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TESTE IMUNOENZIMÁTICO COM BASE EM ANTICORPO MONOCLONAL PARA A DETECÇÃO DE ANTICORPOS CONTRA HERPESVÍRUS BOVINO TIPOS 1 E 5. / A MONOCLONAL ANTIBODY-BASED ENZYME-LINKED IMMUNOSORBENT ASSAY FOR DETECTION OF ANTIBODIES TO BOVINE HERPESVIRUSES 1 AND 5

Bauermann, Fernando Viçosa 11 September 2009 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This dissertation reports the standardization of a monoclonal antibody (MAb)-based immunoenzymatic test (ELISA) for detection of antibodies to bovine herpesvírus types 1 and/or 5 (BoHV-1 and BoHV-5). The initial steps involved the determination of the most suitable MAb, the appropriate dilutions of viral antigen and test sera; and the cut-off value of the assay. After standardization, the ELISA was validated by testing 506 cattle serum samples previously tested for neutralizing antibodies to BoHV-1 and BoHV-5 by virus neutralizing (VN) assay. Comparing to the VN for BoHV-1 antibodies, the ELISA presented sensitivity and specificity of 96.6% and 98.3%, respectively. Positive and negative predictive values were 97.6%, the concordance between the tests was 97.6% and the coefficient of correlation k (kappa) was 0.95, demonstrating an excellent correlation. Comparing to the VN for BoHV-5 antibodies, the ELISA presented 94.3% of sensitivity, 97.9% of specificity, 97.1% of positive predictive value, 95.9% negative predictive value, concordance of 96.4% and kappa coefficient of 0.92. These results demonstrate that the ELISA presents suitable specificity and sensitivity to be used for individual and herd serological diagnosis of BoHV-1 and BoHV-5, thus, representing an alternative for VN assays and imported ELISA kits. / Essa dissertação relata a padronização de um teste imunoenzimático do tipo ELISA, com base em anticorpo monoclonal (AcM), para a detecção de anticorpos séricos que reagem contra herpesvírus bovino tipos 1 e/ou 5 (BoHV-1, BoHV-5). Inicialmente, determinou-se o AcM mais adequado para a sensibilização das placas, as diluições apropriadas do antígeno e dos soros-teste e o ponto de corte do ensaio. Após a padronização, o ensaio foi validado testando-se 506 amostras de soro bovino, previamente testadas para anticorpos neutralizantes contra o BoHV-1 e/ou BoHV-5 pela técnica de soroneutralização (SN). Comparando-se com os resultados da SN frente ao BoHV-1, o teste de ELISA apresentou sensibilidade e especificidade de 96,6% e 98,3%, respectivamente. Os valores preditivos positivo e negativo foram de 97,6%, a concordância foi de 97,6% e o índice de correlação (kappa) entre os testes foi de 0,95, o que indica uma excelente concordância. Comparando-se com os resultados da SN frente ao BoHV-5, o ELISA apresentou 94,3% de sensibilidade; 97,9% de especificidade; 97,1% de valor preditivo positivo e 95,9% de valor preditivo negativo. Para o BoHV-5, a concordância entre os testes foi de 96,4% e o índice de correlação foi de 0,92, também excelente. Esses resultados demonstram que o teste padronizado apresenta sensibilidade e especificidade adequados para o diagnóstico sorológico das infecções pelo BoHV-1 e BoHV-5 em nível individual e de rebanho. Dessa forma, o ensaio pode se constituir em alternativa para o teste de SN e para os kits de ELISA importados.
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Ecologia de Culex quinquefasciatus e de Culex nigripalpus no Parque Ecológico do Tietê, São Paulo, Brasil / Ecology of Culex quinquefasciatus and Culex nigripalpus at the Parque Ecológico do Tietê, São Paulo, Brasil.

Gabriel Zorello Laporta 19 October 2007 (has links)
Introdução - Culex quinquefasciatus é um mosquito sinantrópico que causa incômodo à população humana e é relacionado com a transmissão de nematóides ou arbovírus em áreas endêmicas, respectivamente, do litoral brasileiro e da América Central ou do Norte. Culex nigripalpus é um mosquito hemi-sinantrópico que possui a capacidade de se dispersar para as áreas antrópicas e transmitir Saint Louis Virus e Equine Encephalitis Virus, respectivamente, na América do Norte e Venezuela. Objetivo - Caracterizar o hábito alimentar de Culex nigripalpus e a densidade, a sobrevivência e o hábito alimentar de Culex quinquefasciatus no Parque Ecológico do Tietê (PET), São Paulo. Métodos - O PET é uma Área de Preservação Ambiental com animais residentes ou migratórios. As amostras de mosquitos adultos foram coletadas, mensalmente, em quatro áreas no PET, durante um ano e por meio de aspirador à bateria. O método de ELISA indireto foi empregado para a identificação do hospedeiro que é fonte alimentar ao mosquito. A densidade da população de Cx. quinquefasciatus foi estimada pelo método de marcação, soltura e recaptura na vegetação da margem de um canal no PET. Amostras de fêmeas de Cx. quinquefasciatus desse local foram dissecadas ou acompanhadas em laboratório para estimativa da taxa de sobrevivência. Resultados – A proporção de repastos sangüíneos de Cx. quinquefasciatus e de Cx. nigripalpus foi, respectivamente, 6,5 e 8,3% em humanos, 18,8 e 27,7% em cães, 7,4 e 2,3% em galinhas, 2,8 e 9,0% em ratos, 3,2 e 8,3% em múltiplos hospedeiros e 67,7 e 60,9% em hospedeiros não identificados. Human Blood Index para Cx. quinquefasciatus e Cx. nigripalpus foi, respectivamente, 0,20 e 0,17. Feeding Index entre os hospedeiros homem/cão, homem/galinha e homem/rato foi, respectivamente, 0,35, 0,63 e 2,65 para Cx. quinquefasciatus e 0,30, 2,56 e 1,05 para Cx. nigripalpus. A distribuição de repastos sangüíneos teve associação significante estatisticamente com as fêmeas de Cx. nigripalpus em estádio de Sella 2 coletadas em todas as áreas do PET. A densidade de Cx. quinquefasciatus para uma área de 2.520 m2 foi 7.262±1.537. A proporção de paridas, a duração do ciclo gonotrófico e a taxa de sobrevivência foram, respectivamente, igual a 0,48, 4,75 (CL 95% = 4,3-5,2) e 0,86, estimados para a população de Cx. quinquefasciatus. Conclusões – Cães e galinhas foram hospedeiros importantes para Cx. quinquefasciatus, enquanto que cães foram hospedeiros importantes para Cx. nigripalpus. O repasto sangüíneo é mais bem detectado pelo ELISA indireto em fêmeas no estádio de Sella 2. A sobrevivência e a densidade de Cx. quinquefasciatus indicam que essa espécie é epidemiologicamente relevante na área do PET como espécies vetora ou peste urbana. Essa espécie deve ser objetivo do programa de controle de vetores no município de São Paulo. / Introduction - Culex quinquefasciatus has high synanthropy, infest human dwellings and is vector of nematoids and arbovirus from endemic areas, respectively, in Brazilian coast and in Central or North America. Culex nigripalpus has average synanthropy and can disperse through the anthropic environment carrying Saint Louis Virus and Equine Encephalitis Virus, respectively, in North America and Venezuela. Objective - To characterize host-feeding habit of Culex nigripalpus and density, survival and host-feeding habit of Culex quinquefasciatus in the Parque Ecológico do Tietê (PET), São Paulo. Methods - The PET is an Area of Environmental Protection with resident or migratory animals. The samples of adult mosquitoes were collected, monthly, in four areas in the PET, during one year and by means of a backpack battery aspirator. An indirect ELISA technique was used for the identification of the host that is an alimentary source for the mosquito species. The density of Cx. quinquefasciatus population was estimated using the Mark, Release and Recapture method on the vegetation of the edge of a canal in the PET. Samples of females of Cx. quinquefasciatus from this place were dissected or followed in laboratory for estimating the survival rate. Results – Cx. quinquefasciatus and Cx. nigripalpus fed on human 6.5 and 8.3%, dog 18.8 and 27.7%, chicken 7.4 and 2.3%, rat 2.8 and 9.0%, multiple hosts 3.2 and 8.2% and unidentified hosts 67.9 and 60.9%, respectively. The unweighted human blood index (HBI) values were 0.20 for Cx. quinquefasciatus and 0.17 for Cx. nigripalpus populations. The feeding index values between the hosts human/dog, human/chicken and human/rat were, respectively, 0.35, 0.63 and 2.65 for Cx. quinquefasciatus and 0.30, 2.56 and 1.05 for Cx. nigripalpus. The distributions of blood-meals had statistically significant association on Sella 2 stage of the Cx. nigripalpus collected in all areas at the PET. The density of Cx. quinquefasciatus for an area of 2,520 m2 was 7,262±1,537. The proportion of parous, gonotrophic cycle length and survival rate were, respectively, equal to 0.48, 4.75 (CL 95% = 4.3-5.2) and 0.86, for Cx. quinquefasciatus population. Conclusions – Dogs and chickens are important hosts for Cx. quinquefasciatus, whereas dog is an important host for Cx. nigripalpus. The host-blood of females in Sella 2 stage increases sensibility of the indirect ELISA assay. The survivorship and the density of Cx. quinquefasciatus indicate that these species are epidemiologically relevant in the PET area as either a pest or vector species. Those species should be a goal of the vector control program of Sao Paulo municipality.
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Prevalência das infecções pelo vírus da leucemia viral felina e da imunodeficiência viral felina na cidade de Porto Alegre

Silva, Flávio Roberto Chaves da January 2007 (has links)
O vírus da imunodeficiência felina (FIV) é um membro da subfamília Lentivirinae da família Retroviridae. A infecção é caracterizada por imunodepressão com um declíneo progressivo dos linfócitos T CD4+, propiciando, desta maneira, o surgimento de infecções oportunistas. Já o vírus da leucemia viral felina (FeLV) pertence a subfamília Oncovirinae da família Retroviridae. Este vírus é um importante patógeno dos gatos domésticos que causa uma variedade de desordens neoplásicas e degenerativas e também apresenta distribuição mundial. O presente estudo compreendeu um levantamento da prevalência das infecções por FIV e FeLV no Município de Porto Alegre. Foram analisadas 65 amostras de gatos sadios e doentes. A detecção destas viroses foi realizada utilizando um “kit” comercial de ELISA para ambas as viroses e um protocolo de reação em cadeia da polimerase aninhada (Nested-PCR) para detecção do FIV. Os resultados demonstraram que 21,5% (14/65) dos gatos foram positivos para FIV combinado os resultados de ambos os testes, 10,8% (7/65) foram positivos para FeLV e 6,1% (4/65) foram positivos para ambos os vírus. Foram também realizados hemogramas de 48 animais, dos quais 8 apresentaram resultados positivos para FIV na Nested-PCR. Através do teste T de Student, verificou-se que não houve diferença significativa nos valores hematológicos destes animais. Conclui-se que a utilização do ELISA com a PCR dobrou a chance de detecção de gatos FIV positivos. Desta forma, a prevalência de FIV foi aproximadamente o dobro do que a de FeLV, ao contrário do que ocorre na maior parte de outros locais estudados. / Feline immunodeficiency virus (FIV) belongs to the Lentivirinae subfamily of the Retroviridae family. The infection is characterized by immunodepression and progressive decline in CD4+ T cells that may render the animal susceptible to opportunistic infections. Feline leukemia virus (FeLV) belongs to subfamily Oncovirinae of the Retroviridae family. The virus also affects domestic cats, being an important pathogen that causes a variety of neoplastic disorders and degenerative diseases. Both viruses have a worldwide distribution. The present study aims to determine the prevalence of infection with FIV and FeLV in Porto Alegre municipality. A total of 65 cats were tested, comprising healthy and sick cats. A commercial ELISA kit was used to detect anti-FIV antibodies and FeLV antigen. A nested polymerase chain reaction (Nested-PCR) was also used for FIV provirus detection. The results showed that 21.5% of the sampled cats were positive for FIV in the ELISA and Nested-PCR, 10.8% were positive for FeLV in the ELISA and 6.1% were positive for both viruses. Haemogram of 48 animals were performed but it was not found any significant association between hematologic values of FIV positive and negative animals. It was concluded that the use of ELISA and Nested-PCR increased the possibility to detect FIV positive cats. The prevalence of FIV infected cats was higher than the prevalence of FeLV positive cats, the opposite of what is normally found in studies performed in other regions.
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PREVALÊNCIA DO VÍRUS ZIKA EM DOADORES DE SANGUE DE UM SERVIÇO DE HEMOTERAPIA DA REGIÃO SUL DO BRASIL

Diefenbach, Cristiane Fração 21 December 2017 (has links)
Submitted by MARCIA ROVADOSCHI (marciar@unifra.br) on 2018-08-21T13:27:45Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CristianeFracaoDiefenbach.pdf: 3471815 bytes, checksum: 5340dde1fa83817a1b28da306684977c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-21T13:27:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_CristianeFracaoDiefenbach.pdf: 3471815 bytes, checksum: 5340dde1fa83817a1b28da306684977c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-21 / The Zika Virus (ZIKV) is a flavivirus, which is responsible for causing an emerging arbovirosis in Brazil what is primarily transmitted by the bite of infected mosquitoes of the genus Aedes. A much discussed transmission route lately is blood transfusion due to the large number of asymptomatic cases and the epidemic potential of ZIKV that causes epidemics of great proportions. As such, asymptomatic individuals may contaminate blood components and thereby participate in the transfusion transmission of this infection. The disease has a benign clinical picture but serious clinical consequences have been reported, such as Guillain-Barré syndrome (GBS) and fetal malformations such as microcephaly. Due to this fact, recently, the Health Ministry (HM) declared the infection by ZIKV a Public Health Emergency of National Importance (PHENI). Thus, the major challenge for blood banks is the transfusion prevention of ZIKV due to lack of licensed laboratory routine tests for blood donor screening. In the South region of Brazil there is no epidemiological study in this population. This study will allow a robust assessment of the current epidemiological situation in this region. The objective of the study is to estimate the seroprevalence and asymptomatic viremia of ZIKV in blood donors of a Hemotherapy Service in the southern region of Brazil. In this study, blood samples were collected from 500 donors in the period from December 2016 to January 2017. The biological materials were tested for the presence of ribonucleic acid (RNA) from ZIKV, by means of real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) test by commercial kit (TaqPath™ Zika Virus Kit (ZIKV) and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) serologically assessed for anti-ZIKV IgG using Anti-Zika Virus ELISA IgG kit (Euroimmun, Medizinische Labordiagnostika AG, Lübek, Germany). No samples showed positive results for ZIKV RNA, which shows the low risk of transfusion transmission in the region studied. However, the serologically assessed showed the detection of a properly positive sample for anti-ZIKV IgG (0.55%) and 4 samples with optical density (OD) values in the gray zone of the test. Due to the high rate of cross-reaction between the different flaviviruses all samples (including the positive) were assessed to confirmatory testing for anti-DENV IgG (Anti-Dengue Virus ELISA IgG, Euroimmun, Medizinische Labordiagnostika AG, Lübek, Germany). The positive sample for anti-ZIKV IgG was negative for anti-DENV IgG, confirming the positive result for anti-ZIKV IgG. However, 3 gray zone seroreactive samples showed very high title of anti-DENV IgG and one remained in the gray zone. Confirmatory analysis of this sample using in-house ELISA with anti-DENV IgG antibody adsorption revealed that it was negative for anti-DENV IgG. This indicates a 0.55% seroprevalence of ZIKV in the Santa Maria-RS region. Our results demonstrate that the transfusional risk of ZIKV in the South of the Country is relatively low, however, it cannot be underestimated and serological analyses of large numbers of samples are required to determine the exact seroprevalence of anti-ZIKV and anti- DENV IgG in blood donors in the region of Santa Maria. / O vírus Zika (ZIKV) é um flavivírus responsável por causar uma arbovirose emergente no Brasil que é transmitido principalmente por picada de mosquitos infectados do gênero Aedes. Uma via de transmissão muito discutida ultimamente é a transfusão de sangue devido ao grande número de casos assintomáticos e o potencial epidêmico do ZIKV que causa epidemias de grandes proporções. Nessas ocasiões, os indivíduos assintomáticos podem contaminar hemocomponentes e deste modo participar na transmissão transfusional dessa infecção. A doença tem quadro clínico benigno, porém consequências clínicas graves têm sido relatadas, tais como a síndrome de Guillain-Barré (SGB) e malformações fetais como microcefalia. Diante desse fato, recentemente, o Ministério da Saúde (MS) declarou a infecção por ZIKV como uma Emergência em Saúde Pública de Importância Nacional (ESPIN). Assim, o principal desafio para bancos de sangue é a prevenção transfusional do ZIKV devido a falta de teste de rotina laboratorial licenciado para triagem de doadores de sangue. Na região Sul do Brasil não há nenhum estudo epidemiológico nessa população. Este estudo permitirá de uma forma robusta avaliar a situação atual epidemiológica nessa região. O objetivo do estudo é estimar a soroprevalência e a viremia assintomática do ZIKV em doadores de sangue de um Serviço de Hemoterapia da região sul do Brasil. Neste estudo foram coletadas amostras sanguíneas de 500 doadores voluntários de sangue no período de dezembro de 2016 a janeiro de 2017. Os materiais biológicos foram testados pela presença do ácido ribonucleico (RNA) do ZIKV, por meio de um teste de reação em cadeia da polimerase por transcrição reversa (RT-PCR) em tempo real por kit comercial TaqPath™ Zika Virus Kit (ZIKV) e inquérito sorológico por teste de imunoabsorbância ligada a enzima (ELISA) Anti-Zika Virus ELISA IgG kit (Euroimmun, Medizinische Labordiagnostika AG, Lübek, Alemanha). Nenhuma amostra mostrou resultado positivo para o RNA do ZIKV, o que mostra o baixo risco de transmissão transfusional na região estudada. No entanto, o inquérito sorológico revelou a detecção de uma amostra devidamente positiva para anti-ZIKV IgG (0.55%) e 4 amostras com valores de densidade ótica (DO) na zona cinza do teste. Devido a alta taxa de reação cruzada entre os diferentes flavivírus todas as amostras (incluindo a positiva) foram submetidas a teste confirmatório para anti-DENV IgG (Anti-Dengue Virus ELISA IgG, Euroimmun, Medizinische Labordiagnostika AG, Lübek, Alemanha). A amostra positiva para anti-ZIKV IgG foi negativa para anti-DENV IgG, confirmando o resultado positivo para anti-ZIKV IgG. No entanto, três amostras sororeagentes na zona cinza mostraram título muito elevado de anti-DENV IgG e uma permaneceu na zona cinza. Análise confirmatória dessa amostra via utilização de ELISA in house com adsorção de anticorpo anti-DENV IgG revelou que a mesma é negativa para anti-DENV IgG. Isso demonstra uma soroprevalência de 0.55% de ZIKV na região de Santa Maria-RS. Nossos resultados demonstram que o risco transfusional do ZIKV no Sul do país é relativamente baixo, contudo, não pode ser subestimado e análises sorológicas de grande número de amostras são necessárias para determinação da soroprevalência exata do anti-ZIKV e anti-DENV IgG em doadores de sangue na região de Santa Maria.
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Contribuição ao estudo epidemiológico da Leishmaniose Visceral Canina por técnicas diretas e indiretas no município de Goiânia / Contribution for the epidemiological study of Visceral Leishmaniose by direct and indirect techniques in Goiânia

AZEVEDO, Elisa Maria Rennó 13 August 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Elisa M R Azevedo.pdf: 722969 bytes, checksum: 9e335992daabd50fc7361968e93df415 (MD5) Previous issue date: 2009-08-13 / Canine visceral leishmaniasis (CVL) is a chronic zoonosis caused by a protozoan called Leishmania (Leishmania) chagasi and has as vectors, the sandflies Lutzomyia longipalpis and Lutzomyia cruzi. The domestic dog is the most important reservoir in urban areas considering the zoonotic disease form and is responsible for maintaining the parasite in endemic foci. Aiming to assist the Superintendent of Policies for Comprehensive Health Care / Health State Department of Goiás (Spais / SES-GO) and the Department of Zoonosis Control from Goiânia (GO-DCZ) in epidemiological surveillance of the disease, this work investigated possible cases of CVL by using laboratory analysis. For this study, dogs seen at the Veterinary Hospital, School of Veterinary Medicine, Federal University of Goiás (HV / EV / UFG) with clinical suspicion of disease and symptomatic and asymptomatic dogs captured by DCZ-GO were analyzed. A total of 214 dogs were evaluated, and classified into three groups. Group 1 (GI): 33 dogs from DCZ with at least three clinical signs suggestive of LVC, Group 2 (GII): 141 clinically healthy dogs from DCZ and Group 3 (GIII): 40 dogs seen at the HV / EV / UFG with clinical suspicion of LVC. The frequency of animals classified as positive with different methods of diagnosis used in this study were: 5.6% (n = 12) in ELISA test, 9.35% (n = 20) in IFAT, 2.80% (n = 6) in the direct parasitological examination of skin imprints; 2.34% (n = 5) in direct parasitological examination of lymphonode, and 3.17% (n = 7) in PCR reactions of both the genderspecific protocol and the L. chagasi-specific. Considering the results and the conditions of the present study, it is concluded that there is casuistry in CVL series of symptomatic or asymptomatic dogs clinically attended in the city of Goiânia. The occurrence of Leishmania chagasi bearer dogs captured in the municipality of Goiânia were detected and the symptoms frequently observed in illness dogs carriers of L. chagasi in Goiânia are: conjunctivitis, lymphadenopathy, skin changes, cachexia and onychogryphosis. / A Leishmaniose Visceral Canina (LVC) é uma zoonose crônica causada por um protozoário denominado Leishmania (Leishmania) chagasi e possui como vetores, os flebotomíneos Lutzomyia longipalpis e Lutzomyia cruzi. O cão doméstico é o reservatório mais importante nos meios urbanos, sendo responsável pela manutenção do parasita nos focos endêmicos. Este trabalho investigou laboratorialmente possíveis casos de LVC. Nesta investigação utilizou-se cães atendidos no Hospital Veterinário da Escola de Veterinária da Universidade Federal de Goiás (HV/EV/UFG) com suspeita clínica da doença e cães errantes sintomáticos e assintomáticos capturados pelo DCZ-GO. Nestes locais foram atendidos 214 cães, classificados em três grupos. Grupo 1 (G1): 33 cães do DCZ com no mínimo três sinais clínicos sugestivos para LVC; Grupo 2 (G2): 141 cães do DCZ clinicamente hígidos e Grupo 3 (G3): 40 cães atendidos no HV/EV/UFG com suspeita clínica de LVC. A frequência de animais classificados como positivos, aos diferentes métodos de diagnóstico empregados neste estudo foram: 5,6% (n=12) pelo ELISA-teste; 9,35% (n=20) à RIFI; 2,80% (n=6) ao exame parasitológico direto de imprints de pele; 2,34% (n=5) ao exame parasitológico direto de linfonodo; e 3,17% (n=7) para as reações de PCR. Este trabalho é pioneiro na investigação da Leishmaniose Visceral Canina no município de Goiânia, Goiás. Outros trabalhos devem ser conduzidos continuadamente, visando à investigação sistemática da doença neste e em outros municípios do estado.Considerando os resultados alcançados e as condições em que foi realizado o presente estudo, conclui-se que há casuística de LVC para cães sintomáticos ou assintomáticos, os quais buscam atendimento clínico-ambulatorial na cidade de Goiânia; existe ocorrência de portador de infecção por Leishmania chagasi entre cães vadios capturados no município de Goiânia; os testes de diagnóstico ELISA e RIFI apresentam resultados apenas moderadamente concordantes para o diagnóstico sorológico da LVC; os exames parasitológicos e PCR conduzidos a partir de amostras de pele e linfonodo apresentam resultados equivalentes para o diagnóstico da LVC.
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Estudo epidemiológico da coinfecção por toxoplasma gondii e pelo vírus da imunodeficiência felina em gatos domésticos (felis catus) em Goiânia, Goiás / Epidemiological study of the coinfection by toxoplasma gondii and by the feline immunodeficiency virus in domestic cats (felis catus) in Goiânia, Goiás

Costa, Rebeka Cristine de Bastos 25 August 2015 (has links)
Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-01-14T16:38:41Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rebeka Cristine de Bastos Costa - 2015.pdf: 2127820 bytes, checksum: 8789b51096d386c4def09d0d1ee4da0d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-01-15T09:55:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rebeka Cristine de Bastos Costa - 2015.pdf: 2127820 bytes, checksum: 8789b51096d386c4def09d0d1ee4da0d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-15T09:55:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rebeka Cristine de Bastos Costa - 2015.pdf: 2127820 bytes, checksum: 8789b51096d386c4def09d0d1ee4da0d (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-08-25 / Toxoplasmosis is a zoonotic disease in which mammals and birds can join the cycle as intermediate hosts, and felids as definitive hosts. Felis catus is recognized as the main responsible for the environmental contamination by Toxoplasma gondii oocysts. Serological diagnosis reveals little about the elimination of oocysts of T. gondii into the environment, principally by F. catus, which plays an important role in Public Health. There are few data on the frequency of feline toxoplasmosis in the State of Goiás. Therefore, the aim of this research was to evaluate the frequency of toxoplasmosis infection in domestic cats and their potential role in its transmission through the oocyst elimination into the environment and the respective factors associated with the infection. For this, we collected 102 blood samples and 98 fecal samples from 102 cats from Goiânia, State of Goiás. The animals were divided into groups according to age, gender and free access to the street or not. Indirect hemagglutination test was performed to determine the level of anti-T. gondii and indirect ELISA for the detection of infection by feline immunodeficiency virus (FIV). For search and detection of T. gondii oocysts elimination in the feces of cats we performed a centrifugal-flotation with Sheather's solution, subsequently we extracted DNA and used conventional PCR. The results showed that 18.63% (19/102) of the cats were positive for T. gondii, with titers ranging from 1:32 to 1: 8.192, while none of the fecal samples were positive in the PCR. The frequency of positive animals for FIV was 55.91% (52/93), and 18.28% (17/93) presented coinfection. By multivariate logistic regression we found the associated factors were the same for both infections, but one did not interfere with another. The factors associated with infection by T. gondii and feline immunodeficiency virus were free life and age under six months, since the sex was not statistically related to any of the illnesses. / A toxoplasmose é uma zoonose na qual, mamíferos e aves podem participar do seu ciclo como hospedeiros intermediários e os felídeos como hospedeiros definitivos. O Felis catus é reconhecido como o principal responsável pela contaminação ambiental por oocistos de Toxoplasma gondii. O diagnóstico sorológico pouco revela sobre a eliminação de tal fase no ambiente, o que representa o real impacto daquela espécie na Saúde Pública frente à toxoplasmose. São escassos os dados da frequência da toxoplasmose felina no Estado de Goiás. Assim sendo, objetivou-se com esta pesquisa avaliar a frequência da infecção da toxoplasmose em gatos domésticos e o seu potencial papel na sua transmissão, através da eliminação de oocistos no ambiente e dos respectivos fatores associados à infecção. Para isto, foram coletadas 102 amostras de sangue e 98 amostras fecais, de 102 gatos provenientes de Goiânia-Goiás. Os animais foram divididos em grupos de acordo com a faixa etária, gênero e livre acesso à rua ou não. Foi realizada a hemaglutinção indireta para a determinação do nível de anticorpos anti-T. gondii e o ELISA indireto para a detecção da infecção pelo vírus da imunodeficiência felina (FIV). Para a pesquisa e detecção da eliminação de oocistos de T. gondii nas fezes dos gatos foi feita a centrifugo-flutuação em solução de Sheather, posterior extração de DNA e realização da PCR convencional. Os resultados revelaram que 18,63% (19/102) dos gatos foram positivos para o T. gondii, com títulos variando entre 1:32 a 1:8.192, sendo que nenhuma das amostras fecais foi positiva na PCR. A frequência de positivos para o FIV foi de 55,91% (52/93), com coinfecção de 18,28% (17/93). Com a regressão logística multivariada verificou-se que os fatores associados foram os mesmos para as duas infecções, porém uma não interferiu diretamente na outra. Os fatores associados para a infecção pelo T. gondii e pelo vírus da imunodeficiência felina foram a vida livre e a idade igual ou superior a seis meses, já o gênero não apresentou relação estatística com nenhuma das enfermidades.
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Aplicação de um algoritmo para avaliação do desempenho de testes diagnósticos para dengue durante epidemia no Centro-Oeste, Brasil (2012-2013) / Testing algorithm in performance evaluation of dengue diagnostic tests during epidemia in Central-West, Brazil (2012-2013)

Botelho, Pedro Henrique Dias 20 April 2017 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-23T11:18:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Pedro Henrique Dias Botelho - 2017.pdf: 2156209 bytes, checksum: 7548059cd0e4b1077f097a09aa4fd4eb (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-23T11:19:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Pedro Henrique Dias Botelho - 2017.pdf: 2156209 bytes, checksum: 7548059cd0e4b1077f097a09aa4fd4eb (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-23T11:19:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Pedro Henrique Dias Botelho - 2017.pdf: 2156209 bytes, checksum: 7548059cd0e4b1077f097a09aa4fd4eb (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-04-20 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Introduction. Laboratory tests are essential for dengue diagnosis, in that sense algorithms are proposed, which proposes instructions for a more effective laboratory dengue diagnosis. Aim. To evaluate the performance of laboratory tests in the confirmation of suspected dengue cases, appling an algorithm, during a dengue epidemic in Goiânia, Central West Brazil 2012-2013. Methodology. This is a retrospective analytical observational study in a database of a prospective cohort with suspected dengue cases. The algorithm applied was based on three periods in the acute phase of disease, 0-3, 4-7 and >7 days after onset of symptoms (DOS) and in detection of immunoglobulins M and G (IgM and IgG), non-structural 1 protein antigen (NS1Ag) and viral RNA by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Positivity was seen individually and in association of tests in the algorithm and per day of infection, and used to confirm cases. The tests performance was evaluated by the sensitivity, specificity and accuracy of each test when compared to the others association, also in the algorithm. The results were statistically analyzed using SPSS Statistics 17.0, R software and OPENEPI. Results. 592 patients with suspected dengue were included, 415 (70.1%) were laboratory confirmed. In the 0-3 DOS period, the best positivities were by RT-PCR (81.6%) and NS1Ag (63.3%). While, IgM obtained the best positivities in 4-7 and >7 DOS periods (85.5% and 93.3%, respectively). Individually, RT-PCR and IgM tests were the most efficient to add positivity to diagnosis at the beginning and at the end of the acute phase of infection, respectively. Sensitivity results were similar to those of positivity, whereas NS1Ag specificities were greater than 90% at all periods. Conclusion. The algorithm sowed which laboratorial test was the best for the course of disease. Until 3 DOS, molecular is most sensitive test; between 4-7 DOS, two techniques may be required to obtain an accurate diagnostic. NS1Ag test, presented less detection in secondary infection cases, however, they was more specific test and can be used in differential diagnosis of dengue. These results contributed to diagnostic decision in the epidemiological context with concomitant arbovirus circulation. / Introdução. Testes laboratoriais são fundamentais para o diagnóstico da dengue, nesse sentido são propostos algoritmos, que propõe instruções para um diagnóstico laboratorial de dengue mais eficaz. Objetivo. Avaliar o desempenho de testes laboratoriais na confirmação de casos suspeitos de dengue, no curso de duas epidemias (2012 e 2013) em Goiânia, Goiás, Centro-Oeste do Brasil. Metodologia. Trata-se de um estudo observacional analítico que analisou uma base de dados clínicos e laboratoriais de uma coorte prospectiva de pacientes com suspeita clínica de dengue. O algoritmo aplicado baseou-se em três períodos da doença, 0-3, 4-7 e >7 dias após o início dos sintomas (DOS) e no uso de testes de detecção das imunoglobulinas M e G (IgM e IgG), do antígeno da proteína não-estrutural 1 (NS1Ag) e do RNA viral por reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa (RT-PCR). Foram avaliadas a positividade dos testes individualmente e em associação de testes por dia de infecção; e a sensibilidade, especificidade e acurácia dos testes. A análise estatistica usou os programas SPSS Statistics 17.0, R software e OPENEPI. Resultados. Dos 592 pacientes selecionados, 415 (70,1%) foram confirmados laboratorialmente. No período de 0-3 DOS, a RT-PCR e NS1Ag obtiveram 81,6% e 63,3% de positividade respectivamente. IgM obteve as positividade nos períodos de 4-7 e >7 DOS (85,5% e 93,3%, respectivamente). Individualmente, os testes de RT-PCR e IgM positividade ao diagnóstico no início e no final da fase aguda da infecção, respectivamente. Os resultados de sensibilidade foram semelhantes aos de positividade, enquanto os de especificidade de NS1Ag foram superiores à 90% em todos os períodos. Conclusão. O algoritmo apontou qual teste laboratorial foi o melhor para o curso da doença. Até 3 DOS, o teste molecular é o mais sensível; Entre 4-7 DOS, duas técnicas podem ser necessárias para obter um diagnóstico preciso. O teste de NS1Ag apresenta menor detecção em casos de infecção secundária, no entanto, foi o teste mais específico, podendo ser utilizado no diagnóstico diferencial de dengue. Estes resultados contribuíram para a decisão diagnóstica no contexto epidemiológico com a circulação concomitante de arbovírus.
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Uso de bioindicador de efeito endócrino e validação do método para determinação de hormônios na água da Represa Municipal de São José do Rio Preto, SP / Use of the endocrine bioindicator efect and method validation for determination homones in water at reservoir São José do Rio Preto city, SP

Daniela Cordeiro 10 December 2009 (has links)
Dentre os vários xenobióticos que as atividades humanas têm produzido nas últimas décadas, os desreguladores endócrinos (EDs), incluindo os hormônios, vêm chamando a atenção de pesquisadores devido aos efeitos que eles causam em animais. Esses efeitos podem resultar em características hermafroditas nos peixes e em anfíbios, inibição do crescimento testicular, inibição da espermatogênese, decrescimento da capacidade de fertilização dos ovos e alteração no comportamento reprodutivo dos seres vivos. Concentrações de apenas 10 ng L-1 de hormônio no meio aquático já são capazes de causar efeito endócrino nos organismos. Neste estudo determinou-se o hormônio natural 17β-estradiol e os hormônios sintéticos levonorgestrel e 17α-etinilestradiol na água da Represa Municipal de São José do Rio Preto (SP). A primeira etapa deste estudo foi a validação dos métodos segundo a Resolução-RE 899 da ANVISA. Os limites de detecção, de quantificação e inferior de quantificação do método para a determinação do 17α-etinilestradiol foram, respectivamente, 25, 100 e 100 ng L-1. A linearidade, desvio-padrão relativo, exatidão e recuperação média para o 17α-etinilestradiol foram, respectivamente, R de 0,98, 3,23%, 100,53% e 89,95%. Os limites de detecção, de quantificação e inferior de quantificação do método para a determinação do 17β-estradiol foram, respectivamente, de 100, 150 e 150 ng L-1. A linearidade, desvio-padrão relativo, exatidão e recuperação média do 17β-estradiol foram, respectivamente, R de 0,99, 3,43%, 106,16% e 89,05%. Para o levonorgestrel, os limites de detecção, de quantificação e inferior de quantificação foram, respectivamente, 50, 150 e 150 ng L-1. A linearidade, desvio-padrão relativo, exatidão e recuperação média do método para a determinação do levonorgestrel foi respectivamente, R de 0,98, 3,48%, 105,15% e 86,45%. Na segunda etapa desta pesquisa analisaram-se amostras de água coletadas na Represa Municipal de São José do Rio Preto (SP) quanto à presença de hormônios. Como método de extração dos hormônios, usou-se a SPE e, como técnica analítica HPLC/FLU/DAD. Os resultados não indicaram a presença dos hormônios estudados até o limite de detecção do método empregado. Foi feita também a análise de vitelogenina (VTG) em plasma sanguíneo de peixes das espécies Geophagus brasiliensis (cará), Satanoperca pappaterra (zoiúdo) e Tilapia rendalli (tilápia rendali) capturados na referida represa. Observou-se que os peixes machos continham concentração de VTG na faixa de 152,4 a 2.841,8 ng mL-1. Isto indica que há substâncias de efeito endócrino na água da represa, mas não se pode afirmar que sejam os hormônios estudados. / Among the several xenobiotics that human activities have produced in the last decades, endocrine disruptors (EDs), including hormones, have been drawing the attention of researches due to the effects they can cause in animals. Those effects may result in hermaphrodite characteristics in fishes and amphibians, testicular growth inhibition, spermatogenesis inhibition, eggs fertilization capacity decrease, and changes in the reproductive behavior of living beings. Concentrations of only 10 ng L-1 of hormones in the aquatic medium are capable of causing endocrine effects in organisms. In this study, the natural hormone 17β-estradiol and the synthetic ones levonorgestrel and 17α-ethinylestradiol were determined in the waters of the São José do Rio Preto (SP) dam. The first step of this study was the validation of the methods according to ANVISA\'s Resolution 899. The detection, quantification, and lower quantification limits of the method for determining 17α-ethinylestradiol were, respectively, 25, 100, and 100 ng L-1. The linearity, relative standard deviation, accuracy, and average recovery of the method for determining 17α-ethinylestradiol were, respectively, R equal to 0.98, 3.23%, 100.53%, and 89.95%. The detection, quantification, and lower quantification limits of the method for determining 17β-estradiol were, respectively, 100, 150, and 150 ng L-1. The linearity, relative standard deviation, accuracy, and average recovery of the method for determining 17β-estradiol were, respectively, R equal to 0.99, 3.43%, 106.16%, and 89.05%. For levonorgestrel, the detection, quantification, and lower quantification limits of the method were, respectively, 50, 150, and 150 ng L-1. The linearity, relative standard deviation, accuracy, and average recovery of the method for determining levonorgestrel were, respectively, R equal to 0.98, 3.48%, 105.15%, and 86.45%. In the second step of this research, samples collected in the São José do Rio Preto (SP) dam were analyzed regarding the presence of hormones. For extracting the hormones, SPE cartridges were used followed by HPLC/FLU/DAD. The results indicated the absence of the studied hormones down to the detection limits of the methods employed. Vitellogenin (VTG) analyses were performed in the blood plasma of fishes captured in the beforementioned dam, of the species Geophagus brasiliensis (pearl cichlid or pearl eartheater), Satanoperca pappaterra (Pantanal eartheater or Paraguay River eartheater), and Tilapia rendalli (redbreast tilapia). It was observed that male fishes had VTG concentrations between 152.4 and 2,841.8 ng mL-1. That indicates that there are substances with endocrine effect in the dam water, although one cannot say the studied hormones are among them.
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Análise de ligação do gene de resistência Zym-2 com marcadores microssatélites e reação de acessos de meloeiro ao Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) / Linkage analysis of Zym-2 resistance gene with microsatellite markers and reaction of melon accessions to Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV)

Líllian Beatriz Januario Bibiano 19 April 2016 (has links)
As viroses causam perdas significativas na cultura do melão. Dentre essas, o vírus do mosaico amarelo da abobrinha-de-moita (Zucchini yellow mosaic virus- ZYMV) possui grande importância para a cultura e é encontrado em todos os locais de plantio de cucurbitáceas. O controle desse vírus através da resistência genética é a forma mais eficiente de manejo. O acesso PI414723 é a única fonte de resistência de meloeiro ao ZYMV. Essa resistência é oligogênica e supostamente condicionada por três genes dominantes: Zym-1, Zym-2 e Zym-3. A localização cromossômica do gene Zym-1 já foi confirmada no grupo de ligação 2, próximo ao marcador CMAG36. Entretanto, a localização de Zym-2 ainda carece de confirmação experimental, muito embora existam evidências de sua localização no grupo de ligação 10 (LGX). Sendo assim, um dos objetivos do presente trabalho foi confirmar a localização do gene Zym-2 através de análises de ligação com marcadores microssatélites (SSRs). Para tanto, foi utilizada uma população F2 derivada do cruzamento PI414723 x \'Védrantais\'. As plantas foram inoculadas mecanicamente com o isolado RN6-F, patótipo 0, duas vezes em um intervalo de 24 h. A confirmação da infecção e a quantificação dos títulos virais nas plantas F2 foram realizadas através do teste PTA-ELISA. O DNA genômico das plantas foi extraído da primeira folha verdadeira e utilizado nas reações de PCR com primers específicos para SSRs selecionados pertencentes ao LGX. Observou-se uma distribuição assimétrica de classes de absorbância e maior frequência de indivíduos F2 na classe com menor valor (0,1 a 0,2), sugerindo a existência de um gene de efeito maior. O teste chi-quadrado mostrou que todos os marcadores segregaram na frequência esperada (1:2:1), exceto o marcador CMCT134b. A ligação do Zym-2 aos marcadores foi confirmada por meio de regressão linear simples. Dos marcadores analisados, a regressão linear foi significativa para MU6549 e CMBR55, com p-valores de 0,011 e 0,0054, respectivamente. As análises de ligação mostraram que as ordens e as distâncias entre os marcadores condizem com os mapas presentes na literatura. Um segundo objetivo do estudo foi o de avaliar a reação ao ZYMV de 42 acessos de meloeiro oriundos da região Nordeste do Brasil, com o intuito de explorar novas fontes de resistência. Foram realizados dois experimentos utilizando a mesma metodologia citada anteriormente. O título viral médio entre os acessos variou de 0,123 a 0,621 no experimento 1 e de 0,019 a 0,368 no experimento 2. Alguns acessos apresentaram consistentemente baixos títulos virais, próximos aos do acesso resistente PI414723 e dos controles negativos (plantas não inoculadas da cultivar \'Védrantais\'). Portanto, estes acessos mostram-se como potenciais fontes de resistência ao vírus para o emprego em programas de melhoramento. / Viruses cause significant losses in the melon crop. Among these, Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) is of great importance and is ubiquitous in cucurbit crops. The control of this virus through genetic resistance is the most efficient management strategy. PI414723 is the only source of resistance to ZYMV in melon. This resistance is oligogenic and is supposed to be conditioned by three dominant genes: Zym-1, Zym-2 and Zym-3. While the chromosomal location of Zym-1 gene has been determined to be close to the CMAG36 marker in linkage group 2, the location of Zym-2 still lacks experimental confirmation, although there is some preliminary evidence that it is located in the linkage group 10 (LGX). Thus, one objective of this study was to confirm the chromosomal location of Zym-2 through linkage analysis with microsatellite markers (SSRs). To this, F2 plants population derived from the cross PI414723 x \'Védrantais\' were used as a segregating population. The plants were mechanically inoculated twice with isolate RN6-F, pathotype 0, at an interval of 24h. Confirmation of the infection and the quantification of viral titers in F2 plants were conducted using the PTA-ELISA technique. Plant genomic DNA was extracted from the first true leaf and used in PCR reactions using specific primers for selected SSRs belonging to LGX. An asymmetric distribution of absorbance classes was observed as well as a higher frequency of F2 individuals in the classes with lower values (0.1 to 0.2), confirming the presence of the major gene Zym-1. The chi-square test showed that all markers segregated according to the expected frequency (1: 2: 1), except for the CMCT134b marker. Linkage analysis among markers showed that the orders and distances between markers were consistent with published linkage maps. Linkage of Zym-2 to the markers was investigated by simple linear regression. Of the analyzed markers, the linear regression was significant for MU6549 and CMBR55, with p-values of 0.011 and 0.0054, respectively. Thus, the location of Zym-2 was determined in LGX. A second objective of the study was to evaluate the reaction to ZYMV of 42 melon accessions from the Northeastern Brazil, in order to discover new sources of resistance. For this, two experiments were conducted using the same inoculation and evaluation procedures previously described. The mean viral titer between accessions ranged from 0.123 to 0.621 in experiment 1 and between 0.019 to 0.368 in the experiment 2. Some accessions consistently showed low viral titers, similar to the resistant access PI414723 and the negative controls (non-inoculated plants of the cultivar \'Védrantais\'). Therefore, these accessions are potential sources of resistance to be employed in breeding programs.
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Caracterização biológica e molecular de isolados do vírus do mosaico da cana-de-açúcar do Estado de São Paulo / Biological and molecular characterization of isolates of Sugarcane mosaic virus from São Paulo state

Carla Fontebasso Pelizari Pinto 19 January 2012 (has links)
A cana-de-açúcar é cultivada em diversos países do mundo. O Brasil é atualmente o maior produtor mundial de cana-de-açúcar e o maior exportador dos produtos derivados dessa espécie, tais como açúcar e etanol. A cultura da cana-deaçúcar apresenta muitos problemas fitossanitários que prejudicam a produção, entre eles o causado pelo vírus do mosaico da cana-de-açúcar (Sugarcane mosaic virus, SCMV). O mosaico da cana-de-açúcar vem sendo controlado com o uso de variedades e híbridos resistentes. No entanto, frequentemente notam-se plantas sintomáticas nas avaliações de novos clones de cana-de-açúcar, em viveiros de mudas e plantios comerciais. Diante desse fato, o presente trabalho teve como objetivo realizar a caracterização biológica e molecular de isolados do SCMV que induzem sintomas variados em plantas de cana-de-açúcar plantadas nos municípios de Assis, Piracicaba e Ribeirão Preto, SP. Nove isolados, identificados por causarem sintomas fraco, intermediário e severo de mosaico foram coletados em cada localidade. Um isolado que causa mosaico listrado também foi coletado em Piracicaba. Todos os isolados foram estabelecidos na variedade SP86155. A caracterização molecular foi feita por meio da analise das sequências de nucleotídeos e de amino ácidos deduzidos do gene da proteína capsidial dos isolados. Também foram diferenciados por meio da análise de polimorfismo de comprimento de fragmentos. A caracterização biológica foi realizada por testes de proteção entre alguns dos isolados. As sequências parciais de nucleotídeos e de aminoácidos deduzidos do gene da proteína capsidial de cada isolado foram comparadas entre si e com outras sequências correspondentes de isolados de diferentes regiões geográficas. As identidades das sequências de nucleotídeos variam de 94 a 100%, entre os isolados estudados. Quando as mesmas sequências foram comparadas com as sequências de nucleotídeos do gene da proteína capsidial de outros isolados do SCMV as identidades variaram de 79 a 98%. Para as sequências de amino ácidos deduzidos as identidades variaram de 94 to 100%, entre os isolados estudados e de 81 to 98% quando comparadas com as de outros isolados do SCMV. Análise filogenética agrupou os 10 isolados com outros isolados brasileiros do SCMV (JAU - 1, RIB - 1 e PIR - 2 e FER - 1) e com os isolados dos E.U.A. originalmente denominados estirpes A, B, D e E. Analises de RFLP mostraram que a enzima de restrição HinfI foi a que melhor diferenciou os isolados e por isso permitiu a análise da proteção. As plantas inoculadas com os isolados fracos de Piracicaba, Ribeirão Preto e Assis ficaram protegidas contra a invasão sistêmica dos isolados severos dos mesmos locais e contra o isolado que causa mosaico listrado de Piracicaba. Falhas na proteção ocorreram em plantas infectadas com o isolado Piracicaba intermediário e desafiadas com os isolados Ribeirão Preto severo e Assis severo. Em conjunto esses resultados indicam que os dez isolados estudados são estirpes do SCMV que induzem sintomas diferenciados. / Sugarcane crop is raised in several tropical countries around the world. Brazil is the largest producer of sugarcane, as well as the largest exporter of ethanol and sugar, which are outputs of sugarcane processing. The sugarcane production faces several sanitary problems and among them is the mosaic disease caused by the potyvirus Sugarcane mosaic virus (SCMV). Traditionally, resistant varieties and hybrids are used for the control of SCMV. However, new cases of symptomatic plants have been reported in commercial crops and in seedling production facilities. Based on this fact, the present work aims to do both molecular and biological characterization of isolates of SCMV which causes different symptoms in sugarcane crops in the regions of Assis (SP), Piracicaba (SP) and Ribeirão Preto (SP). Nine isolates identified as causing mild, intermediate and severe mosaic were collected in each of the three areas. One isolate which causes striped mosaic was also collected in the Piracicaba area. All isolates were established in the variety SP86155 by mechanical inoculation. The molecular characterization was done through the analysis of nucleotide and deduced amino acid sequences for the coat protein gene. Likewise the isolates were differentiated through the analysis of restriction fragment length polymorphism (RFLP) for further use on biological characterization through cross protection tests between the isolates. The partial nucleotide and deduced amino acid sequences for the coat protein gene were compared among themselves and with corresponding sequences for other isolates from different geographical regions. The identity of the nucleotide sequences ranged from 94 to 100% among the studied isolates. When compared with the corresponding nucleotide sequences of other isolates of SCMV the identities ranged from 79 to 98%. The identity of the deduced amino acids sequences ranged from 94 to 100% among the studied isolates, and from 81 to 98% when compared with isolates form different geographical regions. Phylogenetic analysis grouped all 10 isolates with other Brazilian isolates do SCMV (JAU-1, RIB-1 e PIR-2 e FER-1), as well as with isolates from the U.S.A, originally named strains A, B, D e E. RFPL analyses pointed out that the restriction enzyme Hinfl did the best differentiation of the isolates and was further used for the evaluation of the cross protection tests. Plants inoculated with mild isolates remained protected against the severe isolates and also against the isolate which causes the stripped mosaic. Fails on cross protection occurred when plants infected with the isolate Piracicaba intermediate were challenged with isolates Ribeirão Preto and Assis severe. Together these data indicate that the 10 studied isolates are strains of SCMV that induce different symptoms.

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