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Análise genética de papilomavírus bovino da região Norte do BrasilSilva, Flávio Roberto Chaves da January 2017 (has links)
Os papilomavírus (PV) são vírus epiteliotrópicos e constituem um grande grupo geneticamente diverso da família Papillomaviridae que infecta diferentes espécies de mamíferos, répteis e aves. Estes vírus caracterizam-se por sua propriedade oncogênica, sendo responsáveis pela indução de tumores benignos e malignos nos epitélios cutâneo e mucoso de suas espécies hospedeiras. Nos bovinos, a papilomatose causa importantes prejuízos econômicos à pecuária de corte e leiteira, dentre as quais destacam-se as infecções secundárias, a dificuldade de amamentação do bezerro, a depreciação do couro e o descarte precoce de animais e, ainda, no caso de rebanhos de aptidão leiteira, a papilomatose mamária ocasiona dificuldade de ordenha, retenção de leite e predispõe à mastite. Independente do nível de tecnificação da exploração na pecuária, estes agentes podem ser encontrados em quase todos os países. No entanto, poucos tipos de papilomavírus bovinos (BPV) foram caracterizados até o presente momento. Desta forma, este trabalho teve como objetivo realizar um estudo de caracterização genética e patológica das infecções causadas pelo BPV na região norte do Brasil. No Capítulo 1, buscou-se avaliar a diversidade dos BPVs em lesões cutâneas de bovinos na região Amazônica brasileira utilizando o par de primers degenerados FAP (FAP59 e FAP64) Foram encontrados os BPVs tipo 1, 2, 11, e 13 além de quatro prováveis novos tipos virais que apresentaram baixa identidade com os BPVs 7, 8, 11 e 12. No Capítulo 2, o genoma de um novo tipo de papilomavírus bovino pertencente ao gênero Xipapillomavirus, espécie Xipapillomavirus 1, foi caracterizado aplicando a técnica de amplificação por círculo rolante seguida de sequenciamento de alta eficiência utilizando a plataforma Illumina. Este novo tipo apresentou maior similaridade com o BPV3 (79% de identidade a nível genômico) e preenche os requisitos para ser considerado um novo tipo de BPV. Histopatologicamente, a lesão causada por esse novo BPV foi caracterizada como papiloma exofítico, apresentando células bem diferenciadas, marcada acantose e paraqueratose. No Capítulo 3, foi realizado o sequenciamento de um genoma completo de BPV5 utilizando o mesmo protocolo do Capítulo 2. Este foi o primeiro genoma de BPV5 da América do Sul completamente sequenciado e caracterizado. Assim, os resultados obtidos nesta tese contribuem para o melhor conhecimento da variabilidade genética do BPV e mostra a importância da utilização de ferramentas moleculares na sua caracterização, principalmente em regiões carentes de estudos e que podem abrigar tipos desconhecidos. / Papillomaviruses (PV) are epitheliotropic viruses that constitute a large genetically diverse group of the Papillomaviridae family which can infect different species of mammals, reptiles and birds. These viruses are characterized by their oncogenic properties and are responsible for the induction of benign and malignant tumors in cutaneous and mucosal epithelia. In cattle, papillomatosis causes significant economic losses to beef and dairy cattle characterized by secondary infections, calf breastfeeding difficulties, leather depreciation, early animal discarding, mammary papillomatosis, retention of milk and predisposes to mastitis. Regardless of the level of technification of livestock farming, these agents can be found in almost all countries. However, few types of bovine papillomavirus (BPV) have been characterized to date. Thereby, this work had as objective to carry out a study of genetic and pathological characterization of the infections caused by the BPV from Northern Brazil. In Chapter 1, we evaluated the genetic diversity of BPVs in bovine cutaneous lesions from Brazilian Amazon using the degenerate FAP pairs of primers (FAP59 and FAP64). BPV1, 2, 11, and 13 were found in addition to four probable new viral types that had low identity with BPVs 7, 8, 11 and 12 In Chapter 2, the whole genome of a new BPV type belonging to genus Xipapillomavirus, species Xipapillomavirus 1, was characterized applying the technique of rolling circle amplification followed by high-throughput sequencing using the Illumina platform. This new type showed greater similarity with BPV3 (79% identity at the genomic level) and fulfills the requirements to be considered a new BPV type. Histopathology was characterized by exophytic papilloma, presenting well differentiated cells, marked acanthosis and parakeratosis. In Chapter 3, a complete BPV5 genome was sequenced using the same protocol used in Chapter 2. This was the first fully sequenced and characterized BPV5 genome from South America. Thus, the results obtained in this thesis contribute to a better knowledge of the genetic variability of BPV and shows the importance of the use of molecular tools in their characterization, especially in regions that are lacking in studies and which may harbor unknown types.
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Análise genética de papilomavírus bovino da região Norte do BrasilSilva, Flávio Roberto Chaves da January 2017 (has links)
Os papilomavírus (PV) são vírus epiteliotrópicos e constituem um grande grupo geneticamente diverso da família Papillomaviridae que infecta diferentes espécies de mamíferos, répteis e aves. Estes vírus caracterizam-se por sua propriedade oncogênica, sendo responsáveis pela indução de tumores benignos e malignos nos epitélios cutâneo e mucoso de suas espécies hospedeiras. Nos bovinos, a papilomatose causa importantes prejuízos econômicos à pecuária de corte e leiteira, dentre as quais destacam-se as infecções secundárias, a dificuldade de amamentação do bezerro, a depreciação do couro e o descarte precoce de animais e, ainda, no caso de rebanhos de aptidão leiteira, a papilomatose mamária ocasiona dificuldade de ordenha, retenção de leite e predispõe à mastite. Independente do nível de tecnificação da exploração na pecuária, estes agentes podem ser encontrados em quase todos os países. No entanto, poucos tipos de papilomavírus bovinos (BPV) foram caracterizados até o presente momento. Desta forma, este trabalho teve como objetivo realizar um estudo de caracterização genética e patológica das infecções causadas pelo BPV na região norte do Brasil. No Capítulo 1, buscou-se avaliar a diversidade dos BPVs em lesões cutâneas de bovinos na região Amazônica brasileira utilizando o par de primers degenerados FAP (FAP59 e FAP64) Foram encontrados os BPVs tipo 1, 2, 11, e 13 além de quatro prováveis novos tipos virais que apresentaram baixa identidade com os BPVs 7, 8, 11 e 12. No Capítulo 2, o genoma de um novo tipo de papilomavírus bovino pertencente ao gênero Xipapillomavirus, espécie Xipapillomavirus 1, foi caracterizado aplicando a técnica de amplificação por círculo rolante seguida de sequenciamento de alta eficiência utilizando a plataforma Illumina. Este novo tipo apresentou maior similaridade com o BPV3 (79% de identidade a nível genômico) e preenche os requisitos para ser considerado um novo tipo de BPV. Histopatologicamente, a lesão causada por esse novo BPV foi caracterizada como papiloma exofítico, apresentando células bem diferenciadas, marcada acantose e paraqueratose. No Capítulo 3, foi realizado o sequenciamento de um genoma completo de BPV5 utilizando o mesmo protocolo do Capítulo 2. Este foi o primeiro genoma de BPV5 da América do Sul completamente sequenciado e caracterizado. Assim, os resultados obtidos nesta tese contribuem para o melhor conhecimento da variabilidade genética do BPV e mostra a importância da utilização de ferramentas moleculares na sua caracterização, principalmente em regiões carentes de estudos e que podem abrigar tipos desconhecidos. / Papillomaviruses (PV) are epitheliotropic viruses that constitute a large genetically diverse group of the Papillomaviridae family which can infect different species of mammals, reptiles and birds. These viruses are characterized by their oncogenic properties and are responsible for the induction of benign and malignant tumors in cutaneous and mucosal epithelia. In cattle, papillomatosis causes significant economic losses to beef and dairy cattle characterized by secondary infections, calf breastfeeding difficulties, leather depreciation, early animal discarding, mammary papillomatosis, retention of milk and predisposes to mastitis. Regardless of the level of technification of livestock farming, these agents can be found in almost all countries. However, few types of bovine papillomavirus (BPV) have been characterized to date. Thereby, this work had as objective to carry out a study of genetic and pathological characterization of the infections caused by the BPV from Northern Brazil. In Chapter 1, we evaluated the genetic diversity of BPVs in bovine cutaneous lesions from Brazilian Amazon using the degenerate FAP pairs of primers (FAP59 and FAP64). BPV1, 2, 11, and 13 were found in addition to four probable new viral types that had low identity with BPVs 7, 8, 11 and 12 In Chapter 2, the whole genome of a new BPV type belonging to genus Xipapillomavirus, species Xipapillomavirus 1, was characterized applying the technique of rolling circle amplification followed by high-throughput sequencing using the Illumina platform. This new type showed greater similarity with BPV3 (79% identity at the genomic level) and fulfills the requirements to be considered a new BPV type. Histopathology was characterized by exophytic papilloma, presenting well differentiated cells, marked acanthosis and parakeratosis. In Chapter 3, a complete BPV5 genome was sequenced using the same protocol used in Chapter 2. This was the first fully sequenced and characterized BPV5 genome from South America. Thus, the results obtained in this thesis contribute to a better knowledge of the genetic variability of BPV and shows the importance of the use of molecular tools in their characterization, especially in regions that are lacking in studies and which may harbor unknown types.
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Análise de variabilidade genética do gene L1 e da região longa de controle (LCR) dos Papilomavírus Humano (HPVs) circulantes da Região Nordeste do Brasil.GURGEL, Ana Pavla Almeida Diniz 25 February 2015 (has links)
Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2016-06-28T18:01:45Z
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Previous issue date: 2015-02-25 / CAPES / Cerca de 265 mil mulheres morrem todos os anos vítimas de câncer cervical. Infecções persistentes causadas por Papilomavírus humano de alto risco oncogênico (HR HPVs) é uma condição necessária, porém não suficiente para o desenvolvimento de lesões cervicais e câncer cervical. Dessa forma, diversos fatores ambientais e genéticos estão envolvidos na carcinogênese cervical. Dentre os fatores genéticos, as variantes genéticas dos HR HPVs parecem estar relacionados com o risco de infecções persistentes e desenvolvimento de lesões e câncer cervical. Assim, o presente estudo investigou: 1) A variabilidade genética de um fragmento do gene L1 dos HPV16, 31, 53, 54, 56, 58, 61, 62, 66, 70 e 81 em amostras biológicas de pacientes oriundos dos Estados de Pernambuco, Alagoas e Sergipe, Nordeste do Brasil; 2) A variabilidade genética da LCR dos HR HPVs 16, 31 e 58 oriundas de pacientes dos Estados de Pernambuco, Alagoas e Sergipe, Nordeste do Brasil; 3) Uma possível associação entre os polimorfismos virais do gene L1 e o risco para desenvolver lesões cervicais nas pacientes do Nordeste do Brasil. Para tanto, a detecção do DNA viral foi realizada em amostras biológicas de 784 pacientes. Os fragmentos parciais do gene L1 e da LCR dos HPVs mencionados foram sequenciados. Análises in silico de possíveis epitopos de células B e de células T foram efetuadas nas regiões de mutação não-sinônima no gene L1. Além disso, análises in silico dos sítios de ligação dos fatores transcricionais foram realizadas em regiões de alteração nucleotídica da LCR. Foram detectados 23 tipos de HPVs: HPVs 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 52, 53, 54, 56, 58, 61, 62, 66, 70, 72, 81, 82, 83 e 84. Com relação ao gene L1 dos HPV analisados, foram detectadas 98 mutações, sendo 96/98 substituições de bases, 1/98 deleção e 1/98 inserção de nucleotídeo. Dentre estas alterações nucleotídicas no gene L1, 29,6% são mutações não sinônimas. Ademais, 18,36% das variações detectadas no gene L1 estavam inseridas em epitopos de células B, 25,5% inseridos em regiões de MHC Classe I e 18,36% inseridos em regiões de MHC Classe II. Um total de 8,1% das variações genéticas observadas no gene L1 dos HPV estudados foram descritos pela primeira vez na literatura. Em relação a LCR, foram detectadas 95 mutações, sendo 88/95 substituições de bases, 5/98 deleções e 2/95 inserções de nucleotídeos. Um total de 51,5% das mutações detectadas estão inseridas em sítios de ligação dos fatores transcricional celular e/ou viral. Além disso, 3,1% das variações genéticas encontradas na LCR foram descritas pela primeira vez na literatura. As análises filogenéticas mostraram a presença das variantes A e D do HPV16, A e C do HPV31 e A, B, C e D do HPV58 circulante no Nordeste do Brasil. Com relação a repercussão biológica das mutações do gene L1 do HPV16, não foram observadas associações significativas (p>0.05) entre os polimorfismos do gene L1 e o risco para desenvolver lesões cervicais. Entretanto, a combinação de determinados alelos destes polimorfismos virais está fortemente associada com o risco de desenvolver lesão cervical. Assim, a detecção das principais variantes e de alterações nucleotídicas com potencial impacto biológico circulantes no Nordeste Brasileiro é importante face as diferenças na patogenicidade dos HPVs. / Approximately 265 thousand women die every year from cervical cancer. Persistent infections caused by high oncogenic risk Human papillomavirus (HR HPV) are necessary but not sufficient condition for the development of cervical lesions and cervical cancer. Therefore, several environmental and genetic factors are involved in cervical carcinogenesis. Concerning the genetic factors, variants of HR HPV seem to be related to the risk of persistent infections and the development of lesions and cervical cancer. In this sense, the present study aimed to investigate: 1) The genetic variability of a L1 gene fragment from HPV16, 31, 53, 54, 56, 58, 61, 62, 66, 70 and 81 in biological samples of patients from Pernambuco, Alagoas and Sergipe states, Northeastern Brazil;
2) The genetic variability of the LCR of HR HPVs 16, 31 and 58 of patients from from Pernambuco, Alagoas and Sergipe states, Northeastern Brazil; 3) Possible association between the viral polymorphisms of the L1 gene and the risk to develop cervical lesions in patients from the Brazilian Northeast. To achieve that, viral DNA detection was performed in biological samples from 784 patients. Partial fragments of the L1 gene and the LCR of the abovementioned HPVs were sequenced. In silico predictions of possible B cells and T cells epitopes were performed in regions of non-synonymous mutation of the L1 gene. Moreover, in silico predictions of the binding sites of transcriptional factors were performed in nucleotide change regions within LCR. Twenty-three HPV types were detected: HPVs 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 52, 53, 54, 56, 58, 61, 62, 66, 70, 72, 81, 82, 83 e 84. Regarding the L1 gene from the analyzed HPVs, 98 mutations were detected, in which 96 are nucleotide substitutions, 1 is deletion and 1 is nucleotide insertion. Among these nucleotide changes in the L1 gene, 29.6% are non-synonymous mutations. Moreover, 18.36% of the nucleotide changes are located in B cell epitopes, 25.5% located in MHC Class I regions and 18.36% located in MHC Class II regions. Finally, 8.1% of the genetic variations in the L1 gene of the studied HPVs were observed for the first time. Concerning LCR, 95 mutations were detected, in which 88 are nucleotide substitutions, 5 are deletions and 2 are nucleotide insertions. A total of 51.5% of the detected mutations are located in binding sites of cellular and/or viral transcriptional factors. Additionally, 3.1% of the genetic variations found in LCR were described for the first time. Phylogenetic analisys showed the presence of A and D variants of the HPV16, A and C variants of the HPV31, and A, B, C and D variants of the HPV58 circulating in the Brazilian Northeast. In regard to the biological repercussion of the L1 gene mutations of the HPV16, no significant associations were observed (p>0.05) between L1 gene polymorphism and the risk to develop cervical lesions. However, the combination of certain alleles from these viral polymorphisms is firmly associated to the risk to develop cervical lesion. Thus, the detection of the main circulating variants with potential biological impact in the Brazilian Northeast is important in view of the differences in the pathogenicity of the HPV.
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Avaliação da prevalência do Papíloma Humano (HPV) em saliva de pacientes portadores do HIVAZEVEDO, Karinne Silva 27 August 2015 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-12-12T14:11:56Z
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DISSERTACAO PARA BIBLIOTECA CENTRAL - KARINNE AZEVEDO.pdf: 2052240 bytes, checksum: fba514c37249c7db73fcf51a37fa21ff (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-12T14:11:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2
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Previous issue date: 2015-08-27 / CAPES / Identificar a presença dos sorotipos de alto risco do Papilomavírus Humano (HPV) na saliva
de pacientes portadores do vírus HIV. A amostra de 90 pacientes foi oriunda de dois centros
de referência em tratamento de ISTs da cidade do Recife, PE, Brasil. Uma entrevista foi
realizada para identificar o perfil da amostra, sendo realizada uma coleta de saliva
empregando tubos falcon e solução para bochecho com sacarose a 5%, com posterior
armazenamento em freezer a -20°C para rastreamento do HPV e genotipagem para o sorotipo
16 e 18 por PCR convencional. Na amostra predominou a presença do sexo masculino 59 de
90 (65,6%), com idade média de 38,8 anos, variando entre 18 e 69 anos, renda familiar média
de 1,95 Salários Mínimos (DP = 1,37). A prevalência de HPV nesta amostra foi de 23 de 90
(25,6%) e dos sorotipos 16 e 18 foi 8 de 90 (8,9%). A co-infecção por HPV é comumente
observada em pacientes portadores de HIV. / To identify the presence of high-risk serotypes human papillomavirus (HPV) in patients with
sexually transmitted infections (STIs). A sample of 90 patients were from two referral
hospitals in treatment of STIs. An interview was conducted to identify the sample’s profile a
saliva collections being perfomed using falcon tubs and mount rinse with 5% sucrose,
subsequente storage in a freezer at -20ºC for HPV screening and genotyping for serotype 16
and 18 by conventional PCR. In the sample predominant male presence 59 of 90 (65.6%) with
mean age of 38.8 years, ranging between 18 and 69 years, average family income of 1.95
minimum wages (SD = 1, 37). The prevalence of HPV in this sample was 23 of 90 (25.6%)
and the serotype HPV 16 and 18 was 8 of 90 (8.9%). Co-infection with HPV is commonly
observed in HIV patients.
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Prevalência de infecção por HPV em jovens primíparas e fatores associados / Prevalence of HPV infection in young primiparous women and associated factorsCristina Helena Rama 21 July 2009 (has links)
Introdução: A infecção genital pelo papilomavírus humano (HPV) é um fator necessário para o desenvolvimento do câncer cervical. Vacinas para prevenir a infecção pelos tipos de alto risco HPV 16 e 18 foram desenvolvidas e idealmente devem ser administradas antes da exposição ao HPV através do contato sexual. As variações na prevalência do HPV e na de seus tipos específicos em diferentes populações podem influenciar as recomendações da vacina contra o HPV em diferentes locais. A vacinação após o primeiro parto poderia ser uma estratégia em potencial para atingir mulheres jovens e saudáveis, dependendo da proporção de mulheres desse grupo ainda não infectadas pelos tipos de alto risco, HPV 16 e 18. Objetivos: O objetivo principal deste estudo foi determinar a prevalência genital do DNA de tipos específicos do HPV e avaliar a associação dessa infecção com fatores de risco selecionados em mulheres após o primeiro parto, usuárias de uma maternidade pública. Métodos: Esse estudo transversal foi realizado no Hospital Maternidade Leonor Mendes de Barros (HMLMB), uma das maiores maternidades públicas da cidade de São Paulo. Durante junho de 2006 até fevereiro de 2007, 301 primíparas de 15-24 anos, cujos partos ocorreram no referido Hospital, foram incluídas no estudo entre 43 e 60 dias após o parto. Na detecção de DNA do HPV extraído das células cervicais esfoliadas foi utilizado protocolo padrão da Reação em Cadeia por Polimerase (PCR), utilizando primers PGMY09/11. Para estimar a associação da infecção por HPV com fatores de risco selecionados, foi calculada a Razão de Prevalência (RP) e o intervalo de 95% de confiança [IC]; o ajuste foi realizado utilizando-se o Modelo Linear Generalizado (MLG) com distribuição binomial e função de ligação logarítmica. Resultados: O DNA do HPV foi detectado em 58,5% (IC 95% 52,7%-64,0%) das jovens mulheres. Os tipos de HPV mais comumente encontrados foram: HPV 16, HPV 51, HPV 52, HPV 58 e HPV 71. A prevalência dos tipos de HPV incluídos nas vacinas profiláticas foi: HPV 16 - 12,0%, HPV 18 - 2,3% e HPV 6+11 - 4,3%. Os tipos de alto risco de HPV foram encontrados em 133 (44,2%) mulheres, enquanto 43 delas (14,3%) apresentaram somente tipos de HPV de baixo risco. Cento e duas mulheres (33,9%) foram positivas para apenas um tipo de HPV; entretanto, 43 (14,3%) apresentaram dois tipos, e 31 (10,3%) apresentaram três ou mais tipos virais. A análise multivariada revelou que somente a idade (p=0,020) e o hábito de fumar (p <0,001) foram fatores de risco independentemente associados com a infecção por HPV. Conclusões: Essas adolescentes e jovens primíparas apresentaram elevada prevalência de infecção genital por tipos de alto risco do HPV, mostrando que constituem um grupo de risco para o desenvolvimento de câncer cervical. Contudo, apenas 17,3% apresentaram pelo menos um dos quatro tipos virais presentes na vacina quadrivalente (HPV 6, 11, 16 ou 18), 13,3% apresentaram infecção pelos tipos HPV 16 ou 18, e somente 1,0% apresentou concomitantemente infecção por esses dois tipos virais de alto risco presentes nas vacinas. Portanto, esse estudo indica que a grande maioria dessas jovens primíparas poderia ainda se beneficiar da imunização (catch-up) contra o HPV e constitui um grupo que deve ser alvo de programas efetivos de prevenção primária e secundária para o câncer cervical / Introdution: Genital infection by human papillomavirus (HPV) is a necessary factor in the development of cervical cancer. Vaccines to prevent infection by high risk HPV genotypes 16 and 18 were developed and ideally should be administered before exposure to HPV through sexual contact. Variations in HPV prevalence in different populations and of specific HPV types could affect vaccine recommendations in different settings. Vaccination after first delivery could be a potential strategy for reaching healthy young women depending on the baseline prevalence of high risk genotypes 16 and 18 in this target group. Objectives: The main objective of this study was to determine genital type specific HPV DNA prevalence and selected risk factors associated with HPV infection after the delivery of the first child among young women in a public maternity. Methods: This cross-sectional study was carried out at Hospital Maternidade Leonor Mendes de Barros (HMLMB), one of the largest public maternity hospitals in Sao Paulo. During June 2006 to February 2007, 301 primiparous women aged 15-24 years, who gave birth at that hospital, were included in the study between 43 and 60 days after delivery. Detection of HPV DNA in cervical specimens was performed using a standardized polymerase chain reaction (PCR) protocol with PGMY09/11 primers. To estimate the association of HPV infection with selected risk factors, prevalence ratios (PR) and 95% confidence interval [CI] were estimated using a Generalized Linear Model (GLM) with binomial distribution and log link function. Results: Any HPV DNA was detected in 58.5% (95% CI 52.7%-64.0%) of the enrolled young women. Most common types of HPV found were: HPV16, HPV51, HPV52, HPV58 and HPV71. The overall prevalence of HPV types targeted by the HPV prophylactic vaccines was: HPV16 - 12.0%, HPV18 -2.3% and HPV 6+11- 4.3%. High-risk HPV types were found in 133 (44.2%) women, whereas 43 women (14.3%) had only low-risk HPV types. One hundred and two women (33.9%) were positive for one HPV type only; however, 43 (14.3%) had two types, and 31 (10.3%) had three or more types detected. The multivariate analysis revealed that only age (p for trend =0.020) and smoking habits (p <0.001) were risk factors independently associated with HPV infection. Conclusions: These adolescents and young primiparous women had high cervical HPV prevalence, suggesting that this is a high risk group for cervical cancer development. Nevertheless, 17.3% were positive to any of the four HPV types included in HPV vaccines (HPV6, 11, 16 or 18), with 13.3% positive for HPV 16 or 18, and only 1.0% of them had both vaccine related oncogenic HPV types. Thus, this study supports that the most part of young primiparous women could benefit from catch-up HPV vaccination, and represents a target group for effective primary and secondary cervical cancer prevention programs
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Análise molecular de papilomavírus canino identificado em cães naturalmente infectados no estado de Sergipe - Brasil / Molecular analysis of canine papillomavirus identified in naturally infected dogs from Sergipe state - BrazilReis, Jordana Dantas Rodrigues 27 June 2017 (has links)
The papillomatosis is an infectious disease caused by papillomaviruses which
belongs to the Papillomaviridae family. In dogs, Canis familiaris papillomavirus
(CPV) species is the causative agent of the disease and it has so far twenty
identified types. These viruses can lead to benign neoplastic lesions of the skin
and mucosal epithelium that are exophytic and endophytic papilloma and
pigmented plaques which may occur progression to carcinoma squamous cell
(SCCs) cancer. The pathogenicity of the virus related to the types, subtypes and
variants can influence deafferents lesions on the animal. Thus, there is a need to
identify and characterize the existing virus to a better understanding of the disease
and adoptions of both preventive measures as treatment. In this study, the general
objective is to analyze the genetic diversity of canine papillomavirus present in
infected dogs in the state of Sergipe - Brazil. We used diagnostic strategies for the
identification of canine papillomavirus; wherein the histopathology was used to the
characterization of the lesion as papilloma and the PCR with electrophoresis for
confirm the viral DNA, then sequencing performed for subsequent genotyping of
samples and bioinformatics tools was used for analysis of the nucleotide and
amino acid sequences of the L1 gene. As a result, eighteen samples of possible
papillomatous lesions were collected and nine samples had the presence of CPV
DNA with oral and cutaneous exophytic lesions confirmed by histopathology. It
was possible observe in one sample the presence of oral SCCs. The Canine
papillomavirus type 1 (CPV1) was identified in nine samples of this study. Eight
samples were CPV1 variants with 100% identity with the already described
variants and one sample was identified as a new CPV1 variant having a difference
of 0.8% when compared with the reference sequence of the CPV1 L1 gene and a
difference of 0.2% with the existing CPV1 variant. The mutations of the variants
and the change in stability of the protein structure were analyzed and it was
observed that the V204A mutation of the new variant of isolate eight is highly
destabilizing with alteration of protein function. This study corroborates the
characterization of CPV1 as the main cause of oral papillomatosis in dogs,
observing the genetic variability of CPV1 with variants of different pathogenic
potentials, with a putative new variant associated with cancer with a mutation that
can destabilize the L1 protein structure of CPV1 altering its function. / A papilomatose é uma doença infecciosa causada pelos papilomavírus
pertencentes a família Papillomaviridae. Em cães, a espécie Canis familiaris
papilomavírus (CPV) é o agente etiológico da doença e possui até o momento
vinte tipos identificados. Estes vírus podem levar a lesões neoplásicas benignas
na pele e epitélio da mucosa, que são os papilomas exofíticos, endofíticos e as
placas pigmentadas, podendo ocorrer a progressão para o câncer carcinoma de
células escamosas (CCEs). A patogenicidade do vírus relacionada aos tipos,
subtipos e variantes pode influenciar diferentes tipos de lesões nos animais. Com
isso, percebe-se que há uma necessidade de identificar e caracterizar os vírus
existentes para um melhor entendimento da doença e adoções de medidas tanto
preventivas quanto de tratamento. Nesse estudo o objetivo geral é analisar a
diversidade genética de papilomavírus canino presentes em cães infectados no
estado de Sergipe - Brasil. Estratégias de diagnóstico foram utilizadas para a
identificação de papilomavírus canino, em que o exame histopatológico foi
utilizado para a caracterização da lesão e o PCR juntamente com a eletroforese
para a confirmação da presença do DNA viral, depois foi realizado o
sequenciamento para subsequente genotipagem das amostras e ferramentas de
bioinformática foram utilizadas para análise das sequências de nucleotídeos e
aminoácidos do gene L1. Como resultado, dezoito amostras de possíveis lesões
papilomatosas foram coletadas, nove amostras tiveram a presença do DNA de
CPV, com lesões exofíticas orais e uma cutânea, confirmadas pelo
histopatológico. Foi possível observar na amostra oito a presença de CCEs oral.
O CPV1 foi identificado em nove amostras deste estudo. Oito amostras eram
variantes de CPV1 com 100% de identidade com uma variante já descrita e uma
amostra foi identificada como uma nova variante de CPV1, possuindo uma
diferença de 0,8% quando comparada com a sequência do gene L1 de referência
de CPV1 e uma diferença de 0,2% com a variante já existente de CPV1. As
mutações das variantes e a alteração na estabilidade da estrutura proteína foram
analisadas e pôde-se observar que a mutação V204A da nova variante do isolado
oito é altamente desestabilizadora com alteração de função da proteína. Esse
estudo corrobora com a caracterização do CPV1 como o principal causador da
papilomatose oral em cães, observando-se a variabilidade genética de CPV1 com
variantes de diferentes potenciais patogênicos, com uma putativa nova variante
associada ao câncer com uma mutação que pode desestabilizar a estrutura
proteica de L1 de CPV1 alterando sua função. / São Cristóvão, SE
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Potencial vacinal de proteínas recombinantes do capsídeo de papilomavírus humano. / Vaccine potential of recombinant proteins of human papillomavirus capsid.Sakauchi, Dirce 04 February 2016 (has links)
O câncer cervical é a consequência mais séria da infecção por Papilomavírus humano - HPV, constituindo uma das principais causas de morte entre mulheres no mundo, remetendo a um importante desafio para a saúde pública mundial. Desenvolvemos a produção de VLPs contendo as proteínas L1 e L2 de HPV16, utilizando células epiteliais humanas 293-F em suspensão e em meio isento de soro fetal bovino. As células possuem metabolismo intenso, adequado para a expressão de proteínas heterólogas. Apresentam vantagens como a facilidade de cultivo, transfecção e ocorrência de processos como a glicosilação de proteínas, fosforilação, formação de pontes dissulfeto e outras modificações pós-traducionais essenciais para a função das proteínas, facilitando a produção similar às condições in vivo. O sistema de produção de VLPs L1L2 de HPV16 foi estabelecido de maneira eficiente, em células epiteliais humanas em suspensão e com resultados promissores, podendo contribuir para o desenvolvimento de uma vacina profilática de amplo espectro de proteção, com custo reduzido de produção. / Cervical cancer is the most serious consequence of infection by human papillomavirus - HPV, constituting one of the leading causes of death among women worldwide that points to a major challenge to global public health. We have developed the production of VLPs containing L1 and L2 proteins of HPV16, using human epithelial cells 293-F suspended in medium without fetal bovine serum. The cells have intense metabolism, suitable for expressing heterologous proteins. Present advantages such as ease of culture, transfection and occurrence of processes such as protein glycosylation, phosphorylation, formation of disulfide bonds and other essential post-translational modifications to protein function, facilitating the production similar to the conditions in vivo. The VLPs L1L2 of HPV16 production system was established efficiently in human epithelial cells in suspension and with promising results, which may contribute to the development of a prophylactic vaccine broad protection spectrum with reduced production cost.
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Papel do metabolismo de tumores associados ao papilomavírus humano na modulação do fenótipo de macrófagos humanos. / The role of HPV-associated tumor metabolism on human macrophage phenotype.Stone, Simone Cardozo 07 October 2016 (has links)
O lactato, produto do metabolismo alterado das células tumorais, possui papel na modulação de fenótipo supressor em células imunes. Macrófagos são uma das principais células do microambiente tumoral, sendo pró-tumorais em câncer cervical. O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito do lactato no fenótipo de macrófagos associados a células tumorais derivadas de câncer cervical. Linhagens celulares positivas e negativa para HPV foram utilizadas para formação de esferoides tumorais, os quais receberam monócitos de doadores saudáveis para diferenciação em macrófagos. Macrófagos cultivados com linhagens tumorais positivas para HPV apresentaram fenótipo misto e pró-tumoral, enquanto os cultivados com a linhagem negativa, um fenótipo mais anti-tumoral. A inibição da enzima lactato desidrogenase, nas células tumorais, promoveu diferentes efeitos no fenótipo dos macrófagos, dependendo do tipo celular a que estavam associados. Essas alterações diminuíram o aspecto pró-tumoral desses macrófagos, que induziram maior proliferação de linfócitos T e morte de células tumorais. / The lactate, product of the altered metabolism of tumor cells, is associated with the induction of a suppressor phenotype in immune cells. Macrophages are one of the major cells of the tumor microenvironment, and are pro-tumor in cervical cancer. The aim of this study was to evaluate the effect of lactate in the phenotype of macrophages associated with tumor cells derived from cervical cancer. HPV positive and negative cell lines were used for formation of tumor spheroids, which received healthy donor monocytes to differentiate into macrophages. Macrophages cultivated with HPV positive tumor cell lines presented a mixed and pro-tumor phenotype, while macrophages cultivated with the HPV negative cell line, a more anti-tumor phenotype. Inhibition of lactate dehydrogenase in the tumor cells promoted different effects on macrophages phenotype, depending on the cell type that they were associated. These changes decreased the pro-tumor property of macrophages, which were able to induced T cell proliferation and tumor cell death.
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Estar infectada com papilomavírus humano: vivências das mulheres e necessidades de cuidado / To be infected with human Papillomavirus: women lives and their necessities of careCestari, Maria Elisa Wotzasek 22 October 2010 (has links)
O Papilomavírus humano (HPV) é um vírus, sexualmente transmissível, com potencialidade carcinogênica para a cérvice uterina, o que torna a infecção de mulheres pelo HPV um problema de saúde pública. Conhecer as necessidades de cuidado de mulheres infectadas pelo HPV inclui também saber suas experiências vividas durante o processo de infecção. A prevenção de doenças e a promoção de saúde ainda estão determinadas por concepções tradicionais da prática médica. É necessário pensar em um cuidado que vá além das necessidades físicas, emocionais e sociais que considere o sujeito com base em seu modo de ser no mundo e que valorize suas experiências, juntamente com suas crenças e valores. O objetivo deste estudo foi compreender a vivência das mulheres infectadas pelo HPV e conhecer quais são suas necessidades de cuidado. Tratou-se de um estudo qualitativo, com referencial da Fenomenologia existencial de Martim Heidegger. Os sujeitos foram 14 mulheres que tinham recebido o diagnóstico de HPV. As questões norteadoras foram: Como é para você estar com HPV? Conte-me sua experiência desde que soube do diagnóstico até hoje. Como está sendo a assistência que você tem recebido? Como resultado, emergiram quatro unidades temáticas: ser-aí mulher com HPV; ser-com nas relações; buscando o cuidado como solicitude e o caminho de transcendência da mulher com HPV. O referencial utilizado possibilitou melhor apreensão dos significados de estar com HPV, assim como o compartilhamento da vivência dessas mulheres em seu cotidiano. Constatou-se a necessidade de implementar ações de promoção e prevenção à saúde, que devem ser executadas por profissionais capacitados e com um perfil adequado para atenção à mulher. As mulheres devem ser encorajadas a demonstrarem suas próprias necessidades de cuidado, e as questões culturais e de gênero devem ser consideradas. É preciso que os profissionais da área da saúde avancem no cuidado com as mulheres infectadas pelo HPV, superando o trabalho restrito à racionalidade das ciências biomédicas. A informação sobre o HPV deve ser compartilhada pelas mulheres, respeitando-se suas necessidades e seu nível de compreensão. É necessário um cuidado mais efetivo e afetivo, no qual as mulheres infectadas pelo HPV exerçam um papel ativo no processo do cuidado e as interações sejam verdadeiras. / The human Papillomavirus (HPV) is a virus, sexually transmittable, with potentiality carcinogenic for the uterine cervix, making women\'s infection by the HPV a problem for the public health. To know the necessities of care of women infected by the HPV includes also knowing their experiences during the process of infection. Diseases prevention and health promotion are still determined by traditional conceptions of medical practice. It is necessary to think about a care that goes besides the physical, emotional and social necessities, that considers the individual based on of her way of being in the world and considers her experiences, beliefs and values. The objective of this study was to understand the life experience of the women infected by the HPV and to know their necessities of care. This research have had a qualitative focus, with reference to the Existential Phenomenology by Martim Heidegger. Were subjected to this research 14 women HPV positive. The research was based on these questions: What does being HPV positive mean for you? Tell me the experience that you have had since you have known you were infected until today. How is the aid that you have been receiving? As result, four thematic topics surfaced: to be there a woman with HPV; to be a woman with HPV in relationships; looking for care as solicitude and the way of transcendence of the woman with HPV. The used referential made possible a better apprehension of the meanings of being with HPV, as well as the share of the existence of these women in their daily life. The necessity of implementing health promotion and prevention actions was noted, and these actions must be executed by enabled professionals with a profile adapted for attention to the woman. The women must be encouraged to demonstrating their necessities of care themselves and questions of culture and of gender must be considered. It is necessary that professionals of the health area keep advancing in the care of women infected by the HPV, surpassing the work limited to the rationality of biomedical sciences. The information on the HPV must be shared by the women, respecting their necessities and their level of understanding. It is necessary a more effective and affectionate care, in which the women infected by the HPV play an active part in the process of the care and the interactions are true.
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Estudo de células dendríticas, expressão das citocinas TNF-alfa, IFN-gama e IL-10 e da molécula de adesão E-caderina em lesões vulvares induzidas pelo papilomavírus humano / Study of dendritic cells, cytokines TNF-alpha, IFN-gamma and IL-10 and the adhesion molecule E-cadherin in vulvar lesions induced by human papillomavirusPereira, Naiura Vieira 14 April 2009 (has links)
INTRODUÇÃO: O papilomavírus humano (HPV) é o agente mais frequentemente encontrado em doenças sexualmente transmissíveis e é responsável por cerca de 40% dos cânceres vulvo-vaginais. Esse trabalho abordou a resposta imune em lesões vulvares, considerando-se as células dendríticas CD1a+, FXIIIa+ e S-100+, citocinas TNF-, IFN- e IL-10 e a molécula de adesão E-caderina. MÉTODOS: Foram utilizadas 49 lesões de vulva pelo HPV (condiloma acuminado, NIV-I, NIV-II e NIV-III) e 11 bióspias com diagnóstico de vulvite crônica inespecífica. Foram constituídos quatro grupos: lesões de baixo grau (condiloma e NIV I), lesões de alto grau (NIV II e III), vulvites inespecíficas e pele normal. A detecção das células, citocinas e E-caderina foi feita através de método imuno-histoquímico. RESULTADOS: As células de Langerhans (CD1a+) estavam distribuídas em todo o epitélio, sobretudo nas camadas suprabasal e espinhosa. Não diferiram entre os grupos de lesões HPV+, mas estavam diminuídas em número e tamanho quando comparadas à pele normal (p<0.0001). As células S-100+ ou FXIIIa+ estavam localizadas em toda a extensão do estroma, sem diferença estatística entre as lesões pelo HPV. Embora os DDFXIIIa+ estivessem aumentados em tamanho nas lesões de vulva, seu número não diferiu da pele normal. Não se observou diferenças numéricas das células S-100+ entre os grupos de lesão e pele normal. Foi possível detectar maior número de DDFXIIIa+ sobre as células S-100+ no grupo de lesões de baixo grau (p = 0,0008) e de alto grau (p = 0,0031). As citocinas foram detectadas em pequenas quantidades nos grupos de lesões, porém sem diferença estatística. Para a análise da expressão de e-caderina, o grupo de vulvites crônicas inespecíficas foi utilizado como controle. Em 91.0% das vulvites inespecíficas foi observado padrão homogêneo e difuso da expressão de e-caderina na camada espinhosa baixa e média. Ambos os grupos de lesões HPV+ exibiram padrões semelhantes de expressão de e-caderina, com marcação difusa ou focal na camada espinhosa baixa e média. Não houve imuno-reatividade nas áreas de displasias. Como resultado da reação de dupla-marcação, feita através da utilização da hibridização in situ para detecção do DNA do HPV e imunohistoquímica para DDFXIIIa+, foi possível identificar antígenos virais no citoplasma dessas células. CONCLUSÕES: o HPV interfere na expressão das células de Langerhans, pois estas estavam diminuídas, com morfologia alterada em relação à pele normal; os DDFXIIIa+ apresentam-se aumentados em número sobre as células S-100+, o que poderia refletir um mecanismo local compensatório contra o HPV; as lesões de baixo e alto grau não apresentam diferenças significativas quanto à densidade de células expressando TNF-, IFN- e IL-10, embora TNF- predomine entre as três citocinas; há uma correlação positiva entre os DDFXIIIa+ e a expressão de TNF-, o que poderia ser explicado por sua capacidade em produzir tal citocina a partir de um provável estímulo desencadeado pelo HPV; o HPV influencia na expressão de E-caderina na vulva, com destaque para a ausência de expressão nas áreas de displasia; o DNA do HPV encontrado no interior dos DDFXIIIa+ aliado às alterações na morfologia celular, a sobreposição destas sobre as células S-100+ e a relação encontrada com a citocina TNF-, nos permitem sugerir que os DDFXIIIa+ têm um papel importante como células apresentadoras de antígeno frente à infecção pelo HPV. / INTRODUCTION: The human papillomavirus (HPV) is the most frequent agent in sexually transmitted diseases and is responsible for almost 40% of vulvovaginal cancer. We studied the immune response in vulvar lesions, considering the CD1a+, FXIIIa+ and S-100+ dendritic cells, TNF-, IFN- and IL-10 cytokines and the adhesion molecule E-cadherin. METHODS: We used 49 vulvar lesions mediated by HPV (condylomata acuminata, VIN-I, VIN-II e VIN-III) and 11 biopsies diagnosed as chronic non-specific vulvitis. Four groups were formed: low-grade lesions (condylomata and VIN-I), high-grade lesions (VIN-II and III), non-specific vulvitis and normal skin. The detection of cells, cytokines and e-cadherin was performed by immunohistochemistry reaction. RESULTS: Langerhans cells (CD1a+) were distributed through epithelia, mainly in suprabasal and spinous layer. They did not differ between HPV groups, but were decreased in number and size when compared to normal skin (p<0.0001). The S-100+ ou FXIIIa+ cells were distributed through stroma and did not differ between HPV lesions. Although the FXIIIa+DD were increased in size in vulvar lesions, their number did not differ from normal skin. The S-100+ cells did not differ in number between the groups of lesions and normal skin. We detected an increased number of FXIIIa+DD over S-100+ cells in the group of low-grade (p = 0.0008) and high-grade lesions (p = 0.0031). The cytokines were detected in small quantities in both the lesions groups, with no statistical difference. The group of chronic non-specific vulvitis was used as control group to analyse the expression of e-cadherin. 91.0% of non-specific vulvitis presented a homogeneous and diffuse pattern of expression in spinous layer Both the HPV+ groups of lesions presented similar patterns of e-cadherin expression, with a focal or diffuse localization in spinous layer. The dysplastic epithelium did not present immunoreactivity. As a result of the double-staining, using in situ hibridization to detect DNA of HPV and immunohistochemistry to FXIIIa+DD, it was possible to observe viral antigens in the cytoplasm of such cells. CONCLUSIONS: The HPV interfere with the expression of Langerhans cells, since they were decreased when compared to the normal skin; the FXIIIa+DD were increased in number over S-100+ cells, suggesting a local compensatory mechanism against the HPV; the low and high grade lesions did not differ in the number of cells expressing TNF-, IFN- and IL-10, although TNF- predominate among the three cytokines; there is a positive correlation between the FXIIIa+DD and the expression of TNF- that could be explained by their role as TNF-producing cells following a stimulus of HPV; the HPV changes the expression of E-cadherin in vulvar lesions, mainly in dysplastic epithelium; HPV DNA visualized in the cytoplasm of FXIIIa+DD and the cellular morphological changes, the increased number over S-100+ cells and the correlation with TNF-, allow us to suggest that FXIIIa+DD play an important role as antigen presenting cells in the infection by HPV.
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