Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-12Bitstream added on 2014-06-13T20:43:05Z : No. of bitstreams: 1 000736380.pdf: 3145920 bytes, checksum: eb9040463ecaf8a423ca7772cda63410 (MD5) / Esta tese compreende quatro diferentes estudos conduzidos a fim de avaliar estratégias alternativas para aumentar a eficiência de seleção genômica (GS) em programas de melhoramento animal. Um primeiro estudo foi desenvolvido com a finalidade de avaliar a performance preditiva de diferentes métodos estatísticos com base na informação de painéis de marcadores densamente distribuídos ao longo do genoma. Cinco diferentes características de uma população real de camundongos foram analisadas. Verificou-se que métodos com grandes diferenças conceituais apresentaram performance preditiva similar em algumas situações, também havendo variação na performance relativa dos métodos em função da característica analisada. O uso de diferentes variáveis resposta (pseudo-fenótipos) para estimação de efeitos de marcadores foi avaliado num segundo estudo, por meio da simulação de uma grande população de bovinos de corte, para a qual predições genômicas foram obtidas usando um procedimento de múltiplas etapas. Houve evidência de que provas desregredidas (dEBV) são mais apropriadas do que valores genéticos preditos (EBV) e médias ajustadas de desempenho da progênie (PYD), tanto para o treinamento de modelos quanto para a validação de predições genômicas. No terceiro estudo, procurou-se avaliar consequências em longo-prazo da aplicação de GS numa população de bovinos de corte sob seleção. Verificou-se grande benefício da aplicação de GS em cenários simulando seleção para características de qualidade de carne e reprodução de fêmeas. Houve evidência de que pode-se esperar maior benefício para GS, quando comparada à seleção por BLUP, no caso de características oligogênicas. Também foi possível inferir que em aplicações de GS, o uso de um critério de seleção em que se atribui maior peso a alelos favoráveis de menor frequência poderia proporcionar... / Improvements in production levels and product quality are needed in livestock systems to meet the growing world demand for animal-source foods. Besides this increasing demand, the productive sector must deal with constraints related to competition for land, greenhouse gas emissions and also due to hardening legislation in the fields of environment and animal welfare (FAO, 2011). In this context, animal breeding has played and will continue to play an important role to improve the efficiency of such production systems, especially in terms of competitiveness, safety, sustainability and biodiversity conservation (Harlizius et al., 2004). The main objective of animal breeding programs is to improve the performance of the next generations, through identification and reproduction of the animals with better genetic pool to efficiently produce in a specific environment (herein, superior animals). In the last decades, animal breeders succeeded in achieving this goal, mostly through the application of statistical tools grounded in quantitative genetics theory, what could be called as 'classical animal breeding'. In this case, the traditional prediction of the genetic merit of individuals (estimated breeding values, EBV) is obtained based on information of pedigree and phenotypes (own records and measures on relatives). With the advent of dense molecular marker panels, the implementation and design of breeding programs, especially in dairy cattle, had changed dramatically as a consequence of incorporating this new information to identify superior animals earlier and more precisely. Pioneer simulation studies drew attention of animal breeders to the possibility of making accurate predictions of the genetic merit of individuals by using genotypic information from dense marker panels, a process known as genomic selection (GS) (Nejati-Javaremi et al., 1997; Meuwissen et al., 2001). Other influential work ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-04-27Bitstream added on 2014-06-13T20:43:05Z : No. of bitstreams: 1 pereira_rj_dr_jabo.pdf: 607358 bytes, checksum: 1336bea4603875e3ea34e119f6764b26 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com o objetivo de desenvolver um modelo adequado para a avaliação genética da raça Gir Leiteiro (GL) utilizando-se as produções no dia do controle (PDC), foram analisados registros de controle leiteiro de primeiras lactações de vacas da raça GL e cruzadas com Holandês. Primeiramente, as PDC foram analisadas por modelos multicaracterísticas, onde a produção em cada um dos 10 meses da lactação foi considerada como uma característica diferente. Compararam-se sete modelos: multicaracterísticas padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros 2, 3 ou 4 componentes principais genéticos e três modelos considerando-se uma estrutura de análise fatorial para a matriz de covariâncias genéticas, com 2, 3 ou 4 fatores. Entre os modelos comparados, aquele ajustando os dois primeiros componentes principais foi o melhor de acordo com os critérios de comparação, e diminuiu consideravelmente o número de parâmetros estimados e o tempo gasto para a convergência. Entretanto, ainda assim o número de parâmetros a ser estimado permaneceu grande. Em um segundo estudo, foram comparados modelos de regressão aleatória cujos efeitos genético aditivo e de ambiente permanente foram modelados por polinômios ortogonais de Legendre ou funções Splines lineares. A variância residual foi modelada por 1, 5 ou 10 classes. Cinco classes modelaram as mudanças nas variâncias residuais adequadamente e foram utilizadas na comparação dos modelos. O modelo que utilizou polinômios de Legendre de grau 3 para o efeito genético aditivo e 4 para o de ambiente permanente foi o melhor modelo de acordo com os critérios DIC e BIC. Entretanto, a alta correlação de rank (0,998) entre este modelo e aquele aplicando polinômios de Legendre de grau 3 para os efeitos genético aditivo e de ambiente... / In order to develop a suitable model for genetic evaluation of Dairy Gyr breed (DG) using test-day yields (TD), first lactation TD records from purebred DG and crossbred (DG x Holstein) cows were analyzed. First, the TD were analyzed by multivariate models, where the production in each of the 10 months was considered to be a different trait. The following seven models were compared: standard multivariate model, three reduced rank models fitting the first 2, 3 or 4 genetic principal components, and three models considering a 2-, 3- or 4-factor structure for the genetic covariance matrix. Among the models compared, that one fitting the first two principal components was the best according to the model selection criteria, and markedly reduced the number of parameters estimated and the time spent to reach convergence. However, the number of parameters to be estimated remained high. In a second study, random regression models (RRM) in which additive genetic and permanent environmental effects were modeled using orthogonal Legendre polynomials or linear Spline functions, were compared. Residual variances were modeled considering 1, 5, or 10 classes. Five classes fitted the changes in residual variances adequately and were used for model comparison. According to the DIC and BIC criteria, a model using third-degree and fourth-degree Legendre polynomials for additive genetic and permanent environmental effects, respectively, provided the best fit. However, the high rank correlation (0.998) between this model and that applying third-degree Legendre polynomials for additive genetic and permanent environmental effects, indicates that practically the same bulls would be selected by both models. Therefore, the latter model, which is less parameterized, was used in the other studies components of the thesis. In the following... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-07Bitstream added on 2014-06-13T20:23:21Z : No. of bitstreams: 1 espindola_smcg_dr_jabo.pdf: 360908 bytes, checksum: 4d6651892be89ff6a6c3957a8387c0d9 (MD5) / Atualmente, a soja destaca-se como a mais importante oleaginosa cultivada no mundo. Os investimentos em pesquisa levaram à tropicalização da soja, permitindo, pela primeira vez na história, que o grão fosse plantado com sucesso, em regiões de baixas latitudes, entre o Trópico de Capricórnio e a linha do Equador. Em função disso tem-se buscado o desenvolvimento de genótipos com ampla adaptabilidade, o que implica em uma baixa interação genótipo x ambiente. O entendimento do tipo de interação permite um melhor posicionamento e indicação de regiões de plantio da cultivar em questão facilitando o trabalho do melhorista. A presença desse fenômeno pode acarretar uma redução da produtividade global de uma área para a qual se faça uma indicação geral de uma dada cultivar. Por outro lado, pode-se tirar proveito de sua existência usando-se procedimentos estatísticos que identifiquem o padrão dessa interação, e gerem informações que possibilitem o agrupamento de locais em zonas dentro das quais a magnitude da interação não seja significativa, permitindo indicações específicas de cultivares para tais zonas. O uso de ferramentas moleculares tem se apresentado como uma opção para seleção de características com base no genótipo e eliminando assim o efeito do ambiente na expressão da característica em questão. O melhoramento assistido por marcadores moleculares tem sido tema de inúmeros trabalhos de seleção assistida, cujos resultados variam de concretos e positivos a controversos e pouco significativos em termos de ganhos genéticos, econômicos e eficiência, quando comparados com a seleção fenotípica. Os capítulos seguintes permitem apresentar resultados de metodologias moleculares e convencionais aplicadas em um programa de melhoramento para seleção de genótipos superiores de soja. / Nowadays, soybean highlights as the most important oilseed cultivated in the world. The investments in research led to soybean “tropicalization”, allowing, for the first time in history, that the grain was seeded with success, in low latitudes, between the tropic of Capricorn and the Equator. Due to this, researchers have tried to develop wide adaptability genotypes, which implies in a low genotype x environment interaction. The comprehension of the type of interaction allows a better placement and indications of cultivar planting regions, facilitating the breeder’s work. The presence of this phenomenon may result in a global productivity decrease of an area that make up an overall indication of a given cultivar. On the other hand, it is possible to take advantage of their existence using statistical procedures to identify the pattern of this interaction, and generate information that allow the grouping of local areas within which the magnitude of the interaction is not significant. Specific cultivar indication for these zones. The use o molecular tools have shown as an option for characteristics selection base on genotype and then eliminating the environment effect in the expression of the characteristic in question. The molecular marker-assisted breeding has been the subject of numerous works assisted selection, whose results varies from concrete and positive to controversial and little significant in terms of genetic gains, and economic efficiency compared to phenotypic selection. The following chapters present results provide molecular and conventional methodologies applied in a breeding program for superior genotypes selection.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-19Bitstream added on 2014-06-13T19:02:40Z : No. of bitstreams: 1 demetrio_cs_dr_jabo.pdf: 450658 bytes, checksum: 4414bc47de06a1e7edb568217892b6bc (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O continuo fenômeno de aquecimento global será certamente acompanhado de um aumento dos períodos de estiagem e instabilidade das condições climáticas. Informações prévias sobre o sistema radicular de genótipos de milho e sua possível relação com a parte aérea são de grande interesse num programa de melhoramento de milho. Assim, o presente trabalho teve como objetivos identificar a existência de possíveis efeitos da seleção prévia de linhagens endogâmicas de milho para comprimento, área e volume do sistema radicular e selecionar híbridos superiores para as regiões de São Paulo e Goiás, por meio da estimativa das capacidades geral e específica de combinação (CGC e CEC). Para avaliação das linhagens de milho como superiores e inferiores para comprimento, área e volume do sistema radicular, foi conduzido no ano de 2009, em Jaboticabal-SP, um experimento em solução nutritiva. No ano agrícola de 2009/2010, as linhagens selecionadas foram cruzadas em esquema de dialelos completos e parcial. Os híbridos dialélicos com sementes suficientes para avaliação das suas características agronômicas em três ambientes, Barretos-SP, Monte Azul Paulista-SP e Santa Helena de Goiás-GO e três testemunhas comerciais (2B707, AG7000 e DKB390) foram avaliados, no ano agrícola de 2010/2011, em delineamentos de blocos casualizados, com três repetições. As variáveis avaliadas foram: acamamento, quebramento, altura de plantas, altura de espiga e produtividade. Verificou-se que, em média para os três ambientes, o grupo de híbridos inferior para sistema radicular se destacou em produtividade em relação aos grupos de híbridos superior e superior x inferior. Porém, as combinações híbridas S10 x S13, S5 x I1 e S2 x S14 se destacaram pelos elevados valores CEC e CGC para seus genitores, apresentam, os três, pelo menos um genitor pertencente ao grupo de linhagens superiores / The continuous phenomenon of global warming will certainly be followed by an increase of droughts and unstable weather conditions. Prior information of genotype maize root systems and their possible relation with the shoot would be of great interest in a corn breeding program. Thus, this study aimed to identify the existence of possible effects of previous selection of maize inbred for length, area and volume of the root system and select superior hybrids for the regions of São Paulo and Goiás states, through the estimation of their general and specific combining abilities (CGC and CEC). To evaluate the maize inbreeds as superior and inferior for length, area and volume of the root system, an experiment in nutrient solution was carried out in 2009 in Jaboticabal-SP, Brazil. In the agricultural year 2009/2010, the selected lines were crossed in complete and partial diallel schemes. The diallel hybrids, with enough seeds for agronomic trait evaluations in three environments, Barretos-SP, Monte Azul Paulista-SP and Santa Helena de Goiás-GO, Brazil, and three commercial checks (2B707, DKB390 and AG7000) were evaluated during the crop year of 2010/2011, in a randomized block design, with three replications. The following variables were evaluated: percentage of lodged and broken plants, plant height, ear height and grain yield. On average for the three environments, the inferior group of hybrids for root system excelled in productivity in relation to the superior and superior x inferior groups. However, the hybrid combinations S10 x S13, S5 x I1 and S2 x S14 that best stood out, by high values of CEC and CGC for it´s genitors, have all three, at least one genitor belonging to the group of superior inbred lines

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-07-15Bitstream added on 2014-06-13T20:43:10Z : No. of bitstreams: 1 silva_clsp_dr_jabo.pdf: 887183 bytes, checksum: 044073bedd049b3dbdbbffe36499be0b (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A apomixia, ou seja a produção de sementes clonais, possuindo embriões idênticos à planta mãe, é um processo controlado geneticamente. Na apomixia facultativa, ocorrente no gênero Citrus, verifica-se a coexistência da reprodução sexual e apomítica em um mesmo óvulo. Entretanto os eventos genéticos que desencadeiam a produção de embriões apomíticos são atualmente pouco conhecidos. Não se sabe ainda, se os mesmos genes responsáveis pela formação dos embriões zigóticos, também seriam os responsáveis pela formação dos embriões apomíticos, expressando-se entretanto, de forma diferente. Outra possibilidade é a existência de genes particulares responsáveis pelo evento apomítico, mas é improvável que este locus envolva novas e distintas vias metabólicas que incluam novos genes para a formação do saco embrionário e para a embriogênese. Uma possibilidade é que a reprodução apomítica seja uma consequência da expressão de um gene que funciona iniciando uma cascata de ações gênicas em diferentes momentos durante o curso dos eventos sexuais no óvulo. Conhecidamente as proteínas de reserva são codificadas por genes, que se expressam de forma tecido específico, constituindo-se em excelente material para estudos de eventos genéticos. Com o objetivo de detectar particularidades genéticas do processo apomítico em Citrus, estudou-se, a nível de mRNA e proteínas, a expressão diferencial de embriões zigóticos, embriões apomíticos e plântulas zigóticas de espécies de Citrus. A condição apomítica ou zigótica dos embriões e plântulas estudados, foi avaliada empregando-se marcadores moleculares do tipo RAPD e fAFLP. Verificou-se que ambos os tipos de embriões, e de plântulas, expressam um grupo de proteínas diferencialmente. A nível de mRNA detectou-se expressão diferencial tanto para a condição zigótica, quanto para a apomítica... / Apomixis or clonal seed production with mother identical embryos is a process genetically controlled. On the facultative apomixy, that takes place in the genus Citrus it is possible to observe the co-existence of sexual and apomitical reproduction on the same ovulum. However the genetic events that trigger the apomitical embryo production are presently poorly known. It is still not known if the same genes related to the zygotic embryo formation would be the same related to the formation of the apomitic embryos, exhibiting different expression patterns. Another possibility is the existence of a particular set of genes that would be responsible for the apomitic event but, it is rather improbable that such locus would control new and distinct metabolic pathways that include the action of new genes related to the formation of the embryonic sac and other set of genes for the embryogenesis itself. One should also consider that the apomitic reproduction might be a consequence of erratic gene expression of a gene that acts triggering a successive set of genetic activities on different occasions during the course of the ovulum sexual processes. The reserve proteins are coded by genes that express on specific tissues, making up a set of excellent material for genetic studies. Aiming to study such genetic particularities on the Citrus apomitic process, it was carried out a study on the differential expression of mRNA and their corresponding reserve protein using zygotic, apomitic and zygotic plants. The apomitical and zygotic embryonic conditions together with those related to early developed seedlings were evaluated using molecular markers such as RAPD, fAFLP. It was observed that both types of embryos and seedlings express a set of differential proteins... (complete abstract, access undermentioned eletronic adress)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-22Bitstream added on 2014-06-13T20:03:34Z : No. of bitstreams: 1 santos_do_dr_jabo.pdf: 436428 bytes, checksum: 0d19e37f42c0f40666cb60140257c676 (MD5) / Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia / A Universidade Estadual Paulista – UNESP, campus de Jaboticabal desenvolve há v ários anos pesquisas na á rea de animais silvestres, contribuindo dessa forma na conservaçã o e produção de esp écies amea çadas de extin ção. Uma dessas espé cies estudadas para fins cientí ficos, a perdiz (Rhynchotus rufescens), apresenta potencialidades para a produ ção comercial em cativeiro. Com o objetivo de determinar polimorfismos gené ticos nessa espé cie e em outras espé cies de tinam ídeos, foram desenvolvidos 16 pares de primers de microssaté lite para a perdiz a partir de biblioteca gen ômica enriquecida com microssat élites. A fim de se verificar a amplificação cruzada em perdiz e em outros tinam ídeos foram utilizados 10 pares de primers desenvolvidos para avestruzes (Struthio camelus) e outros 10 pares desenvolvidos para o inhamb ú-da-cabe ça-vermelha (Tinamus major). Dos 16 locos desenvolvidos para perdiz, 8 apresentaram sucesso na amplificação nessa esp écie e apenas cinco amplificaram em outros tinamídeos. Foi realizada a genotipagem em 26 amostras de perdizes e obtidas estimativas relacionadas ao percentual de locos polimó rficos (50%), nú mero m édio de alelos por loco (5,75), conte údo polim órfico informativo m édio (0,62) e diversidade gené tica esperada (0,69). Quanto ao teste de transferabilidade, dos pares de primers desenvolvidos para T. major, somente um apresentou amplificação especí fica em perdizes, sendo observadas taxas de amplificação cruzada de 100 e 70% para macuco (Tinamus solitarius) e para a azulona (Tinamus tao), respectivamente. As amplificações nos demais tinamí deos ficaram restritas a cinco locos de microssat élites. Com o uso de programas computacionais e de... / The São Paulo State University UNESP, Jaboticabal campus has for several years research with wild animals, contributing for the preservation and production of the species threatened by extinction. One of these species is the red-winged-tinamou (Rhynchotus rufescens), that has potential for production in captivity. The aim of the study was to determine genetic microsatellite polymorphisms in this species and other tinamous species. Sixteen microsatellite primer pairs were developed for the red-winged-tinamou from a genomic library enriched with microsatellites. In order to verify the cross amplification for the tinamous species we used 10 pairs of primers designed for ostriches (Struthio camelus) and 10 pairs developed for Tinamus major. From the 16 loci developed for red-winged-tinamou, 8 amplified in this species and only five amplified in other Tinamous. Genotyping was performed on 26 samples and estimates related to the percentage of polymorphic loci (50%), average number of alleles per locus (5.75), polymorphic information content (average 0.62) and expected genetic diversity (0.69). In order to test the transferability of the primer pairs developed for T. major, only one had a specific amplification in partridges, with observed rates of crossamplification of 100 and 70% for macuco (Tinamus solitarius) and the azulona (Tinamus tao), respectively. The amplifications in other tinamous were restricted to five microsatellite loci. With the use of computer programs and statistical analysis, we estimated genetic and phenotypic parameters of morphometric characteristics in red-winged-tinamou, in order to... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador : Prof. Dr. Gilvan Wosiacki / Co-orientador : Prof. Dr. Alessandro Nogueira / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Tecnologia, Programa de Pós-Graduaçao em Processos Biotecnológicos. Defesa: Curitiba, 06/12/2011 / Bibliografia: fls. 193-196 / Área de concentração: Agroindústria e biocombustíveis / Resumo: O fermentado de maçã consiste em um dos principais sub-produtos da agroindústria da maçã. Entretanto, no Brasil este produto além de recente, apresenta baixa qualidade aromática. A microbiota natural das maçãs apresenta uma população de leveduras variando de 10 - 105 ufc.cm-2 ou g, entre espécies Saccharomyces sp. e não-Saccharomyces. As leveduras não convencionais são reconhecidas na literatura como produtoras de compostos voláteis frutados capazes de melhorar o perfil sensorial de bebidas fermentadas. O presente trabalho teve como objetivo isolar cepas de leveduras não-Saccharomyces a partir do mosto de maçãs, selecionar, conservar e identificar as eminentes produtoras de aromas frutados para avaliá-las na elaboração do fermentado de maçã, em culturas puras, mistas e sequenciais, com relação à cinética de crescimento, atributos físico-químicos e perfil aromático dos fermentados obtidos. O isolamento foi realizado em meio seletivo a partir do mosto bruto de maçãs das cultivares Gala e Fuji. Foram selecionadas cepas não-convencionais por meio de teste sensorial de produção de aromas frutados ou florais. Na identificação das leveduras foram consideradas preliminarmente suas características morfológicas, fisiológicas e posteriormente por metodologia molecular foi realizado o sequenciamento das regiões D1/D2 da subunidade maior do rRNA. Testes de preservação dos isolados ocorreram por liofilização e a -80ºC, com armazenamento por 12 meses, à temperatura ambiente e em ultra-freezer, respectivamente. Para as fermentações foi utilizado mosto de maçã da cv. Gala e monitorado o crescimento das leveduras, parâmetros físico-químicos, cinéticos e perfil aromático ao longo de 10 dias de fermentação. As técnicas de headspace estático e microextração em fase sólida (SPME) foram utilizadas para a captura dos compostos voláteis dos fermentados, analisados em CG. Os resultados da identificação revelaram a presença de dez espécies, sendo Candida oleophila, Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Clavispora lusitaniae, Hanseniaspora guilliermondii, Hanseniaspora uvarum, Lodderomyces elongisporus, Pichia anomala, Pichia fermentans e Rhodotorula mucilaginosa, das quais, cinco foram pela primeira vez relatadas em mostos de maçãs. Na fermentação pura foi confirmado que as cepas do gênero Hanseniaspora contribuem positivamente com o perfil aromático de fermentados de maçã. Em fermentação mista e sequencial, os resultados evidenciaram uma boa interação entre as leveduras fermentativas e oxidativas. A análise cromatográfica dos compostos voláteis permitiu identificar etanoato de etila, butanoato de etila acetato de isopentila, etanoato de hexila, 2-hidróxi propanoato de etila, octanoato de etila, decanoato de etila, 1,4-butanoato de etila, dodecanoato de etila, etanal, ácido butanóico e octanóico, etanol, 3-metil-1-butanol, 2-hexanol, 1-hexanol, 2-fenil etanol e 2-heptanona, nos fermentados elaborados por fermentação mista e sequencial. Foi verificado que tanto a liofilização quanto a conservação a -80ºC garantiram a viabilidade das leveduras durante o tempo estudado. Desta forma, considerando a presença do grupo dos ésteres e, principalmente, dos álcoois superiores, responsáveis por aromas frutais e florais, os ensaios de culturas mistas e sequenciais revelaram a possibilidade de contribuir para a qualidade aromática do fermentado de maçã. / Abstract: The fermented apple is one of the main by-products of the apple industry. However, in Brazil, this product is recent and has low aromatic quality. The natural apples microbiota has a yeast population oscillating between 10 - 105 ufc.cm-2 or g, between species Saccharomyces sp. and non-Saccharomyces. The non-conventional yeasts are recognized in the literature as fruity volatiles compounds producers able of improve with the sensory profile of fermented beverages. This work aims to isolate non-Saccharomyces yeast strains from the apple must, select, preserve and identify the main fruity flavors producers to evaluate them in the preparation of apple wine, in pure, mixed and sequential cultures, with respect to growth kinetics, physical-chemical attributes and aromatic profile of the fermented obtained. The isolation occurred in the selective medium from the raw apple must of Gala and Fuji cultivars. Non-conventional strains were selected by sensory testing for the fruity or floral aroma production. In the yeasts identification, were preliminarily considered their morphological and physiological characteristics and, then, by molecular methodology it was made the sequencing of D1/D2 regions of the large subunit of rRNA. Conservation tests of the isolates occurred by freeze drying and frozen at -80ºC, with storage for 12 months at room temperature and ultra-freezer, respectively. For the fermentations were used apple must of Gala cultivar and it was monitored the yeast growing, physical-chemical parameters, kinetics and the aroma profile along 10 days of fermentation. The static headspace and solid phase microextraction (SPME) technique were used for the volatile compounds capture of the fermented, and it was analyzed by gas chromatography. The identification results revealed the presence of ten species, being Candida oleophila, Candida parapsilosis, Candida tropicalis, Clavispora lusitaniae, Hanseniaspora guilliermondii, Hanseniaspora uvarum, Lodderomyces elongisporus, Pichia anômala, Pichia fermentans and Rhodotorula mucilaginosa, of which, five were reported for the first time in apples musts. In the pure fermentation it was confirmed that the strains of the genus Hanseniaspora contribute positively to the aromatic profile of apple wine. In the mixed and sequential fermentation the results showed a good interaction between the fermentative and oxidative yeasts. The chromatographic analysis of volatile compounds identified ethanoate, ethyl butanoate, ethyl acetate isopenthyl, hexylethanoate, 2-hydroxy ethyl propanoate, ethyl octanoate, ethyl decanoate, ethyl 1,4-butanoate, ethyl dodecanoate, butanoic and octanoic acid, ethanol, 3-methyl-1-butanol, 2-hexanol, 1-hexanol, 2-phenyl ethanol and 2-heptanone in the fermented made by mixed and sequential fermentation. It was notice that both freeze drying and conservation at -80ºC ensured the yeasts viability during the period studied. Thus, considering the presence of the esters group and, especially, the superior alcohols, responsible by fruity and floral aromas, the mixed and sequential cultures testing revealed the possibility to contribute to the aromatic quality of apple wine.

Resumo: Esta dissertação foi concebida como uma investigação teórica acerca das relações entre representações verbais e musicais. Para tanto, nossa argumentação se apoiou em uma abordagem que aqui chamamos de teórico-relevante. Descrevemos este viés como uma convergência entre duas teorias: a teoria da relevância (SPERBER & WILSON, 1993, 1995, 2005) e a epidemiologia das representações (SPERBER, 1996, 2000). Estas concepções são complementares, visto que ambas são articuladas a partir de uma perspectiva cognitiva para os comportamentos culturais humanos. Além disso, ambas as teorias rejeitam o modelo tradicional das humanidades para os fenômenos comunicativos, segundo o qual, os significados comunicativos decorrem de processos de codificação/decodificação de informações. Neste trabalho, nós descrevemos como relevância é um conceito cognitivo necessário não só para a teorização adequada acerca da comunicação humana, mas também para que nós possamos compreendê-la como manifestação cultural. No primeiro capítulo, nós demonstramos como este percurso teórico é resultado de uma postura de naturalização do campo de estudos sobre o comportamento linguístico. Para este efeito, a abordagem computacional gerativa (CHOMSKY, 1957), a teoria modular da mente (FODOR, 1983) e a concepção evolucionista de cognição (COSMIDES & TOOBY, 1987) são vistas como desenvolvimentos científicos cruciais que possibilitaram a articulação do viés teórico-relevante. No segundo capítulo, nossa atenção recaiu sobre os modelos de transmissão cultural. Em especial, nós demonstramos que as ciências sociais aceitam passivamente que os fatores psicológicos não influenciam na descrição teórica de nossos comportamentos culturais. Nós nos apoiamos em argumentos oriundos da Psicologia Evolutiva (PINKER, 2004) e da Pragmática para advogarmos a favor de uma concepção massiva para a modularidade da mente, que possibilita explicar a diversidade cultural humana, sem que tenhamos que abdicar de uma teorização inatista da mente. No terceiro capítulo, descrevemos as manifestações verbais e musicais como fenômenos culturalmente comunicativos. Segundo nosso argumento, cultura deve ser compreendida como um sistema emergente resultante de microprocessos psicológicos que acarretam em macroprocessos físicos. Assim, consideramos que há indícios de que, mesmo que a musicalidade humana seja incapaz de redundar em propriedades semânticas, sons musicais são linguagens comunicativas porque, no âmbito individual, podem ser interpretados como demonstrações públicas de intencionalidades comunicativas culturalmente reconhecíveis. Portanto, representações verbais (públicas ou mentais) são consideradas como ferramentas de construção de ambientes cognitivos, que possibilitam aos envolvidos no processo de comunicação a atuarem de forma a disseminar culturalmente as representações musicais (públicas ou mentais). Desta maneira, consideramos o viés teórico aqui apontado como pertinente para compreendermos como as representações musicais se distribuem, tanto como manifestações psicológicas quanto como em demonstrações explícitas. Isto torna plausível a assunção de que músicas são comunicativas por meio de micro e macro processos de disseminações representativas. Finalmente, nós argumentamos pela afirmação de que o conceito de atração cultural é um fator epidemiológico fundamental, além de ser mais adequado aos fenômenos culturais do que uma descrição de processos sociais de replicação de significados contidos em códigos.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseMRV.pdf: 3701923 bytes, checksum: d40873dfb2b0089df5c80f139959adb5 (MD5) Previous issue date: 2006-11-10 / Universidade Federal de Minas Gerais / This study presented cytogenetic analysis of small fishes species collected in the headwaters of Jaguariaíva, Ribeira and, Tibagi rivers. Some of these species have had a comparative cytogenetic population analysis among different basins, while in the others were observed inherent specific problems only in one population. In this work we boarded cytogenetic, cytotoxonomy, biogeographic and evolutive biology aspects of these populations: Corydoras paleatus, Corydoras ehrhardti, Apareiodon sp., Geophagus brasiliensis, Cichlasoma facetum, Astyanax scabripinnis species complex, Astyanax janeiroensis, and Characidium sp. cf. C. gomesi. Here we discussed and presented (a) the sympatric occurrence of C. paleatus and C. ehrhardti from Dourada lagoon, Tibagi basin; (b) a ZZ/ZW sex chromosome system in an undescribed species of the genus Apareiodon in the Verde river, Tibagi basin (c) the karyotypic conservadorism visualized in species and populations of Perciformes, G. brasiliensis and C. facetum, in the Jaguariaíva, Ribeira and Tibagi basins, showing the dispersion of fish species hypotheses among these basins; (d) a comparative cytogenetic analysis of A. scabripinnis species complex, among Jaguariaíva, Ribeira, and Tibagi basins, all of them shared karyotypes with 2n=50 chromosomes but minors differences among them were observed, and we also showed a sympatric cytotype with 2n=48 chromosomes only in the Jaguariaíva basin; (e) the composition, location and nature of heterochromatic sites present in the A. janeiroensis karyotype of Ribeira basin and; (f) a possible sinapomorphic condition in the Characidium species with heteromorphic sex chromosome system. We also discussed the possible faunes interchange in the headwaters regions of Ribeira de Iguape and Tibagi rivers in the Ponta Grossa arc region, beside to the supposed endemic ictiofaune of Jaguariaíva basin. Thus, this study associated cytogenetic data, biogeographic aspects, and evolutive biology of fishes species located in the headwaters of three Paraná State rivers. / O estudo apresentou uma análise citogenética de espécies de peixes de pequeno porte coletadas nas cabeceiras das bacias dos rios Jaguariaíva, Ribeira e Tibagi. Algumas espécies tiveram uma análise citogenética populacional comparativa entre essas diferentes bacias, enquanto em outras foram abordados problemas específicos inerentes apenas à uma população. Foram abordados aspectos de citogenética, citotaxonomia, biogeografia e de biologia evolutiva das populações de Corydoras paleatus, Corydoras ehrhardti, Apareiodon sp., Geophagus brasiliensis, Cichlasoma facetum, complexo Astyanax scabripinnis, Astyanax janeiroensis e Characidium sp. cf. C. gomesi. Foram apresentados e discutidos (a) a ocorrência simpátrica de C. paleatus e C. ehrhardti para a Lagoa Dourada, bacia do rio Tibagi (b) um sistema de cromossomos sexuais ZZ/ZW em uma espécie não descrita do gênero Apareiodon do rio Verde, bacia do rio Tibagi (c) o conservadorismo cariotípico apresentado para as espécies e populações de Perciformes, G. brasiliensis e C. facetum, das bacias dos rios Jaguariaíva, Ribeira e Tibagi, aliado à uma hipótese de dispersão das espécies de peixes entre essas bacias (d) a análise citogenética comparativa do complexo de espécies A. scabripinnis para as bacias dos rios Jaguariaíva, Ribeira e Tibagi, todas mostrando cariótipos similares com 2n=50 cromossomos, porém não idênticos, aliada a um novo citótipo simpátrico apresentando 2n=48 cromossomos somente na população da bacia do rio Jaguariaíva (e) a localização, composição e natureza dos domínios heterocromáticos presentes no cariótipo de A. janeiroensis da bacia do rio Ribeira e; (f) uma possível condição sinapomórfica para as espécies de Characidium que apresentam sistema de cromossomos sexuais heteromórficos. Foi também discutido o possível intercâmbio de faunas nas regiões de cabeceiras dos rios Ribeira de Iguape e Tibagi na região do arco de Ponta Grossa, ao lado de uma ictiofauna aparentemente mais endêmica para a bacia do rio Jaguariaíva. Assim, esse estudo procurou associar dados citogenéticos, questões de biogeografia e biologia evolutiva das espécies de peixes presentes nas cabeceiras destes três rios paranaenses.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseLTGS.pdf: 4761977 bytes, checksum: fd63c5cb5025f3d28cda158a969b6afd (MD5) Previous issue date: 2001-06-21 / Financiadora de Estudos e Projetos / The parasitic Trypanosoma brucei is the causative agent of African Trypanosomiasis (sleeping sickness) in humans, and nagana in animals and is responsible for heavy socioeconomic losses in most countries of sub-Saharan Africa. Therapy against sleeping sickness is unsatisfactory because the toxicity and arising of the drug resistant parasites. Trypanosomatids contain a single mitochondrion, the kinetoplast, whose genetic code deviates from the universal code where a UGA stop codon is used as a Trp codon. A single nuclear-encoded tRNATrp(CCA), that can decode the canonical Trp codon, is used by both the nucleus and mitochondria genes. A C to U editing event at position 34 of tRNATrp(CCA) changes the anticodon from CCA to UCA allowing the decoding of the UGA stop codon to Trp from the mitochondrial genes. We have identified two different nuclear-encoded tryptophanyl-tRNA-synthetase (WARSs) genes (one cytoplasmic (WARS1) and the other to the kinetoplast (WARS2)) in both Leishmania and Trypanosoma cells. With the purpose to validate the mitochondrial WARS enzymes of trypanosomatids, as potential drug targets, we performed gene silencing (RNAi) experiments with both WARSs forms from T. brucei. In the conditions tested, the expression of dsRNA from a dual promoter system generated potent RNA silencing, leading to clear phenotypes characterized by morphologic alterations, severe growth inhibition, reduction in the levels of oxygen consumed (only TbWARS2) and cellular death. The efficiency and specificity of silencing were estimated by quantitative PCR and significant modifications of the specific amount of TbWARSs mRNA were evidenced. / O parasita Trypanosoma brucei é o agente causal da Tripanossomíases Africana (doença do sono) em humanos e nagana em animais, cujo impacto socioeconômico é devastador nos paises sub-Saharianos da África. Atualmente, as terapias existentes contra esta doença são insatisfatórias, devido a sua toxicidade e ao surgimento de linhagens resistentes. Tripanosomatídeos contem uma simples mitocôndria, o kinetoplasto, cujo código genético desvia do código universal, onde o códon de parada UGA é usado como códon para Trp. Um simples tRNATrp(CCA) codificado no núcleo, decodifica o códon canônico Trp, usado para a tradução dos genes nucleares e mitocondriais. O evento de editoramento C por U na posição 34 do tRNATrp(CCA) muda o anticódon de CCA para UCA, permitindo a decodificação do códon de parada UGA para Trp, nos genes mitocondriais. No genoma de Leishmania e Trypanosoma, foram identificados dois genes nucleares para Triptofanil-tRNA sintetases (WARSs), uma citoplasmática (WARS1) e outra mitocondrial (WARS2). Com o propósito de validar a WARS mitocondrial de tripanosomatídeos, como um potencial alvo farmacológico, foi realizado o silenciamento gênico (RNAi) de ambos genes WARSs de T. brucei. Nas condições testadas, a expressão do dsRNA gerou um potente silenciamento, levando ao desenvolvimento de um fenótipo caracterizado por alterações morfológicas, drástica inibição do crescimento, redução nos níveis de oxigênio consumido (somente na TbWARS2) e morte celular. A eficiência e especificidade do silenciamento foram estimadas por PCR quantitativo e foram evidenciadas significativas modificações na quantidade de mRNA específico para as TbWARSs.