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Controle do ciclo estral e taxa de prenhez em matrizes de corte bovinas: efeitos hormonais, genéticos e ambientais / Control of the estrous cycle and pregnancy rate in beef cattle cows and heifers: effects hormonal, genetic and environmentalGottschall, Carlos Santos January 2011 (has links)
Investigou-se o desempenho reprodutivo de novilhas e vacas de corte submetidas a protocolos de sincronização de estros para a inseminação artificial e a associação entre marcadores moleculares e desempenho reprodutivo. Exp.1 avaliou-se a antecipação da aplicação da PGF2a em programa de IATF com implante de progesterona em 306 vacas Angus, com cria ao pé. A antecipação da aplicação da PGF2a afetou a taxa de concepção à IATF e prenhez final (P<0,05), respectivamente de 60,9% e 89,1% quando comparados a PGF2a na retirada do dispositivo, respectivamente de 49,3% e 76,7%. Exp.2 avaliaram-se os efeitos do GnRH e da manifestação de estro sobre o desempenho reprodutivo em 197 vacas Angus submetidas à IATF. A manifestação de estro antes da IATF influenciou a taxa de prenhez à IATF (TxPIATF) e prenhez final, respectivamente de 46,6%, 78,6% (C/estro) e 33,0%, 60,6% (S/estro) (P<0,05). O GnRH no momento da IATF resultou em menor taxa de prenhez à IATF, 32,3%, comparado a ausência de GnRH 48,0% (P<0,05), mas não afetou a prenhez final, respectivamente de 69,7% e 70,4%. Houve interação entre estro e GnRH. Vacas C/estro-C/GnRH tiveram 31,4% de prenhez à IATF contra vacas C/estro- S/GnRH com 61,5% (P<0,05). Nas vacas sem estro, o GnRH não apresentou efeito (P>0,05) na TxPIATF (32,6% e 33,3%). O escore de condição corporal (ECC) afetou a taxa de manifestação de estro e a TxPIATF, com superioridade (P<0,05) para vacas > de 3,0. Exp.3 compararam-se os efeitos de diferentes protocolos para a IATF com o acasalamento por touros (Controle) sobre o desempenho reprodutivo de 249 vacas Angus. Formou-se 5 grupos: Controle; Crestar 2º uso; OvSynch; Primer 1ºuso e Primer 2ºuso. A IATF dos animais foi realizada 27 dias e 38 dias após o inicio da estação do grupo controle. Sete dias após a IATF iniciou o repasse com touros. A estação de acasalamento (EA) foi de 91 dias para o grupo controle e 64 e 53 dias para os grupos IATF. A taxa de prenhez ao final da EA não se diferenciou entre os grupos 83,9%. As perdas reprodutivas entre o diagnóstico de gestação e o nascimento foram de 10,5%, sem diferenças entre grupos. O ECC de fêmeas que emprenharam no grupo controle foi diferente do ECC de fêmeas vazias, mas não se diferenciou nos animais da IATF. Exp.4 avaliaram-se protocolos de inseminação sobre o índice reprodutivo em 249 novilhas Britânicas e cruzas, acasaladas aos 14 e 27 meses. Novilhas de 14 e 27 meses foram submetidas aos tratamentos Crestar ou inseminação artificial (IA) por 7 dias, seguida por mais 5 dias após PGF2a (grupo PGF2a) Novilhas de 27 meses também foram submetidas ao OvSynch. Foram avaliados o peso vivo, ECC, escore de trato reprodutivo (ETR) ao início da estação reprodutiva. Os tratamentos OvSynch e Crestar tiveram 100% dos animais inseminados (IATF), enquanto os grupos IA com PGF2a aos 14 e 27 meses tiveram, respectivamente 21,9% e 43,5%. Não houve diferença nas taxas de concepção entre tratamentos e idades (P>0,05), com valores respectivos de 46,5%, 56,3%, 64,7% para Crestar, OvSynch, PGF2a e de 44,4% e 57,1%, para 14 e 27 meses. A taxa de prenhez à IA(TF) foi de 46,5%, 56,3%, 23,4% para Crestar, OvSynch, PGF2a, com superioridade (P<0,05) a favor do Crestar e OvSynch. A taxa de prenhez à IA(TF) foi de 18,6% e 41,3% (P<0,01) para idades 14 e 27 meses. A taxa de prenhez final, após o repasse com touros, foi superior a 90% em todos os grupos (P<0,05). O ETR influenciou a taxa de prenhez após a inseminação. Exp.5 e 6 buscou-se uma associação entre a resposta reprodutiva e marcadores moleculares ligados aos genes do receptor para IGF-1, LH , Leptina, receptores do FSH e LH. Foram utilizados dados de 249 novilhas (Exp4.) e 249 vacas (Exp.3). Nas novilhas a prenhez à inseminação e a prenhez final foram de 41,0% e 91,6%. Nas novilhas não foram encontradas associações entre marcadores e reprodução. No rebanho das vacas a taxa de natalidade no ano subseqüente foi de 75,5%, sem diferenças entre tratamentos, idade e escore ovariano. O ECC influenciou a taxa de natalidade, respectivamente de 55,6%, 75,8% e 82,4% (P<0,05) para os animais com ECC menor que 2,5; 2,5 a 2,9; maior ou igual a 3,0 ao do inicio EA. Vacas homozigóticas no marcador AFZ-1 apresentaram 84,4% de natalidade em comparação as heterozigóticas com 71,5% (P<0,05). A presença do alelo*161 nomarcador HEL5 resultou em 33,3% de natalidade, contra 76,5% em vacas sem esse alelo (P<0,05). Os experimentos evidenciaram que a antecipação da aplicação da PGF2a resultou em aumento da taxa de prenhez à IATF. O ECC mostrou-se como importante preditor do desempenho reprodutivo em vacas de corte. O uso do GnRH concomitante à IATF em vacas com manifestação de estro induzido com benzoato resultou em menor resposta reprodutiva à IATF. A IATF proporcionou aumento nas taxas de inseminação em novilhas, especialmente nas submetidas ao acasalamento 14 meses. O escore de trato reprodutivo ao início da estação de acasalamento influenciou a precocidade de concepção das novilhas. O atraso da realização da IATF após o início da EA não afetou a taxa de prenhez final de vacas de cria quando comparado ao acasalamento por touros. Marcadores moleculares apresentaram associação com o desempenho reprodutivo de bovinos. / Were investigated the reproductive performance of beef heifers and cows submitted to different estrus synchronization protocols for artificial insemination and the association between molecular markers and reproductive performance. Trial.1 The anticipation of the application of PGF2a in TAI program with implantation of progesterone in 306 nursing Angus cows was evaluated. Anticipating the application of PGF2a affected (P <0.05) conception rate to TAI and final pregnancy, respectively 60.9% and 89.1% when compared to PGF2a in the removal of the device, respectively 49.3% and 76.7%. Trial.2 The effects of GnRH and oestrus on reproductive performance in 197 Angus cows subjected to TAI It were evaluated. The expression of oestrus before TAI influenced the pregnancy rate to TAI (TxPTAI) and final pregnancy (P<0.05), respectively 46.6%, 78.6% (oestrus) and 33.0%, 60.6% (No/oestrus). GnRH at the time of TAI resulted in lower pregnancy rate to TAI (32.3%) compared to the absence of GnRH (48.0%) (P<0.05) but did not affect the final pregnancy, respectively 69, 7% and 70.4%. There was interaction between GnRH and oestrus. Cows with oestrus and GnRH had 31.4% pregnancy for TAI cows against with oestrus without GnRH with 61.5% (P <0.05). In cows without oestrus, GnRH had no effect (P> 0.05) TxPTAI (32.6% and 33.3%). The body condition score (BCS) affected the rate of oestrus and TxPTAI, with higher (P <0.05) for cows > than 3.0. Trial.3 The effects of different protocols for TAI with mating by bulls (control) on the reproductive performance of 249 Angus cows were compared. It was formed five groups: Control; Crestar 2nd use; OvSynch; Primer new and Primer 2nd use. The TAI was performed 27 days and 38 days after the start breeding season in the control group. Seven days after TAI was realized the clean-up bulls. The mating season (MS) was 91 days for the control group and 64 and 53 days for TAI groups. Pregnancy rate at the end of MS did not differ between groups (83.9%). Reproductive failure between diagnosis of pregnancy and birth were 10.5%, without differences between groups. The BCS to pregnant cows in the control group differed from open cows, but it was not different in cows submitted to TAI. Trial.4 Different protocols to insemination on reproduction in 249 British and crossbred heifers, bred at 14 and 27 months were evaluated. Heifers to 14 and 27 months were treated Crestar or artificial insemination (AI) for 7 days, followed by more than 5 days after PGF2a (PGF2a group) Heifers 27 months were also submitted to OvSynch. We evaluated body weight, BCS, reproductive tract score (RTS) to the beginning of the breeding season. Treatments OvSynch and Crestar had 100% of the animals inseminated (TAI), while groups with PGF2a IA at 14 and 27 months were respectively 21.9% and 43.5%. There was no difference in conception rates between treatment and age (P>0.05), with respective values of 46.5%, 56.3%, 64.7% for Crestar, OvSynch, PGF2a, and 44.4% and 57.1% for 14 and 27 months. Pregnancy rate to AI (TAI) was 46.5%, 56.3%, 23.4% for Crestar, OvSynch, PGF2a, with higher (P <0.05) in favor of Crestar and OvSynch. Pregnancy rate to AI (TAI) was 18.6% and 41.3% (P <0.01) for ages 14 and 27 months. The final pregnancy rate after clean-up bulls was superior to 90% in all groups (P<0.05). The RTS influenced the pregnancy rate after insemination. Trial.5 and 6 we looking for an association between the reproductive response and molecular markers linked to genes for IGF-1 receptor, LH , Leptin, FSH and LH receptors. We used data from 249 heifers (Trial4.) and 249 cows (Trial.3). Pregnancy in heifers at insemination and final pregnancy were 41.0% and 91.6%. No associations were found between markers and reproduction in heifers. In the cow`s herd the birth rate in subsequent years was 75.5%, with no differences between treatments, age and ovarian score. The BCS has influenced the birth rate, respectively 55.6%, 75.8% and 82.4% (P <0.05) for animals with BCS less than 2.5, 2.5 to 2.9; greater than or equal to 3.0 to the beginning of the MS. Cows in homozygous marker AFZ-1 showed 84.4% of the birth rate compared with 71.5% (P <0.05) in heterozygous cows. The presence of allele*161 to HEL5 marker resulted in 33.3% of birth rate vs. 76.5% in cows without this allele (P<0.05). The experiments showed that the anticipation of the implementation of PGF2a resulted in increased pregnancy rate to TAI. BCS has proven to be an important predictor of reproductive performance in beef cows. The use of GnRH in cows with the oestrus induced with benzoate showed worse reproductive response to TAI. The TAI has provided increased rates of insemination in heifers, especially in heifers submitted to matting by 14 months. The reproductive tract score at the beginning of the breeding season influenced the speed of conception in heifers. The delay of the realization of TAI after the onset of MS did not affect the final pregnancy rate of beef cows when compared to breeding only by bulls. Molecular markers were associated with the reproductive performance of cattle.
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Coleta, caracterização molecular e seleção de isolados de Beauveria bassiana visando ao controle da broca-do-café no Espírito Santo / Collect, molecular characterization and selection of Beauveria bassiana strains to control of coffee berry borers in Espírito Santo, BrazilDalvi, Leandro Pin 23 February 2008 (has links)
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Leandro Pin Dalvi.pdf: 1271308 bytes, checksum: 029f08fb27575fe178e1d7fbfa5e6720 (MD5)
Previous issue date: 2008-02-23 / A cafeicultura é a maior geradora de empregos e renda para as famílias do Espírito Santo. Dentre os problemas que esta atividade enfrenta, destaca-se a broca-do-café
Hypothenemus hampei, uma praga que causa prejuízos em todos os estágios de maturação dos frutos, assim como no pós-colheita. O objetivo do presente trabalho foi coletar, caracterizar molecularmente e selecionar isolados do fungo
entomopatogênico Beauveria bassiana com potencial para utilização em programas de manejo fitossanitário da broca-do-café. O trabalho foi realizado no Setor de Entomologia e Fitopatologia NUDEMAFI, localizado no Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Espírito Santo (CCA-UFES), e nos laboratórios de Entomologia e Biotecnologia da Embrapa-Soja localizados em Londrina, Paraná. As coletas resultaram em 28 isolados classificados como B. bassiana, tendo sido um dos isolados descartado dos testes por apresentar baixo crescimento. As amplificações utilizando 12 primers (iniciadores) deram origem a 82 bandas. O coeficiente de similaridade Dice variou de 93 a 51%. Foi evidente, salvo algumas exceções, que o local de coleta foi peça chave na formação de grupos muito relacionados. Ocorreu grande amplitude na virulência. Foram pré-selecionados os isolados CCA-UFES/Bb4, CCA-UFES/Bb11, CCA-UFES/Bb15, CCA-UFES/Bb18 que produziram mortalidade confirmada acima de 60%. Posteriormente, o isolado CCA-UFES/Bb15 apresentou melhor resposta, diferenciando-se do isolado utilizados como padrão - ESALQ-447 - cujos CL50 foram de 4,0 x 104 e 11,85 x 104 conídios/mL, respectivamente. Para todos os isolados selecionados, assim como para o padrão, o aumento na concentração representou aumento na mortalidade. A conidiogênese sobre os cadáveres da broca-do-café foi inversamente proporcional à virulência dos isolados, sendo ambas as características importantes para o sucesso de um programa de Manejo Integrado de Pragas (MIP). Os resultados obtidos são promissores, dando subsídio a novas pesquisas preferencialmente a campo / The coffee plantation is the largest source of jobs and familiar income of the State of Espírito Santo (Brazil). The coffee berry borer, Hypothenemus hampei, is widely considered one of the most important coffee pests because the losses in all stages of coffee grain as well as in post-harvest in this activity. The objective of this study was the collect, molecular characterization and the select of entomopathogenic fungus Beauveria bassiana strains, with potential use in integrated pest management in coffe plantations. The work was carried out at NUDEMAFI, located in the Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Espírito Santo, in municipality of Alegre, Brazil and the Biotechnology and Biological laboratories in the Embrapa Soja, in municipality of Londrina, State of Paraná, Brazil. A collection of 28 B. bassiana strains,isolated from different geographic regions were established. Only one
Bassiana bassiana strain was discarded for low growth in laboratory. The amplifications using 12 "primers" (initiators) led to 82 bands. Dices coefficient ranged from 51 to. 93% with few exceptions Groups of B. bassiana strains related were forming due to the place colleted and high levels of virulence was observed. The Beauveria bassiana strains CCA-UFES/Bb4, CCA-UFES/Bb11, CCA-UFES/Bb15, CCA-UFES/Bb18 were pre-selected which showed confirmed mortality higher than 60Only The LC50, of the CCA-UFES/Bb15 strains was better response with significant difference between the standard, with 4.0 x 104 in 11.85 x 104 conidia / ml, respectively,. All isolates selected, as well as for the standard, the increase in the concentration resulted an increase of mortality of H. hampei. The conidiogenesis on coffee berry borers cadavers was inversely proportional to the virulence of the B. bassiana strains, and both this characteristics are important to the success of a program of Integrated Pest Management (IPM)
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Diversidade genética de populações naturais de Anthonomus grandis Boheman (Coleoptera : Curculionidae)MARTINS, Walter Fabrício Silva January 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006 / O bicudo do algodoeiro, Anthonomus grandis Boheman, é considerado a maior praga da
cotonicultura mundial, ocasionando danos que repercutem principalmente na
produtividade, qualidade do algodão colhido e gasto com medidas de controle. Neste
estudo foi realizada pela primeira vez, uma análise da diversidade e estrutura genética das
populações naturais de A. grandis do Brasil. Doze populações coletadas em seis estados
brasileiros (Paraíba, Ceará, Bahia, Pará, Mato Grosso e Goiás) em áreas onde são
praticadas a agricultura em escala empresarial e agricultura familiar, foram avaliadas pelas
técnicas de Polimorfismo do DNA Amplificado Randomicamente (RAPD), Isoenzimas e
Microssatélite. Os resultados obtidos em seis populações pela técnica de RAPD baseados
em 25 loci, revelaram uma heterozigosidade média de 0,262, com polimorfismo (P)
variando de 52 a 84%. A diferenciação genética entre as populações foi extremamente
elevada e significativa (GST = 0,258; p < 0,05), refletindo a existência de baixo fluxo
gênico entre as mesmas (Nm = 0,72). A análise de cinco populações com 6 loci alozímicos
mostrou uma heterozigosidade média de 0,212 e polimorfismo (P) variando entre 25 e
100%. O índice de diferenciação genética FST obtido por este marcador entre as populações
correspondeu a 0,544 (p < 0,05), sugerindo a ocorrência de baixo fluxo gênico (Nm =
0,210) entre as populações. A heterozigosidade e o polimorfismo (P) observados em onze
populações pela análise de 8 loci de microssatélites variaram entre 0,038 e 0,224 e de 37,5
a 75%, respectivamente. O FST entre as populações correspondeu a 0,220, produzindo um
Nm de 0,8. Os três marcadores moleculares utilizados revelaram que as populações de A.
grandis dos estados brasileiros avaliados apresentam baixa diversidade genética, em
comparação às populações dos Estados Unidos, México e demais países da América do
Sul, sugerindo que a colonização deste inseto ocorreu em uma ou poucas áreas. Os
resultados obtidos relativos à diversidade genética também permitiram distinguir
populações oriundas de regiões onde é praticada a agricultura em escala empresarial das
áreas de agricultura familiar, assim como mostrou que as populações do nordeste podem
estar servindo de fonte para colonização de novas áreas e de áreas já tratadas
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Avaliação da estabilidade genômica em acessos naturais e sintéticos de Lippia alba (MILL.) N. E. Br. (Verbenaceae)Julião, Sirlei Aparecida 11 August 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-08-11 / Lippia alba é uma espécie medicinal com ampla diversidade fenotípica, incluindo a composição do óleo essencial. A variação genética é provavelmente a principal causa dessa variação. A espécie foi descrita como um complexo poliploide com cinco números cromossômicos (2n=30, 38, 45, 60 e 90). Devido à importância econômica e à variação genética natural, essa espécie representa um excelente modelo em estudos sobre estabilidade genômica. Este trabalho teve como objetivo investigar a estabilidade genômica de 22 acessos naturais cultivados in vitro durante sete anos e em acessos poliploides sintéticos obtidos a partir da duplicação cromossômica de um acesso diploide natural usando colchicina. Para analisar a estabilidade do genoma de plantas cultivadas a longo prazo, foram analisadas quatro plantas (três mantidas in vitro e uma no campo) de 22 acessos. O tamanho do genoma foi verificado por citometria de fluxo e oito marcadores ISSR foram utilizados para verificara estabilidade em nível de sequencia de DNA. Para avaliar a estabilidade genômica após a poliploidização, onze plantas poliploides sintéticas, sendo 5 tetraploides (4X) e 6 mixoploides (2X / 4X) foram comparadas com a planta matriz diploide. As comparações foram baseadas no conteúdo de DNA, contagem cromossômica, marcadores moleculares ISSR e SSR e no perfil químico do óleo essencial. A comparação entre as plantas mantidas in vitro e as respectivas plantas mantidas no campo mostrou que 13 dos 22 acessos sofreram uma pequena redução no tamanho do genoma. Os marcadores ISSR detectaram polimorfismos na sequência de DNA variando de 1,61 a 33,87%. Somente três acessos não apresentaram bandas polimórficas. O número de bandas polimórficas entre os outros 19 acessos variou de um a 21. A análise da ploidia das plantas poliploides sintéticas realizada em folhas e raízes confirmou a estabilidade das plantas tetraploides. As plantas mixoploides apresentaram um único pico G1 correspondente a plantas triploides. A análise cromossômica revelou 60 cromossomos com 12 sítios de DNAr 45S nas plantas tetraploides e 9 sítios de DNAr 45S nos 45 cromossomos observados nas plantas triploides. Os marcadores ISSR mostraram polimorfismo entre a planta matriz diploide e as plantas poliploides sintéticas. A taxa de polimorfismo variou de 1,81 a 5,45% nas plantas tetraploides e de 43,63 a 56,36% nas plantas triploides. Alterações no tamanho dos alelos de microssatélites também foram detectadas. A planta matriz diploide apresentou dez alelos, três dos quais foram compartilhados com as plantas triploides e sete com as plantas tetraploides. Todas as plantas triploides apresentaram 13 alelos, sendo dez deles correspondentes a alelos novos. O número de alelos detectados nas plantas tetraploides variou de oito a 11 e o número de alelos novos como consequência da poliploidização variou de dois a quatro. O componente majoritário detectado no óleo essencial da planta matriz diploide e das plantas tetraploides foi o citral e nas plantas triploides foi o linalol. A instabilidade genômica detectada em L. alba após sete anos de cultura in vitro pode ser devido à consequência da instabilidade do genoma natural combinada com a cultura in vitro a longo prazo. Os efeitos da poliploidização que resultam em reorganização genômica e alterações fisiológicas podem explicar a variação observada nas plantas poliploides sintéticas. / Lippia alba is a medicinal species with a broad phenotypic diversity, including the essential oil composition. Genetic variation is probably the main cause of this variation. The species is a polyploid complex with five chromosome numbers (2n = 30, 38, 45, 60 and 90). Due to the economic importance and the natural genetic variation, this species represents an excellent model in studies on the genomic stability. This work aimed to investigate the genomic stability of 22 natural accessions grown in vitro for 7 years and in synthetic polyploid accessions obtained from the chromosome duplication of a natural diploid access using colchicine. To analyze the genome stability of long-term cultivated plants, four replicates (three maintained in vitro and one in the field) of 22 accessions were analyzed. The size of the genome was verified by flow cytometry and eight ISSR markers checked for stability in the DNA sequence. To evaluate the effect of polyploidization, eleven synthetic polyploid plants composed of 5 tetraploids (4X) and 6 mixoploids (2X/4X) were compared with the diploid parent plant. The comparisons were based on DNA content, chromosomal count, molecular markers ISSR and SSR, and chemical profile of the essential oil. The comparison between the plants maintained in vitro and the respective plants maintained in the field showed that 13 of the 22 accessions suffered a small reduction in the size of the genome. ISSR markers detected polymorphisms in the DNA sequence ranging from 1.61 to 33.87%. Only three accessions did not present polymorphic bands. The number of polymorphic bands among the other 19 accesses ranged from 1 to 21. Analysis of the ploidy of the synthetic polyploid plants carried out on leaves and roots confirmed the stability of the tetraploid plants. The mixoploid plants presented a single G1 peak corresponding to triploid plants. The chromosome analysis showed 60 chromosomes with twelve 45S rDNA sites in the synthetic tetraploids and nine 45S rDNA sites over the 45 chromosomes observed in the synthetics triploid plants. ISSR markers showed polymorphism between the diploid parent plant and synthetic polyploid plants. The polymorphism rate varied from 1.81 to 5.45% in the tetraploid plants and from 43.63 to 56.36% in the triploid plants. Changes in the size of the microsatellite alleles were also detected. The diploid parental plant presented 10 alleles, of which 3 were shared with the triploid plants and 7 with the tetraploid plants. All triploid plants had 13 alleles, 10 of which correspond to new alleles. The number of alleles detected in tetraploid plants ranged from 8 to 11 and the number of new alleles as a consequence of polyploidization ranged from 2 to 4. The major component detected in the essential oil of the parental diploid plant and the tetraploid plants was the citral and the triploid plants was the linalool. The genetic instability detected in L. alba after seven years of in vitro culture may be due to the consequence of natural genome instability combined with long-term in vitro culture. The effects of polyploidization that result in genomic reorganization and physiological changes may explain the variation observed in synthetic polyploid plants.
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Variabilidade genética de Arrabidaea bilabiata com marcadores moleculares AFLP e teste de extratos em fungos fitopatogênicosSouza, Luciana Souza de Aguiar e 29 September 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-09-29 / The grass pasture degradation is one of most serious problems to animal production in Amazonia. Weeds occur on pastures and cause some problems, livestock poisoning is a serious problem. Specially in the north states of Brazil when toxic plants cause large deaths on cattle and the large amount of this
deaths is caused by Arrabidaea bilabiata in river Amazonas floodplains. Otherwise weeds are potential source of secondary metabolites and another compound with biotechnological potential. Some weeds of Arrabidaea are studied for your medicinal, antifungal and toxic activities. A. bilabiata
extracts were assayed for in vitro activity against Escherichia coli, Klebsiella pneumonae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Bacillus sp. and Candida albicans. All microbial strains were found to be resistant to the extracts with the exception of C. albicans, suggesting a possible antifungal activity. The main goal of this work was to evaluate the genetic variation
between A. bilabiata from Autazes, Itacoatiara and Parintins (AM) and evaluate in vitro antifungal activity of A. bilabiata aquous and alcoholic extracts on BDA. The four combinations of AFLP markers used yielded 309 bands in 65 analyzed plants, with most (98.5%) being polymorphic, indicating a large level of genetic diversity. The minimum and maximum number of
bands per primer was respectively, 59 and 85 bands and the minimum and maximum similarity coefficient was 14,28% and 88,50%. The lower similarity coefficient was chosen between Autazes and Itacoatiara and Parintins plants (14,28% to 17,08%). The greatest genetic variability in Autazes, Itacoatiara
and Parintins A. bilabiata plants occurred between those places. The UPGMA dendrogram indicate two isolated groups the first one with Autazes plants and the second one with Itacoatiara and Parintins plants together. The results of this study indicate that AFLP markers were efficient in measuring the genetic
variability amongst A. bilabiata plants and suggest the existence of low reproductive propagation tax and low seed dispersion efficiency. More studies about reproductive biology and seeds dispersion of this specie is valuable to help explain how this specie evolved and create diversification. More studies which large populations can improve more information about which factors
contribute to genetic variation in A. bilabiata. The aquous extract of A. bilabiata don t show antifungal effect against C. cassicola; in S. rolfsii it reduces in 50% this fungus species growth on 40% concentration. In C. casiicola the aquous extract reduce in 20% and 40% concentration, 62% and 70% esporulation, respectively. The alcoholic extracts don t show antifungal
effect against evaluated fungus. The C. casiicola esporulation reduction suggests the aquous extracts potential in biologic control. For S. rolfsii we don t indicate A. bilabiata extract because it has stimulated effects on this fungus sclerodium production. / A degradação das pastagens é um dos maiores problemas da pecuária, principalmente na Amazônia devido à baixa tecnologia adotada em pequenas propriedades. Em pastagens degradadas ou não, é comum a ocorrência de plantas daninhas, algumas das quais podem ser tóxicas e danosas aos animais. Na região Norte as plantas tóxicas são responsáveis pela maioria das mortes
de bovinos adultos, e grande parte destas mortes é causada por Arrabidaea bilabiata nas várzeas do rio Amazonas e seus afluentes. Os estudos atualmente conduzidos sobre A. bilabiata avaliam principalmente as doses letais e os sintomas de intoxicação em diferentes espécies animais como coelhos, búfalos e bovinos, necessitando estudos mais acurados sobre
possíveis diferenças genéticas entre populações geograficamente isoladas, auxiliando no combate às intoxicações e descoberta de possíveis compostos químicos com potencial biotecnológico. O objetivo geral deste trabalho foi estudar a variabilidade genética entre plantas de A. bilabiata dos municípios de Autazes, Itacoatiara e Parintins e avaliar o potencial de extratos aquosos e
alcoólicos e de A. bilabiata no controle de fungos fitopatogênicos in vitro. Nos 65 indivíduos analisados por marcadores AFLP, encontrou-se um coeficiente médio de similaridade de 51,39%, com amplitude de 14,28% a 88,50%. As bandas amplificadas pelas quatro combinações de primers variaram de 59 a 85
com uma média de 76 bandas polimórficas, foram amplificadas um total de 309 bandas com uma porcentagem de 98,5% de polimorfismo. As maiores similaridades estão entre indivíduos das mesmas áreas de coleta e variaram de 78,52% a 88,50%. Os menores coeficientes de similaridade encontrados estão entre os indivíduos dos municípios de Autazes e os indivíduos dos
municípios de Itacoatiara e Parintins e variaram de 14,28% a 17,08%. Os resultados encontrados neste trabalho podem sugerir que as plantas de A. bilabiata possam ter tido uma origem comum há muito tempo atrás, e que com o passar do tempo foram sofrendo seleção, deriva, isolamento geográfico
e mutações que as estruturaram em subpopulações. Estudos genéticos em regiões mais amplas, com populações com maior número de indivíduos e com auxílio do estudo da fenologia da espécie e da biologia repodutiva podem auxiliar na compreeensão dos fatores que influenciaram a variação genética existente nos indivíduos analisados. Os marcadores AFLP foram eficientes para
caracterizar a variabilidade genética nos 65 indivíduos de A. bilabiata analisados. A maior variabilidade em A. bilabiata para os locais de coleta estudados está entre os locais de coleta. Houve formação de dois grupos isolados, o primeiro grupo formado pelos indivíduos de Autazes e o segundo com os indivíduos de Itacoatiara e Parintins. A existência de maior variabilidade entre as populações e não dentro delas sugere a existência de
baixa taxa de propagação reprodutiva e talvez baixa eficiência na dispersão de sementes e polén. O extrato aquoso de A. bilabiata não demonstrou propriedades fungitóxicas no crescimento micelial de C. cassicola mesmo nas concentrações mais elevadas. Para S. rolfsii houve redução do tamanho da colônia da ordem de 50% na concentração de 40% de extrato aquoso de A. bilabiata em relação à testemunha. O extrato aquoso promoveu redução da esporulação de C. casiicola nas concentrações 20 e 40% em 62% e 70 % respectivamente, em relação ao controle. O extrato alcóolico não obteve efeito no crescimento dos fungos testados. A redução de esporulação de C. cassiicola mostra o potencial do extrato aquoso de A. bilabiata como alternativa de controle biológico, por inibir a formação de esporos do fungo, reduzindo desta forma a quantidade de inóculo do patógeno no campo. Com relação ao fungo S. rolfsii, a atividade estimulante na produção de escleródios observada in vitro, não indica o uso do extrato de A. bilabiata em campo, pois os escleródios são estruturas de resistência e sobrevivência do patógeno extremamente eficientes, dificultando o controle da doença. A coleta das plantas de A. bilabiata para a realização dos extratos aquosos e etanólico em diferentes locais impossibilitou atribuir unicamente à menor solubilidade do(s) composto(s) presente(s) no extrato de A. bilabiata a inexistência de atividade
antifúngica do extrato etanólico nas concentrações testadas neste trabalho, é necessária a realização de experimentos posteriores para esclarecer este aspecto.
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Desenvolvimento de um novo sistema Multiplex de microssatélites (STR) para análise genética de populações humanasPontes, Isabel da Mota 14 December 2009 (has links)
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Isabel da Mota Pontes.pdf: 2179836 bytes, checksum: 0b2f33d44ee029fbf560b3505ea884b2 (MD5)
Previous issue date: 2009-12-14 / The present work presents the development of a new system called multiplex Pentaplex-ised, composed of 5 microsatellite loci STR type (D5S198498, D3S18773, GH15, D8S82535 and D11S118590). Such microsatellites have been identified in the human genome, using the program BLAST-N (GenBank). Specific primers were designed for amplification via PCR. Fluorescent primers were synthesized to allow simultaneous analysis of multiple amplicons (multiplex analysis). All microsatellite loci were genotyped confirming the high degree of polymorphism. In the validation, the minimum DNA concentration of for amplification was estimated at 0.25 ng. Several types of biological samples (blood, saliva, urine and semen) were acquired satisfactorily. We built a database of microsatellite allele frequencies for three Brazilian populations -Amazonas, Rio de Janeiro and Espírito Santo. The distributions of allele frequencies showed little variation between population groups. By means of statistical tests of χ2 using the program Arlequim 3.1 most alleles do not adhere to Hardy-Weinberg equilibrium if performed separately for each of the populations. However, in the analysis performed with the whole set of three populations, there is high adherence to the Hardy-Weinberg equilibrium. The three populations were grouped and compared pair-to-pair, showing that the genetic variation is greater within populations than between them. Statistical data about the power of exclusion, discrimination power and polymorphism information content for the five loci were determined for each STR and together to assess the potential of the system Pentaplex-ised in human identification. We observed that this multiplex system is suitable for human identification and that can be used in a complementary method with other systems for genetic analysis, by having a cumulative power of discrimination of 99.996% and 93.436% cumulative exclusion / O presente trabalho consiste no desenvolvimento de um novo sistema multiplex denominado PentaPlex-ISED, composto por 5 loci tipo microssatélites STR (D5S198498, D3S18773, GH15, D8S82535 e D11S118590). Esses microssatélites foram identificados no genoma humano, por meio do programa BLAST-N (GenBank). Primers específicos foram desenhados para amplificação via PCR. Primers fluorescentes foram sintetizados para permitir análise simultânea de vários amplicons (análise multiplex). Todos os loci microssatélites foram genotipados confirmando-se o alto grau de polimorfismo. Na validação do sistema, a concentração mínima de DNA para a amplificação dos loci incluídos nesse multiplex foi estimada em 0,25 ng. Diversos tipos de amostras biológicas (sangue, saliva, urina e sêmen) foram adquiridas satisfatoriamente. Foi construído um banco de dados de freqüências dos alelos microssatélites para três populações brasileiras (Amazonas, Rio de Janeiro e Espírito Santo). Confirmou-se a independência dos loci. As distribuições das freqüências alélicas apresentaram pouca variação entre os grupos populacionais. Por meio dos testes estatísticos de χ2, utilizando o programa Arlequim 3.1 verificou-se que a maioria dos loci não adere as condições do equilíbrio de Hardy-Weinberg se análise for feita separadamente em cada uma das populações. No entanto, na análise feita com o conjunto total das três populações, há aderência ao Equilíbrio de Hardy-Weinberg. As três populações foram agrupadas e comparadas par-a-par; mostrando-se que a variação genética é maior dentro das populações que entre elas. Os dados estatísticos sobre o poder de exclusão, poder de discriminação e o conteúdo de informação do polimorfismo, para os 5 loci foram determinados para cada STR e em conjunto para avaliar o potencial do sistema PentaPlex-ISED na identificação humana. Observou-se que este sistema multiplex é adequado para identificação humana e que pode ser usado de forma complementar com os outros sistemas de análises genéticas, por possuir um poder de discriminação acumulado em 99,996 % e o poder de exclusão acumulado em 93,436 %.
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Variabilidade genética molecular em uma coleção de germoplasma de Hymenaea stigonocarpa (Fabaceae) / Molecular genetic variability in a germplasm collection of Hymenaea stigonocarpa (Fabaceae)Gonçalves, Ariany Rosa 22 March 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-03-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The study of genetic variation in plant populations, especially in native Brazilian savanna, is
fundamental to understanding the magnitude of biodiversity in ecosystems. Understanding how
this variability is structured, gives us evidence of how evolution is acting in these populations,
bringing subsidies to trace relevant conservation strategies for these species. Its economic potential
is significant, mainly due to its nutritional value. The extractive use of native plants is a warning,
because the genetic resources of these plants can be exhausted without even discover their full
potential. Given this, the germplasm collections that conserve genetic resources ex situ and in vivo,
are an alternative to access information about the species at the same time helps conserve their
genetic variability. This study was therefore to characterize, genotypically, individuals of the
collection of germplasm Hymenaea stigonocarpa, located in the Escola de Agronomia of the
Universidade Federal de Goiás. For this, we used ten microsatellite markers with detection methods
by capillary electrophoresis. Individuals in the collection are from fruit collections occurred in 24
locations spanning the Brazilian savanna. In total, were evaluated 353 individuals in 119 progenies.
Subpopulations showed moderate level of genetic diversity for the evaluated loci and mean
heterozygosity was 0,59. Significant genetic structure was detected on subpopulations (𝜃𝑃 = 0,14),
with intrapopulation inbreeding coefficient (f) of 0,12 and total inbreeding (F) 0,25. These results
suggest that these subpopulations are not behaving as a panmitic population. Analyses of genetic
diversity through the genetic distance of Nei (1972), showed two distinct groups subdivided. The
correlation between genetic and geographic distances, doesn’t show a strong relationship between
these arrays (r = 0.27), suggesting that the physical distance between subpopulations is not
sufficient to differentiate them genetically. The germplasm collection has an effective size of 60,
an amount considered sufficient to conduct breeding programs (minimum 50), and presents an
allelic representation of 78.84% compared to 32 natural subpopulations. Thus, it can be concluded
that the collection of germplasm,satisfactorily, represents the genetic variability of H. stigonocarpa
while preserving their diversity, which is essential to support future work of conservation and
improvement of the species. / O estudo da variabilidade genética em populações de plantas é fundamental para a compreensão
da magnitude da biodiversidade nos ecossistemas. Entender como essa variabilidade está
estruturada fornece evidências de como a evolução está atuando nessas populações, trazendo
subsídios para traçar estratégias de conservação pertinentes àquela espécie. Uma das espécies
nativas do Cerrado que vem sendo alvo de estudos em diversas áreas é Hymenaea stigonocarpa
(Fabaceae). Seu potencial econômico é significativo, principalmente graças a seu valor nutricional.
O uso extrativista de plantas nativas serve de alerta, pois os recursos genéticos dessas plantas
podem se esgotar, sem ao menos descobrirmos seu total potencial. Diante disto, as coleções de
germoplasma, que conservam os recursos genéticos de organismos ex situ e in vivo, são uma
alternativa para ter acesso às informações sobre a espécie, ao mesmo tempo em que auxilia na
conservação de sua variabilidade genética. Este trabalho teve o objetivo de caracterizar, do ponto
de vista molecular, os indivíduos que compõem a coleção de germoplasma de H. stigonocarpa,
localizada na Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás. Para tanto, foram utilizados
dez marcadores microssatélites com métodos de detecção por eletroforese capilar. Os indivíduos
da coleção são provenientes de coletas de frutos ocorridas em 24 localidades de abrangência no
Cerrado. No total, foram avaliados 353 indivíduos distribuídos em 119 progênies. As
subpopulações apresentaram nível moderado de diversidade genética, para os locos avaliados, com
heterozigosidade média esperada de 0,59. Foi detectada estruturação genética significativa nas
subpopulações (𝜃𝑃 = 0,14), com coeficiente de endogamia intrapopulacional (𝑓) de 0,12 e
endogamia total (𝐹) de 0,25. Estes resultados sugerem que essas subpopulações não estão se
comportando como uma população panmítica. As análises de divergência genética, por meio da
distância genética de Nei (1972), apresentaram dois grupos distintos subdivididos. A correlação
entre as distâncias genética e geográfica, demonstra que não há uma relação muito forte entre essas
matrizes (𝑟 = 0,27), sugerindo que a distância física entre as subpopulações não é suficiente para
diferenciá-las geneticamente. A coleção de germoplasma detém um tamanho efetivo de 60, valor
considerado suficiente para a condução de programas de melhoramento (mínimo 50), além de
apresentar uma representatividade alélica de 78,84% com relação a 32 subpopulações naturais.
Assim, pode-se concluir que a coleção de germoplasma representa satisfatoriamente a variabilidade
genética de H. stigonocarpa, preservando sua diversidade, o que é fundamental para subsidiar
futuros trabalhos de conservação e melhoramento da espécie.
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Variabilidade genética em espécies de plantas do cerrado: uma avaliação cienciométrica e meta-analítica / Genetic variability in cerrado plant species populations. scientometric and meta-analytic evaluationSouza, Ueric José Borges de 29 May 2014 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2016-11-11T16:19:16Z
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Previous issue date: 2014-05-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Cerrado biome of Brazil originally occupied approximately 2 million km2
of the country.
It is formed by a heterogeneous mosaic of distinct habitats and has the richest flora of the
savanas of the world, with high diversity at level of genera and families. It is also currently
classified as a priority for conservation because of its rich biodiversity and simultaneous high
level on threat due to the destruction of natural habitats resulting from anthropogenic
activities. The advent of molecular biology techniques has allowed direct access to the genetic
variability of species and populations and made it possible to infer the genetic variability
within and among populations, increasing the interest in studying genetic diversity and
structure in plant species population of the Cerrado biome. It was conducted here an
exhaustive survey of scientific platforms such as the Web of Science, Scopus, Scielo and
Google Scholar, to carry out an analysis of published papers evaluating the genetic variability
within and among populations in plant species from the Cerrado biome, and to quantify and
describe aspects of scientific production in the field of population genetics to plant species
from the Cerrado using a scientometric approach, and using a meta-analytic approach to
evaluate genetic variability, it was collected some of the genetic parameters estimated in the
studies (observed (HO) and expected (HE) heterozygosities and the F statistics of Wright (FIS;
FST or analogs)) to test the effect of this genetic parameters in some life history and ecological
traits of the species and in methodological characteristics of the article. It was obtained 176
publications from 45 journals through the period of 1999-2012 and the number of studies
published has increased significantly through this period. The journal “Genetics and
Molecular Research” published the highest number of papers. Ninety-six species from 32
plant families were studied, with highest numbers from the family Fabaceae. Although the
species comprised a wide sample of plants with different characteristics, trees, shrubs and
herbs were the main life forms and “Mata de galeria”, “cerrado” and “cerradão” were the
main fitofisionomies studied. The molecular markers used included microsatellites, cpDNA,
isoenzymes, RAPDs, AFLPs and ISSRs and the Microsatellites were the most popular marker
used and also show the highest mean value from the genetic variability within populations
when compared across studies. It was observed that population genetics parameters molecular
derived from molecular markers are closely associated with some life history traits and
ecological traits of the species and with methodological characteristics of the article. The
analyses allows a better understanding of the current knowledge on plant population genetics
in Cerrado biome and the association with the population genetics parameters and some
ecological, life history and methodological traits has considerable importance and may be
useful to guide future research programs in this system with potential to produce information
with important implications in evolutionary biology and ecology as well as in conservation
biology / O bioma Cerrado ocupa aproximadamente 2 milhões km2
do Brasil. É formado por um
mosaico heterogêneo de tipos de vegetação e tem a mais rica flora entre as savanas do mundo,
com alta diversidade em nível de gêneros e famílias. Atualmente tem sido classificado como
prioridade em programas de conservação devido à sua rica biodiversidade e perda de habitats
naturais resultantes das atividades antropogênicas. Com o advento de técnicas moleculares,
tornou-se possível o acesso direto da variabilidade genética das espécies e do modo como essa
variabilidade genética se encontra distribuida dentro e entre populações, aumentando assim o
interesse em estudar a diversidade genética e estrutura populacional de espécies de plantas do
bioma Cerrado. Foi conduzida uma busca usando as bases de dados “Web of Science”,
“Scopus”, “Scielo” e “Google Scholar” com o objetivo de realizar uma análise dos artigos
publicados que avaliaram a variabilidade genética dentro e entre populações de espécies de
plantas do bioma Cerrado, de modo a quantificar e descrever aspectos da produção científica
na área de genética de populacões para espécies de plantas do Cerrado utilizando uma
abordagem cienciométrica, e utilizando uma abordagem meta-analítica foi coletado alguns
dos parâmetros genéticos estimados nos estudos (heterozigosidade esperada (HE) e observada
(HO) e as estatísticas F de Wright (FIS (coeficiente de endogamia); FST ou análogos)) para
testar o efeito destes parâmetros genéticos em caracteristicas ecológicas e de história de vida
das espécies, bem como para características metodológicas extraídas dos artigos. A busca na
base de dados resultou em um total de 176 publicações de 45 periódicos durante o período de
1999-2012 e o número de estudos publicados tem aumentado significativamente durante este
período. A revista Genetics and Molecular Research apresentou o maior número de artigos
publicados. Noventa e seis espécies, envolvendo 32 famílias botânicas foram estudadas, sendo
Fabaceae representada pelo maior número de espécies. Diferentes características entre as
espécies estudadas foi observado, sendo árvores, arbusto e ervas as principais forma de vida e
mata de galeria, cerrado e cerradão os principais tipos fitofisionômicos das espécies.
Diferentes tipos de marcadores moleculares, incluindo microssatélites, cpDNA, isoenzimas,
RAPDs, AFLPs e ISSRs foram utilizados, sendo os microssatélites o marcador mais
frequentemente usado, e também o com o maior valor médio para os parâmetros de
variabilidade genética dentro de populações quando comparados entre os estudos. Foi
observado que os parâmetros estimados nos estudos de genética de populações obtidos via
marcadores moleculares estão relacionados com características ecológicas e de história de
vida das espécies e com características metodologicas das publicações. A análise permitiu
uma melhor compreensão atual sobre a genética de populações de plantas do bioma Cerrado e
a associação encontrada entre parâmetros genético-populacionais e diferentes características
das espécies tem importância no sentido de orientar pesquisas futuras, com potencial para
produzir informações com implicações importantes para ecologia, biologia evolutiva e
biologia da conservação.
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Melhoramento genético para altos teores de ferro e zinco em feijoeiro-comum / Genetic breeding for high iron and zinc contents in common beanDi Prado, Poliana Regina Carloni 30 March 2017 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-10T12:38:29Z
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Previous issue date: 2017-03-30 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The iron and zinc deficiency reaches millions of people worldwide, generating public health problems. One of the most viable alternatives to minimize this issue is the biofortification and the common bean stands out as a crop with wide potential to be biofortified. The objectives of this work were: i) to verify the importance of genetic (G), environmental (E) and G x E interaction effects for iron content (FeC) and zinc content (ZnC) in common bean grains and to identify the cultivars/lines that associate high potential for FeC, ZnC, protein content (PtC), yield and weight of 100 grains (W100); ii) to verify if exists genetic relation between these traits; iii) to obtain, evaluate and select promising common bean segregating populations for high FeC and ZnC, yield and W100; iv) to estimate parental general (GCA) and specific (SCA) combining ability for FeC and ZnC, aiming the understanding of genetic control and the selection of parental lines; v) to estimate genetic parameters and to select lines for FeC, ZnC, yield and W100; vi) to validate microsatellites molecular markers (SSR), previously identified as linked to QTLs for FeC and ZnC in common bean, in breeding populations, with high mean. On the first study, to verify the importance of G x E interaction, 34 genotypes were evaluated at 19 environments, assessing the FeC, ZnC, PtC, yield and W100. Combined analyses of variance, adaptability and stability analyses by Nunes graphical method were performed, in addition to the estimation of genetic correlations between the traits. There were significant differences between genotypes for all traits. The environment and interaction effects were significant, and the environment represented the most of total variation, 63% (FeC) and 65% (ZnC), followed by G x E interaction effect, 18% (FeC) and 15% (ZnC). The cultivar BRS Sublime, with carioca grains type, combined high FeC, ZnC, PtC, yield and grains with commercial size, in addition to wide adaptability and stability. The genetic correlations between FeC x ZnC, FeC x PtC and ZnC x PtC were significant and positive, indicating, likely, the occurrence of pleiotropy or that some genes that control these traits are linked. It is concluded that, due to the great environmental effect influencing FeC and ZnC the evaluation trials of these traits should be performed in multiple environments. On the second study, 15 segregating populations were obtained and evaluated from crosses on complete diallel design between six parental lines selected for high FeC and ZnC. The populations were assessed at Santo Antônio de Goiás-GO, on winter/2012 (F2), winter/2013 (F3) and rainy/2013 (F4) seasons, and at Brasília-DF, on rainy/2013 (F4) season. The traits evaluated were FeC and ZnC, yield and W100. Significant differences were detected between the populations for all traits. Based on the combine analysis, for FeC additive effects were more important and the line G 2358 stood out by its high GCA (5.63). For ZnC, both additive and non additive effects were important, however no parental line showed significant GCA. The populations selected simultaneously for all four traits, based on combined analysis, were Porto Real x G 2358, BRSMG Majestoso x G 2358, BRS Requinte x BRSMG Majestoso, Porto Real x BRS Requinte and Porto Real x BRSMG Majestoso. The population BRS Requinte x G 2358 is indicated for extraction of lines with high FeC and ZnC. It is concluded that the parental G 2358 has great potential and must be used in new crosses to increase FeC in common bean grains. The population BRS Requinte x G 2358, that presented excellent performance for FeC and ZnC, and the population BRS Requinte x Porto Real, selected simultaneously for all traits, must follow on the breeding program for lines extraction. On the third step of this work, 116 lines of these two populations and five controls were assessed, in a triple lattice experimental design 11x11, at three environments and FeC, ZnC, yield and W100 were evaluated. Analyses of variance and the estimation of genetic parameters were performed. It was also performed the genotyping of the parental lines and lines of these populations with 20 SSR previously identified as linked to FeC and ZnC QTLs and, later, it was performed the single marker mapping analysis. Differences were identified between the lines at all environments for all traits. The estimates of heritability and expected gain from selection indicated the possibility of obtaining genetic gains for each trait individually. On simultaneous selection of lines for the four traits, based on combined analysis, the expected gains from selection of the best 24 lines were 4.7% for FeC, 2.8% for ZnC, 3.9% for yield and 0.9% for W100. Only the marker BM 154 was polymorphic and only on population BRS Requinte x Porto Real. The single marker mapping analysis showed association only between BM 154 and FeC, at one environment, explaining 14.5% of the phenotypic variation. It is concluded that there is possibility on selecting lines that combine desired phenotypes for the four traits of interest and that, likely, the QTLs linked to the tested markers are already fixed and that there is the presence of QTLs x environments interaction. / A deficiência de ferro e de zinco atinge milhões de pessoas em todo o mundo e gera problemas de saúde pública. Uma das alternativas mais viáveis para minimizar este problema é a biofortificação e o feijoeiro-comum se destaca com uma cultura com amplo potencial para ser biofortificada. Os objetivos deste trabalho foram: i) verificar a importância do efeito genético (G), ambiental (E) e da interação G x E para teor de ferro (TFe) e teor de zinco (TZn) nos grãos de feijoeiro-comum e identificar as cultivares/linhagens que associem alto potencial para TFe, TZn, teor de proteína (TPt), produtividade (Prod) e massa de 100 grãos (M100); ii) verificar se existe relação genética entre estes caracteres; iii) obter, avaliar e selecionar populações segregantes de feijoeiro-comum promissoras para alto TFe e TZn, Prod e M100, iv) estimar a capacidade geral (CGC) e específica (CEC) de combinação de genitores para TFe e TZn, entender o controle genético e selecionar genitores; v) estimar parâmetros genéticos e selecionar linhagens para TFe, TZn, Prod e M100; vi) validar marcadores moleculares microssatélites (SSR), previamente identificados como ligados a QTLs para TFe e TZn em feijoeiro-comum, em populações de melhoramento, com alta média. No primeiro estudo, para verificar a importância da interação G x E, avaliou-se o TFe, TZn, TPt, Prod e M100 de 34 genótipos em 19 ambientes. Realizaram-se análises de variância, análises de adaptabilidade e estabilidade pelo método de Nunes, além da estimação de correlações genéticas entre os caracteres. Houve diferenças significativas entre os genótipos para todos os caracteres. Os efeitos de ambientes e de interação foram significativos, sendo que o de ambientes representou a maior parte da variação total, 63% (TFe) e 65% (TZn), seguido pelo efeito de interação G x E, 18% (TFe) e 15% (TZn). A cultivar BRS Sublime, de grãos tipo carioca, reuniu altos TFe, TZn, TPt, Prod e grãos com tamanho comercial, além de ampla adaptabilidade e estabilidade. As correlações genéticas entre TFe x TZn, TFe x TPt e TZn x TPt foram significativas e positivas, o que indica provavelmente a ocorrência de pleiotropia ou que alguns genes que controlam esses caracteres estejam ligados. Conclui-se que devido ao grande efeito ambiental influenciando TFe e TZn os ensaios de avaliação desses caracteres devem ser realizados em vários ambientes. No segundo estudo, foram obtidas e avaliadas 15 populações segregantes a partir de cruzamentos no esquema de dialelo completo entre seis genitores selecionados para altos TFe e TZn. As populações foram avaliadas em Santo Antônio de Goiás-GO, nas safras de inverno/2012 (F2), inverno/2013 (F3) e águas/2013 (F4), e em Brasília-DF, na safra das águas/2013 (F4). Os caracteres avaliados foram TFe e TZn, Prod e M100. Foram detectadas diferenças significativas entre as populações para todos os caracteres. Com base na análise conjunta, para TFe os efeitos aditivos foram mais importantes e a linhagem G 2358 se destacou pela alta CGC (5,63). Para TZn, tanto os efeitos aditivos como os não aditivos foram importantes, entretanto nenhum genitor apresentou CGC significativa. As populações selecionadas simultaneamente para os quatro caracteres, com base na análise conjunta, foram Porto Real x G 2358, BRSMG Majestoso x G 2358, BRS Requinte x BRSMG Majestoso, Porto Real x BRS Requinte e Porto Real x BRSMG Majestoso. A população BRS Requinte x G 2358 é indicada para extração de linhagens com altos TFe e TZn. Conclui-se que o genitor G 2358 possui grande potencial e deve ser utilizado em novos cruzamentos para aumentar o TFe nos grãos de feijoeiro-comum. A população BRS Requinte x G 2358, que apresentou ótimo desempenho para TFe e TZn, e a população BRS Requinte x Porto Real, selecionada simultaneamente para todos os caracteres, devem seguir no programa de melhoramento para extração de linhagens. Na terceira etapa do trabalho, foram avaliadas 116 linhagens destas duas populações e cinco testemunhas, em delineamento experimental látice triplo 11x11, em três ambientes e foram avaliados TFe, TZn, Prod e M100. Foram realizadas análises de variância e estimação de parâmetros genéticos. Também foi realizada a genotipagem dos genitores e das linhagens destas populações com 20 SSR previamente identificados como ligados a QTLs de TFe e TZn e, posteriormente, realizada a análise de mapeamento por marca simples. Foram identificadas diferenças entre as linhagens em todos os ambientes para todos os caracteres. As estimativas de herdabilidade e de ganho esperado com a seleção indicaram a possibilidade de obtenção de ganhos genéticos para cada caráter isoladamente. Na seleção simultânea das linhagens para os quatro caracteres, com base na análise conjunta, os ganhos esperados com a seleção das 24 melhores linhagens foram de 4,7% para TFe, 2,8% para TZn, 3,9% para Prod e 0,9% para M100. Somente o marcador BM 154 foi polimórfico e apenas na população BRS Requinte x Porto Real. A análise de mapeamento por marca simples mostrou associação apenas entre BM 154 e TFe, em um ambiente, que explica 14,5% da variação fenotípica. Conclui-se que há possibilidade selecionar linhagens que reúnam fenótipos desejáveis para os quatro caracteres de interesse e que, provavelmente os QTLs ligados aos marcadores testados já estão fixados e que há presença de interação de QTLs com ambientes.
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Determinação de compostos orgânicos no material particulado (MP(sub>10) atmosférico do estado de São Paulo / Determination of Organic Compounds in Airborne Particulate Matter (PM10) collected in São Paulo State SitesFernando Cavalcante dos Santos 16 November 2010 (has links)
A poluição do ar causa um dos impactos ambientais mais significativos e seus efeitos afetam em diversas formas a saúde humana, os ecossistemas, os materiais e as condições climáticas globais. Sabendo-se que a composição do material particulado ainda é bastante desconhecida no Brasil e que regiões com diferentes características sociais, culturais e econômicas além de geográficas emitem poluentes para a atmosfera com diferenças qualitativas e quantitativas, este trabalho teve como objetivo principal determinar na fase particulada, n-alcanos e HPAs por cromatografia a gás com detecção por ionização em chama (CG-DIC); n-alcanais e n-alcanonas por cromatografia a gás com detecção por espectrometria de massas (CG/EM). Também foram investigados a influência das queimadas provenientes do plantio da cana-deaçúcar e o transporte de poluentes através do modelo de trajetória de chegada de massas de ar. Amostras de material particulado (MP10) foram coletadas no estado de São Paulo (Brasil): (i) Cidade Universitária - SPA, área urbana com tráfego intenso de veículos leves e pesados, (ii) ESALQ - PRB, região impactada pela atividade agrícola e queima da cana-de-açúcar, (iii) Núcleo Florestal Santa Virgínia - MAT, uma região com baixo impacto antrópico. A concentração de MP10 e as trajetórias de chegada de massas de ar mostraram que os sítios SPA e MAT recebem influências da região de queima de biomassa. Estas concentrações médias ultrapassaram os níveis diários recomendados pela OMS (MP10 = 50 µg m-3), apesar de estarem dentro dos limites da legislação brasileira (MP10 = 150 µg m-3) para o padrão diário. Para avaliar as possíveis fontes de emissão de alguns compostos orgânicos foram calculados alguns índices que forneceram as seguintes informações sobre os sítios de estudo: o sítio SPA apresentou influência antrópica embora também tenha apresentado contribuição biogênica por localizar-se dentro da Cidade Universitária, local próximo a uma pequena área verde; o sítio PRB apresentou índices encontrados em sítios urbanos e florestais e suas emissões estiveram associadas a fatores antrópicos como, emissões veiculares, atividade industrial, queima de biomassa e principalmente a combustão de carvão, que esteve presente apenas nas amostras de PRB. O sítio MAT apresentou uma contribuição predominantemente de origem biogênica aproximando-se aos índices de regiões florestais previamente estudadas. Apesar de ser um sítio com baixa influência antrópica, MAT sofreu influência do transporte de massa, emissões veiculares e das queimadas ocorridas no norte nordeste do estado de São Paulo. As concentrações de n-alcanais encontradas em MAT são comparáveis a resultados obtidos em regiões marinhas, sendo possível que os n-alcanais determinados tenham a mesma origem, devido à proximidade do sítio ao oceano. Os sítios SPA e PRB apresentaram valores de concentração de n-alcanonas superiores a MAT, sugerindo que estes compostos são principalmente formados em áreas urbanas. / Air pollution causes one of the most significant environmental impacts and its effects impact the human health, ecosystems, materials and the global climatic conditions. The composition of the particulate material collected in Brazilian sites is still unknown and regions with social, cultural and economic differences, as well as geographical characteristics, emit pollutants into the atmosphere with qualitative and quantitative differences. This study aimed to determine in the particulate phase, nalkanes and PAHs by gas chromatography with flame ionization detection (GC-FID) and n-alkanals and n-alkanones by gas chromatography with mass spectrometry detection (GC/MS). The influence of the sugarcane burning and the transport of pollutants were studied using the air masses trajectories. Samples of particulate matter (PM10) were collected at sites in São Paulo State (Brazil): (i) SPA, urban area with traffic of heavy and light vehicles, (ii) PRB, site impacted by agricultural and sugarcane burning activities, (iii) MAT, a forest site with low anthropogenic impact. The concentration of PM10 and the trajectories of air mass showed that the sites SPA and MAT are influenced by regional biomass burning. The PM10 concentrations exceeded the levels recommended by the World Health Organization (PM10 = 50 µm m-3), although being within the limits of the brazilian legislation (PM10 = 150 µm m-3) for the daily pattern. According to some diagnostic ratios used to evaluate the possible emissions sources of organic compounds, the SPA site presented anthropogenic and biogenic influences; PRB site presented mixed (urban and forest) influences associated to anthropogenic activities, such as vehicular emissions, industrial activity, biomass burning and mainly coal burning (only in PRB samples). MAT site presented predominantly biogenic contribution, similar a others forest sites in the world, although influenced by transport of air masses (observed by air mass trajectories), vehicle emissions and sugarcane burning occurred in the Sao Paulo State. MAT site presented n-alkanals concentrations found at marine areas suggesting contribution from ocean. SPA and PRB sites showed concentrations of n-alkanones higher than those found at MAT site, suggesting that these compounds are mainly formed in urban areas.
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