Au regard de la croissance constante de la demande énergétique mondiale et de l'épuisement des ressources fossiles et des problèmes environnementaux, le recours à des sources d'énergie renouvelables est incontournable. La filière biomasse parait une voie prometteuse pour la production d’énergie propre et durable. La production du Gaz Naturel Synthétique (SNG) à partir de biomasse lignocellulosique est en plein essor. L’objectif de ce travail est la comparaison, par le biais d’indicateurs de développement durable, de systèmes de production de SNG à partir des résidus forestiers et des déchets des palmiers dattiers. L’Analyse de Cycle de Vie Emergétique a été choisie comme l’outil le plus judicieux pour cette étude. Elle permet de comparer les deux systèmes afin de déterminer lequel est le plus efficace et le plus durable, et de localiser leurs possibilités d’améliorations environnementales. Les résultats montrent que l'augmentation de la teneur en eau dans le gaz de synthèse peut éviter le dépôt de carbone au cours de la méthanation. Le rendement « Cold Gaz Efficiency » du procédé SNG est de 52%. Les résultats de l'évaluation environnementale montrent de fortes réductions des gaz à effet de serre pour chaque système. La transformité de SNG français est inférieure à celle du SNG tunisien. Par ailleurs, le système tunisien a la plus grande valeur du pourcentage de renouvelabilité et d'indice de durabilité. Le profil environnemental et la durabilité des deux systèmes étudiés peuvent être encore plus intéressants en installant l'unité de SNG à proximité d’oasis ou de forêts. Dans l'ensemble, le SNG devrait contribuer favorablement à l'avenir du mix d'énergie renouvelable / Actually biomass-based energy supply is a promising route for renewable energy system and sustainable development strategy. Methane rich gas from biomass can be obtained from gasification (Synthetic Natural Gas, SNG). SNG is very suitable, as it could be an important energy carrier. It could replace natural gas for electricity generation and heating systems and use the existing gas infrastructure. The main objective of this work is to investigate the syngas methanation, and to compare the environmental performance and sustainability for different SNG production systems. The French system (valorization of forest residue) and the Tunisian system (valorization of date palm waste) are analyzed and compared by using the Emergetic Life Cycle Assessment method. The inventory data are obtained mainly through process simulation by Aspen PlusTM software. The results show that increasing the steam ratio in syngas can avoid the carbon deposit during methanation process. The cold gas efficiency of the SNG process is 52%.The environmental analysis results show that high greenhouse gas savings can be obtained for each system. The transformity of the French SNG is lower than the one of the Tunisian SNG. On the other hand, the Tunisian system has the highest percentage of renewability and index of sustainability. The environmental performance and the sustainability of the two systems can be made even more attractive by installing the SNG production units near forests or oasis. Overall, the SNG is expected to contribute favorably to the future renewable energy system

Cette thèse a pour principal objet la reconnaissance du local et de l’autochtonie au sein des aires protégées en général et des Parcs nationaux français en particulier. Du global au local, elle tend à voir ce processus comme résultante de la montée en puissance d’un principe axiologique non nécessairement nouveau, mais qui conditionne néanmoins de manière croissante la légitimité et l’efficacité de l’action publique environnementale. La reconnaissance du local et de l’autochtonie serait ainsi en particulier internationalement devenue l’une des conditions de réalisation d’une plus grande justice environnementale au sein des aires protégées.Nous interrogeons comment ce processus a pu s’étendre aux Parcs nationaux français à travers notamment l’analyse des causes et des effets de leur récente réforme (2006). Comment cette reconnaissance a-t-elle pu se voir reprise et éventuellement redéfinie dans l’institutionnalisation des Parcs nationaux dits de « nouvelle génération » ? Par suite, à quels effets, nouveaux ou non, cette reconnaissance « à la française » permet-elle d’aboutir localement, en matière d’inégalité environnementale ? Notre démonstration s’appuie sur la notion de capital d’autochtonie (Retière, 2003) et soutient que les groupes sociaux locaux à même d’administrer la preuve de leur « capital environnemental autochtone » auprès des instances gestionnaires des Parcs nationaux seraient les plus à même de conserver intacts leurs usages de ces aires protégées.Pour mieux traiter notre problématique d’une reconnaissance du local « sous conditions », nous avons concentré sans nous y limiter, nos efforts d’enquête sur le récent Parc national de La Réunion (2007), présenté avec le Parc amazonien de Guyane et le Parc national des Calanques comme parcs de nouvelle génération. Cette enquête, s’appuyant sur plusieurs autres points de comparaison, conduit à entrevoir le Parc national de La Réunion (PNRun) comme un cadre intégrateur écocentré de différents récits globaux et territoriaux. Le déclinisme environnemental, à la fois local et mondialisé, est le plus prééminent de ces récits. Des récits de valorisation de la culture créole et de rattrapage économique lui coexiste néanmoins et le PNRun, enjoint à les reconnaitre au regard de la doctrine du développement durable, apparait comme une combinatoire sans cesse mouvante et instable d’un compromis entre ces trois récits potentiellement contradictoires.La conflictualité coutumière des Parcs nationaux français (Larrère et al., 2009) peut ainsi se comprendre à la lueur d’une concurrence des récits et de leurs porteurs, qui peuvent contester ou soutenir la manière propre au Parc national d’administrer, mais aussi de « mettre en récit » le territoire qui le supporte. Le défi actuel des Parcs nationaux français consiste, au regard de la réforme de 2006, à permettre et à accepter que cette mise en récit soit le fruit d’une co-construction élargie, et non plus d’un exercice réservé aux élites scientifiques, politiques et sociales qui ont toujours constitué ses publics de prédilection. En contexte postcolonial comme sur l’ile de La Réunion, ce défi parait d’autant plus aigu que le « concernement » local pour une mise en récit qui soit réparatrice d’injustices culturelle, sociale et environnementale est important, voire sine qua non. / The main purpose of this thesis is about the recognition of local and indigenous people within protected areas in general and French National Parks in particular. From global to local scales, this process appears to be the result of an axiological principle that is not necessarily new but which nevertheless increasingly conditions the legitimacy and effectiveness of public environmental action. The recognition of local and indigenous people would thus have become one of the conditions for achieving greater environmental justice within protected areas, particularly internationally.We question how this process has been extended to French National Parks, in particular through the analysis of the causes and effects of their recent reform (2006). How could this recognition be taken up and possibly redefined in the institutionalization of the so-called "new generation" national parks? Consequently, to what effects does this "French-style" recognition make it possible to achieve locally, in terms of environmental inequality? Our demonstration is based on the notion of "indigenous capital" (Retière, 2003) and argues that local social groups able to demonstrate their "indigenous environmental capital" to national park management authorities would be in the best position to keep intact their uses of these protected areas.To better address the issue of local people’s recognition "under conditions", we investigated the recent Reunion Island National Park (2007), presented with the Amazonian Park of French Guyana and the Calanques National Park as new generation parks. This survey, based on several other points of comparison, leads us to see Reunion Island National Park (PNRun) as an ecocentric integrating framework of different global and territorial narratives. “Environmental declinism”, both local and globalized, is the most prominent of these stories. Nevertheless, a “local cultural” and an “economic catch-up” narratives coexist with the first one. The PNRun, urged to recognize them due to the doctrine of sustainable development, appears as an ever-changing and unstable combination of these three - potentially contradictory - narratives.The traditional and customary conflicts within French National Parks (Larrère, 2009) can thus be understood as part of a competition between stories and their bearers, who can challenge or support the National Park's own way of administering, but also of "telling" the territory that supports it. The current challenge for French National Parks, in regard of the 2006 reform, is to allow and accept that this policy narrative is the result of a collective construction, and no longer an exercise reserved for some scientific, political and social elites who have always constituted its preferred audiences. In a postcolonial context such as on Reunion Island, this challenge seems all the more acute as the local "concern" for a narrative which is reparative of cultural, social and environmental injustices is important, even sine qua non.

Depuis quelques années, le développement durable s’est imposé comme une valeur sociétale. Les entreprises sont confrontées aux attentes et aspirations de leurs parties prenantes qui ne cessent de croître. Le développement durable est devenu un impératif stratégique et une « source d’enjeux stratégiques » pour les entreprises, indépendamment de leurs secteurs d’activités. Cependant, la question de l’opérationnalisation de ce concept polysémique, polymorphe et protéiforme en des pratiques managériales claires et pertinentes demeure un véritable problème pour les entreprises voulant intégrer le développement durable dans leurs stratégies.Ce travail vise à développer une compréhension de l’implémentation du concept de développement durable dans le cadre des stratégies volontaristes. Pour y parvenir, le point d’ancrage théorique privilégié a été le modèle des ressources et des compétences. Cette recherche qualitative consiste en une étude de cas multiple dans une perspective de réplication littérale. Pour décrire, analyser et comprendre l’implémentation du développement durable, des entretiens semi-directifs et des données secondaires ont été recueillis.Cette recherche est une contribution à la stabilisation et à la mise en perspective du concept de développement durable en sciences de gestion. Elle met en évidence quatre attitudes stratégiques susceptibles d’être adoptées par les entreprises et propose deux modalités complémentaires de mise en œuvre du concept de développement durable. Enfin, elle offre plusieurs pistes d’opérationnalisation dudit concept énoncées de façon thématique. / For some years, sustainable development has imposed itself as a societal value. Enterprises are facing growing expectations and aspirations from their stakeholders. Sustainable development has become both a strategic imperative and a “source of strategic stakes” for enterprises, irrespective of their sector of activities. However, the issue relating to the implementation or conversion of such a polysemous, polymorphic and protean concept into clear and relevant management practices remains a deep concern for the enterprises that are willing to integrate sustainable development in their strategies.This work aims at developing a comprehensive approach in line with the implementation of the concept of sustainable development in the framework of voluntarist strategies. To do so, the privileged theoretical standpoint has been the resources and competence model. Such a qualitative research consists in a multiple case study, in a perspective of literal replication. To describe, analyze and understand the implementation of sustainable development, semi-directing interviews have been carried, along with secondary data collection.This research is instrumental in stabilizing and putting in perspective the concept of sustainable development in the field of management science. First of all, it brings into focus four strategic attitudes that are likely to be adopted by enterprises, and then suggests two complementary modalities for implementing the concept of sustainable development. And finally, it offers several implementation approaches - stated in a thematic way- to address the aforementioned concept.

Les enjeux environnementaux contemporains nécessitent la mobilisation de l’ensemble des acteurs sociétaux. Dans ce contexte, comprendre adéquatement la participation politique citoyenne face à l’environnement est primordial. En recensant la littérature, on note que certains courants analytiques concluent à la nécessité d’élargir les concepts de participation politique et d’activisme environnemental afin de mieux considérer l’impact du mode de vie et de la sphère privée. En nous appuyant sur les points saillants de ces deux littératures, nous avançons une typologie qui différencie les gestes activistes pro-environnementaux selon leur «nouveauté» (en tant qu’objets analytiques de nature politique) et leur radicalité. Afin de valider empiriquement ce modèle et de déterminer si les nouveaux comportements activistes environnementaux sont réellement politiques, nous avons analysé les données d’un sondage réalisé auprès de 3458 Canadiens issus de la population générale et de 2653 membres de groupes environnementaux canadiens. Nous avons d’abord effectué une analyse factorielle exploratoire afin d’identifier différents types de gestes pro-environnementaux. Après avoir associé les facteurs résultant aux quadrants de notre typologie, nous avons effectué une série d’analyses de régression linéaires visant à comparer les caractéristiques des gestes conventionnellement politiques et des nouveaux comportements activistes. Les résultats tendent à confirmer la vision voulant que ces derniers aient une forte résonance politique. Il semble donc nécessaire de tenir compte du potentiel élargi de la notion de comportement politique, de façon à tirer des conclusions plus justes, tant au niveau de l’évaluation de la participation politique citoyenne que de l’engagement activiste lié aux enjeux environnementaux. / Contemporary environmental issues require the mobilization of all societal actors. In this context, it is essential to be able to adequately understand citizen political participation regarding the environment. In reviewing the literature, we note that certain analytical currents conclude that there is a need to broaden the concepts of political participation and environmental activism in order to better consider the impact of lifestyle and the private sphere. Based on the highlights of these two literatures, we propose a typology that differentiates pro-environmental activist actions according to their "novelty" (as analytical objects of a political nature) and their radicality. In order to empirically validate this model and to determine whether new environmental activist behaviours are truly political, we analyzed data from a survey of 3458 Canadians from the general population and 2653 members of Canadian environmental groups. We first conducted an exploratory factor analysis to identify different types of pro-environmental actions. After associating the resulting factors to the quadrants of our typology, we conducted a series of linear regression analyses to compare the characteristics of conventional political actions and new activist behaviours. The results tend to confirm the view that the latter have a strong political resonance. It therefore seems necessary to consider the broader potential of the notion of political behaviour in order to draw more accurate conclusions, both in terms of assessing citizen political participation and activist engagement in environmental issues.

En regardant de près les outils juridiques et autres leviers, pour la conservation de la biodiversité, il semblerait que les invertébrés, et notamment les insectes, soient minoritaires ou absents. Ce constat est d’autant plus paradoxal lorsque l’on sait que 2/3 de la diversité biologique est composée par des insectes. Comment cette diversité essentielle pour le fonctionnement des écosystèmes se retrouve-t-elle dans l’angle mort de la conservation ?La première réponse avancée est le manque d’outils techniques pour étudier ces organismes petits et relativement insaisissables. La rencontre avec les nouvelles méthodes techniques pour la détection et l’étude des insectes est plus que jamais nécessaire. En effet, ces leviers permettront de faciliter l’étude de ces organismes, d’augmenter les connaissances et ainsi de développer une conservation plus adéquate. Nous évoquerons deux approches en particulier : la détection avec des outils moléculaires et l’utilisation de modèles statistiques pour l’exploration de la distribution potentielle des espèces.Mais les connaissances sont également fondées sur la demande sociétale. Et les connaissances alimentent elles-mêmes les outils de protection et de conservation de la biodiversité. À l’échelle des invertébrés, des disparités existent, privilégiant les « grands papillons bleus » aux « petits diptères marrons ». De fait, l’enjeu le plus important pour déverrouiller la conservation des insectes réside dans l’humain et la perception qu’il a de cette biodiversité. À travers une approche de psychologie de la conservation, nous sonderons la perception du grand public sur les insectes. De même, avec une approche de recherche-action-participative, nous tenterons d’engager divers acteurs vers la conservation d’un groupe d’insectes ordinaires : les coléoptères coprophages. Notre volonté est de proposer des moyens pour sensibiliser, éduquer et engager la société dans cet enjeu majeur qu’est la conservation de l’entomofaune. / Looking closely at the legal tools and other levers for preserving biodiversity, it would seem that invertebrates, in particular insects, are in a minority, or absent. This observation is all the more paradoxical when we know that 2/3 of the biological diversity consists of insects. How does this diversity, essential for the functioning of the ecosystems, find itself in the dead angle of conservation?The first answer that is usually put forward is lack of technical tools to study these small and relatively elusive animals. Getting to know and use new technical methods for the detection and the study of insects is more than ever necessary. Indeed, these levers will facilitate the study of these animals, and will thus increase knowledge, which will lead to developing more adequate conservation strategies. We shall evoke two approaches in particular: detection with molecular tools and use of statistical models to explore the potential distribution of the species.But knowledge is also based on what society asks for. Public interest orients the tools of protection and preservation of biodiversity. Among invertebrates, disparities exist, favoring the “big blue butterflies” over the “small brown dipterans”. A simple coincidence? No. Actually, the decisive factor to unlock the preservation of insects rests in human beings and how they perceive this biodiversity. Using a conservation psychology approach, we will explore how the general public perceives insects. We will also draw on participatory action research to see how various conservation actors can be committed towards preserving a group of ordinary insects: coprophagous beetles. Our aim is to propose ways to raise awareness, educate and engage society to this major issue: preserving entomofauna.

Le temps passé couché est un aspect important du bien-être des vaches en lactation. Pendant leur cycle de production, celles-ci sont confrontées à plusieurs facteurs de stress pouvant l'entraver. Notamment, la chaleur est reconnue pour diminuer le temps passé couché quotidien de 2 à 4 h/jr chez les vaches en lactation. Plusieurs stratégies peuvent être utilisées afin d'atténuer les réponses physiologiques au stress de chaleur, dont l'inflammation, mais on retrouve peu d'informations sur les changements comportementaux qui y sont associés. Le projet présenté dans ce mémoire avait comme objectifs de déterminer les impacts du stress de chaleur sur le temps passé couché quotidien ainsi que sur le rythme circadien chez des vaches en lactation logées en stabulation entravée et d'évaluer si l'atténuation de l'inflammation par une infusion abomasale d'Oméga-3 peut moduler ces impacts. Nos résultats indiquent une association modérée entre le temps passé couché et les réponses physiologiques au stress de chaleur. Le temps passé couché quotidien (min/jr) des vaches exposées au stress de chaleur était réduit de 2 h/jr comparativement aux vaches gardées en conditions de thermoneutralité. Pour sa part, le temps passé couché quotidien des vaches exposées au stress de chaleur et recevant l'infusion abomasale était plus élevé (+ 1 h/jr) que celui des vaches exposées au stress de chaleur. Une interaction significative entre le traitement et le temps a été mesurée alors que le temps passé couché était réduit pour les deux traitements de stress de chaleur le matin (0000 - 0600 h) et en soirée (1800 - 2400 h) comparativement au traitement de thermoneutralité. Un rythme circadien a été décelé chez tous les traitements. Les vaches gardées en conditions de thermoneutralité avaient la moyenne de temps passé couché par heure, la fluctuation (31,9 min/h) et l'amplitude (11,5 min/h) les plus élevées. Le pic de temps passé couché se produisait chez tous les traitements après minuit, mais plus tôt chez les vaches gardées en thermoneutralité. Ces résultats indiquent que les vaches subissant un stress de chaleur adaptent leur comportement de repos afin de dissiper plus de chaleur et que la réduction de l'inflammation permet de moduler ces adaptations. / Lying time is paramount to dairy cows' welfare. During their production cycle, they are faced with several stress factors that can hinder their resting behavior. Heat is known to reduce daily lying time by 2 to 4 h/d. Several strategies can be used to attenuate physiological responses to heat stress, including inflammation, but there is little information on the behavioral changes associated with it. The project presented in this dissertation had the objectives of determining the impacts of heat stress on the daily lying time as well as on its circadian rhythm in lactating cows housed in tie-stalls and to evaluate whether the attenuation of inflammation by an abomasal infusion of Omega-3 can modulate these impacts. Our results indicate a moderate association between time spent lying down and physiological responses to heat stress. The daily lying time of cows exposed to heat stress was reduced by 2 h/d compared to cows kept in thermoneutrality conditions. For its part, the daily lying time of cows exposed to heat stress and receiving the abomasal infusion was higher (+ 1 h/d) than that of cows exposed to heat stress. A significant interaction between treatment and time was measured as the time spent lying down was reduced for both heat stress treatments in the morning (0000 - 0600 h) and evening (1800 - 2400 h) compared to the thermoneutrality treatment. A circadian rhythm was detected in all treatments. Cows kept in thermoneutrality conditions had the highest average time spent lying down per hour, fluctuation (31.9 min/h) and amplitude (11.5 min/h). The peak time spent lying down occurred in all treatments after midnight, but earlier in cows kept in thermoneutrality relative to other treatments. These results indicate that cows experiencing heat stress adapt their resting behavior to dissipate more heat and that reducing inflammation helps modulate these adaptations.

L’interdépendance de l’environnement a mis en évidence le besoin de la communauté internationale de trouver des mécanismes capables de dépasser les frontières et de protéger les biens naturels d’intérêt commun. Étant donné l’inefficacité du concept de patrimoine commun de l’humanité en ce qui a trait à la protection des biens soumis à la souveraineté d’un État, cette étude analyse l’application de la responsabilité internationale au « dommage transfrontière médiat » (c’est-à-dire, le dommage environnemental qui a lieu à l’intérieur d’un territoire étatique, mais qui caractérise une perte au patrimoine environnemental planétaire) comme mesure capable de surmonter les frontières et de protéger l’environnement. La responsabilité internationale se présente sous deux formes en droit international public général, soit la responsabilité des États pour les activités non interdites par le droit international (ou la responsabilité objective), soit celle découlant d’un fait internationalement illicite. Cette dernière comporte encore deux subdivisions : celle ayant pour cause une « violation d’une obligation internationale » et celle pour une « violation grave d’obligation découlant de normes impératives du droit international général ». L’analyse des principes de droit environnemental international et du principe de la souveraineté démontre que le « dommage transfrontière médiat » pourrait, en théorie, être considéré comme un fait internationalement illicite permettant donc la responsabilisation d’un État. / The interdependence of the environment has highlighted the need for the international community to find mechanisms that are able to work beyond national borders and protect the natural assets of common interest. Given the inefficiency of the concept of common heritage of mankind for the protection of the natural assets subject to the sovereignty of a State, this study provides an analysis of the application of international responsibility to mediate transboundary harm (e.g. the environmental harm taking place in State’s territory that causes a loss to the planetary natural heritage) as a mechanism that can overcome borders and protect the environment. There are two types of international responsibility in general public international law. The first one consists of the State responsibility for activities not prohibited by international law; and the second one deals with the origin of an internationally wrongful act, which, in turn, has two subdivisions: one due to "violation of an international obligation" and another caused by "serious breaches of obligations under peremptory norms of general international law." The analysis of the principles of international environmental law and the principle of sovereignty demonstrate that “mediate transboundary harm” could in theory be considered an internationally wrongful act, therefore allowing the accountability of a state.

Scientifiques, gouvernements, entreprises et consommateurs s’entendent aujourd’hui pour dire que le système naturel est déréglé, que l’activité industrielle en est la cause principale. L’éco-conception est une manière de concevoir des biens ou des services en diminuant leurs impacts sur l’environnement et la société. De plus en plus présente dans les grandes entreprises où, associée à une gestion intégrée de l’environnement, elle procure des bénéfices non négligeables et une image de marque, l’éco-conception a beaucoup de difficultés à s’implanter dans les petites et moyennes entreprises. Dans ce travail, nous avons cherché à comprendre les raisons de ces difficultés. Deux approches ont été utilisées, l’une basée sur une analyse documentaire des rapports de RSE de dix entreprises, grandes et petites, de différents secteurs d’activité, qui nous a permis de fixer le cadre et le formalisme de la démarche de recherche, l’autre sur le principe d’entretiens semi-dirigés à partir de questions ciblées. Après une présentation générale de ce qu’est l’éco-conception et quelle en est la problématique appliquée aux PME (chapitre 2), nous précisons le cadre méthodologique de la recherche (chapitre 3) et exposons ses résultats (chapitre 4). Nous montrons que les freins à l’adoption de l’éco-conception dans les PME sont multiples et complexes, tant la diversité de ces entreprises est grande et difficile à synthétiser. En soulignant les freins, les leviers, les risques et les opportunités liés à l’intégration des principes de développement durable dans ces entreprises, nous faisons un portrait global de la situation actuelle et des difficultés rencontrées par ces PME pour adhérer à ces principes. / Scientists, governments, businesses and consumers agree that the natural system is deregulated, and that the industrial activity is the main cause. Eco-design is a way to design products or services by reducing their impacts on environment and society. This approach to design is increasingly present in large corporations which, combined with an integrated environmental management system, provides significant profits and brand image. Conversely, eco-design is barely implanted in small and medium-sized enterprises (SMEs). Through this research, we have tried to understand the reasons of these difficulties. Two approaches have been used. One is based on a document review of corporate social responsability (CSR) reports of ten, large and small, companies from different industrial sectors. This has enabled us to establish the framework and the form of the research approach. The second approach is based on semi-directed interviews with a set of prepared specific questions. After an overview describing eco-design and its problematic applied to SMEs (Chapter 2), we develop the methodological framework of this research (Chapter 3) and present its results (Chapter 4). We show that the barriers to adoption of eco-design within SMEs are multiple and complex, so much the diversity of these companies is vast and difficult to synthesize. By highlighting the barriers, the drivers, the risks and the opportunities related to integrating sustainable development principles in these organizations, we provide an overview of the current situation and challenges faced by SMEs when seeking to adhere to these principles.

Les EHEC de sérotype O157:H7 sont des agents zoonotiques d’origine alimentaire ou hydrique. Ce sont des pathogènes émergeants qui causent chez l’humain des épidémies de gastro-entérite aiguë et parfois un syndrome hémolytique-urémique. Les EHEC réussissent leur transmission à l’humain à partir de leur portage commensal chez l’animal en passant par l’étape de survie dans l’environnement. L’endosymbiose microbienne est une des stratégies utilisées par les bactéries pathogènes pour survivre dans les environnements aquatiques. Les amibes sont des protozoaires vivants dans divers écosystèmes et connus pour abriter plusieurs agents pathogènes. Ainsi, les amibes contribueraient à transmettre les EHEC à l'humain. La première partie de mon projet de thèse est centrée sur l'interaction de l’amibe Acanthamoeba castellanii avec les EHEC. Les résultats montrent que la présence de cette amibe prolonge la persistance des EHEC, et ces dernières survivent à leur phagocytose par les amibes. Ces résultats démontrent le potentiel réel des amibes à héberger les EHEC et à contribuer à leur transmission. Cependant, l’absence de Shiga toxines améliore leur taux de survie intra-amibe. Par ailleurs, les Shiga toxines sont partiellement responsables de l’intoxication des amibes par les EHEC. Cette implication des Shiga toxines dans le taux de survie intracellulaire et dans la mortalité des amibes démontre l’intérêt d’utiliser les amibes comme modèle d'interaction hôte/pathogène pour étudier la pathogénicité des EHEC. Durant leur cycle de transmission, les EHEC rencontrent des carences en phosphate inorganique (Pi) dans l’environnement. En utilisant conjointement le système à deux composantes (TCS) PhoB-R et le système Pst (transport spécifique de Pi), les EHEC détectent et répondent à cette variation en Pi en activant le régulon Pho. La relation entre la virulence des EHEC, le PhoB-R-Pst et/ou le Pi environnemental demeure inconnue. La seconde partie de mon projet explore le rôle du régulon Pho (répondant à un stress nutritif de limitation en Pi) dans la virulence des EHEC. L’analyse transcriptomique montre que les EHEC répondent à la carence de Pi par une réaction complexe impliquant non seulement un remodelage du métabolisme général, qui est critique pour sa survie, mais aussi en coordonnant sa réponse de virulence. Dans ces conditions le régulateur PhoB contrôle directement l’expression des gènes du LEE et de l’opéron stx2AB. Ceci est confirmé par l’augmentation de la sécrétion de l’effecteur EspB et de la production et sécrétion de Stx2 en carence en Pi. Par ailleurs, l’activation du régulon Pho augmente la formation de biofilm et réduit la motilité chez les EHEC. Ceci corrèle avec l’induction des gènes régulant la production de curli et la répression de la voie de production d’indole et de biosynthèse du flagelle et du PGA (Polymère β-1,6-N-acétyle-D-glucosamine). / EHEC O157:H7 are an emerging zoonotic food- and water-borne hazard highly pathogenic to humans and associated with diseases ranging from acute gastroenteritis to hemolytic uremic syndrome. From their commensal carriage by farm animals to human targets, EHEC pass through a crucial step of persistence in the open environment. Microbial endosymbiosis is one strategy used by pathogenic bacteria to survive in aquatic environments. Amoebae species are free-living protozoa found in diverse environmental habitats and known to host several water-borne pathogens. Thus amoebae could contribute to transmission of EHEC to humans. The first part of my PhD project was focused on interaction of the free-living amoebae Acanthamoeba castellanii with EHEC. The results showed that the presence of amoeba extends the persistence of EHEC that survived phagocytosis by amoebae. This demonstrates the real potential of amoebae to harbourd EHEC that may contribute to their transmission. However, absence of shiga toxins enhanced the intra-amoeba survival. Moreover, EHEC had a toxic and lethal effect on amoebae partially due to shiga toxins. The involvement of shiga toxins in the intracellular survival and mortality of amoebae suggests the value of using amoebae as a model of host/pathogen interactions to study the pathogenicity of EHEC. During their transmission cycle, EHEC encounter limitation inorganic phosphate (Pi) in the environment. Using jointly the PhoB-R two-component system (TCS) and the Pst (Pi specific transport) system, EHEC detect and respond to this Pi limitation by activating the Pho regulon. The interplay between the EHEC virulence, the Pho-Pst and/or the environmental Pi remains unknown. The second part of my project explored the role of Pho regulon (responding to Pi-limitation stress) in the virulence of EHEC. Transcriptomic analysis showed that EHEC has evolved a sophisticated response to Pi deficiency involving not only biochemical strategies that are likely critical to its survival, but also coordinating its virulence response. In these conditions, the regulator PhoB regulates directly the expression of LEE and Stx2 genes. This is confirmed by an increase in EspB secretion and Stx2 production and secretion in low Pi conditions. Moreover, the activation of Pho regulon increases biofilm formation and reduces motility in EHEC. This correlated with the induction of genes regulating curli production and repression of indole production pathway and the flagellum and PGA biosynthesis.

L’objectif de cette thèse est de proposer une caractérisation du bien propre des touts écologiques, comme les communautés biotiques et les écosystèmes, dont peut être dérivée une notion de ce qui est bon pour eux. Ceci vise à défendre les deux principales approches holistes en éthique de l’environnement, c’est-à-dire l’approche pragmatiste défendue par Bryan G. Norton et l’approche écocentriste défendue par J. Baird Callicott, contre certaines objections ayant été soulevées contre elles, faisant valoir l’impossibilité pour les écosystèmes d’avoir un bien propre. Cette thèse répond à ces objections en mobilisant plusieurs ressources théoriques issues de la philosophie de la biologie et de la méta-éthique. Ces ressources sont notamment celles fournies par les discussions sur les notions de fonction et de santé en philosophie de la biologie, celles fournies par les conceptions néo-aristotéliciennes de la normativité en méta-éthique, et celles offertes par les discussions de philosophie de l’écologie sur le holisme et le réductionnisme, sur l’idée d’équilibre de la nature, et sur le concept de santé écosystémique. Cette thèse mobilise ces ressources afin d’élaborer les fondements philosophiques des notions de fonction écologique et de santé écosystémique, desquelles est dérivée une caractérisation du bien propre des écosystèmes. / The goal of this dissertation is to defend the view that ecological wholes, such as biotic communities and ecosystems, have a good of their own, from which an idea of what is good for them can be derived. This aims to respond to the common criticism addressed to the two main holistic approaches to environmental ethics, namely Bryan G. Norton’s pragmatist approach and John Baird Callicott’s ecocentrist approach, which argues that biotic communities and ecosystems have no such good. This dissertation addresses those objections by mobilizing theoretical resources taken from the philosophy of biology and metaethics. In particular, those theoretical resources come from studies about the notions of function and health in the philosophy of biology, from neo-aristotelian accounts of normativity in metaethics, and from discussions in the philosophy of ecology on holism and reductionism, the balance of nature idea, and the concept of ecosystem health. Those resources are mobilized to elaborate some philosophical foundations for the notions of ecological function and ecosystem health, from which an account of the good of ecosystems is derived.