espermatozoides analisados (39,58%), caracterizados como rapidos, lineares, progressivos e com alta frequencia de batimento flagelar (VCL: 134,11 Êm/s, LIN: 81,41%, STR: 86,57% e BCF: 26,73 Hz), sendo observada tambem alta correlacao positiva com a fertilidade (r= 0,79). Apos o descongelamento do semen de tambaqui, foi possivel identificar apenas duas subpopulacoes espermaticas com homogeneidades distintas. A subpopulacao 1, representou 33,24% dos espermatozoides analisados os quais foram caracterizados como lentos, nao lineares, nao progressivos e com baixa frequencia de batimento flagelar (VCL: 52,96 Êm/s, LIN: 20,70%, STR: 41,70% e BCF: 5,61Hz). A subpopulacao 2 correspondeu a 66,76% dos espermatozoides analisados os quais foram caracterizados como rapidos, lineares, progressivos e com alta frequencia de batimento flagelar (VCL: 121,57 Êm/s, LIN: 69,02%, STR: 77,09% e BCF: 26,00 Hz). Conclui-se que o semen de tambaqui possui tres subpopulacoes espermaticas caracterizadas pelo padrao de movimento, sendo duas delas, representadas por espermatozoides rapidos, diretamente relacionados com a fertilidade. O processo de criopreservacao reduz o numero de subpopulacoes espermaticas e altera o padrao de linearidade e progressividade dos espermatozoides.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-24T13:07:49Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Irani S. Morais.pdf: 958348 bytes, checksum: 4cb82461a30de956c21e1bd20e3cd847 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-24T13:08:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Irani S. Morais.pdf: 958348 bytes, checksum: 4cb82461a30de956c21e1bd20e3cd847 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-01-24T13:08:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Irani S. Morais.pdf: 958348 bytes, checksum: 4cb82461a30de956c21e1bd20e3cd847 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-24T13:08:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Irani S. Morais.pdf: 958348 bytes, checksum: 4cb82461a30de956c21e1bd20e3cd847 (MD5) Previous issue date: 2016-09-12 / Não há. / A aquicultura é uma das atividades agropecuárias que mais cresce no Brasil e no mundo. Na Amazônia, possui grande potencial devido à importância natural dos peixes na alimentação das populações humanas locais, que sempre os tiveram em abundância e variedade. Nas últimas décadas, o crescimento dos centros urbanos, principalmente Manaus, e o aumento da pressão de captura sobre os estoques naturais foram fatores responsáveis pela diminuição da fartura de peixes na região. Dessa forma, a piscicultura vem crescendo para suprir essa demanda e com isso gerando emprego e renda para as comunidades rurais. Como consequência do cultivo, surge a necessidade de melhoria e rapidez no processo de criação de peixes, usando técnicas que viabilizem o cultivo em menor tempo e em maior eficiência (produção por área de cultivo). Com a finalidade de fornecer conhecimentos básicos que possam auxiliar o desenvolvimento de novas tecnologias para a piscicultura regional e nacional, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a influência da temperatura e pH na determinação de machos e fêmeas de tambaqui. Para isso, os referidos fatores físicos foram controlados em laboratório e foram realizados dois experimentos independentes, um para pH (6,5, 7,5 – controle e 8,5) e outro para temperatura (26, 28 – controle e 30 ºC), com dois ensaios em cada um. As larvas de tambaqui (12 dpe) foram mantidas nos tratamentos até atingirem 4 cm de comprimento padrão, quando foram transferidas para tanques rede até alcançarem o tamanho de sexagem. Com base em avaliações histológicas das gônadas, o tratamento de pH ácido produziu mais machos que o tratamento controle (pH 7,5). A temperatura de 26 ºC mostrou-se inviável experimentalmente pela alta mortalidade dos animais. A temperatura mais elevada apresentou uma tendência em aumentar a proporção de machos no lote. O resultado do trabalho sugere que o pH ácido (6,5) pode influenciar na proporção de machos e fêmeas em tambaqui, com maior número de machos. Os dados certamente poderão contribuir para o avanço do conhecimento sobre a biologia do desenvolvimento do tambaqui, servindo de apoio às pesquisas aplicadas, como em estudos sobre efeitos do aquecimento global, evolutivos, ecologia da espécie e biotecnologia.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-30T11:49:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Mayanny Carla de Carvalho Lima - 2014.pdf: 1796303 bytes, checksum: c0641cf70a66e7b2a235ae25a90eadf7 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-30T14:44:16Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Mayanny Carla de Carvalho Lima - 2014.pdf: 1796303 bytes, checksum: c0641cf70a66e7b2a235ae25a90eadf7 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-30T14:44:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Mayanny Carla de Carvalho Lima - 2014.pdf: 1796303 bytes, checksum: c0641cf70a66e7b2a235ae25a90eadf7 (MD5) Previous issue date: 2014-08-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Knowing fish embryonic and larval development is essential to understand species biology, supply chain development and studies of breeding and reproduction of fish technology. This study aimed was to describe Tambaqui (Colossoma macropomum), pirapitinga (Piaractus brachypomus) and its hybrid tambatinga (♀C. Macropomum x ♂ P. brachypomus). embryonic and larval development. The experiment was conducted in Buritizal Fish Farm, located in Palmeiras de Goiás district. It was used three Tambaqui females, three pirapitinga females, five males tambaqui and five pirapitinga in reproductive age. Reproduction was performed by hormonal induction. Eggs were incubated in vertical incubators of 200L water capacity. Sampling took place at pre-determined time from the moment of extrusion of oocytes to 84 hours after fertilization. Samples were fixed in formalin buffered saline to 10% immediately after collection, and examined under a stereomicroscope. Tambaqui and pirapitinga females produced spherical, non-adhesive, translucent oocytes. During embryonic development stage of the zygote, cleavage, morula, blastula, gastrula, organogenesis and hatching were observed. The vegetative pole remained undivided throughout embryonic development, characterizing segmentation type meroblastic discoidal, typical egg yolk with large amounts. Pirapitinga and tambaqui eggs hatched 15 hours or 422 hours-degree after fertilization, tambatinga hybrid eggs hatched 14 hours or 394 hours-degree after fertilization, at an average temperature of 28.13 ± 0,06ºC. Parental species and hybrid under study showed characteristic embryonic and larval of telolecithal fish with eggs, wherein the newly hatched larvae, has not yet fully formed, all organic systems, limited to a few organs, and depending on the yolk for nourishment . No morphological difference in embryonic and larval development of hybrid tambatinga regarding parental species was observed. / O conhecimento do desenvolvimento embrionário e larval dos peixes é essencial para o entendimento da biologia das espécies, desenvolvimento da cadeia produtiva e estudos de melhoramento genético e de tecnologia da reprodução de peixes. Assim, objetivou-se descrever o desenvolvimento embrionário e larval do tambaqui (Colossoma macropomum), pirapitinga (Piaractus brachypomus) e do seu híbrido tambatinga (♀C. macropomum x ♂ P. brachypomus). O experimento foi realizado na Piscicultura Buritizal, localizada no município de Palmeiras de Goiás. Foram utilizados três fêmeas tambaqui, três fêmeas pirapitinga, cinco machos tambaqui e cinco machos pirapitinga em idade reprodutiva. A reprodução foi realizada através de indução hormonal. Os ovos foram incubados em incubadoras verticais, com capacidade para 200L d’água. As amostragens ocorreram em tempos pré-determinados, desde o momento da extrusão dos ovócitos até 84 horas após a fertilização. As amostras foram fixadas em solução formol salina tamponada a 10% imediatamente após a coleta e analisadas em estereomicróscopio. As fêmeas de tambaqui e pirapitinga produziram ovócitos esféricos, não adesivos e translúcidos. Durante o período de desenvolvimento embrionário foram observadas as fases de zigoto, clivagem, mórula, blástula, gástrula, organogênese e eclosão. O polo vegetativo permaneceu indivisível durante todo o desenvolvimento embrionário, caracterizando o tipo de segmentação meroblástica discoidal, típica de ovos com grandes quantidades de vitelo. Os ovos de tambaqui e pirapitinga eclodiram 15 horas ou 422 horas-grau após a fertilização, já os ovos do híbrido tambatinga eclodiram 14 horas ou 394 horas-grau após a fertilização, à temperatura média de 28,13±0,06ºC. As espécies parentais e o híbrido em estudo apresentaram desenvolvimento embrionário e larval característico dos peixes com ovos telolécitos, na qual a larva recém eclodida, ainda não apresenta todos os sistemas orgânicos completamente formados, limitada a poucos órgãos, e ainda dependente do vitelo para sua nutrição. Não foi observado nenhuma diferença morfológica no desenvolvimento embrionário e larval do híbrido tambatinga em relação as espécies parentais.

O objetivo do trabalho foi verificar se existe associação dos polimorfismos de lócus microssatélites com o desempenho e expressão gênica. Após genotipagem, os alelos 122 e 130 foram observados, com frequência de 0,94 e 0,06. A frequência gênica foi de 0,88 para animais 130/130 e de 0,12 para indivíduos 122/130. Não houve diferença para os dados fenotípicos entre animais de genótipos diferentes, embora o grupo de animais heterozigoto tenha apresentado uma leve superioridade. A taxa de expressão do Gh não é estatisticamente diferente entre os genótipos observados, porém o grupo homozigoto teve uma taxa de expressão de mRNA maior e mesmo assim menores valores de peso e comprimento, sugerindo uma correlação. O par de iniciadores desenhado amplificou e genotipou com eficiência o locus STR nos animais estudados. A falta de qualidade da água e o manejo inadequado dos animais podem ser os causadores das alterações histopatológicas encontradas no fígado dos animais estudados. Os peixes podem ser via de contaminação humana, devido ao seu consumo como alimento, portanto, medidas de controle devem ser iniciadas para minimizar esse processo. Estudos mais aprofundados com maior controle ambiental, maior variabilidade alélica, maior número amostral e análise de outros genes de interesse associados, seriam interessantes para complementar e enriquecer o presente trabalho. / The objective of this study was to verify if there is association of polymorphisms of microsatellite loci with the performance and gene expression. After genotyping, alleles 122 and 130 were observed, with a frequency of 0,94 and 0,06. The gene frequency was 0,88 for 130/130 animals and 0,12 for 122/130 individuals. There was no difference for phenotypic data among animals of different genotypes, although the group of heterozygous animals presented a slight superiority. The expression rate of GH is not statistically different among the observed genotypes, but the homozygote group had a higher mRNA expression rate and even lower values of weight and length, suggesting a correlation. The pair of primers designed amplified and efficiently genotyped the STR locus in the animals studied. The lack of water quality and inadequate management of the animals may be the cause of the histopathological changes found in the liver of the animals studied. Fish can be a way of human contamination, due to their consumption as food, therefore, control measures must be initiated to minimize this process. Further studies with greater environmental control, greater allelic variability, greater sample size and analysis of other associated genes of interest, would be interesting to complement and enrich the present work.

Tambaqui (Colossoma macropomum) is the largest native Characiform species from the Amazon and Orinoco river basins of South America. Tambaqui farming is growing rapidly in Brazil, its production reached 139.209 tons in 2014, what corresponds to 57.7% of increase compared with 2013. However, few genetic studies of tambaqui are currently available. The tambaqui genetic studies for cultured and wild populations need a holistic approach for a rational action facing ecological and market challenges in aquaculture. Approaches based on genetic studies have provided important tools to understand population dynamics, local adaptation, and gene function to improve selection strategies to be applied in breeding programs. The next-generation sequencing (NGS) allowed a great advance in genomic and transcriptomic approaches, especially related to non-model species. The genotype-by-sequencing (GBS) is one of this approaches based on genome complexity reduction using restriction enzymes (REs). This thesis presents the application of these approaches to provide advances in the genetic background for tambaqui studies. The GBS approach provided a high-density SNPs panel that allowed us to develop the first linkage map, and association studies with environmental variables, local adaptation, and lack of intermuscular bones, both using tambaqui as a model. This work can give us many theoretical references to be applied in genetic breeding programs for tambaqui, allowing a better understanding of genetic processes related to traits of interest in aquaculture. / O tambaqui (Colossoma macropomum) é a maior espécie nativa de Characiforme da América do Sul e é encontrado nas bacias do rio Amazonas e Orinoco. O cultivo do tambaqui está crescendo rapidamente no Brasil, sua produção atingiu 139.209 toneladas em 2014, o que corresponde a 57,7% de aumento em relação a 2013. No entanto, poucos estudos genéticos realizados com o tambaqui estão disponíveis atualmente. Estudos genéticos em tambaqui, tanto em populações cultivadas quanto em populações selvagens, necessitam de uma abordagem holística para uma ação racional frente aos desafios ecológicos e mercadológicos na aquicultura. Abordagens baseadas em estudos genéticos têm fornecido ferramentas importantes para se entender a dinâmica populacional, adaptação local e função gênica visando melhorar as estratégias de seleção a serem aplicadas em programas de melhoramento genético. O sequenciamento de nova geração (NGS) permitiu um grande avanço nas abordagens genômicas e transcriptômicas, especialmente relacionadas a espécies não-modelo. A genotipagem por sequenciamento (GBS) é uma dessas abordagens que utilizam enzimas de restrição (REs) para reduzir a complexidade do genoma. Esta tese apresenta a aplicação desta abordagem objetivando proporcionar avanços significativos nos estudos genéticos de base para tambaqui. A técnica de GBS forneceu um painel de SNPs de alta densidade que nos permitiu desenvolver o primeiro mapa de ligação e estudos de associação com variáveis ambientais, adaptação local e ausência de ossos intermusculares no tambaqui. Este trabalho pode nos dar muitas referências teóricas a serem aplicadas em programas de melhoramento genético do tambaqui, permitindo uma melhor compreensão dos processos genéticos relacionados a traços de interesse na aquicultura.

Orientador: Fabiana Pilarski / Banca: José Luiz Pedreira Mouriño / Banca: Manoel Victor Franco Lemos / Resumo: Os probióticos são microorganismos vivos que afetam de forma benéfica o hospedeiro ou o ambiente. Na aquicultura podem ser usados tanto na água como na ração, mas seu uso na alimentação é destacado como uma das principais medidas profiláticas. As doenças bacterianas são consideradas um dos principais entraves no crescimento da aquicultura, e assim, há a necessidade urgente no desenvolvimento de probióticos. O tambaqui Colossoma macropomum é a espécie nativa mais produzida no Brasil, e apesar de sua importância econômica, não há estudos que estabeleçam os microorganismos com potencial probiótico para esta espécie de peixe. Neste trabalho foi possível identificar e caracterizar bactérias autóctones com potencial probiótico para o tambaqui a partir de testes de: caracterização morfológica, catalase, tolerância à bile, antagonismo frente à patógenos, sensibilidade a antimicrobianos e sequenciamento do gene 16S rRNA. As cepas selecionadas foram: Enterococcus faecalis, Enterococcus hirae, Lactococcus lactis, Pediococcus pentosaceus, Staphylococcus hominis e Staphylococcus saprophyticus. Todas as cepas foram tolerantes aos ácidos biliares do tambaqui e capazes de inibir o crescimento dos patógenos Enterococcus casseliflavus, Lactococcus garvieae e Aeromonas hydrophila. Todas as cepas foram parcialmente resistentes contra sete antibióticos. Como as cepas de S. saprophyticus e E. faecalis apresentaram menores valores no teste de antagonismo e por estas bactérias serem relatadas como a... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Probiotics are living microorganisms that beneficially affect the host or the environment. In aquaculture it can be used in both water and feed, but its use in feed is highlighted as one of the main prophylactic measures. Bacterial diseases are considered to be one of the major obstacles to the growth of aquaculture, and thus, there is an urgent need for the development of probiotics. The tambaqui Colossoma macropomum is the most produced native species in Brazil, and despite its economic importance, there are no studies that establish the microorganisms with probiotic potential for this fish species. In this study it was possible to identify and characterize autochthones bacteria with probiotic potential for tambaqui from tests of: morphological characterization, catalase, bile tolerance, antagonism of pathogens, antimicrobial susceptibility and 16S rRNA gene sequencing. The selected strains were: Enterococcus faecalis, Enterococcus hirae, Lactococcus lactis, Pediococcus pentosaceus, Staphylococcus hominis and Staphylococcus saprophyticus. All strains were tolerant to acids bile from tambaqui and capable of inhibiting the growth of Enterococcus casseliflavus, Lactococcus garvieae and Aeromonas hydrophila pathogens. All strains were partially resistant against seven antibiotics. Since the strains of S. saprophyticus and E. faecalis presented lower values in the test of antagonism and because these bacteria were reported as zoonotic agents, we conclude this study selecting fou... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-15T17:51:33Z No. of bitstreams: 2 Givanildo Ximenes Santana.pdf: 1222692 bytes, checksum: efbd8d3b842a4b1aceefa175fc58b8b3 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-15T17:51:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Givanildo Ximenes Santana.pdf: 1222692 bytes, checksum: efbd8d3b842a4b1aceefa175fc58b8b3 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2011-04-05 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Fishing and aquaculture are directly or indirectly important to the life of million people around the world. However, many species are being overexploited and reduced in number, without management and conservation plans to minimize the impacts caused by human activity. The management of fisheries genetic resources, from nature or captivity, depends on strict monitoring of populations, considering their dynamics, ecological relevance and genetic variability. The conservation and management of these resources have grown substantially over the years for species that are overfished or endangered. Currently, many molecular markers are utilized for studies of genetic variability in fish as well as to know the structure of populations and their relationships within and among them; these studies are applied for both fisheries and aquaculture areas. Colossoma macropomum is a neotropical fish, it is the largest Characiformes in the Amazon region and has been one of the most important species commercially in Brazil, both for fisheries and for aquaculture. This study aims to determine the genetic variability of four different populations of the neotropical fish Colossoma macropomum from captive populations and nature. An enriched library of microsatellite was developed for studies of populations of tambaqui. Seven new loci and six loci previously described in literature were used in this study. Intrapopulation and interpopulation analysis were performed to verify genetic diversity of populations. Two models of Bayesian cluster analysis were tested to observe the structure between them. The results showed that populations are highly structured. The genetic variability in populations of fish farming is low and the wild population has a deficit of heterozygotes. The two clustering models can be related to genetic structuring among populations, corroborating the results of differentiation and genetic distance. In conclusion, the genetic conservation of the populations of C. macropomum require continuous monitoring for recovery of genetic variability. / A pesca e a piscicultura são direta ou indiretamente importantes para o sustento de milhões de pessoas em todo o mundo. Entretanto, muitas espécies estão sendo sobreexploradas e tendo seus estoques reduzidos sem que haja planos de manejo e conservação que possam minimizar os impactos deixados pela ação antrópica sobre as mesmas. O gerenciamento de recursos genéticos pesqueiros, sejam da natureza, sejam de cativeiro, depende de rigorosos monitoramentos nas populações, considerando a dinâmica de seus aspectos ecológicos e a relevância de suas variabilidades genéticas. A conservação e manejo desses recursos vêm crescendo substancialmente sobre as espécies sobreexploradas ou em risco de extinção. Atualmente inúmeros marcadores moleculares são utlizados para estudos de variabilidade genética em peixes, bem como para conhecer a estrutura das populações e suas relações intra e interpopulacionais. No domínio da pesca e da aquicultura, os microssatélites são úteis para a caracterização da variabilidade genética e estruturação das populações. O Colossoma macropomum é um peixe de clima tropical, sendo o maior Characiforme da região Amazônica e vem sendo uma das espécies mais importantes comercialmente no Brasil, tanto para a pesca como para a aquicultura. Este estudo tem como objetivo verificar a variabilidade genética em quatro diferentes populações do peixe neotropical Colossoma macropomum, a partir de populações de cativeiro e da natureza. Para tanto, foram selecionados seis locos descritos na literatura e desenvolvidos sete novos locos, a partir de uma biblioteca genômica enriquecida em microssatélites. Análises intrapopulacionais e interpopulacionais foram realizadas para verificar a diversidade genética das populações. Dois modelos de análise bayesiana de agrupamento foram testados para observar a estruturação entre elas. Os resultados demonstraram que as populações estão fortemente estruturadas. A variabilidade genética nas populações de piscicultura é baixa e a população da natureza está com deficiência de heterozigotos. Os dois modelos de agrupamentos genético podem ser relacionados à estruturação entre as populações, corroborando os resultados de diferenciação e distância genética.