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Determinação dos agentes etiológicos virais de diarreia em cães no Brasil

Granados, Oscar Fernando Ortiz January 2015 (has links)
Os vírus entéricos causam infecções que podem ocasionar uma alta morbidade e mortalidade em cães. A diarreia se destaca como o principal sinal clínico e a subsequente desidratação pode causar a morte do animal. O Carnivore protoparvovirus 1 (CPV-2), Canine mastadenovirus A tipo 1 (CAdV-1), o Canine coronavirus (CCoV), o Canine rotavirus (CRV) e o Canine distemper virus (CDV) são considerados os principais agentes que causam gastroenterite viral aguda em cães jovens. O objetivo deste trabalho foi detectar a presença destas cinco espécies virais na população de cães do Brasil. Para isto, foram coletados 325 suabes retais de cães com ou sem diarreia, jovens (> 6 meses) e adultos (< 6 meses), com ou sem histórico de vacinação e de diversas regiões do Brasil. As amostras foram analisadas através da reação em cadeia da polimerase (PCR) ou transcrição reversa seguida de PCR (RT-PCR) utilizando iniciadores específicos para cada um dos agentes virais. Resultaram 81% (264/325) das amostras positivas para um destes vírus, das quais 30,7% (100/325) foram positivas para o CPV-2, 25,5% (83/325) para o CDV, 17,2% (56/325) para o CCoV, 4,6% (15/325) para o CRV e 2,7% (9/ 325) para o CAdV-1. Algumas amostras apresentaram co-infecções, sendo que as espécies mais predominantemente encontradas em co-infecções foram o CDV e CPV-2 em 15,4% (50/325) e 15,0% (49/325), respectivamente, seguidos do CCoV em 10,1% (33/325,), CRV em 3,0% (10/325) e CAdV-1 em 1,5% (5/325) das amostras. A associação viral mais observada foi CDV e CPV-2 em 31/325 (9,5%) amostras positivas para ambos os vírus. Em conclusão, os resultados demonstram que CPV-2, CDV e CCoV são os principais vírus entéricos patogênicos que circularam no Brasil entre os anos de 2008 e 2014, infectando mais frequentemente animais jovens. / Enteric viruses cause infections that lead to high morbidity and mortality. Diarrhea is the main clinical sign, whose subsequent dehydration can cause death of the animal. Carnivore protoparvovirus 1 (CPV-2), Canine mastadenovirus A (CAdV-1), Canine coronavirus (CCoV), Canine rotavirus (CRV) and Canine distemper virus (CDV) are considered the main agents that cause acute viral gastroenteritis in young dogs. The aim of this study was the detection of these five viral species in dogs from Brazil. Rectal swabs from 325 dogs, puppies (< six months old), adult dogs (> 6 months old), with or without a history of vaccination, were collected from various regions of the country. The samples were analyzed by polymerase chain reaction (PCR) or reverse transcription following followed by PCR (RT-PCR) using oligonucleotides specific for each one of this virus. As result, 81% (264/325) of the samples were observed to be positive for at least one virus, 30,7% (100/325) were positive for CPV-2, 25,5% (83/325) for CDV, 17,2% (56/325) for CCoV, 4,6% (14/325) for CRV and 2,7% (9/325) for CAdV-1. Some samples showed co-infection, where the species most predominantly found were CDV and CPV-2 with 15,4% (50/325) and 15,0% (49/325), respectively, followed by CCoV with 10,1% (33/325,), CRV with 3,0% (10/325) and CAdV-1 1,5% (5/325). The most observed viral association was CDV and CPV-2, with 31/325 (9,5%) positive samples for both viruses. In conclusion, the results showed that CPV-2, CDV and CCoV are the main pathogenic enteric viruses that circulated in Brazil between the years 2008 and 2014, infecting more frequently puppies.
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Reconstrução tridimensional de objetos a partir das projeções de suas secções / Tridimensional objects reconstruction from the projections of theirs sections

Mattos, Patrícia Noll de January 1996 (has links)
Este trabalho trata da reconstrução tomográfica bidimensional e tridimensional, a partir de projeções, visando sua utilização em qualquer aplicação que necessite do volume completo do objeto em questão ou que necessite das imagens adquiridas dos- objetos projetados. Propicie-se utilizar um dos métodos pelo qual a tomografia Computadorizada gera as fatias bidimensionais do corpo exposto, expandindo-o para a terceira dimensão. Para tornar isto possível, é necessário o estudo de métodos de reconstrução-bidimensional, bem como a implementação de um deles. E desenvolvido, então, um estudo sobre os conceitos da tomografia computadorizada, seus diferentes tipos, contendo, os métodos de reconstruçãobidimensional utilizado por elas, alem, dos métodos de aquisição das projeções dos objetos a serem reconstruídos. E apresentada uma proposta de trabalho bidimensional, onde será implementado, alem do algoritmo de reconstrução, o processo de aquisição das projeções do objeto em questão, bem como, a modelagem do mesmo. Além, do desenvolvimento de uma proposta de trabalho tridimensional, onde o método de reconstrução bidimensional desenvolvido será expandido para a terceira dimensão e implementado, juntamente com o processo de aquisição dos objetos tridimensionais projetados, bem como, a modelagem dos mesmos. Um protótipo para cada uma destas propostas é gerado, contendo, cada um, a etapa de aquisição das imagens projetadas, e a etapa de reconstrução do objeto. Tanto os resultados da imagem sendo reconstruída, como as imagens adquiridas dos objetos projetados, são Bravados em arquivos. Por fim, é apresentada uma analise dos resultados gerados por estes protótipos, no que diz respeito a convergência de seus algoritmos, e a melhor maneira de utilizá-los, a fim de se obter um melhor resultado. / This paper is about bidimensional and tridimensional tomographic reconstruction working with projections in order to use in any application that needs complete volume of the object used or that needs images of the projected objects acquired. It is used one of the methods by which the computerized tomography generates bidimensional slices of the exposed body expanding it to third dimension. In order to make it possible it was necessary to study bidimensional reconstruction methods, as well as implementing one of them. It is developed a study on concepts of computerized tomography, its different types, including bidimensional reconstruction methods used by them, besides the methods used to acquire projections of the objects to be reconstructed. It is presented a proposal of the bidimensional work, where it will be implemented, besides the reconstruction algorithm, the aquisition process of the projection of the meant objects, as well as modelling them. It is also developed a proposal of a tridimensional work, where the bidimensional reconstruction method developed will be implemented and expanded to third dimension as well as the process of aquisition of the tridimensionals projected objects as well as modelling them. A prototype of these proposals is generated , containing each one the aquisition step of the projected images and the reconstruction step of the object. The results of the reconstructed image as well as the acquired images of the projected objects are saved in files. Finally it is presented an analysis of the generated results of the prototypes as to the convergence of these algorithms and the best way to use them in order to obtain a better result.
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Comparação de algoritmos de aprendizagem de máquina para construção de modelos preditivos de diabetes não diagnosticado / Comparison of machine learning algorithms to build predictive models of undiagnosed diabetes

Olivera, André Rodrigues January 2016 (has links)
O objetivo deste trabalho foi desenvolver e comparar modelos preditivos para detecção de diabetes não diagnosticado utilizando diferentes algoritmos de aprendizagem de máquina. Os dados utilizados foram do Estudo Longitudinal de Saúde do Adulto (ELSA-Brasil), um conjunto bastante completo com aproximadamente 15 mil participantes. As variáveis preditoras foram selecionadas de forma que sejam informações simples dos participantes, sem necessidade de exames laboratoriais. Os testes foram realizados em quatro etapas: ajuste dos parâmetros através de validação cruzada, seleção automática de variáveis, validação cruzada para estimativa de erros e teste de generalização em um conjunto independente dos dados. Os resultados demonstram a viabilidade de utilizar informações simples para detectar casos diabetes não diagnosticado na população. Além disso, os resultados comparam algoritmos de aprendizagem de máquina e mostram a possibilidade de utilizar outros algoritmos, alternativamente à Regressão Logística, para a construção de modelos preditivos. / The aim of this work was to develop and to compare predictive models to detect undiagnosed diabetes using different machine learning algorithms and data from the Longitudinal Study of Adult Health (ELSA-Brasil), which collected an extensive dataset from around 15 thousand participants. The predictor variables were selected from literature research. The tests were performed in four steps: parameter tuning with cross validation, automatic feature selection, cross validation to error evaluation and generalization test in an independent dataset. The results show the feasibility of extracting useful information from ELSA-Brasil as well as the potential to use other algorithms, in addition to logistic regression, to build predictive models from ELSA-Brasil dataset.
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Estudo dos níveis de referência de diagnóstico para procedimentos de tomografia computadorizada no estado de Santa Catarina

Savi, Matheus Brum Marques Bianchi January 2014 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:59:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326189.pdf: 1723668 bytes, checksum: c50ff2e2cf082d829e12a9dd5ff2197a (MD5) Previous issue date: 2014 / A Radiação Ionizante (RI) é conhecida por causar danos aos tecidos humanos e seu uso é cada vez mais frequente. Nesse âmbito, a Tomografia Computadorizada (TC) se destaca por ser responsável por mais de 40% da dose de radiação coletiva mundial. Uma das maneiras conhecidas utilizadas para monitorar e indicar a boa prática do uso da RI na TC, por sua vez, são os Níveis de Referência em Diagnóstico (DRL). Com base nesse panorama, o presente estudo tem por objetivo conhecer os níveis de dose praticados em TC no Estado de Santa Catarina - Brasil e, a partir de tais valores, propor DRLs para os exames de tomografia de crânio, tórax, abdômen e pelve, comparando-os com valores publicados na literatura internacional. Para tanto, foram analisados 1050 exames de Crânio, 108 de Tórax, 98 de Abdômen e 98 de Pelve, totalizando 1354 exames, cedidos por 11 instituições ou aparelhos de TC das seis regiões geográficas de Santa Catarina. A aquisição de valores das variáveis CTDIvol (mGy), Produto Dose-Comprimento (mGy.cm) e Corrente Efetiva (mAs) se deu de duas formas: extração da informação escrita do arquivo DICOM utilizando software específico, ou por meio do Relatório de Dose, em forma de imagem. Uma quarta informação, o Comprimento da Estrutura Irradiada, foi deduzida a partir do CTDIvol e do Produto Dose-Comprimento. Foram realizadas estatísticas descritivas (média, mediana, desvio-padrão, coeficiente de variação e 75 percentil ou terceiro quartil - Q¾) e testes estatísticos teste-t de Student e ANOVA com Post Hoc, por meio da correlação de Bonferroni, para a comparação de variáveis. O Q¾ aplicado ao CTDIvol e DLP foi de 57,4 mGy e 910,4 mGy.cm para exames de TC de crânio, 14,4 mGy e 395 mGy.cm para tórax, 16,25 mGy e 566,9 mGy.cm para abdômen, e 20 mGy e 410 mGy.cm para pelve, frente ao que se propôs novos DRLs (CTDIvol e DLP): 60 mGy e 1000 mGy.cm para TC de crânio, 15 mGy e 400 mGy.cm para TC tórax, 15 mGy para TC de abdômen e 20 mGy com 450 mGy.cm para pelve. Como resultados secundários, estatisticamente, os equipamentos Siemens, os aparelhos de dois canais e a região sul do Estado apresentaram menores doses de radiação ionizante (p<0,001). Em uma visão geral, portanto, pôde-se perceber que a prática dos exames de TC é consonante à dos países comparados a este estudo, como por exemplo, França e Irlanda, ficando acima apenas de uma menor quantia, como a pesquisa de dose em Malta. Há, porém, um grande potencial de redução de dose, uma vez que cerca de metade dos equipamentos produzem doses médias de radiação menores que o Q¾ encontrado neste estudo.<br> / Abstract : The Ionizing Radiation (IR) is known to cause damage to human tissue and its use is becoming increasingly common. Computed tomography (CT) is responsible for over 40 % of the global collective dose of radiation. One of the known ways to monitor and indicate good practice in the use of IR in TC is the Diagnostic Reference Levels (DRL). This study aims to evaluate the dose levels in CT practiced in the State of Santa Catarina (SC) - Brazil, propose DRLs for CT scans of head, thorax, abdomen and pelvis, and compare them with values published in the literature in other countries. In this context, 1050 head, 108 Thorax, 98Abdomen and 98 of pelvis exams were analyzed, totaling 1352 scans. Eleven institutions and CT scanners from 5 geographic regions of Santa Catarina participated in this study. The acquisition of variables values of CTDIvol (mGy), Dose-Length Product (mGy.cm) and Effective Current (mAs) were obtained in two ways: written information extracted from DICOM files using a specific software or through Dose Report image form. A fourth information, the Length of Radiated Structure was deduced from the CTDIvol and Dose-Length Product. Descriptive statistics (mean, median, standard deviation, coefficient of variation and 75 percentile or third quartile - Q¾) and statistical tests such as Student's t test and ANOVA with Bonferroni post hoc testing was used. The Q¾ CTDIvol and DLP was 57.4 mGy and 910.4 mGy.cm for CT of the Head, 14.4 mGy and 395 mGy.cm for chest, 16.25 mGy and 566.9 mGy.cm for abdomen and 20 mGy and 410 mGy.cm for pelvis. Thus the DRLs (CTDIvol and DLP ) were proposed: 60 mGy and 1000 mGy for head CT, 15 mGy and 400 mGy.cm for chest CT, 15 mGy for CT of the abdomen and 20 mGy and 450 mGy.cm for pelvis. As a secondary data, statistically the Siemens equipment, TC with 2 channel and southern Region of Santa Catarina have lower radiation doses (p<0.001). In an overview of the practiced exams of CT, SC it is in accordance with what is practiced in the countries compared in this study such as France and Ireland, standing up only in a few studies like the Maltese one. There is great potential for dose reduction as approximately half of the equipment produces smaller doses of radiation than that Q¾ doses obtained in this study.
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[en] STATISTICAL DETECTION OF PERFORMANCE ANOMALIES IN MIDDLEWARE-BASED SYSTEMS / [pt] DETECÇÃO ESTATÍSTICA DE ANOMALIAS DE DESEMPENHO EM SISTEMAS BASEADOS EM MIDDLEWARE

SAND LUZ CORRÊA 13 September 2011 (has links)
[pt] Tecnologias de middleware têm sido amplamente adotadas pela indústria de software para reduzir o custo do desenvolvimento de sistemas computacionais. No entanto, é difícil estimar o desempenho de aplicações baseadas em middleware devido a fatores como a especificidade de implementação das plataformas de middleware e a multiplicidade de serviços e configurações provida para diferentes cenários de implantação. O gerenciamento do desempenho de aplicações baseadas em middeware pode ser uma tarefa não trivial. Computação autonômica é um novo paradigma para construir sistemas autogerenciáveis, que procuram operar com o mínimo de intervenção humana. Este trabalho investiga o uso de abordagens estatísticas para construir mecanismos autonômicos de controle do desempenho de aplicações baseadas em middleware. Particularmente, investigamos o tema sob três perspectivas. A primeira é pertinente à previsão de problemas de desempenho. Propomos o uso de técnicas de classificação para derivar modelos de desempenho que auxiliem o gerenciamento autonômico das aplicações. Nesse sentido, diferentes classes de modelos em aprendizado estatístico são avaliadas, tanto em cenários de aprendizado offline quanto online. A segunda perspectiva refere-se à redução da emissão de alarmes falsos, visando a construção de mecanismos robustos a falhas transientes dos classificadores. Este trabalho propõe um algoritmo que aumenta o poder de predição das técnicas de aprendizado estatístico combinando-as com testes estatísticos para a detecção de tendência. Por fim, a terceira perspectiva é pertinente ao diagnóstico das causas de um problema de desempenho. Para esse contexto, também propomos o uso de testes estatísticos. Os resultados apresentados nesta tese demonstram que abordagens estatísticas podem contribuir para a construção de ferramentas eficazes e eficientes para a caracterização do desempenho de aplicações baseadas em middleware. Portanto, essas abordagens podem contribuir de forma decisiva para diferentes perspectivas do problema. / [en] Middleware technologies have been widely adopted by the software industry to reduce the cost of developing computer systems. Nonetheless, predicting the performance of middleware-based applications is difficult due to specific implementation details of a middleware platform and a multitude of settings and services provided by middleware for different deployment scenarios. Thus, the performance management of middleware-based applications can be a non-trivial task. Autonomic computing is a new paradigm for building self-managed systems, i.e., systems that seek to operate with minimal human intervention. This work investigates the use of statistical approaches to building autonomic management solutions to control the performance of middleware-based applications. Particularly, we investigate this issue from three perspectives. The rest is related to the prediction of performance problems. We propose the use of classiffcation techniques to derive performance models to assist the autonomic management of distributed applications. In this sense, different classes of models in statistical learning are assessed in both online and online learning scenarios. The second perspective refers to the reduction of false alarms, seeking the development of reliable mechanisms that are resilient to transient failures of the classifiers. This work proposes an algorithm to augment the predictive power of statistical learning techniques by combining them with statistical tests for trend detection. Finally, the third perspective is related to diagnosing the root causes of a performance problem. For this context, we also propose the use of statistical tests. The results presented in this thesis show that statistical approaches can contribute to the development of tools that are both effective, as well as effcient in characterizing the performance of middleware-based applications. Therefore, these approaches can contribute decisively to different perspectives of the problem.
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Avaliação do papel dos marcadores CD200, CD43, CD52 e CD123 no diagnóstico diferencial das doenças linfoproliferativas crônicas b

Arlindo, Elissandra Machado January 2015 (has links)
Introdução: as doenças linfoproliferativas de células B maduras correspondem a cerca de 80% das neoplasias linfoides, são caracterizadas pela proliferação clonal de uma célula B precursora em diferentes estágios de diferenciação. A semelhança imunofenotípica a um dado estágio maturativo é relevante para o diagnóstico diferencial através da imunofenotipagem por citometria de fluxo, embora a sobreposição de expressões possa dificultar a identificação correta de cada linfoproliferação. Alguns marcadores são pouco conhecidos nas diferentes linfoproliferações B e há pouca literatura analisando os dados quantitativamente, sendo grande parte qualitativa. Objetivos: este trabalho avalia a expressão quantitativa em intensidade de fluorescência média (IFM) dos anticorpos CD200, CD43, CD52 e CD123 no diagnóstico diferencial das doenças linfoproliferativas B crônicas. Métodos: estudo transversal, com 124 amostras de pacientes em investigação diagnóstica de doenças linfoproliferativas que realizaram imunofenotipagem em um centro de referência em neoplasias hematológicas no período de outubro de 2014 a junho de 2015. Foram analisadas as IFMs de cada marcador nas onze diferentes doenças diagnosticadas. Resultados: as neoplasias dos 124 pacientes analisados foram: 81 leucemias linfocíticas crônicas (LLC), 17 linfomas de zona marginal (LZM), 9 linfomas linfoplasmocíticos (LLPL), 6 linfomas do manto (LM), 2 tricoleucemias (TRL), 2 tricoleucemias variantes (TRLv), 5 linfomas foliculares (LF), 1 linfoma de Burkitt e 1 linfoma difuso de grandes células B (LDGCB). A expressão mediana do CD200 foi de 46,8 (intervalo: 1,5-334). A expressão mediana de CD200 foi maior na TRL (incluindo a TRLv) e na LLC (85 e 61,2, respectivamente). A expressão de IFM do CD200 na TRLv diferiu quando comparado à TRL na sua forma clássica (mediana: 36,1 versus 220,3). A mesma diferença foi observada na expressão do CD123 quando comparada a TRL à TRLv. Verificamos, que casos de LZM demonstraram IFM medianas de CD43 de 7,1 (intervalo: 1,1-106), em comparação a casos de LM e LLC, nos quais as medianas de IFM do CD43 foram 90 e 176, respectivamente. A comparação da intensidade de CD52 entre amostras demostrou diferença estatisticamente significativa entre LLC e LZM com medianas de IFM de 775,5 versus 1297,0 (P=0,04). Conclusões: nossos resultados sugerem que a citometria de fluxo quantitativa desses marcadores pode ser uma ferramenta adicional útil na identificação de alguns tipos de DLPCBs. / Background: lymphoproliferative disorders of mature B cells account for about 80% of the lymphoid malignancies. They are characterized by the clonal proliferation of a B cell precursor at different stages of differentiation. The similarity of a given phenotypical maturation stage is relevant for the differential diagnosis by immunophenotyping, however overlap in cell morphology and immunologic features may difficult the correct identification of each pathology. Some markers are not well known in different B lymphoproliferative neoplasms and there is little literature analyzing the data quantitatively. Objectives: this study evaluated the expression of CD200, CD43, CD52 and CD123 by flow cytometry on B-cell chronic lymphoproliferative disorders (BCLDs) differential diagnosis. Methods: cross-sectional study, of 124 samples from patients for diagnostic investigation of lymphoproliferative disorders who underwent immunophenotyping in a referral center for hematologic malignancies from October 2014 to June 2015. MFIs were analyzed for each marker in eleven different diagnosed pathologies. Results: the diseases of the 124 patients investigated comprised: 81 chronic lymphocytic leukemia (CLL), 17 marginal zone lymphoma (MZL), 9 lymphoplasmacytic lymphoma (LPL), 6 mantle cell lymphoma (MCL), 2 hairy cell leukemia (HCL), 2 hairy cell leukemia variant (HCLv), 5 folicular lymphoma (FL), 1 Burkitt lymphoma (BL) e 1 diffuse large B cell lymphoma (DLBCL). The CD200 median MFI expression was 46,8 (range: 1,5-334). CD200 was higher in HCL (including HCLv) and CLL cells (85 and 61,2 respectively). HCLv difference in CD200 MFI, when compared to classical HCL (median 36,1 versus 220,3). The same difference in CD123 expression was observed when comparing HCL versus HCLv. We found that cases of MZL exhibited CD43 median MFI of 7,1 (range: 1,1-106), in contrast to cases of MCL and CLL, which had median MFIs for CD43 of 90 and 176, respectively. The comparison of CD52 intensity between CLL and MZL samples showed statistically significant difference with a median MFI of 777,5 versus 1297,0 (P=0,04). Conclusion: our results suggest that quantitative flow cytometry of these markers may be a useful additional tool to better identify some types of BCLDs.
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Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar / Real Time -PCR and NESTED-PCR to detect Mycobacterium tuberculosis in pulmonary samples

Rozales, Franciéli Pedrotti January 2013 (has links)
A tuberculose (TB) é um importante problema de saúde pública, portanto, é necessário o desenvolvimento de novas ferramentas para a detecção rápida e confiável do Mycobacterium tuberculosis, prevenindo a transmissão da TB. O objetivo deste estudo foi avaliar dois testes moleculares para detecção de bactérias do Complexo Mycobacterium tuberculosis (MTBC) diretamente de amostras clínicas. Foi realizado um estudo transversal, no qual foram selecionadas 124 amostras respiratórias. As amostras foram avaliadas por dois testes moleculares “in house” para detecção do MTBC: NESTED-PCR (NPCR) e Real Time PCR (RT-PCR) ambos com primers para o IS6110. As amostras também foram avaliadas por um teste direto (pesquisa de BAAR). Os resultados foram comparados com a cultura para M.tuberculosis e também com os resultados da cultura juntamente com dados clínicos. Uma amostra comercial com quantificação de DNA conhecida foi utilizada para determinação do Limite de Detecção (LOD) dos testes moleculares. O LOD foi de 1 cópia/μL para o RT-PCR e de 25 cópias/μL para o NPCR. O BAAR apresentou baixa sensibilidade - SE - (40%) e alta especificidade - SP - (94%). Ambos os ensaios moleculares, apresentaram elevada SE e SP (RT-PCR 98% e 91%, NPCR 86% e 93%, respectivamente) em relação à cultura. Quando comparamos os resultados frente a cultura juntamente com os dados clínicos, a SE e a SP foram de 90% e 97% para a RT-PCR e de 80% e 99% para a NPCR, respectivamente. Houve um pequeno decréscimo da SE dos métodos moleculares, quando comparados com a cultura mais os dados clínicos em relação à cultura isoladamente, no entanto, a SP foi consideravelmente elevada para os três métodos avaliados. Avaliamos o custo dos insumos para os ensaios moleculares: o custo do NPCR foi de $ 17.77/teste enquanto que o custo do RT-PCR foi de $ 15.76/teste. Em relação ao tempo de execução dos testes o RT-PCR foi mais rápido (2 horas) do que o NPCR (4 horas). Este estudo confirma que técnicas de PCRs podem ser muito úteis para o diagnóstico rápido da TB respiratória, com altas taxas de SP. Ele também pode ser muito importante para a exclusão de diagnóstico, considerando o alto VPN encontrados no nosso estudo. Os resultados demonstraram que os ensaios moleculares visando IS6110 do M. tuberculosis podem ajudar a melhorar o diagnóstico da TB pulmonar, com muitos potenciais efeitos positivos para a gestão clínica e de controle da doença. / Tuberculosis (TB) remains as an important public health problem worldwide. Therefore, the rapid detection of M. tuberculosis is of primary importance to effectively reduce transmission among patients. The aims of this study were to evaluate two molecular tests to detect M. tuberculosis complex (MTBC) directly from clinical samples. The study included 124 respiratory samples which were evaluated by two in house molecular assays for MTBC detection: Nested PCR (NPCR) and Real Time PCR (RT-PCR). The respiratory samples were also evaluated by the direct test (AFB assay). The results were compared with the results of culture and also compared with the culture results plus clinical data of patients. We used a commercial DNA sample with known quantification to establish the Limit of Detection (LOD). The LOD was 1 copy/μL for RT-PCR and 25 copies/μL for NPCR. The AFB assay presented low sensitivity – SE - (40%) and a high specificity - SP – (94%). Both molecular assays, RT-PCR and NPCR presented high SE and SP (RT-PCR 98% and 91%, NPCR 86% and 93%, respectively) compared to culture. When the results of the molecular tests were compared to the culture plus clinical data the SE and SP were 90,20% and 97,26% for RT-PCR and 80,39% and 98,63% for the NPCR, respectively. It was possible to observe a slight decrease of SE of the molecular methods in comparison to culture plus clinical data in relation to culture; however, the SP was increased, since many cases of TB could not be confirmed by culture. Furthermore we evaluated the cost of molecular assays: the NPCR cost was $17.77/test while the RT-PCR cost was $15.76/test. The RT-PCR test was faster (2 hours) than the NPCR (4 hours) to be performed. Our study confirms that PCRs may be useful for rapid diagnosis of respiratory TB, with high SP rates. It may also be very important to exclude such diagnosis, considering the high NPV found in our study. In summary, PCRs targeting IS6110 of MTB improve the accuracy of the diagnosis of pulmonary TB, with many potential positive effects for clinical management and control of the disease.
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Camisa de força para menores : a patologização de crianças e adolescentes (Hospício São Pedro, 1884-1929)

Trevizani, Tiago Marcelo January 2013 (has links)
Esta dissertação busca problematizar a patologização dos modos de ser criança e adolescente que vem se proliferando na atualidade, devido à pulverização dos diagnósticos e à banalização das terapêuticas corretivas. Para isso, recorre à história como uma estratégia metodológica de problematização do presente. Inspirado em uma perspectiva genealógica, tal como propõe Michel Foucault, realizou-se uma análise de prontuários de crianças e adolescentes internados no Hospício São Pedro em Porto Alegre/RS entre os anos de 1884 e 1929. Outras fontes históricas que subsidiaram a pesquisa foram relatórios administrativos dos médicos-diretores desse mesmo estabelecimento, além de livros e artigos científicos escritos por alienistas e psiquiatras no período em questão, publicados, especialmente, nos Archivos Brasileiros de Hygiene Mental e nos Archivos Rio Grandenses de Medicina. Analisaram-se os diagnósticos atribuídos às crianças e adolescentes nessa época; as estratégias disciplinares de normalização dos corpos anômalos e das condutas desviantes; assim como os modelos explicativos da etiologia da alienação mental. Entende-se que os acontecimentos históricos e políticos estão diretamente implicados na produção dos discursos e das práticas em torno das patologias das crianças e adolescentes, pois as fronteiras da anormalidade estão circunscritas num determinado regime de verdade e emergem num determinado campo de relações de poder. / This dissertation aims to problematize the pathologization of the modes of being child and adolescent that comes proliferating today, due to the pulverization of diagnostics and the banalization of corrective therapies. In this way, it uses story as a methodological strategy of questioning the present. Inspired by a genealogical perspective, as proposed by Michel Foucault, an analyze of medical records of children and adolescents admitted into Hospício São Pedro in Porto Alegre/RS between the years 1884 to 1929 was made. Other historical sources that support the research were administrative reports of the medical directors of that establishment. Books and scientific articles written by alienists and psychiatrists in the period in question, published, especially in the Archivos Brasileiros de Hygiene Mental and the Archivos Rio Grandenses de Medicinina have also been used. Were analyzed the diagnostics attributed to children and adolescents at the time; strategies disciplinary of normalization of the bodies anomalous and the deviant behaviors, even as the explicative models of the etiology of mental alienation. Is understood that the historical and political events are directly involved in the production of discourses and practices around the pathologies of children and adolescents, because the borders of the abnormality are circumscribed in a determined regime of truth and emerge in a particular field of power relations.
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Repercussao da presenca de doenca organica e da suspeita de transtorno mental em adolescentes de 13 a 20 anos medida atraves de escalas de sintomatologia depressiva, de risco de suicidio e de expectativa de futuro

Feijo, Ricardo Becker January 1994 (has links)
Com o objetivo de avaliar a repercussão da doença orgânica de baixa morbimortalidade e da suspeita de transtornos mentais medida através de uma escala de triagem, foi delineado um estudo transversal agregado ao Fator em Estudo, onde 187 adolescentes entre 13 e 20 anos foram avaliados quanto ao nível de depressão, expectativa de futuro, ideação e comportamento suicida. Os jovens foram divididos em grupos conforme a presença de doença orgânica e de acordo com a positividade da triagem para transtorno mental. Foram controladas variáveis sócio-demográficas como idade, sexo, instrução, défict cognitivo, Depressão Maior, classe social, tabagismo, turno escolar e turno de atendimento médico, assim como a presença de suspeita ou diagnóstico de doenças neuro-psiquiátricas e doenças orgânicas graves. A presença da doença orgânica esteve associada a maiores níveis de depressão, transtorno mental, menor expectativa de futuro, sem diferenças quanto à ideação e comportamento suicida. A positividade na escala de rastreamento para transtorno mental foi de 8% em jovens da comunidade e 28% em adolescentes com doença orgânica. Quando divididos pelo ponto de corte da escala de triagem, houve associação do grupo positivo com maiores níveis de depressão, menor expectativa de futuro, maior ideação suicida, havendo maior comportamento suicida apenas nos jovens sem diagnósticos clínicos. O sexo feminino apresentou maior nível de depressão e maiores escores de transtorno mental nas escolas da comunidade. Não houve relação entre nível sócioeconômico e nível de instrução com as variáveis estudadas. Este estudo conclui que a doença orgânica de baixa morbi-mortalidade exerce influência nos jovens avaliados, caracterizando-se por maior nível de depressão, transtorno mental e menor expectativa de futuro. Os adolescentes da comunidade com triagem positiva para transtorno mental através de uma escala de rastreamento demonstram maior sintomatologia depressiva, menor motivação para o futuro e maior ideação e comportamento suicida. Finalmente, enfatiza a importância de considerar a seriedade das queixas dos adolescentes doentes clinicamente, e da necessidade da investigação de alterações psiquiátricas nos jovens através de instrumentos elaborados e direcionados às características peculiares desta etapa da vida.
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Comparacao dos resultados da cintilografia de vias biliares sequencial de 24 horas, do indice hepatico e do estudo de variaveis histopatologicas hepaticas no diagnostico diferencial da colestase neonatal

Santos, Jorge Luiz dos January 1993 (has links)
A diferenciação diagnóstica entre colestase extra-hepática e colestase intra-hepática no neonato é um desafio que exige solução antes das primeiras oito semanas de vida. Este estudo compara os resultados da cintilografia de vias biliares seqüencial de 24 horas, do Índice Hepático e do estudo de variáveis histopatológicas hepáticas na diferenciação diagnóstica das causas da colestase neonatal de 49 pacientes internados no Hospital de Clinicas de Porto Alegre entre 1984 e 1991. Vinte e três pacientes foram avaliados prospectivamente pela cintilografia seqüencial de 24 horas e Índice Hepático. Vinte e seis pacientes foram avaliados retrospectivamente, não tendo sido submetidos ao Índice Hepático. Do total de pacientes, em 47 foi realizado estudo histopatológico de figado. A etiologia da colestase neonatal entre os casos estudados inclui atresia de vias biliares (24 pacientes) , hepatite neonatal idiopática (20 pacientes), lues congênita (1 paciente), doença de Caroli (1 paciente), sindrome de Alagille (1 paciente), galactosemia (1 paciente) e sepse (1 paciente). A distribuição sexual na amostra foi 32 meninos e 17 meninas, sendo a relação masculino:feminino próxima de 3:1 na colestase intra hepática e em torno de 1 : 1 na colestase extra-hepática. A freqüência de anomalias extra-hepáticas congênitas associadas à colestase neonatal foi semelhante nas colestases intra e extra-hepática. Um caso de sindrome de polisplenia foi encontrado em um paciente com colestase intra-hepática. A sensibilidade da cintilografia seqüencial de 24 horas e do Índice Hepático foi de 100%. No estudo histopatológico hepático a sensibilidade foi de 95,8%. A especificidade da cintilografia seqüencial de 24 horas em avaliação retrospectiva foi de 45, 5%, a do Índice Hepático foi de 42,8%. Quanto à cintilografia seqüencial em estudo prospectivo a especificidade foi de 71, 4%. Não houve relação entre bilirrubinemia total e de reação direta, e os resultados da cintilografia seqüencial de 24 horas em pacientes com colestase intra-hepática. A especificidade do estudo das variáveis histopatológicas hepáticas foi de 60,9%. As variáveis histopatológicas hepáticas mais importantes na diferenciação entre colestase intra e extra-hepática pelo teste da Análise Discriminante foram proliferação ductal peri-portal, proliferação ductal portal, expansão portal , colestase em duetos neoformados e pontes porta-porta sugerindo colestase extra-hepática. Metaplasia mielóide mostrou-se sugestiva de colestase intra- hepática. Nenhuma variável histopatológica hepática foi discrimi nadora entre coles tase intra e extra-hepática nas primeiras oito s e manas de vida. Os pacientes, tanto com colestase intra-hepática como com coles tase extra- hepática, fizeram a cintilografia, na média com mais de oito semanas de vida <77,94 ~ 42 , 98 dias de vida) e o estudo histopatológico hepático cerca de duas semanas após a realização do teste cintilográfico. Apenas seis pacientes (12,8% dos 47 casos) fizeram o estudo histopatológico hepático antes dos primeiros 60 dias de vida.

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