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Nonlinear dynamics of within-host parasite competition

Rethinavel, Natarajan [UNESP] 29 May 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-27T14:36:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-05-29Bitstream added on 2014-08-27T15:57:07Z : No. of bitstreams: 1 000778127.pdf: 1378513 bytes, checksum: d1d6783639c75c24813a467c1ea25eae (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Nesta tese estudamos a biologia de populações de sistemas hospedeiro-parasita, com especial atenção para os efeitos produzidos por múltiplas infecções de diferentes parasitas numa dada população de hospedeiros. Tal situação se assemelha a múlpiplas espécies competindo por um mesmo recurso. Com os parasitas competindo por hospedeiros, diversos resultados no nível populacional podem ocorrer. Se ambos parasitas não puderem infectar um hospedeiro conjuntamente, então o parasita mais apto elimina o menos apto. Quando co-infecções são possíveis, o padrão muda e a coexistência pode ser estabelecida. Finalmente, se um parasita pode deslocar o outro, o assim chamado efeito intraguilda, o resultado dependerá fortemente da taxa de geração de novos hospedeiros, a qual é determinada por fatores ambientais. Nós estudamos este sistema por meio de um modelo matemático su?cientemente abrangente para dar conta destas situações. Procedemos passo-a-passo: começamos com um modelo matemático simples para o caso de um parasita e um hospedeiro. Ao progredirmos para outros casos nosso modelo matemático passa a incluir novos termos até chegarmos num modelo completo. Há dois métodos de análise envolvidos. Estudamos analiticamente a estabilidade do estado livre de infecções, o que nos permite dar condições sobre a capacidade dos parasitas de invadir uma população não infectada/parasitada. Por outro lado, usamos métodos numéricos para estudar o comportamento para grandes tempos, que em todos os casos tende a um ponto ?xo. O foco é saber qual parasita prevelacerá ou se haverá coexistência, além de determinar as condições que regulam o resultado da interação. Através de diagramas de bifurcação analisamos a importância da riqueza de recursos do ambiente, relacionada à taxa de produção de novos hospedeiros. Encontramos que os estados assimptóticos dependem fortemente... / In this thesis we study the population biology of host-parasite systems, with a systematic view of the e?ects produced by multiple infections of di?erent parasites on a same host population. This situation is akin to multiple species competing for a shared resource. As parasites compete for a host, several outcomes at the population level can appear. If both parasites cannot jointly infect the same host, then the ?ttest parasite eliminates the other. When confection is possible, the pattern changes, and coexistence of both parasites becomes possible. Finally, if a parasite can displace the other within the host, the so-called intraguild e?ect, the outcome will strongly be dependent on the income rate of new hosts, which is determined by environmental factors. We studied this system through a mathematical model which is broad enough to encompass these situations. We proceed by steps: ?rst we framed a simple mathematical model for a single parasite/host case and as we progress to other cases, our mathematical model includes new terms and ?nally it is shaped into a complete model. Our methods are twofold. We study analytically the stability of the disease-free state, which allows us to give conditions for the ability of the parasites to invade a disease-free/non-infected population. On the other hand, we resort to numerical methods to study the long-term behavior of the system, which in all cases tends to a ?xed point. The main focus is to know which parasite prevails or if they are able to coexist, and determine the conditions that regulate this outcome . Through bifurcation diagrams we analyzed the importance of the richness of the environment, de?ned by the rate of production of new hosts. We found that the long-term states depend crucially on this rate. Our main original contribution is related to the study of the intraguild e?ect. Depending of the host income rate we can have four di?erent states, which are a disease...
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Helmintofauna associada a répteis provenientes da Reserva Particular do Patrimônio Natural Foz do Rio Aguapeí, estado de São Paulo

Silva, Lidiane Aparecida Firmino da [UNESP] 27 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2014-11-10T11:58:40Z : No. of bitstreams: 1 000786523.pdf: 3204960 bytes, checksum: 56fc411aea7922a35918f2e46bb8b479 (MD5) / Os biomas de Mata Atlântica e Cerrado possuem pontos de contato conhecidos como “áreas de transição”, as quais são altamente complexas por abrigarem elementos dos dois biomas e ainda elementos distintos, o que as tornam de alta relevância, devido à possibilidade de endemismos. O objetivo deste estudo foi descrever a helmintofauna associada à répteis de uma região caracterizada por bioma de transição, localizado na unidade de conservação da Reserva Particular do Patrimônio Natural (RPPN) Foz do Rio Aguapeí, porção Noroeste do Estado de São Paulo, município de Castilho. Foram necropsiados 88 espécimes de répteis, representados por cinco famílias de serpentes (Boidae, Colubridae, Dipsadidae, Typhlopidae e Viperidae), cinco de lagartos (Diploglossidae, Gymnophthalmidae, Mabuyidae, Teiidae e Tropiduridae), uma de crocodilianos (Alligatoridae) e uma de quelônio (Chelidae). A prevalência parasitária total observada foi de 57%. Vinte e sete taxa de helmintos foram recuperados: Acanthocephala (Cistacanto), Digenea (Cheloniodiplostomum testudinis, Infidum infidum, Infidum similis, Nematophila grandis, Telorchis birabeni, Travtrema stenocotyle e dois morfotipos não identificados), Monogenea (Polystomoides brasiliensis e Polystomoides sp.), Cestoda (Crepidobothrium cf. gerrardii, Oochoristica sp. e Ophiotaenia sp.) e Nematoda (Brevimulticaecum sp., Brevimulticaecum pintoi, Cistos, Cosmocerca podicipinus, Hastospiculum digiticaudatum, Ortleppascaris alata, Parapharyngodon largitor, Physaloptera sp., Physalopteroides sp., Rhabdias sp., Serpinema monospiculatus, Spiroxys figuereidoi e Strongyloides ophidae). Este estudo registra 25 novos hospedeiros para diferentes espécies de helmintos. Além de representar uma importante contribuição para o conhecimento da helmintofauna associada à répteis da América do Sul, aumentando o conhecimentos do parasitismo nesses hospedeiros da região neotropical / The biomes Atlantic Forest and Savannah hold contact points known as “transition areas”. Such areas are highly complex because they harbor elements belonging to the two biomes and also distinct elements, which make them relevant due to the possibility of endemism. The aim of this study was to characterize the composition and structure of the helminth fauna associated with reptiles from a biome of transition area, located in the National Park “Foz do Aguapeí” (Reserva Particular do Patrimônio Natural – RPPN - Foz do Rio Aguapeí), Northwest portion of São Paulo State, Castilho municipality. It was necropsied 88 reptile specimens, comprised by five snake families (Boidae, Colubridae, Dipsadidae, Typhlopidae and Viperidae), five lizard families (Diploglossidae, Gymnophthalmidae, Mabuyidae, Teiidae and Tropiduridae), one crocodile family (Alligatoridae), and one chelonian family (Chelidae). A total parasite prevalence of 57% was observed. The helminthes recuperated represent 27 taxa: Acanthocephala (Cystacanth), Digenea (Cheloniodiplostomum testudinis, Infidum infidum, Infidum similis, Nematophila grandis, Telorchis birabeni, Travtrema stenocotyle and two unidentified morpho-types), Monogenea (Polystomoides brasiliensis and Polystomoides sp.), Cestoda (Crepidobothrium cf. gerrardii, Oochoristica sp. and Ophiotaenia sp.) and Nematoda (Brevimulticaecum sp., Brevimulticaecum pintoi, Cistos, Cosmocerca podicipinus, Hastospiculum digiticaudatum, Ortleppascaris alata, Parapharyngodon largitor, Physaloptera sp., Physalopteroides sp., Rhabdias sp., Serpinema monospiculatus, Spiroxys figuereidoi and Strongyloides ophidae). This study records 25 new hosts for different helminth species, and represents an important contribution for the knowledge of helminth fauna associated with reptiles from South America, broadening the parasitism records of hosts from the Neotropical region
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Descrição extensiva dos sialomas de Rhodnius neglectus e Triatoma dimidiata, vetores da doença de Chagas

Santiago, Paula Beatriz January 2016 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, 2016. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-10-10T18:21:06Z No. of bitstreams: 1 2016_PaulaBeatrizSantiago.pdf: 14571538 bytes, checksum: e6692f71f1b3e972f9f5a7e93a8a6ea1 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-10-10T18:22:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_PaulaBeatrizSantiago.pdf: 14571538 bytes, checksum: e6692f71f1b3e972f9f5a7e93a8a6ea1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-10T18:22:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_PaulaBeatrizSantiago.pdf: 14571538 bytes, checksum: e6692f71f1b3e972f9f5a7e93a8a6ea1 (MD5) Previous issue date: 2017-10-10 / Programa de apoio a Núcleos de excelência (PRONEX); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Fundação de Apoio à Pesquisa do Distrito Federal (FAP-DF); Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP). / A doença de Chagas é causada pelo tripanossomatídeo Trypanosoma cruzi, geralmente transmitido ao hospedeiro vertebrado através do contato com as fezes do inseto vetor infectado durante o repasto sanguíneo. A lesão vascular ocasionada pela picada do triatomíneo hematófago desencadeia no hospedeiro manifestações que poderiam interferir na alimentação, tais como resposta imune, inflamação e hemostasia. No entanto, os insetos hematófagos são capazes de neutralizar essas defesas através de um complexo repertório de moléculas salivares, fundamentais para a manutenção do fluxo sanguíneo e o sucesso do repasto. No intuito de conhecer a complexidade molecular da saliva dos triatomíneos Rhodnius neglectus e Triatoma dimidiata, esta tese descreve os transcritomas de suas glândulas salivares utilizando sequenciamento de próxima geração. Foram obtidos 5.704 transcritos a partir da biblioteca de cDNA das glândulas salivares de T. dimidiata e 5.705 da biblioteca de R. neglectus, dos quais 662 e 636, respectivamente, codificam proteínas secretadas. A análise revelou a expressão de famílias gênicas já descritas na saliva de outros hematófagos, como lipocalinas, grupo abundante, antígeno-5 e apirases. Além disso, inibidores de proteases do tipo Kazal e proteases também foram encontrados. Adicionalmente, o conteúdo salivar foi submetido à análise proteômica, sendo identificadas 111 e 73 proteínas nos proteomas de T. dimidiata e R. neglectus, respectivamente. Os resultados obtidos validaram alguns transcritos putativamente secretados. Este estudo evidenciou que a saliva dos triatomíneos investigados tem característica multifuncional diretamente relacionada a diferentes atividades anti-inflamatórias, anti-hemostáticas e imunomoduladoras. O estudo dos compostos salivares auxilia a compreensão acerca da biologia dos vetores e transmissão de doenças, da evolução dos hematófagos, além de estimular a busca por novos fármacos. / Chagas disease is caused by Trypanosoma cruzi trypanosomatid, usually transmitted to vertebrate host through contact with faeces of infected vector insects during a blood meal. The vascular injury caused by the bite triggers symptoms capable to preventing an association with the host, such as immune response, inflammation and haemostasis. However, hematophagous arthropods are able to neutralize these defenses through a complex repertoire of salivary proteins acting as vasodilators, antiplatelets and anticoagulants. These molecules are essential for the blood flow maintenance and the success of the blood meal. In order to understand the salivary molecular complexity of Rhodnius neglectus and Triatoma dimidiata, this work describes their salivary glands (SG) transcriptome using next-generation sequencing. It was possible to obtain 5,704 transcripts from T. dimidiata and 5,705 from R. neglectus SGs, of which 662 and 636 encoded putatively secreted proteins respectively. The analysis revealed the expression of gene families already described in the saliva of other hematophagous insects, such as lipocalin, abundant protein family, antigen-5 and apyrases. Besides, Kazal type protease inhibitors and proteases were also found. In addition, the salivary content was submitted to proteomic analysis, being possible to identify 111 and 73 proteins in T. dimidiata and R. neglectus proteomes respectively. The results validated some putatively secreted transcripts. This work showed that saliva of the triatomines investigated here possess multi-functional feature directly related to different anti-inflammatory, anti-hemostatic and immunomodulatory activities. Salivary research helps the understanding of vector biology and disease transmission, hematophagous evolution, in addition to stimulating the search for new drugs.
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Parâmetros bioecológicos de Gryon gallardoi (Brethes) (Hymenoptera: Scelionidae) e modelagem da dinâmica espaço-temporal da sua interação com Spartocera dentiventris (Berg) (Hemiptera: Coreidae) através da simulação de múltiplos agentes

Silva, Celson Roberto Canto January 2003 (has links)
Estudos referentes à dinâmica espaço-temporal da interação hospedeiro-parasitóide são de fundamental importância para o desenvolvimento de técnicas de manejo de insetos em agroecossistemas. Uma recente abordagem têm sido o estudo de populações através da simulação computacional dos indivíduos que a compõem. Este método tem possibilitado a incorporação de importantes características como individualidade e estrutura espacial nos modelos teóricos. Neste sentido, o presente estudo visou a elaboração de um modelo baseado no comportamento individual para simular a dinâmica espaço-temporal da interação Spartocera dentiventris (Berg) (Hemiptera: Coreidae), inseto associado à cultura do fumo, e de seu inimigo natural, o parasitóide de ovos Gryon gallardoi (Brethes) (Hymenoptera: Scelionidae). Para a elaboração do modelo, estudos sobre a bioecologia de G. gallardoi foram desenvolvidos, de modo a investigar (i) o efeito da temperatura no seu desenvolvimento e viabilidade, (ii) a mortalidade de imaturos em campo, (iii) os parâmetros reprodutivos e a longevidade dos adultos, (iv) os padrões de dispersão em campo e (v) a resposta funcional e a interferência mútua dos parasitóides em diferentes densidades de ovos de S. dentiventris. No intuito de avaliar a capacidade de predição do modelo elaborado, a dinâmica espaço-temporal de ovos sadios e parasitados de S. dentiventris foi acompanhada em um cultivo de fumo, estabelecido em área experimental do Departamento de Fitossanidade da Faculdade de Agronomia da UFRGS, Porto Alegre (30o01’S e 51o13’O), RS, Brasil A viabilidade do desenvolvimento dos parasitóides na faixa de 20 a 30oC não diferiu significativamente, alcançando 98,8%. O tempo de desenvolvimento ovo-adulto de machos e fêmeas foi inversamente proporcional ao aumento da temperatura. Os valores estimados para o limite térmico inferior de desenvolvimento e para a constante térmica foram 15,5oC e 185,19GD para machos e 15,6oC e 192,31GD para fêmeas. Diversos fatores afetam o sucesso de imaturos de G. gallardoi em campo, sendo que o malogro e a predação por sugadores são os principais responsáveis pela emergência de apenas 37,87% dos adultos. Foi observado um período médio de oviposição de 10,1 ± 1,74 dias, com o pico de oviposição no segundo dia, sendo depositados ao longo dos mesmos uma média de 67,5 ± 11,29 ovos por fêmea. Fêmeas de G. gallardoi foram significativamente mais longevas que os machos, vivendo, respectivamente, 13,7 ± 1,94 e 10,6 ± 1,78 dias. A razão sexual total observada foi de 0,79. A dispersão de G. gallardoi em cultivo de fumo não foi sensivelmente influenciada pelo vento, sendo estimada uma capacidade de locomoção diária média para fêmeas de no mínimo 7,62 m. O padrão de parasitismo de G. gallardoi ajustou-se perfeitamente à resposta funcional do tipo II (pseudo-r2= 0,99), sendo obtidos os valores de 0,0557 e 0,9989 h para os componentes a’ e Tm , respectivamente O aumento da densidade de parasitóides acarretou, de maneira geral, uma diminuição no número de ovos parasitados por parasitóide. Foi obtido para o índice de interferência mútua “m” o valor 0,626. A dinâmica temporal de S. dentiventris – G. gallardoi simulada ajustou-se muito bem aos dados obtidos em campo (r2= 0,82 para ovos sadios e r2= 0,72 para ovos parasitados). Da mesma forma, os arranjos espaciais dos ovos e da taxa de parasitismo observados em campo foram satisfatoriamente reproduzidos através das simulações computacionais. Os resultados indicam que G. gallardoi apresenta um bom potencial para controlar populações de S. dentiventris, seja pela sua viabilidade de desenvolvimento em uma larga faixa de temperatura ou pela sua capacidade reprodutiva e padrões de dispersão similares àqueles observados para outras espécies já utilizadas no controle biológico de insetos. Por outro lado, a sensibilidade às baixas temperaturas, a alta mortalidade de imaturos observada em campo e uma resposta funcional do tipo II podem ser fatores que se contrapõe ao sucesso do parasitóide no controle de populações de S. dentiventris. Considerando a independência entre os dados observados e os dados obtidos através de simulações, o modelo elaborado obteve pleno sucesso em simular a dinâmica da interação S. dentiventris – G. gallardoi a partir do comportamento individual dos diferentes agentes Duas importantes características associadas à estabilidade de sistemas hospedeiro-parasitóide foram observadas no estudo de campo e reproduzidas no modelo – um padrão de parasitismo inversamente dependente da densidade dos hospedeiros e uma resposta agregativa dos parasitóides em algumas regiões do sistema. Desta forma, futuros estudos podem avaliar, a partir de um enfoque baseado no indivíduo, quais mecanismos são responsáveis por tais comportamentos e qual é o seu efeito na dinâmica do sistema. Conclui-se, através deste trabalho, que o estudo da dinâmica de populações através de uma abordagem baseada no indivíduo, com base em modelos computacionais, pode ser uma alternativa viável para superar as limitações e a complexidade inerente ao uso de modelos populacionais analíticos. Desta forma, o maior realismo implícito nestes modelos os torna ferramentas muito úteis para diversas áreas da ecologia aplicada, particularmente para a entomologia agrícola.
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O hábito alimentar dos morcegos (Mammalia, Chiroptera) e sua relação com a diversidade viral

Teixeira, Paula Galvão 05 July 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia, 2016. / Texto liberado parcialmente pelo autor. Conteúdo restrito: Capítulos 1 e 2. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-12-19T12:22:39Z No. of bitstreams: 1 2016_PaulaGalvãoTeixeira_Parcial.pdf: 339424 bytes, checksum: aa707ae64fc171a2b3f268c17a6d9fc8 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-01-27T17:21:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_PaulaGalvãoTeixeira_Parcial.pdf: 339424 bytes, checksum: aa707ae64fc171a2b3f268c17a6d9fc8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-27T17:21:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_PaulaGalvãoTeixeira_Parcial.pdf: 339424 bytes, checksum: aa707ae64fc171a2b3f268c17a6d9fc8 (MD5) / Os morcegos são reconhecidos como hospedeiros de uma grande variedade de vírus. No entanto, a relação entre a presença dos vírus e o hábito de vida dos morcegos quase não é explorada. O presente trabalho teve como objetivo entender um pouco melhor esta relação. Para tanto foi realizado um levantamento bibliográfico, apresentado no primeiro capítulo, sobre em quais morcegos já foram identificados vírus e quais são esses vírus, em um panorama global. Foi possível constatar que existe um maior número de estudos nos continentes do Velho Mundo e que a maioria dos trabalhos sobre vírus em morcegos nas Américas e no Brasil é sobre o vírus da raiva. Vírus pertencentes a 16 famílias já haviam sido identificados em morcegos no continente americano, sendo que destas famílias, apenas oito haviam sido identificadas no Brasil. Foi possível constatar que a família de morcegos Phyllostomidae é a que possui mais dados sobre vírus tanto no Brasil como nas Américas, seguida da família Molossidae, no Brasil. Sabendo que a ordem Chiroptera possui uma das dietas mais diversificadas entre todos os mamíferos, elaborei um estudo no capítulo 2 a fim de verificar a hipótese de que o hábito alimentar de quatro espécies de morcegos exerce influencia sobre a sua diversidade viral, bem como a hipótese de que quanto mais especializada a dieta dos morcegos, menor será a diversidade de vírus presentes em seus intestinos. Para tanto foram capturados 15 indivíduos de cada uma das seguintes espécies: Artibeus lituratus (Phyllostomidae) - frugívoro, Glossophaga soricina (Phyllostomidae) - nectarívoro, Desmodus rotundus (Phyllostomidae) – hematófago e, Nyctinomops laticaudatus (Molossidae) – insetívoro, em pontos aleatórios do Distrito Federal, no domínio Cerrado do Planalto Central, nos anos de 2014 e 2015. Os animais foram eutanasiados e tiveram seus intestinos armazenados a -80 ˚C para posterior análise. As amostras passaram por um processo de enriquecimento viral e os ácidos nucleicos foram extraídos utilizando-se o Kit de extração Zymo ZR Virus DNA/RNA. O DNA foi a seguir amplificado com polimerase phi29 e sequenciado usando o Kit de preparação Nextera DNA Library na plataforma Illumina MiSeq. As sequencias obtidas (reads) foram processadas e montadas usando CLC Genomics Workbench v.6.0.3. Os contigs resultantes foram comparados com o banco de dados Viral RefSeq, utilizando o programa BLASTX. A hipótese de que a diversidade viral varia de acordo com o hábito alimentar dos morcegos foi confirmad, porém a hipótese de que quanto mais especializada a dieta, dos morcegos, menor a diversidade viral encontrada no intestino, foi refutada. A espécie N. laticaudatus apresentou a maior diversidade viral, provavelmente porque os vírus encontrados no intestino dos espécimes, derivam da maior diversidade de insetos predados. As espécies G. soricina e A. lituratus apresentaram a mesma diversidade, o que pode ser explicado pelo fato de as duas espécies eventualmente utilizarem como alimentos plantas e esporadicamente insetos. D. rotundus foi a espécie com a menor diversidade viral, devido a dieta ser bastante restrita, apenas sangue. Porém, nesta espécie foi encontrado o vírus da Anemia Infecciosa das Galinhas – CAV, aqui encontrado pela primeira vez em D. rotundus, indicando que a espécie está predando além de mamíferos, aves. No todo 54 novos vírus foram detectados nas quatro espécies de morcegos, reforçando que pouco se conhece sobre os vírus presentes em morcegos. / Bats have been identified as a reservoir host of many viruses. However, the relationship between the presence of virus and bats trophic guild has been underexplored. The present study aimed to know this relationship better. To do this, I did a literature compilation in Chapter 1, showing which bats have already been identified as hosts of viruses and which viruses are these at a global scale. I found that most studies have been made in the Old World countries and that most of the studies on viruses in bats in the Americas and Brazil are about rabies virus. Viruses belonging to 16 families have already been identified in bats on the American continent, but only eight of these have been identified in Brazil. The bat family Phyllostomidae is the one with most data about viruses, followed by the Molossidae family, in Brazil. Knowing that the Chiroptera order has one of the most diversified diets of all mammals, I proposed a study, presented in Chapter 2, to verify the hypothesis that viral diversity is guided by the feeding habits of four bat species and the hypothesis that the more specialized the diet of the bats, the lower the viral diversity presente in their intestines. I captured 15 individuals of each of the following species: Artibeus lituratus (Phyllostomidae) - frugivorous, Glossophaga soricina (Phyllostomidae) - nectarivorous, Desmodus rotundus (Phyllostomidae) – sanguivorous e, Nyctinomops laticaudatus (Molossidae) – insectivorous, during the years of 2014 and 2015, in the Brazilian Cerrado (a savanna-like vegetation) areas in the Federal District. The captured bats were euthanized, and their intestines were stored at -80 ˚C until processing. After viral enrichment, nucleic acids were extracted using the Zymo ZR Virus DNA/RNA Extraction kit. The resulting DNA was amplified with a phi29 polymerase and sequenced using Nextera DNA Library Preparation Kit and Illumina MiSeq platform. The paired-ends readings (881,946) were quality-filtered, re-assembled using CLC Genomics Workbench v.6.0.3, and the resulting contigs were compared to the Viral RefSeq database using BLASTX. The hypothesis that viral diversity varies according to the eating habits of the bats was confirmed, but the hypothesis that the more specialized the diet of the bats, the lower the viral diversity present in their intestines, was disproved. N. laticaudatus species had the highest viral diversity, probably because the viruses found in the intestines of specimens reflect the diversity of insects predated by them. The species G. soricina and A. lituratus showed the same viral diversity, which can be explained by the fact that this two species feed on plants and sporadically in insects. D. rotundus was the species with the lowest viral diversity due to its restricted blood feeding habits. However, Chicken Anemia Virus – CAV was reported for the first time in D. rotundus, indicating that D. rotundus bats are preying on avian hosts, despite preying on mammals too. Finally, altogether, 54 new viruses have been detected in the four bat species on this study, stressing that little is known about viruses in bats.
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Transmissão por larvas em parasitos Monogenoidea favorece a especialização por linhagens de hospedeiros? o contexto do compartilhamento de um Dactylogyridae (Monogenoidea, Platyhelminthes) em duas espécies sintópicas de Characidium (Characiformes)

Ferreira, Renata Cristina Santos 07 December 2012 (has links)
Resumo
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Helmintofauna associada a répteis provenientes da Reserva Particular do Patrimônio Natural Foz do Rio Aguapeí, estado de São Paulo /

Silva, Lidiane Aparecida Firmino da. January 2014 (has links)
Orientador: Reinaldo José da Silva / Banca: Robson Waldemar Ávila / Banca: Lúcia Helena O'Dwyer de Oliveira / Resumo: Os biomas de Mata Atlântica e Cerrado possuem pontos de contato conhecidos como "áreas de transição", as quais são altamente complexas por abrigarem elementos dos dois biomas e ainda elementos distintos, o que as tornam de alta relevância, devido à possibilidade de endemismos. O objetivo deste estudo foi descrever a helmintofauna associada à répteis de uma região caracterizada por bioma de transição, localizado na unidade de conservação da Reserva Particular do Patrimônio Natural (RPPN) Foz do Rio Aguapeí, porção Noroeste do Estado de São Paulo, município de Castilho. Foram necropsiados 88 espécimes de répteis, representados por cinco famílias de serpentes (Boidae, Colubridae, Dipsadidae, Typhlopidae e Viperidae), cinco de lagartos (Diploglossidae, Gymnophthalmidae, Mabuyidae, Teiidae e Tropiduridae), uma de crocodilianos (Alligatoridae) e uma de quelônio (Chelidae). A prevalência parasitária total observada foi de 57%. Vinte e sete taxa de helmintos foram recuperados: Acanthocephala (Cistacanto), Digenea (Cheloniodiplostomum testudinis, Infidum infidum, Infidum similis, Nematophila grandis, Telorchis birabeni, Travtrema stenocotyle e dois morfotipos não identificados), Monogenea (Polystomoides brasiliensis e Polystomoides sp.), Cestoda (Crepidobothrium cf. gerrardii, Oochoristica sp. e Ophiotaenia sp.) e Nematoda (Brevimulticaecum sp., Brevimulticaecum pintoi, Cistos, Cosmocerca podicipinus, Hastospiculum digiticaudatum, Ortleppascaris alata, Parapharyngodon largitor, Physaloptera sp., Physalopteroides sp., Rhabdias sp., Serpinema monospiculatus, Spiroxys figuereidoi e Strongyloides ophidae). Este estudo registra 25 novos hospedeiros para diferentes espécies de helmintos. Além de representar uma importante contribuição para o conhecimento da helmintofauna associada à répteis da América do Sul, aumentando o conhecimentos do parasitismo nesses hospedeiros da região neotropical / Abstract: The biomes Atlantic Forest and Savannah hold contact points known as "transition areas". Such areas are highly complex because they harbor elements belonging to the two biomes and also distinct elements, which make them relevant due to the possibility of endemism. The aim of this study was to characterize the composition and structure of the helminth fauna associated with reptiles from a biome of transition area, located in the National Park "Foz do Aguapeí" (Reserva Particular do Patrimônio Natural - RPPN - Foz do Rio Aguapeí), Northwest portion of São Paulo State, Castilho municipality. It was necropsied 88 reptile specimens, comprised by five snake families (Boidae, Colubridae, Dipsadidae, Typhlopidae and Viperidae), five lizard families (Diploglossidae, Gymnophthalmidae, Mabuyidae, Teiidae and Tropiduridae), one crocodile family (Alligatoridae), and one chelonian family (Chelidae). A total parasite prevalence of 57% was observed. The helminthes recuperated represent 27 taxa: Acanthocephala (Cystacanth), Digenea (Cheloniodiplostomum testudinis, Infidum infidum, Infidum similis, Nematophila grandis, Telorchis birabeni, Travtrema stenocotyle and two unidentified morpho-types), Monogenea (Polystomoides brasiliensis and Polystomoides sp.), Cestoda (Crepidobothrium cf. gerrardii, Oochoristica sp. and Ophiotaenia sp.) and Nematoda (Brevimulticaecum sp., Brevimulticaecum pintoi, Cistos, Cosmocerca podicipinus, Hastospiculum digiticaudatum, Ortleppascaris alata, Parapharyngodon largitor, Physaloptera sp., Physalopteroides sp., Rhabdias sp., Serpinema monospiculatus, Spiroxys figuereidoi and Strongyloides ophidae). This study records 25 new hosts for different helminth species, and represents an important contribution for the knowledge of helminth fauna associated with reptiles from South America, broadening the parasitism records of hosts from the Neotropical region / Mestre
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Padrões ecológicos da relação de parasitismo entre ácaros mesostigmata e alguns roedores neotropicais /

Cruz, Leonardo Dominici. January 2012 (has links)
Orientador: Claudio José Von Zuben / Banca: Aricio Xavier Linhares / Banca: Gilberto Salles Gazêta / Banca: Fabio Akashi Hernandes / Banca: Karim Christina Scopinho Furquim / Resumo: Ácaros mesostigmatídeos e seus roedores hospedeiros compreendem um dos mais ricos e diversos sistemas parasito-hospedeiro da região Neotropical. A maior parte do conhecimento disponível sobre este sistema refere-se a listas de ocorrências, descrições de espécies parasitas e relações de especificidade hospedeira em escalas locais. Estudos ecológicos com o objetivo de procurar padrões de estruturas de comunidades de espécies parasitas, bem como investigar os possíveis processos subjacentes à organização destas comunidades são escassos. Dessa forma, o presente estudo tenta contribuir para o conhecimento ecológico deste sistema parasito-hospedeiro. No Capítulo 1, investigou-se a existência de padrões organizacionais nas infracomunidades de mesostigmatídeos em duas populações do hospedeiro roedor Oligoryzomys nigripes, bem como possíveis fatores subjacentes aos padrões observados. Demonstrou-se que as infracomunidades de mesostigmatídeos podem apresentar variações na sua organização, indo desde infracomunidades completamente aleatórias, a infracomunidades estruturadas. Fatores relacionados à história de vida dos hospedeiros podem ser responsáveis pela estruturação das infracomunidades de mesostigmatídeos; todavia, a proposição de padrões gerais não foi possível, principalmente devido a grande diversidade de espécies parasitas e hospedeiras envolvidas na região Neotropical. No Capítulo 2, investigou-se a existência de padrões de similaridades entre as comunidades de mesostigmatídeos em duas escalas observacionais: comunidade componente e comunidade composta. Os resultados obtidos demonstraram que as similaridades entre as comunidades componentes e entre as comunidades compostas geralmente são baixas, não sendo influenciadas pela distância geográfica e pela dissimilaridade ambiental entre as localidades... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Mites and their rodent hosts mesostigmatídeos comprise one of the richest and most diverse host-parasite systems of the Neotropical region. Most of the knowledge available about this system refers to occurrence lists, parasite species descriptions and host specificity relationships at local scales. Ecological studies with the aim looking for structure patterns of parasite communities, as well as investigate the possible processes underlying the organization of these communities are scarce. Thus, this study attempts to contribute to the ecological knowledge of this host-parasite system. In Chapter 1, we investigated the existence of organizational patterns in infracommunities of Mesostigmata mites of the two populations of the rodent host Oligoryzomys nigripes as well as possible factors underlying the observed patterns. It was demonstrated that the infracommunities of Mesostigmata mites may vary in their organization, ranging from completely random infracommunities to structured infracommunities. Factors related to the hosts life histories may be responsible for structuring Mesostigmata mites infracommunities. However, the proposition of general patterns was not possible, mainly due to the great diversity of parasites and host species involved in Neotropical region. In Chapter 2, we investigated the existence of similarity patterns among Mesostigmata mites communities in two levels: component community and compound community. The results showed that the similarities among the component communities and among the compound communities generally are low, not being influenced by geographical distance and environmental dissimilarity among the localities. However, the similarities of Mesostigmata mites among the compound communities were positively related to the host faunas similarities among the localities... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Nonlinear dynamics of within-host parasite competition /

Rethinavel, Natarajan. January 2013 (has links)
Orientador: Roberto André Kraenkel / Banca: Hilda Cerdeira / Banca: Fernando Fagundes Ferreira / Banca: Mario José de Oliveira / Banca: Stefanella Boatto / Resumo: Nesta tese estudamos a biologia de populações de sistemas hospedeiro-parasita, com especial atenção para os efeitos produzidos por múltiplas infecções de diferentes parasitas numa dada população de hospedeiros. Tal situação se assemelha a múlpiplas espécies competindo por um mesmo recurso. Com os parasitas competindo por hospedeiros, diversos resultados no nível populacional podem ocorrer. Se ambos parasitas não puderem infectar um hospedeiro conjuntamente, então o parasita mais apto elimina o menos apto. Quando co-infecções são possíveis, o padrão muda e a coexistência pode ser estabelecida. Finalmente, se um parasita pode deslocar o outro, o assim chamado efeito intraguilda, o resultado dependerá fortemente da taxa de geração de novos hospedeiros, a qual é determinada por fatores ambientais. Nós estudamos este sistema por meio de um modelo matemático suficientemente abrangente para dar conta destas situações. Procedemos passo-a-passo: começamos com um modelo matemático simples para o caso de um parasita e um hospedeiro. Ao progredirmos para outros casos nosso modelo matemático passa a incluir novos termos até chegarmos num modelo completo. Há dois métodos de análise envolvidos. Estudamos analiticamente a estabilidade do estado livre de infecções, o que nos permite dar condições sobre a capacidade dos parasitas de invadir uma população não infectada/parasitada. Por outro lado, usamos métodos numéricos para estudar o comportamento para grandes tempos, que em todos os casos tende a um ponto fixo. O foco é saber qual parasita prevelacerá ou se haverá coexistência, além de determinar as condições que regulam o resultado da interação. Através de diagramas de bifurcação analisamos a importância da riqueza de recursos do ambiente, relacionada à taxa de produção de novos hospedeiros. Encontramos que os estados assimptóticos dependem fortemente... / Abstract: In this thesis we study the population biology of host-parasite systems, with a systematic view of the effects produced by multiple infections of different parasites on a same host population. This situation is akin to multiple species competing for a shared resource. As parasites compete for a host, several outcomes at the population level can appear. If both parasites cannot jointly infect the same host, then the fittest parasite eliminates the other. When confection is possible, the pattern changes, and coexistence of both parasites becomes possible. Finally, if a parasite can displace the other within the host, the so-called intraguild effect, the outcome will strongly be dependent on the income rate of new hosts, which is determined by environmental factors. We studied this system through a mathematical model which is broad enough to encompass these situations. We proceed by steps: first we framed a simple mathematical model for a single parasite/host case and as we progress to other cases, our mathematical model includes new terms and finally it is shaped into a complete model. Our methods are twofold. We study analytically the stability of the disease-free state, which allows us to give conditions for the ability of the parasites to invade a disease-free/non-infected population. On the other hand, we resort to numerical methods to study the long-term behavior of the system, which in all cases tends to a fixed point. The main focus is to know which parasite prevails or if they are able to coexist, and determine the conditions that regulate this outcome . Through bifurcation diagrams we analyzed the importance of the richness of the environment, defined by the rate of production of new hosts. We found that the long-term states depend crucially on this rate. Our main original contribution is related to the study of the intraguild effect. Depending of the host income rate we can have four different states, which are a disease... / Doutor
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Atividade anti-tumoral estimulada pela infusão de células tronco mesenquimais utilizadas no tratamento da doença do enxerto contra hospedeiro aguda (DECHa) resistente a esteroides

Valim, Vanessa de Souza January 2017 (has links)
O transplante de Células Tronco Hematopoéticas alogênico é o tratamento curativo para diversas doenças hematológicas malignas, benignas e imunodeficiências, porém é acompanhado de grande morbidade e mortalidade. Uma das principais complicações é a doença do enxerto contra hospedeiro aguda que, se não controlada rapidamente, pode ser fatal. A Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda tem como tratamento o uso de esteróides, no entanto, em cerca de 30 a 50% dos casos se revela resistente à esta terapia, sendo considerados com Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda refratária ou resistente. O tratamento para Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda refratária ou resistente à esteróides não está ainda estabelecido sendo alta a mortalidade desses pacientes. Nesse contexto, começou-se a pesquisar o papel das células-tronco mesenquimais em pacientes com Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda resistente a esteróides, devido a capacidade de imunomodulação que aquelas possuem. As células-tronco mesenquimais são células-tronco adultas, com capacidade de autorrenovação, proliferação e diferenciação em diferentes linhagens celulares. As propriedades imunomoduladoras das células-tronco mesenquimais ainda não são totalmente conhecidas, mas sabe-se por estudos in vitro que elas interagem com diversos tipos celulares e citocinas, sendo sua aplicabilidade terapêutica muito pesquisada em diversas doenças inflamatórias; ainda assim, poucos se conhece sobre o efeito modulador das células-tronco mesenquimais in vivo. Inúmeros estudos piloto ou séries de casos sobre a aplicabilidade de célula-tronco mesenquimal para o tratamento da Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda foram publicados com resultados animadores, no entanto, não há até o momento na literatura estudo prospectivo randomizado em pacientes com Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda refratária comparando célula-tronco mesenquimal com o tratamento padrão. Finalmente, dentre os problemas decorrentes da intensa imunossupressão necessária para controlar a Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda resistente a esteroides, se destacam o aumento da incidência de infecções graves e a possibilidade da diminuição do Efeito Enxerto Versus Leucemia, ao qual se atribui o poder curativo do transplante de células-tronco hematopoético alogênico. As células Natural Killer com sua capacidade anti-tumoral inata, parecem ser os principais linfócitos envolvidos no Enxerto Versus Leucemia. Esse estudo teve como objetivo determinar o papel das células-tronco mesenquimais no tratamento da Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda resistente a esteroides comparando, de forma randomizada, com a terapia com anticorpos monoclonais padrão; e estudar aspectos relacionados à imunomodulação decorrente da terapia com célulatronco mesenquimal, in vivo, com particular atenção à citocinas a ao comportamento das células Natural Killer neste contexto. Nossos resultados confirmam que a infusão de célula-tronco mesenquimal levam a um aumento significativo da Interleucina 10 de efeito anti-inflamatório, e indicam pela primeira vez, que as células Natural Killer aumentam gradativamente durante e após as infusões de células-tronco mesenquimais tanto em proporção dentre os linfócitos, como no seu grau de ativação, resultando em uma atividade citotóxica significativamente elevada no 280 dia após o início das infusões. Postulamos, inclusive, que a ativação das células Natural Killer seria o mecanismo pelo qual não se observa aumento de recidiva ou das infecções com o emprego de infusões de células-tronco mesenquimais para o tratamento da Doença do Enxerto contra Hospedeiro aguda resistente a esteróides. / Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation is the curative therapy for several malignant and non-malignant hematological diseases as well as for immunodeficiences. Although curative, morbidity and mortality are high, been acute Graft versus Host Disease and infections amongst the most frequent life threatening complications. Treatment for acute Graft versus Host Disease is high dose steroids, however, 30 to 50% of the cases are resistant or refractory to it. Steroid resistant or refractory Graft versus Host Disease is a very difficult condition to treat and effective treatment strategies are still to be defined. In this scenario, the intravenous infusion of Mesenchymal Stem Cells has emerged as a tool to rescue patients from that condition because of its immunomodulatory potential. Mesenchymal Stem Cells are adult stem cells with capacity for self-renewal, proliferation and differentiation in mesodermal tissues, particularly chondrocytes, osteoblasts and fibroblasts. Its immunomodulatory proprieties and effectiveness in several inflammatory diseases are still a matter of intense debate and mostly studied in in vitro conditions. There are several published or ongoing studies on the role of Mesenchymal Stem Cells for steroid resistant acute Graft versus Host Disease, but none randomizing it with monoclonal antibody therapy frequently utilized as treatment with variable results, and complicated by an intense cellular immunodeficiency and severe infections. Since hematologic malignancies are the number one indication for allogeneic hematopoietic stem cell transplantation and the secondary Graft versus Leukemia effect mediated by immune effector cells recognized as responsible for its curative potential, an intense cellular immunodeficiency is not desirable in this scenario. In the last few years, Natural Killer cells have emerged as an effector involved in Graft versus Leukemia sparing the patient of Graft versus Host Disease, however, in vivo Mesenchymal Stem Cells and Natural Killer crosstalk have not been studied although severe infections and relapse are not increased after Mesenchymal Stem Cells cellular therapy. Here we show that, in spite of the results of most of the in vitro studies suggesting that Mesenchymal Stem Cells inhibits Natural Killer cell activity, in vivo evidences points to an increment of Natural Killer cells number and activity during the several Mesenchymal Stem Cells infusions, particularly at the 28th day after the beginning of infusions, thereby explaining the apparent infection and relapse protection promoted by Mesenchymal Stem Cells.

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