Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DoutRCP.pdf: 570979 bytes, checksum: 8077cbbb5452a0d44ca522fb7a753bb5 (MD5) Previous issue date: 2003-03-14 / Universidade Federal de Minas Gerais / Wasps of the genus Trypoxylon (Sphecidae) building their nests with mud and mass-provisioned them with paralyzed spiders. The males of the subgenus Trypargilum may act as guards during the period of nest construction and provisioning. This behavior is common to other Sphecidae, but unusual in Hymenoptera. Theoretically, such behavior makes sense, due to haplodiploid and its relatedness asymmetry, only if male guards be the fathers of the female brood. In this study was investigated the population structure of T. (Trypargilum) albitarse and T. (Trypargilum) rogenhoferi, both common species in Brazil. Nests were sampled in São Carlos and Luís Antônio, State of São Paulo cities. Pupae and adults were analyzed using horizontal starch gel electrophoresis. The populations of the two species showed structured, probably as consequence of philopatric behavior of the wasps. In the case of T. rogenhoferi, behind philopatry, differentiate fecundity among females may be important to determine the observed population structure. Larger females produce more offspring than small ones and, on average, the daughters of these larger females are larger too. Thus, the larger females genotype may be the predominant in the nesting area. In this manner, T. rogenhoferi fits the predictions of the models on optimal sex allocation, another line of investigation in this study. Maternal provisions determined the size of each offspring and females allocated well-stocked brood cells to daughter, the sex that benefits most being large. This strategy yielded differences in size between the sexes, being the females larger than males. There are evidences local prey availability may influence the female decision of lay a male or a female egg and also influence the body size of both sexes, but furthers studies are necessary to test whether local resources enhancement might play some role in T. rogenhoferi populations. The guard paternity also was investigated and was verified to both species that in many cases the guard was the father of the female offspring, but the results are contradictory. The relatedness estimates (determined using variable enzyme systems as markers) have large standard errors; so many of the values do not differ from zero or 0.75 (full sisters). It was not possible to determine whether such deviations are due (i) multiple mating by females, (ii) nest switching and/or (iii) more than one female laying eggs in a nest. It was observed that (ii) and (iii) can occur in variable frequencies, being dependents of population density and availability of places to nesting. The occurrence of (i) may be possible whether the repeated copulations solicited by the guard from the female were not effective to assure to him the paternity. In areas with dense populations, extrapair copulations are frequent. Maybe, the adoption of another approach to determine the paternity in these wasps be the better solution to this question. / Vespas do gênero Trypoxylon (Sphecidae) utilizam barro na construção de seus ninhos e os aprovisionam de modo massal com aranhas paralisadas. Os machos do subgênero Trypargilum atuam como guardas durante a construção e aprovisionamento do ninho. Este comportamento é comum a alguns grupos de Sphecidae, mas não generalizado em Hymenoptera e, teoricamente, devido a assimetria de parentesco decorrente da haplodiploidia, ele tem sentido apenas se a guarda do ninho garantir ao macho a paternidade da prole feminina. Neste estudo, foi verificado como estão estruturadas as populações de T. (Trypargylum) albitarse e T. (Trypargilum) rogenhoferi, espécies comuns em todo Brasil. Para isso, foram coletados ninhos em São Carlos (SP) em Luís Antônio (SP), sendo pupas e adultos analisados usando-se eletroforese em sentido horizontal em gel de amido. As populações das duas espécies mostraram-se estruturadas, provavelmente, em conseqüência do comportamento filopátrico destas vespas. No caso de T. rogenhoferi, além da filopatria, a fecundidade diferenciada entre as fêmeas pode ter papel importante na estruturação da população. Fêmeas grandes produzem maior número de prole e, em média, as filhas destas fêmeas também são grandes. Assim, o genótipo de fêmeas grandes pode predominar nas áreas de nidificação. Neste sentido, T. rogenhoferi adequa-se aos preceitos dos modelos de alocação sexual ótima, outro ponto analisado neste estudo. O aprovisionamento materno determinou o tamanho de cada progênie e as fêmeas destinaram as células de cria melhor aprovisionadas às suas filhas, as quais se beneficiaram por serem maiores. Esta estratégia produziu diferenças de tamanho entre os sexos, sendo as fêmeas maiores do que os machos. Há evidências que a disponibilidade local de presas pode ser importante na decisão da fêmea em produzir prole de um ou outro sexo e influenciar o tamanho corporal de ambos os sexos, mas estudos futuros são necessários para verificar se o aumento local de recursos poderia desempenhar algum papel nas populações de T. rogenhoferi. A paternidade do guarda também foi investigada e foi verificado nas duas espécies que em muitos casos ele é o pai da prole feminina, mas os resultados apresentaram- se contraditórios para as duas espécies. Devido aos grandes erros padrões associados as estimativas de parentesco (determinadas usando-se sistemas enzimáticos polimórficos como marcadores), muitos dos valores encontrados não diferiram de zero ou 0,75 (irmãs completadas). Não foi possível determinar se estes desvios relacionam-se com (i) acasalamentos múltiplos, (ii) troca de ninhos entre fêmeas e/ou (iii) posturas de fêmeas diferentes em um mesmo ninho. De acordo com observações feitas nas áreas de nidificação, (ii) e (iii) podem ocorrer com freqüência muito variável, dependendo da densidade populacional e disponibilidade de locais de nidificação. A ocorrência de (i) pode ser possível caso as repetidas cópulas entre o guarda e a fêmea não sejam efetivas para assegurar a ele a paternidade. Em áreas com populações densas, cópulas extrapar são comuns. Talvez a adoção de outra abordagem na determinação da paternidade nestas vespas seja a melhor solução para esta questão.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6253.pdf: 5729447 bytes, checksum: f2e05373166926e6816bed92f8f5d53f (MD5) Previous issue date: 2014-10-01 / Universidade Federal de Minas Gerais / The origin and evolution of Elateridae bioluminescence is uncertain, especially the evolution of the luciferases of different phases and lanterns of Elateridae, the relationship between structure and bioluminescence spectra and the phylogeny of neotropical species. In this study, the cDNA containing the genes of Fulgeochlisus bruchi and Pyrophorus angustus luciferases, which presente different kinetic characteristics, such as high pH optimum and a high affinity for ATP and Luciferin, were cloned. Analyses of Elateridae luciferases suggest that, regardless of the stage of life or organ (dorsal or ventral lanterns), these luciferases displayed a higher identity degree to the luciferases that present closer bioluminescence spectra, probably, due to intergenetic recombination effects. The luciferase primary sequences alignments and site-directed mutagenesis studies suggested important residues to modulate color in Elateridae, such as S247. Our phylogenetic analyzes indicated a closer relationship between Elateridae and Phengodidae, however there are diverngence between the markers used. The sequencing of mitochondrial genomes showed that the Phengodidae genomes displayed several rearrangements and gene duplication, indicating the need for further studies on this family. Our data also suggest that bioluminescence arised at least three times independently in Elateoridea from ancestors similar enzymes. / A origem e evolução da bioluminescência em Elateridae é incerta, especialmente a evolução das luciferases das diferentes fases e lanternas de elaterídeos, a relação entre estrutura e espectros de bioluminescência e a filogenia de espécies neotropicais. Neste trabalho os cDNA contendo os genes das luciferases de Fulgeochlisus bruchi e de Pyrophorus angustus, as quais possuem características cinéticas distintas, como elevado pH ótimo e alta afinidade com ATP e Luciferina, foram clonados. Comparando as luciferases de Elateridae sugerimos que, independentemente da fase de vida ou órgão (lanterna dorsal ou ventral), essas luciferases apresentam maior grau de identidade quanto mais próximos forem os espectros de bioluminescência, provavelmente, devido a efeitos de recombinação gênica. Os alinhamentos das sequências primárias das luciferases e de estudos de mutagênse sítiodirigida sugerem possíveis resíduos importantes para a modulação de cor em Elateridae, como o resíduo S247. Nossas análises filogenéticas indicaram uma maior proximidade entre as famílias Elateridae e Phengodidae, porém existem divergências entre os marcadores utilizados. O sequenciamento dos genomas mitocondriais mostrou que os genomas dos Phengodidae possuem diversos rearranjos e duplicações gênicas, indicando a necessidade de mais estudos sobre essa família. Nossos dados também sugerem que a bioluminescência se originou pelo menos três vezes independentemente em Elateoridea, a partir de enzimas ancestrais similares.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1068.pdf: 1558374 bytes, checksum: 9f494970208ef891e83b858667c6094d (MD5) Previous issue date: 2006-05-10 / Universidade Federal de Sao Carlos / The Roseate Spoonbill (Platalea ajaja, Aves: Threskiornithidae) is a wading bird species which breeds in wetland colonies from the southern United States (US) to the pampas of Argentina. Brazilian colonies are abundant in the Pantanal region, Rio Grande do Sul marshes and in the north region of this country. Adults undergo two annual molt periods which partially overlap with the reproductive cycle. The species has been described as socially monogamous based on field observations of only one couple. We sampled five Pantanal and one Rio Grande do Sul breeding colonies, applying nestling blood and feather sampling and a new non-invasive methodology, the collection of adult molted feathers. Four species-specific and one heterologous microsatellite markers were used to characterize the genetic variability distribution and levels of genetic structure within and between the colonies; to estimate levels of genetic relatedness between nestlings found at the same nest to infer about breeding behavior in the wild; and to estimate and compare the distribution of genetic variability and values of genetic relatedness between male and female adults to infer about patterns of natal dispersal. Mean observed heterozigosity (0,575) was comparable to the reported for a wild-caught population maintained in a US zoo. Results are discussed supposing reduced losses of genetic variability in the US population after the population decline undergone by it, or by a rapid recovery of this population after the bottleneck. Another possibility was hypothesized considering that Brazilian Pantanal population may be declining. No evidences were found of genetic structuring nor differentiation between the colonies (global FST = -0.002, P: 0,59), thus suggesting the existence of high levels of recent or past gene flow between them. Unexpected low relatedness values with significant probability (LOD) values were observed for some dyads found at the same nests. We suggest that extra-pair copulation and/or brood parasitism, already observed in captivity birds, can be occurring in Roseate Spoonbill natural populations, but this fact may be further explored. Comparative analyses showed that genetic variability distribution and relatedness values did not differ significantly between male and female adult samples. The interpretation of these results indicates that both sexes of Roseate Spoonbill apparently present similar patterns of natal dispersal. / O colhereiro (Platalea ajaja, Aves: Threskiornithidae) é uma ave aquática de porte médio, pernas longas e cor rosada que nidifica em colônias reprodutivas em áreas alagadas desde a porção meridional dos Estados Unidos da América (EUA) até as pampas da Argentina. As colônias brasileiras dessa espécie são abundantes no Pantanal, na região dos banhados do Rio Grande do Sul e no norte do país. Os adultos passam por duas mudas ao longo do ano que se sobrepõem, em parte, ao ciclo reprodutivo. A espécie foi descrita como socialmente monogâmica segundo observações de campo de um único casal. Neste trabalho, foram amostradas cinco colônias reprodutivas pantaneiras e uma colônia no Rio Grande do Sul, aplicaram-se estratégias convencionais e uma abordagem não-invasiva de coleta de penas de adultos. Quatro locos de microssatélites espécie-específicos e um heterólogo foram usados para: 1) caracterizar a distribuição da variabilidade genética e os níveis de estruturação genética dentro e entre as colônias; 2) estimar os níveis de parentesco genético entre ninhegos amostrados nos mesmos ninhos com o objetivo de inferir sobre o comportamento reprodutivo dos adultos na natureza e 3) estimar e comparar a distribuição da variabilidade genética e os níveis de parentesco genético entre machos e fêmeas adultos para inferir sobre padrões de dispersão natal na espécie. A heterozigosidade media observada (0,575) foi comparável à reportada para uma população de indivíduos capturados na natureza e mantidos em cativeiro num zoológico dos EUA. Os resultados são discutidos supondo pouca perda de variabilidade na população norte-americana após a redução no tamanho populacional por ela sofrido, ou uma rápida recuperação da mesma. Outra hipótese é levantada, considerando que as populações do Pantanal poderiam estar em declínio. Não foram encontradas evidências de estruturação genética nem diferenciação entre as colônias (FST global = -0.002, P: 0,59), o qual sugere a existência de altos níveis de fluxo gênico atual ou passado entre elas. Valores baixos, mas significativos, de parentesco genético foram observados para alguns pares encontrados nos mesmos ninhos. Sugere-se que a copula extra-par e/ou parasitismo de ninho, já observados em indivíduos em cativeiro, podem ocorrer em populações naturais, mas esses fatos devem ser mais profundamente investigados. A análises comparativas demonstraram que a distribuição da variabilidade genética e os valores de parentesco não diferiram entre machos e fêmeas. A interpretação desses resultados indica que ambos os sexos apresentariam padrões semelhantes de dispersão natal.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissMMLU.pdf: 7846926 bytes, checksum: 6aebcfbd2d53467c15e12a4e2d348917 (MD5) Previous issue date: 2006-08-16 / Financiadora de Estudos e Projetos / não consta

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1309.pdf: 889947 bytes, checksum: caf2fc030984ff45b3878c8ece85bb3c (MD5) Previous issue date: 2006-05-29 / Financiadora de Estudos e Projetos / The aim of this work was to investigate the metabolism of juvenile tambaqui (Colosssoma macropomum) fed 4 different protein (35, 30, 25 e 20,5 %) and lipids (4, 8, 11 e 14,5 %) levels in isoenergetic diets. The experiment was carried out in the facilities of the Adaptative Biochemistry Laboratory, located in the Genetics and Evolution Department of the Federal University of São Carlos. Fish growth, hematological parameters, digestives enzymes (unspecific proteases, unspecific lipase and amylase), metabolites (glucose, lactate, piruvate, ammonia, protein, fat acids, triglycerides, amino acids and glycogen), and the enzymes LDH, MDH, GDH, ASAT and ALAT were assayed. The hematological parameters presented no significant alterations. Tambaqui digestive enzymes were responsive to dietary levels of protein and lipids. Fish from the treatments I and II depicted the best growth. In contrast, the lowest one was observed in fish fed with the treatments III and IV. We detected glycolysis, glycogenolysis and lipolysis in livers in accordance the increase of the dietary lipid. It was observed muscular glycogenesis and gluconeogenesis from amino acids and lipolysis to energetic supply in fish fed with high lipid levels. The plasma metabolic profile reflected the function of blood metabolite deliver among the tissues underlining biochemical adaptations due to alterations on the fish feeding. In conclusion, dietary protein and lipid levels induced tambaqui digestive enzymes. The increase of dietary lipid resulted in fish growth decreased, augmented the liver glycolysis and glycogenolysis, increase the muscular glucogenesis and the gluconeogenesis. The fish metabolism seemed to be predominantly lipolitic. / Este trabalho foi realizado no Laboratório de Bioquímica Adaptativa do Departamento de Genética e Evolução da UFSCar, onde propusemo-nos a estudar os aspectos digestivos e metabólicos de juvenis de tambaqui, Colossoma macropomum, alimentado com quatro dietas isoenergéticas com diferentes níveis de proteína (35, 30, 25 e 20,5 %) e lipídio (4, 8, 11 e 14,5 %). Foram analisados os parâmetros hematológicos, a porcentagem de ganho em peso, as atividades das enzimas digestivas (proteases inespecíficas, lipase inespecífica e amilase), intermediários metabólicos (glicose, lactato, piruvato, amônia, proteína, ácidos graxos livres, triglicerídeos livres, aminoácidos e glicogênio) no fígado, músculo branco e plasma e enzimas do metabolismo (LDH, MDH, GDH, ASAT e ALAT). Os resultados obtidos indicaram que os parâmetros hematológicos não apresentaram alterações em função dos níveis de nutrientes das dietas. As enzimas digestivas foram responsivas à mudança nos teores de proteína e lipídio das dietas. Os tratamentos I e II apresentaram as melhores porcentagens de ganho em peso quando comparados aos tratamentos III e IV. O fígado realizou glicólise, glicogenólise e lipólise conforme aumentou o teor de lipídio na dieta. O músculo branco realizou glicogênese, neoglicogênese a partir de aminoácidos e lipólise para atender a demanda energética quando os teores de lipídio aumentaram nas dietas experimentais. O perfil metabólico do plasma refletiu seu papel de transporte dos diversos intermediários metabólicos entre os tecidos, refletindo os ajustes bioquímicos do metabolismo de tambaqui frente às mudanças na composição das dietas. Concluímos que as enzimas digestivas de tambaqui são induzidas pela concentração de proteína e lipídio da dieta, o aumento do teor de lipídio da dieta diminuiu a porcentagem de ganho em peso dos animais, aumentou a glicólise e a glicogenólise hepáticas, aumentou a glicogênese e a neoglicogênese musculares. A preferência metabólica nas condições ensaiadas para manutenção dos processos de produção de energia foi lipolítica.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2669.pdf: 905418 bytes, checksum: e06df8c17515f9220d215dad2779c365 (MD5) Previous issue date: 2009-07-29 / Universidade Federal de Sao Carlos / A carcinicultura marinha brasileira, desde a década de 90, concentra sua produção, principalmente, na espécie exótica Litopenaeus vannamei, a qual era inicialmente importada de países localizados na costa do Pacífico. Devido às normas de proteção ambiental, o setor produtivo, no entanto, foi alertado sobre o risco de importar novos reprodutores para a criação dessa espécie, o que levou os produtores de L. vannamei a adotar práticas de endocruzamento para manutenção de seus planteis e estoques comerciais, conduzindo à perda da viabilidade genética das populações cativas ao longo das gerações. Desta forma, o monitoramento dos níveis de diversidade genética associado ao desenvolvimento de métodos de cruzamento seletivos, utilizando ferramentas moleculares, passou a ser essencial para o manejo adequado desta espécie no Brasil. Este estudo teve como objetivo desenvolver novas marcas microssatélites para esta importante espécie de camarão e analisar a variabilidade e o nível de diversidade genética de duas famílias cativas em L. vannamei, submetidas a um programa de melhoramento genético para caracteres divergentes. Através de uma biblioteca genômica parcial enriquecida (Hamilton et al. 1999), conseguimos desenvolver dez novas marcas de microssatélites úteis em L. vannamei, que também se mostraram eficientes em cinco outras espécies nativas a costa brasileira em testes de transferabilidade de locos. Com essas novas dez marcas foram analisadas a variabilidade e os níveis de diversidade e distancia genética em duas famílias construídas a partir de pools gênicos diferentes; Familia G1 (Venezuela F22 X Panamá F7) e Família G2 (Equador F8 e Panamá). As freqüências alélicas e genotípicas, o número de heterozigotos e homozigotos esperados e observados foram calculados utilizando-se o software Genepop v. 3.4 (Raymond & Rousset 1995). Também foi empregado o software Popgene, versão 1.31 (Yeh et al., 1999) a fim de calcular as porcentagens de locos polimórficos, as freqüências gênicas (Nei, 1987), os índices de diversidade (Nei, 1973), a distância 2 genética (Nei, 1972) e a identidade genética (Nei, 1978). Para calcular a freqüencia de alelos nulos foi usado o software Micro Checker (Oosterhout et al. 2004). As duas famílias apresentaram déficit de heterozigotos significativo (p<0,007), (três locos para G1 e um para G2), sendo verificado um loco com excesso de heterozigotos na família G2. Os locos, no entanto, não apresentaram desequilíbrio de ligação. A análise de estimativa de erros de genotipagem revelou a presença de alelos nulos em três locos, apenas para a família G1, não sendo, porém, constatada a presença de dropout e/ou stutters para nenhum dos sete locos polimórficos analisados. A distância genética e a identidade genética calculadas entre as duas famílias foram de 0,42 e 0,64, respectivamente, sendo observada uma heterozigosidade média de 0,49 para G1 e 0,53 para G2. Essa heterozigosidade pode ser considerada alta quando comparada com estudos em populações selvagens e cativas, provavelmente, devido às famílias em estudo terem sido formadas a partir do cruzamento entre indivíduos pertencentes a estoques geneticamente divergentes. Nesta estratégia, o exocruzamento realizado para formar estas duas famílias parece ter ajudado a recuperar a diversidade genética dos estoques que originaram as famílias G1 (F22 x F07) e G2 (F07 x F08), os quais eram provenientes de cruzamentos endogâmicos em gerações relativamente já avançadas.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2707.pdf: 1210470 bytes, checksum: b1969a78fcafd5db746d0bfe14a82770 (MD5) Previous issue date: 2009-07-07 / Universidade Federal de Sao Carlos / A tribo Euglossini possui cerca de 200 especies de abelhas descritas, distribuidas em cinco generos considerados monofileticos. Os generos Exaerete e Aglae apresentam comportamento cleptoparasita, atacando outras especies de Euglossini. Para a especie Exaerete smaragdina, os unicos relatos na literatura referem-se ao parasitismo de Eulaema nigrita. Porem, ha indicios de que esta nao seja sua unica hospedeira. Desta forma, a filogeografia destas duas especies foi comparada, com o intuito de analisar se ha concordancia entre as suas historias evolutivas, pois, quanto maior a obrigatoriedade da relacao parasitahospedeiro, mais congruente espera-se que sejam suas filogeografias. Para Ex. smaragdina, foram observadas populacoes estruturadas geograficamente e os testes de neutralidade nao foram significantes. Para El. nigrita, nao foi observada estruturacao populacional, havendo uma baixa variabilidade genetica e a maioria das populacoes compartilhando um mesmo haplotipo. Estes dados, associados a testes de neutralidade estatisticamente significantes, indicam que as populacoes desta especie sofreram uma expansao populacional recente. A comparacao dos padroes filogeograficos indica ainda que El. nigrita nao deva ser a unica hospedeira de Ex. smaragdina. Tambem foi analisado o status de especie da Exaerete lepeletieri, considerada recentemente uma sinonimia de Ex. frontalis. Os resultados indicam que Ex. lepeletieri apresenta monofilia para o loco 16S, enquanto dois clados foram observados para o loco Citocromo B (CytB).

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2692.pdf: 5081574 bytes, checksum: 0403cbfc056a6ef26ddbae9e26772bec (MD5) Previous issue date: 2009-07-01 / Universidade Federal de Minas Gerais / The Tribe Euglossini consists of relatively large bees, with metallic skin and bright color. Their extremely long tong enables them to use nectar resources that are inaccessible to other bees. Equipped with high capacity of dispersal, they are able to survive in disturbed environments, and compose even 25% of bees diversity in some forests. As important pollinators of many Angiosperms, especially Orchidaceae, they are fundamental to maintaining the stability of plant communities. Some species of the tribe are abundant in cities, in particular, Euglossa cordata. The genetic variability of five urban populations of this species was estimated by López-Uribe (2006) in adults caught while they were collecting nectar in flowers of Thevetia peruviana. The lack of structure found from nuclear loci (allozymes) and significant population structure for the 16S mitochondrial region are evidences that males and females showed different patterns of dispersion, where females are philopatrics while males are dispersers. To corroborate this hypothesis, this study aimed to determine the genetic structure of populations of E. cordata collected in flowers of T. peruviana in cities along a north/south transect of the State of São Paulo using mitochondrial and nuclear genetic data. The genetic differentiation found in the examined 12 populations was significant for the data sequence of mitochondrial cytb region (Fst=0.15; P<0.05), unlike observed for nine microsatellite loci (Fst=0.008; P>0.05). Allozymes loci were analyzed with the primary purpose of checking the individuals species; most polymorphisms showed that the populations are homogeneous, similar to the microsatellite data. Thus, our data from nuclear genes strongly suggest that there is no evidence of population structure in E. cordata, whereas mitochondrial data suggest structured population and that geographical proximity influence the events of colonization. Our results indicate that dispersal and colonization in E. cordata are characteristic attributes of males and females, respectively. / A tribo Euglossini é constituída por abelhas relativamente grandes, que possuem tegumento metálico, de coloração brilhante. Sua língua é extremamente longa, o que possibilita utilizar recursos de néctar inacessíveis a outras abelhas. Dotadas de alta capacidade de dispersão, são capazes de sobreviver em ambientes perturbados, além de constituírem até 25% da diversidade de abelhas em algumas matas. São importantes polinizadores de diversas Angiospermas, especialmente de Orchidaceae, sendo fundamentais para a manutenção da estabilidade das comunidades vegetais onde se encontram. Algumas espécies da tribo são abundantes nas cidades, em particular, Euglossa cordata. A variabilidade genética de cinco populações urbanas desta espécie foi estimada por López-Uribe (2006) em adultos coletados em flores de Thevetia peruviana durante a coleta de néctar. A ausência de estruturação verificada a partir de locos nucleares alozímicos e a significativa estruturação populacional para a região 16S mitocondrial indicavam que machos e fêmeas apresentavam padrão de dispersão distinto, em que as fêmeas eram filopátricas, enquanto os machos eram os dispersores. Para corroborar esta hipótese, este trabalho teve como objetivo determinar por meio de marcadores genéticos mitocondriais e nucleares a estrutura genética de populações de E. cordata coletadas em flores de T. peruviana em cidades ao longo de um transecto norte/sul do Estado de São Paulo. A diferenciação genética encontrada para 12 populações analisadas foi significativa para os dados de seqüência da região mitocondrial cytb (Fst=0,15; P<0,05), ao contrário do observado para nove locos microssatélites (Fst=0,008; P>0,05). Locos alozímicos também foram analisados, com o intuito principal de verificar a espécie dos indivíduos; a maioria dos polimorfismos demonstraram que as populações são homogêneas, semelhantemente aos dados de microssatélites. Assim, nossos dados de genes nucleares indicam fortemente que não há indícios de estruturação populacional em E. cordata, enquanto que os dados mitocondriais parecem indicar estruturação populacional e que a proximidade geográfica influencia os eventos de colonização. Neste sentido, os dados indicam que dispersão e colonização em E. cordata são atributos característicos de machos e fêmeas, respectivamente.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2827.pdf: 904817 bytes, checksum: cbde040392a5d96f81eb30ab1ff1ce1c (MD5) Previous issue date: 2010-02-26 / Universidade Federal de Sao Carlos / The Atlantic forest is reduced to less than 8% of its original extent, but still has one of the greatest diversity and endemism rates observed in the Neotropical forests. Therefore, this biome can be internationally considered an hotspot for conservation priority. Several taxa are threatened by the intense habitat fragmentation, particularly, some understory species of birds have a reduced ability of permanence in degraded places. Studies on the species Dendrocincla turdina demonstrate that it possesses sensitivity to local intense edge effects and it could even disappear at depleted environments. This lowers tolerance may be due to its high ecological specialization. We can verify the impacts of environmental degradation on the species through analysis of genetic diversity, which is made using molecular markers. A quite useful molecular marker for population studies are the microsatellites, however, some species have none described, preventing such analysis to be performed. Our aim was to identify and to characterize microsatellite loci for D. turdina and to analyze the genetic variability of a population of this species from an Atlantic Forest area in the Sao Paulo State, in order to contribute to the conservation of this species. It were identified and characterized nineteen microsatellite loci, of which 11 showed polymorphism for the studied population. So far there was not any described loci for the species The number of alleles for polymorphic loci ranged from 2 to 16. Only one locus (Dft12) presented deviations of Hardy-Weinberg equilibrium, possibly due to the presence of null alleles. No pair of loci was in linkage disequilibrium. The genetic diversity varied from 0.08 to 0.91 and the observed heterozygosity from 0.07 to 0.80. The inbreeding coefficient for the population did not differ significantly from zero. The software Bottleneck indicated a possible occurrence of population bottleneck. The sex ratio was the expected 1:1. The described microsatellites amplified with success in other two species of the family Dendrocolaptidae (Xyphorhynchus fuscus and Sittasomus griseicapillus), indicating its potential use for population analysis of related taxa. The study produced valuable genetic tools for studies that seek to understand the diversity and genetic structure of the species D. turdina and possibly related groups. The analysis of the molecular biodiversity of species in habitats critically endangered, as the Atlantic forest, may be useful for conservation plans and management, aiding in the recognition and characterization of areas with larger genetic resources, in order to preserve the largest possible variability. / A Mata Atlântica está reduzida a menos de 8% de sua extensão original, ainda assim, possui uma das maiores diversidades e taxas de endemismos observadas em florestas neotropicais. Portanto, este bioma é considerado um local prioritário para conservação internacionalmente. Diversos táxons são ameaçados pela intensa fragmentação de hábitat, particularmente, algumas espécies de aves de sub-bosque têm uma capacidade reduzida de permanência em locais degradados. Estudos com a espécie Dendrocincla turdina demonstram que possui sensibilidade a locais com intenso efeito de borda, podendo até mesmo desaparecer de ambientes muito impactados. Esta baixa tolerância pode ocorrer devido à sua alta especialização ecológica. Podemos verificar os impactos da degradação ambiental sobre as espécies por meio de análises de sua diversidade genética, para isso é necessário fazer uso de marcadores moleculares. Um marcador molecular bastante útil para estudos populacionais são os microssatélites, no entanto, algumas espécies não possuem nenhum loco descrito, impedindo que tal análise seja realizada. Nosso objetivo foi identificar e caracterizar locos de microssatélites para a espécie D. turdina e analisar a variabilidade genética de uma população da espécie em uma área de Mata Atlântica do Estado de São Paulo, de modo a contribuir com a conservação dessa espécie. Foram identificados e caracterizados dezenove locos de microssatélites, dos quais 11 apresentaramse polimórficos para a população estudada. Até o momento não havia nenhum loco descrito para a espécie. O número de alelos para os locos polimórficos variou de 2 a 16. Apenas um loco (Dft12) apresentou desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg, possivelmente devido à presença de alelos nulos. Nenhum loco estava em desequilíbrio de ligação. A diversidade gênica variou de 0,08 a 0,91 e a heterozigosidade observada de 0,07 a 0,80. O coeficiente de endocruzamento para a população não diferiu significativamente de zero. O programa Bottleneck indicou uma possível ocorrência de gargalo populacional. A razão sexual foi a esperada de 1:1. Os microssatélites descritos amplificaram com sucesso em outras duas espécies da família Dendrocolaptidae (Xiphorhynchus fuscus e Sittasomus griseicapillus), indicando sua possível utilização para análises populacionais de grupos taxonômicos relacionados. O estudo produziu ferramentas genéticas importantes para trabalhos que visem compreender a diversidade e estrutura genética da espécie D. turdina e possivelmente de grupos próximos. A análise da biodiversidade molecular de espécies em hábitats criticamente ameaçados, como a Mata Atlântica, podem ser úteis para planos de conservação e manejo, auxiliando no reconhecimento e caracterização de áreas com maiores recursos genéticos, de modo a preservar a maior variabilidade possível.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3067.pdf: 3124482 bytes, checksum: 1b3dfc28c4bcee4b3d0072ea2a186976 (MD5) Previous issue date: 2010-06-02 / Universidade Federal de Sao Carlos / Mdh-1 enzyme locus coding for cytoplasmic malate dehydrogenase has three common alleles Mdh-1100 (F), Mdh-180 (M) e Mdh-165 (S) and it has been extensively used as racial marker in populational studies of Apis mellifera. Additional isoforms are detected by electrophoretic analysis during ontogenetic development of A. mellifera, indicating differential expression of this locus, and a large set of evidences suggests that Mdh-1 alleles are under temperature-mediated selection. In this work, we proposed to study molecular aspects of this locus aiming to understand the nature of observed polymorphism and possible mechanisms leading to the formation of additional isoforms. Our results suggest Mdh-1100 as the ancestral allele that gave origin to alleles Mdh-180 and Mdh-165, and electrophoretic mobility differences of allelic products may be attributed to the substitution of a single aminoacid in each variant. Regarding genic expression during development, we re able to determine that both loci Mdh-1 and Mdh-2, coding for mitochondrial malate dehydrogenase, have high expression in larval and late pupal stages, and present a significant decrease in expression during transitional stages between larva and pupa. We also determined that additional isoforms are characteristic of pupae fat body and hemolymph, not being detected in other tissues, appearing at late larval stage and starting to disappear with beginning of pupal pigmentation. We were not able to identify the causes promoting the formation of the new isoforms, but our results suggest that this phenomenon is not due to alternative splicing or expression of a stage- and tissue-specific gene. / O loco enzimático Mdh-1, codificante da malato desidrogenase citoplasmática, possui três alelos comuns Mdh-1100 (F), Mdh-180 (M) e Mdh-165 (S) e tem sido extensivamente utilizado como um marcador racial nos estudos de população de Apis mellifera. Análises eletroforéticas demonstram o surgimento de isoformas adicionais durante o desenvolvimento ontogenético de A. mellifera, indicando que o loco apresenta expressão diferencial, e um amplo conjunto de evidências sugere que os alelos deste loco estão sob ação da seleção natural mediada pela temperatura. Neste trabalho, nos propusemos a estudar aspectos moleculares deste loco com o objetivo principal de entender a natureza do polimorfismo observado e os possíveis mecanismos que levam à formação das isoformas adicionais. Nossos resultados sugerem que o alelo Mdh-1100 é ancestral e originou os outros alelos Mdh-180 e Mdh-165, e que a diferença na mobilidade eletroforética dos produtos destes alelos pode ser atribuída à alteração de um único aminoácido em cada uma das variantes. Em relação à expressão gênica durante o desenvolvimento, pudemos determinar que tanto o loco Mdh-1 quanto o loco Mdh-2, codificante da malato desidrogenase mitocondrial, apresentam elevada expressão durante a fase de larva e no final da fase de pupa, e uma significativa redução durante a transição de larva a pupa. Também determinamos que as isoformas adicionais são características do corpo gorduroso e da hemolinfa, não sendo encontradas em outros tecidos, e surgem no final da fase larval e começam a desaparecer com o início da pigmentação das pupas. Não pudemos identificar as causas que promovem o aparecimento dessas novas isoformas, porém, nossos resultados sugerem que o fenômeno não deve ser devido a splicing alternativo ou expressão de um novo gene estágio- e tecido-específicos.