Orientador: Assis Vicente Benedetti / Co-orientador: Denise Bevilaqua / Banca: Hideko Yamanaka / Banca: Ana Teresa Lombardi / Banca: Zeki Naal / Banca: Patrícia Hatsue Suegama / Resumo: No presente trabalho é apresentado um estudo eletroquímico utilizando eletrodo de pasta de carbono com calcopirita (CuFeS2) contendo 50% em massa do mineral (tamanho de partícula < 38 mm) e grafite (tamanho de partícula: 20 mm) em solução salina ácida (pH 1,8) naturalmente aerada na ausência e presença de diferentes concentrações de íons ferrosos para avaliar a influência desses íons na resposta eletroquímica do sulfeto mineral na presença e ausência da bactéria Acidithiobacillus ferrooxidans. O potencial de circuito aberto (EOC) foi lido antes de cada medida de espectroscopia de impedância eletroquímica (EIS). Os ensaios de EIS foram realizados em diferentes tempos até 97 horas com eletrodo estático ou rotatório (1500 rpm). Alguns ensaios foram feitos aplicando potencial constante durante 4 horas seguidas de medidas de EIS. A análise qualitativa dos diagramas de impedância mostra duas constantes de tempo atribuídas ao processo de transferência de carga e de difusão, que podem ser alteradas pela presença de óxidos na superfície do mineral ou modificações da superfície da calcopirita produzidas durante o ensaio. A resposta com eletrodo rotatório mostrou menores arcos capacitivos do que na ausência de rotação sugerindo que o transporte de massa diminui a resistência de transferência de carga. Porém, nestes experimentos o arco capacitivo sempre aumentou com o tempo indicando possível modificação da superfície da calcopirita. A presença de bactéria juntamente com íons ferrosos elevou EOC e indicou a formação de um filme/biofilme na superfície do eletrodo, o qual não alterou significativamente o diâmetro do arco capacitivo, indicando que tais modificações não passivaram a superfície do eletrodo. Para uma análise quantitativa dos resultados obtidos com eletrodo estático foram sugeridos diferentes circuitos elétricos equivalentes (EEC) com arranjos de duas... / Abstract: We present an electrochemical study using carbon paste electrode modified with chalcopyrite (CuFeS2) containing 50 wt% of the mineral (particle size < 38 mm) and graphite (particle size @ 20 mm) in salt acid solutions (pH 1.8) naturally aerated with different ferrous ions concentrations to evaluate the influence of these ions on the electrochemical behavior of the mineral sulfide in the absence and presence of the bacteria Acidithiobacillus ferrooxidans. The open circuit potential was read before each measuring electrochemical impedance spectroscopy (EIS). The impedance tests were performed at different times up to 97 hours with static or rotating electrode (1500 rpm) by applying EOC. Some tests were performed by applying constant potential for 4 hours followed by EIS measurements. The qualitative analysis of the impedance diagrams show two time constants assigned to charge transfer and diffusion processes, which may be modified by the presence of oxides on the surface of the mineral or by chalcopyrite surface modifications produced during the test. The response with rotating disc electrode showed smaller capacitive arc than with static electrode suggesting that the mass transport decreases the charge transfer resistance. However, in these experiments the capacitive arc always increased with time indicating a possible modification of the surface of chalcopyrite. The presence of bacteria along with ferrous ions raised EOC and indicated the formation of a film / biofilm on the electrode surface, which did not significantly alter the diameter of the capacitive arc, showing that the modification did not passivate the electrode surface. For a quantitative analysis of the results obtained with a static electrode different equivalent electrical circuits (EEC) with two or three time constants have been suggested various, which were associated with the charge transfer process involving chalcopyrite, oxygen... / Doutor

Resumo: Métodos tradicionais de isolamento e cultivo limitam análises da diversidade microbiana no meio ambiente, pois acredita - se que aproximadamente 10% desses microrganismos possam ser cultivados. A ecologia microbiana molecular teve recentes progressos através da construção de bibliotecas metagenômicas, o que constitui uma poderosa abordagem para explorar a diversidade microbiana de solo fornecendo inclusive dados sobre os microrganismos não cultiváveis desse habitat. Este trabalho teve por objetivo comparar e estimar a diversidade de comunidades bacterianas, em solos de duas áreas, sendo solo de Floresta Nativa (SFN) e a outra sob arboreto com eucaliptos (SAE) de uma mesma região. Utilizando oligonucleotídeos iniciadores específicos, o gene 16S rRNA foi amplificado por PCR, os amplicons foram clonados em pGEMR-T e os clones obtidos seqüenciados parcialmente. No solo SFN foram analisados 231 clones e no solo SRE 248 clones. As seqüências obtidas foram submetidas à análise de similaridade de nucleotídeos com o banco de dados GenBank. Os filos bacterianos que mais se destacaram nos dois tipos de solo foram Acidobacteria e Proteobacteria. No solo SFN destacaram-se também as bactérias pertencentes ao filo Bacteroidetes e no solo SAE observou-se alta freqüência das bactérias Actinobacteria. Análises filogenéticas revelaram diferenças em ambos os solos, verificando através de índice de diversidade bacteriana observou-se que o solo sob eucalipto apresentou maior diversidade quando comparado ao solo sob de Floresta Nativa. / Abstract: Traditional methods of isolation and culture limits the analyses of the microbian diversity in the environment, because it is believed - that approximately 10% of these microrganisms can be cultivated. The molecular microbian ecology have had recent progress through the construction of metagenomics Iibraries, what constitutes a powerful boarding to explore the microbian diversity of soil, also supplying information on the microrganisms that cannot be cultivated on this habitat. This work had the objective of stimate the diversity of bacterial communities, in two areas, an area of Native Forest (SFN) and the another one under eucalypts (SAE) of the same region. Using specific oligonucleotides starters, the gene 16S rRNA was amplified by PCR, amplicons had been cloned in pGEMR-T and the obtained clones were partial/y sequenced. In the soil SFN, 231 clones had been analyzed and 248 clones in the soil SAE. The sequences obtained were submitted to the nucleotides similarity analysis with the GenBank database. The bacterial phylum that was more evident in the two types de soil were Acidobacteria and Proteobacteria. In the soi! SFN the bacteria of the phylum Bacteroidetes were evident and in the soil SRE high frequency of the Actinobacteria bacteria was observed. Phylogenetic analyses reveled an extensive diversity in both soils, verified through diversity index differences in the bacterial communities in both areas, and that the area under eucalypt presented more diversity in relation to the area of Native Forest. / Orientadora: Lúcia Maria Carareto Alves / Coorientadora: Eliana Gertrudes Macedo Lemos / Banca: Janete Apparecida Desiderio Sena / Banca: Uderlei Doniseti Silveira Covissi / Mestre

Orientador: Denise Bevilaqua / Co-orientador: Ana Teresa Lombardi / Banca: Sandra Regina Pombeiro Sponchiado / Banca: Mirian Cristina dos Santos / Banca: Valéria de Carvalho Santos Ebinuma / Banca: Clóvis Wesley Oliveira de Souza / Resumo: Atualmente, a indústria sucroalcooleira é tida como uma das indústrias mais importantes do cenário socioeconômico brasileiro. Entretanto, este setor gera grandes quantidades de resíduos . D entre esses resíduos encontra - se a torta de filtro (TF), um resíduo or gânico sólido representativo. U ma alternativa para a disposição final d a TF tem sido a reciclagem agrícola . Contudo, uma das principais preocupações em relação à aplicação deste composto no solo é a presença de contaminantes, como os elementos potencialmen te tóxicos (E PT s ) . E studos têm mostrado que a biolixiviação, um p rocesso que se baseia na capacidade dos microrganismos transfomarem os EPT s ligados a resíduos sólidos em formas solúveis extraíves, é uma alternativa promissora para o tratamento de diversos res íduos . Assim sendo, o presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar a remoção de elementos potencialmente tóxicos presentes no composto de torta de filtro produzido por uma usina sucroalcooleira utilizando a biolixiviação . Para isso, for am realizados ensaios de biolixivia ção, utilizando inicialmente as bactérias Acidithiobacillus ferrooxidans - LR e Acidithiobacillus thiooxidans - FG01. Iniciou - se a pesquisa com duas amostra s do compost o d e torta de filtro de safras diferente s (2014 e 201 5). As amostras foram caracterizadas quanto ao seu potencial agronômico e EPT s . Os ensaios de biolixiviação foram realizados em frascos agitados ( 150 rpm, 30ºC ), utilizando uma bactéria oxidante de ferro e a bactéria oxidante de enxofre suplementadas com F eSO 4 ou S°, respectivamente, bem como seus controles abiótico s correspondentes. Foi utilizada uma concentração inicial de densidade de polpa de 2% (m/v), e posteriormente com 10% (m/v) de torta de filtro. Observou - se que amostras coletadas na safra de 2014 inibiram a oxidação do Fe 2+ e a produção de... / Abstract: Currently, the sugar industry is considered one of the most important indu stries of the Brazilian socioeconomic scenario. However, this sector generates large amount of waste products, among which the filter cake (FC) is a rep resentative solid waste. A gricultural recycling can be considered as an alternative to the fin al disposa l of such solid waste . However, one of the main concerns regarding its application in the soil is the presence of contaminants such as trace elements. S tudies have shown that bioleaching is a promising alternative for the treatment of various wastes. Biole aching is efficient for the removal of potential ly t oxic elements ( P TE), allowing the compost to be used as soil conditioner, without causing additional problems. Th e objectives of the present work were to evaluate the removal of potential ly t oxic elements pre sent in the filter cake produced by a sugar and alcohol industry, through bioleaching. To accomplish this objective, we used bioleaching tests performed initially with the bacteria Acidithiobacillus ferrooxidans - LR and Acidithiobacillus thiooxidans - FG0 1. Initially two samples of the filter cake of different harvest s in 2014 and 2015 were used. The samples were characterized for their agronomic potential and presence of potential ly t oxic elements . Bioleaching experiments were carried out in flasks shaked ( 150 rpm at 30 °C ) supplemented with FeSO 4 or S o depending on the bacteria, as well as their corresponding abiotic controls. An initial concent ration of 2% pulp density (w/ v) followed by 10% (w / v) concentration of the filter cake along with T & K and 9K media were used. The results showed that samples from the 2014 crop inhibited the growth of microorganisms in comparison with the 2015 one. All subsequent tests were performed with samples from 2015 crop . The potential ly t oxic elements solubilization in the filte r cake was, in desc... / Doutor

Orientador: Denise Bevilaqua / Banca: Ana Teresa Lombardi / Banca: Paulo Teixeira Lacava / Resumo: A demanda crescente de metais como ferro, cobre, entre outros ocasionou o esgotamento progressivo dos depósitos minerais ; de tal modo que as companhias minera doras desenvolver am tecnologias alternativas aos métodos convencionalmente aplicados para a recuperação e extração de metais valiosos partir de minerais de baixo teor e outras fontes de metais polimetálicos como minerais de ferro que contem metais de base associados . Uma dessa s alternati vas é a biomineração que utiliza principalmente microrganismos procariontes e eucariontes para acelerar a dissolução oxidativa de minerais sulfetados presentes em minér i os de baixo teor produzindo a solubilização de metais associados; esta biotecnologia é atualmente usada apenas para processar minérios reduzidos e rejeitos minerais uma vez que a maioria destes minerais são sulfetados. No entanto, muitos metais de valor econ ômico também são encontrados em minerais que são parcial ou totalmente oxidados como as lat eritas de cobre ou níquel, minerais que não são susceptíveis à dissolução oxidativa; portanto, os minerais de ferro férrico contidos nes ses minérios não podem ser pr ocessados oxidativamente, pois estes compostos são susceptíveis de serem reduzidos por processos biológicos, derivando na solubilização de metais associados . Microrganismos acidófilos tais como Acidithiobacillus ferrooxidans podem catalisar a redução dissimilatória de íons férrico s na ausência de oxigênio para acelerar a solubilização destes metais. Estud os recentes têm mostrado que ess a nova abordagem pode ser utilizada para extrair metais tais como níquel e cobre a partir d e minérios oxidados a uma velocidade mais elevada do que pode ser conseguido por processos oxidativos. Neste trabalho, foram realizados ensaios de redução biológica de íons férrico s acoplado a oxidação anaeróbia de enxofre elementar em um biorreator... / Abstract: The growing demand for metals such as iron, copper, and others has caused the gradual exhaustion of mineral deposits; such a way that the mining companies have developed technologies alternative to the methods conventionally applied for the recovery and e xtraction of valuable metals from low grade minerals and other sources of polymetallic metals such as iron minerals which contains base metals associated . One such alternative is the biomining which uses mainly microorganisms prokaryotes and eukaryotes to accelerate the oxidative dissolution of sulphide minerals present in low grade ores producing solubilization of associated metals; This biotechnology is currently used only to process reduced ores and minerals tailings since most of these minerals are sulp hides. However, many metals of economic value are also found in minerals that are partially or fully oxidized like copper or nickel laterites, minerals that are not susceptible to oxidative dissolution; therefore, the mineral ferric iron contained in these ores can not be oxidatively processed, since these compounds are capable of being reduced by biological processes, deriving the associated solubilizing metals. Acidophilic microorganisms such as Acidithiobacillus ferrooxidans can catalyze the dissimilator y reduction of ferric iron in the absence of oxygen to accelerate the solubilization of these metals. Recent studies have shown that this new approach can be used to extract metals such as copper and nickel from oxide ores at a higher speed than can be ach ieved by oxidative processes. In this work were carried out biological reduction tests of ferric iron coupled anaerobic oxidation of elemental sulfur in an automated bioreactor 2 L with temperature, agitation and pH constant in anaerobic conditions using a n iron ore and a pure culture of facul tative anaerobic bacterium At. ferrooxidans. The sample was provided by the Vale Technology... / Mestre

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-04-01T19:51:45Z No. of bitstreams: 1 CelesteMariaDeMenezesSouza_DISSERT.pdf: 828781 bytes, checksum: 9755e5418c5ee46cbd00b3d37d799061 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-04-07T21:48:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CelesteMariaDeMenezesSouza_DISSERT.pdf: 828781 bytes, checksum: 9755e5418c5ee46cbd00b3d37d799061 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-07T21:48:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CelesteMariaDeMenezesSouza_DISSERT.pdf: 828781 bytes, checksum: 9755e5418c5ee46cbd00b3d37d799061 (MD5) Previous issue date: 2015-04-24 / Diagn?sticos imprecisos das vulvovaginites geram tratamentos inadequados que causam preju?zos ? sa?de das mulheres. Sendo assim, a pesquisa tem como objetivo: avaliar sistematicamente a efic?cia dos m?todos diagn?sticos das vulvovaginites infecciosas. Para tanto, adota como m?todo: realiza??o de um estudo de corte transversal com 200 mulheres no menacme com queixa de corrimento vaginal. Foi coletado material vaginal dessas mulheres para realiza??o dos seguintes exames: microbiol?gico a fresco e corado pelo Gram, citologia oncol?gica, teste das aminas e mensura??o do pH vaginal. Foi avaliada a efic?cia dos m?todos dispon?veis para diagn?stico do corrimento vaginal (sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo). Os dados foram inseridos em planilha do software Excel/Office 2010 com todas as vari?veis e, ap?s, exportados para o Graphpad Prism 6, para an?lise estat?stica. Resultados: na avalia??o da efic?cia dos m?todos, foram estudadas 200 pacientes, tendo como padr?o ouro o exame microbiol?gico corado pelo Gram, atrav?s do qual foram obtidos os seguintes resultados: exame a fresco para a candid?ase vaginal: sensibilidade = 31%, especificidade = 97%, valor preditivo positivo (VPP) = 54%, valor preditivo negativo (VPN) = 93%, acur?cia = 91%; exame a fresco para vaginose bacteriana: sensibilidade = 80%, especificidade = 95%, valor preditivo positivo (VPP) = 80%, valor preditivo negativo (VPN) = 95%, acur?cia = 92%; abordagem sindr?mica para vaginose bacteriana: sensibilidade = 95%, especificidade = 43%, valor preditivo positivo (VPP) = 30%, valor preditivo negativo (VPN) = 97%, Acur?cia = 54%; abordagem sindr?mica para a candid?ase vaginal: sensibilidade = 75%, especificidade = 91%, valor preditivo positivo (VPP) = 26%, valor preditivo negativo (VPN) = 98%, acur?cia = 90%; Papanicolau para a candid?ase vaginal: sensibilidade = 68%, especificidade = 98%, valor preditivo positivo (VPP) = 86%, valor preditivo negativo (VPN) = 96%, acur?cia = 96%; Papanicolau para vaginose bacteriana: sensibilidade = 75%, especificidade = 100%, valor preditivo positivo (VPP) = 100%, valor preditivo negativo (VPN) = 94%, acur?cia = 95%. Houve apenas um ?nico caso de tricomon?ase vaginal, diagnosticado pela citologia oncol?gica e exame a fresco, confirmado pelo Gram. A abordagem sindr?mica o deu como vaginose bacteriana. A partir desses dados e tendo ainda o suporte da literatura mundial, foi elaborado o Protocolo de diagn?stico e tratamento das Vulvovaginites da Maternidade Escola Janu?rio Cicco /UFRN. Desse estudo, restou como conclus?o: o Papanicolau e o exame a fresco demonstraram, respectivamente, baixa e muito baixa sensibilidade para a candid?ase vaginal; a abordagem sindr?mica apresentou muito baixa especificidade e acur?cia para a vaginose bacteriana, o que implica, na pr?tica cl?nica, um grande n?mero de pacientes n?o diagnosticadas ou tratadas de forma incorreta. / Inaccurate diagnosis of vulvovaginitis generates inadequate treatments that cause damages women's health. Objective: evaluate the effectiveness of methods when diagnosing vulvovaginitis. Method: a cross-sectional study was performed with 200 women who complained about vaginal discharge. Vaginal smear was collected for microbiological tests, considering the gram stain method as gold standard. The efficacy of the available methods for diagnosis of vaginal discharge was assessed (sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value). Data were inserted to Graphpad Prism 6, for statistical analysis. Results: the following results were obtained: wet mount for vaginal candidiasis: sensitivity = 31%; specificity = 97%; positive predictive value (PPV) = 54%; negative predictive value (NPV) =93%; accuracy = 91%. Wet mount for bacterial vaginosis: sensitivity = 80%; specificity =95%; positive predictive value (PPV) = 80%; negative predictive value (NPV) = 95%; accuracy = 92%. Syndromic approach for bacterial vaginosis: sensitivity = 95%; specificity=43%; positive predictive value (PPV) =30%; negative predictive value (NPV) = 97%; accuracy = 54%. Syndromic approach for vaginal candidiasis: sensitivity = 75%; specificity =91%; positive predictive value (PPV) = 26%; negative predictive value (NPV) = 98%; accuracy = 90%. Pap smear for vaginal candidiasis: sensitivity = 68%, specificity = 98%; positive predictive value (PPV) = 86%; negative predictive value (NPV) =96%; accuracy = 96%. Pap smear for bacterial vaginosis: sensitivity = 75%; specificity = 100%; positive predictive value (PPV) = 100%; negative predictive value (NPV) =94%; accuracy = 95%. There was only one case of vaginal trichomoniasis reported ? diagnosed by oncological cytology and wet mount ? confirmed by Gram. The syndromic approach diagnosed it as bacterial vaginosis. From the data generated and with support on world literature, the Maternidade Escola Janu?rio Cicco?s vulvovaginitis protocol was constructed. Conclusion: Pap smear and wet mount showed respectively low and very low sensitivity for vaginal candidiasis. Syndromic approach presented very low specificity and accuracy for bacterial vaginosis, which implies a large number of patients who are diagnosed or treated incorrectly.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / O objetivo deste estudo foi avaliar ex vivo a extrusão bacteriana apical após instrumentação mecanizada com sistemas reciprocantes de instrumento único e movimento reciprocante (WaveOne and Reciproc) comparados a um sistema multi-instrumentos (BioRaCe). Quarenta e cinco incisivos inferiores humanos unirradiculares, ovais e de anatomia semelhante foram utilizados. Os dentes foram acessados e seus canais radiculares foram contaminados com uma suspensão de Enterococcus faecalis e incubados por 30 dias possibilitando crescimento bacteriano em biofilme. Os dentes contaminados foram divididos em três grupos com 15 espécimes cada (RE - Reciproc, WO -WaveOne e BR - BioRaCe). Foram utilizados oito dentes para grupos controle de crescimento bacteriano positivo e negativo. As bactérias extruídas apicalmente durante a instrumentação foram coletadas em frascos de vidro contendo 0,9% de NaCl. As amostras microbiológicas foram retiradas dos frascos e incubadas em meio BHI ágar, durante 24 horas. O crescimento bacteriano foi contado e os resultados foram expressos em unidades formadoras de colônia (UFC). Os dados foram analisados pelos testes estatísticos de Wilcoxon e Kruskal-Wallis. Não houve diferença estatisticamente significante no número de UFC entre os dois sistemas reciprocantes (p>0,05). Em contrapartida, o sistema de instrumentos rotatórios mostrou uma quantidade de UFC significativamente maior do que os dois outros grupos (p <0,05). A partir da análise dos resultados e dentro das limitações deste estudo foi possível concluir que todos os sistemas de instrumentação testados extruem bactérias apicalmente. No entanto, ambos os sistemas de instrumento único e movimento reciprocante extruem menos bactérias apicalmente do que o sistema rotatório multi-instrumentos de referência. / The aim of this work was to evaluate ex vivo the apical bacterial extrusion of reciprocating single-file systems (Wave One and Reciproc) compared to a multi-file rotary system (BioRaCe). This was tested in the current study using extracted, single-rooted teeth with oval canals (n = 45) with similar anatomy. Endodontic access cavities were prepared and root canals were contaminated with an Enterococcus faecalis suspension and incubated for thirty days to promote bacterial biofilm growth. The contaminated teeth were divided into three groups with 15 specimens each (RE - Reciproc, WO- Wave One and BR - BioRaCe). Positive and negative bacterial growth control groups were done. Bacterial extruded from the apical foramen during instrumentation were collected into vials containing 0.9% NaCl. The microbiological samples were taken from the vials and incubated in BHI agar medium during 24h. Bacterial growth was counted and the results were given by colony-forming units (CFU). These data were analyzed by Wilcoxon matched-pairs signed rank test and KruskalWallis H-test. After data analysis, no significant difference was found in the number of CFU between the two reciprocating systems (p > 0.05). Conventional multi-file rotary system group showed significantly higher CFU than both of the other two reciprocating groups (p<0.05). Based on the results evaluation and within the limitation of this study, it was possible to conclude that all tested instrumentation systems extruded bacteria beyond the apex. However, both reciprocation single-file systems apically extruded fewer bacteria than the conventional multi-file rotary system.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:18:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FladjuleRSS.pdf: 330062 bytes, checksum: 22e7d9836e1ea44b75c1f00b2ab22a60 (MD5) Previous issue date: 2008-03-28 / Bacterial meningitis (BM) is still an important infectious disease causing death and disability. Invasive bacterial infections of the central nervous systems (CNS) generate some of the most powerful inflammatory responses known, which contributes to neuronal damage. The DNA microarray technology showed alterations in the kynurenine (KYN) pathway that is induced in BM and other diseases associated with inflammation, leading to brain injury. Our main aim was to search SNPs previously described in the KYN path enzymes to investigate a putative association of this SNPs with imbalanced in this pathway in patients with BM. The patients included in this study were 33 males and 24 females, with ages varying from 02 months to 68 years. SNPs were located inside of the domain conserved in KYNU, IDO, KATI and KATII. Primers were designed for analysis of SNPs already described by PIRA-PCR followed by RFLP. The analysis of KYNU+715G/A SNP found a heterozygous frequency of 0.033. We did not found the variant allele of SNP KYNU+693G/A, KATI+164T/C, KATII+650C/T and IDO+434T/G. Despite of previews studies showing the importance of KYN pathway we did not found one association of these SNPs analyzed with susceptibility or severity of MB in study population. / A meningite bacteriana (MB) ? uma doen?a infecciosa que causa morte e deixa graves seq?elas. Infec??es bacterianas do sistema nervoso central (SNC) geram uma das mais poderosas respostas inflamat?rias conhecidas, a qual contribui para os danos neuronais. Atrav?s de an?lises por Microarray foi poss?vel observar altera??es na Rota da Quinurenina (RQ) que s?o induzidas na MB e em outras doen?as associadas com inflama??o, levando a inj?ria cerebral. A RQ tem um papel crucial na patog?nese da MB, produzindo neurotoxinas e esp?cies reativas de oxig?nio. Nosso principal objetivo foi buscar SNPs previamente descritos no banco de dados do NCBI em enzimas da RQ e investigar uma poss?vel associa??o destes SNPs com as altera??es da RQ em pacientes com MB. Os pacientes inclu?dos neste estudo foram 33 homens e 24 mulheres, com idades variando entre 02 meses a 68 anos. Os SNPs foram localizados dentro do dom?nio conservado da cadeia polipept?dica das enzimas KYNU, IDO, KATI e KATII. Primers foram desenhados para an?lises do SNPs atrav?s da t?cnica do PIRA-PCR seguido por RFLP. A an?lise do SNP KYNU+693G/A mostrou uma freq??ncia de heterozigosidade de 0,033. N?s n?o encontramos freq??ncia al?lica na popula??o estudada para os SNPs KYNU+693G/A, KATI+164T/C, KATII650C/T e IDO+434T/G. Apesar de estudos anteriores mostrarem a import?ncia da RQ, n?o foi encontrada uma associa??o dos SNPs estudados com a susceptibilidade ou a severidade das seq?elas da MB na popula??o em estudo.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-02-15T11:56:11Z No. of bitstreams: 1 LeonardoCesarAndriolaCarvalho_DISSERT.pdf: 1817208 bytes, checksum: 513d53ff5b107ffefc3220ff658f24fa (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-02-16T16:04:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 LeonardoCesarAndriolaCarvalho_DISSERT.pdf: 1817208 bytes, checksum: 513d53ff5b107ffefc3220ff658f24fa (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-16T16:04:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LeonardoCesarAndriolaCarvalho_DISSERT.pdf: 1817208 bytes, checksum: 513d53ff5b107ffefc3220ff658f24fa (MD5) Previous issue date: 2017-05-19 / A otite externa canina ? uma enfermidade relevante na cl?nica veterin?ria. Considerando a elevada frequ?ncia de atendimentos de c?es com otite externa bacteriana, objetivou-se identificar a frequ?ncia etiol?gica da otopatia e tra?ar o perfil de resist?ncia dos Staphylococcus Meticilina Resistentes (SMR) e enterobact?rias produtoras de Beta-Lactamases de Espectro Estendido (ESBL) em pacientes ambulatoriais e de internamento. As amostras foram submetidas a isolamento prim?rio, testes de susceptibilidade ? antimicrobianos e de resist?ncia bacteriana. Para os Staphylococcus sp. aplicou-se o Teste D (Disk Test) e o teste de Resist?ncia ? Meticilina (Met-25). Nas cepas positivas para o Met-25 foi feita Rea??o em Cadeia da Polimerase (PCR) para detec??o do gene mecA. Para estirpes positivas na PCR foi determinada a Concentra??o Bactericida M?nima (CBM) do gluconato de clorexidina. Os grupos bacterianos isolados das 140 amostras coletadas foram: Staphylococcus sp. (122 ? 49,38%), Pseudomonas sp. (22 ? 8,91%), enterobact?rias (19 ? 7,69%), Enterococcus sp. (17 ? 6,88%) e Acinetobacter sp. (12 ? 4,86%). Foram isoladas 14 cepas de SMR (11,47%) e todas continham o gene mecA. Observou-se que 14 Staphylococcus sp. foram Teste D positivo. Para os Staphylococcus coagulase positiva (SCP) a CBM foi de 500.000?g/mL (0,5%) enquanto que para os Staphylococcus coagulase negativa (SCN) o valor da CBM foi de 62.500?g/mL (0,0625%). Detectou-se 3 cepas de enterobact?rias ESBL. Os antimicrobianos mais efetivos para Staphylococcus sp. foram: Linezolida (100%), Rifampicina (94,26%) e Cloranfenicol (92,62%). Para Pseudomonas sp.: Cefepime (100%), Imipenem (100%) e Meropenem (100%). Para as enterobact?rias: Ertapenem (100%), Imipenem (100%) e Cefotaxima (84,21%). Para Enterococcus sp.: Cloranfenicol (100%), Linezolida (94,12%) e Vancomicina (88,24%). Para Acinetobacter sp.: Imipenem (100%), Meropenem (100%) e Ticarcilina com Clavulanato (91,67%). Apesar do gene mecA e de enterobact?rias produtoras de ESBL terem baixa ocorr?ncia neste estudo, existe a necessidade de um monitoramento constante em cepas isoladas de animais dom?sticos. Cultura bacteriol?gica e os testes de suscetibilidade aos agentes antimicrobianos s?o de grande import?ncia na rotina cl?nica veterin?ria para garantir o sucesso do tratamento de infec??es otol?gicas caninas. / The canine external otitis is a relevant disease regarding veterinary clinic. Considering the high frequency of treatment of dogs with external bacteria otitis, this research aims to identify the etiological frequency of otopathy and trace the resistance profile of the Methicillin Resistant Staphylococcus (MRS) and enterobacteria that produce Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) in outpatients and internment patients. The samples were submitted to primary isolation, tests of antimicrobial susceptibility and bacterial resistance. For the Staphylococcus sp. the Disk Test was applied along with the resistance test to Methicillin (Met-25). In the positive strains for Met-25, a Polimerase Chain Reaction (PCR) was applied to detect the mecA gene. For the PCR positive strains, a Minimum Bactericidal Concentration (MBC) of chlorhexidine gluconate was determined. The isolated bacterial groups of the 140 samples collected were: Staphylococcus sp. (122 ? 49.38%), Pseudomonas sp. (22 ? 8.91%), enterobacteria (19 ? 7.69%), Enterococcus sp. (17 ? 6.88%) and Acinetobacter sp. (12 ? 4.86%). 14 MRS strains (11.47%) were observed and all off them had the mecA gene. 14 Staphylococcus sp. were Disk Test positive. Concerning the positive Staphylococcus coagulase, the MBC was 500.00?g/mL (0.5%) whereas for the negative Staphylococcus coagulase the MBC value was 62.500?g/mL (0.0625%). 3 ESBL enterobacteria strains were detected. The more effective antimicrobial for the Staphylococcus sp. were: Linezolid (100%), Rifampicin (94.26%) and Chloramphenicol (92.62%). Regarding the Pseudomonas sp.: Cefepime (100%), Imipenem (100%) and Meropenem (100%). Regarding the enterobacteria: Ertapenem (100%), Imipenem (100%) and Cefotaxime (84.21%). Regarding the Enterococcus sp.: Chloramphenicol (100%), Linezolid (94.12%) and Vancomycin (88.24%). Regarding the Acinetobacter sp.: Imipenem (100%), Meropenem (100%) and Ticarcillin with Clavulanate (91.67%). Although the mecA gene and the enterobacteria that produce ESBL are briefly presented in this research, there is a need for constant monitoring of isolated strains in domestic animals. The bacteriological growth and the susceptibility tests in the antimicrobial agents are of great importance in the veterinary clinic routine in order to insure the success in treating canine otological infections.

A tuberculose (TB) é uma doença infecto-contagiosa causada pelo complexo Mycobacteruim tuberculosis. A melhor forma de prevenção se baseia na detecção e na cura dos casos. Um diagnóstico acurado de TB seria essencial para a identificação e tratamento dos pacientes. O diagnóstico laboratorial recomendado baseia-se na baciloscopia e na cultura de material clínico. Novos métodos, os quais empregam técnica genética baseada na amplificação e detecção do DNA bacteriano ou do RNA, visam melhorar a velocidade, sensibilidade e especificidade da detecção da bactéria. O principal teste desse grupo é o método da reação da cadeia da polimerase (PCR). Entretanto, há discordância na literatura quanto as dados de validade da PCR aplicada ao diagnóstico de tuberculose. O presente estudo realizou uma meta-análise sobre o teste da PCR no diagnóstico de TB. O método estatístico usado estimou efeitos do teste entre os estudos primários. A sensibilidade e a especificidade foram calculadas de acordo com as suas definições: Sensibilidade = TPR, taxa de verdadeiros positivos e Especificidade = 1 FPR, onde FPR = taxa de falsos positivos. Calculamos os logit de TPR e FPR a soma e suas diferenças e fizemos uma back transformação aos eixos de TPR vs. FPR com posterior construção da curva SROC (Moses & Shapiro, 1993). A curva SROC representa uma estimativa da medida de acurácia do teste índice a qual é ajustada pelo ponto de corte tanto quanto pela interdependência dos valores de sensibilidade e especificidade obtidos de cada estudo. Foram localizados 1375 artigos através de busca base de dados do Medline no período de 1988 a 2000. Considerando os critérios de elegibilidade, foram aceitos 111 artigos. A caracterização dos estudos, a validade e a sua aplicabilidade foram apreciadas. A medida combinada de todos os estudos foi de 0,86 para a sensibilidade e 0,95 para a especificidade usando-se o método de efeitos aleatórios. A PCR in-house apresentou melhor performance do que a Amplicor. O AMTD obteve os maiores valores de acurácia possivelmente devido o rRNA apresentar múltiplas cópias por célula. Diante das evidências, a PCR se constitui num teste complementar para tuberculose devendo ter critérios próprios para a sua utilização. No entanto, este teste não contempla os atributos requeridos para a substituição da baciloscopia na rotina diagnóstica.

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