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Community structure of anurans along an altitudinal gradient: the role of topographic and climatic variables and their implications for conservation / Estrutura da comunidade de anuros ao longo do gradiente altitudinal: o papel das variáveis topográficas e climáticas e suas implicações para a conservação

Matavelli, Rodrigo Augusto 22 February 2019 (has links)
Montane ecosystems cover approximately 22 to 25% of land surface from sea level to more than 8,000 m a.s.l., harboring more than a third of the planet\'s biodiversity and includ half of global biodiversity hotspots. Among geographical gradients (latitudinal or altitudinal), the latitudinal species richness pattern is the most recognized and studied. Although not so intensively studied as latitudinal gradients, altitudinal gradients also provide great patterns of species richness distributions. Despite of the processes that driving the species richness patterns are still poorly understood, three main patterns have been reported along altitudinal gradients: 1) decreasing of species richness with increasing altitude, 2) increase in species richness with increased altitude, and 3) increasing species richness at intermediate altitudes (hump-shaped pattern), followed by a decreasing of species richness with increasing altitude. The hump-shaped pattern is considered the most common. A macroecological hypothesis that to explain species richness patterns along geographical gradients focusing in species range size is Rapoport\'s rule. This rule is a positive correlation between altitude and species range size distribution based on climate seasonality effects. Rapoport\'s rule prediz that species that can withstand broad climatic variability can become more widely distributed along geographical gradients. However, this hypothesis still has presented controversial results and this controversial results increased our interest in testing Rapoport\'s altitudinal rule in Atlantic Forest mountain ecosystems biome. However, patterns and process that drivres community assembly along altitudinal gradients have received little attention and remain controversial. Based on the anuran community strutucture variation (richness, composition and abundance) along altitudinal gradients, the present work aims to understand and disentangle the topographic and climatic effects on spatial patterns distribution and species altitudinal range size in the Atlantic Forest highlands, which will highlight how topographic and climate conditions acting in communities\' assembly along altitudinal gradients subside important rules to biodiversity conservation. / Os ecossistemas montanhosos cobrem aproximadamente 22 a 25% da superfície terrestre desde o nível do mar até mais de 8.000 m, abrigam mais de um terço da biodiversidade do planeta incluindo metade dos hotspots globais de biodiversidade. Entre os gradientes geográficos (latitudinais ou altitudinais), o padrão latitudinal de riqueza de espécies é o mais reconhecido e estudado. Embora não tão intensamente estudados como os gradientes latitudinais, os gradientes altitudinais também fornecem ótimos padrões de distribuição de riqueza de espécies. Apesar dos processos que impulsionam os padrões de riqueza de espécies ainda serem pouco compreendidos, três principais padrões tem sido relatados ao longo dos gradientes altitudinais: 1) decréscimo da riqueza de espécies com o aumento da altitude; 2) aumento da riqueza de espécies com o aumento da altitude and 3) aumento da riqueza de espécies em altitudes intermediárias (unimodal padrão), seguido por uma diminuição da riqueza de espécies com o aumento da altitude. O unimodal padrão é considerado o mais comum. Uma hipótese macroecológica que explica os padrões de riqueza de espécies ao longo de gradientes geográficos com foco no tamanho das faixas altitudinais das espécies é Rapoport regra. Esta prediz uma correlação positiva entre a altitude e a distribuição do tamanho das faixas altitudinais das espécies com base nos efeitos da sazonalidade climática. Rapoport regra prediz que as espécies que podem suportar um ampla variabilidade climática podem se tornar mais amplamente distribuídas ao longo dos gradientes geográficos. No entanto, essa hipótese ainda apresenta resultados controversos o que aumentaram nosso interesse em testar a Rapoport altitudinal regra em ecossistemas montanhosos na Mata Atlântica. Entretanto, os padrões e os processos que conduzem a montagem da comunidade ao longo dos gradientes altitudinais receberam pouca atenção e ainda permanecem controversos. Com base na variação da estrutura da comunidade de anuros (riqueza, composição e abundância) ao longo dos gradientes altitudinais, o presente estudo teve como objetivo compreender e desemaranhar os efeitos topográficos e climáticos nos padrões de distribuição espacial e tamanho das faixas altitudinais das espécies em ecossitemas montanhosos na Mata Atlântica, o qual realçará como as condições topográficas e climáticas atuam na montagem de comunidades ao longo de gradientes de altitude subsidiando importantes regras para a conservação da biodiversidade.
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Influência do efeito de borda sobre a anurofauna do parque estadual Carlos Botelho (SP) / Influence of edge effects in frogs of parque estadual Carlos Botelho (SP)

Adriano, Leonardo Ramos 14 September 2012 (has links)
Este trabalho teve como objetivo determinar a extensão do efeito de borda e sua influência sobre a riqueza e a abundância de anfíbios anuros em uma Unidade de Conservação de Mata Atlântica do estado de São Paulo, o Parque Estadual Carlos Botelho. Foram utilizados 28 transectos com seis parcelas de 4×4m paralelas à borda e distantes desta 0, 25, 50, 100, 200 e 300 m, totalizando 168 amostras nos arredores da unidade de conservação. Toda a amostragem ocorreu durante a estação úmida, tendo sido capturados 160 indivíduos de 28 espécies, distribuídas em 10 famílias. Nas mesmas parcelas, foram medidas as seguintes variáveis ambientais: Temperatura do Ar, Umidade Relativa do Ar, Cobertura do Dossel e Profundidade da Serapilheira (média de 10 pontos). No programa Ecosim 7.0 foi feita a estimativa de riqueza de espécies obtida pelo processo de rarefação, indicando que o esforço amostral empregado no trabalho foi suficiente. A variação na composição das espécies em relação à distância da borda foi representada com gráficos por meio de uma análise de gradiente, sendo as espécies Leptodactylus marmoratus, Ischnocnema guentheri e Haddadus binotatus as mais abundantes e distribuídas ao longo de todo o gradiente estudado e espécies raras como Macrogenioglottus alipioi e Chiasmocleis leucosticta foram capturadas em parcelas distantes 100 m da borda, o que pode indicar uma tolerância fisiológica e ecológica destas espécies, servindo como boas indicadoras da qualidade do ambiente nas áreas de borda do PECB. Análises de regressão simples e múltipla foram feitas para identificar relações entre as variáveis ambientais e a riqueza de espécies, sendo que a variável Cobertura do Dossel explica em 20% a variação na Riqueza de Espécies e as outras variáveis ambientais não determinaram a variação na Riqueza de Espécies . Também foi feita uma Análise de Variância Fatorial comprovando que não existem diferenças na Riqueza de Espécies entre as categorias de distância da borda e os diferentes cultivos agrícolas nas bordas do PECB. Todas as análises estatísticas foram feitas no software Systat 12 (P≤0,05). / This study aimed to determine the extent of the edge effect and its influence on the richness and abundance of amphibians in a conservation of the Atlantic Forest in the state of São Paulo, the Carlos Botelho State Park. We used 28 transects with six plots of 4 × 4 m apart and parallel to the edge of this 0, 25, 50, 100, 200 and 300 m, totaling 168 samples in the vicinity of the protected area. All sampling occurred during the wet season, having captured 160 individuals of 28 species belonging to 10 families. In the same plot, we measured the following variables: Air Temperature, Relative Humidity, Canopy Coverage and Depth of the Litter (averaging 10 points). In Ecosim 7.0 program was made to estimate species richness obtained by thinning process, indicating that the sampling effort was sufficient employee at work. The variation in species composition in relation to the distance from the edge was represented with graphs using a gradient analysis, and species Leptodactylus marmoratus, Ischnocnema guentheri and Haddadus binotatus the most abundant, and distributed throughout the gradient and rare species studied as Macrogenioglottus alipioi and Chiasmocleis leucosticta were captured in plots 100 m distant from the edge, which may indicate a physiological and ecological tolerance of these species, serving as good indicators of environmental quality in the areas of PECB edge. Analyses of simple and multiple regression were conducted to identify relationships between environmental variables and species richness, and the variable canopy coverage explains 20% variation in species richness and other environmental variables not determined the variation in species richness . Also we made a Factorial Analysis of Variance proving that there are no differences in species richness between the categories of distance from the edge and different crops on the edges of PECB. All statistical analyzes were performed in Systat Software 12 (P≤0.05).
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Coevolução do comportamento antipredatório, desempenho locomotor e morfologia em anuros da Floresta Atlântica / Coevolution of antipredator behavior, locomotor performance and morphology of anurans of the Atlantic Forest

Citadini, Jessyca Michele 13 February 2017 (has links)
Anfíbios anuros representam um grupo de vertebrados cujo plano corpóreo apresenta uma série de modificações associadas ao desempenho locomotor através de saltos, sendo estas especializações muito antigas e conservadas filogeneticamente. Embora estudos comparativos venham demonstrando associações entre desempenho de salto e diversidade de habitat e história de vida para esse grupo filogenético, as relações entre o desempenho locomotor e o comportamento antipredatório dentro do contexto da diversificação do uso do micro-habitat permanecem inexploradas. Primeiramente, nós testamos modelos adaptativos de evolução morfológica associados com a diversidade do uso do micro-habitat (aquático, arborícola, fossorial, reofílico e terrestre) em espécies de anuros e foi examinada a relação da distância máxima do salto como uma função dos componentes das variáveis morfológicas e do uso do micro-habitat. Nós também investigamos, tanto em nível intra quanto interespecífico a influência da complexidade do microambiente (arena vazia, arena com folhiços ou arena com folhiço e arbustos) e do tipo de estímulo (aproximação versus toque) na manifestação do comportamento antipredatório em anuros. Adicionalmente, nós investigamos o efeito do uso de diferentes tipos de refúgio pelos anuros quando sujeitos aos testes de simulação predatória no laboratório. Nossos resultados demostram a existência de múltiplos ótimos adaptativos para os comprimentos dos membros associados aos diferentes usos do micro-habitat, com uma tendência de aumento dos membros posteriores em espécies reofílicas, arborícolas e aquáticas quando comparadas com espécies terrestres e fossoriais, as quais evoluíram em direção ao ótimo adaptativo com membros posteriores mais curtos. Além disso, espécies reofílicas, arborícolas e aquáticas apresentaram maior desempenho para o salto e membros posteriores mais longos quando comparadas com espécies terrestres e fossoriais. Em seguida foi abordada a influencia da complexidade do ambiente no comportamento antipredatório e nossas análises intraspecíficas mostraram que o número de respostas ativas (salto) e passivas é fortemente dependente do tipo de estímulo e varia de acordo com a complexidade estrutural do ambiente. Simultaneamente, nossas análises comparativas interespecíficas mostraram que anuros modulam a distância saltada em resposta ao toque do predador de acordo com a complexidade ambiental, e nós ressaltamos uma variação interespecífica associada ao uso de micro-habitat. Por fim, foi investigado o uso de refúgios pelos anuros expostos a testes de simulação predatória. Nossos resultados mostram que os anuros usam a vegetação arbustiva, o folhiço e a água como areas de refúgio quando sujeitadas a simulação predatória. Além disso, ocorreu variação interespecífica na escolha de refúgios potencialmente associados à diversificação do uso de microhábitat / Anuran amphibians represent a group of vertebrates whose body plan presents a series of changes associated with jumping locomotor performance; these specializations are very old and phylogenetically conserved. Although comparative studies have shown associations among jumping performance, habitat diversity and life history for this phylogenetic group, the relationship between locomotor performance and antipredator behavior remains unexplored within the context of diversification of microhabitat use and habitat. First, we tested adaptive models of morphological evolution associated with the diversity of microhabitat use (aquatic, arboreal, fossorial, torrent and terrestrial) in species of anurans and examined the relation of the maximum distance jumped as a function of components of morphological variables and microhabitat use. We also investigated, both at intra and interspecific levels, the influence of the complexity of microenvironment (empty arena, with leaf litter or bushes) and stimulus type (approach versus touch) on the manifestation of antipredator behavior in anurans. In addition, we investigated the effect of the use of different types of refuges by anurans when subjected to simulated predator tests in the laboratory. Our results demonstrate the existence of multiple optima of limb lengths associated to different microhabitats, with a trend of increasing hindlimbs in torrent, arboreal, aquatic species whereas fossorial and terrestrial species evolve toward optima with shorter hindlimbs. Moreover, arboreal, aquatic and torrent anurans have higher jumping performance and longer hindlimbs, when compared to terrestrial and fossorial species. Then, was addressed the influence of the complexity of environment on antipredator behavior and our intraspecific analyzes showed that the number of active responses (jump) and passive responses is strongly dependent on stimulus type and varies according to the structural complexity of the environment. At the same time, our interspecific comparative analyzes showed that anurans modulate the distance jumped in response to the predator\'s touch according to environmental complexity, and we highlight an interspecific variation associated with the use of microhabitat. Lastly, was investigated the use of refuges by anurans exposed to simulated predation events. Our results show that anurans use bushes, leaf litter and water as refuge areas when subjected to simulated predator. Moreover, there is interspecific variation in the choice of refuges potentially associated to diversification of microhabitat use
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Estudo da comunidade de anfíbios e répteis em um fragmento de Mata Atlântica e em áreas perturbadas no Estado de São Paulo: subsídios para conservação e manejo de áreas protegidas / Amphibian and reptilian community study on an Atlantic Forest fragment and on disturbed areas at São Paulo State: contribution for conservation and management of protected areas

Carmona, Renata Uesugui 29 June 2007 (has links)
A Mata Atlântica é reconhecida internacionalmente como um dos 25 hotspots do planeta englobando áreas com elevada biodiversidade de espécies, elevado endemismo e fortes pressões antrópicas, constituindo a segunda floresta mais ameaçada do planeta que abriga muitas espécies ameaçadas de extinção. Anfíbios e répteis são animais abundantes e funcionalmente importantes em muitos hábitats terrestres e aquáticos. Sua maior diversidade ocorre em florestas tropicais úmidas, onde o processo de fragmentação pode causar diversos efeitos negativos como a remoção e a redução de populações. O presente estudo foi desenvolvido no Residencial Reserva Ibirapitanga, município de Santa Isabel, Estado de São Paulo. Trata-se de um projeto urbanístico, onde o proprietário de cada lote se torna sócio e responsável pela RPPN (Reserva Particular do Patrimônio Natural) Rio dos Pilões. Este é um modelo inédito no Brasil, pois os lotes foram planejados apenas em áreas desmatadas no passado onde ocorrem atualmente pastagens abandonadas. O trabalho teve como objetivos levantar as espécies da herpetofauna que ocorrem em quatro diferentes ambientes do Residencial Reserva Ibirapitanga: Mata Secundária ou Capoeirão, Capoeira, Capoeirinha e Campo Antrópico, através de dois métodos distintos (Armadilhas de Interceptação e Queda e Procura Ativa), além de caracterizar esses ambientes quanto à composição e abundância da herpetofauna e de identificar as espécies endêmicas, raras e ameaçadas de extinção. Dessa forma, o presente estudo pôde contribuir para a elaboração do Plano de Manejo da RPPN Rio dos Pilões. Durante o período de Setembro de 2005 e Julho de 2006 foram registradas 25 espécies de anfíbios anuros e 3 de répteis. A utilização de dois métodos de amostragem teve relevante importância, pois algumas espécies foram encontradas somente através de um ou outro método. No entanto, a Procura Ativa foi considerada o método mais eficiente, já que amostrou 23 das 28 espécies encontradas. Já através das armadilhas de interceptação e queda foi possível determinar as abundâncias relativas de espécies encontradas por este método. Assim, a espécie mais abundante na Mata Secundária e na Capoeira foi Chaunus ornatus; em Capoeirinha, Physalaemus cuvieri e em Campo Antrópico, a maior abundância relativa foi de Leptodactylus cf. bokermanni. Hypsiboas cf polytaenius e Physalaemus cuvieri apresentaram distribuição espacial mais ampla, ocorrendo em todos os ambientes amostrados. Um maior número de espécies foi encontrado na Mata Secundária, ambiente menos perturbado que apresentou então, 23 espécies. A Capoeira apresentou 15 espécies, Capoeirinha, 6 e Campo Antrópico 4 espécies apenas. Foram realizadas comparações com taxocenoses de outras localidades, escolhidas de acordo com o método de coleta utilizado. Espécies como Aplastodiscus leucopygius, Proceratophrys boiei e Enyalius perditus, associadas a ambientes de mata, foram encontrados na área de estudo, enfatizando a importância da conservação deste remanescente florestal localizado na Serra da Mantiqueira. / Atlantic Forest is internationally recognized as one of the 25 hotspots on the planet which embodies high diversity and high endemism areas over strong anthropic influence, composing the second most threatened forest on the planet, representing an unique shelter for many endangered species. Amphibians and Reptiles are animals abundant and play an important role on many terrestrial and aquatic habitats. Its diversity occurs mainly within rain forests, where fragmentation processes may result on severe negative effects such as removal and population reduction. This study was developed at Ibirapitanga Residential Reserve, Santa Isabel municipal district, Sao Paulo State. The study deals about an urban project, where every plot owner becomes an associate responsible for the "Rio dos Pilões" RPPN (Particular Reserve of the Natural Patrimony) maintainance. This is a pioneer model in Brazil, since the residential plots were located within past devastaded areas, which are actually occupied by abandoned pastures. Herpetofauna species assesment was made at Ibirapitanga Residential Reserve within four different environments (Advanced Secondary Forest, Secondary Forest, Early Secondary Forest and Anthropic Field) using two distinct methods: pitfall traps and drift fences and active search. Environmental characterization was observed regarding herpetofauna species composition and abundance, besides the endemic, rare or threatened species occurrence. For this matter, this study contributes on the elaboration of the management plan for the "Rio dos Pilões" RPPN (Particular Reserve of the Natural Patrimony). From September 2005 to July 2006, 25 anuran amphibian species and 3 reptilian species were registered. The distinct sampling methods presented relevant differences, since some species were sampled exclusively by one or other method. However, active search was considered the best sampling method, since it sampled 23 out of the 28 studied species. Through pitfall traps and drift fences method it was possible to determine species relative abundance. The most abundant species found on Advanced Secondary Forest and Secondary Forest was Chaunus ornatus; on Early Secondary Forest it was Physalaemus cuvieri and on Anthropic Field the higher relative abundance was found for Leptodactylus cf. bokermanni. Species with enlarged distribution, occuring within every sampled environment, were represented by Hypsiboas cf. polytaenius and Physalaemus cuvieri. A higher number of species was found within Advanced Secondary Forest, which represent the less disturbed areas, with 23 different species. Secondary Forest presented 15 species, Early Secondary Forest 6 species and Anthropic Field only 4 species. Comparisons were made to assemblages from other localities, chosen accordingly to the sampling method applied. Species like Aplastodiscus leucopygius, Proceratophrys boiei and Enyalius perditus, commonly associated with forest environment, were found within the studied areas, pointing out the importance of this forest remnant conservation, located at Mantiqueira mountain range.
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Diversidade, biologia, filogeografia e taxonomia molecular de tripanossomas de anuros da família Leptodactylidae. / Diversity, biology, phylogeography and molecular taxonomy of trypanosomes of frogs in the Leptodactylidae Family.

Sato, Lyslaine Hatsue 12 June 2015 (has links)
A fim de avaliar a diversidade genética, morfológica e filogeografia de tripanossomas de leptodactilídeos, analisamos diversos isolados encontrados em amostras de sangue e fígados obtidos no Brasil (Amazônia, Caatinga, Cerrado, Mata Atlântica e Pantanal), na Colômbia e na Venezuela. Inferências filogenéticas baseadas em marcadores moleculares (V7V8 SSUrDNA e gGAPDH) demonstraram uma complexa associação entre clados, biomas e hospedeiros vertebrados. Nossos resultados corroboram a monofilia dos trypanossomas de anuros e sugerem a existência de, ao menos, seis clados (An01-06) nesse grupo com 12 candidatos a novas espécies. O clado An01 compreende tripanossomas de leptodactilídeos e hilídeos de todos os biomas. Os clados An02, An05 e An06 são formados, predominantemente, por tripanossomas de leptodactlídeos de diferentes biomas brasileiros, da Colômbia e da Venezuela. O clado An03 é formado por tripanossomas de leptodactilídeos, bufonídeos e flebotomíneos, todos do bioma amazônico. O clado An04 agrupa apenas tripanossoma exóticos da América do Norte, África e Europa. / Aiming to investigate the genetic diversity, the morphology and the phylogeny of leptodactylid trypanosomes, we analyzed a number of trypanosomes from blood and liver samples from Brazil (Amazonia, Caatinga, Cerrado, Atlantic Forest and Pantanal), Colombia and Venezuela. Phylogenetic analyses based on molecular markers (V7V8 SSUrDNA and gGAPDH) demonstrated a complex association between clades, biomes and vertebrate hosts. Our results corroborated the monophyly of anuran trypanosomes and suggested the existence of, at least, six clades (An01-06) inside the anuran clade with 12 candidate new species. Clade An01 groups trypanosomes from leptodactylids and hylids collected in all biomes. Clades An02, An05 and An06 are composed, mostly, by leptodactylid trypanosomes from several Brazilian biomes, Colombia and Venezuela. Clade An03 aggregates parasites from leptodactylids, bufonids and phlebotomines from Amazonia. Clade An04 groups only exotic trypanosome species from North America, Africa and Europe.
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Análise de marcadores moleculares do DNA mitocondrial em anuros da Mata Atlântica / Analysis of molecular markers of mitochondrial DNA in Atlantic Rainforest Anurans

Anna Carolina da Silva Chaves 11 March 2014 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A Mata Atlântica brasileira concentra uma das maiores diversidades biológicas da Terra com cerca de 7% das espécies animais e vegetais do planeta. Esse bioma abriga atualmente mais de 50% das espécies de anuros do Brasil (c.a. 500 espécies), mas sofre intensa perda e fragmentação de habitat. Um dos principais fragmentos da Mata Atlântica, a Reserva Ecológica de Guapiaçu (REGUA) abriga vasta anurofauna, com cerca de 71 espécies já descritas. Acredita-se, porém, que muitas ainda precisam ser identificadas e estudadas. A identificação de espécies baseada em caracteres moleculares vem se mostrando uma alternativa para dar suporte à identificação morfológica, e dentro deste contexto os genes de DNA mitocondrial, como o 16S, são utilizados para a realização de barcode. O objetivo deste estudo foi testar a metodologia de identificação molecular de espécies (DNA barcode) na comunidade de anfíbios anuros da REGUA utilizando o gene mitocondrial 16S. Para isso, foram coletados tecidos de 99 indivíduos, entre adultos e girinos de 23 espécies, agrupados em seis famílias distintas. Desses 99 indivíduos, 88 foram amplificados corretamente para o gene em referência e foram realizadas, com sucesso, a determinação de espécies de 84 anuros (95,45%) da REGUA. As espécies de Scinax albicans, Scinax flavoguttatus e Hylodes charadranaetes, cujas identificações haviam sido determinadas com base em critérios morfológicos, agruparam em clados de mesmo gênero, porém de espécies diferentes quando analisadas pelas metodologias neighbor-joining e maximum-likelihood. Além de altos valores de distância intraespecífica (2,18%, 3,49% e 3,77%, respectivamente) e distâncias interespecíficas nulas (0%) temos a indicação de possíveis equívocos em determinações de espécies feitas exclusivamente por critérios morfológicos. Nesse caso, as discordâncias morfológica e molecular são exclusivamente de girinos, demonstrando a dificuldade na identificação morfológica e a escassez de chaves de identificação dessas espécies em estágio larval. Os resultados mostram que o gene mitocondrial 16S teve seu uso na identificação de anuros da REGUA confirmada e apontam que, em casos de estudos com indivíduos em estágios larvais, como em girinos, a metodologia de barcode, quando complementada a identificação morfológica, suporta a correta identificação das espécies de anfíbios anuros. / The Brazilian Atlantic Forest focuses one of the greatest biological diversity of the Earth with about 7% of the planet's animal and plant species. This biome is currently home to more than 50% of anurans species from Brazil (c.a. 500 species), but it suffers severe loss and fragmentation of habitat. One of the main fragments of the Atlantic Forest, the Reserva Ecológica de Guapiaçu (REGUA) houses a wide anuran fauna, with about 71 species had already described. It is believed, however, that lots of them still need to be identified and studied. The identification of these species based on molecular characters has proven to be an alternative to support a morphological identification, and in this context the mitochondrial DNA genes, such as 16S are used to perform barcode. The goal of this study was to test the methodology for molecular identification (DNA barcode) in anurans of REGUA community using 16S mitochondrial gene. For this, tissues of 99 individuals, including adults and tadpoles of 23 species, grouped into six different families were collected. Of these 99 individuals, 88 were amplified correctly to the reference gene and were successful determination of 84 species of anurans (95.45%) of the REGUA. Scinax albicans, Scinax flavoguttatus and Hylodes charadranaetes species whose identifications had been determined based on morphological criteria, grouped into clades of the same gender, but different species when analyzed by methodologies neighbor-joining and maximum-likelihood. In addition to high intraspecific distances (2,18%, 3,49% and 3,77% respectively) and interspecific distances to nil (0%), we have an indication of possible mistakes of species determinations made by a morphological criterion. In this case, the morphological and molecular disagreements are exclusively on tadpoles, demonstrating the difficulty of morphological identification and the shortage of identification of these species larval stage. The results show that the 16S mitochondrial gene had its use in identifying the anurans REGUA confirmed and indicate that the case studies with individuals in larval stages, as in tadpoles , the methodology of the barcode when complemented morphological identification, supports the correct identification of species of anurans amphibians .
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Efeito da temperatura sobre as interações cardiorrespiratórias em sapos Rhinella schneideri

Zena, Lucas Aparecido 26 October 2016 (has links)
Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-02-01T10:40:13Z No. of bitstreams: 1 TeseLAZ.pdf: 5426859 bytes, checksum: 033582b6221f018d86ae920b42835b76 (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Passos (camilapassos@ufscar.br) on 2017-02-08T12:03:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseLAZ.pdf: 5426859 bytes, checksum: 033582b6221f018d86ae920b42835b76 (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Passos (camilapassos@ufscar.br) on 2017-02-08T12:05:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseLAZ.pdf: 5426859 bytes, checksum: 033582b6221f018d86ae920b42835b76 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T12:05:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseLAZ.pdf: 5426859 bytes, checksum: 033582b6221f018d86ae920b42835b76 (MD5) Previous issue date: 2016-10-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / For adequate blood supply to match metabolic demand, vertebrates regulate blood pressure (BP) in order to maintain adequate perfusion of target organs avoiding ischemia and tissue damage like edema. Effective short-term BP regulation in anuran amphibians occurs through adjustments in heart rate (HR), peripheral vascular resistance, and changing pulsatile frequency of lymph hearts. In addition, pulmonary ventilation in anurans is directly linked to blood volume homeostasis by facilitating lymph fluid movement back into the cardiovascular system which takes place by changing pressure and volume within anurans' lymphatic sacs. It is apparent that an interaction between baroreflex regulation and breathing control exists in anuran amphibians. In the present study I used pharmacological methods (phenylephrine and sodium nitroprusside; infusion ramp and in bolus methods) to investigate baroreflex sensitivity at different temperatures in the cururu toad Rhinella schneideri. I evaluated the degree to which arterial baroreflex plays a role in pulmonary ventilation in the cururu toad. Baroreflex regulation in the toad R. schneideri was temperature dependent and influenced the toad’s ventilation. Hypotension and hypertension resulted in increases and decreases in HR, respectively, as well as increases and decreases in pulmonary ventilation mainly through adjustments in breathing frequency. In contrast to data from the literature, anuran amphibians seem to defend lower BP events primarily rather than hypertension independent of temperature. Anurans exhibit higher rates of transcapillary fluid filtration which means during hypertension fluid filtration is increased and excess interstitial fluid formation will be reclaimed by an efficient lymphatic system. Therefore, besides pulmonary ventilation's role in matching O2 delivery to demand (e.g. temperatures) in anurans, it also plays a role in BP regulation possibly owing to an interaction between baroreflex control and respiratory areas in the brain. / Para um adequado suprimento sanguíneo de modo a atender as diferentes demandas metabólicas, os vertebrados regulam a pressão arterial (PA) mantendo adequada perfusão dos órgãos evitando assim eventos isquêmicos ou outros danos teciduais, como edema. O controle efetivo da PA a curto prazo em anfíbios anuros se dá por ajustes da frequência cardíaca (FC), resistência vascular periférica e também por ajustes da frequência de pulsação dos corações linfáticos. Além disso, a ventilação pulmonar nos anuros está diretamente associada à homeostase do volume sanguíneo por meio da facilitação do transporte de fluído linfático de volta ao sistema cardiovascular, que se dá por meio da alteração de pressão e volume dos sacos linfáticos. Isso parece sugerir a existência de uma possível interação entre a regulação barorreflexa e o controle da respiração nos anfíbios anuros, como já observado para os mamíferos. No presente estudo utilizamos de um método farmacológico (fenilefrina e nitroprussiato de sódio: infusão em rampa e injeção in bolus) para investigar a sensibilidade barorreflexa em diferentes temperaturas no sapo cururu Rhinella schneideri. Também avaliamos o papel do barorreflexo arterial na modulação da ventilação pulmonar nesta mesma espécie. A regulação barorreflexa no sapo R. schneideri apresentou dependência térmica, além de afetar consideravelmente a ventilação dos sapos. A hipotensão e hipertensão resultaram em aumentos e reduções da FC, respectivamente, bem como na ventilação pulmonar, que se deu prioritariamente por meio de ajustes na frequência respiratória. Ao contrário dos dados da literatura, os anfíbios anuros parecem defender prioritariamente eventos de hipotensão ao invés da hipertensão, independente da temperatura testada. É importante salientar que os anuros apresentam alta taxa de filtração transcapilar, e que durante eventos de PA elevada, um aumento na formação de fluido transcapilar pulmonar seria recrutado por um eficiente sistema linfático, característico dos anuros. Portanto, apesar da função da ventilação pulmonar em corresponder à disponibilidade de O2 em diferentes demandas metabólicas (e.g. temperatura), também parece apresentar participação na regulação da PA, possivelmente devido a uma interação entre o barorreflexo e as áreas respiratórias no sistema nervoso central.
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Análise de marcadores moleculares do DNA mitocondrial em anuros da Mata Atlântica / Analysis of molecular markers of mitochondrial DNA in Atlantic Rainforest Anurans

Anna Carolina da Silva Chaves 11 March 2014 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A Mata Atlântica brasileira concentra uma das maiores diversidades biológicas da Terra com cerca de 7% das espécies animais e vegetais do planeta. Esse bioma abriga atualmente mais de 50% das espécies de anuros do Brasil (c.a. 500 espécies), mas sofre intensa perda e fragmentação de habitat. Um dos principais fragmentos da Mata Atlântica, a Reserva Ecológica de Guapiaçu (REGUA) abriga vasta anurofauna, com cerca de 71 espécies já descritas. Acredita-se, porém, que muitas ainda precisam ser identificadas e estudadas. A identificação de espécies baseada em caracteres moleculares vem se mostrando uma alternativa para dar suporte à identificação morfológica, e dentro deste contexto os genes de DNA mitocondrial, como o 16S, são utilizados para a realização de barcode. O objetivo deste estudo foi testar a metodologia de identificação molecular de espécies (DNA barcode) na comunidade de anfíbios anuros da REGUA utilizando o gene mitocondrial 16S. Para isso, foram coletados tecidos de 99 indivíduos, entre adultos e girinos de 23 espécies, agrupados em seis famílias distintas. Desses 99 indivíduos, 88 foram amplificados corretamente para o gene em referência e foram realizadas, com sucesso, a determinação de espécies de 84 anuros (95,45%) da REGUA. As espécies de Scinax albicans, Scinax flavoguttatus e Hylodes charadranaetes, cujas identificações haviam sido determinadas com base em critérios morfológicos, agruparam em clados de mesmo gênero, porém de espécies diferentes quando analisadas pelas metodologias neighbor-joining e maximum-likelihood. Além de altos valores de distância intraespecífica (2,18%, 3,49% e 3,77%, respectivamente) e distâncias interespecíficas nulas (0%) temos a indicação de possíveis equívocos em determinações de espécies feitas exclusivamente por critérios morfológicos. Nesse caso, as discordâncias morfológica e molecular são exclusivamente de girinos, demonstrando a dificuldade na identificação morfológica e a escassez de chaves de identificação dessas espécies em estágio larval. Os resultados mostram que o gene mitocondrial 16S teve seu uso na identificação de anuros da REGUA confirmada e apontam que, em casos de estudos com indivíduos em estágios larvais, como em girinos, a metodologia de barcode, quando complementada a identificação morfológica, suporta a correta identificação das espécies de anfíbios anuros. / The Brazilian Atlantic Forest focuses one of the greatest biological diversity of the Earth with about 7% of the planet's animal and plant species. This biome is currently home to more than 50% of anurans species from Brazil (c.a. 500 species), but it suffers severe loss and fragmentation of habitat. One of the main fragments of the Atlantic Forest, the Reserva Ecológica de Guapiaçu (REGUA) houses a wide anuran fauna, with about 71 species had already described. It is believed, however, that lots of them still need to be identified and studied. The identification of these species based on molecular characters has proven to be an alternative to support a morphological identification, and in this context the mitochondrial DNA genes, such as 16S are used to perform barcode. The goal of this study was to test the methodology for molecular identification (DNA barcode) in anurans of REGUA community using 16S mitochondrial gene. For this, tissues of 99 individuals, including adults and tadpoles of 23 species, grouped into six different families were collected. Of these 99 individuals, 88 were amplified correctly to the reference gene and were successful determination of 84 species of anurans (95.45%) of the REGUA. Scinax albicans, Scinax flavoguttatus and Hylodes charadranaetes species whose identifications had been determined based on morphological criteria, grouped into clades of the same gender, but different species when analyzed by methodologies neighbor-joining and maximum-likelihood. In addition to high intraspecific distances (2,18%, 3,49% and 3,77% respectively) and interspecific distances to nil (0%), we have an indication of possible mistakes of species determinations made by a morphological criterion. In this case, the morphological and molecular disagreements are exclusively on tadpoles, demonstrating the difficulty of morphological identification and the shortage of identification of these species larval stage. The results show that the 16S mitochondrial gene had its use in identifying the anurans REGUA confirmed and indicate that the case studies with individuals in larval stages, as in tadpoles , the methodology of the barcode when complemented morphological identification, supports the correct identification of species of anurans amphibians .
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Análise comparativa dos nichos espacial e alimentar de anuros em áreas de Caatinga e Mata Atlântica de Sergipe, Brasil

Silva, Adilson de Oliveira 28 February 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Distinct environmental characteristics can directly affect community structure, they offer varying conditions and resources, which allows each area to establish different groups of species. In this study we analyzed two amphibian assemblages between October 2012 and September 2013 in two areas with different degrees of environmental heterogeneity, one in the Caatinga (Monument Natural Grota do Angico - MNGA ) and the other in the Atlantic Rainforest (Refugio de Vida Silvestre Mata do Junco - RVSMJ), both in the state of Sergipe. We used information about the spatial and food niches and their relationships with ecological and historical factors. We analyzed 1,332 records (999 - RVSMJ 333 - MNGA) of 28 species (22 - RVSMJ and 15 - MNGA, nine common to both areas). The food and space niche overlap was relatively high in both study sites. Nine types of microhabitats were used by the species being the most common, regardless of the area, soil (45.1 %), water (23.7 %) and leaflitter (8.6%). The most important preys in their diets were Formicidae and Coleoptera in both areas. Individuals in the Atlantic rainforest were relatively smaller than those of the Caatinga area suggesting differentiated investments between reproduction and growth between the areas. The results suggest that the assemblages from both areas are influenced by historical or phylogenetic factors only in the use of space assets. Their diets are strongly influenced by the availability of resources the environment offers. / Características ambientais distintas podem afetar diretamente a estruturação das comunidades, pois oferecem recursos e condições variadas, o que permite que em cada área, grupos diferenciados de espécies se estabeleçam. Nesse estudo duas taxocenoses de anfíbios anuros foram analisadas entre outubro de 2012 e setembro de 2013, em duas áreas com diferentes graus de heterogeneidade ambiental, uma na Caatinga (Monumento Natural Grota do Angico MNGA) e outra de Mata Atlântica (Refugio da Vida Silvestre Mata do Junco RVSMJ), ambas no estado de Sergipe. Foram utilizadas informações sobre os nichos espacial e alimentar e suas relações com fatores ecológicos e históricos. Foram tomados 1.332 registros (999 - RVSMJ e 333 - MNGA) pertencentes a 28 espécies (22 RVSMJ e 15 MNGA, sendo nove comuns as duas áreas). A sobreposição de nicho espacial e alimentar foi relativamente alta em ambas as áreas. Nove tipos de microhábitats foram utilizados pelas espécies sendo os mais comuns, independente da área, solo (45,1%), água (23,7%) e folhiço (8,6%). As presas mais importantes das dietas foram Formicidae e Coleoptera em ambas as áreas. Os indivíduos da Mata Atlântica foram relativamente menores que os da Catinga sugerindo investimentos diferenciados em reprodução e crescimento entre as áreas. Os resultados obtidos sugerem que as taxocenoses de ambas as áreas são influenciadas por fatores históricos ou filogenéticos somente na utilização dos recursos espaciais. Suas dietas são fortemente influenciadas pelas disponibilidades de recursos que o ambiente oferece.
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Avaliação dos efeitos genotóxicos dos corpos de água temporários de um perímetro irrigado do semiárido sergipano, por meio do Teste SMART em Drosophila melanogaster (MEIGEN, 1830) e do teste do micronúcleo em anfíbios de Hypsiboas creptans (WIED-NEUWIED, 1824)

Santos, Poliana 28 July 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In an attempt to solve the drought problem which causes the loss of agricultural productivity in the Brazilian semiarid zone, leading to starvation, unemployment and rural exodus, the Federal Government has deployed several public irrigated perimeters. In the State of Sergipe, we highlight the Irrigated California Area, which was intended to be the model of rational exploitation of soil and water in the northeast semi-arid. The main crops grown in this perimeter are acerola, banana, guava, mango, soursop, pumpkin, cassava, peanut, cowpea, maize, okra and tomato, with an average annual production of 12,682, 34 tons. Aiming to fulfill this agricultural demand, the use of pesticides and fertilizers is given in excess and without any technical support. This Perimeter is located in the surroundings of the Monumento Natural Grota do Angico a conservation unit. The excessive use of pesticides in this region can contaminate the environment, cause serious harm to human health, putting endangered the local wild species and those that inhabit the conservation area, can cause the loss of biodiversity and as a last destination can reach the water bodies near the plantations. Based on these data, we aimed in the present study to investigate the presence of pesticides with mutagenic effects in temporary water bodies in the Irrigated California Area by 2 tests: the SMART in the wings of D. melanogaster, in which the larvae were treated with water samples from 6 different points and the Micronucleus test, applied in erythrocytes of Hypsiboas creptans tadpoles collected in 3 water bodies between 2013 and 2014. The micronucleus test showed significantly higher frequency of micronuclei in tadpoles collected in one of the temporary water bodies in the Irrigated California Area (CD2) than the ones in the reference area (MNGA). In SMART Test we observed an increase in the frequency of mutant spot cells in the wings of D. melanogaster only in one of the water bodies (CD5), the one with no pesticides detected. The data presented here are pioneers in the evaluation of pesticides mutagenic effect in the semiarid irrigation areas of Sergipe and allow us to conclude that there are different sources of genotoxins presented in the Irrigated California Area, impacting the water and the resident biota, bringing huge risk for farmers and their families who live in that environment. / Na tentativa de resolver o problema das secas, que causam a perda da produtividade agrícola na zona semiárida brasileira, gerando fome, desemprego e êxodo rural, o Governo Federal tem implantado diversos perímetros irrigados públicos. No Estado de Sergipe, destaca-se o Perímetro Irrigado Califórnia, que foi planejado para ser o modelo de exploração racional de solo e água no semiárido nordestino. As principais culturas exploradas neste Perímetro, são acerola, banana, goiaba, manga, graviola, abóbora, aipim, amendoim, feijão de corda, milho, quiabo e tomate, com uma média de produção anual de 12.682, 34 toneladas. Visando atender essa demanda agrícola, agrotóxicos e fertilizantes são usados em excesso e sem qualquer acompanhamento técnico. Este Perímetro localiza-se no município de Canindé de São Francisco, no entorno da unidade de Conservação Monumento Natural Grota do Angico. O uso excessivo de agrotóxicos nesta região pode contaminar o meio ambiente, causar sérios danos à saúde humana, colocar em risco de extinção as espécies selvagens do local e aquelas que habitam a unidade de conservação, podendo causar a perda da biodiversidade e, como último destino, podem alcançar os corpos de água próximos às plantações. Baseando-se nestes dados, o objetivo geral do presente estudo foi investigar a presença de agrotóxicos com efeitos mutagênicos em corpos de água temporários do Perímetro Irrigado Califórnia por meio de 2 testes: Teste SMART de asa em D. melanogaster, onde larvas foram tratadas com amostras de água de 6 diferentes pontos e o Teste do Micronúcleo, aplicado em eritrócitos de girinos da espécie Hypsiboas creptans, coletados em 3 corpos de água, entre 2013 e 2014. O Teste do micronúcleo mostrou frequência significativamente maior de micronúcleos nos girinos coletados em um dos corpos de água temporários do Perímetro Irrigado Califórnia (CD2) que da área de referência (Monumento Natural Grota do Angico). No Teste SMART observou-se aumento na frequência de manchas mutantes em células da asa de D melanogaster somente para um dos corpos de água (CD5). Os dados aqui apresentados são pioneiros na avaliação de efeito mutagênico de agrotóxicos em áreas de irrigação do semiárido sergipano e nos permitem concluir que há genotoxinas de diferentes fontes presentes no ambiente do Perímetro Irrigado Califórnia, com impacto sobre a água e a biota residente, trazendo enorme risco para os agricultores e suas famílias que convivem nesse ambiente.

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