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Detecção de elementos transponíveis e desenvolvimento parcial de um protocolo de inativação gênica mediada pelo transposon impala em fusarium graminearum / Detection of transposable elemento and partial development of aogenic inactivation protocol mediated for Impala transposon in Fusarium graminearum

Leão, Ricardo Costa 22 June 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV07MA023.pdf: 3345243 bytes, checksum: 4a8cf32319e030bf77cdd4320f251d27 (MD5) Previous issue date: 2007-06-22 / The fungi Fusarium graminearum (teleomorph Gibberella zeae) is the etiological agent of scab wheat, one of the most important cereal s winter diseases in Brazil. Outbreaks are generally sporadic but in the last few years is frequently reported an increase in disease intensity in almost all the wheat producing areas around the world. Some studies demonstrate a high genetic diversity in F. graminearum from different geographic areas, as well as in isolates at the same locality. In filamentous fungi, as the F. graminearum, one of the main mutation s causes is the transposable elements or transposons which are capable to generate different types of mutations. In some cases, these mutations are involved with the resistance break, an important phenomenon for the occurrence of epidemics. The objectives of this study were to detect putative transposable elements sequences in the F. graminearum genome, as well as to develop and to analyze adequate procedures for co-transformation of brazilin isolates of this fungi with the vectors pNI160, which carry the transposon impala and pAN7.1, which code to hygromycin B resistance. To detect putative sequences of transposable elements in the F. graminearum genome, specifics oligonucleotides were constructed and 14 isolates, originated from the States of Rio Grande do Sul, Paraná and São Paulo were used. A total of 10 oligonucleotides pairs were constructed (6 oligonucleotides pairs were specific to transposase, 3 to transcriptase reverse and 1 to gene that code for GAG protein). Considering these 10 oligonucleotides pairs, the one that would amplify a transcriptase reverse region similar to a Magnaporthe grisea reverse transcriptase did not amplify any fragment in the isolates total DNA, and the pair that would amplify a transposase region similar to Metarhizium anisopliae originated many fragments of different sizes that do not show relation with 683 bp expected size fragment. Considering the eight oligonucleotides pairs remained, five of them amplified the expected fragments for transposase (715 bp region similar to F. oxysporum f. sp. ciceris transposase, 306 bp similar to Aspergillus awamori transposase, 556 bp similar to A. niger tansposase, 339 bp similar to Arabdopsis thaliana transposase and 554 bp similar to Cochliobolus carbonum transposase), two of them amplified the transcriptase reverse fragments (161 bp similar to A. thaliana reverse transcriptase and the 752 bp similar to Caenorhabditis elegans reverse transcriptase) and one oligonucleotide pair amplified an 581 bp expected size fragment similar to F. oxysporum gag gene. The amplification occurred, even for different oligonucleotides pairs, in all 14 analyzed isolates confirming the presence of transposable elements putative sequences in Brazilian isolates of F. graminearum. This also shows a diversity of groups of these putative elements, considering that some of the sequence amplified is characteristic of a transposable element specific group. To develop the genic inactivation protocol, we select the isolates F02 and F12 which are pathogenic for BR18-Terena cultivar. To evaluate the better medium for selection of chlorate resistant mutants, it was analyzed two different medium. This analysis showed that medium describe by Cove (1979) is more indicate for selected the chlorate resistant mutants. A total of 15 9 chorate resistant mutants were obtained, being five identified as nitrate reductase mutants (niaD), eight specific regulator mutants (nirA) and two permease mutants. Differences related to the number of mutants obtained and number inoculated plates, number of nitrate reductase mutants and macroconides production indicate that the choice of the isolate can influence the isolation of mutants and in protoplast production. Analysis with different hygromycin B concentrations revealed that doses up to 30 μg.mL-1 were enough to control the fungal growth. Two nitrate reductase mutants (M01 and M194) were select to protoplastization and co-transformation, once these two mutants in relation to others produce lower concentration of residual mycelium. Only one transformant were obtained and it was denominated T3, what shows that the transformation protocol needs to be modified to increase the number of transformants. If hybridization experiments confirm the transformation of T3 with only one copy of the impala element, it will be confirmed the transposition ability of impala in F. graminearum, and it will be useful in genetic inactivation studies, especially to genes involved in pathogenicity process / O fungo Fusarium graminearum (teleomorfo Gibberella zeae) é o agente etiológico da giberela do trigo, atualmente uma das principais doenças de inverno no Brasil. Epidemias ocorrem esporadicamente, embora nos últimos anos, registraram-se incrementos na intensidade da doença em quase todas as áreas produtoras de trigo no mundo. Vários estudos demonstram uma grande diversidade genética em isolados de F. graminearum de diferentes áreas geográficas, como também em isolados de uma mesma localidade. Em fungos filamentosos como o F. graminearum, uma das principais fontes de mutações capaz de gerar alta variabilidade genética são os elementos transponíveis ou transposons. Essas mutações algumas vezes estão envolvidas com a quebra de resistência, fenômeno importante para o surgimento de epidemias. Os objetivos deste trabalho foram de detectar putativas seqüências de elementos transponíveis no genoma deste fungo, bem como, desenvolver e analisar procedimentos e métodos adequados para a co-transformação de isolados brasileiros deste fungo com o plasmídio pNI160, o qual carrega o transposon impala, e o plasmídio pAN7.1, no qual esta inserido o gene de resistência a higromicina B. Para detectar putativas seqüências de elementos transponíveis no genoma deste patógeno foram construídos oligonucleotídeos específicos para amplificação, via PCR de seqüências características destes elementos transponíveis. Foram utilizados 14 isolados de F. graminearum, provenientes dos Estados do Rio Grande do Sul, Paraná e São Paulo e um total de 10 pares de oligonucleotídeos foram construídos (6 pares para genes que codificam a enzima transposase, 3 pares para genes que codificam a enzima transcriptase reversa e 1 par um gene que codifica a proteína GAG). Dos 10 pares de oligonucleotídeos utilizados, o par que amplificaria uma região de transcriptase reversa similar ao mesmo gene de Magnaporthe grisea não amplificou nenhum fragmento nos isolados utilizados, e o par que amplificaria uma região de transposase similar ao mesmo gene de Metarhizium anisopliae originou muitos fragmentos de diferentes tamanhos não condizentes com o tamanho esperado de 683 pb. Dos oito pares de oligonucleotídeos restantes, cinco amplificaram as regiões esperadas para a transposase (regiões de 715 pb similar a uma transposase de F. oxysporum f. sp. ciceris, 306 pb similar a uma transposase de Aspergillus awamori, 556 pb similar a uma transposase de A. niger, 339 pb similar a uma transposase de Arabidopsis thaliana e 554 pb similar a uma transposase de Cochliobolus carbonum), dois amplificaram as regiões de transcriptase reversa (regiões de 161 pb similar a uma transcriptase reversa de A. thaliana e 752 pb similar a uma transcriptase reversa de Caenorhabditis elegans) e um amplificou um fragmento de tamanho esperado de 581 pb similar ao gene gag de F. oxysporum. A amplificação ocorreu, mesmo que para diferentes pares de oligonucleotídeos, em todos os 14 isolados analisados, confirmando a presença de seqüências putativas de elementos transponíveis em isolados de F. graminearum provenientes de diferentes regiões do Brasil, além de demonstrar uma diversidade de classes de putativos elementos, uma vez que cada seqüência é característica de um determinado grupo de elementos transponíveis. Para o desenvolvimento do protocolo de inativação gênica foram 7 selecionados os solados F02 e F12 patogênicos a cultivar BR18-Terena. Um teste para avaliação do meio de cultura para seleção dos mutantes resistentes ao clorato demonstrou que o meio descrito por Cove (1979) é o mais indicado para os isolados selecionados. Um total de 15 isolados mutantes resistentes ao clorato foi obtido, dos quais 5 foram identificados como mutantes para o gene nitrato redutase (niaD), 8 mutantes para um regulador específico (nirA) e 2 mutantes para permease. Diferenças quanto ao número de mutantes selecionados pelo número de placas inoculadas, número de mutantes nitrato redutase e produção de esporos assexuais, indicam que a escolha do isolado pode influenciar na obtenção de mutantes e na produção de protoplastos. Testes com diferentes concentrações de higromicina revelaram que doses acima de 30 μg. mL-1 são suficientes para o controle do crescimento do fungo. Dois mutantes nitrato redutase (M01 e M194) foram selecionados para a protoplastização e cotransformação, com base na menor produção de micélio residual em relação aos demais. Apenas um transformante foi obtido sendo denominado T3, mostrando a viabilidade do protocolo, mas também, que mais estudos devem ser realizados para se aumentar o número de transformantes. Se confirmada, através de hibridização, a transformação de T3 com uma única cópia do elemento impala, este poderá além de confirmar a capacidade de transposição deste elemento em F. graminearum, também servir em estudos de expressão gênica, principalmente àqueles genes envolvidos no processo de patogenicidade
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Divergência genética e relacionamento filogenético em espécies de morcegos das famílias Molossidae, Phyllostamidae, Vespertilionidae e Emballonuridae baseado em análise de PCR-RFLP /

Marchesin, Sandra Regina de Carvalho. January 2006 (has links)
Orientador: Eliana Morielle-Versute / Banca: Fernando de Camargo Passos / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Guaracy Tadeu Rocha / Banca: Wagner André Pedro / Resumo: A proposta do presente trabalho foi analisar as relações de proximidade genética e evolutiva entre espécies de Chiroptera, a partir da utilização da técnica PCR-RFLP para a obtenção de dados moleculares para os genes mitocondrial 12/16S e nuclear RAG2. A variabilidade detectada no presente estudo para as diferentes espécies é extremamente importante e poderá orientar ou subsidiar estudos com diferentes finalidades. A complexidade dos táxons de Chiroptera observada em outras análises, como citogenética e morfológica também foi revelada pela análise de RFLP, reforçando a importância dessa metodologia nos estudos evolutivos do grupo. / Abstract: The aim of this study was to assess the relationships of genetic and evolutive proximity among Chiroptera species, through the obtention of molecular data through mitochondrial (12/16S) and nuclear (RAG2) genes by PCR-RFLP technique. The variability detected by this study to the different species is extremely important and can direct or subsidize studies with different purposes. The complexity of Chiroptera taxa observed in cytogenetic and morphologic analyses was also revealed by the RFLP technique, reinforcing the importance of this methodology in evolutive studies of the group. / Doutor
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Variabilidade genética de população selecionada e teste de paternidade de uma progênie de polinização aberta de Eucalyptus Grandis Hill ex Maiden

Siqueira , Leandro de [UNESP] 02 October 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-10-02Bitstream added on 2014-06-13T18:40:23Z : No. of bitstreams: 1 siqueira_l_me_botfca.pdf: 207322 bytes, checksum: 7e913115e8637d3ba62aaff4d615e95b (MD5) / A espécie Eucalyptus grandis Hill ex Maiden é atualmente a mais comumente cultivada em projetos comerciais no Brasil devido as excelentes características de qualidade da madeira e o alto incremento volumétrico de madeira, a espécie é plantada como cultivar e também na forma de plantios clonais de seus híbridos interespecíficos. O presente trabalho é um estudo da variabilidade genética de uma população selecionada de Eucalyptus grandis que formam um pomar de sementes clonal originário de Coff’s Harbour – Austrália, Rio Claro e Zimbabwe. Este pomar, de propriedade da empresa Suzano Papel e Celulose S.A., encontra-se estabelecido na Fazenda Santa Eliza, no Município de São Miguel Arcanjo no Estado de São Paulo. Tem também como objetivo analisar um teste de paternidade de uma progênie de polinização aberta de Eucalyptus grandis, cuja a mãe é um dos clones componentes do pomar de sementes citado anteriormente. Os objetivos principais do trabalho foram estudar (i) a variabilidade genética dentro de uma população selecionada de Eucalyptus grandis, por meio de marcadores moleculares microssatélites; (ii) o sistema reprodutivo de uma área de recombinação de genótipos superiores (Pomar de Sementes Clonal) e de entrada de fluxo gênico; (iii) a paternidade de uma progênie superior de Eucalyptus grandis de programa de melhoramento. Os resultados mostraram que a população selecionada apresentou um grande polimorfismo de alelos (na = 12) e grandes distâncias genéticas entre os indivíduos selecionados mostrando alta variabilidade genética; que existe uma pequena taxa de endogamia na população selecionada (6,24%) devida a quantidade de heterozigose observada (Ho = 0,7927) ter sido menor que a esperada (He = 0,8455), e que a população selecionada de Eucalyptus grandis apresentou um sistema reprodutivo intermediário com forte tendência a alogamia (88,2%). / The species Eucalyptus grandis Hill ex Maiden is the most commonly cultivated in commercial plantings in Brazil due to its excellent wood quality characteristics and the high wood volume increment. The species is planted as a cultivar and also by clonal plantings of its interspecific hybrids. The research is a study of the genetic diversity of a Eucalyptus grandis selected population originated from Coff’s Harbour – Australia, Rio Claro – Brazil, and Zimbabwe, set up as a clonal seed orchard. The orchard is of Suzano Papel e Celulose private company, located on Santa Elisa Experimental Station, in São Miguel Arcanjo County, S.P., Brazil. It has also as objective to analyze a paternity test of an open pollinated progeny of Eucalyptus grandis, which mother clone is part of the orchard. The objectives of this research were to study (i) the genetic variability within the one selected population of Eucalyptus grandis, by microsatellite molecular markers; (ii) the mating system of recombination area of superior genotypes (Clonal Seed Orchard) and gene flow; and (iii) the paternity of a superior progeny of Eucalyptus grandis breeding program. The results have shown that the selected population presented a high polymorphism of alleles (na = 12) and large genetic distances between selected individuals showing high genetic variability. There is a small inbreeding rate into the selected population (6.24%) because of the observed heterozigosity (Ho = 0.7927) to be lower than the expected (He = 0.8455). The selected Eucalyptus grandis population presented to have an intermediate mating system with high tendency of alogamy.
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Variabilidade do feromônio sexual de diferentes populações brasileiras de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) / Variability of sex pheromone of different Brazilian populations of Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae)

Luiza Cristiane Fialho Zazycki 27 May 2014 (has links)
S. frugiperda é uma praga chave no cultivo de milho. A espécie é polífaga e apresenta variações intraespecíficas, sendo caracterizada em dois grupos em função do seu hospedeiro - raça \'Milho\' e raça \'Arroz\' - onde indivíduos morfologicamente idênticos apresentam cargas genéticas distintas. Essas variações podem ser observadas na formação de subgrupos, os quais podem ser compostos por indivíduos geograficamente distintos ou pela forma como se distribuem dentro das populações refletindo diretamente nos padrões de acasalamento da espécie. Em razão disso, este trabalho teve por objetivo compreender a variabilidade genética de populações brasileiras de S. frugiperda e como ela está associada com a produção de diferentes compostos feromonais ou à variação na taxa desses compostos. Para tal, foram coletadas lagartas de S. frugiperda em 6 localidades brasileiras (Santo Augusto-RS, São Raimundo das Mangabeiras-MA, Dourados-MS, Sinop-MT, Assis-SP, e Santa Helena de Goiás-GO). As populações foram avaliadas quanto a sua diversidade genética, perfil cromatográfico das repostas em eletroantenografia (CG-EAG), produção do feromônio e respostas comportamentais em túnel de vento. Os resultados demonstraram uma frequência variável entre as raças de \'Milho\' e \'Arroz\' nas populações brasileiras de S. frugiperda de acordo com o local e época de amostragem. Foram constatados um elevado número de haplótipos nas populações brasileiras, e aparentemente, isto foi resultado da presença de um alta diversidade haplotípica e das pressões do ambiente. Os machos de S. frugiperda responderam para até 4 compostos químicos presentes nas amostras de feromônio sexual e houve uma diferença na abundância do composto majoritário, o acetato de (Z)-9 Tetradecenila, entre as populações das diferentes localidades avaliadas. Em túnel de vento, os machos apresentaram diferentes níveis de atração para as fêmeas de S. frugiperda tanto para uma mesma localidade quanto para localidades distintas. / S. frugiperda is a key pest in corn cultivation. This species is polyphagous and has intraspecific variation, which can be distinguished into two groups according to their host - races \'Corn\' and \'Rice\'. Individuals of both races are morphologically identical, but have distinct genetic loads. These variations can be observed in subgroups formation, which may consist of geographically distinct individuals or by the way they are distributed within populations reflecting directly on mating patterns of the species. For this reason, this work aims at understanding the genetic variability of Brazilian populations of S. frugiperda and how it is associated with the production of different pheromonal compounds or the variation in the rate of these compounds. For this, fall armyworms were collected at 6 locations in Brazil (Santo Augusto-RS, São Raimundo das Mangabeiras-MA, Dourados-MS, Sinop-MT, Assis-SP, and Santa Helena de Goiás-GO). The populations were evaluated for genetic diversity, chromatographic profile of the responses in electroantennography (GC-EAD), pheromone production and behavioral responses in a wind tunnel. Results showed a variable frequency between races \'Corn\' and \'Rice\' in Brazilian populations of S. frugiperda according to the locality and period of sampling. A large number of haplotypes in Brazilian populations were identified, and apparently, this is caused by the presence of a haplotype diversity and environmental selection pressure. Males of S. frugiperda responded to up to 4 chemical compounds from samples of sex pheromone and there was a difference in the abundance of the major compound, the acetate (Z)-9 Tetradecenila between populations of different localities evaluated. In the wind tunnel, males showed different levels of attraction to females of S. frugiperda to both the same site and for different site.
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Aspectos fenotípicos e moleculares da adesão e atividade enzimática de Candida sp isoladas de pacientes com sinais clínicos de candidíase oral / Phenotypic and molecular aspects of adhesion and enzymatic activity of Candida sp recovered from patients with clinical signs of oral candidiasis

Karen Regina Carim da Costa 19 November 2009 (has links)
O amplo espectro da candidíase e respectiva importância clínica da infecção impulsionam as pesquisas que visam esclarecer os mecanismos de patogenicidade e identificação dos fatores de virulência de Candida sp. Portanto, o objetivo deste estudo foi verificar através de testes fenotípicos e moleculares a capacidade de adesão, atividade de proteases e variabilidade genética de isolados clínicos de C. albicans e C. tropicalis. A capacidade de adesão às glicoproteínas de matriz extracelular laminina e fibronectina foi avaliada utilizando-se a técnica de ELISA (Enzyme-linked imunosorbent assay). A pesquisa de proteases foi realizada pelos métodos semiquantitativo, em placa de ágar com albumina bovina, e quantitativo, em solução-tampão com hemoglobina. A presença dos genes ALS2, ALS3, SAP1, SAP3 e PLB1 foi verificada pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e os polimorfismos intra e interespécies pela técnica do DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso (RAPD). Todos os isolados de C. albicans e C. tropicalis apresentaram ligação a laminina e a fibronectina imobilizadas. Os isolados Ca33 e Ct13 apresentaram índice de adesão relativa significativamente maiores em relação aos demais isolados para as duas glicoproteínas (p < 0,001). A atividade de proteases foi observada em todos os isolados de C. albicans tanto pelo método semiquantitativo quanto pelo método quantitativo. A atividade de proteases dos isolados de C. tropicalis foi melhor evidenciada através do método quantitativo. A amplificação de fragmentos dos genes relacionados à adesão (ALS2 e ALS3), atividade de proteases (SAP1 e SAP3) e fosfolipase (PLB1) foi observada em todos os isolados de C. albicans. Os isolados de C. tropicalis não apresentaram produtos de amplificação para os genes pesquisados. A variabilidade genética avaliada pela técnica do RAPD revelou uma população heterogênea em ambas as espécies. No entanto, C. tropicalis apresentou maior diversidade genética que C. albicans. / The wide spectrum of candidiasis and its clinical importance encourage the research with the purpose of clarifying the mecanisms of pathogenicity and identification of virulence factors of Candida sp. Therefore, the aim of this study was to verify through phenotypic and molecular assays the adhesion, enzymatic activity e genetic variability of clinical C. albicans and C. tropicalis isolates. The adhesion ability to the extracellular matrix glycoproteins laminin and fibronectin was evaluated using the ELISA technique (Enzyme-linked imunosorbent assay). The research of proteases was carried out in agar plate containing bovine albumin and through a quantitative method in buffer solution containing hemoglobin. The presence of ALS2, ALS3, SAP1, SAP3 and PLB1 was verified using polimerase chain reaction (PCR) and intra and interespecies polimorphisms through Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. All C. albicans and C. tropicalis isolates binded to immobilized laminin and fibronectin. Ca33 and Ct13 isolates had relative adhesion index significantly higher than the other isolates for both glycoproteins (p < 0,001). Protease activity was observed in all isolates of C. albicans using either the semi-quantitative or quantitative assay. The protease activity of C. tropicalis was better detected through the quantitative assay. The amplification of genes related to adhesion (ALS2 and ALS3), proteases (SAP1 and SAP3) and phospholipase (PLB1) activity using PCR was observed in all C. albicans strains. PCR amplification products were not observed in C. tropicalis isolates for the researched genes. The genetic variability by RAPD revealed an heterogeneous population in both species. Nevertheless, C. tropicalis presented higher genetic variability than C. albicans strains.
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Caracterização morfológica e estimativas de parâmetros genéticos em melão do grupo momordica / Morfhological characterization and estimates of genetic parameters in momordica melon group

VALADARES, Ricardo de Normandes 30 January 2014 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-01T12:24:38Z No. of bitstreams: 1 Ricardo de Normandes Valadares.pdf: 3969497 bytes, checksum: c099bd82231afad59b13a873926a8417 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-01T12:24:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ricardo de Normandes Valadares.pdf: 3969497 bytes, checksum: c099bd82231afad59b13a873926a8417 (MD5) Previous issue date: 2014-01-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The morphological characterization provides us several data bases about the existence of phenotype variability, allowing us to use the genetic resources in a rational and sustainable way, while the estimates of genetic parameters brief us about the nature of the gene action related to the inheritance of characters, and may be applied to help choosing more efficient methods of selection. This work goals to characterize and estimate the genetic parameters for morphologic characters of 19 accesses of melons of momordica group, two cultivars of inodorus group and two cultivars of cantalupensis group. Data was obtained from an experiment in randomized block design and eight replications, performed at the greenhouse of Rural Federal University of Pernambuco (UFRPE), at Recife – Brazil, between April and July 2013. The characterization of the fruits was made by the list of morphological descriptors for melons published by the Ministry of Agriculture, Livestock and Food Supply of Brazil and IPGRI – International Plant Genetic Resources Institute. The accesses showed genetic variability to the most of assessed characteristics. However, only the accesses A-10, A-13 and A-19 showed some difference of pulp and peel colors. In general, the accesses presented good production, earliness, long fruit with thick flesh and low rates of soluble solids. As for the estimates of genetic parameters, the numbers showed high heritability (71.77 to 98.66%), coefficient of genetic variation (from 3.70 to 72.04%) and ratio CVg / CVe (0.56 to 3.03), revealing high genetic variability between the accesses, suggesting that simpler selection methods can be applied, resulting in genetic gain when selection is made. The genetic correlations presented similar traces between them and higher values when compared to their respective phenotype and environmental correlations when assessed the major part of pairs. Positive and high magnitude correlations were obtained from the following pairs: pulp thickness x soluble solids, flesh thickness x average fruit weight, soluble solids x number of days to maturity and average fruit weight x number of days to maturity, while the reasons length / width of the fruit were negatively correlated with most of the assessed characteristics, suggesting us that the selection against the character will indirectly afford pulp thickness and average fruit weight at characteristics increase. / A caracterização morfológica fornece uma série de dados sobre a existência de variabilidade fenotípica, favorecendo o uso racional e sustentável dos recursos genéticos, enquanto que, as estimativas de parâmetros genéticos fornecem informações sobre a natureza da ação dos genes envolvidos na herança dos caracteres, e que podem ser utilizados para auxiliar na escolha de métodos de seleção mais eficientes. O objetivo deste trabalho foi caracterizar e estimar os parâmetros genéticos para caracteres morfológicos de 19 acessos de melão do grupo momordica, duas cultivares do grupo inodorus e duas cultivares do grupo cantalupensis. Os dados foram obtidos de um experimento em delineamento de blocos casualisados e oito repetições, conduzido em casa de vegetação da Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife – PE, entre os meses de Abril e Julho de 2013. Os acessos foram caracterizados com base na lista de descritores morfológicos publicado para melão (C. melo L.) do Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento e do IPGRI – International Plant Genetic Resources Institute. Os acessos mostraram variabilidade genética para a maioria das características avaliadas. Entretanto, apenas os acessos A-10, A-13 e A-19 apresentaram diferenças para coloração de polpa e casca. Em geral, os acessos mostraram boa produtividade, precocidade, frutos compridos com polpa espessa e baixo teor de sólidos solúveis. Quanto às estimativas de parâmetros genéticos, os resultados mostraram estimativas elevadas de herdabilidade (71,77 a 98,66%), coeficiente de variação genético (3,70 a 72,04%) e razão CVg/CVe (0,56 a 3,03), revelando alta variabilidade genética entre os acessos, sugerindo que métodos de seleção simples possam ser utilizados, proporcionado ganho genético considerável na seleção. Já as correlações genéticas apresentaram sinais semelhantes e com valores superiores as suas respectivas correlações fenotípicas e ambientais para a maioria dos pares avaliados. Correlação positiva e de alta magnitude foram obtidas para os pares: espessura de polpa x teor de sólidos solúveis, espessura de polpa x massa média de frutos, teor de sólidos solúveis x número de dias para a maturação e massa média de frutos x número de dias para a maturação, enquanto que a razão comprimento/largura do fruto se correlacionou negativamente com a maioria das características avaliadas, sugerindo que a seleção contra este caráter, proporcionará indiretamente no incremento das características: espessura de polpa e massa média de frutos.
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Caracterização morfológico reprodutiva de acessos de Jureminha (Desmanthus virgatus (L.) Willd.) nativa de Sergipe / Morphological-reproductive characterization of jureminha (Desmanthus virgatus L. (Willd) accessions natives of Sergipe

Fontenele, Ana Consuelo Ferreira 29 March 2007 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Among the most representative families of the world flora, the Legumonosae (Fabaceae) is one of most expressive her the capacity in fixing nitrogen in the soil and its releasing for the agroecosystems, presence in many agricultural systems, aggressive characteristic of seed dispersion, and by the considerable forage potential. The present work aimed to characterize accessions of the native legume Jureminha, collected in different ecological- geographic regions of Sergipe state, using morphological reproductive descriptors. Two-hundred and twelve accessions of Desmanthus were cultivated the Embrapa Tabuleiros Costeiros Experimental Station in Nossa Senhora das Dores, SE. The experiment was carried out in a completely randomized block design with 2 replications and 3 representative plants per plot, spaced by 2x2 m from each other. The characters of fertilization percentage (Ft), flowering after pruning (Flo), pods per flower (Vi), pod length (CpV), pod width (LgV), seeds per pod (SV), locus per pod (LoV), weight of 100 seeds (PS) were evaluated. Analysis of variance was processed by the GENES statistical program (Cruz, 2001), estimating for each characteristic the average genetic inheritance (h2 m), the experimental variation (CVe%) and genetic (CVg%) coefficients, and the correlation between such coefficients. Grouping multivariate techniques by the method of Tocher Optimization and Hierarchic Closest Neighbor and the Plane Distance Projections, utilizing the Mahalanobis generalized distance as the dissimilarity measurements were also applied. Significant genetic variability for the characters VI. PS, CpV, and LoV were found between the studied accessions, indicating a genetic potential to be used in breeding programs. Largest genetic inheritance were found for the CpV and LoV characters with respectively 59.59% and 50.61%. Such characters also showed the highest degree of correspondence between the genetic value and phenotypic value with respectively 0.72 % and 0,859 %. The SV and LoV characters had the greatest contribution for the divergence with respectively 37.20% and 14.39% of the variation. Seven divergent groups were formed. There was concluded that there are not a large genetic divergence among the accessions considering the majority of the accessions composed the first group and two groups were composed by four accessions and three groups were composed by two accessions each one, and one group by only one accessions. / Entre as famílias mais representativas da flora no mundo, a Leguminosae (Fabaceae) é uma das mais expressivas, pela fixação de nitrogênio no solo e seu repasse ao agroecossistema, presença em vários sistemas agrícolas, pela sua agressividade na dispersão de sementes, além de possuir relevante potencial forrageiro. Nesse sentido, este trabalho objetivou caracterizar através de descritores morfológicos reprodutivos acessos de jureminha, leguminosa nativa, coletadas em várias regiões ecogeográficas do Estado de Sergipe. Foram implantados 212 acessos no Campo Experimental em Nossa Senhora das Dores, SE, pertencente a Embrapa Tabuleiros Costeiros. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso com duas repetições e três plantas úteis por parcela, separadas entre si e entre linha por 2 m, além de uma linha de bordadura externa em cada bloco. Os caracteres avaliados foram percentual de fertilização (Ft), florescimento após o corte (Flo), número de vagens por inflorescência (VI), comprimento de vagem (CpV), largura de vagem (LgV), número de sementes por vagem (SV), número de locos por vagem (LoV) e peso de 100 sementes (PS). A análise de variância foi realizada utilizando o programa GENES, Cruz (2001), o qual estimou para cada característica, a herdabilidade média (h2 m), os coeficientes de variação experimental (CVe%) e genético (CVg%) e a relação entre esses coeficientes. Foram realizadas também, técnicas multivariadas de agrupamento pelo método de Otimização de Tocher e Hieráquico do Vizinho Mais Próximo e a Projeção das Distâncias no Plano, utilizando-se a distancia generalizada de Mahalanobis (D²) como medida de dissimilaridade. Existe variabilidade genética significativa entre os acessos avaliados, para os caracteres VI, PS, CpV e LoV, indicando como um potencial genético a ser explorado em programas de melhoramento. Sendo os caracteres CpV e LoV os que apresentaram maiores herdabilidades, 59,59% e 50,61%, e os maiores graus de correspondência entre o valor genético e o valor fenotípico 0,72% e 0,86%, respectivamente. Já os caracteres que mais contribuíram para a divergência foram SV com 37,20% da variação, seguido por LoV com 14,39%. No entanto, houve formação de sete grupos divergentes, concluindo-se que a divergência genética entre os acessos não é grande, pois o primeiro grupo formado englobou a maioria dos acessos, dois grupos foram formados por quatro acessos, três grupos com dois acessos e um grupo com apenas um acesso.
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Resistência em genótipos segregantes de Psidium guajava L. à Meloidogyne enterolobii / Resistance in segregating genotypes of psidium guajava L. to meloidogyne enterolobii

Vieira, Alessandra Abreu Rodrigues 08 August 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alessandra Abreu Rodrigues Vieira.pdf: 310728 bytes, checksum: 0e9cc138bfaeaf0b6e9c447ce14acf80 (MD5) Previous issue date: 2011-08-08 / Neste trabalho, avaliou-se a resistência da goiabeira Psidium guajava L. a Meloidogyne enterolobii (sin. M. mayaguensis) em condições de casa de vegetação. Foram estudados 16 genótipos segregantes, de ocorrência espontânea, coletados nos municípios de Alegre (ES) e Caparaó (MG). O experimento foi conduzido em delineamento inteiramente casualizado, seguindo o esquema fatorial com 16 genótipos x 3 concentrações (500, 2.000 e 4.000 ovos + J2 de Me) e 6 repetições. Os genótipos foram constituídos de plantas oriundas de frutos coletados em plantas matrizes nativas da região. As sementes foram retiradas desses frutos, semeadas e as plantas originadas de cada genótipo foram inoculadas aos seis meses com diferentes concentrações de inóculo. Avaliou-se a altura de plantas (ALT) aos 90 dias após a inoculação e aos 135 foram realizadas as análises de massa fresca de raiz (MFR), número de galhas (NG) e população final (PF) do nematoide. A classificação das progênies quanto à resistência foi realizada pelos critérios proposto por Oostenbrink (1966) e Moura e Régis (1987), ambos baseados no fator de reprodução (FR). Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Scott e Knott, a 5 % de probabilidade. Os genótipos 5, 6 e 7 apresentaram valores de médias para FR<1 pela classificação de Oostenbrink (1966), assim como dentro das famílias encontrou-se indivíduos com valores de FR<1. Foram encontrados nas progênies dos genótipos 1, 4, 9, 10, 12, 13 e 14 valores de FR<1, o que demonstrou a segregação de genes para resistência em progênies de plantas matrizes suscetíveis. Nos genótipos 2, 3, 8, 11, 15 e 16, todas as progênies apresentaram FR>1 sendo considerados suscetíveis de acordo com critérios de Oostenbrink (1966) e algumas progênies com resistência moderada de acordo com Moura e Régis (1987). Esses resultados permitiram inferir sobre a existência de genes de resistência em P. guajava a M. enterolobii. Houve pouca variação dentro de progênies dos genótipos 2, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 12 e 16 para as variáveis MFR, NG e PF, referente ao nível de 500 ovos + J2 de M. enterolobii, os quais se encontram sempre dentro do mesmo grupo de médias que não diferem entre si, mostrando maior homogeneidade desses genótipos quanto à reação ao nematoide. O genótipo 15 apresentou baixos valores de MFR e altos valores de NG e PF nas três concentrações de inóculo, o que demonstrou uma tendência desse genótipo ao parasitismo e reprodução do M. enterolobii / In this work, it was evaluated the resistance of the guava tree Psidium guajava L. to Meloidogyne enterolobii (syn. M. mayaguensis) in green house conditions. Were studied 16 segregating genotypes of spontaneous occurrence collected in the cities of Alegre (ES) and Caparaó (MG). The experiment was conducted in completely randomized design (CRD), following the factorial scheme with 16 genotypes x 3 concentrations (500, 2.000 e 4.000 eggs + J2 of Me) and 6 repetitions. The genotypes were constituted of plants from fruits collected in mother plants native of the region. The seeds were removed of these fruits, sown and the plants originated from each genotype were inoculated with six months old in different concentrations of inoculum. It was evaluated the plants height (ALT) at 90 days after inoculation and at 135 were realized the analysis of fresh weight of root (MFR), number of galls (NG), and final population (PF) of the nematode. The classification of progenies for resistance was carried out by the criteria proposed by Oostenbrink (1966) and Moura and Regis (1987), both based on the reproduction factor (FR). Data were submitted to the analysis of variance and the means compared by the Scott and Knott test in 5% of probability. The genotypes 5, 6 and 7 had mean values for FR<1 by the Oostenbrink (1966) classification, as well as within the families were found individuals with values of FR<1. Were found in the progenies of the genotypes 1, 4, 9, 10, 12, 13 and 14 values of FR<1, what showed the segregation of genes to resistance in progenies of mother plants susceptibles. In the genotypes 2, 3, 8, 11, 15 and 16, all the progenies had FR>1, being considered susceptible in accord with the criteria of Oostenbrink (1966) and some progenies with moderate resistance in accord with Moura e Régis (1987). These results allowed infer about the existence of resistance genes in P. guajava to M. enterolobii. There was little variation within the progenies of the genotypes 2, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 12 and 16 for the variables MFR, NG, and PF, on the level of 500 eggs + J2 of M. enterolobii, which are always within the same group averages that do not differ from each other, indicating greater homogeneity of these genotypes for reaction to the nematode. The genotype 15 showed low values of MFR and high values of NG and PF in the three concentrations of inoculum, what indicated a trend of this genotype to the parasitism and reproduction of M. enterolobii
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Identificação de famílias mutantes de arroz (Oryza sativa L.) para características de importância agronômica e tolerância a baixas temperaturas na germinação / Identification of mutant families of rice for traits of agronomic importance and tolerance to low temperatures during germination.

Luz, Viviane Kopp da 02 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Viviane_Kopp_Luz.pdf: 1878214 bytes, checksum: 773673ed91b567de63552267f5779d03 (MD5) Previous issue date: 2011-07-02 / The existence of variability is essential for successful breeding. The use of mutagens can increase the mutation frequency, enabling the development of variation for traits of interest. The occurrence of low temperatures is a common stress in rice cultivation in temperate regions, therefore the tolerance to low temperatures is a desirable feature of Brazilian rice genotypes grown in the South, where low temperatures affect the germination and crop establishment causing reductions in the grain yield. This work aimed to identify mutants of rice genotypes for traits of agronomic importance and to evaluate the low temperature stress tolerance of genotypes on germination stage. In stage germination, 400 M3 families and control genotypes BRS Querência, BR IRGA 409 and Nourim Mochi, were subjected to treatments with different temperatures (13 C and 25 C) and compared for their relative performance, measured by the coleoptile, root and shoot length. To evaluate the traits of agronomic importance, M3 rice seeds were sown in the experimental field at Embrapa Clima Temperado. The experimental design was a completely randomized block with four replications. Seven traits of agronomic importance were evaluated: length of main panicle in cm, weight of main panicle in g; grain mass of the main panicle in g, length of flag leaf, in cm, width of flag leaf, in cm, plant height, in cm, and stem length, in cm. The results indicate that the ethylmethanesulfonate mutagen (EMS) was effective in generating mutants of rice for six of the traits, except for the character length of the flag leaf, which did not show increase in genetic variability. The induction of mutation was also efficient in generating genetic variability for tolerance to low temperatures at the stage of germination, but the results also indicated the occurrence of a large number of deleterious mutations, affecting negatively the performance of the mutant families. / A existência de variabilidade é fundamental para o sucesso do melhoramento genético. O uso de agentes mutagênicos pode incrementar a freqüência de mutação, possibilitando o desenvolvimento de variação para as características de interesse. A ocorrência de baixas temperaturas é um estresse comum na cultura do arroz em regiões temperadas, portanto a tolerância a baixas temperaturas é uma característica desejável em genótipos brasileiros de arroz cultivados no sul do país, onde as temperaturas baixas prejudicam a germinação, o estabelecimento da lavoura e diminuem o rendimento de grãos. Este trabalho teve como objetivo identificar genótipos mutantes de arroz para características de importância agronômica e avaliar a tolerância ao estresse por baixas temperaturas no estádio germinativo. No estádio germinativo 400 famílias M3 e as testemunhas BRS Querência, BR IRGA 409 e Nourim Mochi, foram submetidas a tratamentos com diferentes temperaturas (13 C e 25 C) e comparados quanto ao seu desempenho relativo, medido pelo comprimento do coleóptilo, comprimento de raiz e comprimento de parte aérea. Para avaliação dos caracteres de importância agronômica, sementes de arroz da geração M3 foram semeadas em campo experimental na Embrapa Clima Temperado. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos completamente casualizados com quatro repetições. Foram avaliados sete caracteres de importância agronômica: comprimento da panícula principal, em cm; peso da panícula principal, em g; massa de grãos da panícula principal, em g; comprimento da folha bandeira, em cm; largura da folha bandeira, em cm; estatura de planta, em cm, e comprimento de colmo, em cm. Os resultados indicam que o agente mutagênico etilmetanosulfonato (EMS), foi eficiente na geração de mutantes de arroz para seis dos caracteres avaliados, exceto para o caráter comprimento da folha bandeira, onde não foi verificado incremento da variabilidade genética. A indução de mutação também foi eficiente em gerar variabilidade genética para tolerância a baixas temperaturas no estádio de germinação, porém os resultados também indicaram a ocorrência de um grande número de mutações deletérias, afetando de forma negativa o desempenho das famílias mutantes.
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Parâmetros genéticos entre híbridos de capim-elefante sob duas formas de avaliação

ASSIS, Liz Carolina da Silva Lagos Cortes 10 November 2008 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-05-15T17:14:57Z No. of bitstreams: 1 Liz Carolina da Silva Lagos Cortes Assis.pdf: 736104 bytes, checksum: 9c999c4794d7a00782ed3b6efca984b6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-15T17:14:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Liz Carolina da Silva Lagos Cortes Assis.pdf: 736104 bytes, checksum: 9c999c4794d7a00782ed3b6efca984b6 (MD5) Previous issue date: 2008-11-10 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this study was to compare two forms of assessment based on data per se and in the form of genetically stratified selection from genetic parameters in cross intra and inter-specific elephantgrass. The study was conducted in the Itambé Experimental Station, of the Pernambuco Agronomic Institute – IPA. For definition of estimated genetic parameters between half-brothers, crossing intraspecific the elephantgrass, in the form of assessment per se and in the form of genetically stratified mass selection was used 10 families of clones F1. The interspecific hybrid crossing, were studied 10 families of clones of hybrids of elephantgrass with millet. The evaluate characteristics were: plant height (m), plant agronomic score (score), dry matter tenor (%) and dry matter production (g/sward). They were estimating broad sense heritability, variance, variation coefficient, genotypic, phenotypic and environmental correlation and gain genetic. To estimate the genetic and phenotypic parameters of families of hybrids of elephantgrass (Pennisetum purpureum Schum.) with millet (Pennisetum glaucum (L.) R.Br.). The genetically stratified mass selection, seeking to control the heterogeneity of soil interspersed through the planting of a plant in genotype (Mineirão), forming strata and providing the selection according to figures from the group consisting of extract (clones and Mineirão). The evaluate characteristics were plant height, plant agronomicescore, dry matter content (TMS) and dry matter production (PMS). The heritability was estimated in the broad sense and averages compared by Scott Knott test of a 5% probability. In the study of intra-specific crossing, there was a significant difference (P <0.05) for the characteristics height and dry matter tenor in the Per se form and dry matter tenor in the genetically stratified form, indicating favorable conditions to theaccomplishment of the improvement. The CVg/CVe reason of the characteristics height, plant agronomic score, dry matter tenor and dry matter production in the Per se form of 1.61; 0.62; 1.65 and 0.74 and in the form genetically stratified of 0.44; 0.19; 0.79 and 0.78, respectively. The heritability had the same behavior in magnitude for Per se form, being 0.89; 0.54; 0.89 and 0.62 and in the genetically stratified form of 0.37; 0.10; 0.65 and 0.61, respectively. It was observed it lowers genetic variability for most of the characteristics studied in the stratified genetically form, determining little contribution for gain genetic. The study of the hybrids showed that there was significant effect (P<0.05) and high heritability for all traits in both forms of selection, ranging from 72 to 91%. The genetically stratified mass selection for the population of hybrids of elephantgrass with millet, was of little use for the character height, desirability andTMS. For the feature PMS, this type of evaluation has shown lower efficiency of removing the environmental effects to improve the experimental precision. The family millet x Pusa Naier 472-76 gathered the largest number of desirable characteristics for forage production. / O objetivo deste trabalho foi comparar duas formas de avaliação, baseada em dados Perse e na forma de seleção geneticamente estratificada a partir de parâmetros genéticos de cruzamentos intra e interespecífico de capim-elefante. O trabalho foi conduzido na Estação Experimental de Itambé, pertencente ao Instituto Agronômico de Pernambuco –IPA. No primeiro experimento utilizou-se 10 clones intra-específicos de capim-elefante (Pennisetum purpureum Schum.) meio-irmãos F1 e o segundo utilizou-se 10 clones interespecíficos de capim-elefante e milheto (Pennisetum glaucum (L.)R.Br.), para estimação de parâmetros genéticos sob na forma de avaliação Per se e na forma de seleção massal estratificada geneticamente foram utilizadas 10 famílias de clones F1. As características avaliadas foram: altura de planta (m), desejabilidade agronômica (nota), teor de matéria seca (%) e produção de matéria seca (g/touceira) nos dois experimentos. Foram estimados a herdabilidade no sentido amplo, variância, coeficiente de variação, correlações genética, fenotípica e ambiental, Razão CVg/CVe (razão entre coeficientede variação genética pelo coeficiente de variação ambiental) e ganho genético. As médias foram comparadas pelo teste de Scott Knott, a 5% de probabilidade. Utilizou-se delineamento em blocos inteiramente casualizado, com três repetições. No estudo dos cruzamentos intra-específicos, houve diferença significativa (P<0,05) para as características altura e teor de matéria seca, na forma Per se, e teor de matéria seca, na forma estratificada, indicando condições favoráveis à realização do melhoramento. A razão CVg/CVe para as características altura, desejabilidade agronômica, teor de matéria seca e produção de matéria seca na forma Per se foram de 1,61; 0,62; 1,65 e 0,74 e na forma geneticamente estratificada de 0,44; 0,19; 0,79 e 0,78, respectivamente. A herdabilidade foi alta para todas as características, na forma Per se, sendo 0,89; 0,54;0,89 e 0,62 e na forma geneticamente estratificada de 0,37; 0,10; 0,65 e 0,61, respectivamente. Observou-se baixa variabilidade genética para a maioria das características estudadas na forma estratificada geneticamente, determinando pouca contribuição para ganhos genéticos. O estudo dos híbridos interespecíficos mostrou que houve efeito significativo (P<0,05) e alta herdabilidade para todas as características estudadas nas duas formas de seleção, variando de 72% a 91%. A seleção massal estratificada geneticamente, para a população de híbridos de capim-elefante com milheto, foi de pouca utilidade para as características, altura, desejabilidade agronômica e TMS. Para a característica PMS, essa forma de avaliação mostrou-se ineficiente em diminuir a interferência ambiental, visando melhorar a precisão experimental. A família milheto x Pusa Napier 472-76 reuniu o maior número de características desejáveis para produção forrageira.

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