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Aplicação de técnicas moleculares no diagnóstico laboratorial complementar das infecções virais do sistema nervoso central no Hospital Universitário da USP. / Molecular techniques application for the complementary laboratory diagnosis of viral infections of the central nervous system, at the University Hospital of USP.Nunes, Rafaella Almeida Lima 22 August 2013 (has links)
Enterovírus (HEV), herpesvírus 1 e 2 (HHV-1 e HHV-2) e adenovírus (HAdV) são importantes agentes de infecções do SNC. Neste trabalho, técnicas moleculares foram aplicadas para a detecção destes vírus em quadros de infecção do SNC. Amostras de líquor foram colhidas de pacientes atendidos no HU-USP entre agosto e novembro/2010 e fevereiro/2012 a janeiro/2013. Através da Nested-PCR HEV foram detectados em 9,8% das amostras, HAdV em 2,5% e HHV-1 e 2 em 1,1%, além de 3 casos de coinfecção, 2 entre HEV e HHV, e 1 entre HEV e HAdV. O material genético viral foi extraído através dos métodos Qiaamp DNA Blood (Qiagen®) e MagMAXTM Viral RNA Isolation (Ambiom), e este último pareceu mais adequado à aplicação na rotina clínica. A análise quimiocitológica do líquor mostrou-se importante no direcionamento da conduta clínica, mas a detecção do vírus é fundamental para a conclusão do diagnóstico. A PCR em tempo real, cuja padronização foi iniciada neste trabalho, consiste em importante ferramenta para a utilização futura no diagnóstico complementar das infecções virais do SNC. / Enteroviruses (HEV), herpesviruses 1 and 2 (HHV-1 and HHV-2) and adenoviruses (HAdV) are important causative agents of infections of the CNS. In this study, molecular techniques were applied to the detection of these viruses. CSF samples were collected from patients treated at the University Hospital of USP, between August and November, 2010, and February 2012 and January 2013. By the Nested-PCR reaction, HEV were detected in 9.8% of the samples, HAdV in 2.5% and HHV-1 and 2 in 1.1%. There were 3 cases of coinfection: 2 with HEV and HHV and other with HEV and HAdV. The viral genetic materials were extracted by QIAamp DNA Blood kit (Qiagen®) and MagMAXTM Viral RNA Isolation (Ambiom), and the second one showed to be more suitable for the application in clinical diagnosis. The CSF chemocytologic analysis proved to be important in directing the clinical conduct, but the detection of viruses is essential for the diagnosis. The real time PCR, which standardization was initiated in this work, will be an important tool for complementary diagnosis of viral infections of the CNS.
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Padronização de teste molecular para o diagnóstico de meningites bacterianas pós-neurocirurgia / Standardization of molecular test for the diagnosis of bacterial meningitis after neurosurgeryMedeiros, Micheli 08 February 2019 (has links)
Resumo: A meningite é uma inflamação das membranas que revestem o sistema nervoso central. As principais etiologias desta doença são de origem infecciosa, podendo ser bacteriana, fúngica ou viral. A meningite pode ocorrer como uma infecção hospitalar e pode ser associada a trauma ou neurocirurgia. Quando diagnosticada após um procedimento neurocirúrgico, a maior parte dos agentes infecciosos causadores da meningite provem da microbiota endógena da pele e do cabelo. No entanto, existem casos no qual o agente etiológico não é diagnosticado pelas técnicas laboratoriais convencionais, como a cultura microbiológica e bacterioscopia, dificultando a prescrição de terapias adequadas. O objetivo deste estudo foi identificar os agentes causadores de meningite após neurocirurgia (MAN) utilizando técnicas de biologia molecular e comparando-as com a cultura microbiológica. Foram incluídas amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes submetidos a neurocirurgia e pacientes submetidos a cirurgias eletivas com uso de raquianestesia durante o período de 2015 a 2016. A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para avaliação da presença do gene 16S do DNA ribossômico, comum em microrganismos de origem bacteriana, e o sequenciamento do mesmo para a identificação do agente etiológico. As amostras foram classificadas em 5 grupos de acordo com a suspeita clínica e dados quimiocitológicos do LCR: meningite bacteriana (MB) confirmada, MB possível, MB provável, MB improvável e sem MB, neste último grupo estão apenas pacientes submetidos a cirurgias eletivas. Das 51 amostras de LCR incluídas (43 pós-neurocirurgia e 8 pré-anestésica), 21 (41,2%) apresentaram cultura microbiológica negativa com PCR positiva, sendo: 3 (14,2%) MB possível, 4 (19,0%) MB provável, 13 (62,0%) MB improvável, 1 (4,8%) sem MB. Do total de 15 amostras positivas para PCR foi identificada ao menos a família filogenética, houve predomínio de microrganismos Gram negativos, somando 11 contra 4 Gram positivos. A identificação dos agentes etiológicos na MAN, incluindo os não detectados por métodos convencionais de identificação laboratorial, demonstraram que a biologia molecular pode complementar o diagnóstico colaborando de forma positiva, guiando o tratamento para o microrganismo específico ou sua família / Abstract: Meningitis is an inflammation of the membranes covering the central nervous system. The main causes of this disease are bacterial, fungal or viral agents. Meningitis may be associated with trauma or neurosurgery. When meningitis is diagnosed after a neurosurgical procedure, the most common microorganisms belong to skin and hair microbiota. However, there are cases in which the etiological agent is not diagnosed by conventional laboratory techniques, such as microbial culture and bacterioscopy, which makes it difficult to establish adequate therapies. The objective of this study is to identify agents causing meningitis after neurosurgery (MAN) using polymerase chain reaction (PCR) and sequencing of the 16S rRNA gene, compared to the conventional microbiological culture. Cerebrospinal fluid (CSF) was collected from 43 patients who had undergone neurosurgery and 8 patients during spinal anesthesia were included during the period from 2015 to 2016. Polymerase chain reaction (PCR) was used to evaluate the presence of the 16S ribosomal RNA gene, common in microorganisms of bacterial origin, and the sequencing of the same for the identification of the etiological agent. Samples were classified into five groups according to clinical data and CSF analysis: confirmed bacterial meningitis (MB), probable MB, possible MB, unlikely MB, no meningitis, in this last group are only patients submitted to elective surgeries. There were 51 CSF samples included (43 post neurosurgery and 8 pre-spinal anesthesia), 21 samples (41.2%) presented negative microbial culture and were PCR-positive, divided as: 3 (14.2%) probable MB, 4 (19%) possible MB, 13 (62%) unlikely MB and 1 (4.8%) no meningitis. From the total of 15 PCR-positive samples at least the phylogenetic family was identified with a predominance of Gram negative microorganisms, (11). The identification of etiologic agents in MAN, including those not detected by conventional laboratory identification methods, suggests molecular biology can complement the diagnosis and collaborate in guiding the treatment for the specific microorganism or its family
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Desenvolvimento e avaliação de modelo computacional para geração de alertas a partir de notificações de casos de meningite meningocócica / Development and evaluation of a computing model of alerts from meningococcal meningitis notification casesZaparoli, Wagner 24 November 2008 (has links)
INTRODUÇÃO: este trabalho apresenta a arquitetura de um sistema de emissão de alertas para surtos e epidemias em tempo real, baseado em notificações eletrônicas da meningite, e discute os resultados dos testes e simulações realizados. MÉTODOS: esse sistema foi desenvolvido em quatro etapas: Concepção, Análise, Construção e Teste/Simulações. A Concepção contemplou a elicitação de requisitos, a qual definiu o que o sistema deve fazer. A Análise se preocupou com a modelagem e especificação das regras que definem como o sistema deve trabalhar. A Construção abrangeu a transformação das regras definidas e modeladas em linguagem de programação. A última etapa, Teste/Simulação, foi responsável por garantir que o sistema construído estava em conformidade com os requisitos elicitados na etapa de Concepção. RESULTADOS: vários artefatos foram criados e algumas constatações foram verificadas nesta etapa. Sobre os artefatos podemos citar os requisitos, casos de uso, diagrama de classes, modelo físico de dados, casos de teste e programas. Sobre as constatações podemos citar o disparo de alertas nas simulações realizadas pelo sistema dois dias antes que o alerta feito pelas autoridades de saúde do Estado de São Paulo usando os procedimentos habituais. DISCUSSÃO e CONCLUSÃO: O sistema desenvolvido pode ser classificado como um Early Warning System. Nas simulações, observamos que em duas oportunidades ele conseguiu evidenciar ocorrência de surto antecipadamente ao método tradicional utilizado pelo Centro de Vigilância Epidemiológico de São Paulo. Comparando-o com sistemas semelhantes em produção, verificamos que esse sistema se diferencia ao emitir ativamente alertas de surtos em tempo real. / INTRODUCTION: this essay presents the architecture of an alert system for epidemics based on real-time electronic notification of meningococcal meningitis, and discusses the results of tests and simulations made. METHODS: this system was developed in four stages: Conception, Analysis, Construction and Test/Simulation. The Conception covered the requirements elicitation, which defined what the system should do. The Analysis involved the modeling and specification rules that defined how the system should work. The Construction covered the transformation of defined and modeled rules in programming language. The last stage, Test/Simulation, checked the system under known scenarios, comparing the timing of outputs with the Brazilian notification surveillance framework. RESULTS: many artifacts were made and some evidences were verified. About the artifacts we can mention the requirements, use cases, class diagram, physical data model, test cases, and algorithms. About the evidences we can mention the fast alert production in simulations of this system as compared with the current procedure in use by health authorities. DISCUSSION AND CONCLUSION: this system can be classified as an Early Warning System. In simulations we observed that in two opportunities, it managed to put in evidence outbreak occurrence in advance to the traditional used method by Epidemiological Surveillance Center of São Paulo. In comparison with the similar systems under operation, we note this system is distinguished from them in issuing real-time outbreak alerts.
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Estudo da imunogenicidade de antígenos de Neisseria meningitidis: utilização de toxóide como adjuvante, vetorizado em lipossomas, no modelo camundongo. / Neisseria meningitidis antigens immune response study: toxoid as mice model adjuvant encapsulated in liposomes.Cunha, Tulio Nakazato da 09 December 2008 (has links)
N.meningitidis é diplococcus gram-negativo, patógeno estritamente humano que similarmente a outras bactérias é circundado por membrana externa, com lipídios, proteínas (OMP) e lipopolissacárides. Ela tem sido uma das principais causas da meningite e de outras infecções invasoras no mundo. Este trabalho buscou usar o toxóide STX2 de E.coli como adjuvante para um possível e futuro modelo vacinal e como estimulante antigênico, proteínas da membrana externa do meningococo (OMP) transportados em lipossomas. Observaram-se diferenças na produção de anticorpos IgG obtidas entre os camundongos após cada uma das 3 sangrias mas, não quanto ao índice de avidez. A nova preparação antigênica desencadeou um alto título, mesmo após um ano da 1ª imunização, estimulou a produção de anticorpos para outros sítios de ligação e serviu como proteção ao LPS residual dos processos com deoxicolato da OMP, diminuindo toxicidade da preparação IM reduzindo os riscos para idosos e crianças muito pequenas e também, em imunizações de longo termo, com grande vantagem aos sistemas tradicionais. / N.meningitidis is diplococcus gram-negative strict human patogen that similarly to other bacteria are surrounded by external membrane with lipids, proteins (OMP) and LPS. It has been one of the main causes of the meningitidis and other invading infections in the world. This work searched to use STX2 toxoid of E.coli as adjuvant for a possible and future vaccine model and as antigenic stimulant proteins of the external membrane of meningococci (OMP) carried in liposomes. Differences in the production of IgG antibodies gotten between the mice each one of the 3 bleedings had been observed after but not how much to the avidity index. The new antigenic preparation unchained one high heading exactly after one year of 1st immunization stimulated the production of antibodies for other sites of linking and served as protection to the residual LPS of the processes with deoxicolate of the OMP diminishing toxicity of IM preparation reducing the aged risks for and very small children e also, in immunizations of long term with great advantage to the traditional systems.
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Estabelecimento de métodos moleculares para aplicação no diagnóstico rápido de virus neurotrópicos. / The integration of molecular methods into the rapid laboratorial diagnostic of neurotropic viruses.Santos, Daniela Carvalho dos 04 September 2009 (has links)
Diversos agentes virais são causadores de meningites e meningoencefalites. Neste estudo, técnicas moleculares foram utilizadas para detecção de HEV, HHV e HAdV em amostras de líquor colhidas de janeiro de 2005 a março de 2007. Dos três métodos de extração de DNA e RNA testados, o kit DNA Qiablood Qiagen® se mostrou o mais sensível e específico. A nested PCR detectou HEV em 28% das amostras, HSV em 4%, HHV-3 em 1%; HHV-4 em 0,3%, HHV-5 em 0,3%, HHV-6 em 0,7% e HAdV em 13%. Através da PCR em tempo real os HEV foram detectados em 23,3% e HSV em 5,1%. Por neutralização, somente duas amostras foram sorotipadas (Echovirus 6 e Coxsackievirus B). Os HEV detectados foram então seqüenciados para a determinação do sorotipo. Os sorotipos Echovirus 18 (53%) e Coxsackievirus B5 (26%) foram os mais freqüentes. As técnicas de biologia molecular aplicadas na detecção de HEV, HHV e HAdV no líquor trazem grandes vantagens ao diagnóstico de doenças do SNC graças à rapidez no diagnóstico, alta sensibilidade e especificidade. / Several viruses are etiological agents of meningitis and meningoencephalitis. In this study, molecular techniques were used for the detection of HEV, HHV and HAdV in liquor samples, collected from January 2005 to March 2007. Among the three methods tested for the extraction of DNA and RNA, the DNA Qiablood kit - Qiagen® was the most sensible and specific. HEV (28%), HSV (4%), HHV-3 (1%), HHV-4 (0.3%), HHV-5 (0.3%), HHV-6 (0.7%) and HAdV (13%) were detected by Nested PCR in the samples. By real time PCR, HEV were detected in 23.3% and HSV in 5.1%. Only two HEV could be serotyped by neutralization (Echovirus 6 and Coxsackievirus B). All detected HEV were then sequenced to determine the serotype. The serotypes echovirus 18 (53%) and Coxsackievirus B5 (26%) were the most frequent. Molecular biology techniques applied in the detection of HEV, HAdV and HHV in CSF bring major benefits to the diagnosis of meningitis thanks to the rapid diagnosis, high sensibility and specificity.
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Análise e determinação de custos específicos e consequências econômico-sociais na incorporação da vacina contra meningite e doença meningocócica C conjugada na rotina do Programa Nacional de Imunização/PNI / Analysis and determination of specific costs and socioeconomic consequences in the incorporation of the vaccine against meningitis and Meningococcal Disease C conjugate in the routine national immunization program / NIPItria, Alexander 14 October 2011 (has links)
As avaliações econômicas em saúde, que se propõe a estudar a alocação mais eficiente de recursos, apresentam expansão nos últimos 20 anos. Para as vacinas especificamente, há crescente surgimento das avaliações econômicas de programas de vacinação dado aumento dos preços das novas vacinas. Nesse cenário tem-se que a doença meningocócica continua sendo um agravo de extrema importância na população mundial, com características peculiares quando se consideram manifestações, morbi-mortalidade e ocorrência nas diferentes regiões. Não são suficientemente conhecidas as causas do início de uma epidemia em um dado momento e lugar, mas sabe-se que são necessários a presença concomitante de múltiplos fatores, como características do agente etiológico, do hospedeiro e do meio ambiente. Isto inclui a susceptibilidade da população, condições climáticas favoráveis, situação socioeconômica precária, tornando a prevenção primária da doença difícil, sendo necessária uma intervenção específica como as vacinas. Há diversas complicações da doença meningocócica, principalmente as sequelas, sendo as mais comuns a perda auditiva, as amputações, necrose de pele e convulsões. O Brasil, através do Programa Nacional de Imunizações / PNI, incluiu em sua agenda de Avaliação de Tecnologias em Saúde, via Secretaria de Vigilância Sanitária do Ministério da Saúde, avaliações econômicas locais para introdução de novas vacinas no calendário nacional de vacinação, sendo uma delas a vacina antimeningocócica C conjugada. Assim o objetivo desta tese é desenvolver um estudo complementar de custo-efetividade para a vacina conjugada contra a doença meningocócica C, com inclusão de estimativas suplementares de custos adicionais, para análise da sua repercussão sobre as razões incrementais encontradas em estudo original. A fim de aprofundar os estudos que medem as proporções de sequelas e os custos indiretos, bem como a inserção de novos custos. A hipótese sugere que a medição e valoração de custos envolvidos com sequelas da doença, aprimora os resultados do estudo de custo-efetividade e agregar elementos adicionais nas decisões dos gestores. Foram realizadas na cidade de Sorocaba entrevistas junto aos doentes e familiares com questionários de rotina de gastos e de qualidade de vida - EuroQol (EQ-5D), sendo inseridos nas análise de custoefetividade, os gastos diversos realizados pelas famílias, ora denominado de Gastos Familiares . A tese teve como resultado o fato que o melhor detalhamento e inserção de gastos familiares no tratamento de pessoas que adquiriram deficiências em consequência de sequelas, alterou a relação de custo-efetividade no programa de vacinação da doença meningocócica. A análise de sensibilidade mostrou que esses dados, quando extrapolados resultam num valor incremental ainda mais próximo no valor ideal de custo-efetividade / The economic evaluations in health, which proposes to study the more efficient allocation of resources, an expansion in the last 20 years. For vaccines specifically, there is increasing emergence of economic evaluations of vaccination programs because price increases of new vaccines. In this scenario have that meningococcal disease still a disorder of extreme importance in the world population with peculiar characteristics when considering events, morbidity, mortality and incidence in different regions. Are not sufficiently known cause of the beginning of an epidemic in a given time and place, but it is known that it takes the concomitant presence of multiple factors like characteristics of the agent, host and environment. This includes the susceptibility of the population, favorable climatic conditions, poor socioeconomic situation, making the primary prevention of the disease hard and requires specific interventions such as vaccines. There are several complications of meningococcal disease, mostly the sequels, the most common hearing loss, amputations, skin necrosis and seizures. Brazil, through the National Immunization Program / PNI, included in its agenda for Technology Assessment in Health via the Health Surveillance Secretariat of the Ministry of Health, local economic assessments for the introduction of new vaccines in national vaccination schedule, one of which meningococcal C conjugate vaccine. So the purpose of this thesis is to develop a complementary study of cost-effectiveness for the conjugate vaccine against meningococcal C disease, with inclusion of supplementary estimates of additional costs for analysis of its impact on the incremental ratios found in the original study. In order to deepen the studies that measures the proportions of sequels and indirect costs, as well as the inclusion of new costs. The hypothesis suggests that the measurement and valuation of costs involved with sequelae of disease, improves the results of cost-effectiveness and add additional elements in the decisions of managers. Were held in the city of Sorocaba interviews with the patients and family questionnaires for routine expenditures and quality of life - EuroQol (EQ-5D), and inserted into the cost-effectiveness, the spending made by many families, sometimes called \"Family Expenditures\". The thesis resulted in the fact that better detail and inclusion of family spending in treating people who have acquired disabilities as a result of disability, has changed the costeffectiveness in the program of vaccination for meningococcal meningitis. The sensitivity analysis showed that these data, when extrapolated result in incremental value even closer to the ideal value of cost-effectiveness
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Doenças inflamatórias bacterianas que afetam o sistema nervoso de ruminantes no Rio Grande do SulKonradt , Guilherme January 2016 (has links)
Distúrbios do sistema nervoso central (SNC) em ruminantes abrangem um importante grupo de enfermidades responsáveis por grandes perdas econômicas em todo o mundo. As principais doenças neurológicas causadas por bactérias em ruminantes e que envolvem processos inflamatórios incluem listeriose, leptomeningites e meningoencefalites supurativas, abscessos cerebrais e medulares, empiema basilar e neurotuberculose. Esta dissertação teve por objetivo a caracterização epidemiológica, patológica, microbiológica e imuno-histoquímica das doenças inflamatórias de origem bacteriana que afetam o SNC de ruminantes no Rio Grande do Sul. Foi realizado um estudo retrospectivo no período compreendido entre janeiro de 1996 a dezembro de 2015, onde um total de 3.274 bovinos, 596 ovinos e 391 caprinos foram avaliados. Destes, 219 bovinos, 21 ovinos e sete caprinos foram diagnosticados com doenças inflamatórias no SNC. As doenças neurológicas inflamatórias de origem bacteriana totalizaram 60 casos divididos em 34 bovinos, 19 ovinos e sete caprinos, os quais foram subdivididas em: meningoencefalite por L. monocytogenes (oito ovinos, cinco caprinos e quatro bovinos), leptomeningite e meningoencefalite supurativa (14 bovinos, dois caprinos e um ovino), abscessos cerebrais (seis bovinos e dois ovinos) e medulares (sete ovinos), empiema basilar (quatro bovinos e um ovino) e neurotuberculose (seis bovinos). O exame imuno-histoquímica foi realizado em todos os casos diagnosticados com listeriose (anticorpo anti-L. monocytogenes), meningite e meningoencefalite supurativa (anticorpo anti-Escherichia coli) e neurotuberculose (anticorpo anti-Mycobacterium tuberculosis). A meningoencefalite por L. monocytogenes representou a principal enfermidade neurológica em ovinos e caprinos, seguido dos abscessos medulares em ovinos. Nos bovinos, a leptomeningite e meningoencefalite supurativa foi a doença neurológica mais prevalente para a espécie, frequentemente relacionada com a falha na transmissão da imunidade passiva. O empiema basilar, frequentemente diagnosticado em bezerros, está diretamente relacionado com o manejo do desmame interrompido através da utilização de tabuletas nasais. A neurotuberculose causada por Mycobacterium spp. é uma importante doença neurológica em bovinos jovens e deve ser considerada como diagnóstico diferencial de doenças neurológicas. Dos dados analisados neste período, as doenças neurológicas inflamatórias bacterianas representaram um total de 24,3% entre as doenças neurológicas inflamatórias diagnosticadas neste período e, com isso, conclui-se que representam importantes causas de mortalidade para os ruminantes domésticos. / Central nervous system (CNS) diseases are worldwide economically important conditions in ruminants. The main neurological bacterial diseases which involve inflammation in ruminants are listeriosis, suppurative leptomeningitis and meningoencephalitis, brain and spinal cord abscesses, basilar empyema and neurotuberculosis. This study aim to describe the epidemiological, pathological, microbiological and immunohistochemical findings of the bacterial inflammatory diseases that affect the CNS of ruminants in Rio Grande do Sul state. A retrospective study was performed from January 1996 to December 2015, during which samples of 3.274 cattle, 596 sheep and 391 goats were evaluated. Of these, 219 cattle, 21 sheep and seven goats were diagnosed with inflammatory diseases affecting the CNS. The neurological inflammatory bacterial diseases accounted for 60 cases, which corresponded to 34 cases in cattle, 19 in sheep and seven in goats. These were further subdivided in: meningoencephalitis by L. monocytogenes (eigth sheep, five goats and four cattle), suppurative leptomeningitis and meningoencephalitis (14 cattle, two goats and one sheep), brain abscesses (six cattle and two sheep) and spinal cord (seven sheep), basilar empyema (four cattle and one sheep) and neurotuberculosis (six cattle). Immunohistochemical exam was performed in all cases diagnosed as listeriosis (antibody anti-L. monocytogenes), as suppurative leptomeningitis and meningoencephalitis (antibody anti-E. coli), and as neurotuberculosis (antibody anti-Mycobacterium tuberculosis). L. monocytogenes meningoencephalitis was the main neurological disease in sheep and goats, followed by spinal cord abscesses in sheep. In cattle, suppurative leptomeningitis and meningoencephalitis was the most frequent neurological disease, and its ocorrunce is related to the failure in passive immunity transmission. Basilar empyema is frequently diagnosed in calves and is directly related to early weaning handling through the use of nose-flaps. Neurotuberculosis caused by Mycobacterium spp. is an important neurological disease in young cattle and should be consired as a differential diagnosis of granulomatous meningoencephalitis. During the described period, neurological inflammatory bacterial diseases accounted for 24.3% of the neurological inflammatory diseases, and, thus, these are important causes of death in domestic ruminants.
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Custos hospitalares da meningite causada por Streptococcus pneumoniae na cidade de São José dos Campos, SP / Hospital costs of Streptococcus pneumoniae meningitis in the city of São José dos Campos, SPLucarevschi, Bianca Rezende 21 September 2010 (has links)
O conhecimento dos custos das doenças imunopreveníveis, em especial os custos hospitalares da meningite pneumocócica, objeto de estudo desta tese, são de grande importância para os processos de tomada de decisão no que se refere a intervenções ou estratégias de saúde pública. O objetivo desta tese foi estimar os custos hospitalares relacionados à meningite pelo Streptococcus pneumoniae em crianças com idade até 13 anos (inclusive), na cidade de São José dos Campos, nos últimos dez anos. Foi realizado um estudo retrospectivo de custo-de-doença, a partir dos casos notificados de meningite pneumocócica ocorridos de janeiro de 1999 a dezembro de 2008. O cálculo da estimativa de custos hospitalares foi realizado de acordo com o método misto para a mensuração das quantidades dos itens de custos identificados e também para atribuição de valor aos itens consumidos, fazendo uso do micro-costing quando este era possível, e do gross-costing, como alternativa de viabilidade. Todos os custos foram calculados com os valores monetários referentes a novembro de 2009, e expressos em reais. Para análise das freqüências e médias, foi usado o programa Epi-Info versão 3.5.1. Resultados: De 1999 a 2008, foram notificados ao núcleo municipal de vigilância epidemiológica 41 casos de meningite pneumocócica em menores com até 13 anos de idade (média = 4,8 anos), a maior parte meninos (65,6%; n=27). A prevalência variou entre 0,48 e 5,96%, ao longo do período de estudo, e o número de casos variou de 1 a 9 por ano. O tempo de internação variou entre 8 e 47 dias (média = 23,1 dias). Dez casos evoluíram para o óbito (24,4%; 95%IC = 12,4% - 40,3%). Dois pacientes evoluíram com hidrocefalia já durante a internação por meningite aguda (11,1%; 95% IC = 1,4% - 34,7%). A complicação mais comum foi a infecção secundária ocorrida em 22,2% dos casos (95% IC = 6,4% - 47,6%), sendo um caso de infecção osteo-articular em paciente com anemia falciforme e deficiência de complemento (fração C2), um caso de pericardite purulenta, e dois casos de pneumonia associada a ventilação mecânica. Os custos hospitalares diretos variaram de R$1.277,9 a R$19.887,56, com média de R$5.666,43. Os custos dos honorários profissionais foram os mais relevantes, e variaram de R$311,00 a R$3.844,95 (média = R$1.211,30), seguidos pelos custos dos medicamentos (de R$60,14 a R$2.602,85; média = R$632,95), procedimentos (de R$7,04 a R$1.655,24; média = R$846,77), materiais (de R$15,42 a R$1.083,08; média = R$210,24), e exames laboratoriais (de R$18,3 a R$ 324,67; média = R$161,32). A falta de padronização nas condutas diagnósticas e terapêuticas, somada às diferenças na gravidade e na evolução clínica entre os casos, fez com que os custos fossem muito variáveis caso a caso, e mesmo ano a ano. Conclui-se, então, que os custos do tratamento hospitalar da meningite pneumocócica em São José dos Campos foram muito variáveis, e dependeram da conduta médica e das variações dos casos quanto a gravidade e evolução clínica. Em todos os casos foram considerados altos, cerca de 10 a 20 vezes maiores que o custo médio de internações pago pelo SUS por AIH / The knowledge of the costs of immuno-preventable diseases, mainly the hospital costs of pneumococcal meningitis, object of study of this thesis, are of great importance to the processes of decision making regarding public health interventions or strategies. The aim of this thesis was to estimate the direct hospital costs related to pneumococcal meningitis in children until 13 years of age, in the city of São José dos Campos, from January 1999 to December 2008. A retrospective cost-of-illness study was performed, from the notified cases of pneumococcal meningitis which happened in the period of study. The estimate calculation of the hospital costs was carried out according to the mixed method for the measurement of the quantities of the items of identified costs, and also to value attribution to the items consumed, making use of micro-costing when this was possible, and of the gross-costing, as a viability alternative. All costs were calculated according to the monetary values of November 2009, and in the Brazilian currency (Real). As for the analysis of frequencies and averages, the Epi-Info program, version 3.5.1, was used. Results: From 1999 to 2008, 41 cases of pneumococcal meningitis in minors until 13 years of age (average = 4.8 years of age), mostly boys (65.6%; n=27) were notified to the municipal nucleus of epidemiological vigilance. The prevalence varied between 0.48 and 5.96%, during the period of study, and the number of cases varied from 1 to 9 per year. The period of permanence in hospital varied between 8 and 47 days (average = 23.1 days). Ten cases resulted in death (24.4%; 95%IC = 12.4% - 40.3%). Two patients acquired hydrocephalus during acute meningitis (11.1%; 95% IC = 1.4% - 34.7%). However, the most common complication was the secondary infection which occurred in 22.2% of the cases (95% IC = 6.4% - 47.6%). There was one case of osteo-articular infection in patient with sickle cell anemia and complement deficiency (C2 fraction), a case of purulent pericarditis, and two cases of pneumonia associated to mechanic ventilation. The direct hospital costs varied from R$1,277.9 to R$19,887.56, with an average of R$5,666.43. Labor costs were more relevant, and varied from R$311.00 to R$3844.95 (average = R$1,211.30), followed by medication costs (from R$60.14 to R$2,602.85; average = R$632.95), procedures (from R$7.04 to R$1,655.24; average = R$846.77), supplies (from R$15.42 to R$1,083.08; average = R$210.24), and lab exams (from R$18.3 to R$ 324.67; average = R$161.32). The lack of standardization in the approach to diagnosis and therapy, added to the differences on the level of seriousness and clinic evolution between the cases, made the costs vary depending on the case, and even to the year. In conclusion, hospital costs for treatment of pneumococcal meningitis in São José dos Campos were very variable, and depend on the medical approach and the variability of clinic conditions. All cases are considered around 10 to 20 times as expensive as the average cost of admissions paid by government for average hospitalization due to other causes
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Papel da colonoscopia com magnificação de imagem associada à cromoscopia no diagnóstico diferencial entre lesões neoplásicas e não-neoplásicas do intestino grosso / Course of neonatal bacterial meningitis according to birth weightCoelho, José Celso Cunha Guerra Pinto 13 October 2005 (has links)
O Câncer colorretal (CCR) é um problema de saúde importante devido a sua incidência e mortalidade elevadas. O rastreamento e o diagnóstico precoce são a principal estratégia para diminuir a mortalidade pelo CCR. A colonoscopia convencional (CC), constitui o melhor método para o diagnóstico precoce do CCR e para o diagnóstico e tratamento das lesões precurssoras. Entretanto a CC apresenta taxas de falha de detecção não desprezíveis. A colonoscopia com magnificação de imagem (CM), vem sendo utilizada com o intuito de melhorar a performance da CC. A sua principal vantagem é a possibilidade de diferenciar lesões neoplásicas de não-neoplásicas, de maneira que apenas lesões neoplásicas seriam retiradas, diminuindo custos e riscos relacionados ao rastreamento por colonoscopia. O objetivo deste estudo é determinar a acurácia da CM para o diagnóstico diferencial entre lesões neoplásicas e não-neoplásicas do intestino grosso por meio da comparação entre o diagnóstico endoscópico e o fornecido pelo exame histopatológico convencional. Entre abril de 2002 e outubro de 2003, cento e vinte pacientes foram incluídos no estudo, tendo-se encontrado 200 lesões. Todas as lesões foram classificadas endoscopicamente através da CM com alta magnificação (até 200X), associada a cromoscopia com índigo carmim, de acordo com a classificação proposta por Kudo, e em seguida excisadas ou biopsiadas para estudo histopatológico. A acurácia da determinação do diagnóstico diferencial endoscópico em relação à histopatologia entre lesões neoplásicas e não-neoplásicas foi de 78,5%. A diferença da CM em relação ao exame histopatológico foi estatisticamente significativa (p<0,0001). Conclui-se que, no atual estágio de desenvolvimento, a CM, pela sua acurácia, não permite excluir o exame histopatológico para o diagnóstico diferencial entre as lesões neoplásicas e não-neoplásicas do intestino grosso. / Bacterial meningitis in the neonatal period is a severe disease, associated to elevated mortality and sequelae in around 12 to 29% of the survivors. Newborns whose birth weight is < 2,500g have a 3-fold increase in the risk of acquiring meningitis when compared to those whose weight is > or = 2,500; among those with very low birth weight (< 1,500g), the risk increases 17-fold. Objectives: General: to describe the clinical picture and the complications of bacterial meningitis in two groups of newborns, considered according to birth weight (< 2,500g or > or = 2,500g). Specific: to describe and compare the etiological agents, the frequency of neurological signs and symptoms and complications, mortality rate and duration of treatment in both groups. Methods: Observational study of 87 newborns with bacterial meningitis, admitted at the Neonatal Intensive Care Unit (NICU) of Instituto da Criança of Hospital das Clínicas of the University of São Paulo School of Medicine, during an 11-year period (January 1994 to December 2004). The data were obtained through the analysis of hospital files. Statistical analysis was carried out with Fisher\'s exact test and the non-parametric Mann Whitney test. Results: Bacteria were identified in the cerebrospinal fluid (CSF) of 39% of the patients, with 50% of them being Gram-positive and 50%, Gram-negative. Most neonates presented unspecific signs and symptoms: fever (63.2%), irritability (31%), and lethargy (26.4%). The neurological findings occurred in 35.3% of the cases. Complications occurred in 48.2% of the neonates, and were mainly seizures (23%), intracranial hemorrhage (14.9%) and hydrocephalus (13.8%) with a mortality rate of 11.5%. At the comparison between clinical evolution and birth weight, associations between weight > or = 2,500g and seizures (p=0.047), weight > or = 2,500g and concave fontanel (p=0.019), bacteria in the CSF and complications (p=0.008) and bacteria in the CSF and death (p=0.043) were observed. Conclusions: The etiological agents most often identified in the CSF were enterobacteria (41%), followed by B Streptococcus (17.5%), non-B Streptococcus (17.5%), Staphylococcus aureus (11.7%), Neisseria meningitidis (8.8%) and Enterococcus faecalis (3.0%), with no statistical difference between the type of bacteria and birth weight. The predominant signs and symptoms were unspecific, with neurological findings in 35% of the cases. The higher frequency of neurological signs and symptoms in newborns with birth weight > or = 2,500g suggest a higher degree of central nervous system maturity in these infants. Although the mortality was lower than that observed in previous studies at the same Service, the frequency of complications was high, regardless of birth weight. The presence of bacteria in the CSF was associated to a higher frequency of seizures and mortality. The need for prolonged treatment in newborns with low birth weight suggests higher disease severity in this group of neonates.
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Rôle du tissu adipeux dans les infections respiratoires par le virus Influenza ou la bactérie streptococcus pneumoniae / Role of adipose tissue in respiratory infections with Influenza virus or bacteria streptococcus pneumoniaeAyari, Asma 28 June 2018 (has links)
Longtemps décrit comme un simple tissu de réserve énergétique, le tissu adipeux blanc est, depuis l’identification de la leptine en 1994, considéré comme un véritable organe endocrine. En effet, ce tissu secrète de nombreuses hormones et cytokines agissant de manière paracrine et endocrine pour contrôler le métabolisme énergétique. Par ailleurs, en plus des préadipocytes et des adipocytes, le tissu adipeux blanc contient également des cellules immunes innées et adaptatives ; lui conférant ainsi un rôle important dans le développement et le contrôle de l’immunité. Cependant, le rôle joué par le tissu adipeux blanc dans les infections - notamment pulmonaires - reste encore peu étudié. C’est dans ce cadre général que s’est inscrit ce travail de Thèse. La susceptibilité accrue des individus obèses (expansion du tissu adipeux blanc) à l’infection par le virus de la grippe (influenza) est largement étayée dans la littérature. Nous avons évalué l’impact de l’infection par le virus influenza sur le tissu adipeux blanc, chez des souris minces et des souris obèses. Nos résultats montrent que, de manière inattendue, le virus est détecté dans les tissus adipeux, sous-cutané (inguinal) et viscéral (périgonadique), de souris infectées par voie intra-nasale (détection du génome viral par RT-qPCR). La présence de virus dans le tissu adipeux est associée à l’augmentation de la sécrétion de cytokines pro- et anti-inflammatoires, à la diminution de l’expression de gènes impliqués dans la lipolyse et la lipogénèse, et à l’augmentation de l’expression des gènes impliqués dans l’induction d’une réponse immune anti-virale. De manière intéressante, l’infection par le virus influenza est associée au brunissement du tissu adipeux sous-cutané chez les souris minces. Chez les souris obèses, l’infection par le virus de la grippe n’induit pas l’effet dépôt spécifique observé chez la souris mince et ne montre pas de brûnissement au niveau du tissu adipeux sous-cutané 7 jours p.i. In vitro, nous montrons que le virus influenza peut infecter les préadipocytes et les adipocytes (lignée murine et cellules primaires humaines). Cependant, alors que le virus effectue la totalité de son cycle dans l’adipocyte, le préadipocyte libère très peu, voire pas, de nouveaux virions infectieux (PCR, transcriptomique, technique de plages de lyse, microscopie confocale et électronique). Ainsi nos résultats, très originaux, identifient le tissu adipeux blanc comme un nouveau tissu cible de l’infection par le virus de la grippe, in vivo. Au sein de ce tissu, les préadipocytes et les adipocytes sont potentiellement infectés par le virus, comme le montrent nos données in vitro, les adipocytes seuls permettant la production de nouvelles particules infectieuses.Contrairement à l’infection grippale, les données épidémiologiques et/ou expérimentales concernant la susceptibilité des obèses à l’infection par la bactérie Streptococcus pneumoniae sont contradictoires, du fait de l’utilisation de différents modèles d’obésité d’origine génétique et de sérotypes de pneumocoques. Dans ce projet, nous avons utilisé un modèle d’obésité d’origine nutritionnelle ; le modèle de souris nourries par un régime enrichi en lipides. Nous montrons que les souris obèses infectées (sérotype Sp1) développent un syndrome de type méningite, mortel, tandis que les souris minces contrôlent l’infection. Si les réponses pulmonaires à l’infection sont comparables entre les souris minces et obèses (dénombrement des colonies bactériennes, histologie, PCR, ELISA, cytométrie en flux), le nombre de bactéries dans le cerveau est significativement plus élevé chez les souris obèses, associé à une altération de la perméabilité de la barrière hématoencéphalique [...] / Since the identification of leptin in 1994, the white adipose tissue (WAT) is no longer considered to solely be an inert tissue storing fat. As an endocrine organ, the adipose tissue synthesizes and secretes several hormones and cytokines involved in the control of whole-body metabolism. In addition, besides preadipocytes and adipocytes, WAT also contains innate and adaptive immune cells; thereby contributing to the development and control of immunity. However, the role played by the adipose tissue during infections - notably during pulmonary infections, such as those resulting from influenza virus or Streptococcus pneumoniae infections - has barely been investigated. This defines the general scope of this work. Epidemiological and experimental data convincingly report that obese individuals are more susceptible to influenza infection. During this project, we therefore questioned whether influenza infection may impact on adipose tissues, both subcutaneous (inguinal, SCAT) and visceral (perigonadal, EWAT) depots, in lean and high-fat diet-induced obese mice. We unexpectedly showed that influenza virus is detected in SCAT and EWAT (quantification of the viral genome by RtqPCR) and that this was associated with drastic changes in the tissue such as: increased secretion of pro- and anti-inflammatory cytokines, decreased expression of genes involved in lipogenesis and lipolysis, as well as increased expression of genes related to the induction of anti-viral immunity. Interestingly enough, influenza infection was associated with the development of brown-like adipocytes in the SCAT, only in lean animals. Moreover, we demonstrated in vitro that preadipocytes and adipocytes (murine cell-line and human primary cells) are permissive to infection, yet with different outcomes. Indeed, only adipocytes allowed the release of new infectious particles (RtqPCR, transcriptomics, quantification of infectious particules on MDCK cells, confocal and transmission electron microscopy). Altogether, our findings revealed, for the first time, that the white adipose tissue, an organ at the crossroads of metabolism and immunity, is deeply affected by influenza infection and might thus be undervalued in influenza pathophysiology.In opposite to influenza infection, the impact of obesity on the outcome of Streptococcus pneumoniae (S.p.) infection remains uncertain, due to the different models (genetically-based obesity, and bacterial strains) used. During this work, we investigated S. pneumoniae (Sp1 strain, sublethal dose) infection in lean and high-fat diet-induced obese mice. We showed that obese mice died from sublethal S. pneumoniae infection, compared to lean animals. The increased mortality induced by infection did not result from impaired pulmonary response but rather from the development of a meningitis-like syndrom likely resulting from an increased bacterial dissemination through the bloodbrain barrier into the brain. We propose that the model of dietary obesity induced by consumption of fat-enriched diet, may be envisaged as a novel and valuable experimental model of memingitis to study Streptococcus pneumoniae travel through the blood-brain barrier and the subsequent immune consequences.
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