L'arrivée du numérique dans le champ des pratiques architecturales et particulièrement dans celui de l'étude et de la documentation du fait bâti a engendré ces trois dernières décennies d'importants bouleversements. A travers une mise en perspective historique et une définition étendue du relevé d'architecture, cette recherche vise à discuter et mettre en tension la dimension cognitive propre à sa pratique avec les enjeux technologiques auxquels elle fait face. Sur cette base, un constat s'impose :les empreintes numériques issues de l'application des méthodes d'acquisition les plus récentes (photogrammétrie & lasergrammétrie) expriment une forte exhaustivité (visuelle et métrique) avec les artefacts relevés mais produisent également d'importants volumes de données. Cette "surcharge d'informations" ne permet pas ou peu de renforcer la représentation architecturale dans son rôle de véhicule de connaissances.Face à ce déficit d'intelligibilité, l'ambition de cette thèse est de fournir une réponse épistémologique permettant de considérer ce besoin d'intelligibilité sans tourner le dos à la richesse des numérisations produites. Nous proposons ici une approche originale de bas niveau (non-interprétative), où la signification des éléments (structure "sémantique" et "géométrique") provient de l'étude des similarités morphologiques observées au sein d'un corpus de formes. L'analyse statistique et le recours à différents descripteurs morphologiques ont permis de formaliser des signatures caractéristiques du corpus étudié ;il s'agit ni plus ni moins de l'expression formelle d'un nombre déterminé d'attributs géométriques. De manière plus profonde, notre démarche fournit une solution méthodologique pour le traitement de données massives. En s'appuyant sur le cumul de données, ce travail offre une réponse analytique complémentaire aux approches "traditionnelles" de haut niveau (interprétatives) où la caractérisation de la forme s'appuie sur les connaissances pré-structurées du domaine. Si l'un des enjeux consiste à appliquer les méthodes d'analyse géométrique aux données massives, l'autre est de confronter, par l'étude comparative, les observations de haut et bas niveaux. A travers cette recherche, notre souhait est d'affiner la compréhension des propagations stylistiques dans le temps et dans l'espace. Afin d'expérimenter cette approche, 31 colonnes du cloître de l'Abbaye de Saint-Michel-de-Cuxa ont fait l'objet d'une analyse morphologique approfondie. / Doctorat en Art de bâtir et urbanisme (Architecture) / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Cette thèse, qui met en relation réflexion théorique et création artistique, entend comprendre pourquoi au cours de la contemplation d’une oeuvre d’art notre attention dépasse rarement ses qualités formelles, esthétiques ou conceptuelles.Contrairement à d’autres artefacts que nous rencontrons au quotidien, nous identifions les œuvres d’art au fait qu’elles ne satisfont pas des fins utilitaires. Leur place dans le musée ou la galerie en atteste et conduit à faire en sorte qu'elles n’ont pas d'autre rôle que d’attirer notre attention sur leurs caractéristiques propres. Cette thèse oppose à ce constat un mode de réception qui repose sur l’articulation de l’artefact à un environnement social. Cela suppose un mode de création et d’expression basé sur la fabrication d’instruments ou dispositifs susceptibles d'interpeller le spectateur. / This thesis, which combines theoretical analysis with artistic creation, attempts to understand the reason why, when contemplating works of art, we rarely look beyond their aesthetic, formal or conceptual qualities. Unlike many other objects that we encounter in our lives, works of art are recognizable by the fact that they serve no practical purpose. Their idle existence in galleries and museums confirms this and ensures that works of art fulfill no other function than that of drawing our attention to their inherent qualities. That being the case, this thesis proposes a way of appreciating art that relies on the articulation between an artefact and a social setting. This assumes a way of creating art and expressing ourselves that is grounded on the fabrication of instruments or devices predisposed to engage the beholder.

Peu d’études ont abordé le phénomène de construction identitaire chez les élèves immigrants du primaire. Or, l’immigration entraîne plusieurs bouleversements qui agissent sur la manière dont les enfants construisent leur identité et choisissent de l’exprimer à l’école. Il n’est cependant pas évident d’étudier un phénomène aussi complexe que l’identité auprès d’enfants dont le vocabulaire n’est pas encore suffisamment développé pour transmettre leur perception de qui ils sont, d’autant plus lorsque la langue de scolarisation n’est pas encore maîtrisée. Dans ce contexte, le recours au dessin apparaît comme une alternative intéressante. Les dessins dévoilent le monde intérieur des enfants qui projettent leurs émotions et leur façon de voir le monde dans les symboles composant les images qu’ils créent. Cette thèse a donc voulu explorer en quoi un programme d’intervention centré autour du dessin intitulé Art & Contes, favorise l’expression identitaire d'élèves immigrants et soutient l’élaboration d’une identité flexible et plurielle chez ces enfants. Dans un premier temps, des dessins libres commentés (n = 478) et des autoportraits dirigés (n = 116) réalisés par 29 élèves en classes d’accueil du primaire (2e et 3e cycle) ont été analysés. Dans un deuxième temps, des entrevues ont été effectuées auprès de quatre de ces enfants et de leur(s) parent(s) notamment afin de recueillir leur histoire familiale et d’approfondir avec l’enfant les histoires associées à ses dessins. Les deux enseignants ont également été rencontrés pour discuter de leur vision de l’enseignement et de leur perception des interactions dans leur classe. Ces entrevues ont servi à construire quatre études de cas qui illustrent la thèse selon laquelle la modulation de l’expression identitaire des enfants leur permettrait de maîtriser et de s’adapter à leurs différents environnements et serait notamment influencée par le milieu scolaire. Les études de cas ont aussi révélé la multiplicité des configurations identitaires que les élèves ont mis en œuvre dans leurs dessins dans le but de se reconstruire une identité flexible et plurielle. Considérant qu’une identité s’adaptant à plusieurs situations favorise l’adaptation psychosociale et scolaire des élèves immigrants, il semble que le dessin ait contribué à exprimer et à partager ces multiples identités. / Few studies have examined the phenomenon of identity construction among immigrant students in primary schools. Yet, immigration brings several changes affecting how children construct their identity and choose to express it at school. However, it is not easy to study a phenomenon as complex as identity with children who have not sufficiently developed their vocabulary to convey their perception of who they are, particularly when they do not master the language of schooling yet. In this context, the use of drawing appears as an interesting alternative. Indeed, drawings unveil the inner world of children who project their emotions and their way of seeing the world in the symbols comprising the images they create. This thesis has therefore attempted to explore how Art & Storytelling, an intervention program centered on drawing, promotes immigrant students’ identity expression and supports the development of a flexible and plural identity for these children. In a first phase, free drawings commented (n – 478) and realized by 29 primary school students (2nd and 3rd cycle) were analyzed as well as directed self-portraits (n = 116). In a second phase, interviews were conducted with four of these children and their parent(s), in order to collect the family history, among others, and to develop with the child the stories associated with his drawings. Both teachers were also interviewed to talk about their vision of teaching and their perception of how students interact in their class. These interviews were used to construct four case studies that illustrate the thesis according to which the modulation in the expression of children's identities would enable them to master and adapt to their different environments and would be influenced by the school environment in particular. The case studies also revealed the multiplicity of identity configurations that students used in their drawings in order to reconstruct a flexible and plural identity. Considering that an identity that adapts to several situations foster immigrant students’ psychosocial and school adjustment, it seems that drawing contributed to express and share these multiple identities.

Il y a quelque chose à prendre au sérieux à la lecture des bandes dessinées de Winsor McCay. C’est sur ce postulat, qu’après avoir décidé que mon corpus se limiterait à son œuvre en songes (toutes les planches qui finissent par une case où le personnage se réveille et réalise qu’il vient de rêver), j’ai envisagé de découvrir ce que l’on pouvait apprendre de la modernité new-yorkaise à lecture de Little Nemo in Slumberland (publié de 1905 à 1927) et de Dreams of the Rarebit Fiend (Les cauchemars de l’amateur de fondue au chester, publié de 1904 à1914). Cette thèse débute par une réflexion sur le concept esthétique et philosophique de la Modernité, et l’établissement méthodologique d’une sociologie de l’œuvre ouverte à la singularité de l’auteur. Elle détaille la construction de son matériel d’analyse et les limites qui se sont révélées à l’usage. Mon analyse de l’œuvre en songes de McCay se divise en deux étapes : l’une s’astreint à une étude différenciée de la case, de l’entre-case et de la planche, afin d’organiser le regard ;l’autre retient de l’œuvre quelques grandes trajectoires. Ce dernier développement permet de mettre l’accent sur la passion moderne du mouvement, le devenir de la fin de l’histoire à l’ère du sériel et le recours à la notion d’infini dans le processus de narration. Cette étude est aussi l’occasion de développer des concepts comme la saute, la création machinale, la rationalité baudelairienne ou le récit d’élection. / There is something serious about reading Winsor McCay's comics. It is based on this basic premise that, after I had decided that I would restrict my corpus to his sleepy stories (all the storyboard in which in the last panel the character wakes up and realizes that he wasdreaming), I intend to seek for what could be taught of new yorker modernity through the reading of Little Nemo in Slumberland (published from 1905 to 1929) and of Dreams of the Rarebit Fiend (published from 1904 to 1914). This thesis begins with a thought on a estheticand philosophical concept of Modernity and goes on with a methodic establishment of sociology of the work of art that encompasses the singularity of the author.I divided my analysis of the sleepy stories of McCay in two steps : one whose aims is toorganize the look provides a differentiated study of the panel, the gutters and the page ; the other one focus on main paths of the work. This last development allows to emphasize the modern passion of movement, the outcome of the end of the story in the age of seria lproduction and the concept of infinity in narrative process. This study also gives the opportunity to develop concepts such as tellings of the chosen one, mechanical creation,baudelerian rationality or the concept of skip.

Dès l’apparition du Pop art autour de 1962, l’iconographie de l’illustration et de la publicité indique l’émergence d’une véritable esthétique graphique. La rencontre du Pop art et du dessin se révèle particulièrement intéressante car suivre les productions réalisées dans cette discipline éminemment manuelle permet de réexaminer les différentes positions des artistes vis-à-vis de la culture de masse et d’aborder des questions tant matérielles qu’iconographiques. Partant du constat que les formations artistiques sont à l’origine du va-et-vient entre options manuelles et mécaniques dans l’économie du Pop art, le propos débute par l’examen des conditions d’émergence du dessin. L’examen des relations entre dessin et culture de masse ne saurait être complet sans évoquer la réponse d’artistes qui s’engagent dans la recherche d’un dialogue avec un public croissant (par des stratégies de classe, l’iconographie de logos de produits, la prise en compte des possibilités de l’estampe etc.). Non seulement l’œuvre naît du parcours de la main, mais le dessin pop dépasse le seul processus créateur pour exister dans un corpus d’œuvres autonomes, qui s’écarte de tout schéma finaliste. Cette présence souligne ce que peuvent avoir de critique l’image et l’action du corps. De même que Claes Oldenburg et David Hockney opposent une tension manuelle aux expressions mécanisées dans la société – et là réside le double sens de la notion d’engagement autant physique que politique dans le dessin pop –, le réinvestissement du corps sous la forme du portrait et du nu affirme sa solidarité avec les combats pour la libération sexuelle à l’aube des années soixante-dix. / By 1962 with the beginning of Pop art, the iconography of illustration and advertising points the development of an art founded on graphics. Interestingly, the relations between Pop art and drawing allow to follow how the handmade practices reassess the artists’ positions towards mass culture and deal with material issues (such as manual involvement) and the meaning of iconography (counter-culture, return of the figure). Starting from the point that artistic pop economy of art owes its back and forth mouvement between manual and mechanical options to its protagonists’ artistic education, this dissertation opens with the study of drawing’s emergence in a pedagogical context. The study of the relations between drawing and mass culture wouldn’t be fully led without assessing the answer of the artists who involve in the claim for a bigger audience (with a class strategy, an iconography full of mass products and the possibilities of prints). Moreover, not only the graphic works stem from the hand, but pop drawing overwhelms the solely issue of creation processes to exist in an autonomous corpus of works, which doesn’t fall into the finalist schema. This presence points how critical may be the body, through drawing, as an image and as an action. Similary to Claes Oldenburg and David Hockney who oppose a manual tension to the social mechanized expressions – and there lay the double sense of the very notion of involvement which is to be understood in Pop art in the same time on a physical and a political level – the reinvolvement of the body by way of portrait or nude shows its solidarity with the fights in the wake of the sixties, fight for sexual liberation, or women rights.

Piaget, Inhelder et Szeminska (1948) ont analysé l’évolution avec l’âge de la copie d’un dessin géométrique angulaire composé de deux traits formant deux angles. Les résultats obtenus sont interprétés dans le modèle stadiste piagétien. En accord avec le modèle de choix de stratégies de Siegler (1996 ; 2007) et l’importance de la variabilité intra-individuelle (Lautrey, 2003), notre thèse reprend cette analyse en faisant l’hypothèse que chaque participant dispose de plusieurs procédures. Nous explorons le répertoire de procédures des enfants âgés de 6 à 12 ans et des adultes en proposant la copie dans plusieurs conditions expérimentales : copie spontanée, plusieurs copies successives en demandant au participant de copier autrement, copie avec l’utilisation d’un instrument spécifique. Nous tentons ensuite d’enrichir ce répertoire en montrant au participant une procédure qu’il n’a pas pu produite seul. Les résultats obtenus sont cohérents avec les modèles pluralistes du développement : dès 10 ans, les enfants disposent de plusieurs procédures pour copier le dessin. Cependant, la mise en évidence de la variabilité intra-individuelle dans cette tâche est contrainte par les conditions expérimentales et les connaissances instrumentales et conceptuelles du participant, notamment l’acquisition du concept d’angle. / Piaget, Inhelder and Szeminska (1948) analysed the age evolution of a geometric drawing two-lines composed and forming an angle. The results obtained are interpreted in the stadist piagetian model. In accordance with the strategy choice model (Siegler, 1996; 2007) and with the intra-individual variability importance (Lautrey, 2003), our thesis takes up this analysis with hypothesis that each participant have at his disposal several procedures. We explore the 6 to 12 aged children and adult procedural repertory by suggesting the copy in different experimental conditions: spontaneous copy, several copies in proceeding (in other way), copy with specific instrument use,. We also attempt to complete this repertory by showing the participant a procedure he could not have produced by himself. The obtained results are suitable with plural models of development: from the age of ten, the children have several strategies for copying the drawing. However, the intra-individual variability observed in this task is forced by experimental conditions and instrumental and conceptual knowledge of the participant, in particular the acquisition of angle concept .

Depuis près de 40 ans, les designers n’échappent pas à la tournure politique de la crise écologique et aux outils normatifs qu’elle engendre pour concevoir notre rapport au monde. Dans ce champ professionnel, le concept de durabilité a été appliqué particulièrement au choix des matériaux et les normes qui en ont découlé ont tendu à consolider les propriétés esthétiques promulguées par le Mouvement moderne. Cette esthétique endémique, fortement uniformisante, anthropocentrée et anhistorique est à l’encontre du programme de changement promis par les politiques environnementales qui enjoint l’engagement citoyen, la construction du commun entre les individus, et aussi avec les autres, les non-humains. Les critiques exprimées contre le Mouvement moderne et l’environnementalisme ont pourtant montré que l’engagement écologique peut prendre forme dans une autre esthétique, une esthétique qui, en outre, défait la distinction entre nature et culture et conserve aux personnes une capacité d’agir nécessaire à la durabilité du monde. En posant un regard anthropologique sur l’esthétique, dans une perspective pragmatique et réaliste, cette thèse avance que l’engagement envers la cause écologique dépend de cette esthétique particulière. L’hypothèse est que l’engagement écologique est étroitement lié à la possibilité d’une esthétique de l’usure — capacité de la matérialité à se transformer, à porter l’usage et le temps. Afin de vérifier cette hypothèse, diverses formes d’engagement écologique ont été identifiées, et leurs propriétés esthétiques visuelles documentées. Une enquête photoethnographique a été réalisée entre 2014 et 2016 auprès de six individus, deux couples et quatre communautés engagés envers la cause écologique dans des milieux de vie urbanisés. Les terrains d’enquêtes comptent un squat activiste autogéré à Istanbul, un centre culturel et social habité autogéré à Berlin, un quartier autogéré à Copenhague, une habitation communautaire, des simplistes volontaires à Montréal et une autoethnographie performative effectuée à la lumière des pratiques observées sur le terrain. Une documentation photographique contextualisée par le biais d’un carnet de terrain a permis de décrire les propriétés esthétiques des lieux habités et des gestes posés au nom du souci écologique. Les résultats montrent que l’esthétique de l’usure est une qualité transversale de ces milieux de vie. Elle s’atteste dans la matérialité artificielle et naturelle, mais aussi gestuelle. Les résultats révèlent aussi douze autres propriétés esthétiques déterminantes de l’engagement écologique. Cette recherche permet de poser un regard critique sur les pratiques des designers adoptées au nom de la durabilité. Elle contribue à une compréhension plus riche des propriétés esthétiques oppressives, liberticides, écologiques et engageantes. L’une des particularités du design est sa capacité à agir sur l’esthétique du quotidien. Ces connaissances permettent aux designers et autres producteurs de l’environnement artificiel de considérer l’esthétique comme un levier d’action pour l’engagement et la transition écologique. Particulièrement, elles démontrent que l’esthétique est un élément clé des transformations sociales et culturelles, mais sa dimension anthropologique reste à explorer, à expérimenter et à légitimer. Enfin, ce travail aspire à éclairer, sur un plan théorique, le rapport entre l’esthétique et l’engagement, puis à sonder la possibilité d’une (contre)politique de l’artificiel pour améliorer les modes de production de demain. / In the last forty years, designers have not been immune to the political turn of the ecological crisis and the normative tools that it generated to design our relationship to the world. In this professional field, the sustainability has been applied particularly to the choice of materials and the standards created have tended to consolidate the aesthetic properties of the Modern Movement. This endemic aesthetic, highly standardizing, anthropocentric and ahistorical is opposite to the change promised by environmental policies which require citizen commitment, building a community between human beings, and also with others, non-humans. Criticisms against the Modern Movement and environmentalism showed that the ecological commitment can take shape in another aesthetic, an aesthetic which also defeats the distinction between nature and culture and preserves the agency of people for sustainability. Looking at aesthetic through an anthropological approach, from a pragmatist and realistic perspective, this thesis argues that the ecological commitment depends on this particular aesthetic. The hypothesis is that the ecological commitment is closely linked to aesthetics of wear - the ability of materiality (bodies and things) to transform, to show mark of uses and time. To verify this hypothesis, various forms of ecological commitment have been identified, and their visual aesthetic properties documented. A photo ethnographic survey was conducted between 2014-2016 with six individuals, two couples and four ecological communities, all settled in urban areas. The fieldwork includes a self-managed activist squat in Istanbul, a self-managed cultural and social center in Berlin, a self-managed neighborhood in Copenhagen, a communitarian house in Montreal, persons following the principles of simple living in Montreal and a self-ethnography performed in the light of ecological practices observed in these fieldworks. A photographic data collection contextualized through a field notebook allows to describe the aesthetic properties of those ecological places and the actions undertaken. The results show that the aesthetics of wear is a transversal quality of these environments. It was identified in artificial and natural materiality, but also in gestures. The analysis also reveals twelve other aesthetic properties crucial to ecological commitment. This research allows us to take a critical look at sustainable practices. It contributes to a richer understanding of oppressive and engaging aesthetic properties. Designers shapes the everyday aesthetics. The knowledge produced allows designers and the other producers of the artificial environment to consider aesthetics as a lever of action for commitment and ecological transition. In particular, it demonstrates that aesthetics is a key element of social and cultural transformations, but its anthropological dimension remains to be explored, tested and legitimized. Finally, this work aspires to contribute, on a theoretical level, to the relationship between aesthetics and commitment, and explore the possibility of a policy (or not) for artificial to improve our future production patterns.

Quel est le sens et la portée des images et des textes diffusés dans les médias? Voici la première question de recherche suggérée sur la page d'accueil web du département de communication de l’Université de Montréal. Le présent mémoire vise justement à répondre en partie à ce questionnement. Plus particulièrement, nous avons tenté de comprendre comment font sens des caricatures éditoriales publiées dans la presse écrite américaine le 12 septembre 2001. En utilisant une méthode d'analyse qui jumelle la théorie sémiotique de Charles Sanders Peirce et la sémiologie de Roland Barthes, nous avons analysé un corpus constitué de dix caricatures publiées au lendemain des évènements du 11 septembre. Nous avons observé la pertinence d’une analyse sémiotique rigoureuse en tentant d’évacuer la latitude discrétionnaire observée dans certaines analyses de notre revue de littérature. Comme nous le montrons, au lendemain de cet événement catastrophique, la plupart des images analysées renforcent le sentiment de tristesse et de peine alors que d’autres images sont plus bellicistes et suggèrent un appel à la vengeance et donc à la guerre. / What is the meaning and scope of the images and texts that we find in the media? This is the first research question suggested on the web page of the Department of communication of the Université de Montréal. This master’s thesis aims to partly address this questioning. Specifically, we tried to understand how political cartoons published in the American press on September 12, 2001 make sense. Using an analytical method that combines Charles Sanders Peirce’s semiotic and Roland Barthes’s semiology, we examined a corpus made of ten cartoons published the day after the September 11 events. We observed the relevance of a rigorous semiotic analysis by trying to eliminate the discretionary latitude observed in certain analyses found in our literature review. In the aftermath of this catastrophic event, most of the images we analyzed reinforce the feeling of sadness and grief while other cartoons are more hawkish and suggest a call for revenge, and therefore for war.

No description available.

Les interactions protéine-protéine sont souvent contrôlées par de petits domaines protéiques qui régulent les chemins de signalisation au sein des cellules eucaryotes. Les domaines PDZ sont parmi les domaines les plus répandus et les plus étudiés. Ils reconnaissent spécifiquement les 4 à 10 acides aminés C-terminaux de leurs partenaires. Tiam1 est un facteur d'échange de GTP de la protéine Rac1 qui contrôle la migration et la prolifération cellulaire et dont le domaine PDZ lie les protéines Syndecan-1 (Sdc1), Caspr4 et Neurexine. Des petits peptides ou des molécules peptidomimétiques peuvent potentiellement inhiber ou moduler son activité et être utilisés à des fins thérapeutiques. Nous avons appliqué des approches de dessin computationnel de protéine (CPD) et de calcul d'énergie libre par simulations dynamique moléculaire (DM) pour comprendre et modifier sa spécificité. Le CPD utilise un modèle structural et une fonction d'énergie pour explorer l'espace des séquences et des structures et identifier des variants protéiques ou peptidiques stables et fonctionnels. Nous avons utilisé le programme de CPD Proteus, développé au laboratoire, pour redessiner entièrement le domaine PDZ de Tiam1. Les séquences générées sont similaires à celles des domaines PDZ naturels, avec des scores de similarité et de reconnaissance de pli comparables au programme Rosetta, un outil de CPD très utilisé. Des séquences contenant environ 60 positions mutées sur 90, ont été testées par simulations de DM et des mesures biophysiques. Quatre des cinq séquences testées expérimentalement (par nos collaborateurs) montrent un dépliement réversible autour de 50°C. Proteus a également déterminer correctement la spécificité de la liaison de quelques variants protéiques et peptidiques. Pour étudier plus finement la spécificité, nous avons paramétré un modèle d'énergie libre semi-empirique de Poisson-Boltzmann ayant la forme d'une énergie linéaire d'interaction, ou PB/LIE, appliqué à des conformations issues de simulations de DM en solvant explicite de complexes PDZ:peptide. Avec trois paramètres ajustables, le modèle reproduit correctement les affinités expérimentales de 41 variants, avec une erreur moyenne absolue de 0,4~kcal/mol, et donne des prédictions pour 10 nouveaux variants. Le modèle PB/LIE a ensuite comparé à la méthode non-empirique de calcul d'énergie libre par simulations alchimiques, qui n'a pas de paramètre ajustable et qui prédit correctement l'affinité de 12 complexes Tiam1:peptide. Ces outils et les résultats obtenus devraient nous permettre d'identifier des peptides inhibiteurs et auront d'importantes retombées pour l'ingénierie des interactions PDZ:peptide. / Small protein domains often direct protein-protein interactions and regulate eukaryotic signalling pathways. PDZ domains are among the most widespread and best-studied. They specifically recognize the 4-10 C-terminal amino acids of target proteins. Tiam1 is a Rac GTP exchange factor that helps control cellmigration and proliferation and whose PDZ domain binds the proteins syndecan-1 (Sdc1), Caspr4, and Neurexin. Short peptides and peptidomimetics can potentially inhibit or modulate its action and act as bioreagents or therapeutics. We used computational protein design (CPD) and molecular dynamics (MD) free energy simulations to understand and engineer its peptide specificity. CPD uses a structural model and an energy function to explore the space of sequences and structures and identify stable and functional protein or peptide variants. We used our in-house Proteus CPD package to completely redesign the Tiam1 PDZ domain. The designed sequences were similar to natural PDZ domains, with similarity and fold recognition scores comarable to the widely-used Rosetta CPD package. Selected sequences, containing around 60 mutated positions out of 90, were tested by microsecond MD simulations and biophysical experiments. Four of five sequences tested experimentally (by our collaborators) displayed reversible unfolding around 50°C. Proteus also accurately scored the binding specificity of several protein and peptide variants. As a more refined model for specificity, we parameterized a semi-empirical free energy model of the Poisson-Boltzmann Linear Interaction Energy or PB/LIE form, which scores conformations extracted from explicit solvent MD simulations of PDZ:peptide complexes. With three adjustable parameters, the model accurately reproduced the experimental binding affinities of 41 variants, with a mean unsigned error of just 0.4 kcal/mol, andgave predictions for 10 new variants. The PB/LIE model was tested further by comparing to non-empirical, alchemical, MD free energy simulations, which have no adjustable parameters and were found to give chemical accuracy for 12 Tiam1:peptide complexes. The tools and insights obtained should help discover new tight binding peptides or peptidomimetics and have broad implications for engineering PDZ:peptide interactions.