Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-23T15:49:15Z No. of bitstreams: 1 Wagner Rogerio Leocadio Soares Pessoa.pdf: 1202325 bytes, checksum: 24359deb95d67f77dc4011b48213d142 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T15:49:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Wagner Rogerio Leocadio Soares Pessoa.pdf: 1202325 bytes, checksum: 24359deb95d67f77dc4011b48213d142 (MD5) Previous issue date: 2005-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The banana is the second largest fruit more consumed in the world, being the fresh fruit that detain the largest market. Brazil blunts as second largest producer of the fruit. In Brazil the varieties Silver and Pacovan approximately 60 % of the cultivate area. However, several phytopathological factors such as fungi and bacteria can cause the banana crop losses that could reach up to 40 %. Among these factors, anthracnose caused by Colletotrichum musae, deserve special attention in harming the commercialization and the consumption in natura. Because of the importance of this disease in banana and the lack of information on the subject, this work had two objectives: 1) study the influence of inoculation methods, different temperatures associates to different wetness period on the development of the disease; 2) verify alterations physicalchemistry happened in the banana fruits. The fruits were inoculated with 17 isolated of C. musae in two ways using PDA disk containing structures of the pathogen and suspension of conidia 4x 106 conidia / mL. The banana fruits were inoculated with the pathogen in the presence or not of artificial wounds. All C. musae isolates were pathogenic independently of the inoculation method used. Lesions could be observed in artificially wounded fruits independently of the inoculation method used (disk and suspension). In order to access the influence of temperature and wetness period, the isolates MAG2, SFV1 and FSA of C. musae were used isolated. These isolates were chosen because they show a wide rage of aggressiveness in the pathogenicity test. The bananas fruits were inoculated and incubated in the temperatures of 10, 15, 20, 25 and 30 oC with periods of wetness of 0, 12, 24 and 36 h, during five days. Temperatures of 20, 25 and 30 oC and with increasing wetness periods favored the development of lesions. Largest lesions wereobserved in the temperatures around 25 to 30 oC and 36 h of wetness period. Several physicalchemical alterations could be observed in the fruits during thexperiment: 1) there was an increase in the banana fruit humidity as the temperature and the wetness period increased, 2) They reach its highest pH value at 30 oC independently of the wetness period, 3) The largest ATT for the isolates SFV and MAG occurred at the same temperature of 25 oC, with wetness period of 12 and 24 h, respectively. The largest ATT value for the isolate FSA occurred at the temperature of 15 oC associated to the wetness period of 36 h, 4) Maximum SST occurred at temperature around 20 oC independent of the wetness period, 5) The largest potassium levels was reach at the temperature of 10 oC with wetness period of 24 h for SVF and MAG and without wetness period in FSA, 6) The total sugars content increased with the elevation of the temperature, decrease as the temperature approached of 30 oC, independent of the wetness period and the isolated of C. musae used. / A banana é a segunda fruta mais consumida no mundo, sendo (a fruta fresca neste contexto detentora de maior mercado no mundo) o Brasil segundo maior produtor, utilizando as variedades Prata e Pacovan em aproximadamente 60% de sua área cultivada. Entretanto, diversos fatores podem ocasionar perdas na produção, podendo chegar à ordem de 30 a 40%. Entre estes fatores encontram-se fungos e bactérias, merecendo destaque especial na pós-colheita a antracnose, causada por Colletotrichum musae, prejudicando a comercialização e o consumo in natura. Diante da importância desta doença na banana e a carência de informações sobre o assunto, este trabalho teve por objetivos, estudar a influência de métodos de inoculação, diferentes temperaturas associadas a distintos períodos de molhamento sobre o desenvolvimento da doença, e sua influência nas características físicoquímica. Avaliaram-se 17 isolados de C. musae, utilizando-se dois tipos de inóculo: disco de meio BDA contendo estruturas do patógeno e suspensão de conídios 4x106 conídios/mL, em duas formas de inoculação: com e sem ferimentos. Todos os isolados de C. musae mostraram-se patogênicos independente do tipo de inóculo utilizado. As lesões ocorreram nas frutas com ferimento, independente do tipo de inóculo (disco e suspensão). Para o estudo da influência da temperatura e período de molhamento, utilizaram-se três isolados do patógeno MAG2, SFV1 e FSA, por mostraram-se mais agressivo, intermediário e menos agressivo, respectivamente, no teste de patogenicidade. Asfrutas foram inoculadas e incubadas nas temperaturas de 10, 15, 20, 25 e 30oC e períodos de molhamento de 0, 12, 24 e 36 h, por cinco dias. As temperaturas em torno de 20, 25 e 30oC independente do período de molhamento favoreceram um maior desenvolvimento de lesões. As alterações físico-química mostraram que houve um aumento de umidade da fruta à medida que a temperatura e o período de molhamento aumentavam. Valores mais elevados de pH ocorreram em torno da temperatura de 30oC, independente do período de molhamento. Em relação a Acidez Titulável Total (ATT) para o isolado SFV1 e MAG2 ocorreu na temperatura ao redor de 25oC, com período de molhamento de 12 e 24 h, respectivamente, e para o isolado FSA ocorreu ao redor da temperatura de 15oC associado ao período de molhamento de 36 h. O teor de Sólidos Solúveis Totais (SST) ficou em volta de 20oC independente do período de molhamento. A temperatura ao redor de 10oC favoreceu a elevação no nível de potássio das frutas, associado ao período de molhamento de 24 h, em frutas inoculadas com os isolados SVF1 e MAG2, e 0 hora quando utilizou-se o isolado FSA. Os teores de açúcares totais aumentaram com a elevação da temperatura, declinando à medida que esta se aproximava de 30oC, independente do período de molhamento e isolados de C. musae.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-24T12:05:27Z No. of bitstreams: 1 Maria Angelica Guimaraes Barbosa.pdf: 669568 bytes, checksum: 979d77dd70ce88a66e50ee1f5eea5d0d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T12:05:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Angelica Guimaraes Barbosa.pdf: 669568 bytes, checksum: 979d77dd70ce88a66e50ee1f5eea5d0d (MD5) Previous issue date: 2006-03-14 / Cotton is the higher economically important plant fiber producer, however yield can be seriously reduced by ramulosis, caused by the fungus Colletotrichum gossypiivar. cephalosporioides, for that the main control management practice is the use of resistant cultivars. In the present work, it was assessed resistance to ramulose of cotton lines, the induction of resistance by chemical inducers, the activity of enzymes involved in the defense response and the physiological cost of induced resistance in cotton. The resistance evaluation to ramulosis of 34 cotton lines was performed on the basis of epidemiological components, initial disease index (IDI), final disease index (FDI), disease progress rate (DPR) and area under the disease progress curve (AUDPC). It was verified, also, the effect of disease resistance inducers acibenzolar-S-methyl (ASM), Agro-Mós® (AM) and sodium silicate (Si) in the cotton cultivars CNPA GO 2000 – 1256 (intermediate resistant) and CNPA GO 2002 – 7997 (susceptible). The inducers ASM and AM were sprayed 5 and 10 days before inoculation of the pathogen, by foliarspray, while Si was mixed to the susbstract. At 24 days after inoculation, plants were assessed for disease index (DI), AUDPC and percent control (PC). ASM and AM were also tested using three doses of each inducer and determined the activity of -1,3- glucanase, peroxidase and phenilalanine ammonia lyase (PAL), at five and ten days after inoculation of the pathogen. The physiological cost of induced resistance was assessed on the basis of plant response to the inducers ASM, AM and jasmonic acid (JA) in substracts fertilized with two levels of nitrogen. Plants were assessed for plant height (PH), internode length (IL), shoot fresh biomass (SFB), root fresh biomass (RFB), shoot dry biomass (SDB) and root dry biomass (RDB). It was also determined the activity of the enzymes PAL and peroxidase. The line CNPA GO 2002 – 7997 showed high susceptibility to disease, with higher FDI. It was obtained significative(P=0,05) correlations between the variables IDI, FDI and AUDPC. The analysis of Euclidian distance by UPGMA allowed the separation of lines in two groups, one of them, composed only by line CNPA GO 2002 – 7997, and all the others grouped in asecond one. It was not observed influence of the time of inducers treatment. Line CNPA GO 2000 – 1256 displayed lower DI for all disease resistance inducers compared to the control. The variable AUDPC did not present interaction between period, cultivar and inducer, although all inducers were significantly different from control. In general, no significantly difference could be detected among doses and control. It was verified the activity of -1,3-glucanase and peroxidase at 10 DAE. CNPA GO 2002 – 7997 showed considerable increase in -1,3-glucanase, while peroxidase activities only ASM- D1 to CNPA GO 2002 – 7997 and ASM- D3 to CNPA GO 2000 – 1656 showed significantly difference from control and increase enzymatic activity. No increase in PAL activity could be detected. ASM produced control of ramulose in cotton, increasing the levels of enzymes involved in the plant defense response, however showed high physiological cost, with accentuated reduction in PH, SFB and SDBfollowed by a higher activity of peroxidase. / O algodão é o produto de maior importância econômica do grupo das fibras, porém a produção pode ser seriamente reduzida pela ramulose, doença causada pelo fungo Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides, que tem como principal medida de controle a utilização de cultivares resistentes. No presente estudo, avaliou-se a resistência de linhagens de algodoeiro à ramulose, a indução de resistência por indutores químicos, a atividade de enzimas envolvidas na resposta de defesa e o custo fisiológico da resistência induzida na planta. A avaliação da resistência de 34 linhagens de algodoeiro à ramulose foi realizada com base nos componentes epidemiológicos, índice de doença inicial (IDI), índice de doença final (IDF), taxa de progresso da doença (TPD) e área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Foi verificado o efeito dos indutores acibenzolar-S-metil (ASM), Agro-Mós® (AM) e silicato de sódio (Si) nas linhagens de algodoeiro CNPA GO 2000 – 1256 (resistência intermediária) e CNPA GO 2002 – 7997 (suscetível). Os indutores ASM e AM foram aplicados 5 e10 dias antes da inoculação do patógeno, através de pulverização foliar, enquanto Si foi incorporado ao substrato. Aos 24 dias após a inoculação, as plantas foram avaliadas quanto ao índice de doença (ID). ASM e AM foram avaliados também, utilizando três dosagens de cada indutor e determinada a atividade de -1,3-glucanase, peroxidase e fenilalanina amônia liase (PAL), aos cinco e dez dias após a inoculação do patógeno. Ocusto fisiológico da resistência induzida foi avaliado com base na resposta das plantas aos indutores ASM, AM e ácido jasmônico (AJ) em substratos com dois níveis de nitrogênio. As plantas foram avaliadas quanto à altura (AP), comprimento de internódio (CI), biomassa fresca da parte aérea (BFPA), biomassa fresca da raiz (BFR), biomassaseca da parte aérea (BSPA) e biomassa seca da raiz (BSR). Também foi determinada a atividade das enzimas PAL e peroxidase. A linhagem CNPA GO 2002 – 7997 é altamente suscetível à doença, com o maior IDF. Foram constatadas correlações significativas (P=0,05) entre as variáveis IDI, IDF e AACPD. A análise da distância Euclidiana por UPGMA permitiu a separação das linhagens em dois grupos, um dos quais, formado apenas pela linhagem CNPA GO 2002 – 7997, e o outro grupo pelas demais linhagens. Não foi observada influência da época de aplicação dos indutores. A linhagem CNPA GO 2000 – 1256 apresentou menor ID para todos os indutores em relação à testemunha. A variável AACPD não apresentou interação entre época, cultivar e indutor, embora todos os indutores tenham diferido significativamente da testemunha. De maneira geral, não houve diferença significativa entre dosagens de indutores e testemunha. CNPA GO 2002 – 7997 apresentou considerável aumento na atividade de -1,3-glucanase quando tratadas com os indutores, enquanto na atividade de peroxidase apenas ASM- D1 para CNPA GO 2002 – 7997 e ASM- D3 para CNPA GO 2000 – 1256 diferiram da testemunha, aumentando significativamente a atividade enzimática. Não houve aumento na atividade de PAL. No geral, ASM proporcionou o controle da ramulose do algodoeiro, aumentando os níveis de enzimas envolvidas na resposta de defesa da planta, porém apresentou alto custo fisiológico, com acentuada redução na AP, BFPA e BSPA acompanhada de maior atividade de peroxidase.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T11:47:52Z No. of bitstreams: 1 Nelson Bernardi Lima.pdf: 1199005 bytes, checksum: e9e20cedc57b8c67aeeb8980dcfd13fb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T11:47:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nelson Bernardi Lima.pdf: 1199005 bytes, checksum: e9e20cedc57b8c67aeeb8980dcfd13fb (MD5) Previous issue date: 2013-02-20 / Colletotrichum species are the most important and widespread form of decay affecting mango fruit worldwide. In this study, Colletotrichum species associated with fruit anthracnose isolated from mango in northeastern Brazil were subject to molecular and morphological analyses, epidemiology and sensitivity to fungicide. The partial sequence of the glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GPDH) gene of 143 Colletotrichum isolates was amplified, as an initial measure of genetic diversity. A subset of 47 isolates, selected to represent the range of genetic diversity and geographic origin, were further sequenced using the partial actin (ACT), β-tubulin (TUB2), calmodulin (CAL), glutamine synthetase (GS) genes and rDNA-ITS (ITS) region. Multilocus sequence analysis, together with a critical examination of the phenotypic characters, revealed four previously described species (Colletotrichum asianum, C. fructicola, C. tropicale and C. karstii) and one new species. The new species is introduced as Colletotrichum dianesii and formally described, illustrated and compared with similar taxa. Only C. asianum and C. karstii have previously been reported from mango, while the other species represent the first report associated with the mango fruits worldwide. In general, mango cultivars were susceptible to Colletotrichum species, although C. karstii did not infect the cultivars Keith and Palmer. The highest virulence of Colletotrichum species was observed in the cultivar Tommy Atkins. All Colletotrichum species were pathogenic to host range (mango, papaya, banana, guava and sweet pepper), which deserves attention in view of the existence of constant potential inoculum source. For all Colletotrichum species temperatures between 25 and 30° C provided the highest lesions, however it was found that the species have different thermal requirements for expressing the maximum virulence in fruits. All Colletotrichum species had reduced mycelial growth in the presence of fungicides methyl thiophanate and difenoconazole an azoxystrobin, regardless of the active principle. The sensitivity response varied with the fungicide and Colletotrichum species. / A antracnose causada por espécies de Colletotrichum é uma das doenças mais importantes da cultura da mangueira em todo o mundo. Neste estudo, espécies de Colletotrichum associadas à antracnose em frutas de mangueira, no nordeste do Brasil, foram coletadas e caracterizadas a partir de marcadores moleculares, morfologia, epidemiologia e sensibilidade a fungicidas. As sequências do gene gliceraldeído-3-fosfato-desidrogenase (GPDH), de 143 isolados de Colletotrichum, foram analisadas como uma primeira medida de diversidade genética. Um subgrupo de 47 isolados, selecionados para representar a gama de diversidade genética e origem geográfica, foram sequenciados usando os genes parcial actina (ACT), β-tubulina (TUB2), calmodulina (CAL), glutamina sintetase (GS) e genes rDNA- região ITS (ITS). A análise multilocus das sequências, juntamente com um exame crítico dos caracteres fenotípicos, revelou quatro espécies descritas anteriormente (Colletotrichum asianum, C. fructicola, C. tropicale e C. karstii) e uma nova espécie. A nova espécie foi introduzida como Colletotrichum dianesii e formalmente descrita e ilustrada. Apenas C. asianum e C. karstii tinham sido relatadas a partir de manga, enquanto as outras espécies representam o primeiro relato associado à antracnose em frutos de mangueira no mundo. De modo geral, as cultivares Tommy Atkins, Palmer e Keith foram suscetíveis as espécies de Colleotrichum. A menor virulência da maioria das espécies de Colletotrichum foi observada na cultivar Tommy Atkins. Todas as espécies de Colletotrichum foram patogênicas à gama de hospedeiros inoculada (manga, mamão, banana, goiaba e pimentão). Para todas as espécies de Colletotrichum as temperaturas entre 25 e 30°C proporcionaram lesões maiores, entretanto, foi comprovado que as espécies têm exigências térmicas diferentes para expressarem a máxima virulência em frutos. Todas as espécies de Colletotrichum apresentaram o crescimento micelial reduzido na presença dos fungicidas tiofanato metílico, difenoconazole e azoxistrobina. A resposta de sensibilidade variou de acordo com o fungicida e a espécie de Colletotrichum.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T13:09:48Z No. of bitstreams: 1 Rinaldo Malaquias Lima Filho.pdf: 461439 bytes, checksum: e026aba19b9815cd933e784e24d7b203 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T13:09:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rinaldo Malaquias Lima Filho.pdf: 461439 bytes, checksum: e026aba19b9815cd933e784e24d7b203 (MD5) Previous issue date: 2008-03-03 / Vários fungos causam doenças no maracujá-amarelo na fase de pós-colheita, principalmente Colletotrichum gloeosporioides que provoca lesões nas frutas, prejudicando a comercialização. Entre os métodos alternativos de controle de doenças pós-colheita a indução de resistência sistêmica com elicitores bióticos e abióticos é uma alternativa promissora, da mesma forma que a utilização do 1-metilciclopropeno (1-MCP) para a manutenção da qualidade do fruto e prevenção contra a antracnose. Este trabalho teve por objetivo verificar os efeitos dos indutores de resistência Agro-Mos (AGM), acibenzolar-S-metil (ASM) e Ecolife (ECL) em maracujá-amarelo contra a antracnose. Foram testados tempos de imersão de 5, 10, 15 e 20 min, assim como as dosagens de 0, 50, 100, 150, 200, 300 μL.L-1 para AGM e ECL, e de 0, 10, 30, 50, 80, 100 mg i.a.L-1 para ASM. Foi avaliado a incidência, severidade, atividade das PR–proteínas (β-1,3-glucanase, peroxidase, polifenoloxidase) e fatores físico-químicos(acidez total titulável (ATT), sólidos solúveis totais (SST) e pH) nas frutas tratadas. O índice de crescimento micelial e esporulação de Colletotrichum gloeosporioides foi determinado em placas de Petri contendo meio BDA e indutores de resistência nas dosagens supra citadas. Com a finalidade de verificar o efeito do 1-MCP sobre o desenvolvimento da antracnose e fatores físico-químicos, frutas sadias foram submetidas às concentrações de 0, 150, 300, 450 e 600 nL.L-1 durante 12 h, inoculadas com o patógeno e armazenadas durante sete dias à 25 ± 2 ºC. O delineamento foi inteiramente casualizado com quatro repetições e a unidade experimental foi composta por uma bandeja contendo 10 frutas. O tempo de imersão não influenciaram a incidência e severidade da antracnose. Os tratamentos AGM e ECL nas dosagens 50 e 100 μL.L-1 reduziram a incidência da antracnose para 85%, mas não influenciou a severidade dadoença. AGM, ASM e ECL foram eficientes na ativação das PR-proteínas causando acúmulo nas frutas tratadas. A maior atividade da β-1,3 glucanase foi detectada em ECL (100 μL.L-1), enquanto as enzimas peroxidase e polifenoloxidase apresentaram maior atividade em AGM (100 μL.L-1). As atividades enzimáticas descreveram perfil semelhante com expressivo acúmulo em torno das menores dosagens dos indutores, decrescendo, em seguida até o último nível testado. Os tratamentos AGM, ASM e ECL não causaram alteração nos teores de SST e pH, porém, AGM e ASM apresentaram redução significativa nos teores de ATT. No estudo do efeito do 1-MCP o crescimento micelial e esporulação foram influenciados diretamente pelos tratamentos com AGM e ECL. O tamanho das lesões foi inversamente proporcional às dosagens testadas, sendo menores com o aumento da concentração do produto. As maiores lesões ocorreram na testemunha (0 nL.L-1) 1,42 cm e a menor 0,77 cm nas frutas submetidas a maior concentração (600 nL.L-1). O desenvolvimento da doença foi menor nos tratamentos comas doses de 300, 450 e 600 nL.L-1. Não houve alteração no pH, no entanto, verificou-se aumento significativo de SST e ATT na polpa do maracujá tratados com 1-MCP quando comparados com a testemunha. / Vários fungos causam doenças no maracujá-amarelo na fase de pós-colheita, principalmente Colletotrichum gloeosporioides que provoca lesões nas frutas, prejudicando a comercialização. Entre os métodos alternativos de controle de doenças pós-colheita a indução de resistência sistêmica com elicitores bióticos e abióticos é uma alternativa promissora, da mesma forma que a utilização do 1-metilciclopropeno (1-MCP) para a manutenção da qualidade do fruto e prevenção contra a antracnose. Este trabalho teve por objetivo verificar os efeitos dos indutores de resistência Agro-Mos (AGM), acibenzolar-S-metil (ASM) e Ecolife (ECL) em maracujá-amarelo contra a antracnose. Foram testados tempos de imersão de 5, 10, 15 e 20 min, assim como as dosagens de 0, 50, 100, 150, 200, 300 μL.L-1 para AGM e ECL, e de 0, 10, 30, 50, 80, 100 mg i.a.L-1 para ASM. Foi avaliado a incidência, severidade, atividade das PR–proteínas (β-1,3-glucanase, peroxidase, polifenoloxidase) e fatores físico-químicos(acidez total titulável (ATT), sólidos solúveis totais (SST) e pH) nas frutas tratadas. O índice de crescimento micelial e esporulação de Colletotrichum gloeosporioides foi determinado em placas de Petri contendo meio BDA e indutores de resistência nas dosagens supra citadas. Com a finalidade de verificar o efeito do 1-MCP sobre o desenvolvimento da antracnose e fatores físico-químicos, frutas sadias foram submetidas às concentrações de 0, 150, 300, 450 e 600 nL.L-1 durante 12 h, inoculadas com o patógeno e armazenadas durante sete dias à 25 ± 2 ºC. O delineamento foi inteiramente casualizado com quatro repetições e a unidade experimental foi composta por uma bandeja contendo 10 frutas. O tempo de imersão não influenciaram a incidência e severidade da antracnose. Os tratamentos AGM e ECL nas dosagens 50 e 100 μL.L-1 reduziram a incidência da antracnose para 85%, mas não influenciou a severidade dadoença. AGM, ASM e ECL foram eficientes na ativação das PR-proteínas causando acúmulo nas frutas tratadas. A maior atividade da β-1,3 glucanase foi detectada em ECL (100 μL.L-1), enquanto as enzimas peroxidase e polifenoloxidase apresentaram maior atividade em AGM (100 μL.L-1). As atividades enzimáticas descreveram perfil semelhante com expressivo acúmulo em torno das menores dosagens dos indutores, decrescendo, em seguida até o último nível testado. Os tratamentos AGM, ASM e ECL não causaram alteração nos teores de SST e pH, porém, AGM e ASM apresentaram redução significativa nos teores de ATT. No estudo do efeito do 1-MCP o crescimento micelial e esporulação foram influenciados diretamente pelos tratamentos com AGM e ECL. O tamanho das lesões foi inversamente proporcional às dosagens testadas, sendo menores com o aumento da concentração do produto. As maiores lesões ocorreram na testemunha (0 nL.L-1) 1,42 cm e a menor 0,77 cm nas frutas submetidas a maior concentração (600 nL.L-1). O desenvolvimento da doença foi menor nos tratamentos comas doses de 300, 450 e 600 nL.L-1. Não houve alteração no pH, no entanto, verificou-se aumento significativo de SST e ATT na polpa do maracujá tratados com 1-MCP quando comparados com a testemunha.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-27T15:47:09Z No. of bitstreams: 1 Valeria Sandra de Oliveira Costa.pdf: 1029280 bytes, checksum: 7057060a8446db15d9f71e5c654fa2be (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T15:47:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valeria Sandra de Oliveira Costa.pdf: 1029280 bytes, checksum: 7057060a8446db15d9f71e5c654fa2be (MD5) Previous issue date: 2009-02-02 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Dieback and stem-end rot in trees and fruits of mango have constituted a serious problem for the agricultural regions of Brazil, and its etiology and control is still a challenge. In the first study, the diversity of isolates of Botryosphaeriaceae from plants and fruits of mango was evaluated in semi-arid region of Northeast Brazil. Morphological characteristics and DNA sequence (5.8 S rDNA, ITS-1 e ITS-2) were used to identify a species already known and to report the presence of two new species of Botryosphaeriaceae in this region. The three species of Botryosphaeriaceae were found always in their anamorphic stage: Botryosphaeria dothidea, Neofusicoccum parvum and Lasiodiplodia theobromae. This is the first occurrence of B. dothidea and N. parvum associated with dieback and stem-end rot on mango in Brazil.Botryosphaeria dothidea and N. parvum species were prevalent in the Vale São Francisco, while L. theobromae prevailed in the Vale Assú. When inoculated in mango fruits ‘Tommy Atkins’, L. theobromae and N. parvum showed to be moreaggressive if compared to B. dothidea. In the second study, it was evaluated the influence of humidity (0 and 72 h in moist chamber) and temperature (25, 30 and 35º C) in the severity of stem-end rot in fruits of mango and the susceptibility of fruits of species different (mango, papaya, avocado and banana) to the species of Botryosphaeriaceae associated with this disease. Mango fruits were inoculated with 15 isolates, five isolates of each of the three species of Botryosphaeriaceae. The humidity and temperature significantly influenced the severity of stem-end rot in fruits of mango. The fruits of mango inoculated with L. theobromae developed symptoms of stem-end rot regardless of the presence of a moist chamber and fruits of mango inoculated with B. dothidea and N. parvum showed symptoms only when they were exposed to a period of 72 h in a moist chamber. The greatest lesions caused by both L. theobromae and by N. parvum wereobserved in fruits kept at temperatures of 25 and 30 ºC. It was not observed thedevelopment of symptoms in the fruits inoculated with B. dothidea when they were maintained at the three temperatures evaluated during the evaluation period. The isolates of L. theobromae and N. parvum were pathogenic when inoculated in healthy fruit of mango, papaya, avocado and banana. The isolates of B. dothidea were not pathogenic on fruits of banana. / A morte descendente e a podridão peduncular em árvores e frutos de mangueira vêm se constituindo em um sério problema para as regiões agrícolas do Brasil, sendo o seu controle e etiologia ainda um desafio. No primeiro estudo, a diversidade de isolados de Botryosphaeriaceae de plantas e frutos de mangueira foi avaliada na região Semi-Árida do Nordeste do Brasil. Características morfológicas e seqüência de DNA (5.8 S rDNA, ITS-1 e ITS-2) foram usados para identificar uma espécie já conhecida e relatar a presença de duas novas espécies de Botryosphaeriaceae nesta região. As três espécies de Botryosphaeriaceae foram encontradas sempre em seu estádio anamórfico: Botryosphaeria dothidea, Neofusicoccum parvum e Lasiodiplodia theobromae. Essa é a primeira ocorrência de B. dothidea e N. parvum associados à morte descendente e podridão peduncular em mangueira no Brasil. Botryosphaeria dothidea e N. parvum foram asespécies prevalentes no Vale do São Francisco, enquanto L. theobromae prevaleceu no Vale do Assú. Quando inoculadas em frutos de mangueira ‘Tommy Atkins’, L. theobromae e N. parvum mostraram maior agressividade quando comparadas com B. dothidea. No segundo estudo, foi avaliada a influência da umidade (0 e 72 h de câmara úmida) e temperatura (25, 30 e 35ºC) na severidade da podridão peduncular em frutos de mangueira e a suscetibilidade de frutos de diferentes (manga, mamão, abacate e banana) às espécies de Botryosphaeriaceae associadas a esta doença. Os frutos de mangueira foram inoculados com 15 isolados, sendo cinco isolados de cada espécie de Botryosphaeriaceae. A umidade e a temperatura influenciaram significativamente a severidade da podridão peduncular em frutos de mangueira. Os frutos de mangueira inoculados com L. theobromae desenvolveram sintomas de podridão independente da presença de câmara úmida e os frutos de mangueira inoculados com B. dothidea e N. parvum apenas quando osmesmos foram expostos a um período de 72 h de câmara úmida. As maiores lesões causadas tanto por L. theobromae como por N. parvum foram observadas nos frutos mantidos nas temperaturas de 25 e 30 ºC. Não foi constatado o desenvolvimento de sintomas nos frutos inoculados com B. dothidea quando eles foram mantidos nas três temperaturas avaliadas durante o período de avaliação. Os isolados de L. theobromae e N. parvum foram patogênicos quando inoculados em frutos sadios de mangueira, mamoeiro, abacateiro e bananeira. Os isolados de B. dothidea só não foram patogênicos em frutos de bananeira.

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T16:13:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rincones_Johana_D.pdf: 3507237 bytes, checksum: b5905da7ffa8ea3a869dd3090e9a1d1f (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A Vassoura-de-Bruxa do cacaueiro constitui um patosistema complexo e até o momento não foi estabelecido um plano de controle efetivo na região produtora da Bahia. O objetivo principal deste trabalho foi aprimorar os conhecimentos sobre a interação C. perniciosa-Cacaueiro com informações referentes à: 1) tamanho e organização do genoma através da obtenção do cariótipo molecular do fungo; 2) variabilidade genética deste fitopatógeno a nível cromossômico na região produtora da Bahia; e 3) expressão gênica do fungo em presença de extratos do hospedeiro. O cariótipo molecular foi estabelecido por eletroforese em gel de campo pulsado. Esta mesma metodologia foi utilizada em combinação com análise tipo microsatélites para um estudo de variabilidade a nível cromossômico de 38 isolados provenientes de três biótipos e diferentes regiões geográficas. Para análise da expressão gênica foram seqüenciadas quatro bibliotecas de cDNA do fungo sob diferentes condições de cultivo e em diferentes estágios do desenvolvimento, incluindo uma biblioteca subtrativa obtida por SSH. Como resultados, apresentamos o cariótipo molecular de C. perniciosa e a existência de polimorfismos cromossômicos. A análise dos 38 isolados permitiu observar que o cariótipo do biótipo-C é estável ao longo do tempo e sua variabilidade na região da Bahia é baixa, mostrando assim a fragilidade do programa de melhoramento genético do cacaueiro na Bahia, onde os clones resistentes selecionados no campo foram desafiados contra apenas dois genótipos do patógeno. Com relação à análise da expressão do fungo, obtivemos 1427 unigenes e sua análise por similaridade com as bases de dados permitiu a identificação de diversos mecanismos pelos quais o fungo poderia estar manipulando o metabolismo da planta para seu benefício e em detrimento da produção de cacau. Assim, consideramos que a partir deste trabalho foi possível obter uma maior compreensão dos mecanismos utilizados por C. perniciosa no desenvolvimento da Vassoura-de-Bruxa em cacaueiro e estudos mais aprofundados, baseados nos resultados aqui obtidos, deverão auxiliar no desenvolvimento de estratégias de controle para esta importante doença / Abstract: Witches' broom disease of cocoa is a complex pathosystem that has evaded an efficient control program in the cacao-producing region of Bahia, Brazil. The main goal of this work was to acquire a better understanding of the C. perniciosa-Cacao interaction by providing new data regarding: 1) the size and organization of the fungal genome through molecular karyotyping; 2) the genetic variability of this phytopathogen at the chromosomal level in the cacao-producing region of Bahia; and 3) the gene expression of the fungus in the presence of host extracts. The molecular karyotype was obtained through pulsed-field gel electrophoresis. This same technique was applied in combination with microsatellite PCR analysis of 38 isolates from different biotypes and geographic regions in order to study the chromosomal-level genetic variability of this pathogen. For the gene expression analysis, four cDNA libraries of the fungus grown under different culture conditions and developmental stages, including a subtractive library using SSH, were sequenced and searched for similarities in the public databases. As results, we present the molecular karyotype of C. perniciosa and the existence of chromosome-length polymorphism. The analysis of the 38 isolates showed that the karyotype of the C-biotype is very stable in time and that the variability of the pathogen in Bahia is very low, thus indicating the fragility of the current cacao-breeding program in Bahia, where the resistant cacao clones selected in the field were challenged against only two different genotypes of the pathogen. With regards to the gene expression analysis, we obtained 1427 unigenes and the similarity searches allowed the identification of various mechanisms through which the fungus might be manipulating the metabolism of the plant for its own benefit and in detriment of cocoa production. Therefore, we consider that this work allowed us to acquire a better understanding of the molecular mechanisms used by C. perniciosa during witches' broom development in cacao and more detailed studies, based on the results presented here, might aid in the development of novel control strategies for this important disease / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T06:16:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Scarpari_LeandraMaria_D.pdf: 5130527 bytes, checksum: 37ee3077a3d859fb1da23df8ea1fa70c (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A doença vassoura-de-bruxa, provocada pelo fungo hemibiotrófico Crinipellis perniciosa, é uma das doenças mais importantes do cacaueiro, diminuindo drasticamente a produção e causando grandes prejuízos econômicos. Uma maior compreensão sobre a interação cacaueiro - C. perniciosa e sobre os processos que ocorrem na planta durante a progressão da doença é necessária para estabelecer novas estratégias de controle para a doença. O presente trabalho teve dois objetivos principais: 1) identificar as mudanças bioquímicas que ocorrem no cacaueiro durante o desenvolvimento da doença; 2) identificar os genes diferencialmente expressos no micélio biotrófico do fungo C. perniciosa cultivado in vitro, sendo este micélio o estágio do ciclo de vida do fungo que induz os sintomas da doença. Os resultados da caracterização bioquímica da doença, usando plântulas de cacau infectadas artificialmente, indicaram uma elevação inicial de metabólitos secundários relacionados à defesa da planta, como alcalóides, fenólicos e taninos. Como esses mecanismos não são eficientes para deter a colonização da planta pelo fungo, uma cascata de eventos, provavelmente ativada pelo aumento dos níveis de etileno, eleva os teores de asparagina, de açúcares, malondialdeido (MDA) e glicerol, altera o perfil de ácidos graxos, reduz os níveis de aminoácidos individuais e de pigmentos fotossintéticos, causando a morte da vassoura. O importante avanço do desenvolvimento de um sistema que permite a manutenção in vitro do micélio biotrófico de C. perniciosa, estabelecido recentemente por nosso grupo, permitiu o estudo da expressão gênica diferencial das duas fases miceliais do ciclo de vida do fungo: biotrófica e necrotrófica. Utilizamos a técnica de microarrays de DNA, analisando 2.304 fragmentos de bibliotecas de DNA genômico do Projeto Genoma da Vassoura-de-bruxa, selecionados a partir da similaridade com genes de patogenicidade de outros patógenos. Os resultados mostraram supressão da expressão de genes relacionados ao transporte e metabolismo de hexoses e ao metabolismo de lipídeos no micélio biotrófico do fungo. Já os genes da família do citocromo P450, hidrofobinas, aglutinina, lacase, várias proteases, lipases, álcool oxidase (AOX) e proteínas pol do sistema de retrotransposição de vírus, tiveram sua expressão induzida no micélio biotrófico, sugerindo uma possível participação nos mecanismos de patogenicidade do fungo. Esses resultados representam avanços significativos para as pesquisas sobre o metabolismo do fungo C. perniciosa e sobre as bases moleculares da progressão da doença vassoura-de-bruxa do cacaueiro, e servirão como base para orientar futuras investigações visando o controle da doença / Abstract: Witches¿ broom disease, caused by the hemibiotrophic fungus Crinipellis perniciosa, is one of the most important diseases of cocoa, causing dramatic production and economic losses. A better understanding of the cacao - C. perniciosa interaction and the processes that occur in the plant during disease progression becomes necessary in order to establish novel control strategies for this disease. In view of this, the present work had two main goals: 1) establishment of the biochemical modifications that occur in the host plant during disease development; and 2) identification of differentially expressed genes in in vitro grown biotrophic mycelia of C. perniciosa, which constitutes the fungal life stage that induces disease symptoms. The results of the biochemical characterization of the disease in artificially infected cocoa seedlings indicated an initial increase of secondary metabolites related to plant defenses, such as alkaloids, phenolics, and tannins. Since these mechanisms fail to control plant colonization by the fungus, a cascade of events, probably triggered by the increased levels of ethylene, boosts the contents of asparagine, sugars, malondialdehyde (MDA) and glycerol, alters the profile of fatty acids, lowers the levels of individual amino acids and photosynthetic pigments, and ultimately leads to tissue death. The important technological development of an in vitro system that allows the maintenance of the biotrophic phase of C. perniciosa, which was recently established by our group, allowed the analysis of the differential gene expression between the two mycelial phases of the life cycle of this fungus: the biothophic and the necrotrophic phases. For this study we employed the technique of DNA microarrays, analyzing 2,304 fragments obtained from the genomic DNA libraries of the Witches¿ Broom Genome Project, and which were selected based on their sequence similarity to pathogenicity genes of other pathogens. The results showed suppressed expression of genes related to the metabolism and transport of hexoses and to the metabolism of lipids in the biotrophic mycelia of the fungus. On the other hand, the expression of genes of the cytochrome P450 family, hydrophobins, agglutinin, laccase, several proteases, lipases, alcohol oxidase (AOX), and pol proteins of the viral retrotransposition system were induced in the biotrophic mycelia, thus suggesting their possible participation in fungal mechanisms of pathogenicity. These results represent significant advances to our understanding of the metabolism of C. perniciosa and also regarding the molecular basis underlying the progression of witches¿ broom disease of cocoa, and will be valuable as a basis for future investigations aimed at disease control / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Atualmente, a doenÃa conhecida como resinose, causada pelo fungo Lasiodiplodia theobromae, vem merecendo destaque no semi-Ãrido brasileiro devido ao ataque em galhos e ramos lenhosos da planta, provocando significativas perdas na produÃÃo de castanha. O desenvolvimento de estudos epidemiolÃgicos à de fundamental importÃncia no entendimento dos aspectos ecolÃgicos envolvidos na ocorrÃncia e progresso da doenÃa. Este trabalho objetivou realizar estudos sobre a dinÃmica espaÃo-temporal do patÃgeno em trÃs diferentes clones de cajueiro. Foram estimadas a dispersÃo desta doenÃa atravÃs de seu padrÃo espacial e temporal na Ãrea em estudo, estudando-se os componentes das anÃlises como os modelos de curva de progresso da doenÃa, intensidade mÃxima da doenÃa, inÃcio de aparecimento dos sintomas e Ãrea abaixo da curva de progresso da doenÃa, de forma a comparar epidemiologicamente o desenvolvimento desta doenÃa em clones com diferentes reaÃÃes. As Ãreas de estudo estÃo localizadas em uma propriedade situada no municÃpio de Pio IX, PI. Os dados de incidÃncia e severidade foram coletados entre os anos de 2002 e 2007, e utilizados nas anÃlises espaciais e temporais para os clones BRS 226, Embrapa 51 e Faga 11. Mesmo apresentando diferenÃas quanto à incidÃncia e severidade, foi observado que a doenÃa assume um modelo aleatÃrio de dispersÃo no inÃcio da epidemia, e que o aumento da incidÃncia se dà pelo surgimento de novos focos unitÃrios e crescimento dos focos antes existentes. Posteriormente, registrou-se uma agregaÃÃo de plantas doentes. Os clones apresentaram ajustes a diferentes modelos epidemiolÃgicos de acordo com o grau de susceptibilidade. As comparaÃÃes entre as epidemias baseadas nos seus componentes apresentaram diferenÃas significativas entre os clones de cajueiro, sugerindo o uso potencial da resistÃncia genÃtica do hospedeiro como mÃtodo de controle da resinose do cajueiro. / Presently, a cashew disease known as gummosis, caused by the fungus Lasiodiplodia theobromae, deserves special attention due to its infection to branches and trunks of woody plants imposing significantly reduction in nut yield. As the importance of disease increases, it becomes of fundamental importance the development of epidemiological studies to understand the ecological aspects involved on disease establishment and progress. This work aimed to study gummosis dynamics in time and space in three different clones of cashew. Patterns of dispersion in space and disease progress on time, as well as the components involved on these models such as disease progress curve, maximum disease intensity, area under the disease progress curve and the point of initial disease were studied analyzed in order to compare epidemics in the three clones with different disease reactions. The study was conducted in a commercial cashew farm in Pio IX district in Piaui state, Brazil. Gummosis incidence and severity data of collected from 2002 to 2007 were used for both time and space analyses for BRS 226, Embrapa 51 and Faga 11 clones. Disregarding differences in disease occurrence and severity among clones, a random pattern of dispersion was observed at the beginning of the epidemic followed by the development of new foci and expansion of original foci. Later, a clustered pattern was observed. Clones showed different fitness to epidemic models accordingly with their degree of susceptibility. Comparison of epidemics based on their components have shown significant differences among clones, providing evidence for the potential use of host resistance as a means of gummosis control.

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de NÃvel Superior / Lasiodiplodia theobromae à um fungo cosmopolita, polÃfago e oportunista, com reduzida especializaÃÃo patogÃnica, que infecta espÃcies de plantas em regiÃes tropicais e temperadas, causando os mais variados sintomas. A crescente expansÃo das doenÃas causadas por L. theobromae em frutÃferas tropicais vem causando inestimÃveis perdas, tanto no sistema produtivo como em pÃs-colheita, representando uma ameaÃa à fruticultura no Nordeste. Daà a necessidade de conhecimentos bÃsicos sobre a biologia populacional e a interaÃÃo do patÃgeno com as plantas hospedeiras. Este estudo teve como objetivo caracterizar isolados de L. theobromae associados a frutÃferas tropicais de diferentes regiÃes, avaliando o aspecto cultural, morfolÃgico e patogÃnico. Foram avaliados o crescimento micelial, coloraÃÃo da colÃnia, dimensÃes dos conÃdios e patogenicidade dos isolados em mudas de cajazeira, cajueiro, gravioleira e umbuzeiro. O trabalho foi realizado na Casa de VegetaÃÃo e no LaboratÃrio de Fitopatologia da Embrapa AgroindÃstria Tropical. Os dados de caracterizaÃÃo morfocultural mostraram haver alta diversidade na populaÃÃo do patÃgeno. As inoculaÃÃes realizadas nas quatro diferentes espÃcies hospedeiras apontaram alta variabilidade patogÃnica entre os isolados do fungo. Em mudas de cajueiro CCP 76 nÃo foi possÃvel observar especificidade patogÃnica, pois todos os isolados apresentaram similar nÃvel de agressividade, demonstrando a suscetibilidade deste clone ao patÃgeno, suscetibilidade essa, tambÃm observada em gravioleira. O umbuzeiro foi a espÃcie que apresentou maior resistÃncia ao fungo. Os dados mostraram que existe interaÃÃo entre as caracterÃsticas morfoculturais e a agressividade dos isolados de L. theobromae. De acordo com os resultados, a altitude dos locais de origem dos isolados nÃo influencia em suas caracterÃsticas morfoculturais e patogÃnicas. / Lasiodiplodia theobromae is an ubiquitous, polyphagous and opportunistic fungus with a reduced pathogenic ability. Nevertheless, it may infect several plant species over tropical and temperate regions, causing many different kinds of symptoms. The increasingly expansion of diseases caused by L. theobromae in tropical fruit plants has been imposing severe losses both at orchard level and in post-harvest at market, threaten the fruit crop industry in Northeast Region of Brazil. Therefore there is an urgent need for research pursuing basic knowledge on population biology of the fungus and host-pathogen interactions. This study aimed to characterize a L. theobromae population which has been associated to tropical plant species growing under different ecosystems in northeastern Brazil. Colony growth in culture, color and size of conidia and ability to cause disease upon inoculation on cashew nut (Anacardium occidentale), soursop (Annona muricata), yellow mombin (Spondias mombin) and Brazil plum (Spondias tuberosa) were evaluated. He study was carried out at Plant Pathology Lab and screenhouse of Embrapa Agroindustria Tropical in Fortaleza, Cearà State. Results showed a high diversity of morphology and hyphal growth among fungus isolates. Also, a very high variability on disease expression upon inoculation into four plant species was observed. However, it was found a lack of specificity of isolates as to infect cashew plants, since all isolates were able to infect cashew with similar high aggressiveness, which demonstrated a high degree of susceptibility of cashew clone used (CCP 76). Similar results were found also for soursop plants as host. Brazil plum showed a very high resistance to all isolates. The data points out for the existence of morphological and pathogenic interactions within L. theobromae population studied. According with the results, altitude and region of isolate origin has no effect on the studied features.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A murcha-de-esclerócio causada por Sclerotium rolfssi é uma das mais importantes doenças do tomateiro em regiões tropicais. O presente trabalho foi realizado com o objetivo de selecionar rizobactérias que promovem o controle da murcha-de-esclerócio sem afetar o crescimento das plantas de tomateiro e verificar se o mecanismo de antiobiose e a inibição da difusão do ácido oxálico têm relação com a capacidade de controle. / The southern blight caused by Sclerotium rolfsii is one of the most important diseases of tomato in tropical countries. The aim of this work was select rhizobacteria capable to control the southern blight with no effect on tomato growth and investigative the correlation of antibiosis mechanism and inhibition of oxalic acid diffusion with the control of disease