Este trabalho apresenta a descrição do comportamento sexual e do som de corte do macho de populações geográficas da América do Sul da mosca africana Zaprionus indianus, juntamente com a caracterização de um fragmento do gene period (per) de Z. indianus e Z. sepsoides, relacionado, em Drosophila melanogaster, com o controle dos ciclos de som de corte. As seqüências destas espécies são comparadas com as de outras da subfamília Drosophilinae e utilizadas em reconstruções filogenéticas. Também é avaliado o polimorfismo populacional deste marcador nas populações de Z. indianus. O comportamento de corte de Z. indianus é mais simples do que o de espécies do gênero Drosophila, sendo a média de latência de corte de 1 min e 33 s, com mínima de 13 s e máxima de 6 min e 51 s, enquanto que a latência de cópula ficou com média de 2 min e 16 s, com mínima de 18 s e máxima de 6 min e 56 s, sendo que não houve diferença estatística entre os valores obtidos nas diferentes populações. O som de corte é formado por uma seqüência de pulsos monocíclicos, com freqüência fundamental intrapulso variando de 193,8 Hz a 269,17 Hz. Dois padrões de intervalo interpulso foram identificados e denominados como pré-cópula e "montado". O primeiro que precede a cópula (pré-cópula), apresentou um IPI com média de 0,2343 ms ± 0,0799 e maiores amplitudes, enquanto o segundo, geralmente mais longo, foi emitido quando o macho já está copulando com a fêmea ("montado"), com média de 0,3657 ms ± 0,1299 e amplitudes menores. Não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas nas médias de IPIs entre as três populações estudadas, entretanto foi detectada diferença estatística nas freqüências intrapulso entre todas as populações. Em relação ao gene per, Z. indianus e Z. sepsoides, não possuem uma repetição do dipeptídio treonina-glicina, característica de algumas espécies de Drosophila, porém Z. indianus apresenta 4 mutações silenciosas nesta região, formando dois haplótipos presente na maioria das populações amostradas. A AMOVA demonstrou uma estruturação geográfica da variância molecular entre os grupos populacionais do Sul, Sudeste e Nordeste. Já a comparação das seqüências de per entre espécies da subfamília Drosophilinae revelou várias sinapomorfias que na análise filogenética recuperam todos os grupos de Drosophila analisados, bem como a monofilia de Zaprionus. Contudo a monofilia dos subgêneros Drosophila e Sophophora não foram recuperadas. Os resultados do comportamento de corte, em especial a velocidade de acasalamento, podem ajudar a explicar a rápida dispersão de Z. indianus no continente sul-americano. As diferenças nas freqüências intrapulso entre as populações podem representar a primeira adaptação comportamental registrada desta espécie na América do Sul. Quanto ao gene per, as sinapomorfias encontradas, reforçam a relação do gênero Zaprionus com as espécies dos grupos immigrans, virilis e repleta, também indicada na reconstrução filogenética usando o método da máxima verossimilhança. Já em relação aos dois haplótipos de per encontrados nas populações colonizadoras de Z. indianus, suas distribuições eqüitativas pode ser resultado da recente e rápida expansão geográfica desta espécie. / This paper describes the sexual behavior and courtship songs of the male in South American populations of the Zaprionus indianus African fly, together with the characterization of a fragment of the period gene (per) of Z. indianus and Z. sepsoides, which is related, in Drosophila melanogaster, with the control of the cycles of the courtship sounds. The sequences of these species are compared with those of the others of the Drosophilinae subfamily and used in phylogenetic reconstructions. The populational polymorphism of this marker of the Z. indianus populations is also evaluated. The courting behavior of Z. indianus is simpler than that of species of the genus Drosophila, with a latency of courtship of 1 minute 33 seconds - a minimum of 13 seconds and maximum of 6 minutes 51 seconds; The latency of copulation has an average of 2 minutes 16 seconds with a minimum of 18 seconds and maximum of 6 minutes 56 seconds. There were no statistically significant differences between the values obtained from the different populations. The courting song is made up of a sequence of monocyclic sounds with an intrapulse frequency varying from 193.8 Hz to 269.17 Hz. Two patterns of inter-pulse intervals were identified and denominated ´´pre-copulation`` and ´´mounted``. The first, which precedes the copulation (pre-copulation) demonstrated an IPI with an average of 0.2343 ms ± 0.0799 and with considerable amplitude while the second - generally longer - was emitted when the male was actually copulating with the female (´´mounted``) and had an average of 0.3657 ms ± 0.1299 but at lower amplitudes. No statistically significant differences were found in the IPI averages in the three populations studied, but such differences were detected in the intra-pulse frequencies in all the populations. In relation to the gene per, Z. indianus and Z. sepsoides do not have the repetition of dipeptide threonine-glycine characteristic of some species of Drosophila, but Z. indianus presents four silent mutations in this region that form two haplotypes that are present in the majority of the populations sampled. The AMOVA analysis demonstrates a geographical structuration of the molecular variance among groups of populations from South, Southeast and Northeast. However, the comparison of the per sequences of the Drosophilinae subfamily revealed various synapomorphies which, in the phylogenetic analysis, recovered all the Drosophila groups that were analyzed as well as the Zaprionus monophyly - that of Drosophila and Sophophora was not recovered. The results of the courting behavior, especially the rapidity of intercourse, could help to explain the rapid dispersion of Z. indianus in the South American continent. The differences in the intrapulse frequencies amongst the populations may represent the first behavioral adaptation registered for this species in South America. As for the per gene, the synapomorphies discovered tend to reinforce the relationship of the genus Zaprionus with the species of the immigrans, virilis and repleta groups, also detected in the phylogenetic reconstruction using the maximum likelihood method. As regards the two per haplotypes found in the Z. indianus colonizing populations, their equitative distribution may be the result of the recent and rapid geographic expansion of this species.

O capim-arroz (Echinochloa spp.) é considerado uma das principais plantas daninhas da cultura do arroz irrigado devido aos elevados prejuízos na produtividade desta cultura. A identificação das diversas espécies de capim-arroz é dificultada devido à grande variabilidade existente nos descritores taxonômicos utilizados. Recentemente diversas populações de capim-arroz têm apresentado resistência aos herbicidas inibidores da acetolactato sintase (ALS) e o mecanismo responsável pela resistência não é completamente conhecido. Os objetivos desta dissertação foi identificar a ocorrência do local de ação alterado como mecanismo de resistência aos herbicidas e avaliar a classificação taxonômica e as relações filogenéticas em acessos de capim-arroz de forma a orientar o correto manejo desta espécie na cultura do arroz irrigado. A avaliação do mecanismo de resistência aos herbicidas foi realizada através de experimentos de crescimento de plantas e atividade da enzima ALS em avaliações de curva dose-resposta e do sequenciamento do gene ALS em seis biótipos. Os resultados demonstraram a ocorrência de menor sensibilidade da enzima ALS nos biótipos PALMS01 e MOSTS51 que apresentam GR50 de 140 e 700 g.ha-1 de imazethapyr devido à ocorrência das mutações S653N e W574L, respectivamente. A identificação de espécie e a relação filogenética foram realizadas através da classificação morfológica com base em chaves taxonômicas e de marcadores moleculares de cloroplasto referentes ao íntron trnT e trnL e de espaçadores transcritos internos (ITS) em 29 acessos originários de lavouras de arroz irrigado do RS. A avaliação morfológica apresentou grande variabilidade tanto de características vegetativas como reprodutivas dificultando a utilização das chaves taxonômicas para vários acessos. O comprimento do eixo secundário da ráquis menor que 2 cm foi característico da espécie E. colonun e a largura do antécio inferior a 1,2 mm foi discriminador de E. crus-pavonis em relação à E. crus-galli. A análise filogenética através de sequências de cpDNA foi mais discriminadora em relação aos parâmetros morfológicos do que as sequências ITS. A espécie E. colonun apresentou vários indel e mutações possibilitando a fácil diferenciação das demais espécies. A sequência de nucleotídeos de cpDNA indicou a ocorrência de duas mutações diferenciais entre as espécies E. crus-galli e E. crus-pavonis referentes às alterações de Timina para Guanina e Adenina para Timina, respectivamente. Existe grande variabilidade morfológica entre as espécies de capim-arroz ocorrentes no RS e marcadores moleculares de cpDNA são eficientes para a discriminação destas espécies. A resistência aos herbicidas imidazolinonas em capim-arroz está relacionada à ocorrência de mutações no gene ALS. / The Echinochloa complex is considered a major weed of irrigated rice due to high losses in grain yield. The identification of the Echinochloa species is difficult due to the large variability of the plant descriptors used in the taxonomic keys. Recently several populations of Echinochloa has evolved resistance to acetolactate synthase (ALS) inhibitors and the mechanism of resistance is not fully understood. The aim of this study was to identify the occurrence of altered target as a mechanism of herbicide resistance and to evaluate the taxonomic classification and phylogenetic relationships in Echinochloa accessions in order to guide the correct management of this species in irrigated rice. The evaluation of the mechanism of herbicide resistance was performed in plant growth and ALS enzyme activity assays evaluated with dose-response curve and by the sequencing of the ALS gene in six Echinochloa biotypes. The results demonstrated the occurrence of ALS enzyme insensitivity and the mutations Ser653N and W574L in the ALS gene in two resistant biotypes. The identification and phylogenetic relationship was evaluated through morphological classification based on taxonomic keys and with molecular markers for the chloroplast trnT and trnL intron and internal transcribed spacers (ITS) in 29 accessions collected in irrigated rice fields in RS. Both vegetative and reproductive characteristics were highly variable resulting in difficulties for using the taxonomic keys. The length of the axis of rachis minor that 2 mm was characteristic of the species E. colonun, and anthecium width of less than 1.2 mm was discriminator E. crus-pavonis towards E. crus-galli. Phylogenetic analysis using cpDNA sequences was more discriminatory in relation to morphological and ITS sequences. E. colonun showed several indel and mutations enabling easy differentiation from other species. The nucleotide sequence of cpDNA obtained with cpDNA markers indicated the occurrence of two differential mutations between species E. crus-galli and E. crus-pavonis related to the changes of Thymine to Guanine and Adenine to Thymine, respectively. There was large variability among the Echinochloa complex accessions collected in RS and molecular markers of cpDNA are efficient to discriminate these species. The resistance to imidazolinone herbicides on barnyardgrass is related to the occurrence of mutations in the ALS gene.

Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-03-17T13:35:21Z No. of bitstreams: 2 Dissertaçao Victor Rafael Coimbra.pdf: 2813070 bytes, checksum: db94506ce452b12ba7734f42b48a4593 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T13:35:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertaçao Victor Rafael Coimbra.pdf: 2813070 bytes, checksum: db94506ce452b12ba7734f42b48a4593 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / Com o intuito de contribuir com o conhecimento taxonômico e filogenético dos membros da ordem Agaricales em Pernambuco, foram realizadas sete visitas a campo, entre os meses de julho de 2011 a abril de 2012, em um remanescente de Mata Atlântica: Reserva Biológica de Saltinho, no município de Tamandaré. No total, foram coletados 82 espécimes, representando 17 espécies, sendo 10 delas possíveis espécies novas para a ciência, uma representa, possivelmente, um novo registro para o Brasil, três são novos registros para a região Nordeste e uma espécie ainda permanece indeterminada. O DNA das possíveis espécies novas e de táxons de difícil identificação por caracteres morfológicos foi extraído e a amplificação, purificação e sequenciamento das regiões ITS e LSU do rDNA foram realizadas. Houve sucesso em 58% dos sequenciamentos da região ITS e 66% da região LSU. Os procedimentos de extração, amplificação e/ou sequenciamento das espécies Amanita sp., Camarophyllus sp., Hydropus sp.1 e Rhodocollybia sp.2 não foram bem sucedidos, enquanto a seqüência obtida de Hygrophorus sp. não apresentou qualidade satisfatória, sendo inviável para este estudo. Para Collybia aurea, só houve sucesso na amplificação e sequenciamento da região LSU, enquanto para Hygrophoraceae sp., Psathyrella sp., Marasmiellus volvatus, Rhodocollybia sp.1, Marasmius sp. e Hydropus sp.2 foi obtido sucesso para ambas as regiões estudadas. Baseado nas análises filogenéticas da região LSU pelo método de inferência bayesiana e pelos BLASTn realizados com as sequências das regiões ITS e LSU, foi possível confirmar a identidade de Collybia aurea, confirmar a identidade de Psathyrella sp., Rhodocollybia sp.1, Marasmius sp. e Hydropus sp.2, bem como dar suporte as suas determinações como novos táxons para a ciência.

Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-10T14:56:28Z No. of bitstreams: 2 TESE MariaTereza Buril.pdf: 4301689 bytes, checksum: a25a6e72564fb58d0cb716905b54a750 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-10T14:56:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE MariaTereza Buril.pdf: 4301689 bytes, checksum: a25a6e72564fb58d0cb716905b54a750 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / FACEPE; CAPES; IAPT / Com cerca de 120 espécies, Jacquemontia é um dos maiores gêneros em Convolvulaceae. Cerca de 50% desta diversidade está presente no Brasil. Entretanto, a espécies brasileiras haviam sido tratadas pela última vez na Flora Brasiliensis (1869). Desde então, devido à dificuldade no reconhecimento das espécies pelo expressivo polimorfismo, o gênero tem acumulado uma série de problemas taxonômicos tais quais sinonímias. Este estudo teve como principal objetivo revisar o gênero no Brasil, além de incluir análises palinológicas, moleculares e biogeográficas para buscar responder questões de demilitação infragenérica. Dos 58 nomes reconhecidos na Flora do Brasil (Bianchini & Ferreira 2012), apenas 42 foram considerados aqui. No total, o Brasil apresenta 50 espécies de Jacquemontia, atendendo as novas espécies e novos sinônimos aqui indicados. Tanto dados polínicos quanto moleculares demonstraram que as seções estabelecidas para o gênero com base exclusivamente na morfologia das inflorescências, não compõem grupos naturais. Dados de distribuição demonstraram que a maioria das espécies brasileiras apresentam um padrão de distribuição restrito, e que o centro de riqueza de endemismos no Brasil está na Cadeia do Espinhaço. Sugerindo assim, o apoio a políticas conservacionistas na área para a conservação do patrimônio genético de Jacquemontia.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2015-05-12T13:26:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese versão final Lucas.pdf: 7855560 bytes, checksum: 88da005a858b6ccf85abc52a60df1875 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-12T13:26:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese versão final Lucas.pdf: 7855560 bytes, checksum: 88da005a858b6ccf85abc52a60df1875 (MD5) Previous issue date: 2015-02-02 / CAPES / Ephemeroptera é um grupo de insetos aquáticos e importante componente de ambientes dulciaquícolas. O conhecimento sobre esse grupo no Brasil aumentou nos últimos anos, principalmente na Região Nordeste, contribuindo para reduzir lacunas de conhecimento. Das 10 famílias de Ephemeroptera reportadas para o Brasil, Caenidae é uma das mais amplamente distribuídas no mundo. Brasilocaenis Puthz, 1975, juntamente com outros três gêneros, é um dos representantes sulamericanos da família. Exceto pela morfologia bem diferenciada da genitália masculina, as espécies desse gênero são muito similares a algumas espécies sulamericanas de Caenis Stephens, 1836 (Caenidae). Este trabalho apresenta uma lista atualizada das espécies de Ephemeroptera do Estado de Pernambuco, Nordeste Brasileiro, e realizar a primeira proposta filogenética para o gênero Brasilocaenis. Baseado na bibliografia e coletas em vários rios e riachos de 27 municípios e 74 localidades, 16 espécies e 10 gêneros são reportados pela primeira vez para Pernambuco, aumentando de 43 para 59, o número de espécies para o Estado. Com estes resultados, Pernambuco se torna o Estado com o maior número de espécies na Região Nordeste do Brasil. Além disso, Caenis chamie Alba-Terce dor & Mosquera, 1999 é reportado pela primeira vez para o Brasil. Para analisar a relação de Brasilocaenis e gêneros relacionados, foram examinados aparentes subgrupos por meio caracteres morfológicos. A primeira análise filogenética de Brasilocaenis é proposta baseada em uma matriz de 10 caracteres contínuos e 24 discretos analisados sob pesagem implícita. O gênero é recuperado como monofilético e redefinido baseado nas redescrições de adultos machos e ninfas do material tipo ou recém coletados, e de três novas espécies descritas a partir de imagos de ambos os sexos e ninfas. Baseada nesses resultados, uma análise biogeográfica foi conduzida baseada nos registros distribucionais de cada espécie usada na análise filogenética, encontrando dois eventos vicariantes. / Ephemeroptera is a group of aquatic insects and important biotic component of freshwater ecosystems. The knowledge about the distribution of Ephemeroptera in Brazil has increased in recent years, contributing to reduce the gaps of distribution. Of the ten families of Ephemeroptera recorded for Brazil, Caenidae is one of the most widespread in the world. BrasilocaenisPuthz, 1975 is a representative South American genus of Caenidae. Except the very differentiate male genitalia, the species of this genus are very similar to some South American species of Caenis Stephens, 1835. This paper presents an updated checklist of the species of Ephemeroptera from Pernambuco State, Northeastern Brazil and performs the first phylogenetical proposal to genus Brasilocaenis. Based on bibliography and collections from numerous rivers and streams of 27 counties and 74 localities, 16 species and 10 genera are recorded for the first time from Pernambuco State, increasing from 43 to 59 the number of known species. With these results, Pernambuco becomes the state with highest number of species in Northeastern Region of Brazil. Moreover, Caenis chamie Alba-Tercedor & Mosquera, 1999 is reported for the first time from Brazil. To analyse the relationship within Brasilocaenis and related genera, we examined apparent subgroupings by morphological characters. This first phylogenetic analysis of Brasilocaenisis proposed based on a matrix of ten continuous and 24 discrete characters analysed under implied weights. The genus is recovered as monophyletic and redefined based on redescription of male imagos and nymphs from the holotype and/or fresh material, and from three new species described from imagos of both sexes and nymph. Based on these results, a biogeographical analysis was conducted, based on distributional records for each species of the phylogenetic analysis, finding two main vicariant events.

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_12084_Dissertação_Diego Prado Ventorim.pdf: 2553859 bytes, checksum: 18056a943ffcba4f96c37b60d75fed08 (MD5) Previous issue date: 2018-03-05 / A febre chikungunya é uma arbovirose altamente debilitante, causada pelo vírus chikungunya, o qual é transmitido pela picada de mosquitos do gênero Aedes. Em 2014 foram registrados os primeiros casos da doença no Brasil, sendo constatada a presença dos genótipos asiático e Leste/Centro/Sul africano do vírus. No final de 2015, pela primeira vez, foram reportados casos no Espírito Santo (ES) e entre 2016-2017 o estado enfrentou um surto da doença. Diante disso, nós, juntamente à Secretaria Estadual de Saúde/ES e ao Laboratório Central/ES objetivamos identificar qual linhagem do vírus circula no ES; analisar características genéticas virais nas amostras estudadas e levantar dados epidemiológicos sobre a doença no estado. As amostras do estudo foram provenientes do Laboratório Central/ES e referentes ao período de março/2016 - dezembro/2017. O diagnóstico viral foi realizado por sorologia ou por técnicas moleculares. Vinte e sete amostras (diagnosticadas molecularmente) foram utilizadas na amplificação parcial e sequenciamento de dois genes codificantes de proteínas do envelope viral, E1 e E2. Seis dessas amostras foram utilizadas nas análises filogenéticas. Os resultados epidemiológicos demonstraram que no período do estudo foram reportados 2.021 casos suspeitos da febre chikungunya, sendo 412 (20,38%) confirmados. Além disso, a distribuição geográfica desses casos constatou que Vitória e Vila Velha representaram mais de 50% de todos os casos do estado. Os achados mostraram que a frequência da infecção pelo vírus chikungunya, em relação ao número de amostras referenciadas ao Laboratório Central/ES, pode ser considerada baixa. No entanto, constatou-se que a doença apresenta relevância epidemiológica e grande distribuição no estado. Os resultados filogenéticos evidenciaram que o vírus circulante pertence à linhagem Leste/Centro/Sul africana, a qual também foi constatada em diversos surtos na Europa, África e Ásia. Além disso, a caracterização molecular dos fragmentos das proteínas E1 e E2 não mostraram a presença das mutações adaptativas E1-K211E; E1-A226V; E2-L210Q e E2-I211T. Esse resultado permite sugerir que o vírus circulante no ES apresenta um potencial de disseminação menor em comparação aos vírus circulantes em grandes epidemias mundiais recentes. Devido à falta de uma vacina e à dificuldade no controle populacional do mosquito vetor, estudos sobre a diversidade genética como este tornam-se alternativas viáveis em busca de melhor entendimento e controle da febre chikungunya no Brasil e, especificamente, no ES.

Orientador: Maria do Carmo Estanislau do Amaral / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-27T11:20:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Feres_Fabiola_M.pdf: 11923620 bytes, checksum: b59558c6f33773f5066c5a47a2771532 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: O gênero Luxemburgia pertence à família Ochnaceae e é exclusivamente brasileiro. As espécies de Luxemburgia são encontradas em campos rupestres e afloramentos rochosos, principalmente na Cadeia do Espinhaço, no Estado de Minas Gerais. Luxemburgia é constituído por espécies arbustivas, facilmente reconhecíveis pelas folhas de margem denteada, onde cada nervura secundária converge para uma glândula marginal, pela presença de um cílio no ápice das folhas, e pelas flores amarelas e zigomorfas, devidas ao agrupamento dos estames em um lado da flor, envolvendo parcialmente o gineceu. Estudos cladísticos utilizando caracteres morfo-anatômicos e moleculares revelaram que os gêneros Luxemburgia e Philacra formam um grupo monofilético. Os objetivos do presente trabalho foram: realizar a revisão taxonômica do gênero Luxemburgia, investigar as relações filogenéticas entre as espécies do gênero, utilizando caracteres morfoanatômicos e moleculares e o gênero Philacra como grupo externo e, a partir dos cladogramas obtidos, interpretar a evolução dos caracteres e a biogeografia histórica das espécies. Foi feita a revisão taxonômica do gênero. São apresentadas chaves de identificação, ilustrações e mapas de distribuição geográfica para todas as espécies de Luxemburgia. São reconhecidas 18 espécies e duas subespécies para o gênero Luxemburgia. Estão sendo propostas duas novas espécies e uma nova subespécie, além de novos sinônimos. Foi feita a análise cladística 60 gênero com caracteres morfológicos e moleculares. Os resultados obtidos são comparados e discutidos. Para a análise cladística com caracteres moleculares, foi sequenciada a região ITS I e II do DNA nuclear ribossomal, para 12 espécies de Luxemburgia e 1 espécie de Philacra. Os resultados obtidos através das análises com caracteres morfológicos e moleculares mostraram grande conflito. É discutida a hipótese de que, durante a evolução do gênero Luxemburgia, primeiro tenha ocorrido eventos de especiação muito rapidamente, e que posteriormente, durante muito tempo, não tenham ocorrido eventos de especiação. Isso explicaria o fato dos ramos basais internos serem curtos e os ramos dos táxons terminais longos, como observado no cladograma obtido com caracteres moleculares / Abstract: Luxemburgia is an exclusively Brazilian genus of the family Ochnaceae. AlI speCles are found in "campo rupestre" vegetation among rocks on the Espinhaço Range, mainly in the state of Minas Gerais. The species of Luxemburgia are shrubs, and easily recognizable by its leaves with toothed margins, where each secondary vein converges to a single marginal gland, by a cilium at the leaf apex, by its yellow and zygomorphic flowers, characterized by the position of the stamens, restricted to one side of the flower and involving partially the gymnoecium. Cladistic studies based on morphological and molecular data sets showed that the genera Luxemburgia and Philacra together form a monophyletic group. The aims of this work were to make a taxonomic review of the genus Luxemburgia and to investigate phylogenetic relationships among the species of Luxemburgia, based on morphological and molecular data sets, using Philacra as outgroup, and also to interpret the characters evolution and the historic biogeography of the species with the phylogenetic trees obtained in the analysis. The taxonomic review has been concluded. Keys, illustrations and maps showing the geographic distribution for all species are provided. The present treatment recognizes 18 species and two subspecies for Luxemburgia. Two new species and one new subspecies are proposed. New synonyms are also proposed. Cladistic analysis of the genus was carried out using morphological and molecular data sets. AlI results are compared and discussed. For the cladistic analysis based on molecular data, the nuclear rDNA regions ITS I and TI were sequenced for 12 species of Luxemburgia and one species of Philacra. The results obtained ITom the two different data sets showed high discordance. The hypothesis is discussed that during the evolution of the genus Luxemburgia, speciation events occurred very early, followed by a long period without speciation events. This would explain the short internal branch lengths and the long branches leading to the terminal taxa observed in the molecular tree / Mestrado / Mestre em Biologia Vegetal

The subfamily Botryllinae is composed of colonial ascidians present in all oceans circunglobally. The botryllinids form thin encrusting sheets, with zooids seldom reaching 3mm in length. Botryllinids comprise two genera, Botryllus and Botrylloides, but the validity of the later is currently questionated. The present work aimed to describe the Botrylllinae from the Brazilian coast, studying their phylogenetic relationships based on morphological characters. All lots of botryllids from the Ascidiacea Collection of the Marine Sciences Institute (Institute de CiÃncias do Mar, Labomar, UFC) were examined. Twenty informative characters based on colony structure and zooid morphology, were selected for phylogenetic reconstruction. The genus Symplegma was used as outgroup. The survey on the collection revealed the following species from Brazilian coast: Botrylloides giganteum, Botrylloides nigrum, Botryllus humilis, Botryllus planus, Botryllus cf. primigenus, Botryllus cf. tuberatus, Botryllus schlosseri, Botryllus tabori e Botryllus sp. n. Among the nine species recorded, only Botryllus tabori and a new species of Botryllus are considered endemic. The cladistic analysis yielded three equally parsimonious trees, where only Botryllus schlosseri changed its position in the different topologies. The monophily of the genus Botrylloides was observed, with the ovaries located ventrally in relation to the testicles as supporting synapomorphy. Botryllus seems to be a paraphiletic genus, with three diverging clades. / A subfamÃlia Botryllinae à um tÃxon de ascÃdias coloniais com ampla distribuiÃÃo, ocorrendo em praticamente todos os mares do planeta. Os animais desta subfamÃlia formam colÃnias incrustantes, com zoÃides raramente alcanÃando 3mm de comprimento. O tÃxon compreende somente dois gÃneros, Botryllus e Botrylloides, mas a validade deste Ãltimo gÃnero ainda à discutida. O presente trabalho teve por objetivo descrever os Botryllinae da costa brasileira, estudando suas relaÃÃes filogenÃticas com base em dados morfolÃgicos. Todos os lotes de botrilÃneos da ColeÃÃo de Ascidiacea do Instituto de CiÃncias do Mar (Labomar, UFC) foram examinados, e as espÃcies encontradas foram identificadas. Para a reconstruÃÃo filogenÃtica, 20 caracteres informativos foram selecionados, com base na estrutura da colÃnia e morfologia dos zoÃides. O gÃnero Symplegma foi usado como grupo externo. O exame dos exemplares da coleÃÃo revelou a presenÃa das seguintes espÃcies: Botrylloides giganteum, Botrylloides nigrum, Botryllus humilis, Botryllus planus, Botryllus cf. primigenus, Botryllus cf. tuberatus, Botryllus schlosseri, Botryllus tabori e Botryllus sp. n. Destas 9 espÃcies, somente a jà conhecida Botryllus tabori e uma espÃcie nova de Botryllus sÃo consideradas endÃmicas. A anÃlise cladÃstica gerou 3 Ãrvores igualmente parcimoniosas, nas quais a Ãnica diferenÃa foi a posiÃÃo da espÃcie Botryllus schlosseri. Foi observada a monofilia para o gÃnero Botrylloides, que teve como sinapomorfia o ovÃrio localizado em posiÃÃo ventral aos testÃculos. Para os Botryllus se observou a parafilia com a divisÃo em trÃs grupos distintos.

Orientadores: André Olmos Simões, Sandra Maria Carmello Guerreiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-22T17:50:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mello_CarolinaCarvalhode_M.pdf: 7597906 bytes, checksum: 1c6ff4625b938a2aa999f5fe5de78b8e (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Este estudo teve como objetivo caracterizar, através da anatomia, os frutos e as sementes de quatro espécies neotropicais e assim levantar caracteres que possuam potencial valor sistemático e evolutivo para tribo, além de contribuir para o conhecimento das Apocynaceae. Flores, frutos e sementes foram coletados, fixados e submetidos a técnicas usuais de anatomia. No primeiro capítulo foram estudados frutos maduros de Couma rigida Mull. Arg, Lacmellea panamensis (Woodson) Monach, Hancornia speciosa Gomes e Parahancornia fasciculata (Poir.). Benoist. Os frutos possuem exocarpo uniestratificado, com cutícula espessa, ornamentações na cutícula foram encontradas somente em P. fasciculata. O mesocarpo apresenta parênquima fundamental, laticíferos, feixes vasculares e idioblastos com compostos fenólicos. Esclereídes foram encontradas apenas em C. rigida, sendo que os arranjos dos idioblastos mudam entre as espécies e aerênquima foi observado somente em P. fasciculata. Em todas as espécies o endocarpo é uniestratificado. No segundo capítulo, sementes maduras das quatro espécies também foram estudadas. Mesmo possuindo características variadas, estas sementes apresentam diversas similaridades, como envoltório único repleto de compostos fenólicos e endosperma com reserva. Todas as sementes são exotestais, sendo que foi encontrada mucilagem nessa camada apenas em P. fasciculata. As principais substâncias de reserva encontradas foram lipídios e proteínas. As proteínas se encontram na forma de cristais somente em L. panamensis. Lipídios foram detectados em todas as espécies, na forma de lipídios totais ou ácidos graxos em gotículas no endosperma das sementes. No terceiro capítulo, foi realizado um estudo ontogenético dos frutos de H. speciosa e P. fasciculata. Os dois frutos possuem o exocarpo originado exclusivamente da epiderme externa do ovário, é formado por uma camada de células epidérmicas, cutícula espessa e estômatos. Sendo que a cutícula de P. fasciculata possui ornamentações. O mesocarpo origina-se do mesofilo ovariano e são constituídos de células parenquimáticas, feixes vasculares, laticíferos e idioblastos com compostos fenólicos. Em H. speciosa, os idioblastos com compostos fenólicos permanecem apenas nas primeiras camadas subepidérmicas, quando maduro. Em P. fasciculata, o mesocarpo apresenta também tecido aerenquimático. O endocarpo das duas espécies é formado por apenas uma camada de células de paredes delgadas e é originado apenas da epiderme interna do ovário / Abstract: This study aimed to characterize, through the anatomy, the fruits and seeds of four neotropical species and thus raise characters that have potential value for systematic and evolutionary tribe, besides contributing to the knowledge of the Apocynaceae. Flowers, fruits and seeds were collected, fixed and submitted to the usual techniques of anatomy. In the first chapter, the ripe fruits of Couma rigida Mull. Arg, Lacmellea panamensis (Woodson) Monach, Hancornia speciosa Gomes and Parahancornia fasciculata (Poir.) Benoist, were studied. The fruits have unistratified exocarp with thick cuticle, but cuticle ornamentation was found only in P. fasciculata. The mesocarp presents fundamental parenchyma, laticifers, vascular bundles and idioblasts with phenolic compounds. Sclereids were found only in C. rigida, the arrangement of idioblasts with phenolic compounds changs among the species and the presence of aerenchyma is present only in P. fasciculata. In all species, the endocarp is unistratified. In the second chapter, ripe seeds of the four species were also studied. Even having varied features these seeds have many similarities, such as single seed-coat with phenolic compounds and endosperm reserves. All seeds are exotestais, mucilage was found only in P. fasciculata in this layer. The main reserve substances found were lipids and proteins. The proteins are found in crystal form only in L. panamensis. Lipids were observed in all species, in the form of lipids or fatty acidsin the endosperm of the seeds. In the third chapter, an ontogenetic study of the Hancornia speciosa and Parahancornia fasciculata fruits were made. Both fruits, originated exclusively from the external epidermis of the ovary, are formed by one layer of epidermal cells with thick cuticle and stomata. Since the cuticle of P. fasciculata has ornamentations. The mesocarp originates from the mesophyll and consists of parenchyma cells, vascular bundles, laticifers and idioblasts with phenolic compounds. In H. speciosa, idioblasts with phenolic compounds remain only in the first subepidermal, when ripe. In P. fasciculata, the mesocarp has aerenchyma tissue too. The endocarp of the two species, are formed by a single layer of cells with thin walls and originated only the internal epidermis of the ovary / Mestrado / Taxonomia Vegetal / Mestra em Biologia Vegetal

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:04:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6193_1.pdf: 776005 bytes, checksum: 030afd1b5bece89b5fb9295c3e29f930 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / A caracterização molecular do vírus da dengue é útil na determinação da origem de amostras e, principalmente, na tentativa de se estabelecer uma correlação de virulência dos isolados e sua importância epidemiológica. Embora os quatro sorotipos do vírus da dengue possam causar a febre hemorrágica da dengue considerando a infecção primária, alguns sorotipos parecem estar associados a determinadas formas e a gravidade da doença em diferentes localidades. Neste trabalho, 14 isolados do sorotipo 3 do vírus da dengue foram obtidos de pacientes com diferentes quadros clínicos em Recife entre 2003-2004: 10 pacientes com dengue clássica sendo que cinco deles cursaram com plaquetopenia e outros quatro com diagnóstico de febre hemorrágica da dengue. A extremidade 5 dos genomas virais foi seqüenciada e foram comparadas às seqüências nucleotídicas e polipeptídicas correspondentes às do capsídeo, da membrana e parte do envelope entre si. Os sítios variantes na porção Cterminal do primeiro ¼ da seqüência do envelope sugerem que a apresentação clinica da doença pode estar relacionada à variabilidade do genoma viral, visto que as análises dos dendrogramas gerados a partir das seqüências dos aminoácidos do fragmento seqüenciado do gene do Envelope, formam três clados distintos, um deles apenas com as seqüências originadas de isolados de pacientes com febre hemorrágica da dengue, outro com seqüências de pacientes com dengue clássica com ou sem plaquetopenia e um clado intermediário onde ocorrem semelhanças entre isolados de formas clínicas diferentes