Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-18Bitstream added on 2014-06-13T18:54:03Z : No. of bitstreams: 1 arneiro_lcm_me_jabo.pdf: 935977 bytes, checksum: a8cbfbbed53f54f73a608f20e432bfe4 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Em mamíferos, incluindo os eqüinos (Equus caballus), o gene protein kinase, AMP-activated, gamma 3 non-catalytic subunit (PRKAG3) encontra-se relacionado ao desempenho muscular, os genes cysteine-rich secretory protein 1 (CRISP1) e spermatogenesis associated 1 (SPATA1) à fertilidade de machos e os genes 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A (HTR1A) e solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4 (SLC6A4) ao temperamento. Os objetivos deste trabalho foram a padronização de metodologia alternativa de genotipagem por PCR-RFLP dos SNPs AY_376689:c.773C>T, AJ_315378:c.110A>G e AB_264325:c.771G>C dos genes eqüinos PRKAG3, CRISP1 e HTR1A, respectivamente, bem como a caracterização em cavalos da raça brasileira Mangalarga destes e de outros polimorfismos, o AAWR_02017454:g.121684T>C do gene SPATA1 e o AB_098561:c.1470G>A do gene SLC6A4, a fim de promover o embasamento necessário para futuras pesquisas visando associação entre marcadores de DNA e características de interesse na raça. Foram utilizados 151 animais Mangalarga, de ambos os sexos e de idades variadas, representativos da população do Estado de São Paulo. O método de PCR-RFLP mostrou-se adequado para a genotipagem dos SNPs AY_376689:c.773C>T do PRKAG3, AJ_315378:c.110A>G do CRISP1 e AB_264325:c.771G>C do HTR1A. Entretanto, os polimorfismos do PRKAG3 e CRISP1 provavelmente não ocorrem na Mangalarga, impossibilitando estudos de associação com os marcadores. As estimativas dos parâmetros genético-populacionais obtidas para o polimorfismo AAWR_02017454:g.121684T>C do gene SPATA1 na amostra estudada demonstraram a possibilidade de realização de pesquisas visando a sua associação com fertilidade de machos. As mesmas estimativas obtidas para os polimorfismos AB_264325:c.771G>C do HTR1A e o AB_098561:c.1470G>A do SLC6A4 desencorajam a realização de pesquisas visando suas associações à características relacionadas ao temperamento / In mammals, including the equine (Equus caballus), the protein kinase, AMP-activated, gamma 3 non-catalytic subunit (PRKAG3) gene is related to muscular development, the cysteine-rich secretory protein 1 (CRISP1) and spermatogenesis associated 1 (SPATA1) genes are related to male fertility and the 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A (HTR1A) and solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, serotonin), member 4 (SLC6A4) genes are related to temperament. The aims of the present study were to propose an alternative genotyping method for the AY_376689:c.773C>T, AJ_315378:c.110A>G and AB_264325:c.771G>C SNPs of the equine PRKAG3, CRISP1 and HTR1A genes, respectively, as well as the characterization in Mangalarga Brazilian breed horses of these and other polymorphisms, the AAWR_02017454:g.121684T>C of the SPATA1 gene and the AB_098561:c.1470G>A of the SLC6A4 gene, in order to provide the necessary basis for future research towards associating the DNA markers and traits of interest in this breed. For this, 151 Mangalarga animals were used, from both sexes and random ages, representing the São Paulo state population. The PCR-RFLP methodology was found to be adequate for the genotyping of the SNPs AY_376689:c.773C>T of the PRKAG3, AJ_315378:c.110A>G of the CRISP1 and AB_264325:c.771G>C of the HTR1A. Nevertheless, the PRKAG3 and CRISP1 polymorphisms probably do not occur in Mangalarga, making it impossible the association studies with these markers. The estimative of the population genetic parameters obtained for the AAWR_02017454:g.121684T>C polimorphism of the SPATA1 gene in the sample studied showed the possibility of carrying out research towards its association with male fertility. On the other hand, the same estimatives obtained for the polymorphisms AB_264325:c.771G>C of the HTR1A and AB_098561:c.1470G>A of the SLC6A4 discourage research towards their association to traits related to temperament

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-06-29Bitstream added on 2014-06-13T20:14:45Z : No. of bitstreams: 1 sarti_dgp_me_jabo.pdf: 1198848 bytes, checksum: e40b6d98807223ccf77d3505c485e6ec (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho objetivou a avaliação da divergência genética entre linhagens e cultivares de soja com resistência ao nematóide de cisto (NCS) através de marcadores moleculares do tipo microssatélite, a fim de identificar genótipos similares e grupos heterogêneos. Foram utilizadas 30 cultivares de soja e 10 genótipos em geração F8, todos resistentes ao NCS. As análises foram realizadas com 12 iniciadores, a saber: Satt185, Satt308, Satt187, Satt070, Satt009, Satt129, Satt154, Satt152, Satt175, Satt045, Satt162 e Satt163. As análises de dissimilaridade foram realizadas através do complemento dos coeficientes de Coincidência Simples e de Rogers e Tanimoto. Os agrupamentos foram realizados pelos Métodos de Otimização de Tocher, Vizinho mais Próximo, Vizinho mais Distante, Ward, Ligação Média Dentro de Grupo, UPGMA e WPGMA. Em adição, foram feitas as projeções no plano bi e tridimensional. Os resultados mostraram coeficientes de dissimilaridade de Coincidência Simples e de Rogers e Tanimoto com médias de 0,36 e 0,5, respectivamente. Foram observados genótipos mais semelhantes e grupos mais divergentes, na maioria das vezes concordando com as respectivas fontes de resistência. Os resultados dos diferentes métodos aglomerativos confirmaram a existência de uma estrutura natural de agrupamento em função da similaridade genética entre os genótipos. Entretanto, o emprego de mais de um método de agrupamento pode ser recomendado devido às diferenças entre as metodologias. Alguns métodos mais comumente utilizados como o Vizinho Mais Distante, Ward, WPGMA e UPGMA foram considerados adequados ao agrupamento de genótipos no presente estudo, apresentando coincidência de resultados, inclusive em relação às genealogias dos genótipos analisados. As projeções no plano... / The present work aimed the evaluation of the genetic divergence among soybean lines and cultivars, resistant to cyst nematode (NCS). Therefore microsatellite molecular markers were used, with the objective of identify similar genotypes and heterogeneous groups. There were used 30 soybean cultivars and 10 genotypes in F8 generation, all of them resistant to NCS. The analyses were made using 20 primers (Satt185, Satt308, Satt187, Satt070, Satt009, Satt129, Satt154, Satt152, Satt175, Satt045, Satt162 and Satt163). The dissimilarity analyses were made through the complement of Simple Coincidence and Rogers and Tanimoto Coefficients. Clusters were performed by the following methods: Tocher Optimization, Single Linkage, Complete Linkage, Ward, Average Link Within a Group, UPGMA and WPGMA. In addition, the bi and tridimensional plan projections were made. The results showed average values of 0,36 and 0,5 in the Simple Coincidence and Rogers and Tanimoto dissimilarity coefficients, respectively. Most similar genotypes and most divergent groups were found, usually according to the respective resistant sources. Results of the different cluster methods confirmed a group’s structure according to genotypes similarity. However, the use of many clustering methods should be recommended, because of their methodology differences. Some of the most used methods, like Complete Linkage, Ward, WPGMA and UPGMA, were considered adequate for clustering the genotypes in this case. There were observed coincidence of results confirming the genotypes genealogies. The plan projections were not satisfactory for these analyses, showing high distortion and stress. The results combination can be useful in the parental choice for crosses of Soybean Breeding Programs.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2739.pdf: 371228 bytes, checksum: c62273cf2751279fd8df20ebbb145ad4 (MD5) Previous issue date: 2009-07-23 / Universidade Federal de Minas Gerais / Two genetic linkage maps were constructed referent to two full-sib families (G1 and G2) of the marine shrimp species Litopenaeus vannamei, and the integration of these maps was accomplished. The mapping was based on polymorphic markers derived from nine AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) primers. A total of 103 and 59 segregating polymorphic markers were used in the construction of the maps for families G1 and G2, respectively. The G1 family map consisted of 14 linkage groups, with estimated genome coverage of approximately 350 cM. The G2 map presented 4 linkage groups, with genome coverage of around 300 cM. The integration of the maps evidenced eight AFLP anchor markers in a same linkage group (LG1) in both families, to which 66 markers were allocated, leading to a well saturated linkage group, with estimated genome coverage of 874.16 cM. / Dois mapas genéticos de ligação foram construídos referentes a duas famílias de irmãos completos (G1 e G2) da espécie de camarão marinho Litopenaeus vannamei e foi realizada a integração desses mapas. O mapeamento foi baseado em marcadores polimórficos derivados de nove primers AFLP (Polimorfismo no Comprimento de Fragmentos Amplificados). Um total de 103 e 59 marcadores polimórficos segregantes foram utilizados respectivamente para a construção dos mapas das famílias G1 e G2. O mapa da família G1 consistiu de 14 grupos de ligação, com cobertura estimada do genoma de aproximadamente 350 cM. O mapa da G2 apresentou 4 grupos de ligação, com cobertura do genoma de aproximadamente 300 cM. A integração dos mapas evidenciou 8 marcadores âncoras AFLP em um mesmo grupo de ligação (GL1) em ambas as famílias, no qual foram alocados 66 marcadores, o que conduz um grupo de ligação bem saturado, com estimativa de cobertura do genoma de 874,16 cM.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2953.pdf: 1029817 bytes, checksum: b1a6dda0d93021f958200ffaa7c6a6a2 (MD5) Previous issue date: 2008-07-08 / The genus Zungaro known as jaú, is composed by two species distributed along the rivers of South America: Zungaro jahu is found further south in the basin of the Paraná-Paraguay whereas Zungaro zungaro is found further north in the basin of the rivers Amazon and Orinoco. However, in the literature the classification and distribution of each of those species is still unclear and the basic information on the biology and natural history is scarce. In Brazil the jaú is listed as one of endangered species, over-exploited or threatened by overexploitation; however, the regulations fail to protect the jaú because they have mistakenly identified it as Zungaro zungaro. In Colombia, according to the freshwater species Red Book, the Zungaro zungaro has been declared endangered. Considering the limited information on the population genetics of these fish, the purpose of this study was to obtain the genetic characterization of the jaú population through mitochondrial and nuclear molecular markers. This purpose includes the following research questions: 1- Given the uncertainties encountered in the taxonomic genus Zungaro, is this group composed by two species, or are they two different populations? 2- Considering the jaú´s big size and the fact that they migrate long distances, would than mean that there is a population structure? and 3- The jaú´s endangered condition, its habitat´s changes and overfishing, could be responsible for a reduction of the genetic variation of these catfishes? In order to conduct the characterization we used molecular markers such as the mitochondrial cytochrome b gene, the nuclear gene RAG (Recombination Activation Gene) and the nuclear gene coding for ribosomal protein S7. Additionally, a total of eight polymorphic microsatellite loci capable of producing a considerable genetic variation was prospected. The population analysis of the genus Zungaro with mitochondrial and nuclear markers indicated the existence of a population structure among the individuals sampled. This result is due mainly to the differences between the populations of Pantanal - Paraná and the populations of Meta and Amazon; this finding supports the separation of these species. It was also found that these populations share a central haplotype, indicating a genetic cohesion in the genus, where the populations of Meta-Amazon had a greater number of derived haplotypes suggesting a possible population expansion. The occurrence of a unique and central haplotype to the populations of Pantanal- Parana from which the haplotypes of Meta and the Amazon are derived, when the gene RAG was used, would support the idea that these populations would be the center of dispersion and they would retain the ancestral haplotype. Regarding the prospected microsatellite loci, the results indicated they were efficient in the amplification and verification of polymorphism in Zungaro jahu, and were effective in heterologous amplification of other species of the Pimelodidae family. Statistical analyses on the microsatellites loci showed evidence of a single population of the Z jahu specie inhabiting the north and south Pantanal. In contrast, the two Z zungaro populations studied (the Meta River, basin of the Orinoco and the Amazon River) shown to be significantly different, indicating a population structure. In spite of the jaú being an endangered species, the results of the genetic variation showed values comparable to other species of fish. These results open the possibility of developing clear management programs specifically directed to each of these populations, seeking the protection and recovery of individual fish stocks. / O gênero Zungaro, conhecido como Jaú, está conformado por duas espécies distribuídas pelos rios da América do Sul. Zungaro jahu ocorre mais ao sul, na bacia do Paraná- Paraguai e Zungaro zungaro que ocorre mais ao norte, na bacia dos rios Amazonas e Orinoco. No entanto, na literatura ainda não existe clareza sobre a classificação e a distribuição da cada uma das espécies e informações básicas sobre a biologia e história natural são escassas. No Brasil o jaú encontra-se listado como uma das espécies ameaçadas de extinção, sobre-explotadas ou ameaçadas de sobre-explotação, no entanto, as normativas emitidas para proteger o jaú apresentam um erro de mencioná-lo como Zungaro zungaro. Na Colômbia, segundo o livro vermelho de espécies de água doce, o Zungaro zungaro encontra-se declarada como em perigo. Considerando a escassez de informações sobre a estrutura genética populacional desses peixes o objetivo do presente estudo foi, através de marcadores moleculares mitocondriais e nucleares, responder se dadas as incertezas taxonômicas encontradas no gênero Zungaro, este está conformado por duas espécies ou são simplesmente populações diferentes, se pelo fato do jaú ser um peixe de grande porte e, aparentemente, de grandes migrações, existe estruturação das populações e se conhecendo a condição de espécie ameaçada e dadas as alterações de habitat sofridas e a sobrepesca, isso já está refletindo numa redução da variação genética desses bagres. Para tanto, foram utilizados como marcadores moleculares como o gene mitocondrial do citocromo b, o gene nuclear RAG (Gene Ativador da Recombinação) e o gene nuclear que codifica para a proteína ribosomal S7, assim mesmo foi prospectado um total de oito locos microssatéllites polimórficos. A análise populacional do gênero Zungaro com os marcadores mitocondriais e nucleares indicou a existência de uma estrutura populacional entre os indivíduos amostrados. Esta estruturação é devida principalmente as diferenças encontradas entre as populações do Pantanal Paraná com relação às populações do Meta e Amazonas, corroborando a separação das espécies. Igualmente, foi encontrado que as populações compartilham um haplótipo central, indicando uma coesão genética no gênero onde as populações do Meta- Amazonas apresentaram um maior número de haplótipos derivados indicando uma provável expansão populacional. A ocorrência de um haplótipo exclusivo e central para as populações do Pantanal-Paraná do qual são derivados os haplótipos do Meta e Amazonas, quando utilizado o gene RAG, suportariam a idéia de que estas populações seriam o centro de dispersão e manteriam o haplótipo ancestral. Enquanto aos locos microssatélites prospectados estes foram eficientes na amplificação e verificação de polimorfismo em Zungaro jahu , assim como mostraram se eficientes na amplificação heteróloga para outras espécies da família Pimelodidae. As análises estatísticas mostraram evidencia da existência de uma única população da espécie Z jahu habitando o pantanal norte e sul. Em contraste, em Z zungaro as duas populações estudadas (do rio Meta, bacia do Orinoco, e do rio Amazonas) mostraram-se significativamente diferentes, evidenciando uma estruturação populacional. Os resultados de variação genética evidenciaram valores comparáveis a outras espécies de peixes de outras localidades, a despeito do jaú ser uma espécie ameaçada. Com esses resultados abre-se a possibilidade de estabelecer programas de manejo claros e dirigidos especialmente para cada uma das populações aqui estudadas visando a proteção e recuperação de cada um dos estoques pesqueiros.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseSMC.pdf: 1475573 bytes, checksum: 4f80d07f9aea9ed3c478641a4ab37393 (MD5) Previous issue date: 2004-06-29 / The PIT1 gene codes for the pituitary transcription factor Pit-1, which is critical for the activation of the expression of prolactin and growth hormone genes, in addition to participating in the activation of PIT1 itself. The objective of the present study was to investigate the effect of HinfI polymorphism of this gene on meat production traits. The sample consisted of 509 Canchim animals born between 1998 and 2000. The sample included a traditional line (GG1) consisting of 5/8 Charolais genome breed and 3/8 of the Zebu breeds, Nelore, Guzerá and Indubrasil, and a new line (GG2) with 21/32 Charolais genome and 11/32 of the Nelore breed. The genotypes for the PIT1 gene were identified by PCR-RFLP. Genotype effect on phenotypic values for birth weight (BW), standardized weaning weight (W240) and at 12 month of age weight (W365), and on average daily weight gain to the born at weaning (GMND) and to the weaning at 12 month of age (GMD12), were analyzed by the least squares method. The results revealed significant effects of the interaction between genetic animal group and PIT1 genotype on W240, GMND and GMD12 (P < 0.05). The differences in mean least squares between genotype ( / ) and genotypes (+/+) and (+/ ) for W240 and GMND were significant in GG2 (P < 0,01 and p < 0,05, respectively), revealing superiority of the ( / ) genotype on that characters. The means for genotypes (+/+) and (+/ ), respectively at the W240 and GMND, did not differ from one another, suggesting a dominance effect of the HinfI (+) allele. The means effects of the HinfI ( ) allele indicated a positive effect of this allele on W240 and GMND, and the deviation estimates attributed to dominance showed a favorable effect of the HinfI ( ) allele on W240 and GMND of GG2 animals, when present in homozygosis in the genotypes of the individuals. The means of the genotypes in GG1 did not differ from one another. The difference in PIT1 behavior observed in the two genetic groups, however, may suggest the action of a quantitative trait locus linked to PIT1 segregating only in GG2 of the population studied, and not a direct effect of PIT1. / O gene PIT1 codifica o fator de transcrição pituitário Pit-1, crítico para ativar a expressão dos genes da prolactina e do hormônio de crescimento, além de participar na ativação do próprio PIT1. Esta pesquisa teve por objetivo investigar o efeito do polimorfismo HinfI desse gene sobre caracteres de produção de carne em um rebanho da raça Canchim. A amostra foi constituída por 509 animais nascidos entre os anos de 1998 e 2000. A amostra incluiu uma linhagem tradicional (GG1) com média de 5/8 de genoma da raça Charolês e 3/8 das raças zebuínas Nelore, Guzerá e Indubrasil, e uma linhagem nova (GG2) com média de 21/32 de genoma de Charolês e 11/32 da raça Nelore. Os genótipos para o gene PIT1 foram identificados mediante técnica PCR-RFLP empregando a enzima HinfI. Os efeitos dos genótipos sobre valores fenotípicos para pesos ao nascimento (PN) e pesos padronizados à desmama (P240) e ao ano (P365), e sobre os valores de ganhos de peso médios diários do nascimento à desmama (GMND) e da desmama aos 12 meses de idade (GMD12) foram analisados pelo método dos quadrados mínimos. Os resultados revelaram efeitos significativos da interação entre grupo genético do animal e genótipo de PIT1 sobre P240, GMND e GMD12 (P < 0,05). As diferenças nas médias dos quadrados mínimos entre o genótipo ( / ) e os genótipos (+/+) e (+/ ) para P240 e para GMND foram significativas em GG2 (P < 0,01 e p < 0,05, respectivamente), revelando superioridade do genótipo ( / ). As médias dos genótipos (+/+) e (+/ ), referentes a P240 e GMND, não diferiram entre si, indicando efeito de dominância do alelo HinfI (+). As médias dos efeitos do alelo HinfI ( ) apontaram para efeito positivo deste alelo sobre P240 e GMND, e as estimativas de desvios atribuídos à dominância mostraram efeito favorável do alelo HinfI ( ), sobre P240 e GMND dos animais do grupo GG2, quando presente em homozigose nos genótipos dos indivíduos. Não houve diferenças significativas entre as médias dos três genótipos no grupo genético GG1. A diferença de comportamento de PIT1 observada nos dois grupos genéticos, entretanto, pode sugerir a ação de um QTL ( Quantitative Trait Locus) ligado ao gene PIT1 segregando apenas em GG2 da população estudada e não efeito direto de PIT1.

Em estudos prévios sobre a filogenia de Passiflora, as espécies P. actinia e P. elegans destacaram-se pela sua grande similaridade genética, apesar de sua classificação em séries taxonômicas distintas. As duas espécies apresentam distribuição geográfica muito diferente. Enquanto P. actinia é encontrada em áreas de Mata Atlântica desde o estado do Espírito Santo até o Rio Grande do Sul (RS), P. elegans está restrita ao RS e a poucas regiões limítrofes. Para melhor avaliar as relações evolutivas entre estas duas espécies foram realizadas coletas intensivas em todo o estado e desenvolvidos testes quanto às seqüências dos espaçadores intergênicos cloroplasmáticos trnL-trnF e psbA-trnH, e dos espaçadores transcritos dos genes ribossomais nucleares ITS de plantas de diferentes localidades. As análises revelaram uma baixa variabilidade intraespecífica, e evidenciaram um perfil genético próprio a cada espécie. Nas comparações interespecíficas, foram utilizadas seqüências de espécies do subgênero (Passiflora) estudadas previamente, pertencentes às séries Simplicifoliae e Lobatae, as mesmas de P. actinia e P. elegans, respectivamente. Nos três marcadores as menores distâncias genéticas encontradas foram entre estas duas espécies, sugerindo o pouco tempo de divergência entre elas. Estas comparações não mostraram diferenças marcantes nas diversidades dentro e entre as duas séries, indicando similaridade genética entre elas Apesar da intensa amostragem realizada na área limítrofe das distribuições de P. actinia e P. elegans, somente foi encontrado um híbrido entre as duas. Além do fenótipo morfológico intermediário, o híbrido pôde ser reconhecido através das suas características genéticas, o espaçador nuclear ITS apresentando padrão aditivo nos sítios variáveis destas duas espécies; as seqüências dos marcadores cloroplasmáticos foram iguais às de P. actinia, indicando que esta é a espécie doadora deste genoma. Os padrões genéticos e geográficos destas duas espécies sugerem que o processo de especiação que se desenvolveu entre as duas seja recente e tenha ocorrido em alopatria, estando provavelmente ligado aos eventos geológicos do Holoceno que influenciaram a migração da Mata Atlântica no RS. A investigação das características abióticas das regiões de ocorrência das espécies não apresentou grandes dissimilaridades, podendo indicar que a atual segregação espacial deva-se à fragmentação florestal ou que haja exclusão competitiva entre elas, pois apresentam nichos ecológicos muito semelhantes.

A introdução de culturas de sequeiro em solos de várzea é importante para o desenvolvimento da região sul do Brasil, uma vez que estas áreas estão sub aproveitadas com a cultura de arroz irrigado e a pecuária extensiva. O milho é uma alternativa para o melhor aproveitamento destas terras, logo o desenvolvimento de genótipos tolerantes ao encharcamento do solo é fundamental para viabilizar esta exploração. Neste sentido, os objetivos deste trabalho foram estudar a genética da tolerância ao encharcamento e identificar marcadores de DNA associados a esse caráter. O trabalho foi conduzido em casa de vegetação, sendo analisados genitores, híbridos F1 e populações segregantes provenientes de cruzamentos entre linhagens tolerantes e sensíveis ao encharcamento do solo. A análise molecular, através de marcadores de microssatélites, foi realizada com uma população F3, resultante do cruzamento entre os genótipos mais contrastantes para a tolerância ao encharcamento. A seleção dos marcadores obedeceu ao critério de amostrar todos os cromossomos, com preferência aos que estivessem ligados a genes pertencentes a rotas metabólicas envolvidas com a glicólise e a fermentação. Os genitores demonstraram a existência de variabilidade genética para os caracteres matéria seca de parte aérea (MSP) e matéria seca de raiz (MSR), sendo que os coeficientes de herdabilidades estimados foram elevados. Ambos os caracteres revelaram complexidade quanto ao número de genes envolvidos, onde a análise de QTL indicou a presença de pelo menos três locos envolvidos na manifestação da tolerância ao encharcamento. A ação gênica predominante foi a de dominância e o efeito materno foi pronunciado. Três marcadores explicaram conjuntamente 33,3% da variação para MSP e 19,9% para MSR, podendo ser úteis na seleção assistida para a tolerância ao encharcamento na fase de planta jovem em milho De maneira geral, a seleção fenotípica para MSP e MSR poderá ser uma alternativa eficiente na seleção de genótipos de milho com tolerância ao encharcamento do solo.

Pour appréhender l'histoire du peuplement autochtone de Guyane française, six populations indiennes (Palikur, Emerillon, Kaliña, Wayampi, Apalaí et Matsiguenga) ont été examinées pour les marqueurs de l'ADN mitochondrial et du chromosome Y, et trois testées pour sept loci autosomaux. Après extraction de l'ADN des sérums ou hématies prélevés sur le terrain, les fragments ont été amplifiés par PCR, analysés par digestion enzymatique et séquençage automatique à la recherche des composantes biologiques amérindiennes principales. Notre travail démontre que chez les populations amérindiennes, la dérive génétique n'explique pas toute la variabilité génétique. Notamment, l'interprétation associant anthropobiologie, ethnologie, linguistique et histoire a révélé son utilité. Enfin, ce travail a montré l'implication directe des groupes non amérindiens dans la dynamique de mise en place des populations indiennes de Guyane française.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós Graduação em Nutrição Humana, 2017. / Texto parcialmente liberado pelo autor. Conteúdo restrito: Capítulo 2. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-10-11T19:59:30Z No. of bitstreams: 1 2017_MarceladeSáBarretodaCunha_PARCIAL.pdf: 1462975 bytes, checksum: 628522b6736f85bb04227d6e4bab7eba (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-10-25T14:10:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_MarceladeSáBarretodaCunha_PARCIAL.pdf: 1462975 bytes, checksum: 628522b6736f85bb04227d6e4bab7eba (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-25T14:10:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_MarceladeSáBarretodaCunha_PARCIAL.pdf: 1462975 bytes, checksum: 628522b6736f85bb04227d6e4bab7eba (MD5) Previous issue date: 2017-10-25 / Nas últimas décadas houve um aumento do número de indivíduos idosos na população mundial, sendo necessário o contínuo desenvolvimento de pesquisas e políticas que promovam um envelhecimento saudável. O envelhecimento é um processo biológico caracterizado pelo predomínio de um estado pró-oxidante e pró-inflamatório, associado a menor eficiência das respostas antioxidantes e anti-inflamatórias. Alguns componentes dietéticos, como o ferro e os compostos fitoquímicos, podem alterar as respostas redox e imune e, consequentemente, modular o processo de envelhecimento. Desse modo, considerando que o tucum-do-cerrado (Bactris setosa Mart.) é um fruto do cerrado brasileiro rico em compostos fitoquímicos e com alto potencial antioxidante in vitro e in vivo, o presente estudo avaliou o efeito do consumo de tucum-do-cerrado nos marcadores moleculares associados ao envelhecimento, em ratos adultos suplementados ou não com ferro dietético. Métodos Trinta e dois ratos Wistar machos, adultos, foram tratados por 12 semanas com uma das seguintes dietas: dieta controle (CT; AIN-93G); dieta enriquecida com ferro (+Fe); dieta adicionada de 15% de tucum-do-cerrado (Tuc) ou dieta adicionada de 15% de tucum-do-cerrado e enriquecida com ferro (Tuc+Fe). A concentração de ferro nos tecidos foi determinada por espectrofotometria de emissão atômica e os parâmetros séricos de ferro utilizando kits comerciais. Os níveis de malondialdeído e proteínas carboniladas foram determinados no fígado, baço, intestino e rim e as atividades das enzimas antioxidantes foram determinadas no fígado e no rim, por espectrofotometria. As concentrações séricas de interleucina (IL)-1β, IL-6 e fator de fator de necrose tumoral-alfa (TNF-) foram determinadas por ELISA. Os níveis de mRNA da hepcidina (Hamp), do fator nuclear eritroide 2 relacionado ao fator 2 (Nfe2l2), da NAD(P)H: desidrogenase-(quinona)1 (Nqo1), da heme oxigenase 1(Hmox1), da interleucina 1-beta (Il1b), do fator de necrose tumoral-alfa (Tnfa), da proteína marcadora de senescência 30 (Smp30), da sirtuína 1 (Sirt1) e Sirt3 foram determinados no fígado e / ou rim, utilizando o sistema de reação da polimerase em cadeia em tempo real (qPCR). Os níveis da proteína Nrf2 no fígado, assim como das proteínas SIRT1 e SIRT3 no fígado e no rim, foram determinados por Western Blotting. As comparações entre os tratamentos foram feitas utilizando teste de comparações múltiplas (ANOVA) com correção de Bonferroni, sendo considerado estatisticamente diferente o valor de p < 0,05. Resultados O consumo da dieta enriquecida com ferro (+Fe) promoveu o aumento da concentração de ferro nos tecidos, dos parâmetros séricos de ferro; no fígado, aumentou os danos oxidativos a proteínas, a atividade de superóxido dismutase (SOD), o nível da proteína Nrf2, os níveis de mRNA da Hamp e da Nqo1 e os níveis séricos de IL-6 e TNF-α; além de ter reduzido os níveis de mRNA da Sirt1 no rim, comparados ao grupo CT. Os ratos tratados com dieta adicionada de tucum-do-cerrado (Tuc) apresentaram redução dos níveis de mRNA hepático da Hamp; aumento da atividade de SOD, dos níveis hepáticos de mRNA da Nfe2l2, Nqo1 e Sirt1, e das proteínas Nrf2 e SIRT1 no fígado, comparados ao CT. A associação de tucum-do-cerrado e ferro na dieta (Tuc+Fe) promoveu a redução dos níveis de mRNA da Hamp no fígado, apesar de não ter alterado o status de ferro, quando comparado ao grupo +Fe. No grupo Tuc+Fe foi observado ainda uma redução dos danos oxidativos a proteínas no fígado e de lipídios no rim, e uma redução marginal dos níveis séricos de IL-6, em relação ao grupo +Fe, bem como um aumento marginal da atividade de SOD no fígado, dos níveis hepáticos de mRNA e proteína da Nrf2, de mRNA da Nqo1 e da proteína SIRT1, em relação ao grupo CT; também apresentaram aumento de mRNA da Sirt1 no rim, em relação ao grupo +Fe. Conclusão Os resultados sugerem que o consumo de tucum-do-cerrado pode promover um efeito antienvelhecimento ativando a via relacionada à SIRT1-Nrf2, a qual atenua o processo oxidativo e inflamatório induzido pelo excesso de ferro. / In the last decades, the number of older people has increased worldwide. Therefore, the continuous development of researches and policies are necessary in an attempt to promote a healthier aging. Aging is a biological process characterized by an increased pro-oxidant and proinflammatory state, associated with inefficient antioxidant and anti-inflammatory responses. Some dietary components, such as iron and phytochemicals compounds, modulate both the redox and imune responses and, consequently, may modulate the aging process. Considering that tucum-do-cerrado (Bactris setosa Mart.) is a Brazilian savanna fruit rich in phytochemical compounds with a high antioxidant potential in vitro and in vivo, the present study investigated the effect of tucum-do-cerrado consumption on molecular markers associated with aging, in adult rats supplemented or not with dietary iron. Methods Thirty-two male adult Wistar rats were treated for 12 weeks with one of the following diets: control diet (CT, AIN-93G), iron-enriched diet (+ Fe), control diet + 15% tucum-do-cerrado (Tuc) or iron enriched-diet + 15% tucum-do-cerrado (Tuc+Fe). Total iron concentration in tissues was determined by atomic emission spectroscopy and the serum iron parameters were determined using commercial kits. Malondialdehyde and carbonyl protein levels were determined in the liver, spleen, intestine and kidney, and the activity of antioxidant enzymes were determined in the liver and kidney, using spectrophotometry. The serum concentration of the interleukins (IL)-1β, IL-6 and tumor necrosis factor-alpha (TNF-) were determined by ELISA. The mRNA levels of hepcidin (Hamp), nuclear factor erythroid 2–related factor 2 (Nfe2l2), NAD(P)H:dehydrogenase- (quinone) 1 (Nqo1), heme oxygenase-1 (Hmox1), interleukin 1-beta (Il1b), factor, tumor necrosis factor-alpha (Tnfa), senescence marker protein 30 (Smp30), sirtuin 1 (Sirt1) and Sirt3 were determined in the liver and / or kidney by the reverse transcription-polymerase chain reaction analysis (qPCR). Protein levels of Nrf2 in the liver, as well as the proteins levels of SIRT1 and SIRT3 in the liver and in the kidney, were determined by Western Blotting. The comparisons among the treatments were done using the multiple comparison test (ANOVA) with Bonferroni correction, and a value of p < 0.05 was considered statistically significant. Results The consumption of the iron enriched-diet (+Fe) promoted an increase of iron concentration in the analyzed tissues and in the serum iron parameters. In the liver, +Fe group showed an increase of protein oxidative damages, superoxide dismutase activity (SOD), Nrf2 protein levels and mRNA levels of Hamp and Nqo1, and IL-6 and TNF-α serum levels; and a decrease in Sirt1 mRNA levels in the kidney, compared with the CT group. The animals treated with the tucum-do-cerrado diet (Tuc) presented lower levels of hepatic Hamp mRNA levels; higher levels of SOD activity, hepatic mRNA levels of Nfe2l2, Nqo1 and Sirt1, and hepatic protein levels of Nrf2 and SIRT1, compared with the CT group. The association of tucum-do-cerrado with iron supplementation (Tuc+Fe) promoted a reduction of hepatic Hamp mRNA levels, but no difference was observed in iron status compared to the +Fe group. In Tuc+Fe group, it has been observed a reduction in oxidative damages to hepatic protein and renal lipids, and a marginal reduction in serum IL-6 levels, compared to the +Fe group, as well as a marginally increased hepatic SOD activity, higher mRNA and protein levels of Nrf2, Nqo1 mRNA and SIRT1 protein levels, in relation to the CT group; and also, an increase of the Sirt1 mRNA levels in the kidney, compared to the +Fe group. Conclusion These results suggested that tucum-do-cerrado might promote healthier aging by increasing SIRT1 expression and consequently partially activating Nrf2-related pathway, which attenuates oxidative and inflammatory responses.

O gênero Mimosa, dividido nas seções Mimadenia, Batocaulon, Calothamnos, Habbasia e Mimosa, possui cerca de 530 espécies, e, destas, cerca de 490 ocorrem nas Américas, ocupando diferentes tipos de habitats. No Brasil, ocorrem principalmente no Cerrado, uma zona de alta biodiversidade. Muitas espécies de grande importância econômica e, dentre elas, destaca-se M. scabrella, arbórea nativa da região Sul do Brasil. Apesar da grande importância do gênero, poucos são os estudos de citogenética. Portanto, o objetivo maior do presente trabalho foi determinar o número cromossômico de um grande número de espécies de Mimosa e tentar estabelecer relações entre distribuição dos níveis de ploidia com posição taxonômica, filogenética e distribuição geográfica. O outro objetivo foi de analisar um grande número de populações de M. scabrella, da região Sul do Brasil, quanto ao número cromossômico e caracterizar sua variabilidade utilizando marcadores moleculares do tipo RAPD. Os resultados, que aumentaram o número de determinações de número cromossômico para o gênero de 10% para mais de 20% dos táxons, são inéditos para 83% das espécies estudadas. O nível diplóide, 2n=2x=26, foi verificado em 76% das espécies. Das demais espécies, 24% são tetraplóides (2n=4x=52), e uma triplóide (2n=3x=39). Variabilidade intraespecífica, com acessos di e tetraplóides, foi verificada em M. pigra var. dehiscens, M. setosa var. paludosa e M. somnians. Com exceção de Mimadenia, onde só uma espécie foi estudada, poliplóides estão presentes em todas as seções taxonômicas. Os resultados indicam que o número cromossômico não é uma característica citotaxonômica distintiva e a poliploidia não foi um fator decisivo para a evolução deste gênero. Células polissomáticas, em ponta de raiz, foram observadas em 43 espécies, com freqüência que variou de 3 a 86%, mas somente logo após a germinação das sementes, não sendo verificado em plantas adultas, sugerindo que a polissomatia parece estar relacionada com um rápido desenvolvimento e estabelecimento da plântula, logo após a germinação. As 25 populações de M. scabrella estudadas foram todas tetraplóides. O resultado da análise molecular RAPD mostrou que a similaridade genética média entre as populações variou de 0,18 a 0,48, indicando grande variabilidade interpopulacional. Os resultados deste trabalho representam uma importante contribuição para um melhor conhecimento do gênero Mimosa. / The genus Mimosa, divided in sections Mimadenia, Batocaulon, Calothamnos, Habbasia and Mimosa, has around 530 species and, from these, approximately 490 occur in the Americas , in a wide range of habitats. In Brazil, they occur mainly in the Cerrado, an area of high biodiversity. Many species are of great economic importance, and among them is M. scabrella, a tree native to southern Brazil. Despite the great importance of the genus, cytogenetic studies are few. Therefore, the main objective of this work was to determine chromosome numbers is a great number of Mimosa species and try to correlate ploidy levels with taxonomic and phylogenetic position and geographic distribution.The other objective was to analyze a great number of M. scabrella populations from southern Brazil regarding chromosome number and genetic variability using RAPD markers. The results, that increased the number of chromosome number determinations for the genus from 10% to more than 20% of the taxa are original for 83% of the studied species. The diploid level 2n=2x=26, was verified in 76% of the species. Among the others, 24% are tetraploid (2n=4x=52), and one triploid (2n=3x=39). Intraspecific variability, with diploid and tetraploid accessions, was found in M. pigra var. dehiscens, M. setosa var. paludosa and M. somnians. With the exception of Mimadenia section, with only one species studied, polyploids occur in all the taxonomic sections. The results indicate that chromosome number is not a distinctive cytotaxonomic characteristic and that polyploidy was a decisive factor in the genus evolution. Polysomatic root-tip cells were found in 43 species, ranging from 3 to 86%, but only soon after seed germination and not in adult plants, suggesting that polysomaty is related to a rapid seedling development and establishment after germination. The 25 M. scabrella populations studied were all tetraploid. RAPD molecular analysis disclosed an average similarity index among populations ranging from, 0.18 to 0.48, indicating great interpopulational variability. The results of this work represent an important contribution to a better knowledge of genus Mimosa.