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Genotipagem do vírus da hepatite C e avaliação da resposta ao tratamento em Goiânia-Goiás, com ênfase no polimorfismo relacionado ao gene IL28B / Genotyping of hepatitis C virus and evaluation of treatment response in Goiânia-Goiás, with emphasis on the polymorphism upstream of IL28B gene

Silva, Ágabo Macêdo da Costa e 28 February 2014 (has links)
Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2014-11-27T19:29:54Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ágabo Macêdo da Costa e Silva- 2014.pdf: 1890977 bytes, checksum: 8a4d7bcee9ab084556c93c3c72e6a9f8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2014-12-01T14:46:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ágabo Macêdo da Costa e Silva- 2014.pdf: 1890977 bytes, checksum: 8a4d7bcee9ab084556c93c3c72e6a9f8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-01T14:46:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ágabo Macêdo da Costa e Silva- 2014.pdf: 1890977 bytes, checksum: 8a4d7bcee9ab084556c93c3c72e6a9f8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Hepatitis C represents a public health problem worldwide. Hepatitis C virus (HCV) is classified into seven genotypes and many subtypes. Besides their epidemiological importance, these genotypes have influence on the response to hepatitis C treatment, as well as other factors related to the virus and its host, such as polymorphisms upstream of interleukin (IL) 28B locus. Despite the importance of these factors in the response to treatment of hepatitis C, there are no data regarding the subject in the Midwest Region of Brazil. The present study aimed to identify the genotypes of HCV among patients attended at a reference laboratory in Goiânia-GO, and also to assess response to treatment of patients infected with genotype 1 with pegylated interferon (PEG-IFN) and ribavirin (RBV), with emphasis on the polymorphism upstream of IL28B gene (rs 12979860). For HCV genotyping, a cross-sectional study was conduct in an anti-HCV positive patients in a reference laboratory in Goiânia-GO, during in a period of 10 years (2003 to 2012) (n = 1300). From January/2012 to December/2013 (n = 101), a cohort was conduct among patients infected with HCV genotype 1 treated with PEG-IFN and RBV in order to evaluate treatment response. Patients were interviewed and blood samples collected for detection of viral RNA by polymerase chain reaction (PCR) with primers complementary to the region 5’ noncoding (NC) of HCV. All HCV RNA positive samples were genotyped by line probe assay – LiPA, and the samples typed as 1a/1b, 2 and 4 were sequenced in the NS5B region of the viral genome. The analysis of single nucleotide polymorphism (SNP) rs12979860 C/T was performed by restriction fragment length polymorphism (RFLP). Of the 1300 samples tested for HCV RNA, 894 were positive. Among these, genotypes 1 (76.3%), 2 (1.9%), 3 (21.6%) and 4 (0.2%) were found. These data show the predominance of genotype 1, followed by 3 and 2, and support the results of other studies in Goiânia. In addition, genotype 4 was found in the studied population. Regarding to SNP rs12979860 C/T, the TC genotype was the most common (57.4%), followed by CC (23.8%) and TT (18.8%). The rate of sustained virologic response (SVR) was 28.7%, being higher in individuals with the CC genotype (54.2%) when compared to those with CT and TT genotypes (22.4% and 15.8%, respectively). These results indicate that analysis of SNP rs12979860 is an important predictor of SVR following PEG-IFN and RBV treatment in patients infected with HCV genotype 1 in our region. / A hepatite C representa um problema de saúde pública mundial. O vírus da hepatite C (HCV) é classificado em sete genótipos e vários subtipos. Além da importância epidemiológica, os genótipos desse vírus influenciam a resposta ao tratamento da hepatite C, assim como outros fatores relacionados ao vírus e ao hospedeiro, como o polimorfismo relacionado ao gene da interleucina (IL) 28B. Apesar da importância desses fatores na resposta ao tratamento da hepatite C, não existem dados sobre o tema na Região Centro-Oeste. O presente estudo teve como objetivos identificar os genótipos do HCV em pacientes atendidos em laboratório de referência em Goiânia-GO e avaliar a resposta ao tratamento com interferon peguilado (PEG IFN) e ribavirina (RBV) em portadores do genótipo 1, com ênfase no polimorfismo relacionado ao gene IL28B (rs 12979860). Foi realizado um estudo de corte transversal para genotipagem do HCV em pacientes anti-HCV reagentes atendidos em laboratório de referência em Goiânia-GO, em um período de 10 anos (2003 a 2012) (n = 1300). Entre janeiro/2012 e dezembro/2013 (n = 101), foi formada uma coorte de portadores do genótipo 1 do HCV submetidos ao tratamento da hepatite C com PEG IFN e RBV, para avaliação de sua resposta. Os pacientes foram entrevistados e amostras sanguíneas coletadas para detecção do RNA viral por reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores complementares a região 5’ não codificante (NC) do HCV. Todas as amostras RNAHCV positivas foram genotipadas por line probe assay – LiPA, e as tipadas como 1a/1b, 2 e 4 foram sequenciadas para a região NS5B do genoma viral. A análise do single nucleotide polymorphism (SNP) rs12979860 C/T foi realizada por restriction fragment length polymorphism (RFLP). Das 1300 amostras testadas para RNA-HCV, 894 foram positivas, sendo identificados os genótipos 1 (76,3%), 2 (1,9%), 3 (21,6%) e 4 (0,2%). Estes dados mostram o predomínio do genótipo 1, seguido do 3 e 2, e corroboram os de outros estudos realizados em Goiânia, com a adição do genótipo 4 na população estudada. Em relação ao SNP rs12979860 C/T, o genótipo TC foi o mais frequente (57,4%), seguido por CC (23,8%) e TT (18,8%). A taxa de resposta virológica sustentada (RVS) foi de 28,7%, sendo superior nos portadores do genótipo CC (54,2%) em relação aos genótipos TC e TT (22,4% e 15,8%, respectivamente). Estes resultados indicam que a análise do SNP rs12979860 é importante preditor de RVS ao tratamento com PEG IFN e RBV em pacientes infectados com o genótipo 1 do HCV em nossa região.
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Caracterização funcional da proteína Triose fosfato isomerase de Paracoccidioides brasiliensis como potencial adesina / Functional characterization of the Paracoccidioides brasiliensis triosephosphate isomerase protein for potential adhesion function

Pereira, Luiz Augusto 04 September 2008 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-01-29T18:42:14Z No. of bitstreams: 2 Tese - Luiz Augusto Pereira - 2008.pdf: 11628724 bytes, checksum: 97ca17282a858a05078e31d8a06bfefe (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-01-29T18:42:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Luiz Augusto Pereira - 2008.pdf: 11628724 bytes, checksum: 97ca17282a858a05078e31d8a06bfefe (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-29T18:42:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Luiz Augusto Pereira - 2008.pdf: 11628724 bytes, checksum: 97ca17282a858a05078e31d8a06bfefe (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2008-09-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Paracoccidioides brasiliensis, an important human pathogen causative of paracoccidioidomycosis (PCM), a systemic mycosis with broad distribution in Latin America. Adhesion to and invasion of host cells are essential steps involved in the infection and dissemination of pathogens. Furthermore, pathogens use their surface molecules to bind to host extracellular matrix components to establish infection. An adhesin of P. brasiliensiswas isolated from two dimensional electrophoresis and characterized. Peptides obtained by partial sequencing of the isolated protein, which presenteda molecular mass of 29 kDa and pI 5.8, were subjected to sequence analysis of their amino acids, that revealed strong homology to triose phosphate isomerase (TPI) from several sources. The complete cDNA and gene encoding TPI of P. brasiliensis (PbTPI) were characterized and both contained an open reading frame predicted to encode a 249 amino acid protein that presented all the peptides characterized in the native PbTPI. The complete coding PbTPI cDNA was cloned and over expressed in Escherichia coli host. The purified recombinant TPI was used to produce polyclonal antibody in rabbit. By immunoelectron microscopy and Western blot analysis, TPI was detected in the cell wall and the cytoplasm of the yeast phase of P. brasiliensis. The expression of PbTPI was analyzed in transition from mycelia to yeast phase. The native PbTPI is preferentially expressed in the yeast parasitic phase of P. brasiliensis. The recombinant PbTPI was found to bind to laminin and fibronectin in ligand far-Western blot assays. TPI binds preferentially to laminin, as determined by peptide inhibition assays. Of special note, the treatment of P. brasiliensisyeast cells with anti-PbTPI polyclonal antibody and the incubation of pneumocytes and VERO cells with the recombinant protein promoted inhibition of adherence and internalization of P. brasiliensisto those in vitrocultured cells. These observations indicate that TPI could be contribute to the adhesion of the microorganism to host tissues and to the dissemination of infection. / Paracoccidioides brasiliensis é um importante patógeno humano que causa a paracoccidioidomicose (PCM), uma micose sistêmica com ampla distribuição na América Latina. A adesão e a invasão de células são eventos essenciais envolvidos na infecção e disseminação do patógeno. Para isso, patógenos utilizam suas moléculas de superfície para se ligar a componentes da matriz extracelular e estabelecer a infecção. Uma proteína antigênica de P. brasiliensisfoi isolada a partir do gel de eletroforese bidimensional de proteínas totais do fungo e caracterizada. Peptídeos obtidos por sequenciamento parcial da proteína de 29 kDa e pI 5.8 mostraram homologia com triose fosfato isomerase (TPI) de diversos organismos. O cDNA e o gene completos que codificam para TPI de P. brasiliensis (PbTPI) foram caracterizados, e ambos contém uma ORF que codifica para uma proteína com 249 aminoácidos que apresenta todos os peptídeos caracterizados na PbTPI nativa. O cDNA completo que codifica para PbTPI foi expresso em Escherichia coli. A proteína recombinante TPI foi utilizada para produção de anticorpo policlonal em coelho. Através de imunomicroscopia de transmissão eletrônica e análises por Western blotting, foi detectada a presença da TPI, na parede celular de leveduras de P. brasiliensis e no citoplasma. A expressão da PbTPI foi analisada na transição das fases de micélio para levedura. A PbTPI nativa está preferencialmente expressa na fase parasitária de P. brasiliensis. A PbTPI recombinante foi capaz de se ligar a laminina e fibronectina em ensaios de Western blotting de afinidade. PbTPI se liga preferencialmente a laminina, como foi determinado por ensaio de inibição com peptídeos sintéticos. Uma observação importante, é que tanto o tratamento de P. brasiliensiscom anticorpo anti-PbTPI, quanto de pneumócitos e células VERO tratados com a TPI recombinante, promoveram considerável inibição da aderência e internalização de P. brasiliensisàs células cultivadas in vitro. Essas observações indicam que a TPI possivelmente contribui para a adesão do microrganismo aos tecidos do hospedeiro e para a disseminação da infecção.
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Seleção de microrganismos endofíticos com potencialidades para a biorremediação de ambientes contaminados com hidrocarbonetos de petróleo e/ou derivados / Selection of endophytic microorganisms for biorremediation in impacted soils with petroleum hydrocarbons and derivates

OLIVEIRA, Natalia Carvalhaes de 16 March 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Natalia Carvalhaes de Oliveira.pdf: 1211975 bytes, checksum: 414976b584307f085c0610f71d63bb94 (MD5) Previous issue date: 2009-03-16 / Endophytic microorganisms live inside plants showing no apparently damage for the host, often assisting in survival of plants, helping its growth with production of phytohormones, phosphates solubilization, nitrogen fixation and enzymes production, or they can metabolize organic contaminants, like petroleum and derivates. This work aimed to isolated and identified endophytic microorganisms of plants present in impacted areas, as well as test their ability in petroleum and its derivatives degradation, identify bacteriocin production, to test their nitrogen fixation capability, phosphate solubilization, indol-acetic acid (IAA) and enzymes production. Plant samples were collected, in an area impacted with asphaltic and mud, were superficially disinfected using 70% ethanol, sodium hypochlorite and sterile distilled water. After macerated and fragmented, the samples were incubated at 30°C for about 72 hours, when growth of microorganisms was observed in culture media: Nutrient Agar, TSA (Tryptone Soya Agar) and King medium. The verification of petroleum and derivatives degradation capacity was performed in ELISA plates, exposing the bacteria to a solution of Minimal Medium, the dye DCPIP solution (2,6-dicloroindofenol sodium salt) and petroleum or derivative tested (burning oil, lubricating oil, diesel oil and gasoline). A positive reading for degradation was observed by discoloration of DCPIP. Among nine bacteria tested, three showed degradative activity in different fractions of petroleum, diesel oil and gasoline, and others showed different profiles. This result shows the potential of these microorganisms for application in bioremediation processes. The production of IAA was tested on TSA medium supplemented with tryptophan and only one sample was positive, while none was considered phosphate solubilizing. Testing the nitrogen fixing, samples were inoculated for a free nitrogen culture media, showing growth after 24 hours of incubation (positive results), however it s isolated did not show positive results in the acetylene reduction test, which confirms activity of the enzyme nitrogenase. The samples showed different profiles for the production and activity of bacteriocins against the clinical isolates tested. There were no detected activity of endoglucanase, cellulolytic and pectinolytic enzymes, but esterases, ß-glucosidases, proteases and amylases were positive. Some isolates were identified from the sequencing of 16S DNA, whose sequence was compared to database (GenBank), and then diagnosed as Bacillus cereus, Staphylococcus pasteuri and Pseudomonas sp. The endophytic bacteria isolated from Cerrado plants confirmed their potential for use in bioremediation, plant growth promotion and diverse enzyme production, with potential for use in pharmaceutical, food, textiles, among others. / Microrganismos endofíticos vivem no interior de plantas sem causar danos aparentes no hospedeiro, muitas vezes auxiliando na sobrevivência do vegetal, auxiliando seu crescimento com produção de fitormônios, solubilização de fosfatos, fixação de nitrogênio e produção de enzimas, ou metabolizando alguns compostos contaminantes orgânicos, como petróleo e/ou derivados. O objetivo deste trabalho foi isolar e identificar microrganismos endofíticos de vegetais presentes em áreas impactadas, assim como testar sua capacidade de degradação de petróleo e alguns derivados, identificar seu perfil para a produção de bacteriocinas, capacidade de fixação de nitrogênio, solubilização de fosfatos, produção de ácido indol-acético (AIA) e enzimas. Amostras vegetais foram coletadas em uma área impactada com lama asfáltica e desinfectadas superficialmente utilizando etanol 70%, hipoclorito de sódio e água destilada esterilizada. Depois de fragmentadas e maceradas, as amostras foram incubadas à 30o C por cerca de 72 horas, quando se observou crescimento de microrganismos nos meios de cultura: Agar nutriente, meio TSA (Tryptone Soya Agar) e meio de King. A verificação da capacidade de degradação de petróleo e derivados foi realizada em placas de ELISA, expondo a bactéria a uma solução contendo meio de cultura Mínimo, solução do corante DCPIP (sal de sódio de 2,6-dicloroindofenol) e petróleo ou derivado testado (óleo queimado, óleo lubrificante, óleo diesel e gasolina). A leitura positiva para degradação foi observada pela descoloração do DCPIP. Entre nove bactérias testadas, três apresentaram atividade degradativa em diferentes frações de petróleo, óleo diesel e gasolina, e as demais apresentaram variados perfis. Este resultado mostra a potencialidade desses microrganismos para aplicação em processos de biorremediação. A produção de AIA foi testada em meio TSA acrescido com triptofano e somente uma amostra apresentou resultado positivo, enquanto nenhuma foi considerada solubilizadora de fosfatos. Para teste de fixação de nitrogênio os isolados foram inoculados em meios livres de nitrogênio, apresentando crescimento após 24 horas de incubação, no entanto não apresentaram resultados positivos no teste de redução do acetileno, que confirma atividade da enzima nitrogenase. As amostras apresentaram variados perfis para a produção e atuação das bacteriocinas frente aos isolados clínicos testados. Não foi detectada atividade das enzimas endoglucanase, celulolítica e pectinolítica, mas sim de esterases, ß- glucosidases, proteases e amilases. Alguns isolados foram identificados a partir do sequenciamento da região 16S DNA, cuja sequência foi comparada a um banco de dados (GenBank) e então diagnosticados como Bacillus cereus, Staphylococcus pasteuri e Pseudomonas sp. Foi confirmada a caracterização de bactérias endofíticas isoladas de plantas de Cerrado com potencial para utilização em biorremediação, promoção de crescimento vegetal e diversa produção enzimática, com potencialidades para utilização em indústria farmacêutica, alimentícia, têxtil, entre outras.
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Aspectos epidemiológicos e genótipos do vírus da Hepatite C em caminhoneiros de rota longa do Brasil / Epidemiological aspects and hepatitis c virus genotypes in long distance truck drivers in Brazil

FREITAS, Nara Rubia de 22 February 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao nara rubia de freitas.pdf: 797605 bytes, checksum: 8cb4f0057aeb5da4a4c5a7c9db0264ef (MD5) Previous issue date: 2008-02-22 / Globally, the prevalence of hepatitis C virus (HCV) infection is about 3%, with a significant variation according to geographic areas and population groups. However, studies concerning this infection in truck drivers population are rare. This study aimed to determine the HCV infection prevalence, to analyse associated risk factors and also to identify this virus genotypes in a population of long distance truck drivers in Brazil. In 2005-2006, 641 truck drivers who were circulating on BR-153 Federal road were interviewed and blood samples collected. Blood samples (sera) were tested for anti-HCV antibodies detection by enzyme linked immunosorbent assay. Anti-HCV reactive sera were retested for confirmation by immunoblot and also for HCV RNA detection by polymerase chain reaction. HCV RNA positive samples were genotyped by line probe assay (LiPA). Nine samples were anti-HCV positive, resulting in a prevalence of 1.4% (95% CI: 0.7-2.7). By multivariate analysis, use of illicit drug and hepatitis B virus seropositivity (anti-HBc marker) were risk factors for this infection. Genotyping of HCV RNA positive samples revealed the presence of genotypes 1 (37.5%), 2 (25.0%) and 3 (37.5%). The findings of this study indicate an intermediate endemicity for HCV infection in truck drivers in Brazil, the relevance of drug use in the transmission of this agent and the circulation of genotypes 1, 2 and 3 in the studied population. / Globalmente, a prevalência da infecção pelo vírus da hepatite C (HCV) é de aproximadamente 3%, variando consideravelmente de acordo com as áreas geográficas e grupos populacionais. Contudo, são poucos os estudos sobre essa infecção na população de caminhoneiros. Este estudo teve como objetivos determinar a prevalência da infecção pelo HCV, analisar os fatores de risco e identificar os genótipos virais em uma população de caminhoneiros de rota longa no Brasil. Em 2005-2006, 641 motoristas de caminhão, que circulavam na Rodovia Federal BR-153, foram entrevistados e tiveram amostras sanguíneas coletadas. As amostras de sangue (soros) foram submetidas à detecção de anticorpos anti-HCV pelo ensaio imunoenzimático. Os soros reagentes foram retestados para anti-HCV por immunoblot e para a detecção do RNA viral pela reação em cadeia da polimerase. As amostras RNA-HCV positivas foram genotipadas pelo método line probe assay (LiPA). Nove amostras foram positivas para o marcador anti-HCV, resultando numa prevalência de 1,4% (IC 95%: 0,7-2,7). Pela análise multivariada, configurou-se como fatores de risco associados a esta infecção: uso de drogas ilícitas e soropositividade ao vírus da hepatite B (marcador anti-HBc). A genotipagem realizada nas amostras RNA-HCV positivas identificou os genótipos 1 (37,5%), 2 (25,0%) e 3 (37,5%). Os achados deste estudo indicam uma endemicidade intermediária para a infecção pelo HCV em caminhoneiros no Brasil, assim como a relevância do uso de drogas na transmissão desse agente e a circulação dos genótipos 1, 2 e 3 na população estudada.
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Prevalência da infecção pelo vírus da hepatite C em hemodialisados no Estado do Tocantins / Prevalence of hepatitis C virus infection in hemodialysis patients in the State of Tocantins

Cordeiro, Valéria Maciel 11 December 2015 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-11-30T17:00:29Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Valéria Maciel Cordeiro - 2015.pdf: 2898371 bytes, checksum: bc056e412813de8d558bc6d88fb95848 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-12-04T10:43:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Valéria Maciel Cordeiro - 2015.pdf: 2898371 bytes, checksum: bc056e412813de8d558bc6d88fb95848 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-04T10:43:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Valéria Maciel Cordeiro - 2015.pdf: 2898371 bytes, checksum: bc056e412813de8d558bc6d88fb95848 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-12-11 / The infection of hepatitis C virus (HCV) is a major public health problem that affects 130-150 million people, chronically, worldwide. HCV infection is highly prevalent among individuals with chronic reanl disease (CKD). The objectives of this study were estimate the prevalence of the infection with hepatitis C in hemodialysis patients of the State of Tocantins, analyze the risk factors associated with HCV infection and characterize circulating genotypes in this population. The study was conducted in 394 patients who were being treated in the hemodialysis centers of the State of Tocantins, from October 2014 to February 2015. The patients were interviewed, the questions were about sociodemographic characteristics and risk factors for HCV infection and blood samples were collected. All samples were tested for antibodies to HCV (anti-HCV) by means of enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The anti-HCV reagents samples were submitted to the detection of viral RNA by reverse transcription polymerase chain reaction (RT_PCR) and genotyped by line probe assay method (LiPA). The prevalence of HCV infection in hemodialysis patients was 2.8% (95% CI: 1.47 to 5.09). The viral RNA was detected in two of the eleven anti-HCV positive samples and identified the genotype 1, subtype 1a in these samples. The treatment time of seropositive patients was on average 105.19 months, and the negatives of 61.23 months. In univariate analysis, prison records and history of sexually transmitted disease were significantly associated with HCV infection. After the multivariate analysis, only the history of STDs remained associated. The results of this study showed a significant reduction of HCV infection in hemodialysis centers of the State of Tocantins, but the prevalence that was found (2.8%) is almost double that seen in the general population of Brazil (1.38%). Therefore, control strategies and prevention of hepatitis C in hemodialysis patients are extremely important to prevent that infection in the sector of dialysis. / A infecção pelo o vírus da hepatite C (HCV) é um importante problema de saúde pública, que acomete cronicamente 130-150 milhões de pessoas em todo o mundo. Essa infecção é altamente prevalente entre os indivíduos com doença renal crônica (DRC). Os objetivos deste estudo foram estimar a prevalência da infecção pelo vírus da hepatite C nos pacientes em hemodiálise do Estado do Tocantins, analisar os fatores de risco associados à infecção pelo HCV e caracterizar os genótipos circulantes nesta população. O estudo foi conduzido em 394 pacientes que estavam em tratamento nos centros de hemodiálise do Estado do Tocantins, de outubro de 2014 a fevereiro de 2015. Os pacientes foram entrevistados sobre características sociodemográficas e fatores de risco para a infecção pelo HCV e amostras de sangue foram coletadas. Todas as amostras foram testadas para detecção de anticorpos específicos (antiHCV), por meio do ensaio imunoenzimático (ELISA). As amostras anti-HCV reagentes foram submetidas à detecção do RNA viral pela reação em cadeia pela polimerase por transcrição reversa (RT-PCR) e genotipadas pelo método line probe assay (LiPA). A prevalência da infecção pelo HCV em pacientes em tratamento hemodialítico foi de 2,8% (IC 95%: 1,47-5,09). O RNA viral foi detectado em duas, das 11 amostras anti-HCV positivas, e identificado o genótipo 1, subtipo 1a nestas amostras. O tempo de tratamento dos pacientes soropositivos foi em média 105,91 meses, e dos negativos de 61,23 meses. Na análise univariada, antecedentes de prisão e história de infecções sexualmente transmissíveis (IST) foram estatisticamente associados à infecção pelo HCV. Após análise multivariada, somente IST permaneceu associada. Os resultados deste estudo mostraram uma redução significativa da infecção pelo HCV nos centros de hemodiálise do Estado do Tocantins, mas a prevalência encontrada (2,8%) é quase o dobro da verificada na população geral do Brasil (1,38%). Portanto, estratégias de controle e prevenção da hepatite C em pacientes em hemodiálise são importantes para prevenir essa infecção dentro do ambiente dialítico.
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Pesquisa da infecção oculta pelo vírus da hepatite B e avaliação da resposta vacinal em pacientes com diabetes mellitus tipo II em Goiânia-Goiás / Search for hidden hepatitis B virus infection and evaluation of the vaccine response in patients with type II diabetes mellitus shows in Goiânia-Goiás

Pimentel, Kamilla Nogueira 27 September 2016 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-12-07T17:53:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Nogueira Pimentel - 2016.pdf: 2443751 bytes, checksum: ca63d8c5718f805e8ab1913299696b99 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-12-08T10:35:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Nogueira Pimentel - 2016.pdf: 2443751 bytes, checksum: ca63d8c5718f805e8ab1913299696b99 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-08T10:35:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Kamilla Nogueira Pimentel - 2016.pdf: 2443751 bytes, checksum: ca63d8c5718f805e8ab1913299696b99 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-09-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The hepatitis B virus infection (HBV) and diabetes mellitus type II represent serious public health problems and, the synergism between these two diseases, can affect the prognosis of the patients with increased risk of developing chronic liver disease, cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The aims of the present study were to investigate the HBV occult infection and to evaluate the vaccine response in patients with diabetes mellitus type II, in Goiânia-Goiás. This study is part of the research "Investigation of the serological, epidemiological and molecular profile of the hepatitis B virus infection in patients with diabetes mellitus type 2 in Goiânia-Goiás" which was developed in five public health units Goiânia. After serologic screening of the population (n = 605), 108 anti-HBc positive patients/HBsAg negative were selected for the HBV-DNA research. For this, after extraction of viral genome, a semi-nested PCR was performed with primers complementary to region pre-S/S of HBV. Among the patients recruited in the units of the Family Health Program (N = 215) those susceptible to HBV infection (N = 172) were selected and invited to participate of the cohort about vacinal response. Thus, 128, 99 and 87 individuals agreed to receive the first, second, and third doses of recombinant vaccine Butang®, respectively. The subjects who received three doses of the vaccine and who agreed to participate in a new blood collection (N = 69) were evaluated for the quantitative detection of anti-HBs marker by enzyme-linked immunosorbent assay microparticle (MEIA) using the AxSYM system automation and AxSYM kits AUSAB (Brazil Abbot Laboratories). It was not found occult HBV infection in diabetic patients in Goiânia- Goiás, which is similar to that found in other population groups in Brazil. In relation to the vaccine response, of the 69 samples analyzed, was observed that 53.6% of patients were able to respond to vaccination, and the geometric mean of anti-HBs titres was 13.76 mIU/mL. The seroprotection rate found in diabetic patients in Goiânia- GO was considered low compared to the healthy adult population. Thus, the data obtained in this study may help in the planning of specific prevention actions of hepatitis B in a population that usually have comorbidities. / A infecção pelo vírus da hepatite B (HBV) e a diabetes mellitus tipo II representam sérios agravos de saúde pública e, quando associadas, podem piorar o prognóstico do paciente, com maior risco de desenvolvimento de doença hepática crônica, cirrose e carcinoma hepatocelular. Os objetivos deste estudo foram investigar o índice de infecção oculta pelo HBV e avaliar a resposta vacinal em pacientes com diabetes mellitus tipo II, em Goiânia-Goiás. Este estudo é parte do projeto intitulado “Investigação do perfil sorológico, epidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite B em pacientes com diabetes mellitus tipo 2 em Goiânia-Goiás” desenvolvido em cinco unidades de saúde pública de Goiânia. Assim, após a triagem sorológica da população (n=605), foram selecionados 108 pacientes anti-HBc positivos/HBsAg negativos para a pesquisa do HBV-DNA. Para isso, após a extração do genoma viral, foi realizada uma semi-nested PCR utilizando primers complementares à região Pré-S/S do HBV. Para a avaliação da resposta vacinal, foram selecionados os pacientes atendidos nas unidades do Programa de Saúde da Família (N=215), sendo aqueles suscetíveis à infecção pelo HBV (N=158) convidados a fazer parte da coorte. Assim, 128, 99 e 87 indivíduos aceitaram receber a primeira, segunda e terceira doses da vacina recombinante Butang®, respectivamente. Os indivíduos que receberam as três doses da vacina e que aceitaram participar de uma nova coleta sanguínea (N=69) foram avaliados para a detecção quantitativa do marcador anti-HBs pelo ensaio imunoenzimático de micropartícula (MEIA), utilizando o Sistema AxSYM de automação e kits AxSYM AUSAB (Abbot Laboratórios do Brasil). Não foi detectada infecção oculta pelo HBV nos pacientes diabéticos de Goiânia-GO, sendo este resultado semelhante ao encontrado em outros grupos populacionais do Brasil. Em relação à resposta vacinal, das 69 amostras analisadas, 53,6% de pacientes foram capazes de responder à vacinação, sendo que a média geométrica de títulos de anti-HBs foi de 13,76 mUI/mL. A taxa de soroproteção encontrada nos pacientes diabéticos em GoiâniaGO foi considerada baixa se comparada à população adulta saudável. Dessa forma, os dados deste estudo servirão como base para o planejamento de ações específicas de prevenção da hepatite B em uma população que, geralmente, já apresenta comorbidades associadas.
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Prevalência de tipos específicos de HPV e anormalidades citológicas em mulheres quilombolas / Prevalence of specific HPV types and cytological abnormalities in maroon women

Batista, José Eduardo 23 October 2014 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-18T12:08:31Z No. of bitstreams: 2 Tese - José Eduardo Batista - 2014.pdf: 4845418 bytes, checksum: 4e199986cf3802d6ecf319c604412503 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-18T12:33:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - José Eduardo Batista - 2014.pdf: 4845418 bytes, checksum: 4e199986cf3802d6ecf319c604412503 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-18T12:33:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - José Eduardo Batista - 2014.pdf: 4845418 bytes, checksum: 4e199986cf3802d6ecf319c604412503 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-10-23 / Introduction: Genital infection by human papillomavirus (HPV) is considered the most common sexually transmitted infection in several countries. The prevalence of HPV genotypes in women with or without cytological abnormalities may vary according to the studied population and the region. Objective: To detect and identify specific HPV types correlating with sociodemographic/behavioral characteristics and cytological abnormalities present in cervical smears of Maroon women. Methods: This cross-sectional study included 353 maroon women users of the unified health System of the municipalities of Maranhão for screening of cervical cancer. The samples were analyzed for the presence of cytological abnormalities by conventional methods and tested for 37 HPV genotypes by polymerase chain reaction (PCR) with primers PGMY09/11 followed by reverse line blot hybridization performed with the Linear Array HPV Genotyping Test kit by Roche Molecular System®. The association of HPV types and cytological diagnosis was investigated according to the different age groups. Results: HPV infection was detected in 13% (46/353) of the cases. Infection types with high-risk HPV were more frequent (78,3 %, 36/46) than for low-risk HPV (21,7 %, 10/46). Genotypes 68 (24,2 % - 11 /46), 58 (19,8% - 9/46), 52 and 31 (10,8% - 5/46 each), and 62 (8,8% 4/46) were the most prevalent. Only 6,6% (3/46) of the cases were positive for HPV 61. The genotypes 73, 70, 54, 53, 45, IS39 and 18, individually represented 4,4% (2/46) of all cases. The CP6 -108, 84, 72, 71, 66, 59, 56, 55, 51, 39, 33 and 16 genotypes individually represented 2,2% (1/46) of the cases. In women without cytological abnormalities, viral infections, both simple and multiple, were detected in 10,7%(35/328) of the cases. For those diagnosed with an abnormality, the prevalence of HPV infection was 24,0% (1 /46), being higher in high grade squamous intraepithelial lesion (HSIL-75,0 %), followed by atypical squamous cells cannot exclude high-grade squamous intraepithelial lesions (ASC-H, 50%), low grade squamous intraepithelial lesions (LSIL-33,4 %) and atypical squamous cells of undetermined significance (ASC-US, 14,3%). The analysis showed a statistically significant association between HPV infection and the detection of cytologic abnormalities in the age groups between 31-40 years (OR = 7.40, 95 % CI :1.07 -51 ,19 , p = 0.03) and 51 to 60 years (OR = 20.4 , 95 % CI : 1.12 to 704.69, p = 0.03). None of the behavioral variables showed significant association with HPV infection, however the presence of this infection was positively associated with detection of cytologic abnormalities (OR=6,57: IC:2,772-15,606), p=0,001. Conclusion: It is possible that the results of this study are due to characteristics of the study population, geographically isolated, with conservative habits and sexual intercourse only between members of the Quilombo. This study with Maroon women allowed us to delineate the epidemiology of this HPV infection in populations living in Maranhão. / Introdução: A infecção do trato genital pelo Papilomavírus humano (HPV) é considerada a infecção sexualmente transmissível (IST) mais comum em diversos países. A prevalência dos genótipos do HPV em mulheres com ou sem anormalidades citológicas pode variar de acordo com a população e a região estudada. Objetivos: Detectar e identificar os tipos específicos de HPV e relacionar com características sociodemográficas/comportamentais e anormalidades citológicas presentes em esfregaços cervicais de mulheres quilombolas do Maranhão. Metodologia: Este estudo de corte transversal incluiu 353 mulheres quilombolas usuárias do Sistema Único de Saúde dos municípios do Maranhão para rastreamento do câncer do colo uterino. As amostras foram analisadas quanto à presença de anormalidades citológicas pelo método convencional e testadas para 37 genótipos de HPV por reação em cadeia da polimerase (PCR) com os iniciadores PGMY09/11, seguida de hibridização reversa em linhas através do Kit Linear Array HPV Genotyping Test (Roche Molecular System)®. A associação dos tipos de HPV e o diagnóstico citológico foi investigada de acordo com as diferentes faixas etárias. Resultados: A infecção pelo HPV foi detectada em 13% (46/353) das mulheres incluídas. Infecções por tipos de HPV de alto risco foram mais frequentes (78,3%; 36/46) do que por HPV de baixo risco (21,7%; 10/46). Os genótipos 68 (24,2% - 11/46); 58 (19,8% - 9/46); 52 e 31 (10,8% - 5/46 cada) e 62 (8,8% - 4/46) foram os mais prevalentes. Apenas 6,6% (3/46) dos casos foram positivos para o HPV 61. Os genótipos 73, 70, 54, 53, 45, IS39 e 18 representaram individualmente 4,4% (2/46) do total de casos. Os genótipos CP6-108, 84, 72, 71, 66, 59, 56, 55, 51, 39, 33, e 16 representaram individualmente 2,2% (1/46) do total de casos. Em mulheres que não apresentaram anormalidades citológicas, infecções virais, tanto simples quanto múltiplas, foram detectadas em 10,7%(35/328) dos casos. Considerando mulheres com diagnóstico de anormalidade citológica, a prevalência de infecção por HPV foi de 24,0% (11/46), sendo maior nos casos de lesão intraepitelial escamosa de alto grau (high grade squamous intaepithelial lesion)-HSIL-75,0%), seguida por mulheres com diagnóstico de células escamosas atípicas não podendo excluir alto grau (Atypical squamous cells cannot exclude high-grade squamous intraepithelial lesions) ASC-H- 50%), com lesão intraepitelial escamosa de baixo grau (low grade squamous intraepithelial lesion) LSIL- 33,4%) e com diagnóstico de células escamosas atípicas de significado indeterminado (atypical squamous cells of undetermined significance ASC-US (14,3%). Houve uma associação estatisticamente significativa entre a infecção por HPV e a detecção de anormalidades citológicas nas faixas etárias de 31 a 40 anos (OR = 7,40; 95% CI:1,07–51,19, p=0,03) e 51 a 60 anos (OR=20,4, 95%CI: 1,12-704,69; p = 0,03). Nenhuma das variáveis comportamentais analisadas mostrou associação significante com a infecção por HPV, contudo a presença desta infecção foi positivamente associada à detecção de anormalidades citológicas (OR=6,57: IC:2,772-15.606), p=0,001. Conclusão: É possível que os resultados deste estudo se devam às características da população estudada: isolada geograficamente, com hábitos conservadores e relações sexuais apenas entre membros do quilombo. Este estudo em mulheres quilombolas permitiu delinear a epidemiologia desta infecção por HPV em populações residentes no Maranhão.
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Caracterização fenotípica e molecular de Acinetobacter baumannii isolados de pacientes de UTIs de Goiânia, com relação à capacidade de formar biofilmes e resistência aos carbapenêmicos. / Phenotypic and molecular characterization of Acinetobacter baumannii isolated from ICU patients in Goiânia, with respect to the ability to form biofilms and carbapenem resistance.

Castilho, Suellen Rocha Araújo 21 February 2013 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2016-08-22T17:02:49Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Suellen Rocha Araújo Castilho - 2016.pdf: 2584243 bytes, checksum: b73318ec0bcbfffa7eb7b840a656cda0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2016-08-22T17:05:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Suellen Rocha Araújo Castilho - 2016.pdf: 2584243 bytes, checksum: b73318ec0bcbfffa7eb7b840a656cda0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-22T17:05:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Suellen Rocha Araújo Castilho - 2016.pdf: 2584243 bytes, checksum: b73318ec0bcbfffa7eb7b840a656cda0 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The species Acinetobacter baumannii is the most important representative of the genus, being globally considered the pathogen of larger relevance, within the complex A. baumannii – A. calcoaceticus, to healthcare institutions worldwide. Its clinical significance has increased in recent years partly due to its notable capacity of adherence to surfaces due to presence of structures such as pili, production of EPS (exopolysaccharides) and presence of genes that favor biofilm formation, providing larger adhesion between the cells and consequent resistance to the antimicrobials. Another important characteristic is its capacity to regulate or to acquire antibiotic resistance, specifically through oxacilinases, encoded by the gene OXA, that presents potent hydrolytic activity against penicilinase-resistant penicillins. Until the moment, 250 types of OXA were already described. The expression of OXA genes can be increased in the presence of the insertion element ISAba1, which when located upstream of the gene, confer a selective advantage for the isolate when this depends on the efficient expression of a variety of resistance genes. In its absence, the resistance is usually expressed in the presence of two or more OXA genes. The capacity of biofilm formation and the presence of the genes blaPER-1, OXA-23, OXA-40, OXA- 51, OXA-58 and ISAba1 were investigated among 84 isolates from 64 patients of the Intensive Care Units of Goiânia. It was observed that 78.5% of the isolates formed biofilm, of which 23% presented the gene blaPER-1. The presence of OXA-51 gene was detected in all isolates, whereas 64.3% of the isolates had the OXA-23 gene and 24.0% of the isolates had the OXA-58 gene. The ISAba1 gene was detected upstream of the OXA-51, OXA-23 and OXA-58 genes in 33.3% (28/84), 92.6% (50/54) and 10.0% (2/20) of the isolates, respectively. None of the isolates studied presented the gene OXA-40. Of the 62 isolates resistant to imipenem and meropenem, 76.0% possessed the OXA-23 gene while 24.2% of the isolates possessed the OXA-58 gene. Of these isolates, 79.0% (49/62) presented the gene ISAba1. In the present study, the blaPER-1 gene presence was not associated with the biofilm formation, while the presence of OXA genes was related to resistance in Acinetobacter baumannii. / A espécie Acinetobacter baumannii é a representante mais importante do gênero, sendo considerado o patógeno de maior relevância, dentro do complexo A. baumannii – A. calcoaceticus, para as instituições de saúde mundialmente. Sua importância clínica tem aumentado nos últimos anos em parte devido a sua notável capacidade de aderência a superfícies devido a presença de estruturas como pili, produção de EPS (exopolissacarídeo) e presença de genes que favorecem a formação de biofilme, proporcionando maior adesão entre as células e consequente resistência aos antimicrobianos. Outro destaque é sua capacidade de regular ou adquirir resistência, em particular por meio das oxacilinases, codificadas pelo gene OXA, que apresentam atividade hidrolítica potente contra penicilinas resistentes às penicilinases. Até o momento, 250 tipos de OXA já foram descritas. A expressão de genes OXA pode ser aumentada na presença do elemento de inserção ISAba1, localizado à montante do gene, conferindo uma vantagem seletiva para o isolado quando este depende da expressão eficiente de uma variedade de genes de resistência a antibióticos. Na sua ausência, a resistência geralmente é expressa na presença de dois ou mais genes OXA. A capacidade de formar biofilme e a presença dos genes blaPER-1, OXA-23, OXA-40, OXA-51, OXA-58 e ISAba1 foram investigados em 84 isolados provenientes de 64 pacientes de UTIs de Goiânia. Observou-se que 78,5% dos isolados formaram biofilme, dos quais 23% apresentaram o gene blaPER-1. A presença do gene OXA-51 foi detectada em todos os isolados, enquanto que 64,3% dos isolados apresentavam o gene OXA-23, e em 24% dos isolados foi encontrado o gene OXA-58. O gene ISAba1 foi detectado à montante dos genes OXA-51, OXA-23 e OXA-58, em 33,3% (28/84), 92,6% (50/54) e 10% (2/20) dos isolados, respectivamente. Nenhum isolado estudado apresentou o gene OXA-40. Dos 62 isolados resistentes ao imipenem e meropenem, 76% dos isolados possuíam o gene OXA-23 enquanto que 24,2% possuíam o gene OXA-58. Dentre estes isolados, 79% (49/62) apresentaram a sequência de inserção ISAba1. No presente estudo, a presença do gene blaPER-1 não foi associada com a formação de biofilmes, enquanto que a presença de genes OXA estava relacionada à resistência em Acinetobacter baumannii.
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Produção e caracterização de celulases e xilanases produzidas por Streptomyces thermocerradoensis I3 em fermentação semi-sólida / Production and characterization of cellulases and xylanases produced by Streptomyces thermocerradoensis I3 in semi-solid fermentation

Gama, Aline Rodrigues 14 September 2016 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-10-06T10:55:44Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Aline Rodrigues Gama - 2016.pdf: 2281415 bytes, checksum: a79af0203dd2a1cfd381c59e3e9d6d7b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-10-06T11:22:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Aline Rodrigues Gama - 2016.pdf: 2281415 bytes, checksum: a79af0203dd2a1cfd381c59e3e9d6d7b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T11:22:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Aline Rodrigues Gama - 2016.pdf: 2281415 bytes, checksum: a79af0203dd2a1cfd381c59e3e9d6d7b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-09-14 / The use of carbohydrates derived from agricultural waste is important in the industry of food, textiles, paper, detergents, animal feed and in the production of bioethanol. Some filamentous bacteria are used in the enzymatic degradation processes, such as Streptomyces thermocerradoensis I3, which was isolated from soil and this work was selected for the production of cellulases and xylanases by growing in semi-solid fermentation (SSF) in medium supplemented with wheat bran (WB) as carbon source. S. thermocerradoensis I3 it was maintained for 4 days at 37 ° C and showed a higher production of Endoglucanase (2,92 U/mL) and Xylanase (12,34 U/mL) after 72 hours of cultivation and β-glucosidase (0,023 U/mL) and FPase (2,82 U/mL) after 96 hours of cultivation. The 96-hour extract was concentrated. The enzyme present in the concentrated extract presented molecular mass of 17 kDa. It showed activity for cellulase and xylanases confirmed by zimograms and enzymatic activities. The crude extract (EB) and the concentrated extract (EC) were analyzed for pH and temperature optima for activity of cellulases and xylanases. The results showed that the highest activity of the total cellulase (FPase) was at pH 6.0 at 60 °C (EB) and pH in the range 3.0 to 6.0 at 80 °C (EC); the endoglucanase has higher activity at pH 6.0 at 55 °C (EB and EC); xylanase showed higher activity at pH 8.0 at 70 °C (EB and EC). The xylanase activity of EB and EC showed thermostability 60% after 2 hours of incubation at 60 °C and the endoglucanase activity of EB and EC remained above 50% after 4 hours of incubation at 50 °C, 60 °C and 70 °C. Qualitative analysis observed by TLC (Thin layer chromatography) showed the production of oligosaccharides and xilooligômeros from the hydrolysis of different substrates. S. thermocerradoensis I3 successfully used the WB in SSF producing enzymes that have the characteristics necessary for their industrial application. / A utilização de carboidratos oriundos dos resíduos agrícolas faz-se importante nas indústrias de alimentos, tecidos, papeis, detergentes, ração animal e ainda na produção de bioetanol. Algumas bactérias filamentosas são utilizadas nos processos de hidrólise enzimática, como Streptomyces thermocerradoensis I3, o qual foi isolado do solo e, neste trabalho, selecionado para produção de celulases e xilanases através de cultivo em fermentação semi-sólida (FSS) em Meio Mínimo suplementado com farelo de trigo (FT) como fonte de carbono. S. thermocerradoensis I3 foi cultivado por 4 dias à 37 °C e apresentou maior produção de Endoglucanase (2,92 U/mL) e Xilanase (12,34 U/mL) após 72 horas de cultivo e de β-glicosidase (0,023 U/mL) e FPase (2,82 U/mL) após 96 horas de cultivo. O extrato de 96 horas foi concentrado e a enzima presente no extrato concentrado apresentou Massa Molecular de 17 kDa. Ela apresentou atividade de celulase e xilanase, as quais foram confirmadas por zimogramas e determinação das atividades enzimáticas. O extrato bruto (EB) e o extrato concentrado (EC) foram analisados quanto ao pH e temperatura ótimos para a atividade de celulases e xilanase. Os resultados obtidos demonstraram que a maior atividade de celulases totais (FPase) foi em pH 6,0 à 60 °C (EB) e pH na faixa de 3,0 e 6,0 à 80 °C (EC); a enduglucanase apresentou maior atividade na faixa de pH 6,0 à 55 °C (EB e EC); a xilanase apresentou maior atividade em pH 8,0 à 70 °C (EB e EC). A atividade de xilanase do EB e da EC apresentou termoestabilidade de 60% após 2 horas de incubação à 60 °C e a atividade de endoglucanase do EB e do EC permaneceu acima de 50% após 4 horas de incubação à 50, 60 e 70 °C. As análises qualitativas observadas por TLC (Thin Layer Chromatography) revelaram a liberação de oligossacarídeos e xilooligômeros a partir da hidrólise de diferentes substratos. S. thermocerradoensis I3 utilizou com sucesso o FT em FSS produzindo enzimas que apresentam as características necessárias para sua aplicação industrial.
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Estudo epidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da Hepatite C em indivíduos infectados pelo vírus da Imunodeficiência Humana em Goiânia-Goiás / Epidemiological and molecular study of Hepatitis C virus infection in individuals infected with the Human Immunodeficiency virus in Goiânia-Goiás

Del-Rios, Nativa Helena Alves 30 March 2011 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-04-27T18:05:38Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2011.pdf: 2685862 bytes, checksum: a88d60dfeef4b6b920f7a23cc00881a3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Rejected by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com), reason: on 2017-04-27T18:05:52Z (GMT) / Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-04-27T18:06:12Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2011.pdf: 2685862 bytes, checksum: a88d60dfeef4b6b920f7a23cc00881a3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-03T11:47:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Nativa Helena Alves Del-Rios - 2011.pdf: 2685862 bytes, checksum: a88d60dfeef4b6b920f7a23cc00881a3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-03T11:47:33Z (GMT). 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This study aimed to investigate the epidemiology and molecular profile HCV infection in HIV-infected individuals with no prior antiretroviral therapy, seen in the referral hospital for the treatment of infectious diseases (Hospital for Tropical Diseases - Anuar Auad / HDT) in Goiania, Goiás. A total of 505 treatment naïve individuals and were referred to the HDT, from April 2009 to April 2010 were interviewed and underwent blood collection. All sera were tested for antibodies to HCV (anti-HCV) and for HCV RNA by polymerase chain reaction (PCR). Genotyping was performed by reverse hybridization by the Line Probe Assay (LiPA) method. The prevalence of anti-HCV was 4.6% (95% CI: 3.0 to 6.8). The viral RNA was detected in 65.2% (15/23) of anti-HCV positive samples. The genotypes identified were 1 (subtypes 1a and 1b) and 3 (subtype 3a). The age > 40 years, living in other states or Goiania city, surgery, injecting and non-injecting drug and anti-HBc positive (antibody to core antigen of hepatitis B virus) were associated with HCV infection after logistic regression. The data presented shows the vulnerability of the HIV sropositive population to acquisition of infectious diseases such as HCV infection. Thus, the information obtained will be essential for planning public health interventions, preventing and control of hepatitis C in this population. / Os vírus da hepatite C (HCV) e da imunodeficiência humana (HIV) causam infecções crônicas no hospedeiro. O advento da terapia antiretroviral potente trouxe uma redução da incidência de infecções oportunistas, e consequentemente, uma maior expectativa de vida aos pacientes HIV soropositivos. No entanto, as hepatopatias surgem como uma das principais causas de morbimortalidade entre esses pacientes, principalmente aquelas relacionadas ao vírus C. A coinfecção HCV/HIV induz a um pior prognóstico de ambas as infecções, podendo levar ao desenvolvimento da Aids, evolução mais rápida para hepatite crônica ativa e/ou cirrose hepática e morte. Este estudo teve como objetivo investigar o perfil epidemiológico e molecular da infecção pelo HCV em indivíduos infectados pelo HIV, sem tratamento antiretroviral prévio, atendidos no Hospital de referência para o tratamento de doenças infecciosas (Hospital de Doenças Tropicais - Anuar Auad / HDT) em Goiânia, Goiás. Um total de 505 indivíduos, virgens de tratamento, encaminhados ao HDT, no período de abril/2009 a abril/2010, foram entrevistados e submetidos à coleta de sangue. As amostras (soros) foram testadas para a detecção de anticorpos para o HCV (ELISA/LIA) e submetidas à identificação do RNA-HCV pela reação em cadeia da polimerase (PCR). A genotipagem foi realizada por hibridização reversa, pelo método Line Probe Assay (LiPA). A prevalência para anti-HCV foi de 4,6% (IC 95%: 3,0-6,8). O RNA viral foi detectado em 15 amostras, sendo todas elas anti-HCV positivas. Foram identificados os genótipos 1 e 3, com predomínio do subtipo 1a, seguido dos subtipos 1b e 3a. As variáveis idade superior a 40 anos, ser procedente de Goiânia ou outros estados, cirurgia, uso de drogas injetáveis e não-injetáveis, história de prisão e positividade ao anti-HBc foram associados à infecção pelo vírus da hepatite C, após regressão logística. Os dados apresentados revelam a vulnerabilidade da população HIV soropositiva à aquisição de doenças infecciosas como a infecção pelo HCV. Assim, as informações obtidas serão essenciais para o planejamento de ações de saúde pública para a prevenção e controle da hepatite C nessa população.

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