Migration literature tends to focus on individual level factors, such as human capital acquired abroad, to explain the success of the integration of returnees while neglecting the importance of the environment in their home country. The dissertation offers a theoretical framework, which involves the factors of the home country’s labour market in explaining the integration of return migrants, while at the same time taking into account changes in the human capital of returnees while they were abroad. The empirical findings of the dissertation are based on three representative surveys carried out in late 2013 among three different audiences in Lithuania: 1) adult population (N=1930); 2) employers (N=1000), and 3) returnees (N=804). The research revealed that almost all return migrants have acquired valuable knowledge and skills while abroad that they expect to use in advancing their careers in Lithuania. Yet most of them underutilise their foreign experience after return. Moreover, they feel that their new knowledge and skills are undervalued in Lithuania. Indeed, the research proved that rather unfavourable attitude towards return migrants and their migration experience prevails in Lithuanian society and among employers. Returnee unfriendly environment leads not only to the loss of potential benefits of human capital but also to the unsuccessful reintegration of returnees and, eventually, to their repeat migration. Therefore, migration policies that aim at encouraging return... [to full text] / Migracijos literatūroje grįžusių migrantų integracijos kilmės šalies darbo rinkoje sėkmė dažniausiai siejama su grįžusiųjų užsienyje įgytais žiniomis ir įgūdžiais, tačiau palyginti mažai dėmesio skiriama juos priimančios darbo rinkos įtakai. Disertacija siekiama užpildyti šią nišą, analizuojant grįžtamąją migraciją ne tik iš grįžusių migrantų, bet ir iš kilmės šalies darbdavių perspektyvos. Disertacija, kurios empirinis tyrimas remiasi 2013 m. atliktomis reprezentatyviomis Lietuvos visuomenės, Lietuvos darbdavių ir į Lietuvą gyventi grįžusių migrantų apklausomis, atskleidžia, kad Lietuvai būdingas žemas darbo rinkos imlumas užsienyje įgytam žmogiškajam kapitalui. Tai paaiškina, kodėl daugeliui grįžusių migrantų migracijos patirtis netampa privalumu Lietuvos darbo rinkoje, nepaisant to, kad 8 iš 10 grįžusių migrantų teigia užsienyje patobulėję. Atliktas tyrimas taip pat rodo, kad negalėjimas panaudoti užsienyje įgytų žinių ir įgūdžių bei jausmas, kad jie nėra tinkamai įvertinami, yra svarbus grįžusiųjų pakartotinės migracijos veiksnys. Tai leidžia naujai pažvelgti ir į Lietuvos ir kitų šalių įgyvendinamą migracijos politiką, kuri paprastai yra orientuota į grįžtančiųjų skaičiaus augimą, tačiau disertacijos tyrimas rodo, kad norint užtikrinti grįžtamosios migracijos tvarumą, dėmesį reikia sutelkti į grįžusiųjų ir jų įgytų žinių paklausos šalies darbo rinkoje didinimą. Be praktinių rekomendacijų politikai tobulinti disertacija papildo migracijos mokslinę literatūrą naujomis... [toliau žr. visą tekstą]

Migracijos literatūroje grįžusių migrantų integracijos kilmės šalies darbo rinkoje sėkmė dažniausiai siejama su grįžusiųjų užsienyje įgytais žiniomis ir įgūdžiais, tačiau palyginti mažai dėmesio skiriama juos priimančios darbo rinkos įtakai. Disertacija siekiama užpildyti šią nišą, analizuojant grįžtamąją migraciją ne tik iš grįžusių migrantų, bet ir iš kilmės šalies darbdavių perspektyvos. Disertacija, kurios empirinis tyrimas remiasi 2013 m. atliktomis reprezentatyviomis Lietuvos visuomenės, Lietuvos darbdavių ir į Lietuvą gyventi grįžusių migrantų apklausomis, atskleidžia, kad Lietuvai būdingas žemas darbo rinkos imlumas užsienyje įgytam žmogiškajam kapitalui. Tai paaiškina, kodėl daugeliui grįžusių migrantų migracijos patirtis netampa privalumu Lietuvos darbo rinkoje, nepaisant to, kad 8 iš 10 grįžusių migrantų teigia užsienyje patobulėję. Atliktas tyrimas taip pat rodo, kad negalėjimas panaudoti užsienyje įgytų žinių ir įgūdžių bei jausmas, kad jie nėra tinkamai įvertinami, yra svarbus grįžusiųjų pakartotinės migracijos veiksnys. Tai leidžia naujai pažvelgti ir į Lietuvos ir kitų šalių įgyvendinamą migracijos politiką, kuri paprastai yra orientuota į grįžtančiųjų skaičiaus augimą, tačiau disertacijos tyrimas rodo, kad norint užtikrinti grįžtamosios migracijos tvarumą, dėmesį reikia sutelkti į grįžusiųjų ir jų įgytų žinių paklausos šalies darbo rinkoje didinimą. Be praktinių rekomendacijų politikai tobulinti disertacija papildo migracijos mokslinę literatūrą naujomis... [toliau žr. visą tekstą] / Migration literature tends to focus on individual level factors, such as human capital acquired abroad, to explain the success of the integration of returnees while neglecting the importance of the environment in their home country. The dissertation offers a theoretical framework, which involves the factors of the home country’s labour market in explaining the integration of return migrants, while at the same time taking into account changes in the human capital of returnees while they were abroad. The empirical findings of the dissertation are based on three representative surveys carried out in late 2013 among three different audiences in Lithuania: 1) adult population (N=1930); 2) employers (N=1000), and 3) returnees (N=804). The research revealed that almost all return migrants have acquired valuable knowledge and skills while abroad that they expect to use in advancing their careers in Lithuania. Yet most of them underutilise their foreign experience after return. Moreover, they feel that their new knowledge and skills are undervalued in Lithuania. Indeed, the research proved that rather unfavourable attitude towards return migrants and their migration experience prevails in Lithuanian society and among employers. Returnee unfriendly environment leads not only to the loss of potential benefits of human capital but also to the unsuccessful reintegration of returnees and, eventually, to their repeat migration. Therefore, migration policies that aim at encouraging return... [to full text]

Syfte: Syftet med denna studie är att undersöka vilka värden som på längre sikt har avgörande betydelse för att engagera en kund med avseende på lojalitetsprogram. Metod: I studien användes en kvantitativ metod där en enkät med stängda svarsalternativ skickades ut till ca 30 000 respondenter. Till enkäten användes ordinal- och nominalskala för att möjliggöra Spearman’s rho korrelationsanalys med hjälp av statistiska mjukvaran IBM SPSS. Analyserna användes sedan för acceptera eller förkasta de hypoteser som deducerats från teorin. Resultat: Resultatet visade att trots en pågående negativ trend för lojalitetsprogram så skapar de engagemang och är betydande för kunden. Det värde som visade sig ha signifikant betydelse för engagemanget var kundens mervärde. Kundens mervärde leder till upprepade köp och har en direkt påverkan på kundens lojalitet och kundens uppfattning av programmet som påverkar engagemanget. Resultatet av studien kan därför ses som en pågående interaktionsprocess där företagets aktiviteter påverkar kundens engagemang både i och utanför lojalitetsprogrammet. Ett ökat mervärde i interaktionsprocessen till följd av företagets aktiviteter och kundens värdering av varumärket, ökar kundens engagemang, vilket möjliggör att lojalitet kan skapas genom program på längre sikt. Förslag till fortsatta studier: Syftet med studien är att öka förståelsen för de värden som engagerar kunden med avseende på lojalitetsprogram. Författarnas ambition är att vidare forskning ska ta avstamp i studiens resultat och den modell som utvecklats. Förhoppningen är att studien ska ligga till grund för empirisk tillämpning inom servicenäringen samt utgöra underlag vid strategiska beslut och marknadsundersökningar.

Changes within and beyond the alpine treeline ecotone are hypothesized to respond to climatic changes and to be controlled by site-specific conditions. Repeated photographs show significant changes in the alpine treeline ecotone of Goodsir Pass in Kootenay National Park, B.C. over the past century. Field work revealed increases in tree density within the ecotone, and a 150 vertical metre increase in the elevation of the ecotone, at a rate of 2.2 metres/year. Change within the ecotone of Goodsir Pass is more closely related to temporal climatic variability than to site-specific spatial variability. Repeated photographs from three National Parks in the southern Canadian Rocky Mountains show this change to be a typical but dramatic example. Results at several scales indicate that the occurrence, magnitude and type of change in the alpine treeline ecotone and the drivers of that change are most influenced by the regional ecologic and geo-climatic setting or context.

DNA is the code for all life. Via intermediary RNA the information encoded by the genome is relayed to proteins executing the various functions in a cell. Together, this repertoire of inherently linked biological macromolecules determines all characteristics and features of a cell. Technological advancements during the last decades have enabled the pursuit of novel types of studies and the investigation of the cell and its constituents at a progressively higher level of detail. This has shed light on numerous cellular processes and on the underpinnings of several diseases. For the majority of studies focusing on nucleic acids, an amplification step has to be implemented before an analysis, scoring or interrogation method translates the amplified material into relevant biological information. This information can, for instance, be the genotype of particular SNPs or STRs, or the abundance level of a set of interesting transcripts. As such, amplification plays a significant role in nucleic acid assays. Over the years, a number of techniques – most notably PCR – has been devised to meet this amplification need, specifically or randomly multiplying desired regions. However, many of the approaches do not scale up easily rendering comprehensive studies cumbersome, time-consuming and necessitating large quantities of material.Trinucleotide threading (TnT) – forming the red thread throughout this thesis – is a multiplex amplification method, enabling simultaneous targeted amplification of several nucleic acid regions in a specific manner. TnT begins with a controlled linear DNA thread formation, each type of thread corresponding to a segment of interest, by a gap-fill reaction using a restricted trinucleotide set. The whole collection of created threads is subsequently subjected to an exponential PCR amplification employing a single primer pair. The generated material can thereafter be analyzed with a multitude of readout and detection platforms depending on the issue or characteristic under consideration.TnT offers a high level of specificity by harnessing the inherent specificities of a polymerase and a ligase acting on a nucleotide set encompassing three out of the four nucleotide types. Accordingly, several erroneous events have to occur in order to produce artifacts. This necessitates override of a number of control points.The studies constituting this thesis demonstrate integration of the TnT amplification strategy in assays for analysis of various aspects of DNA and RNA. TnT was adapted for expression profiling of intermediately-sized gene sets using both conventional DNA microarrays and massively parallel second generation 454 sequencing for readout. TnT, in conjunction with 454 sequencing, was also employed for allelotyping, defined as determination of allele frequencies in a cohort. In this study, 147 SNPs were simultaneously assayed in a pool comprising genomic DNA of 462 individuals. Finally, TnT was recruited for parallel amplification of STR loci with detection relying on capillary gel electrophoresis. In all investigations, the material generated with TnT was of sufficient quality and quantity to produce reliable and accurate biological information.Taken together, TnT represents a viable multiplex amplification technique permitting parallel amplification of genomic segments, for instance harboring polymorphisms, or of expressed genes. In addition to these, this versatile amplification module can be implemented in assays targeting a range of other features of genomes and transcriptomes. / QC 20100819

O tema da repetição atravessa toda a teoria psicanalítica, tendo se constituído um dos seus conceitos fundamentais. Freud elaborou o conceito de repetição a partir de sua experiência clínica e Lacan o situou na ordem do Real. No campo da Filosofia, a repetição foi conceituada pelo filósofo Kierkegaard, pensador dinamarquês do Século XIX. O conceito psicanalítico de repetição é distinto do da Filosofia, no entanto, eles se entrelaçam em alguns pontos. A clínica psicanalítica se apresenta como lugar da repetição e da fala; nela, conforme a articulação que fazemos, o sujeito é pensado, também, a partir da existência, segundo a concepção kierkegaardiana. Esta pesquisa é de natureza teórica e utiliza alguns fragmentos clínicos; tem como objetivo geral analisar o conceito de repetição na Psicanálise, com o aporte do conceito kierkegaardiano de repetição, ressaltando as repercussões clínicas na interface dos dois conceitos. Os objetivos específicos são: investigar o conceito de repetição em Freud e Lacan; estudar o conceito de repetição em Kierkegaard; situar a clínica psicanalítica como lugar da repetição e da fala; destacar a criatividade no processo clínico, considerando a positividade da repetição segundo o ponto de vista de Kierkegaard articulado ao da Psicanálise. Como referencial teórico, utilizaremos as teorias de Freud, Lacan e Kierkegaard. O texto é apresentado em três capítulos: no primeiro, trabalhamos o conceito de repetição a partir das elaborações teóricas de Freud e a contribuição teórica de Lacan; no segundo capítulo, apresentamos o conceito de repetição em Kierkegaard; no terceiro capítulo, situamos as repercussões clínicas do conceito psicanalítico de repetição na interface com o conceito kierkegaardiano, considerando a demanda do sofrimento no contexto do sujeito na atualidade. Como conclusão, apresentamos uma reflexão a respeito do sujeito enquanto capaz de elaborar a experiência afetiva do trauma e toda a excitação recebida como herança, no sentido de construir algo que lhe pertença. Esperamos que a aproximação entre a Psicanálise e a Filosofia kierkegaardiana contribua para uma melhor compreensão do conceito de repetição e, sobretudo, para enriquecer o trabalho clínico.

Introdução: A cesárea vem aumentando progressivamente no Brasil e no mundo. Dentre os fatores associados a esse evento, destaca-se a cesárea prévia. Embora a maioria dos partos realizados em mulheres com história de cesárea seja cirúrgico, autores tem demonstrado altos índices de partos vaginais após cesárea - PVAC com baixa incidência de complicações. Diante do alarmante crescimento das taxas de cesárea, o presente estudo objetiva identificar a proporção e o perfil das mães com história de repetição de cesárea - RC no Estado de São Paulo, em 2012. Métodos: Os dados provenientes do Sistema de Informações Sobre Nascidos Vivos foram vinculados aos do Cadastro Nacional de Estabelecimentos de Saúde. Os resultados a respeito das características das mães com história de RC foram analisados segundo características da gestação, do recém-nascido RN e segundo tipo do hospital do parto. Os dados foram descritos na forma de medidas de proporção (frequências), com diferenças entre variáveis de interesse verificadas pelos testes de proporção e de médias (nível de significância de 5 por cento ). Resultados: Foram estudados 273.329 nascidos vivos de mães com pelo menos um filho anterior. Destes, 43 por cento nasceram por RC e 7,4 por cento por PVAC. As mães que realizaram CR são mais velhas e mais escolarizadas e os RNs nascidos desse grupo apresentaram menor proporção de baixo peso ao nascer. O início do pré-natal no primeiro trimestre e a realização de 7 ou mais consultas de pré-natal foi mais frequente no grupo CR. Termo precoce foi a classificação mais frequente para idade gestacional dos que nasceram por CR. Em contrapartida, os RNs por parto vaginal apresentaram maiores proporções de termo tardio do que aqueles por repetição de cesárea. A RC foi mais frequente nos hospitais sem vínculo com o Sistema Único de Saúde - SUS (44,1 por cento ). Dentre esses, a maioria (54,3 por cento ) teve idade gestacional classificada como termo precoce. Somente o grupo SUS alcança uma melhor proporção de termo pleno (46,5 por cento ), contudo esse grupo tem a frequência mais elevada de termos tardios (10,9 por cento ). Conclusão: As altas taxas de cesárea de repetição, principalmente no setor privado, evidenciam a necessidade de melhoras no modelo de atenção ao parto no Estado de São Paulo. / Background: Cesarean section has been progressively increasing in Brazil and worldwide. Among the factors associated with this event stands out a prior cesarean delivery. Although most deliveries in women with a prior cesarean delivery is surgical, authors have demonstrated high levels of vaginal births after cesarean - VBAC with low incidence of complications. Given the alarming increase in cesarean rates, this study aims to identify the proportion and profile of mothers with repeat cesarean delivery - RCD in the State of São Paulo, in 2012. Methods: Data from Live Births Information Systems were linked to the National Health Establishments Registration. The results about the characteristics of mothers with RCD were analyzed according to characteristics of pregnancy, newborn and type of maternity hospital. Data were presented in the form of proportion measures (frequencies), with differences between variables of interest verified by the proportion and average tests (5 per cent significance level). Results: 273 329 live births of mothers with at least one previous child were studied. 43 per cent of these were born by RCD and 7.4 per cent by PVAC. Mothers who underwent RCD are older and more highly educated and newborn infants in this group had a lower incidence of low birth weight. The beginning of prenatal care in the first trimester and the realization of 7 or more prenatal visits was more frequent in the RCD group. Early term was the most frequent rating for gestational age born by RCD. In contrast, newborns by vaginal delivery had greater proportions of late term than those by repeat cesarean. The RCD was more common in hospitals not affiliated with the Unified Health System - UHS (44.1 per cent ). In these, the majority (54.3 per cent ) of newborn had gestational age of early term. Only the UHS group achieves a better proportion of full term (46.5 per cent ), however, this group has the highest frequency of late terms (10.9 per cent ). Conclusion: The high repeat cesarean rates, especially in the private sector, highlight the need for improvements in childbirth care model in São Paulo.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1477917 bytes, checksum: 4ab8f5cc2dd481acd067b02bd7abf32d (MD5) Previous issue date: 2012-01-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Colletotrichum is one of the most important genera of plant-pathogenic fungi in the world. The pathogenic species of this genus have hemibiotrophic lifestyle and cause diseases in several economically significant crops. Besides the economic importance, Colletotrichum has great significance as a model system for studying the molecular and cellular bases of fungal pathogenicity. The species C. graminicola, causal agent of corn anthracnose (Zea mays), has rare sexual stage and was the first species of the genus to have its genome completely sequenced. The transposable elements are ubiquitous and constitute a source of new mutations, being an important source of genetic variability. These elements are divided into two classes according to the presence or absence of an RNA intermediate in transposition. Elements of class I transpose via RNA intermediate, while class II elements transpose directly as DNA. The transposable elements can be applied as mutagenic agents aimed at the identification and labeling of genes and in phylogenetic and population studies. Given the importance of transposable elements in the generation of genetic variability and its applications in research, the aim of this study was to identify and characterize the class II transposable elements in the genome of C. graminicola. For this purpose, we used a bioinformatic approach combined with experimental activities. We identified 132 complete sequences of transposable elements in the sequenced genome of C. graminicola, which represent a significant proportion of the genome (0.47%). The elements were classified into six families according to similarity, all elements have characteristics of Tc1-mariner superfamily. Although some of these elements possess putative transposases with conserved DDE domain, all are interrupted by multiple stop codons. None of the elements identified has all the necessary features to be considered an active element. In silico analysis revealed evidence that these sequences are mutated by RIP (repeat point induced mutation) mechanism. TCg1 element was amplified by PCR from a Brazilian isolate and has imperfect terminal inverted repeats and the putative transposase sequence has three conserved domains characteristic of transposases: DDE, CENPB and HTH. However, this sequence is interrupted by stop codons and lacks the initiation codon and termination codon, therefore, is probably inactive. The genomic DNA from 49 different isolates were analyzed by hybridization with a probe derived from the inner region of TCg1 and different profiles were identified. The strategy allowed the efficient identification of a variety of Tc1-Mariner transposable elements degenerated by mutations characteristics of RIP in C. graminicola. It is unlikely that any of the identified elements is autonomous, however, these elements must have an important role in the genetic variability of this fungus. The TCg1 element is present in the genomes of different isolates of C. graminicola and has the potential to be used as a molecular marker in population analyzes. / Colletotrichum é um dos gêneros mais importantes de fungos fitopatogênicos em todo o mundo. As espécies fitopatogênicas desse gênero apresentam ciclo de vida hemibiotrófico e causam doenças em diversas culturas economicamente importantes. Além da importância econômica, Colletotrichum possui grande relevância como um sistema modelo para o estudo das bases celulares e moleculares da patogenicidade fúngica. A espécie Colletotrichum graminicola, agente causal da antracnose do milho (Zea mays), possui ciclo sexual raro e foi a primeira espécie do gênero a ter o seu genoma completamente sequenciado. Os elementos transponíveis são ubíquos e constituem uma fonte de novas mutações, sendo, portanto, uma importante fonte de variabilidade genética. Esses elementos são divididos em duas classes de acordo com a presença ou ausência de um intermediário de RNA na transposição. Os elementos da classe I se transpõem via intermediário de RNA, enquanto os elementos da classe II se transpõem diretamente como DNA. Os elementos transponíveis podem ser utilizados como agentes mutagênicos visando à identificação e etiquetagem de genes e em estudos filogenéticos e populacionais. Tendo em vista a importância dos elementos transponíveis na geração de variabilidade genética e as suas aplicações na pesquisa, o objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar elementos transponíveis da classe II no genoma de C. graminicola. Para tanto, foi utilizada uma abordagem de bioinformática (análises in silico) aliada às atividades experimentais. Foram identificadas 133 sequências completas de elementos transponíveis no genoma sequenciado de C. graminicola, que representam uma proporção relevante do genoma (0,47%). Os elementos foram classificados em 6 famílias de acordo com a identidade e apresentam características da superfamília Tc1-Mariner. Apesar de algumas transposases putativas codificadas por esses elementos possuírem domínio DDE conservado, todas estão interrompidas por vários códons de parada. Nenhum elemento identificado possui todas as características necessárias para um elemento autônomo. A análise in silico revelou evidências de mutações geradas pelo mecanismo de RIP (Mutação de ponto induzida por repetição). O elemento TCg1, amplificado por PCR a partir de um isolado brasileiro de C. graminicola, possui extremidades repetidas invertidas imperfeitas e a sequência putativa da transposase apresenta os três domínios característicos conservados: DDE, HTH e CENPB. Entretanto, essa sequência está interrompida por códons de parada e não foram localizados os códons de iniciação e de terminação, sendo, portanto, provavelmente inativa. O DNA genômico de 49 diferentes isolados foi analisado por hibridização com uma sequência derivada da região interna de TCg1 e apresentaram diferentes perfis. A estratégia utilizada permitiu uma identificação eficiente de uma variedade de elementos transponíveis Tc1-Mariner degenerados por mutações características de RIP em C. graminicola. É improvável que algum dos elementos identificados seja autônomo, entretanto, esses elementos devem possuir um importante papel na variabilidade genética desse fungo. O elemento TCg1 está presente no genoma de diferentes isolados de C. graminicola e possui potencial para ser utilizado como marcador molecular em análises populacionais.

Introduction: Colonization of the anogenital tract of pregnant women by Group B Streptococcus (GBS) is the main risk factor for early-onset neonatal sepsis. Identification of maternal colonization allows antimicrobial prophylaxis and prevention of vertical transmission. Objectives: To identify the genetic diversity and phenotypic characteristics of GBS using molecular biology techniques and culture in specific medium, and the epidemiological aspects of pregnant women colonized by this bacterium. Methods: It was performed a cross-sectional study, anogenital samples of 316 pregnant women were collected between 35 and 37 weeks and submited to culture in specific medium, antimicrobial susceptibility test, multiplex PCR, multi locus sequence typing (MLST) and multi locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA). The epidemiological aspects of colonized and non-colonized pregnant women were also investigated. Results: It was obtained a prevalence of 36.4% by culture and 38.6% by PCR. Multiplex PCR had sensitivity of 100%, specificity of 96.5%, positive predictive value of 94.3% and negative predictive value of 100%. The most common serotypes were Ia, V, II and III. Resistance genes were identified in 34 samples. Sensitivity to penicillin was universal, 24.3% presented resistance to erythromycin and 14.8% to clindamycin. Evaluating the epidemiological variables, there were no differences between the colonized and non-colonized pregnant women. Diversity index and number of genotypes found by MLST was 0.608 and 6, and by MLVA was 0.840 and 15, respectively. Conclusion: We found a high prevalence of maternal GBS colonization, with serotype distribution similar to the Americas region. Multiplex PCR was more accurate than culture, and maternal epidemiological variables showed no difference when evaluating presence or absence of bacterial colonization, its serotypes and antimicrobial resistance. MLVA showed a higher discrimination capacity among the unrelated strains than MLST. / Submitted by Otto Henrique May Feuerschuette (otto.feurschuette@unisul.br) on 2018-04-26T00:54:22Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) OTTO TESE CORRIGIDA PÓS BANCA (1).pdf FINAL.pdf: 3081595 bytes, checksum: afad5beba2687558aafe2f1705d36e01 (MD5) / Approved for entry into archive by Silvane Cauz (silvane.cauz@unisul.br) on 2018-04-26T12:14:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) OTTO TESE CORRIGIDA PÓS BANCA (1).pdf FINAL.pdf: 3081595 bytes, checksum: afad5beba2687558aafe2f1705d36e01 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-26T12:14:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) OTTO TESE CORRIGIDA PÓS BANCA (1).pdf FINAL.pdf: 3081595 bytes, checksum: afad5beba2687558aafe2f1705d36e01 (MD5) Previous issue date: 2018 / Introdução: A colonização do trato anogenital de gestantes pelo Estreptococo do grupo B (EGB) é o fator de risco primário para a sepse neonatal precoce. A identificação da colonização materna permite a profilaxia antimicrobiana e prevenção da transmissão vertical. Objetivos: Identificar a diversidade genética e as características fenotípicas do EGB utilizando-se técnicas de biologia molecular e cultura em meio específico, e avaliar os aspectos epidemiológicos de gestantes colonizadas por essa bactéria Métodos: Foi realizado um estudo transversal com 316 amostras anogenitais de gestantes entre 35 e 37 semanas para realização de cultura em meio específico, teste de sensibilidade aos antimicrobianos, PCR multiplex, multi locus sequence typing (MLST) e multi locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA). Pesquisou-se também os aspectos epidemiológicos dessas gestantes. Resultados: Foi encontrada prevalência de 36,4% pela cultura e 38,6% pela PCR. A PCR multiplex apresentou sensibilidade de 100%, especificidade de 96,5%, valor preditivo positivo de 94,3% e valor preditivo negativo de 100%. Os sorotipos mais encontrados foram Ia, V, II e III. Os genes de resistência foram identificados em 34 amostras. A sensibilidade à penicilina foi universal, 24,3% apresentaram resistência à eritromicina e 14,8% à clindamicina. Avaliando-se as variáveis epidemiológicas, não se identificaram diferenças entre as gestantes colonizadas e não colonizadas. O índice de diversidade e o número de genogrupos encontrados pelo MLST foi 0,608 e 6, e pela MLVA foi 0,840 e 15, respectivamente Conclusão: Constatou-se uma alta prevalência de colonização materna, com distribuição dos sorotipos semelhante à região das Américas. A PCR multiplex foi mais acurada que a cultura, e as variáveis epidemiológicas maternas não apresentaram diferença significativa ao avaliar-se a presença ou não de colonização bacteriana, seus sorotipos e a resistência aos antimicrobianos. A MLVA apresentou uma capacidade de discriminação entre as cepas não relacionadas maior do que a MLST

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Luciano_Carlos_da_Maia.pdf: 871025 bytes, checksum: fcb02e5ff38b9223264b40df7fe04318 (MD5) Previous issue date: 2009-07-03 / Molecular markers have been successfuly applied in genetic mapping and marker assisted selection as an auxiliary tool for plant breeding and transfer of genetic information among related species. In this sense, the understanding of genome elements occurring in important crop species such as wheat, rice and maize can be used towards the improvement of basic knowledge in orphan grass species. Rice, after the completion of its genome sequence, has been proposed as a genetic model in the grasses. Among the different types of molecular markers, microsatellites have been indicated as the preferred class for such studies. In general, the strategy of transposing molecular markers between species still poses some questions/difficulties regarding the most conserved microsatellite patterns among plant species, genera and families. This study had as objective to use bioinformatic tools to characterize microsatellites from rice and other Grass species of economical importance, enabling the prediction of microsatellite patterns that are most promising in transfer strategies. Three studies were performed. The first was concerned about developping and validating a microsatellite searching tool plus primer design and PCR simulation. A database containing 28,469 fl-cDNA sequences originating from japonica rice genome was used. From a total of 3,907 microsatellite loci, 3,329 primer pairs were designed and tested using the simulated PCR feature showing that only 2,397 (72%) of pairs amplified in specific regions. The second study had as objective to describe the occurrence of microsatellites in expressed regions originating from ten species from three different plant families. The results indicated the frequency and patterns of occurrence of microsatellites within and between the different families. The third study had as objective to characterize the complete occurrence of microsatellites in the rice genome. The results showed a different pattern of occurrence of microsatellites for the different chromosomes and which arrangements are most abundant. Inferences on which elements allow better genome coverages are discussed. / Marcadores moleculares têm sido utilizados com sucesso em mapeamento genético e seleção assistida como uma ferramenta auxiliar para o melhoramento de plantas e transferência de informações entre espécies relacionadas. Neste sentido, o entendimento da ocorrência de microssatélites no genoma nas diferentes espécies melhoradas como trigo, arroz e milho pode ser utilizado no sentido da melhoria do conhecimento básico das espécies gramíneas descritas como “orfãs”. O arroz, após a conclusão do seqüênciamento do seu genoma, tem sido proposto como modelo genético entre as gramíneas. Dentre os diferentes tipos de marcadores moleculares, os microssatélites são indicados como a classe preferida para estes estudos. De maneira geral, as estratégias de transposição de marcadores moleculares entre espécies ainda apresentam algumas dificuldades e questionamentos referentes os padrões mais conservados de microssatélites entre espécies, genêro e famílias vegetais. Este estudo teve como objetivo, o uso de ferramentas de bioinformática para caracterizar microssatélites oriundos do genoma do arroz e outras espécies, possibilitando predizer padrões de microssatélites mais promissores na transferência. Três estudos foram realizados. O primeiro consistiu no desenvolvimento e validação de uma ferramenta para localização de microssatélites, desenho de iniciadores e simulação da PCR. Foi utilizado um banco de dados contendo 28.469 seqüências fl-cDNA de arroz japonica. Do total de 3.907 loci encontrados, foram desenhados 3.329 conjuntos de iniciadores e testados pela simulação da PCR, mostrando que somente 2.397 (72%) iniciadores amplificaram regiões específicas. No segundo estudo foi analisada a ocorrência de microssatélites em regiões expressas de dez espécies de três diferentes famílias de plantas. Os resultados indicaram a freqüência e padrões de microssatélites dentro e entre as diferentes famílias. No terceiro estudo foi feita a caracterização de microssatélites no genoma completo do arroz. Os resultados mostraram um conservado padrão de ocorrência dos diferentes microssatélites nos diferentes cromossomos e quais os arranjos foram os mais abundantes. Inferências sobre quais elementos permitem a melhor cobertura do genoma foram discutidas.