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Correlação entre concentração inibitória mínima e níveis urinários de antimicrobianos para o tratamento de infecções no trato urinário / Correlation between minimum inhibitory concentration and urinary levels of antimicrobials for treatment of infections in urinary tract

Remonatto, Gabriela January 2007 (has links)
Introdução: As Infecções no trato urinário (ITU) estão entre as doenças infecciosas mais comumente diagnosticadas e são responsáveis por uma grande proporção do consumo de agentes antimicrobianos, sendo a Escherichia coli o microorganismo mais freqüentemente envolvido. Os antimicrobianos utilizados no tratamento das ITU sofrem concentração no processo de eliminação, ocasionando altos níveis de antimicrobiano na urina. No entanto, os testes que avaliam a susceptibilidade aos antimicrobianos são baseados em concentrações séricas. Assim, é de interesse a padronização de um teste que utilize níveis urinários (discos de alta potência) dos antimicrobianos frente aos uropatógenos. Objetivo: padronizar teste de susceptibilidade aos antimicrobianos para E. coli de ITU, com concentrações de antimicrobianos atingidas na urina. Métodos: foram utilizados 204 isolados bacterianos resistentes a pelo menos um dos seguintes antimicrobianos: ampicilina, cefalotina, ciprofloxacino, gentamicina, sulfametoxazol-trimetoprima(cotrimoxazol) para os quais foi determinada a MIC através de diluição em agar. Através da análise das MIC obtidas e das concentrações que os antimicrobianos atingem na urina, foram estabelecidas as concentrações dos discos de alta concentração. As seguintes concentrações de disco foram utilizadas: ampicilina (500, 400, 300 μg), cefalotina (200, 100 μg) e ciprofloxacino (200, 150 μg). Resultados: a ampicilina apresentou MIC ≥ 512μg/mL para cerca de 50% dos isolados. Dos discos testados, o de 500 μg mostrou melhor coeficiente de correlação de Spearman (rs: -0,659) e foi escolhido para a determinação do ponto de corte através de curva ROC (receiver operating characteristic). Pela curva, um diâmetro de halo de 9 mm separaria as amostras resistentes (R) das susceptíveis (S) a altos níveis de ampicilina com 100% de sensibilidade e especificidade de 50%. A cefalotina apresentou MIC inferior a 256μg/mL para 78% dos isolados sendo que o “rs” para os discos de 100 e 200 μg foi o mesmo: -0,744. Pela curva ROC, halos de 17mm (disco de 200μg) e 13mm (disco de 100μg) discriminariam amostras R de S com 100% de sensibilidade e 96,9% de especificidade. O ciprofloxacino apresentou MIC ≤ 128 μg/mL para mais de 50% dos isolados, sendo que o “rs” foi melhor com o disco de 200μg (rs:-0,916). Um halo de 21mm separaria as amostras S e R com 100% de sensibilidade e 78,9% de especificidade. Para o cotrimoxazol, 95% das amostras se mostraram resistentes a altos níveis e os testes com disco de alta potência não foram realizados. Para a gentamicina o baixo nº de amostras (n=22) prejudicou a análise, mas cerca de 63% dos isolados seriam susceptíveis a altos níveis. Conclusão: O presente estudo demonstrou que o uso de discos de alta concentração pode ser útil para avaliar a susceptibilidade de isolados urinários. Isto tem importância em laboratórios clínicos onde, embora haja dificuldade na realização da MIC, testes de disco-difusão estão incorporados na rotina. / Introduction: The urinary tract infections (UTI) are among the most common infectious diseases and are responsible for a high antimicrobial usage. The Escherichia coli is the main microorganism involved in UTI. The antimicrobials used for treatment of UTI concentrate in the urinary tract and this leads to high levels of them in the urine. However, the susceptibility tests are based on the serum levels of the antimicrobials. Therefore, it is of interest to develop a test which correlates the urinary levels of antibiotics (discs with high levels) with the uropathogens. Objective: to propose a susceptibility test of E. coli from UTI using doses of the antimicrobials reached in the urine. Methods: a total of 204 clinical isolates of E.coli resistant, according to conventional antimicrobial susceptibility test to, at least, one of the following antimicrobials: ampicillin, cefalotin, ciprofloxacin, gentamicin and trimetoprima- sulfametoxazol. The MIC was determined by the agar dilution technique. According to the results of the MICs and the urinary levels of the antimicrobials it was possible to establish the concentration of the high potency discs. The following concentration of discs were used: ampicilina (500, 400, 300 μg), cefalotin (200, 100 μg) and ciprofloxacin (200, 150 μg). Results: ampicillin presented MIC ≥ 512μg/mL for around 50% of E. coli isolates. The disc containing 500 μg of ampicillin displayed the best coeficient of correlation (rs: -0,659) and it was chosen to establish diameter breakpoint according to the ROC curve. A diameter of 9 mm would discriminate high level ampicillin resistant isolates with 100% and 50% of sensitivity and specificity, respectively. Cefalotin presented MIC below 256 μg/mL for 78% of E. coli isolates. Its “rs” for discs containing 100 and 200μg was the same: - 0,744. According to the ROC curve zone diameters of 17mm (disk of 200μg) e 13mm (disk of 100μg) were able to discriminate isolates resistant with 100% and 96.9% of sensitivity and specificity, respectively. Ciprofloxacin presented MIC ≤ 128 μg/mL for more than 50% of isolates and the best “rs” was achieved with the 200μg (r:-0,916) disk. A zone diameter of 21mm would discriminate susceptible isolates with 100% and 78.9% of sensitivity and specificity. respectively. A total of 95% of E. coli isolates proved to be resistant to high levels of cotrimoxazole and, therefore, tests with high potency disks were not performed. Due to the small numbers of isolates resistant to gentamycin (n=22) we were not able to perform further analysis although 63% of E coli isolates proved to be susceptible to high levels of this antimicrobial. Conclusion: This study indicated that the susceptibility test with disks containing high levels of antimicrobials may be useful to evaluate the susceptibility of urinary tract isolates This may be of importance as the clinical laboratory may not be able to perform the MIC test for routine isolates.
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Avaliação do efeito antimicrobiano de nanopartículas em bactérias da periodontite crônica / Evaluation of the antimicrobial effect of nanoparticles in chronic periodontitis bacteria

Araújo, Tatiana Santos 27 August 2018 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-09-03T11:25:27Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatiana Santos Araújo - 2018.pdf: 2428189 bytes, checksum: df19f39a21998d1646d7679e34c5497e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-09-03T11:28:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatiana Santos Araújo - 2018.pdf: 2428189 bytes, checksum: df19f39a21998d1646d7679e34c5497e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-03T11:28:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatiana Santos Araújo - 2018.pdf: 2428189 bytes, checksum: df19f39a21998d1646d7679e34c5497e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-08-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Periodontal disease is a common and localized inflammatory disease caused by bacterial infection associated with dental biofilm and several pathological conditions, such as inflammation of the gingiva, degeneration of the periodontal ligament, root cementum and loss of alveolar bone, characterizing periodontitis. Chronic Periodontitis is one of the manifestations of Periodontal Disease, it stands out for the high prevalence and incidence, and still remains, throughout the world, as a public health problem, affecting the quality of life of these people. It can be considered a disease of high complexity as to the nature of its etiology, different forms of classification, treatment and maintenance. The major bacteria found include Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, P. intermedia, C. rectus, E. corrodens, Fusobacterium. nucleatum, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, P. micros, Treponema and Eubacterium species. Antimicrobials, by the inhibition of pathogenic microorganisms growth, are a prophylactic and therapeutic alternative for multiple diseases, as well as Chronic Periodontitis. The high capacity of developing resistance to antibiotics has steadily increased and its control is still a major challenge. Nanotechnology provides a new platform for developing important metal properties in the form of nanoparticles (NPs) with promising applications as antimicrobial agents. Since the last decade, silver NPs (Ag-NP) have demonstrated antimicrobial properties against gram-negative bacteria and gram-positive bacteria. In this work, the NPs of Ag and zinc oxide decorated with silver (ZnO-Ag- NP) were synthesized and analyzed for: I the final quality of NPs by X-ray Diffraction (XRD) and Transmission Electron Microscopy MET); II by determining the minimum inhibitory concentration (MIC), the antimicrobial potential on Fusobacterium nucleatum (ATCC 10953) and Porphyromonas gingivalis (ATCC 33277), in vitro for a period of 24 to 96 hours. The antimicrobial activity of Amoxicillin (AMX) and Metronidazole (MTZ) on the strains were evaluated in the same experimental conditions. DRX confirmed the synthesis of Ag-NPs in the face-centered cubic crystallographic phase and ZnO-Ag-NP in the Wurtzite hexagonal phase. MET images showed aspherical shape with an average size of about 2 nm (Ag-NP) and 8 nm (ZnO-Ag-NP) indicating the efficiency of the synthesis method to obtain colloidal suspensions. The CIM for Ag-NP (in the range of 32.4 to 4.05 and> 150 to 37.5 μg / mL) and ZnO-Ag-NP (> 150 to 37.5 and 150 μg / mL) F. nucleatum and P. gingivalis, respectively, point to the concentration-time dependent activity; with higher Ag-NP antimicrobial activity for the same exposure times, 24, 48, 72 and 96 hours. Comparatively, greater sensitivity of F. nucleatum than P. gingivalis to NPs is clearly observed. AMX (0.047 to 0.023 μg / mL) and MTZ (5.0 to 0.625 μg / mL) presented lower MIC values than NPs under microdilution test conditions under anaerobic conditions. The development of new drugs or nanomaterials is promising in the face of the propagation of bacterial resistance, since they have a low propensity to induce microbial resistance when compared to conventional antibiotics. / A Doença Periodontal é uma doença inflamatória localizada e bastante comum, causada por infecção bacteriana associada ao biofilme dental e à diversas condições patológicas, como a inflamação da gengiva, degeneração do ligamento periodontal, cemento radicular e a perda de osso alveolar, caracterizando às periodontites. A Periodontite Crônica é uma das manifestações da Doença Periodontal, destaca-se pela alta prevalência e incidência em todo o mundo, afetando a qualidade de vida dessas pessoas. Pode-se considerar uma doença de elevada complexidade quanto à natureza da sua etiologia, formas de classificação, tratamento e à sua manutenção. As principais bactérias encontradas incluem Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia, P. intermedia, C. rectus, E. corrodens, Fusobacterium nucleatum, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, P.micros e espécies de Treponema e Eubacterium. Os antimicrobianos, por inibirem o crescimento de microrganismos patogênicos, são uma alternativa profilática e terapêutica de múltiplas doenças, assim como da Periodontite Crônica. A alta capacidade de desenvolvimento de resistência contra antibióticos tem aumentado continuamente e seu controle é ainda um grande desafio. A nanotecnologia fornece uma nova plataforma de desenvolvimento das propriedades importantes do metal sob a forma de nanopartículas (NPs) com aplicações promissoras como agentes antimicrobianos. Desde a última década, as NPs de prata (Ag-NP) têm demonstrado propriedades antimicrobianas contra as bactérias gram-negativas e bactérias gram-positivas. Neste trabalho, as NPs, de Ag e de óxido de zinco decoradas com prata (ZnO-Ag-NP), foram sintetizadas e analisadas quanto: I a qualidade final das NPs por Difração de Raios X (DRX) e Microscopia Eletrônica de Transmissão (MET); II através da determinação da concentração inibitória mínima (CIM), o potencial antimicrobiano sobre sobre Fusobacterium nucleatum (ATCC 10953) e Porphyromonas gingivalis (ATCC 33277), in vitro pelo período de 24 à 96h. Comparativamente foi avaliada a atividade antimicrobiana de Amoxicilina (AMX) e Metronidazole (MTZ) sobre as cepas nas mesmas condições experimentais. A DRX confirmou a síntese de Ag-NPs na fase cristalográfica cúbica de face centrada e de ZnO-Ag-NP na fase hexagonal do tipo Wurtzita. As imagens de MET revelaram formato esférico com tamanho médio de cerca de 2 nm (Ag-NP) e 8 nm (ZnO-Ag-NP) apontando a eficiência do método de síntese para a obtenção de suspensões coloidais. A CIM para as Ag-NP (na faixa de 32,4 a 4,05 e >150 a 37,5 μg/mL ) e de ZnO-Ag-NP (>150 a 37,5 e 150 μg/mL) sobre F. nucleatum e P. Gingivalis, respectivamente, apontam para a atividade tipo concentração-tempo dependente; com maior atividade antimicrobiana de Ag-NP para os mesmos tempos de exposição, 24, 48, 72 e 96h. Comparativamente, observa-se com clareza maior sensibilidade de F. nucleatum do que P. gingivalis às NPs. AMX (0,047 a 0,023 μg/mL) e MTZ (5,0 a 0,625 μg/mL) apresentaram valores de CIM menores do que as NPs, em condições de teste em microdiluição em condições anaeróbicas. O desenvolvimento de novos medicamentos ou nanomateriais é promissor diante a propagação da resistência bacteriana, por estes apresentarem baixa propensão de induzir resistência microbiana quando comparados aos antibióticos convencionais.
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Produção, caracterização e estudo da estabilidade de filmes à base de gelatina e extrato de própolis vermelha enriquecidos com óleos essenciais de manjericão (Ocicum basilicum), cravo (Syzygium aromaticum) ou hortelã (Mentha piperita) / Production, characterization and stability study of gelatine-based films and red propolis extract enriched with essential oils of basil (Ocicum basilicum), clove (Syzygium aromaticum) or mint (Mentha piperita)

Laura María Reyes Méndez 15 February 2017 (has links)
Os óleos essenciais e a própolis vermelha são reconhecidos pela atividade antimicrobiana e capacidade antioxidante, e têm sido utilizados em filmes à base de biopolímeros como agentes ativos. O objetivo geral desta tese foi o desenvolvimento de filmes à base de gelatina contendo extrato etanólico de própolis vermelha (EEP) e óleo essencial de cravo (OE cravo), de manjericão (OE manjericão) ou de hortelã (OE hortelã), e aplicação na conservação de carne bovina moída. O EEP e OE´s foram caracterizados em relação ao conteúdo de fenóis totais, atividade antioxidante (ABTS e DPPH) e atividade antimicrobiana contra bactérias Gram (+) S. aureus, L. monocytogenes e bactérias Gram (-) E. coli e S. enteritidis. Foram elaborados filmes com diferentes concentrações de OE´s (8 tratamentos) seguindo um delineamento experimental simplex com dois componentes, e quatro filmes controles: gelatina; gelatina e EEP, gelatina e OE cravo, gelatina e OE manjericão. Os filmes foram caracterizados em relação a conteúdo de fenóis, capacidade antioxidante, atividade antimicrobiana, umidade e solubilidade, propriedades mecânicas (tração e perfuração), propriedades óticas e barreira à luz, permeabilidade ao vapor de água (PVA). Também foram realizadas análises por espetroscopia de infravermelho com transformada de Fourier (FTIR), por difração de raios x (DXR), por calorimetria diferencial de varredura (DSC), e por microscopia eletrônica de varredura (SEM) e microscopia de força atômica (AFM). O filme ativo que apresentou melhor atividade antimicrobiana e capacidade antioxidante e os filmes controles, foram acondicionados a 4 °C e 58%UR por quatros semanas para avaliação da estabilidade antioxidante e antimicrobiana. Amostras de carne bovina moída foram recobertas com o filme ativo e filmes controles, e acondicionadas a 4 ± 2 °C por 10 dias, com avaliações nos dias 0, 3, 7 e 10 de parâmetros cromáticos, índice de peróxidos (IP) e atividade antimicrobiana frente a coliformes totais, aeróbios mesófilos e S. aureus. Observou-se que o EEP apresentou capacidade antioxidante e atividade antimicrobiana, dependentes do tratamento de extração. Foram adicionados no filme de gelatina o EO cravo e OE manjericão por apresentarem atividade antimicrobiana e capacidade antioxidante maior que OE hortelã. A adição de EEP e OE´s na matriz de gelatina proporcionou um aumento no conteúdo de fenóis totais nos filmes. As propriedades mecânicas foram alteradas com a adição dos OE´s e propriedades óticas e barreira a luz UV-Vis pela adição de EEP. A umidade, solubilidade, PVA não foram modificadas drasticamente com a adição dos compostos ativos. Propriedades térmicas, cristalinidade e os resultados das análises espectrofotométricas FTIR apresentaram discretas modificações. O filme ativo e filmes controles diminuíram o crescimento microbiano nas amostras de carne bovina moída comparado com à amostra controle, além de apresentar diminuição no IP ao longo do tempo. Pode-se concluir que a adição de EEP e OE´s melhorou algumas propriedades físicas, além de conferir atividade antimicrobiana e antioxidante aos filmes de gelatina que podem ser aplicados na conservação de alimentos de baixa ou intermediária umidade e susceptíveis à oxidação lipídica. / Essential oils and red propolis are recognized by its antimicrobial activity and antioxidant capacity, and have been used in films based on biopolymers as active agents. The general objective of this thesis was the development of gelatin-based films added with red propolis ethanolic extract (EEP) and essential oil of clove (OE clove), basil (OE basil) and mint (OE mint), and its application for conservation of ground beef. The EEP and OE\'s were characterized in relation to the total phenol content, antioxidant capacity (ABTS and DPPH) and antimicrobial activity against Gram (+) bacteria S. aureus, L. monocytogenes and Gram (-) bacteria E. coli and S. enteritidis. Films with different concentrations of EO clove and EO basil (8 treatments), following a simplex experimental design with two components, and four control films were prepared: gelatin, gelatin and EEP, gelatin and OE clove, gelatin and OE basil. The films were characterized in relation to phenols content, antioxidant capacity, antimicrobial activity, moisture and solubility, mechanical properties (tensile strength and puncture tests), optical properties and light barrier, water vapor permeability (WVP). Moreover, analyses were performed by fourier transform infrared spectroscopy (FTIR), by X-ray diffraction (DXR), by differential scanning calorimetry (DSC), and by scanning electron microscopy (SEM) and atomic force microscopy (AFM). The active film that showed better antimicrobial and antioxidant capacity and controls films were stored at 4 °C and 58% RH for four weeks to evaluate antioxidant and antimicrobial stability. Ground beef were coated with active film and controls films and conditioned at 4 ± 2 ° C for 10 days, with evaluations on days 0, 3, 7 and 10 of the color parameters, peroxide value (PV) and antimicrobial activity against total coliforms, aerobic mesophiles and S. aureus. The EEP presented antioxidant capacity and antimicrobial activity, depending on the extraction treatment. OE clove and OE basil were added to the gelatin film because they presented antimicrobial activity and antioxidant capacity higher than OE mint. The addition of EEP and OE\'s in the gelatin matrix provoked an increase in the content of total phenols in films. The mechanical properties were altered with the addition of OE\'s and optical properties and UV-Vis light barrier by addition of EEP. The moisture, solubility, PVA did not change strongly with the addition of the active compounds. Thermal properties, crystallinity and FTIR spectrophotometric results presented slight modifications. The active film and control films decreased the microbial growth in ground beef samples compared to the control sample, besides showing decrease in the PV over time. It can be concluded that the addition of EEP and OE\'s improved some physical properties, besides conferring antimicrobial and antioxidant activity to the gelatin films that can be applied in the preservation of foods of low or intermediate moisture and susceptible to lipid oxidation.
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Correlação entre concentração inibitória mínima e níveis urinários de antimicrobianos para o tratamento de infecções no trato urinário / Correlation between minimum inhibitory concentration and urinary levels of antimicrobials for treatment of infections in urinary tract

Remonatto, Gabriela January 2007 (has links)
Introdução: As Infecções no trato urinário (ITU) estão entre as doenças infecciosas mais comumente diagnosticadas e são responsáveis por uma grande proporção do consumo de agentes antimicrobianos, sendo a Escherichia coli o microorganismo mais freqüentemente envolvido. Os antimicrobianos utilizados no tratamento das ITU sofrem concentração no processo de eliminação, ocasionando altos níveis de antimicrobiano na urina. No entanto, os testes que avaliam a susceptibilidade aos antimicrobianos são baseados em concentrações séricas. Assim, é de interesse a padronização de um teste que utilize níveis urinários (discos de alta potência) dos antimicrobianos frente aos uropatógenos. Objetivo: padronizar teste de susceptibilidade aos antimicrobianos para E. coli de ITU, com concentrações de antimicrobianos atingidas na urina. Métodos: foram utilizados 204 isolados bacterianos resistentes a pelo menos um dos seguintes antimicrobianos: ampicilina, cefalotina, ciprofloxacino, gentamicina, sulfametoxazol-trimetoprima(cotrimoxazol) para os quais foi determinada a MIC através de diluição em agar. Através da análise das MIC obtidas e das concentrações que os antimicrobianos atingem na urina, foram estabelecidas as concentrações dos discos de alta concentração. As seguintes concentrações de disco foram utilizadas: ampicilina (500, 400, 300 μg), cefalotina (200, 100 μg) e ciprofloxacino (200, 150 μg). Resultados: a ampicilina apresentou MIC ≥ 512μg/mL para cerca de 50% dos isolados. Dos discos testados, o de 500 μg mostrou melhor coeficiente de correlação de Spearman (rs: -0,659) e foi escolhido para a determinação do ponto de corte através de curva ROC (receiver operating characteristic). Pela curva, um diâmetro de halo de 9 mm separaria as amostras resistentes (R) das susceptíveis (S) a altos níveis de ampicilina com 100% de sensibilidade e especificidade de 50%. A cefalotina apresentou MIC inferior a 256μg/mL para 78% dos isolados sendo que o “rs” para os discos de 100 e 200 μg foi o mesmo: -0,744. Pela curva ROC, halos de 17mm (disco de 200μg) e 13mm (disco de 100μg) discriminariam amostras R de S com 100% de sensibilidade e 96,9% de especificidade. O ciprofloxacino apresentou MIC ≤ 128 μg/mL para mais de 50% dos isolados, sendo que o “rs” foi melhor com o disco de 200μg (rs:-0,916). Um halo de 21mm separaria as amostras S e R com 100% de sensibilidade e 78,9% de especificidade. Para o cotrimoxazol, 95% das amostras se mostraram resistentes a altos níveis e os testes com disco de alta potência não foram realizados. Para a gentamicina o baixo nº de amostras (n=22) prejudicou a análise, mas cerca de 63% dos isolados seriam susceptíveis a altos níveis. Conclusão: O presente estudo demonstrou que o uso de discos de alta concentração pode ser útil para avaliar a susceptibilidade de isolados urinários. Isto tem importância em laboratórios clínicos onde, embora haja dificuldade na realização da MIC, testes de disco-difusão estão incorporados na rotina. / Introduction: The urinary tract infections (UTI) are among the most common infectious diseases and are responsible for a high antimicrobial usage. The Escherichia coli is the main microorganism involved in UTI. The antimicrobials used for treatment of UTI concentrate in the urinary tract and this leads to high levels of them in the urine. However, the susceptibility tests are based on the serum levels of the antimicrobials. Therefore, it is of interest to develop a test which correlates the urinary levels of antibiotics (discs with high levels) with the uropathogens. Objective: to propose a susceptibility test of E. coli from UTI using doses of the antimicrobials reached in the urine. Methods: a total of 204 clinical isolates of E.coli resistant, according to conventional antimicrobial susceptibility test to, at least, one of the following antimicrobials: ampicillin, cefalotin, ciprofloxacin, gentamicin and trimetoprima- sulfametoxazol. The MIC was determined by the agar dilution technique. According to the results of the MICs and the urinary levels of the antimicrobials it was possible to establish the concentration of the high potency discs. The following concentration of discs were used: ampicilina (500, 400, 300 μg), cefalotin (200, 100 μg) and ciprofloxacin (200, 150 μg). Results: ampicillin presented MIC ≥ 512μg/mL for around 50% of E. coli isolates. The disc containing 500 μg of ampicillin displayed the best coeficient of correlation (rs: -0,659) and it was chosen to establish diameter breakpoint according to the ROC curve. A diameter of 9 mm would discriminate high level ampicillin resistant isolates with 100% and 50% of sensitivity and specificity, respectively. Cefalotin presented MIC below 256 μg/mL for 78% of E. coli isolates. Its “rs” for discs containing 100 and 200μg was the same: - 0,744. According to the ROC curve zone diameters of 17mm (disk of 200μg) e 13mm (disk of 100μg) were able to discriminate isolates resistant with 100% and 96.9% of sensitivity and specificity, respectively. Ciprofloxacin presented MIC ≤ 128 μg/mL for more than 50% of isolates and the best “rs” was achieved with the 200μg (r:-0,916) disk. A zone diameter of 21mm would discriminate susceptible isolates with 100% and 78.9% of sensitivity and specificity. respectively. A total of 95% of E. coli isolates proved to be resistant to high levels of cotrimoxazole and, therefore, tests with high potency disks were not performed. Due to the small numbers of isolates resistant to gentamycin (n=22) we were not able to perform further analysis although 63% of E coli isolates proved to be susceptible to high levels of this antimicrobial. Conclusion: This study indicated that the susceptibility test with disks containing high levels of antimicrobials may be useful to evaluate the susceptibility of urinary tract isolates This may be of importance as the clinical laboratory may not be able to perform the MIC test for routine isolates.
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Identificação de perfis farmacocinéticos de resíduos de fármacos antimicrobianos utilizados na produção de frangos de corte / Methods Development for Determination of Fluoroquinolones, Amphenicols and Coccidiostats Vet Drugs Residues and Evaluation of Pharmacokinetic Profiles of Enrofloxacin, Ciprofloxacin and Chloramphenicol in Broiler Chickens

Barreto, Fabiano January 2014 (has links)
Objetivo: O objetivo geral deste trabalho foi avaliar o perfil farmacocinético para os compostos enrofloxacino (ENRO) e seu principal metabólito, ciprofloxacino (CIPRO), e cloranfenicol (CAP) em frangos de corte visando subsidiar a tomada de ações para controle de resíduos de medicamentos veterinários em produtos de origem animal e a produção de materiais de referência para fins de controle de qualidade analítica. Métodos: Frangos machos da linhagem Cobb-Vantress foram utilizados nos experimentos para determinação da farmacocinética plasmática e níveis teciduais para os compostos ENRO/CIPRO (10 mg/kg), CAP (100 mg/kg) após administração em dose única oral e administração contínua através da água de consumo simulando as condições reais de produção. As concentrações plasmáticas e teciduais foram determinadas utilizando a técnica de cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas em tandem (LC-MS/MS) através de métodos desenvolvidos e validados in house. Análise farmacocinética nãocompartimental e modelagem compartimental dos dados foram realizadas utilizando o software WinNonlin e NONMEM v.6, respectivamente. Para determinação das concentrações teciduais os animais foram sacrificados em tempos pré-definidos e amostras de plasma, músculo e fígado coletadas para os compostos ENRO/CIPRO e plasma e músculo para CAP. Resultados e Discussão: Três métodos multirresíduos para determinação de medicamentos veterinários incluindo diferentes compostos pertencentes às classes químicas ou terapêuticas previstas nesse projeto foram desenvolvidos utilizando LCMS/ MS com limites de quantificação (LOQ) em acordo com os propósitos de aplicação das metodologias. Além disso, métodos específicos para a análise dos compostos individuais nas amostras de plasma foram desenvolvidos para a determinação dos perfis farmacocinéticos em plasma. Conclusões: com base nos dados gerados foi possível implementar novas metodologias para o controle de resíduos de medicamentos veterinários relevantes na produção de aves de corte, bem como o estudo dos perfis farmacocinéticos e depleção tecidual permitiram o delineamento correto das etapas de planejamento e predição de valores encontrados em amostras experimentais. De forma complementar, os dados gerados permitirão a produção de amostras naturalmente contaminadas contendo os fármacos em questão para a produção de materiais de referência com o objetivo de serem utilizados para controle de qualidade analítico. / Objective: The aim of this study was to evaluate the pharmacokinetic profile for compounds enrofloxacin (ENRO) and its major metabolite, ciprofloxacin (CIPRO), and chloramphenicol (CAP) in broilers in order to support the actions taken to vet drugs residues control in animal products and production of reference materials for purposes of analytical quality control. Methods: Cobb- Vantress male broilers were used in experiments to determine the plasma pharmacokinetics and tissue levels to ENRO / CIPRO (10 mg / kg) and CAP (100 mg / kg) after single oral dose administration and continuous administration compounds through drinking water simulating the production conditions. Plasma and tissue concentrations were determined using liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) using inhouse developed and validated methods. The non-compartmental and compartmental pharmacokinetic data modeling was performed using WinNonlin software and NONMEM v.6, respectively. For determination of tissue concentrations, animals were sacrificed at predefined times and plasma, muscle and liver samples collected for ENRO/ CIPRO and plasma and muscle samples to CAP. Results and Discussion: Three mutiresidue methods for determination of veterinary drugs including compounds belonging to same chemical and therapeutic classes in this project were developed using LCMS/ MS with limits of quantification (LOQ) in accordance with the purposes of application of methodologies. Furthermore, specific for analyzing individual compounds in the plasma samples methods have been developed for determination of plasma pharmacokinetic profiles. Conclusions: Based on the data generated was possible to implement new methodologies for control of veterinary drug residues relevant in broiler production, as well as the study of pharmacokinetic profiles and tissue depletion allowed the correct delineation of planning and predicting values found in experimental samples. As a complement, the data generated will enable the production incurred samples containing the drugs for production of reference materials for analytical quality control purposes.
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Utilização de redes neurais artificiais para a classificação da resistência a antimicrobianos e sua relação com a presença de 38 genes associados a virulência isolados de amostras de Escherichia coli provenientes de frangos de corte

Rocha, Daniela Tonini da January 2012 (has links)
A Escherichia coli patogênica aviária (APEC), pertence à família Enterobacteriacea, é responsável por vários processos patológicos nas aves, atuando como agente primário ou secundário na aerossaculite, pericardite, perihepatite, peritonite, salpingite, onfalite, celulite, entre outros. O presente estudo aborda a resistência a antimicrobianos de amostras de E. coli (APEC) de uma forma inovadora, utilizando como ferramenta as redes neurais artificiais, metodologia inserida na linha de pesquisa do CDPA (Centro de Diagnóstico e Pesquisa em Patologia Aviária). A utilização de inteligência artificial, especificamente, as redes neurais artificiais (RNAs), está sendo crescentemente empregada como ferramenta para a análise de dados não lineares e multivariados, característica comum em fenômenos biológicos. O objetivo do presente trabalho foi demonstrar que é possível predizer o uso de antimicrobianos, utilizando trinta e oito genes responsáveis por distintos fatores de virulência, oriundos das amostras de Escherichia coli isoladas de frango de corte, através das redes neurais artificiais (RNAs). Além disso, verificou-se a relação entre o índice de patogenicidade (IP) e a resistência aos quatorze antimicrobianos que fazem parte do banco de dados usado para o desenvolvimento deste estudo. Neste trabalho foram utilizados os dados disponíveis referentes a 256 amostras de E. coli isoladas de camas de aviários, lesões de celulite e quadros respiratórios de frangos de corte. Para a confecção das redes neurais artificiais as entradas escolhidas foram: os índices de patogenicidade, as lesões induzidas em pintos de um dia de idade, a caracterização dos genes associados à patogenicidade, o bioquimismo, a origem das amostras e por fim, a motilidade. As redes neurais artificiais foram criadas realizando associações entre as variáveis de entrada com o objetivo de encontrar o modelo mais ajustado. As saídas utilizadas de acordo com Salle (2009) foram o comportamento das cepas de Escherichia coli frente aos 14 antimicrobianos. Para verificar se existia diferença significativa entre as médias dos índices de patogenicidade (IP) e as amostras sensíveis e resistentes aos 14 antimicrobianos utilizados neste estudo, realizou-se análise estatística com o auxílio do software JMP® 9.0.1 (SAS Institute Inc., 2010). Os resultados obtidos demonstram que as redes neurais artificiais foram capazes de realizar a classificação correta do comportamento das amostras com amplitude de 74,22% a 98,44%, desta forma tornando possível predizer a resistência antimicrobiana da Escherichia coli, através de modelo das RNAs. A análise estatística realizada para verificar a relação entre o IP e a resistência aos 14 antimicrobianos demonstrou que estas são variáveis independentes. Ou seja, podem haver picos no IP sem alteração na resistência antimicrobiana, ou até mesmo o contrário, alterações na resistência antimicrobiana sem mudanças no IP. / The avian pathogenic Escherichia coli (APEC), belongs to the family Enterobacteriacea, is responsible for various pathological processes in poultry, acting as an agent in the primary or secondary lesion such as: sacculitis, pericarditis, perihepatitis, peritonitis, salpingitis, omphalitis, cellulitis, among others. This study addresses the antimicrobial resistance of E. coli (APEC) strains in an innovative way, using tools such as artificial neural networks, methodology embedded in the CDPA´s search line (Center for Diagnostics and Research in Avian Pathology). The use of artificial intelligence, specifically artificial neural networks (RNAs), is being increasingly used as a tool for data analysis and nonlinear multivariate, common feature in biological phenomena. The objective of this study was to demonstrate that it is possible to predict the use of antimicrobials, using thirty-eight distinct genes responsible for virulence factors, derived from Escherichia coli isolates from broiler, through artificial neural networks (ANNs). Besides, it was found the relationship between pathogenicity index (PI) and resistance to fourteen antimicrobial forming part of the database used for the development of this study. In this study was used the data available for 256 samples of E. coli isolated from broiler litter, lesion of cellulitis and respiratory symptoms in broilers. To make the neural network inputs have been chosen: the indices of pathogenicity, the induced lesions in chicks at day old, characterization of genes associated with pathogenicity, biochemism, the source of samples and finally motility. Artificial neural networks have been created making associations between the input variables in order to find the best adjusted model. The outputs used according Salle (2009) was the behavior of Escherichia coli strains compared to 14 antimicrobials. To check whether there was a significant difference between the average indices for pathogenicity (IP) and the sensitive and resistant samples to 14 antimicrobials used in this study, statistical analysis was performed with the help of software JMP ® 9.0.1 (SAS Institute Inc., 2010). The results show that artificial neural networks were able of performing correct classification of the behavior of the samples with an amplitude of 74.22% to 98.44%, thereby making it possible to predict the antibiotic resistance of Escherichia coli, using ANNs model. The statistical analysis performed to assess the relationship between IP and resistance to 14 antibiotics showed that these variables are independent. That is, it can happen peaks in IP without change in antimicrobial resistance, or even the opposite, changes in antimicrobial resistance without changes in IP.
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Screening de bactérias ácido lácticas isoladas de leite e derivados com potencial probiótico / Screening of lactic acid bacteria isolated from milk and probiotic potential.

Uecker, Julia Neitzel 27 March 2018 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-07-27T21:51:06Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇAO FINAL - Julia Uecker.pdf: 1793822 bytes, checksum: e6a91bc415ec8e15d94438df9730dc76 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-31T19:02:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇAO FINAL - Julia Uecker.pdf: 1793822 bytes, checksum: e6a91bc415ec8e15d94438df9730dc76 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-31T19:02:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇAO FINAL - Julia Uecker.pdf: 1793822 bytes, checksum: e6a91bc415ec8e15d94438df9730dc76 (MD5) Previous issue date: 2018-03-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Bactérias ácido lácticas (BAL) são as principais representantes dos probióticos em alimentos, proporcionando efeitos benéficos à saúde do hospedeiro. Devido aos efeitos já relatados na literatura, a procura por novas linhagens com essas características tem sido relevante. Assim, o objetivo deste estudo foi isolar, identificar e caracterizar BAL presentes em alimentos de origem láctea com potencial probiótico, bem como analisar o efeito antimicrobiano, a capacidade antioxidante e a presença de fatores de virulência e de resistência. Para isso, foram isolados 40 micro-organismos de diferentes produtos lácteos (yakult®, san bios®, leite de vaca, Ricota, queijo minas frescal e kefir), escolhidos 17 micro-organismos de forma aleatória para as analises futuras, como: avaliação das propriedades probióticas pelos testes de tolerância ao pH, sais biliares e trato gastrointestinal superior; determinação das propriedades antioxidantes pelos métodos de captura do radical 2,2-difenil-1-picril-hidrazil (DPPH) e reação ao ácido tiobarbitúrico (TBARS); atividade antimicrobiana frente à micro-organismos patogênicos pelos métodos difusão em poços e difusão em discos; susceptibilidade a antimicrobianos; aspectos de segurança por diversos métodos e detecção de genes com potencial fator de virulência relacionados à adesão, agregação e resistência à vancomicina, além da identificação molecular do 16S rDNA pelo método de Sanger. Por meio dos resultados obtidos observou-se que todos os micro-organismos apresentaram alguma característica probiótica relacionada; todos apresentaram potencial antioxidante pelo método DPPH, porém pelo método TBARS apenas três microorganismos apresentaram inibição da peroxidação lipídica. A análise antimicrobiana por difusão em poços demonstrou que os micro-organismos R1, F3 e F4 apresentaram inibição frente a Escherichia coli; R1 e R9 frente a Listeria monocytogenes e K1, K2, R1, R5, e R9 apresentaram ação antimicrobiana frente ao Staphylococcus aureus. A atividade antimicrobiana por difusão em disco demonstrou que os micro-organismos Y1, Y2, SB4, SB6, R1, R5, R9, L1, L2, L4, K1 e K2 apresentaram inibição frente a E. coli; SB4, SB6, F1, F2 e L4 frente a Salmonella Enteretidis; frente a L. monocytogenes SB6 e L4 apresentaram ação inibitória; e em relação a S. aureus foi observada atividade antimicrobiana quando analisados os micro-organismos L4 e L5. Os micro-organismos foram classificados como homofermentativos, gelatinase, lipase e DNAse negativa; α-hemolíticos, não formadores de biofilme, e não apresentam genes de virulência como agg, asa e genes de resistência como vanA. Assim, conclui-se que os micro-organismos R9 (Lactococcus lactis subsp. Lactis) e L1 (Leuconostoc citreum), destacaram-se como micro-organismos promissores com potencial de uso como probiótico, bem como apresentaram características antimicrobianas e antioxidantes satisfatória. Este resultado torna-se de suma importância, visto o possível uso destes na produção futura de alimentos. / Lactic acid bacteria (BAL) are the main representatives of probiotics in foods, providing beneficial effects to host health. Due to the effects already reported in the literature, the search for new lineages with these characteristics has been relevant. Thus, the objective of this study was to isolate, identify and characterize BAL present in dairy foods with probiotic potential, as well as to analyze the antimicrobial effect, the antioxidant capacity and the presence of virulence and resistance factors. To that end, 40 microorganisms from different dairy products (yakult, San Bios, fresh cow's milk, Ricotta, Frescal cheese and Kefir) were selected, and 17 microorganisms were randomly chosen for future analyzes, such as: evaluation of the probiotic properties by pH, bile salts and upper gastrointestinal tolerance tests; determination of the antioxidant properties by the methods of capture of 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl radical (DPPH) and reaction with thiobarbituric acid (TBARS); antimicrobial activity against pathogenic microorganisms by well diffusion and disk diffusion methods; susceptibility to antimicrobials; safety aspects by several methods and detection of genes with potential virulence factor related to adhesion, aggregation and vancomycin resistance, as well as the molecular identification of 16S rDNA by the Sanger method. By means of the obtained results it was observed that all the microorganisms presented some related probiotic characteristic; all presented antioxidant potential by the DPPH method, but by the TBARS method only three microorganisms showed inhibition of lipid peroxidation. Antimicrobial analysis by well diffusion showed that the microorganisms R1, F3 and F4 showed inhibition against Escherichia coli; R1 and R9 against Listeria monocytogenes and K1, K2, R1, R5, and R9 presented antimicrobial action against Staphylococcus aureus. The antimicrobial activity by disk diffusion showed that the microorganisms Y1, Y2, SB4, SB6, R1, R5, R9, L1, L2, L4, K1 and K2 showed inhibition against E. coli; SB4, SB6, F1, F2 and L4 against Salmonella Enteretidis; against L. monocytogenes SB6 and L4 presented inhibitory action; and in relation to S. aureus, antimicrobial activity was observed when the L4 and L5 microorganisms were analyzed. The microorganisms were classified as homofermentative, gelatinase, lipase and DNAse negative; α-hemolytic, non-biofilm forming, and do not show virulence genes such as agg, wing and resistance genes such as vanA. Thus, it was concluded that the microorganisms R9 (Lactococcus lactis subsp. Lactis) and L1 (Leuconostoc citreum) have been shown to be promising microorganisms with potential for use as probiotics, as well as satisfactory antimicrobial and antioxidant properties. This result becomes of paramount importance, considering the possible use of these in future food production.
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Salmonella sp. em ovos e patos (Cairina moschata) de criações informais / Salmonella sp. in eggs and ducks (Cairina moschata) from informative creations

Delfino, Denizard André de Abreu 07 October 2016 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-03-15T19:00:03Z No. of bitstreams: 2 Tese - Denizard André de Abreu Delfino - 2016.pdf: 1856323 bytes, checksum: cf3dc822049bf13dcac10982b702dfc6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-20T12:43:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Denizard André de Abreu Delfino - 2016.pdf: 1856323 bytes, checksum: cf3dc822049bf13dcac10982b702dfc6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T12:43:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Denizard André de Abreu Delfino - 2016.pdf: 1856323 bytes, checksum: cf3dc822049bf13dcac10982b702dfc6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-10-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The survey was conducted in order to investigate the presence of Salmonella sp. in swabs of cloaca and duck eggs coming from 38 informal breeding sites and 38 markets, and to detect anti-Salmonella Gallinarum and Pullorum antibodies in blood serum of these birds, in the State of Goiás and the Federal Distrito. To determine the productive and sanitary profile of the farms where ducks are raised, we applied 38 questionnaires consisting of 12 closed questions. Through the information obtained by the responses to the questionnaires during the visits, we observed that the farms of the studied regions did not present adequate productive and sanitary management. We collected 324 whole blood samples were used in the test Serological Rapid Agglutination plate (SAR) to detect anti-Salmonella pullorum antibodies. In this test 117/324 (36.1%) blood sera were seropositive. We harvested 324 cloacal swabs from ducks and 912 eggs from 38 farms and 38 markets. The samples were subdivided according to the structure in pools, producing 228 eggshell samples, 228 albumen samples and 228 yolk samples, totaling 684 samples. Cloacal swabs and eggs were analyzed by conventional bacteriology for Salmonella sp. We obtained 38 isolates, 36 from eggs in 36/684 (5.3%), and the serovars were Salmonella Heidelberg, Schwarzengrund, antigenic form O: 9.12, and Salmonella typhimurium, and two isolates from cloaca swabs 02/324 (0.62%). The identified serovars were Salmonella Typhimurium and Hadar. The 36 isolates from eggs and two from cloacal swabs were submitted to susceptibility test to 15 antimicrobials, from which we obtained the following distribution of resistance: 29/38 (76.3%) to sulfonomide, 14/38 (36, 9%) to enroflaxacin, 10/38 (26.3%) to amoxicillin, 7/38 (18.4%) to ampicillin, 7/38 (18.4%) to gentamicin, 6/38 (15.8%) to cotrimoxazole, 6/38 (15.8%) to cephalothin, 6/38 (15.8%) to trimethoprim, 03/38 (7.9%) to ceftiofur, 05/38 (13.1 %) to neomycin, 5/38 (13.1%) to tetracycline, 5/38 (13.1%) to fosfomycin, 3/38 (7.9%) to chloramphenicol, 2/38 (5.3%) to ciprofloxacin, and 0/38 (0%) to florfenicol. The percentage distribution of the isolated serovars was: 32/38 (84.2%) Salmonella Schwarzengrund, 3/38 (7.9%) Salmonella Typhimurium, 1/38 (2.6%) the antigen form: 9.12, 1/38 (2.6%) Salmonella Heidelberg, and 1/38 (2.6%) Salmonella Hadar. The 36 isolates of Salmonella were also submitted to proof of real-time polymerase chain reaction (real-time PCR) on which the following genes were detected: 33/35 (94.3%) for rfbJ, 07/35 (20%) for Int1 gene, and 06/35 (17,1%) for Sul1 gene. Therefore, we verified circulation of Salmonella in ducks and their eggs in informal rearing farms in the state of Goiás and in the Federal District, we also confirmed the antimicrobial resistance and detected resistance genes. This information is important for determining risk for both poultry and public health. / A pesquisa foi feita com o objetivo de investigar a presença de Salmonella sp. em suabes de cloaca e nos ovos de patas oriundos de 38 criações informais e de 38 feiras livres, além de detectar anticorpos anti-Samonella Gallinarum e Pullorum em soro sanguíneo destas aves, no Estado de Goiás e no Distrito Federal. Para determinação do perfil produtivo e sanitário destas propriedades que criavam patos foram aplicados 38 questionários compostos por 12 perguntas fechadas. Mediante as informações obtidas pelas respostas dos questionários aplicados durante as visitas, foi observado que as propriedades das regiões estudadas não apresentavam manejo produtivo e sanitário adequados. Foram colhidas 324 amostras de sangue total que foram utilizadas na prova Sorológica de Aglutinação Rápida em Placa (SAR), para detecção de anticorpos anti-Salmonella Pullorum e Gallinarum. Nesta prova 117/324 (36,1%) dos soros sanguíneos foram sororreagentes. Foram colhidas 324 suabes cloacais de patos e 912 ovos em 38 propriedades e 38 feiras, que foram subdivididos de acordo com a estrutura em pool, dando origem a 228 amostras de casca, 228 de albúmen e 228 de gemas, totalizando 684 amostras. Os suabes cloacais e ovos foram analisados por bacteriologia convencional para pesquisa de Salmonella sp. Foram obtidos 38 isolados, sendo 36 em ovos 36/684 (5,3%), onde os sorovares foram Salmonella Heidelberg, Schwarzengrund, forma antigênica O:9,12 e Salmonella Typhimurium e dois isolados de suabes de cloaca 02/324 (0,62%), sendo identificados os sorovares Salmonella Typhimurium e Hadar. A distribuição percentual dos sorovares isolados foi: 32/38 (84,2%) Salmonella Schwarzengrund, 3/38 (7,9%) Salmonella Typhimurium, 1/38 (2,6%) a forma antigênica O:9,12, 1/38 (2,6%) Salmonella Heidelberg e 1/38 (2,6%) Salmonella Hadar. Os 36 isolados de ovos e os dois de suabes cloacais foram submetidos aos testes de suscetibilidade a 15 antimicrobianos, nos quais se obteve a seguinte distribuição de resistência: 29/38 (76,3%,) às sulfonamidas, 14/38 (36,9%) à enroflaxacina, 10/38 (26,3%) à amoxicilina, 7/38 (18,4%) à ampicilina, 7/38 (18,4%) à gentamicina, 6/38 (15,8%) ao cotrimoxazol, 6/38 (15,8%) à cefalotina, 6/38 (15,8%) ao trimetoprim, 03/38 (7,9%) ao ceftiofur, 05/38 (13,1%) a neomicina, 5/38 (13,1%) à tetraciclina, 5/38 (13,1%) à fosfomicina, 3/38 (7,9%) ao cloranfenicol, 2/38 (5,3%) à ciprofloxacina e 0/38 (0%) ao florfenicol. Os 36 isolados de Salmonella foram ainda submetidos a prova de PCR em tempo real, onde foram detectados os seguintes genes: rfbJ 33/35 (94,3%), o gene Int1 foi de 07/35 (20%) e o gene Sul1 foi de 06/35 (17,1%). Portanto, foi detectada a circulação de Salmonella em patos e seus ovos nas criações informais e feiras no Estado de Goiás e no Distrito Federal, assim como a confirmação de resistência aos antimicrobianos e detecção de genes de resistência. Estas informações são importantes para determinação de risco, tanto para sanidade avícola quanto para saúde pública.
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Caracterização genotípica e fenotípica de cepas de Escherichia coli associadas à diarreia pós-desmame em suínos / Genotypic and phenotypic characterization of Escherichia coli strains associated with from post-weaning swine

Marina Moreno 24 February 2015 (has links)
A Escherichia coli é um dos principais agentes envolvidos na síndrome da diarreia pós-desmame em suínos, sendo a infecção de difícil controle devido à elevada capacidade deste agente em desenvolver e disseminar mecanismos de resistência aos antimicrobianos utilizados para o tratamento da doença. No presente estudo foi estabelecido o perfil de virulência de cepas de E. coli isoladas de 621 leitões com sintomas de diarreia na fase de creche (21 a 40 dias de vida), provenientes de 52 granjas de suínos no Brasil. Foram selecionadas 148 cepas de E. coli, positivas para fímbria F4 e /ou F18 e destas foi determinado o perfil de resistência à antimicrobianos por determinação da concentração inibitória mínima para os seguintes antimicrobianos: ampicilina, clindamicina, clortetraciclina, danofloxacina, enrofloxacina, florfenicol, gentamicina, neomicina, oxitetraciclina, sulfadimetoxina, espectinomicina, trimetoprima / sulfametoxazole, tiamulina, tilmicosina, tulatromicina, tilosina, ceftiofur e enrofloxacina. Dos 621 animais observados, 321 animais foram positivos para pelo menos um fator de virulência. Das cepas estudadas, todas as 148 foram resistentes a tilosina, clindamicina, tiamulina, tilmicosina e sulfadimetoxina. A frequência de cepas resistentes foi elevada também para o oxitetraciclina, clortetraciclina, danofloxacina, ampicilina e ao florfenicol. Considerando-se o fato de 100% das cepas terem apresentado resistência a mais de três classes de antimicrobianos pode-se concluir que todas as cepas de E.coli do presente estudo foram multirresistentes sendo frequente a resistência aos principais antimicrobianos utilizados na terapia da diarreia em leitões de creche / Escherichia coli is one of the agents involved in the syndrome of post-weaning diarrhea in swine. The infection is difficult to control because of high ability of this agent to develop and spread antimicrobial resistance mechanisms against commonly used antibiotics. This study has as goal determine the virulence profile of E. coli strains isolated of 621 piglets with diarrhea symptoms in the nursery with 21-40 days of age, from 52 pig farms in Brazil. Of the isolated strains, we selected 148 strains of E. coli, positive for F4 fimbriae and / or F18 and these were tested for antimicrobial resistance for determining the minimum inhibitory concentration for the following antibiotics: ampicillin, clindamycin, chlortetracycline, danofloxacin, enrofloxacin, florfenicol, gentamicin, neomycin, oxytetracycline, sulfadimethoxin, spectinomycin, trimethoprim / sulfamethoxazole, tiamulin, tilmicosin, tulathromycin, tylosin, ceftiofur and enrofloxacin. Of the 621 observed animals 321 animals were positive for at least one virulence factor. Of the studied strains, all 148 were resistant to tylosin, clindamycin, tiamulin, tilmicosin and sulfadimethoxin. The frequency of resistant strains was also high for oxytetracycline, chlortetracycline, danofloxacin, ampicillin and florfenicol. Considering the fact that 100% of the strains have shown resistance to more than three classes of antimicrobials can be concluded that all E. coli strains in this study were multidrug-resistant and are frequent the resistance to the main antimicrobials used in therapy of diarrhea in nursery pigs
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Controle de patógenos de importância alimentar utilizando ramnolipídeo e óleoresina de Apium graveolens / Control of foodborne pathogens using rhamnolipid and Apium graveolens oilresin

Debora Mariana Drappé Mayer 06 October 2017 (has links)
O controle bacteriano na indústria alimentícia é de extrema importância uma vez que os microrganismos são responsáveis por causar contaminações persistentes, levando à deterioração do alimento e à transmissão de doenças. Este trabalho teve por objetivo avaliar o potencial antimicrobiano do biossurfatante ramnolipídeo (RL) e de óleoresinas (OR) de aipo, noz moscada, alho, gengibre, pracaxi, patauá e buriti frente as bactérias patogênicas alimentares Listeria monocytogenes, Bacillus cereus e Escherichia coli enterohemorrágica (EHEC). O OR de aipo foi avaliado individualmente e em combinação com o RL. A atividade antimicrobiana foi determinada pelo método de microdiluição em caldo - concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima (CBM). Biofilmes de L. monocytogenes e B. cereus foram formados em placas de microtitulação de poliestireno, respectivamente, nos meios de cultivo triptona de soja com extrato de levedura (TSYE) e caldo nutriente (CN) à 37ºC por 48 h e avaliados através da quantificação da biomassa e viabilidade celular após tratamento com os antimicrobianos. O RL apresentou efeito bacteriostático com CIM 125 &#956g/mL frente a L. monocytogenes e para B. cereus observou-se ação bactericida com CBM de 31,25 &#956g/mL. A triagem preliminar mostrou que, dentro da faixa das concentrações testadas, os óleos de buriti, pracaxi, patauá, alho e gengibre não apresentaram CIM frente aos patógenos. O OR de aipo inibiu o crescimento de L. monocytogenes e B. cereus com CIM de 3% e 0,75%, respectivamente. A combinação de 125 &#956g/mL de RL e 3% de óleo de aipo foi bacteriostática para L. monocytogenes, enquanto para B. cereus a combinação dos agentes foi bacteriostática com menor valor de CIM (7,81 &#956g/mL de RL e 0,19% de OR de aipo), sugerindo efeito sinérgico. A linhagem de Escherichia coli (EHEC) foi resistente aos agentes nas concentrações testadas. O RL removeu 70,7% dos biofilmes de L. monocytogenes após 24 h de tratamento, entretanto a redução da viabilidade celular foi maior após 2 h de contato com RL inibindo 66,6%. O OR de Aipo (6%) foi capaz de reduzir 57,1% da viabilidade celular após 24 h de tratamento, já a combinação do RL com OR de aipo foi eficaz em todos os tempos de tratamentos, com redução média de 49,5% de células viáveis do biofilme de L. monocytogenes. Para o biofilme de B. cereus o melhor tratamento (13h) com RL (31,25 &#956g/mL) removeu 71,5% do biofilme, enquanto que a combinação com o OR de aipo (15,62 &#956g/mL + 0,38%) foi capaz de remover 79,5% da biomassa. O RL (62,50 &#956g/ mL) mostrou inibição média de 85,4% da viabilidade celular de biofilme de B. cereus. O melhor tratamento com OR de aipo (1,50%) reduziu a viabilidade celular de B. cereus em 51,2%, após 2 h; e quando combinado com RL (15,62 &#956g/ mL + 0,38%) em 71,8%. RL e OR de aipo mostraram ação antimicrobiana frente a células planctônicas e sésseis de L. monocytogenes e B. cereus, sugerindo potencial para desenvolvimento de novas formulações naturais visando o controle destes patógenos alimentares. / Bacterial control in the food industry is very important once many microorganisms are responsible for causing persistent contamination, leading to food deterioration and disease transmission. Research and development of natural antimicrobial agents is a trend of the market that has been gaining increasing interest. The aim of this study was to evaluate the antimicrobial potential of the rhamnolipid biosurfactant (RL) and celery oleoresin (OR) against food pathogens Listeria monocytogenes, Bacillus cereus and Escherichia coli enterohemorrhagic (EHEC) both in planktonic and in biofilms forms. Celery OR was evaluated individually and in combination with RL. Antimicrobial activity was determined by the broth microdilution method and expressed as minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC). Biofilms of L. monocytogenes and B. cereus were formed in polystyrene microtiter plates, respectively, in tryptone yeast extract (TSYE) and nutrient broth (NB) media at 37°C for 48 h. Biofilms were evaluated by quantification of biomass and cell viability after treatment with antimicrobials. RL presented bacteriostatic effect showing MIC of 125 &#956g/mL against L. monocytogenes and a bactericidal effect at 31.25 &#956g/mL against B. cereus. Preliminary screening showed that, within the range of tested concentrations, buriti, pracaxi, patauá, garlic and ginger oils did not show minimal inhibitory concentration against pathogens. Celery OR inhibited the growth of L. monocytogenes and B. cereus at MIC of 3% and 0.75%, respectively. The combination of 125 &#956g/mL RL and 3% celery oil was bacteriostatic for L. monocytogenes, while for B. cereus the combination effect was also bacteriostatic at a lower MIC (7.81 &#956g/mL RL and 0.19% celery OR), suggesting synergistic effect. Escherichia coli strain (EHEC) was resistant to all agents at the concentration tested. The biofilms of L. monocytogenes were removed by 70.7% after 24 h of treatment using RL (250 &#956g/mL), however, at shorter time (2 h) were more effective in reducing cell viability, showing an inhibition of 66,6%. Celery OR (6%) was able to reduce 57.1% of cell viability after 24 h of treatment, and the combination of RL and celery OR was effective at all treatment times, with a mean reduction of 49.5% of viable L. monocytogenes biofilm cells. Biofilms of B. cereus treated with RL (31.25 &#956g/ml) for 13 h were removed in 71.5%, while the combination of RL with celery OR (15.62 &#956g/mL + 0.38%) was able to remove 79.5%. The RL (62.50 &#956g/mL) reduced B. cereus biofilm viability by a mean of 85.4%. Treatment with celery OR (1.50%) reduced the cell viability of B. cereus in 51.2% after 2h and when combined with RL (15.62 &#956g/ mL + 0.38%) in 71.8%. The RL and celery OR showed antimicrobial activity against planktonic and sessile cells of L. monocytogenes and B. cereus suggesting potential to development of new natural formulations to control these food pathogens.

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