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Efeito da restrição alimentar e do grupo genético sobre a microbiota do trato gastrintestinal, a expressão gênica hepática e a deposição de lipídeos na carcaça de frangos de corte /

Lunedo, Raquel. January 2016 (has links)
Orientador: Marcos Macari / Coorientador: Luiz Roberto Furlan / Banca: Luiz Lehmann Coutinho / Banca: Alex Maiorca / Banca: Jackson Antonio Marcondes de Souza / Banca: Poliana Fernanda Giachetto / Resumo: A hipótese testada neste projeto é que a restrição alimentar altera a composição da microbiota intestinal e a expressão gênica hepática em frangos de corte, e estas alterações podem influenciar a deposição tecidual das aves. Outra hipótese, é que a genética do frango influencia estas variáveis, e pode alterar a sua resposta frente a restrição alimentar. Os objetivos específicos foram analisar a resposta de duas linhagens de frangos de corte (crescimento rápido - Cobb - ou lento - Label Rouge) a dois programas de restrição alimentar (quantitativa ou energética) sobre: 1) o desempenho zootécnico; 2) a deposição tecidual; 3) a microbiota de íleo e ceco; 4) a expressão de genes relacionados ao metabolismo hepático. Para tal, dois experimentos foram conduzidos, sendo que no experimento I foram utilizados 480 frangos de corte, machos, da linhagem comercial Cobb500TM e no experimento II foram utilizados 480 frangos de corte, machos, da linhagem Label Rouge. Até os 21 dias as aves receberam mesma dieta e foram criadas em temperatura termoneutra. Aos 22 dias, oito grupos de 20 aves foram distribuídos dentro de cada um dos três tratamentos experimentais: 1. Controle (ad libitum - 3,176 Mcal/kg de EM e 19% PB); 2. Restrição energética (2,224 Mcal/kg EM e 19% PB) até os 43 dias de idade, com consumo equiparado ao controle; 3. Restrição quantitativa (restrição de 70%, ou seja, as aves restritas ingeriram apenas 30% da quantidade de ração consumida pelo grupo controle - 3,176 Mcal/kg EM e 19% PB) durante 7 dias, seguido de realimentação ad libitum até os 43 dias de idade. A restrição alimentar energética diminuiu o ganho de peso e o peso da carcaça e piorou a conversão alimentar em ambas as linhagens; diminuiu as contagens do grupo Lactobacillus e aumentou as contagens de Enterococcus e Enterobacteriaceae nas aves de crescimento rápido; favoreceu... / Abstract: The hypothesis of this project is that feed restriction alters the composition of gut microbiota and hepatic gene expression in broilers, and these changes can influence the tissue deposition of birds. The second hypothesis is that the broiler genetics influence on these variables, and can change the response in front of feed restriction. The specific objectives were investigated the response of broilers (fast - Cobb - or slow-growing - Label Rouge - strains), in front of two feed restriction programs (energetic or quantitative), on: 1) growth performance; 2) tissue deposition; 3) ileal and cecal microbiota; 4) expression of genes related to hepatic metabolism. For this, two experiments were conducted. In the experiment I, were used 480 male Cobb500TM broilers, and in the experiment II, were used 480 male Label Rouge broilers. Up to 21 days of age, the birds received the same diet and were created in thermoneutral temperature. At 22 days of age, birds were divided into 3 experimental treatments (8 replicates of 20 birds): T1. Control (ad libitum - 3.176 Mcal/kg ME and 19% CP); T2. Energetic restriction (2.224 Mcal/kg ME and 19% CP) up to 42 days with consumption equivalent to control; T3. Quantitative restriction (70% restriction, i. e., restricted broilers ingested only 30% of the quantity consumed by the control group - 3.176 Mcal/kg ME and 19% CP) for 7 days, followed by refeeding ad libitum until 42 days. Energetic restriction reduces body weight gain and carcass weight and increased feed conversion ratio in both strains; reduced the Lactobacillus and increased the Enterococcus and Enterobacteriaceae copies in fast-growing broilers; promoted the Lactobacillus proliferation and reduced Enterococcus and Enterobacteriaceae populations in ceca of slow-growing broilers; induced the gene expression of ACACA and FASN in slow-growing, and CPT1-A in fast-growing broilers; and reduced ... / Doutor
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Indicadores de qualidade de alfaces (Lactuca sativa L.) produzidas em municípios do sertão paraibano: aspectos microbiológicos e parasitológicos / Quality indicators of lettuce (Lactuca sativa L.) produced in municipalities of the Sertão Paraíba: microbiological and parasitological aspects

Barreto, Newcélia Paiva 25 May 2018 (has links)
Submitted by Rebeka Godeiro (rebeka_carvalho@hotmail.com) on 2018-05-25T13:29:42Z No. of bitstreams: 1 NEWCELIA PAIVA BARRETO - DISSERTAÇÃO ZOOTECNIA 2018.pdf: 2457443 bytes, checksum: 7981f08ce4096ee4d8bc46d84ef6e436 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-25T13:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NEWCELIA PAIVA BARRETO - DISSERTAÇÃO ZOOTECNIA 2018.pdf: 2457443 bytes, checksum: 7981f08ce4096ee4d8bc46d84ef6e436 (MD5) Previous issue date: 2018-02-27 / Capes / Dentre as hortaliças mais consumidas, a alface (Lactuca sativa L.) é considerada a mais popular devido a vários fatores, destacando-se primeiramente seu sabor suave, segundo, sua produção fácil e adaptável a qualquer tipo de solo e, consequentemente, a sua disponibilidade no mercado e baixo custo. É a hortaliça folhosa mais comercializada no Brasil, e estas, consumidas cruas, necessitam ser puras e saudáveis. Nesse contexto, objetivou-se identificar agentes microbianos presentes em hortaliças cultivadas em diferentes cidades do sertão da Paraíba, por meio de análises microbiológicas e parasitológicas e em seguida avaliar o agente de sanitização mais eficaz no processo de higienização dessas hortaliças. Foram realizadas análises microbiológicas de acordo com o método padronizado pela American Public Health Association (APHA, 1995) e para análise parasitológica empregou o método baseado por Lutz,Hoffman e Foram coletadas 15 amostras de alface (Lactuca sativa L.), de propriedades rurais do munícipio de Teixeira-PB e 15 amostras de alfaces no município de Patos-PB. Desse total, constatou-se que 46,4% e 80% das alfaces analisadas, estavam contaminadas, nos municípios de Teixeira, PB e Patos, PB respectivamente. De acordo com a RDC n°12 de 02 Janeiro de 2001 da Agência Nacional de Vigilância Sanitária – ANVISA, as hortaliças cruas devem apresentar-se livres da presença de Salmonella spp. em 25g de produto, sendo tolerada a presença de até 10 2 NMP/g da amostra para coliformes termotolerantes. As amostras de ambos os municípios, apresentaram formas imaturas de nematódeos e protozoários, constatando-se contaminação por estruturas de parasitos de cães como o Toxocara spp. Toxoplasma, protozoários como Giardia lambria, Ancylostoma spp. e Ascaris. A legislação estabelece como padrão a “ausência” de parasitas e larvas. Nessa perspectiva o processo de higienização das hortaliças cruas deve garantir a segurança do consumo das mesmas, contudo verificou-se a eficácia do ácido acético 6,6% (vinagre) e do hipoclorito de sódio 1% (água sanitária) na higienização da alface (Lactuca sativa L. var. crispa) in natura, proveniente de feira livre da cidade de Patos, PB. Constatou-se que o hipoclorito de sódio foi mais eficaz como método de sanitização das folhas da alface. O ácido acético (vinagre) muitas vezes utilizado para a higienização da alface, não se mostrou totalmente eficiente, já que foram enumeradas células de coliformes termotolerantes, nas amostras analisadas. / Among the most consumed vegetables, lettuce (Lactuca sativa L.) is considered the most popular due to several factors, especially its mild flavor, second, its easy production and adaptable to any type of soil and, consequently, its availability in the market and low cost. It is the most traded leafy vegetable in Brazil, and these, eaten raw, need to be pure and healthy. In this context, the objective was to identify microbial agents present in vegetables grown in different cities of the interior of Paraíba, by means of microbiological and parasitological analyzes and then to evaluate the most effective sanitizing agent in the hygiene process of these vegetables. Microbiological analyzes were performed according to the standardized method by the American Public Health Association (APHA, 1995) and for parasitological analysis the Lutz-based method (NEVES, 2005) was used. Fifteen samples of lettuce (Lactuca sativa L.) were collected from rural properties of the municipality of Teixeira-PB and 15 samples of lettuce in the municipality of Patos-PB. From this total, 46.6% and 80% of the lettuces analyzed were contaminated in the municipalities of Teixeira, PB and Patos, PB, respectively. According to DRC No. 12 of 02 January 2001 of the National Agency for Sanitary Surveillance - ANVISA, raw vegetables should be free of the presence of Salmonella spp. in 25g of product, the presence of up to 10 2 NMP / g of the sample for thermotolerant coliforms being tolerated. Samples from both municipalities showed immature forms of nematodes and protozoa, showing contamination by structures of parasites of dogs such as Toxocara spp. Toxoplasma, protozoa such as Giardia lambria, Ancylostoma spp. and Ascaris. The legislation establishes as the default the "absence" of parasites and larvae. In this perspective, the hygienic process of the raw vegetables should guarantee the safety of their consumption. However, the effectiveness of acetic acid (vinegar) and sodium hypochlorite 1% (sanitary water) in the hygiene of lettuce ( Lactuca sativa L. var. Crispa) in natura, from the free fair of the city of Patos, PB. It was found that sodium hypochlorite was more effective as a method of sanitizing lettuce leaves. Acetic acid (vinegar), often used for the cleaning of lettuce, was not fully efficient, since thermotolerant coliform cells were enumerated in the analyzed samples.
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Etiologia e resist?ncia bacteriana em unidades de terapia intensiva atrav?s de culturas de vigil?ncia

Franco, Mayara Maria Bastos 29 March 2017 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-04T11:53:11Z No. of bitstreams: 1 MayaraMariaBastosFranco_DISSERT.pdf: 2345421 bytes, checksum: cac97047a722e5ab5047a164b245b028 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-11T12:49:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MayaraMariaBastosFranco_DISSERT.pdf: 2345421 bytes, checksum: cac97047a722e5ab5047a164b245b028 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T12:49:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MayaraMariaBastosFranco_DISSERT.pdf: 2345421 bytes, checksum: cac97047a722e5ab5047a164b245b028 (MD5) Previous issue date: 2017-03-29 / A exist?ncia de pat?genos com alto perfil de resist?ncia, colonizando a pele e mucosas de pacientes internados, elevam o risco da ocorr?ncia de infec??es graves. Deste modo as culturas de vigil?ncia s?o importantes a fim de se identificar estes microrganismos e minimizar a sua propaga??o para outros indiv?duos. Este estudo utilizou culturas de vigil?ncia para determinar o perfil de resist?ncia presente em bact?rias isoladas de 114 pacientes internados em Unidades de Terapia Intensiva (UTIs). Utilizou-se m?todos de identifica??o fenot?pica, de sensibilidade aos antibi?ticos e testes fenot?picos de indica??o de produ??o de ?-lactamases. Das amostras de Staphylococcus spp. isoladas, 89% (98/110) apresentaram resist?ncia ? Oxacilina, 39% (52/133) das enterobact?rias eram produtoras de ?-lactamase de Espectro Estendido, 57,5% (23/40) das Pseudomanoas aeruginosa eram produtoras de ?-lactamase AmpC e 80% (30/37) dos Acinetobacter spp. eram resistentes aos carbapen?micos. Dentre as vari?veis cl?nicas estudadas, encontrou-se uma associa??o estatisticamente significativa entre o uso de carbapen?micos e a coloniza??o por bact?rias resistentes aos antibacterianos mais frequentes utilizados na rotina. Estes ?ndices elevados refletem a tend?ncia epidemiol?gica atual do crescimento das bact?rias com alto padr?o de resist?ncia, tornando-se essencial a implementa??o de medidas de vigil?ncia, isolamento e racionaliza??o do uso de antibi?ticos a fim de se minimizar a dissemina??o destes pat?genos. / The existence of pathogens with high antimicrobial resistance, colonizing the skin and mucous membranes of hospitalized patients, increases the risk of serious infections. Thus surveillance cultures are important to identify these microorganisms and minimize their propagation to other individuals. This research used surveillance cultures to determine the resistance profile existent in bacteria colonizing 114 patients admitted in Intensive Care Units (ICUs) for 7 or more days. For this purpose, manual methods of phenotypic identification, antimicrobial susceptibility and phenotypic tests for the indication of ?-lactamase? production were used. From the Staphylococcus spp. isolated, 89% (98/110) were resistant to oxacillin, 39% (52/133) of Enterobacteriaceae were producers of Extended Spectrum ?-Lactamases, 57.5% (23/40) of Pseudomonas aeruginosa were producers of AmpC ?-Lactamase and 81% (30/37) of Acinetobacter spp. were resistant to carbapenems. Among the studied clinical variables, it was found a significant statistical association between the use of carbapenems and colonization by bacteria resistant to these antibiotics. These high indexes reflect the current epidemiological tendency of high resistant bacteria growth, making essential the implementation of surveillance measures, isolation and rationalization of antibiotic use to minimize the dissemination of these pathogens.
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Efeito da mistura do líquido da casca da castanha de caju e do óleo de mamona no desempenho, na imunidade e na microbiota de frangos de corte desafiados por coccidiose

Moraes, Priscila de Oliveira January 2017 (has links)
O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da mistura comercial do líquido da casca de castanha de caju e do óleo de mamona (Essential, Oligo Basics Agroind. Ltda., Cascavel, Brasil) no desempenho, na microbiota e no sistema imune de frangos de corte desafiados ou não por coccidiose. Ao total 864 pintos machos (Cobb) de um dia de idade foram distribuídos aleatoriamente em 6 tratamentos (8 boxes/tratamento e 18 pintos/box) em um desenho fatorial 3 x 2 com 3 aditivos: controle (sem aditivo), 100 ppm de monensina ou 0,15% de Essential e 2 níveis de desafio aos 14 dias de idade: não desafiados ou inoculados por gavagem com 1mL de solução contendo oocistos esporulados de E. tenella, E. acervulina e E. máxima. Os resultados foram divididos em dois artigos. Artigo 1: Na primeira semana após desafio, as aves desafiadas suplementadas com monensina apresentaram maior ganho de peso (GP), consumo de ração (CR) e melhor conversão alimentar (CA) (P <0,05), porém na segunda semana o Essential apresentou maior GP e melhor CA (P <0,05), aos 42 dias de idade, ambos os grupos não se diferiram em GP, CR, PV e foram maiores do que o controle (P <0,05). A utilização de monensina em aves desafiadas reduziu o número cópias do domínio bactéria e de E.coli (P<0,05), por sua vez, a suplementação com Essential reduziu Clostridium Cluster XIV, Clostridium perfringens e Staphylococcus aureus em relação aos demais tratamentos (P<0,05). As aves não desafiadas que receberam Essential ou monensina apresentaram menor população de C.perfringens e S. aureus (P<0,05). Artigo 2: O grupo que recebeu Essential aumentou a expressão gênica de IFN-y, IL-6 e TNF-α (P<0,05) e o grupo controle aumentou a expressão gênica de COX-2 e IL-1 em relação aos demais tratamentos (P<0,05). As aves não desafiadas que receberam monensina apresentaram maior expressão gênica de IFN-y, COX-2 e IL-1 comparadas aos demais tratamentos (P<0,05), ao contrário do grupo com Essential que reduziu a expressão gênica com exceção do TNF-α. Aos 7 e 14 dias após o desafio houve maior excreção de oocistos para o grupo controle, Essential e monensina não diferiram-se (P>0,05). Assim, o Essential melhorou o desempenho de frangos de corte infectados por coccidiose após a segunda semana do desafio e atuou como um modulador da microbiota intestinal e do sistema imune, direcionando a resposta inflamatória contra o parasita. / The objective of this study was to evaluate the effects of a commercial mixture of cashew shell liquid and castor oil (Essential, Oligo Basics Agroind. Ltda., Cascavel, Brazil) on growth performance, immunity and microbiota in broilers challenged with coccidiosis. A total of 864 one-day-old male chicks (Cobb) were randomly assigned to 6 treatments (8 pens/treatment and 18 birds/pen) in a 3 x 2 factorial design with 3 additives: control (no additive), 100 ppm of monensin, and 0.15% of Essential; and 2 challenge levels at 14 days of age: no challenge and inoculation by gavage of 1 ml of a solution containing sporulated oocysts of E. tenella, E. acervulina, and E. maxima. The results were divided into two articles. Article 1: In the first week after challenge, challenged birds supplemented with monensin showed higher LW, WG, FI and better FCR (P <0.05), but in the second week Essential presented higher WG and better FCR (P <0.05), at 42 days of age, both groups did not differ in WG, FI, and LW and were higher than the control (P <0.05). The use of monensin in challenged birds reduced the number of copies of the bacteria domain and of E.coli (P<0,05). In turn, Essential supplementation reduced Clostridium Cluster XIV, Clostridium perfringens and Staphylococcus aureus in relation to the other treatments (P<0,05). The unchallenged birds that received Essential or monensin presented a lower population of C.perfringens and S. aureus (P<0,05). In addition, Essential presented higher number of copies of Lactobacillus spp., followed by monensin and control (P <0.05). Article 2: The group that received Essential increased the gene expression of IFN-y, IL-6 e TNF-α (P<0,05) and the control group increased the gene expression of COX-2 and IL-1 in relation to the other treatments (P <0.05). The unchallenged birds that received monensin presented upregulated expression of IFN-y, COX-2 and IL-1 compared to the other treatments (P <0.05), unlike the Essential group, which reduced gene expression with the exception of TNF-α. At 7 and 14 days after the challenge there was a higher excretion of oocysts for the control group, Essential and monensin did not differ (P>0,05). Thus, Essential improved the performance of coccidiosis-infected broiler chickens after the second week of challenge, as well as acts as a modulator of intestinal flora and immune system, directing the inflammatory response against the parasite.
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Influência do uso de antimicrobianos na ração de suínos criados com diferentes níveis de medicação sobre resistência de Escherichia coli e perfil da microbiota intestinal / Influence of antimicrobial administration in feed of pigs raised with different medication levels on the Escherichia coli resistance and on the gut microbiota profile

Pissetti, Caroline January 2016 (has links)
Bactérias resistentes aos antimicrobianos representam um risco, não apenas para a saúde animal, como também para a saúde pública. As bactérias comensais, como Escherichia coli, são consideradas um bom indicador do padrão de resistência de uma população microbiana, uma vez que, por residirem no intestino, estão submetidas à constante pressão de seleção resultante da administração de antimicrobianos, podendo sobreviver ao processo de abate de suínos e chegar aos consumidores. Neste sentido, os objetivos deste estudo foram: i. avaliar a frequência de resistência antimicrobiana fenotípica e a presença de grupos clonais em E. coli isoladas de fezes e carcaças suínas; ii. determinar o perfil fenotípico e genotípico de resistência aos antimicrobianos em isolados multirresistentes de E. coli provenientes de carcaças de suínos e identificar grupos clonais presentes em carcaças suínas; iii. comparar o perfil fenotípico de resistência antimicrobiana em isolados de E. coli de fezes de suínos submetidos a diferentes protocolos de administração de antimicrobianos via ração; iv. descrever o perfil da microbiota intestinal de suínos submetidos a diferentes protocolos de uso de antimicrobianos via ração. Para isto, três etapas distintas foram realizadas. Na etapa 1, dois ciclos de amostragem foram conduzidos em três matadouros-frigoríficos (A, B, C) de suínos, sendo coletado fezes depositadas no piso da pocilga de espera e suabes de superfície de carcaças na etapa de pré-resfriamento. Escherichia coli foi isolada dessas duas origens e avaliada quanto à resistência aos antimicrobianos. Além disso, 92 isolados de ambas as origens apresentando perfil de multirresistência foram submetidos à análise por Pulsed-field gel eletrophoresis (PFGE). Para a etapa 2, os isolados multirresistentes provenientes de carcaças foram submetidos a novos testes de sensibilidade antimicrobiana e de acordo com o perfil fenotípico foram pesquisados quanto aos genes de resistências e submetidos à técnica de PFGE. Em relação a etapa 3, quatro grupos de suínos que utilizavam protocolos distintos de uso de antimicrobianos via ração foram acompanhados em todas as fases zootécnicas e avaliados quanto a frequência de resistência antimicrobiana de E. coli e perfil bacteriano da microbiota intestinal através do sequenciamento de duas regiões do gene 16S rRNA. Entre os 674 isolados de E. coli da etapa 1 apenas 7,4% foram susceptíveis a todos os antimicrobianos testados. As maiores frequências de resistência foram identificadas frente à tetraciclina (85,9%), ampicilina (73,0%), sulfonamida (70,0%), florfenicol (65,0%) e ácido nalidíxico (58,9%). Do total de isolados de E. coli, 79,5% (536/674) foram classificados como multirresistentes. A análise de macro restrição (PFGE), conduzida em isolados apresentando perfis de multirresistência mais prevalentes, demonstrou que isolados de fezes e carcaças eram na maioria dos casos relacionados (similaridade ≥70%) nos três matadouros-frigoríficos. Dos isolados multirresistentes provenientes das carcaças, dez novos antimicrobianos foram testados; em relação a esses, as maiores frequências de resistências foram à cloranfenicol (86,4%), estreptomicina (65,8%) e trimetoprima (57%). Cada matadouro-frigorífico apresentou um perfil distinto de multirresistência predominante. Nos isolados submetidos à pesquisa de genes de resistência, foram detectados por ordem de frequência: strA (83,3%); aac(3)IVa (70%); tetB (70%); sul2 (60%); floR (56,6%); tetA (50%); aph(3)Ia (43,3%); sul3 (26,6%) e blaTEM (10%); três grupos de isolados relacionados (similaridade ≥ 70%) foram encontrados na análise por PFGE. Em relação à etapa 3, os grupos com diferentes protocolos de uso antimicrobianos via ração não apresentaram alteração significativa no perfil de microbiota intestinal e contagem de E. coli; entretanto, os perfis fenotípicos de resistência antimicrobiana foram distintos entre os grupos. O grupo que recebia protocolo com uso alternado de antimicrobianos de seis classes distintas apresentou maior frequência de resistência e multirresistência. De acordo com os resultados encontrados protocolos de uso continuado de antimicrobianos na criação de suínos gera uma pressão seletiva, resultando em cepas multirresistentes que podem sofrer propagação no ambiente e na cadeia de produção de alimentos. Considerando os perfis de resistência encontrados em E. coli originada de carcaças suínas e fezes, em todas as etapas deste trabalho, observou-se que essas cepas são selecionadas na granja pelo uso de antimicrobianos, chegaram ao pré-abate, disseminaram-se na linha de abate e contaminar a carcaça. O uso prudente de antimicrobianos é amplamente citado em toda a literatura científica veterinária e, conforme nossos resultados demonstraram, deve ser incluído entre as metas da suinocultura brasileira. / Bacteria resistant to antimicrobials present a hazard not only for animal health but public health too. Commensal bacteria, such as Escherichia coli, are considered a good indicator of microbial population resistance, because they live in gut and are subjected to constant pressure resulting selection of the administration of antibiotics, may survive in slaughtering process and get consumers. In this sense, the aims of this study were: i. to evaluate the frequency of antimicrobial phenotype resistance and presence of clonal groups for E. coli isolated from feces and pig carcasses; ii. to determine phenotypic profile and antimicrobial genotypic resistance in multiresistant E. coli isolated from pig carcasses and identify clonal groups present in pig carcasses; iii. to compare phenotypic profile of antimicrobial resistance in E. coli from swine feces submitted to different antimicrobial in-feed protocols; iv. to describe gut microbiota profile in pigs submitted to different antimicrobial in-feed protocols. For this, three steps were performed. In step 1, two sampling cycles were conducted in three slaughterhouses (A, B, C) of pigs being collected feces deposited in pen floor and pre-chill carcasses. Escherichia coli was isolated from these two sources and evaluated for antimicrobial resistance. In addition, 92 isolates with multidrug resistance profile were analyzed by pulsed-field gel eletrophoresis (PFGE). In step 2, isolated from carcasses and multiresistant underwent new antimicrobial susceptibility testing and in accordance with the phenotypic profile were screened for the resistance gene and PFGE. In step 3, four groups of pigs used different antimicrobial in-feed protocols were followed in all phases and evaluated frequency of antimicrobial resistance and gut bacterial profile by sequencing two regions of 16S rRNA. Among the 674 E. coli isolates from step 1 just 7.4% were susceptible to all antibiotics. The highest frequencies of resistance were: tetracycline (85.9%), ampicillin (73.0%), sulfonamide (70.0%), florfenicol (65.0%) and nalidixic acid (58.9%). Of total E. coli isolates, 79.5% (536/674) were multidrug. Macrorestriction analysis (PFGE), conducted in isolates with profiles more prevalent multidrug resistance showed that isolated from feces and carcasses were in most cases related (≥70% similarity) in the three slaughterhouses. The multiresistant isolates from carcasses, ten new antibiotics were tested, with greatest frequency in add antimicrobial resistance were: chloramphenicol (86.4%), streptomycin (65.8%) and trimethoprim (57%). Each slaughterhouse showed a distinct profile of resistance and number of resistance markers. Isolates submitted to research genes were detected in order of frequency: strA (83.3%); aac(3)IV (70%); tetB (70%); sul2 (60%); floR (56.6%); tetA (50%); aph(3)Ia (43.3%); sul3 (26.6%) and blaTEM (10%); and three related groups (similarity ≥ 70%) were formed in PFGE. For step 3, groups with different antimicrobial in-feed had no significant change in gut microbiota profile and E. coli counts; however the phenotypic profiles of antimicrobial resistance were different between the groups. The group receiving protocol with alternate use of antimicrobials six different classes showed higher frequency of resistance and multidrug resistance. According to the results, different protocols of antimicrobial in pig farming creates a selective pressure, resulting in multi-drug resistant strains that may contribute to spread environment and in food production chain. Considering the resistance profiles found in E. coli originated from swine carcasses and feces, in all stages of this work, it was observed that these strains were selected for in farm by use of antimicrobials, reached the pre-slaughter, spread in the slaughterhouse and carcasses. The concept of prudent use of antimicrobials is widely quoted in all the veterinary scientific literature and, as our results showed, it should be included among the goals of the Brazilian pig farming.
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Utilização de própolis e probiótico em dietas para leitões recém-desmamados / Use of propolis and probiotic in newly weaned pigs diets

Natália Yumi Ikeda 22 January 2016 (has links)
A restrição ao uso de antimicrobianos melhoradores de desempenho em dietas animais, em consequência de preocupações relacionadas a qualidade e segurança dos alimentos, estimula a procura por aditivos alternativos naturais. Com o intuito de investigar aditivos alternativos naturais na nutrição de leitões recém-desmamados, o objetivo deste projeto de pesquisa foi estudar os efeitos independentes e da combinação da própolis bruta e do probiótico, adicionados em dietas para leitões recém-desmamados, sobre o desempenho zootécnico, a frequência de diarreia, a digestibilidade dos nutrientes e energia da dieta, a morfometria e peso de órgãos (digestórios e baço), a histologia do epitélio intestinal (altura de vilosidade, profundidade de cripta e relação vilosidade:cripta) e a microbiologia do conteúdo intestinal (plaqueamento em placa de ágar), em comparação ao uso de um antimicrobiano melhorador de desempenho (clorohidroxiquinilina). Foram utilizados 120 leitões recém-desmamados em um experimento em blocos completos casualizados com cinco tratamentos, oito repetições (blocos) por tratamento e três animais por unidade experimental (baia). Os tratamentos foram distribuídos aleatoriamente dentro de cada bloco, obedecendo a um esquema fatorial 2x2+1, sendo: controle (dieta basal sem adição de aditivos); própolis (dieta basal com 0,4% de própolis bruta); probiótico (dieta basal com 0,1% de probiótico); própolis + probiótico (dieta basal com 0,4% de própolis bruta e 0,1% de probiótico) e antimicrobiano (dieta basal com antimicrobiano). As dietas e a água foram fornecidas a vontade durante o período experimental de 35 dias. Os animais foram pesados no 1º, 7º, 21º e 35º dia do experimento. A ocorrência de diarreia foi registrada diariamente. Ao final do período experimental, um animal de cada baia foi abatido para a realização da morfometria e pesagem de órgãos, histologia do epitélio intestinal e microbiologia do conteúdo intestinal. Os dados foram analisados pelo procedimento MIXED do SAS e as medias comparadas pelo teste de Dunnett, comparando o tratamento antimicrobiano com os outros tratamentos. A inclusão de própolis bruta e probiótico, isolados ou em combinação, não afetou o desempenho, a frequência de diarreia e a histologia do epitélio intestinal. A própolis influenciou negativamente na digestibilidade aparente do extrativo não nitrogenado (p<0,05). A própolis e o probiótico, isolados ou em combinação, também influenciaram negativamente na digestibilidade de todos os nutrientes e na energia bruta das dietas em comparação a utilização de antimicrobiano (p<0,05). A combinação de própolis e probiótico promoveu aumento do peso absoluto e relativo do intestino delgado em comparação ao tratamento antimicrobiano (p<0,05). No conteúdo intestinal do jejuno, a inclusão do probiótico aumentou a contagem de bactérias do gênero Enterococcus (p<0,05). Entretanto, a própolis diminuiu a contagem de bactérias do gênero Lactobacillus (p<0.05). No conteúdo do ceco, a própolis bruta isolada promoveu contagem de bactérias do gênero Enterococcus superior em relação ao tratamento antimicrobiano (p<0,05). E o tratamento antimicrobiano diminuiu a contagem de bactérias do gênero Lactobacillus em comparação aos outros tratamentos (p<0,05). A inclusão de própolis bruta e probiótico, isolados ou em combinação, não melhorou o desempenho de leitões recém-desmamados em comparação ao tratamento antimicrobiano neste experimento. / Antimicrobial growth promoter restriction in animal diets due to safety concerns enhanced the research of natural feed additive alternatives. In order to search for natural feed additive alternatives for weanling pigs, this study investigated independent and combined dietary effects of crude propolis and probiotic on weanling pigs\' performance, diarrhea, nutrients and energy digestibility, organ weights (digestive organs and spleen), intestinal epithelium histology (villus height, crypt depth and villus:crypt ratio), and intestinal microbial counts (agar plating assay) in comparison to an antimicrobial growth promoter (chlorohydroxiquinoline). One hundred and twenty 21-d weaned pigs were allotted in a randomized complete block design experiment with five treatments, eight replications and three animals per experimental unit (pen). Treatments, arranged in a 2x2+1 factorial design, were: control treatment consisted in a basal diet without any additive; propolis, basal diet with 0.4% of crude propolis; probiotic, basal diet with 0.1% of probiotic; propolis + probiotic, basal diet with 0.4% of crude propolis and 0.1% of probiotic and antimicrobial treatment, basal diet with antimicrobial growth promoter. Feed and water were given ad libitum during a 35-d nursery feeding experiment. Animals were weighed at d 0, 7, 21 and 35 of experiment. Diarrhea occurrence was registered every day. At the end of experimental period, an animal per pen was slaughtered for analyses of organ weights, intestinal epithelium histology and intestinal microbial counts. Data was analyzed by using the MIXED procedure of SAS. Dunnett test was used to compare antimicrobial treatment with each other treatment. Dietary crude propolis and probiotic inclusion, isolated and combined, did not affected weanling pigs\' growth performance, diarrhea occurrence and intestinal epithelium histology. Dietary propolis reduced nitrogen-free extract digestibility (p<0.05). Dietary propolis and probiotic, isolated and combined, negatively affected nutrients and energy digestibility compared to antimicrobial treatment (p<0.05). Propolis and probiotic combination increased small intestine weight in comparison to antimicrobial treatment (p<0.05). In jejunum content, dietary probiotic increased Enterococcus sp. counts (p<0.05), while dietary propolis decreased Lactobacillus sp. counts (p<0.05). In cecum content, isolated propolis had higher Enterococcus sp. counts compared to antimicrobial (p<0.05). Moreover, antimicrobial treatment lowered Lactobacillus sp. counts compared to all other treatments (p<0.05). Overall, dietary propolis and probiotic, isolated and combined, did not enhanced growth performance compared to antimicrobial treatment in the present study.
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Microbiota fúngica isolada da pele de suínos hígidos procedentes de diversos municípios do Estado do Rio Grande do Sul.

Carregaro, Fabiano Bonfim January 2006 (has links)
A suinocultura brasileira encontra-se atualmente em um nível técnico de destaque no contexto mundial. Entretanto, diversas estratégias são utilizadas para restringir a compra dos produtos brasileiros por países estrangeiros, em especial barreiras sanitárias. Os objetivos desse trabalho foram determinar a microbiota fúngica da pele de suínos sem lesões aparentes e estabelecer os possíveis agentes micóticos de importância nesta espécie. Foram obtidas 261 amostras de animais com 20 a 120 dias de idade, provenientes de 11 granjas do Rio Grande do Sul. As amostras foram obtidas apenas dos animais com ausência de qualquer patologia. Essas foram semeadas em Agar Sabouraud com cloranfenicol. Obteve-se o crescimento de 509 culturas, sendo 305 (59,92%) fungos filamentosos e 204 (40,08%) leveduras. A distribuição do número de diferentes colônias isoladas por amostra demonstra uma predominância de monocultura no grupo 1 (animais de 20 a 60 dias de idade) em relação ao grupo 2 (animais acima de 60 dias de idade). Dentre os fungos filamentosos septados, ocorreu predominância dos hialohifomicetos (43,03%) em relação aos feohifomicetos (10,41%), enquanto que observou-se apenas 6,48% de filamentosos asseptados. O Aspergillus (22,90%) foi o gênero de hialohifomiceto mais isolado, com predominância do A. flavus (5,70%). Dentre os feohifomicetos, o gênero Cladosporium foi o mais prevalente (9,04%). No que concerne os zygomicetos, o gênero mais isolado foi Mucor (4,13%). Em relação às leveduras, o gênero Candida foi o mais isolado (14,73%), sendo a distribuição de freqüência das espécies: C. albicans (13,56%), C. parapsilopsis (0,59%), C. famata (0,20%), C. tropicalis (0,20%) e outras espécies de Candida (0,20%). A reduzida quantidade de diferentes fungos isolados por amostra nos animais do grupo 1, em relação ao grupo 2, pode ter sido influenciada pela menor quantidade de grãos utilizada na fabricação de ração nos animais mais novos, maior freqüência de limpeza e desinfecção das instalações, bem como a não mistura de animais provenientes de diferentes origens. A alta prevalência do gênero Candida observada em suínos, um gênero normalmente comensal do trato gastrintestinal, se torna importante quando esses animais são acometidos por doenças imunossupressoras. Estudos clínicos longitudinais e/ou infecções experimentais talvez possam definir a importância destes agentes em suínos. / Brazilian pig production has reached a technical and techological level that stands out in international pig production. However, several strategies have been used to limit access of Brazilian pig products to international market, including health barriers. The objective of our work was to determine the fungal flora of the healthy pig skin and to determine possible micotic agents important for this animal species. 261 samples from 20-120 day old pigles were obtained from 11 pig farms from the State of Rio Grande do Sul, Brazil. All sampled animals were negative for any skin lesions. The samples were cultured in Sabouraud agar and cloranfenicol. Cultures were obtained from 509 materials, with 305 (59,95%) filamentous fungi and 204 (40,08%) yeasts. The distribution of different fungi isolated each simple shows a high prevalence on group 1 (20-60 days old) in relation to group 2 (more than 60 days old). Among septated filamentous fungi, there was a great preponderance of hialohifomycetes (43,03%) in relation to feohifomycetes (10,41%), while only 6,48% were aseptated filamentous. Aspergillus (22,90%) was the most isolated genus of hialohifomycetes and A. flavus (5,70%) was the more prevalent specie isolated. As to zygomycetes, the most isolated genus was Mucor (4,13%). Regarding yeasts, the genus Candida was the most prevalent (14,73%) and the species distribution was: C. albicans (13,56%), C. parapsilopsis (0,59%), C. famata (0,20%), C. tropicalis (0,20%) and other Candida species (0,20%). The little quantity isolated per sample could have been influenced by quantity of grains used in pig feed in these different stages of production, types of facilities, stress and environmental changes could be important to imbalance the flora, as well as favoring diffusion of mycosis in the herds. The limited number of different fungi isolated from animal flora on group 1 may have been influenced by the smaller use of grains in the feed mill in this stage, a better cleaning and disinfection of premises, as well as avoiding mixing pigs of different source. Clinical longitudinal studies and/ or experimental infections perhaps may help to define the importance of these fungi to that species.
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Perfil microbiano láctico do queijo de coalho artesanal de Cachoeirinha – PE, Brasil

ALBUQUERQUE, Thiciane Carvalho de 23 February 2010 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-11-07T15:54:23Z No. of bitstreams: 1 Thiciane Carvalho de Albuquerque.pdf: 461700 bytes, checksum: a5dec4d0c1023c838fd185f90ab1ad6c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-07T15:54:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thiciane Carvalho de Albuquerque.pdf: 461700 bytes, checksum: a5dec4d0c1023c838fd185f90ab1ad6c (MD5) Previous issue date: 2010-02-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This paper deals the characterization of lactic microflora of artisanal “coalho” cheese produced in the city of Cachoeirinha, semi arid of Pernambuco - Brazil. Were analyzed four samples collected in dates with differents rainfall. The lactic microflora was assessed by isolation in APT and MRS culture medias, both incubated at temperatures of 30 and 42 ° C, followed by two purifications. Was considered lactic acid bacteria (LAB) only the gram-positive, catalase negative, in the form of coccus and bacillus, and producing acid in litmus milk. The differentiation of the genus was performed by testing for growth based on the physiology of the isolates. From a total of 320 isolates, 295 were confirmed as LAB. The mean genera of LAB isolated by the four samples were: Enterococcus (36.27%), Streptococcus (25.12%), Lactococcus (23.03%), Lactobacillus (13.55%) and Leuconostoc(2.3%). The constant presence and distribution of the genera isolated in different periods indicate that, in the samples analyzed, there is no apparent correlation between the distribution of the genera isolated and different rainfall occurred in the sampling dates, indicating the product standardization. / O presente trabalho trata da caracterização da microbiota lática do queijo de coalho artesanal produzido no Município de Cachoeirinha, Agreste de Pernambuco, Brasil. Foram analisadas quatro amostras coletadas em épocas do ano com diferentes índices pluviométricos. A microbiota lática foi avaliada através do isolamento em meios APT e MRS, ambos incubados em temperaturas de 30 e 42°C; seguida de duas purificações. Foram consideradas BAL apenas os microrganismos Gram positivos, catalase negativa, na forma de cocos ou bastões e produtores de ácido em leite tornassolado. A diferenciação dos gêneros foi realizada através de testes de crescimento com base na fisiologia dos isolados. De um total de 320 isolados, 295 foram confirmados como BAL. As médias dos gêneros de BAL isolados nas quatro coletasforam: Enterococcus (36,27%), Streptococcus (25,12%), Lactococcus (23,03%), Lactobacillus (13,55%) e Leuconostoc (2,3%). A presença e distribuição constante dos gêneros isolados em diferentes períodos indicam que, nas amostras analisadas, não há correlação aparente entre a distribuição dos gêneros isolados e os diferentes índices pluviométricos ocorridos nas datas de coleta, indicando padronização do produto.
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Efeito dos oligossacarídeos FOS e GOS na microbiota intestinal e no pH do conteúdo cecal de ratas Wistar em desenvolvimento / Effect of oligosaccharides FOS and GOS on the intestinal pH and microbiota of the young female Wistar rats

Lima, Glaucia Carielo 04 January 2011 (has links)
Orientador: Mário Roberto Maróstica Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-17T20:43:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lima_GlauciaCarielo_M.pdf: 794328 bytes, checksum: 905ed92bfa1f9e04a2c521c1c5e898b7 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Muitos estudos tem demonstrado que o consumo acumulado de galactooligossacarídeo (GOS) e frutooligossacarídeo (FOS) pode trazer benefícios significativos para a saúde, relacionados com a sua resistência à digestão, sendo utilizados como substrato pelas bactérias intestinais, em especial as bifidobactérias. O objetivo do presente trabalho foi avaliar os efeitos de alteração de pH e microbiota (contagem de Bifidobacterium e Lactobacillus) no intestino grosso de ratas Wistar após o consumo dos oligossacarídeos não digeríveis (ONDs) FOS e GOS. Foram confeccionadas quatro dietas baseadas na AIN93G para roedores utilizando os ONDs em substituição parcial à sacarose para os grupos experimentais. Desta forma, o experimento contou com quatro grupos experimentais, sendo: grupo Controle, grupo FOS, grupo GOS e grupo FOS + GOS. O ensaio biológico contou com 32 animais divididos em grupos de 8 animais cada, mantidos em gaiolas separadas, sob ciclo claro/escuro de 12 horas, com temperatura e umidade controladas, durante o período de 90 dias. O consumo de dieta e o ganho de peso foram monitorados. Ao final do experimento, os animais foram sacrificados por decapitação, seu ceco retirado para coleta de material para análises posteriores de pH e microbiota intestinal. A análise de pH foi realizada por meio de peagômetro digital (TEC 5MP, Tecnal) e a análise de microbiota, a partir de diluições do conteúdo fecal e inoculação em meios de cultura específicos. Todas as placas foram incubadas em câmaras de anaerobiose contendo sistema gerador de anaerobiose Anaerogen (Oxoid Ltd., Basingstoke, Hampshire, England) durante 24 - 48 horas a 37°C. Os resultados foram e xpressos na forma do logaritmo decimal das unidades formadoras de colônia/g material (Log10 UFC). Para a análise estatística, foi utilizado o software GraphPad Prism 5.0. A análise de variância (ANOVA) foi realizada e os dados paramétricos foram analisados por meio do teste de Tukey, a 5% de significância e os não paramétricos por teste de Dunnett. Os resultados obtidos demonstraram um abaixamento do pH intestinal nos grupos que consumiram FOS e FOS + GOS e aumento da contagem de Bifidobacterium no conteúdo cecal dos grupos FOS, GOS e FOS + GOS e aumento de Lactobacillus dos grupos FOS e FOS + GOS / Abstract: Many studies have shown that consumption of galactooligosaccharide (GOS) and fructooligosaccharides (FOS) can bring significant benefits to health. NDC are used as substrate by intestinal bacteria, especially bifidobacteria, as these compounds are resistance to digestion. The aim of this study was to evaluate the effects in pH and microbiota (specifically for Lactobacillus and Bifidobacterium growth) in the large intestine of Wistar rats after consumption of non-digestible oligosaccharides (NDOs) FOS and GOS. Four different diets were produced, based on the AIN93G formula for rodents, using NDOs in partial replacement of sucrose by prebiotics FOS and GOS for the experimental groups. Thus, the experiment had four experimental groups, as described: Control group, FOS group, GOS group and FOS + GOS group. For the 'in vivo¿ experiment, the 32 animals were divided into groups of 8 animals each. The rats were kept in separate cages under light / dark cycles of 12 hours, with controlled temperature and humidity during 90 days. The diet consumption and weight gain were monitored. At the end of the experiment, the animals were killed by decapitation, their cecum removed to collect material for further analysis of pH and intestinal microbiota. The pH analysis was performed using digital pH meter (TEC 5MP Tecnal) and analysis of microbiota from dilutions of fecal contents and inoculation on specific culture media. All plates were incubated in anaerobic chambers containing anaerobic generation system Anaerogen (Oxoid Ltd., Basingstoke, Hampshire, England) for 24-48 hours at 37 °C. The results were expressed as the logarithm of colony forming units / g material (Log10 CFU). For statistical analysis, GraphPad Prism 5.0 was used. The analysis of variance (ANOVA) was performed and parametric data were analyzed using the Tukey test at 5% significance and the nonparametric by Dunnett's test. The results showed a lowering of intestinal pH in the groups consuming FOS and FOS + GOS and increased count of Bifidobacterium in the cecal contents of the groups FOS, GOS and FOS + GOS and increase of Lactobacillus in the groups FOS and FOS + GOS / Mestrado / Nutrição Experimental e Aplicada à Tecnologia de Alimentos / Mestre em Alimentos e Nutrição
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Efeitos imuno-moduladores de Lactobacillus bulgaricus no câncer colorretal associado à colite / Immuno-modulatory effects of Lactobacillus bulgaricus on colorectal cancer associated with colitis

Denise Sayuri Calheiros da Silveira 27 October 2017 (has links)
O câncer associado à colite (CAC - colitis-associated cancer) é um subtipo de câncer colorretal (CRC) precedido por doenças inflamatórias do intestino (IBD - inflammatory bowel disease). Diante das altas taxas mundiais de incidência e mortalidade do CRC, muitos esforços têm sido movidos pela comunidade científica em busca do desenvolvimento de novas abordagens e estratégias terapêuticas contra esse tipo de câncer. Doenças inflamatórias do intestino estão associadas a um risco aumentado para o desenvolvimento de CRC e evidenciam assim, a complexa conexão entre inflamação e câncer. A microbiota intestinal possui papel central na patogênese de IBD. Há evidente aumento no interesse em investigar maneiras de contornar alterações da resposta imunitária do hospedeiro à disbiose microbiana utilizando suplementos à base de microrganismos vivos. Isso ocorre uma vez que estudos com probióticos têm demonstrado o seu grande potencial imunomodulador. A administração de probióticos tem sido associada à manutenção de períodos prolongados de remissão da doença e à ausência de resistência ao tratamento. No presente trabalho, utilizamos modelo experimental de câncer colorretal associado à inflamação para investigar os efeitos do probiótico Lactobacillus bulgaricus sobre a carcinogênese. Nossos resultados demonstram papel anti-inflamatório de L. bulgaricus na colite induzida por DSS, associado a menores níveis intestinais das citocinas TNF-?, IL-1?, IL-6, IL-17, IL-23. Na carcinogênese, o probiótico induziu menores níveis intestinais das citocinas pró-inflamatórias e levou à redução expressiva do volume tumoral total e tamanho médio de tumores ao final do tratamento. Em conjunto, nossos resultados demonstram papel anti-inflamatório e antitumoral de Lactobacillus bulgaricus na carcinogênese colorretal associada à inflamação. / Colitis-associated cancer (CAC) is a subtype of colorectal cancer (CRC) preceded by inflammatory bowel disease (IBD). Faced with the high global rates of CRC incidence and mortality, many efforts have been made by the scientific community to develop new approaches and therapeutic strategies against this type of cancer. IBDs are associated with an increased risk for CRC development, highlighting the complex connection between inflammation and cancer. The intestinal microbiota has a central role in the pathogenesis of IBD. Currently there is evident increase in interest in investigating manners to circumvent the host\'s immune response to microbial dysbiosis using a supplement based on live microorganisms. This is because studies on probiotics have demonstrated their high immunomodulatory potential. Probiotic administration has been associated with the maintenance of prolonged remission periods of the disease, and with the lack of resistance to treatment. In the present study, we used experimental model of colorectal cancer associated with inflammation to investigate the effects of the probiotic Lactobacillus bulgaricus on carcinogenesis. Our results demonstrate the anti-inflammatory role of L. bulgaricus in DSS-induced colitis, which was associated with lower intestinal levels of the cytokines TNF-?, IL-1?, IL-6, IL-17, IL-23. In carcinogenesis, the probiotic induced lower intestinal levels of the proinflammatory cytokines and led to an expressive reduction of total tumor volume and mean size of tumors at the end of treatment. Taken together, our results demonstrate the anti-inflammatory and antitumor role of Lactobacillus bulgaricus in inflammation-associated colorectal carcinogenesis.

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