Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-12-18T13:25:28Z No. of bitstreams: 1 Roberta Rocha Ferreira.pdf: 3077956 bytes, checksum: 0c56b291570f1a18e2eadbd875ae0b1f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T13:25:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roberta Rocha Ferreira.pdf: 3077956 bytes, checksum: 0c56b291570f1a18e2eadbd875ae0b1f (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / In this study was accomplished the identification of cytoplasmic types and genotyping of Ms locus in 59 onion genotypes of the Embrapa germplasm collection, as well as association of molecular observations with pollen viability tests, aiming to reduce time for identification of male-sterile lines („A‟) and their maintainers („B‟), for the development of hybrids adapted to the edafoclimatic conditions of the São Francisco Valley. 5‟cob/orfA501 and orf725 markers were used for cytoplasmic identification, whereas AcSKP1 and AcPMS1 for genotyping of Ms. The pollen viability was estimated with acetocarmine 2%, Alexander‟s staining and in vitro germination. In the molecular identification two types of male-sterile cytoplasmic („S‟ and „T‟), as well as fertile cytoplasmic („N‟) and Ms and ms alleles, both in homozygosity and heterozygosity, were identified in the evaluated genotypes. The frequencies with 5‟cob/orfA501 and orf725 and AcSKP1 and AcPMS1 markers were approximate the evaluated accessions. For Brazilian germplasm, the cytoplasmic frequencies of „N‟, „S‟ and „T‟ were approximately 0,47, 0,28 e 0,25, respectively, while the allelic frequencies were 0,52 and 0,48 for Ms and ms, respectively. The accessions Régia, EHCEB 20146, EHCEB 201427, Alvorada, Serrana, Crioula Mercosul, EHCEB 20142, BRS 367, Rainha, Juporanga and Alfa SF C-XI exhibit potential for identification of „A‟ and „B‟ lines because show mixtures of type of cytoplasmic and different Ms allelic frequencies. The accessions EHCEB 20142040/EHCEB 20141040, EHCEB 20142028/EHCEB 20141028, EHCEB 20112006/EHCEB 20111006, EHCEB 20142027/EHCEB 20141027, EHCEB 20102019/EHCEB 20101019 and Alfa SF „B‟/Alfa SF „A‟ presented all evaluated plants in the Nmsms and Smsms or Tmsms conditions. Molecular selection and pollen viability tests showed complete agreement for Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms), BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms), Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20102017 and EHCEB 20142027. For Alfa SF (Tmsms), EHCEB 20142028 (Nmsms), EHCEB 20141028 (Smsms), EHCEB 20141027 (Tmsms) and EHCEB 20141017 (Tmsms) there was no validation of molecular selection by pollen viability tests for some plants. The pollen viability evaluation methods did not present sterile and fertile classification agreement for the accessions EHCEB 20142028, EHCEB 20141028, EHCEB 20141027 and EHCEB 20141017. Six pairs of „A‟ and „B‟ lines identified in the present study, Alfa SF (Tmsms ) x Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms) x BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms) x Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20142027 (Nmsms) x EHCEB 20141027 (Tmsms), EHCEB 20102017 (Nmsms) x EHCEB 20141017 (Tmsms) and EHCEB 20142028 (Nmsms) x EHCEB 20141028 (Smsms) demonstrated potential for the development of hybrids. / No presente trabalho foi realizado a identificação dos tipos citoplasmáticos e a genotipagem do locus Ms presentes em 59 genótipos de cebola do banco de germoplasma da Embrapa, bem como associação das observações moleculares de genótipos com testes de viabilidade polínica, visando diminuir o tempo na identificação de linhas macho-estéreis („A‟) e de suas mantenedoras („B‟), para o desenvolvimento de híbridos adaptados às condições edafoclimáticas do Vale do São Francisco. Os marcadores 5‟cob/orfA501 e orf725 foram usados para identificação de citoplasma, enquanto os marcadores AcSKP1 e AcPMS1 para genotipagem do locus Ms. A viabilidade polínica foi estimada com carmim acético 2%, solução de Alexander e germinação in vitro. Na identificação molecular os dois tipos de citoplasma macho-estéreis („S‟ e „T‟), bem como o citoplasma fértil („N‟), assim como os alelos Ms e ms, tanto em homozigose como em heterozigose foram, detectados nos 59 genótipos avaliados. As frequências com os marcadores 5‟cob/orfA501 e orf725, bem como com os marcadores AcSKP1 e AcPMS1, foram aproximadas nos acessos de cebola avaliados. No germoplasma brasileiro, as frequências dos citoplasmas „N‟, „S‟ e „T‟ foram de 0,47, 0,28 e 0,25, respectivamente, enquanto as frequências alélicas foram de 0,52 e 0,48 para Ms e ms, respectivamente. Os acessos Régia, EHCEB 20146, EHCEB 201427, Alvorada, Serrana, Crioula Mercosul, EHCEB 20142, BRS 367, Rainha, Juporanga e Alfa SF C-XI tem potencial para identificação de linhas „A‟ e „B‟, pois apresentaram misturas para tipo de citoplasma e diferentes frequências alélicas para Ms. Os acessos EHCEB 20142040/EHCEB 20141040, EHCEB 20142028/EHCEB20141028 e EHCEB 20112006/EHCEB20111006, EHCEB 20142027/EHCEB 20141027, EHCEB 20102019/EHCEB 20101019 e Alfa SF „B‟/Alfa SF „A‟ apresentaram todas as plantas avaliadas na condição Nmsms e Smsms ou Tmsms. A seleção molecular e testes de viabilidade polínica apresentaram completa concordância para as linhagens Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms), BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms), Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20102017 e EHCEB 20142027. Para Alfa SF (Tmsms), EHCEB 20142028 (Nmsms), EHCEB 20141028 (Smsms), EHCEB 20141027 (Tmsms) e EHCEB 20141017 (Tmsms) não houve validação da seleção molecular pelos de testes de viabilidade polínica para algumas plantas. Os métodos de avaliação da viabilidade polínica não apresentaram concordância de classificação estéril e fértil para os acessos EHCEB 20142028, EHCEB 20141028, EHCEB 20141027 e EHCEB 20141017. Seis pares de linhas „A‟ e „B‟ identificados no presente estudo, Alfa SF (Tmsms) x Alfa SF (Nmsms), BRS 367 (Tmsms) x BRS 367 (Nmsms), Cascuda T7 (Nmsms) x Cascuda T5 (Smsms), EHCEB 20142027 (Nmsms) x EHCEB 20141027 (Tmsms), EHCEB 20102017 (Nmsms) x EHCEB 20141017 (Tmsms) e EHCEB 20142028 (Nmsms) x EHCEB 20141028 (Smsms), apresentam potencial para o desenvolvimento de híbridos.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-05-10T12:49:09Z No. of bitstreams: 1 Antonio Guedes Correa Gondim Filho.pdf: 1055026 bytes, checksum: b26290e72dd1ee5f07323536bbed0dcb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-10T12:49:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antonio Guedes Correa Gondim Filho.pdf: 1055026 bytes, checksum: b26290e72dd1ee5f07323536bbed0dcb (MD5) Previous issue date: 2018-02-08 / The nutritional value of ten genotypes of forage peanut (Arachis pintoi): 13251, 15121, 15598, 30333, 31135, 31496, 31534, 31828, Itabela and RIO were evaluated. The statistical design used was a randomized block design with ten treatments (genotypes) and three replicates. At the CEPLAC Zootecnia station, in Itabela-BA, they were cultivated and harvested in two seasons (dry period, with lower rainfall, and rainy season, referring to the period with higher rainfall). The dry matter production (kg / ha), the production of green matter (kg / ha), crude protein, neutral detergent fiber, acid detergent fiber, insoluble protein of acid detergent from crude protein (% PB), insoluble protein of acid detergent from dry matter (% DM) and accumulated gas production adjusted to the Gompertz, Logistic, Brody, Von Bertalanffy and Bicompartmental Logistic models and evaluated by R², QMR, AIC and BIC were evaluated. The multivariable analysis used was the analysis of clusters with cophenetic correlation coefficient and the Rand index to verify the quality of adjustments and the number of groups. In the period of greatest rainfall, genotypes 15121, 15598, 30333 and 31496 stood out as the ones with best productivity and nutritional value. In the period of lower precipitation, genotypes 31828 and Itabela stood out as the best genotypes for feeding ruminants. The best model adjusted for both genotypes was the Logistic Bicomportamental model because it presented lower AIC and BIC. Therefore, it has superior adjustment and should be used to describe cumulative curves of gases in forage peanut (Arachis pintoi). / Foram avaliados o valor nutricional de dez genótipos de amendoim forrageiro (Arachis pintoi): 13251, 15121, 15598, 30333, 31135, 31496, 31534, 31828, Itabela e RIO. O delineamento estatístico utilizado foi o de blocos ao acaso com dez tratamentos (genótipos) e três repetições. Na estação de Zootecnia do Extremo Sul (ESSUL) da CEPLAC, em Itabela-BA e foram cultivados e colhidos e em duas épocas (período seco, ou seja, com menor precipitação e período chuvoso, referente ao período com maior precipitação). Avaliou-se: a produção de matéria seca (kg/ha); a produção de matéria verde (kg/ha); os teores de proteína bruta (PB), fibra em detergente neutro, fibra em detergente ácido e proteína insolúvel em detergente ácido (% PB e % MS); a produção acumulada de gases ajustados aos modelos de Gompertz, Logístico, Brody, Von Bertalanffy e o Logístico Bicompartimental. Os modelos foram avaliados em relação aos seguintes parâmetros: R², QMR, AIC e BIC. A análise multivariada utilizada foi a análise de agrupamentos com coeficiente de correlação cofenética e o índice de Rand para verificar a qualidade do ajuste e a quantidade de grupos. No período de maior precipitação pluviométrica os genótipos 15121, 15598, 30333 e 31496 foram considerados os de melhor produtividade e de valor nutricional. Já no período de menor precipitação os genótipos 31828 e Itabela se destacaram como os melhores genótipos para a alimentação de ruminantes. O melhor modelo ajustado para ambos os genótipos foi o modelo Logistico Bicomportamental por apresentar menor AIC e BIC. Portanto, esse modelo, por apresentar ajuste superior pode ser utilizado para descrição de curvas cumulativas de gases em amendoim forrageiro (Arachis pintoi).

Orientador: Laura Sterian Ward / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-05T09:20:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Granja_Fabiana_D.pdf: 1074428 bytes, checksum: 51c77bb7845f7a0a68c3b0af88316c7f (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: O desenvolvimento de métodos moleculares de rastreamento de indivíduos com risco de desenvolver câncer entre os portadores de nódulos na tiróide é uma questão urgente de Saúde Pública. O objetivo deste trabalho é analisar a utilidade do perfil genotípico de GSTP1, GSTO1 e p53 na identificação de risco para câncer de tiróide e na sua resposta terapêutica. Comparamos amostras de sangue periférico de 157 controles com 142 indivíduos com nódulos: 44 benignos (30 bócios e 14 adenomas foliculares- AF) e 98 malignos (77 carcinomas papilíferos- CP e 21 carcinomas foliculares- CF). Todos os pacientes foram tratados e seguidos de acordo com o mesmo protocolo. Os pacientes com câncer da tiróide apresentavam mais freqüentemente os polimorfismos de GSTP1 (câncer = 27.5% versus controle = 5.7% - p<0.0001) e os polimorfismos do códon 72 de p53 (câncer =12.2% versus controle =2% - p<0.001) do que na população controle. Não houve diferença entre pacientes e controles em relação ao perfil do gene GSTO. Estes genótipos variantes conferiram um aumento de risco para câncer de tiróide de mais de 7 vezes, tanto para GSTP1 (Odds ratio= 7.415; 95% CI: 2.472-22.243) como para o códon 72 de p53 (Odds ratio=7.023; 95% CI: 1.928-25.588). Os polimorfismos em GSTP1 e códon 72 p53 identificam câncer com sensibilidade de 75% e 80% e especificidade de 68% e 63%, respectivamente. Análise de regressão logística ajustada para sexo, idade e cor, mostra que estes polimorfismos de GSTP1 e p53, mas não os de GSTO1, são fatores independentes de risco para malignidade. Não houve correlação entre o perfil genotípico para qualquer gene e a resposta a terapia ou evolução dos pacientes com câncer. Sugerimos que o uso desses marcadores moleculares, combinado com as clássicas características clínico-epidemiológicas associadas à susceptibilidade ao câncer da tiróide, pode ser útil no rastreamento de malignidade entre os portadores de nódulos tiroidianos da população brasileira / Abstract: The development of screening tools designed to identify individuals at risk for thyroid odule cancer is of utmost necessity. The aim of the present research is to evaluate the utility of GSTP1, GSTO1 and p53 genotype profiles as markers of risk to thyroid cancer and its response to treatment. We compared peripheral blood samples from 157 controls to 144 patients with thyroid nodules: 44 benign (30 hyperplasias and 14 folicular adenomas - AF) and 98 malignant (77 papillary carcinomas - PC and 21 folicular carcinomas - FC). All patients were managed according to a standard protocol. Thyroid carcinoma patients presented more frequently GSTP1 (cancer = 27.5% versus controls = 5.7% - p<0.0001) and codon 72 of p53 (cancer =12.2% versus controls =2% - p<0.001) polymorphisms than the control population. There was no difference between cancer and controls regarding GSTO gene. These variant genotypes increased the risk for thyroid câncer more than 7 times for GSTP1 (Odds ratio= 7.415; 95% CI: 2.472-22.243) and codon 72 of p53 (Odds ratio=7.023; 95% CI: 1.928-25.588). GSTP1 and codon 72 p53 polymorphisms identify thyroid câncer with a sensitivity of 75% and 80% and specificity of 68% and 63%, respectively. Logistic regression analysis adjusted for gender, age and color demonstrated that GSTP1 and p53, but not GSTO1 polymorphisms are independent factors of risk for malignancy. There was no correlation between any genetic profile and the response to treatment or the outcome of cancer patients. Our data indicates that the use of these molecular markers, together with the classic clinico-epidemiologic features associated to thyroid cancer susceptibility may be useful in screening thyroid nodules malignancy in Brazilian population / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Dados de 111.101 pesos a desmama ajustado aos 205 dias de idade (PES205), 50.860 pesos ajustados aos 390 dias (PES390) e 47.462 ganhos de peso até 185 dias após a desmama (GP185) foram analisados para avaliar a interação genótipos-ambientes e estimar parâmetros de adaptabilidade para sete combinações genotípicas de bovinos cruzados para corte, criados em três diferentes ambientes do Brasil. A interação genótipos-ambientes foi fonte de variação significativa (P<0,01) para todas as características avaliadas. As decomposições das somas de quadrados das interações genótipos-ambientes, para cada variável estudada, foram realizadas pelo método de regressão. Foram verificados por meios dos coeficientes angulares que, para PES205, os animais de composição genotípica 7 foram considerados como de adaptabilidade ampla. Os genótipos 2, 3 e 6 foram considerados de adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e as composições genotípicas 1, 4 e 5 foram classificadas como de adaptabilidades específicas a ambientes desfavoráveis. Para PES390, os animais considerados como de adaptabilidade ampla foram os de composições genotípicas 1 e 3. Os de combinações genotípicas 2, 6 e 7 foram considerados de adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e os genótipos 4 e 5 foram classificados como animais com adaptabilidade específica a ambientes desfavoráveis. Para GP185, verificou-se que os animais considerados como de adaptabilidade ampla foram os de composição genotípica 4 e 5, enquanto que as combinações genotípicas 1, 2 e 3 foram considerados de adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e as composições genotípicas 6 e 7 foram classificados como de adaptabilidades específicas a ambientes desfavoráveis. / Data from 111,101 weaning weight adjusted to 205 days (WW), 50,860 yearling weight adjusted to 390 days (YW) and 47,462 weight gain from weaning to yearling (WG) were analyzed to evaluated the genotype-environmental interactions and estimates adaptability parameters for seven genotype combinations of crossbreed beef cattle, raised in three environment of the Brazil.. The genotypeenvironmental interation effect was significative (P<0.01) for all de traits analyzed. The sum squares decompositions of genotype-environmental interations, were accomplishment by regression method for each trait analyzed. Were verified, through the slopes of the regression lines that, for WW, the animals considered as wide adaptability were genotype composition 7. The genotype compositions 2, 3 and 6 were considered of specific adaptability for favorable environments, and genotype compositions 1, 4 and 5 were classified as combinations with specific adaptability for unfavorable environments. For YW, the animals considered as wide adaptability were genotypes compositions 1 and 3. The genotype compositions 2, 6 and 7 were considered of specific adaptability for favorable environments and genotype compositions 4 and 5 were classified as combinations with specific adaptability for unfavorable environments. For WG, the animals with genotype composition 4 and 5 were considered as wide adaptability, while the genotype compositions 1, 2 and 3 were considered of specific adaptability for favorable environments and genotype compositions 6 and 7 were classified as combinations with specific adaptability for unfavorable environments.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2017-12-04T17:19:14Z No. of bitstreams: 2 Jonatas_Marcolin_2017.pdf: 1529869 bytes, checksum: 182017133f5454db9f8fc1e8635e6663 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-04T17:19:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Jonatas_Marcolin_2017.pdf: 1529869 bytes, checksum: 182017133f5454db9f8fc1e8635e6663 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-28 / The objective of this work was to stratify the crop environments of west and central western Paraná, in order to complement the information obtained in each location, to evaluate the potential per se of the genitors, to demonstrate heterosis in hybrids and to obtain genetic control information for attributes related to productivity and maturation. Productivity and harvest moisture information of 16 commercial hybrids, conducted in DBC with two replicates, present in the Coodetec VCU trials in the seasons of 2014 and 2015, sown in the micro regions of Cascavel, Toledo, Foz do Iguaçu for representation of the West and in the microregion of Campo Mourão and in Mariluz, representing the Caiuá sandstone, for the representation of the central western Paraná, were used for environmental stratification, using the factor analysis methodology. For the study of heterosis, potential per se and genetic control, we selected 13 elite strains from the Coodetec breeding program, from which leaf discs were collected for genotyping with SNP molecular markers. The 78 hybrids, recorded in a half-diallel table, the 13 parents and 9 commercial hybrids were planted in Mariluz, Palotina and São Pedro do Iguaçu, in a 10x10 square lattice with three repetitions. Male and female blooms, crop moisture, yield and the weight of one thousand seeds were evaluated. For the grouping based on the dissimilarity matrix, the modified Tocher (sequential) method was used, and the methodologies of Gardner and Eberhart (1966) and Hayman (1954) were used for evaluation of the diallel. The environmental stratification showed that the municipalities of Cascavel, Palotina, Mariluz, Campo Mourão and São Pedro do Iguaçu are vital selections for yields, and Campo Mourão, Cascavel, Mariluz, Santa Terezinha do Itaipu, Palotina and São Pedro do Iguaçu for crop moisture. The cluster analysis formed three heterotic groups based on genetic distance, and the mean heterosis showed the possibility of exploiting the group of strains for precocity and yield. The combinations CD008 x CD038 and CD072 x CD070 stood out for population synthesis and CD010 x CD034 for direct synthesis of the hybrid. The CD034 strain stood out as more divergent among the strains studied for testing potential. The genetic information showed that the dominant strains are found more frequently in the parents, except for yield, which is predominantly recessive. Dominant gene effects are predominant in the control of the variables studied with an overdominant interaction between the alleles. The CD069 strain shows a higher number of dominant genes for maturation and the CD038 strain had a higher number of dominant genes for yield. / O trabalho teve como objetivo estratificar ambientes de safrinha do Oeste e Centro Ocidental do Paraná quanto a complementariedade de informações obtidas em cada local, avaliar o potencial “per se” de genitores, a manifestação da heterose em híbridos e obter informações sobre o controle genéticos para atributos relacionados a produtividade e maturação. Informações de produtividade e de umidade de colheita de 16 híbridos comerciais, conduzidos em DBC com duas repetições, presentes nos ensaios de VCU da Coodetec nas safrinhas 2014 e 2015, semeados nas microrregiões de Cascavel, Toledo, Foz do Iguaçu para representação do Oeste e na microrregião de Campo Mourão e em Mariluz, representando o arenito Caiuá, para a representação do Centro Ocidental paranaense, foram utilizados para estratificação ambiental, utilizando-se a metodologia de análise de fatores. Para o estudo da heterose, potencial “per se” e o controle genético, foram selecionadas 13 linhagens elite do programa de melhoramento da Coodetec, das quais foram coletados discos foliares para genotipagem com marcadores moleculares SNP. Os 78 híbridos, obtidos em um dialélo de meia tabela, os 13 genitores e 9 híbridos comerciais foram semeados em Mariluz, Palotina e São Pedro do Iguaçu, em látice quadrado 10x10 com três repetições. Foram avaliados floração masculina e feminina, umidade de colheita, produtividade e peso de mil sementes. Para o agrupamento baseado na matriz de dissimilaridade foi empregado o método de Tocher modificado (sequencial), para a avaliação do dialélo foi utilizada a metodologia de Gardner e Eberhart (1966) e a metodologia de Hayman (1954). A estratificação ambiental evidenciou que os municípios Cascavel, Palotina, Mariluz, Campo Mourão e São Pedro do Iguaçu são mais informativos para seleção para produtividade e Campo Mourão, Cascavel, Mariluz, Santa Terezinha do Itaipu, Palotina e São Pedro do Iguaçu para umidade de colheita. A análise agrupamentos formou três grupos heteróticos baseado na distância genética, a heterose média evidenciou possibilidade de exploração do grupo de linhagens para precocidade e produtividade. Destacaram-se as combinações CD008 x CD038 e CD072 x CD070 para síntese de populações e CD010 x CD034 para a síntese direta de híbrido. A linhagem CD034 destacou-se como divergente entre as linhagens estudada sendo um testador de potencial. As informações genéticas evidenciaram que alelos dominantes encontram-se em maior frequência nos genitores, exceto para produtividade que há predominância de recessivos. Há predominância de efeitos gênicos de dominância no controle das variáveis estudadas com interação de sobredominância entre os alelos. A linhagem CD069 apresenta maior número de genes em dominância para maturação e a linhagem CD038 maior número de genes em dominância para produtividade.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente trabalho foi realizada a caracterização da variabilidade fenotípica e genética em genótipos de cajueiros, representando uma população natural da espécie Anacardium occidentale L. A pesquisa teve como objetivo caracterizar a qualidade do fruto e do pseudofruto, por meio de análises morfológicas e físico-químicas nos anos de 2005 e 2006, bem como analisar a diversidade genética entre os genótipos dessa mesma população de cajueiros no município de Boa Vista - Roraima. Estes resultados podem ser utilizados na escolha de progenitores mais adequados dentro da população de cajueiros natural estudada, para iniciar um programa de melhoramento de qualidade do fruto e do pseudofruto, uma vez que esses recursos naturais apresentam potencialidade econômica. / Work was carried out, regarding the classification of the genetic and phenotypical variation and the genetic constitution of cashew trees (Anacardium occidentale L.). Research was done to find the quality of its fruits and pseudofruits by morphological and physio-chemical analization during the years 2005 and 2006, as well as an analysis of the genetic variety and genetic constitution of cashew trees in Boa Vista - Roraima. These results could be utilized in choosing better progenitores among the cashew trees that have already been studied and to start a programme for the betterment of fruit quality, once these the natural resources show economic potentiality.

Em estudos de divergência genética por métodos multivariados, a distância euclidiana é a medida de distância mais amplamente utilizada e essa distância é a mais recomendada quando as unidades de cálculos são escores de componentes principais, como é o caso da análise AMMI (additive main effects and multiplicative interaction analysis). Tal análise permite a obtenção de estimativas mais precisas das respostas genotípicas e possibilita a análise da divergência genética por métodos aglomerativos. A análise dos modelos AMMI combina, num único modelo, componentes aditivos para os efeitos principais (genótipos e ambientes) e componentes multiplicativos para os efeitos da interação genótipos × ambientes. Os melhoristas de plantas compreendem que a interação genótipos × ambientes é de suma importância para a obtenção de variedades superiores e as estimativas de dissimilaridade atendem aos objetivos do melhorista, por quantificarem e informarem sobre o grau de semelhança ou de diferença entre pares de indivíduos. Entretanto, quando o número de indivíduos é grande, torna-se inviável o reconhecimento de grupos homogêneos pelo exame visual das estimativas de distância. Portanto, é importante proceder à análise de agrupamentos, obter dendrogramas por meio de métodos hierárquicos e posteriormente, analisar os grupos formados. A fim de determinar e classificar os grupos formados na clusterização hierárquica foram utilizados comandos específicos do programa computacional R que desenha no dendrograma os retângulos de cada grupo e os numera. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi analisar a divergência genética via modelo AMMI, utilizando-se de técnicas multivariadas e reamostragem \"bootstrap\". / In studies of genetic diversity using multivariate approaches, the Euclidean distance is the most common measure used. This method is recommended when data are scores of principal components, such as in AMMI analysis (additive main effects and multiplicative interaction analysis). The AMMI method allows obtaining more precise estimates for genotypic results and also permits the use of genetic diversity analysis by using agglomerative approaches. Furthermore, this method combines additive components for the main effects (genotypes and environments) and multiplicative components for genotypes x environment interaction effects in a unique model. Plant breeders understand the importance of genotype and environment interaction to obtain superior varieties and the dissimilarity estimation meets breeders\" objectives since it quantifies and determines the similarity or the divergence between pairs of individuals. However, when the number of individuals is large it is unfeasible to recognize the group homogeneity by using a visual analysis of the distances estimation. Therefore, is important to use cluster analysis to obtain dendograms based on hierarchical methods and then analyze the groups obtained. In order to determine and classify the obtained groups from hierarchical cluster analysis specifics commands in the R software were used which shows in the dendrogram rectangles and numbers for each group. In this way, the objective of this work was to analyze the genetic divergence through AMMI model, by using multivariate approaches and \"bootstrap\" resampling.

A doença de Wilson, moléstia hereditária, caracteriza-se pela deficiência de excreção de cobre pelo fígado, originária da mutação do gene ATP7B. As manifestações neurológicas na doença de Wilson são pleomórficas, observando-se distúrbios do movimento com início insidioso e em idade variável - geralmente na segunda ou terceira décadas de vida. Este estudo, dividido em duas partes, descreve as manifestações neurológicas iniciais em 119 pacientes com doença de Wilson (93 casos-índice e 26 familiares acometidos), avaliados entre 1963 e 2004 dos quais 109 foram através de análise retrospectiva dos prontuários médicos, enquanto aos 10 pacientes restantes se dispensou avaliação clínica prospectiva, a partir de 2002. O início dos sintomas ocorreu na média etária dos 19,4 anos (7-37), e o tempo médio do surgimento dos sintomas ao diagnóstico de 1,1 +/- 1,2 anos (0-5 anos). Entre as manifestações neurológicas mais freqüentes, observaram-se: disartria (91%), distúrbios da marcha (75%), risus sardonicus (72%), distonia (69%), rigidez (66%), tremor (60%) e disfagia (50%). A incidência das manifestações coréia e atetose, 16% e 14%, respectivamente, foi baixa. Manifestações atípicas incluíram convulsões (4,2%) e sinais piramidais (3%). A segunda parte do estudo trata da investigação do genótipo ATP7B em 41 pacientes e suas possíveis correlações com o fenótipo neurológico. Encontraram-se 23 mutações distintas, a mais comum das quais (p.A1135fs) com freqüência alélica de 31,7%. Expressiva associação (p<0,05) se deu entre essa mutação e a manifestação disfagia, ainda que limitada por amostra restrita de pacientes. Também sugestiva foi a associação entre a mutação p.A1135fs e quadros neurológicos precoces e graves. Este é o primeiro estudo a comparar o genótipo ATP7B com as manifestações neurológicas na doença de Wilson / Wilson disease, a rare inborn metabolic error, is characterized by deficient hepatic copper excretion, due to mutations in ATP7B gene. Neurological manifestations may vary, although there is commonly a movement disorder starting in the second or third decade of life. This study is divided in two parts, and it describes the neurological manifestations in 119 patients with Wilson disease (93 index cases and 26 affected family members), which were seen between 1963 and 2004 a retrospective analysis in 109 medical records and prospective clinical evaluation in 10 patients since 2002. The average age of symptoms onset was 19.4 years (ranging from 7 - 37 years), and the mean time between the first symptom and diagnosis was 1, 1 +/- 1, 2 years. The most frequent neurological manifestations observed were: dysarthria (91%), gait disturbance (75%), risus sardonicus (72%), dystonia (69%), rigidity (66%), tremor (60%), and dysphagia (50%). Less frequent manifestations were chorea (16%), and athetosis (14%). Rare neurological presentations were seizures (4,2%), and pyramidal signs (3%). In the second part of this study, we ascertain ATP7B genotype correlations with distinct neurological phenotypes in 41 Wilson disease patients. A total of 23 distinct mutations were detected, and the p.A1135fs frameshift had the highest allelic frequency (31.7%). An association between a p.A1135fs mutation and dysphagia was detected (p<0, 05), but the limited number of patients restricts valuable conclusions. This analysis also suggests an association between this mutation and early and severe neurological presentation. This present study is the first one to evaluate an ATP7B genotype correlation with specific neurological profile in Wilson disease

INTRODUÇÃO: Hepatite B é uma das doenças infecciosas mais prevalentes no mundo, controlada em países onde a vacinação foi implantada, porém permanece alta em populações de risco e em países onde a transmissão vertical e horizontal intradomiciliar ainda persiste. O Estado de Santa Catarina é considerado hoje uma região de alta endemicidade para o VHB, tem uma prevalência estimada de AgHBs em doadores de sangue de 1,14%, o que é consideravelmente maior do que aquela estimada para o Brasil (0,61%). Em Chapecó, oeste de Santa Catarina, a prevalência do AgHBs em doadores de sangue foi de 3,2% em 1999, 1,63% em 2000 e 1,54% em 2001, significativamente maior do que em outras cidades do Estado. OBJETIVOS: Estudar os portadores de hepatite B crônica no município de Chapecó, possibilitando o conhecimento das características epidemiológicas, clínicas e laboratoriais do vírus nesta região de alta endemicidade. MÉTODOS: Estudou-se dois grupos de portadores de hepatite B crônica naquela região. O primeiro grupo (Grupo A) foi composto pelos casos notificados no ano de 1996 e o segundo grupo (Grupo B) foi composto pelos casos notificados no ano de 2006. RESULTADOS: Dos 352 pacientes notificados nos anos de 1996 e 2006 como portadores de hepatite B crônica no Município de Chapecó, 150 pacientes foram elegíveis após a aplicação dos critérios de inclusão e exclusão. A média de idade na época da notificação do grupo A foi de 29,9 anos (± 10,3) e do grupo B foi de 34,9 anos (± 11,9). O principal meio de diagnóstico foi após doação de sangue, sendo 53,6% pacientes no grupo A e 34,8% pacientes no grupo B. A maioria nasceu na região Oeste de Santa Catarina, sendo a cidade de Chapecó a mais freqüente. Seus familiares são naturais, em sua maioria, do Estado do Rio Grande do Sul. 96,4% dos pacientes do grupo A e 86,4% do grupo B apresentam AgHBe negativo. A maioria dos pacientes nos dois períodos estudados apresentava valores de ALT até 2x o LSN. 60,2% dos pacientes AgHBe negativos do grupo A apresentava carga viral <= 2.000 UI/mL, enquanto no grupo B 78,3% apresentava carga viral > 2.000 UI/mL. Todos os 105 pacientes que tiveram o VHB genotipado, apresentaram VHB genótipo D. CONCLUSÕES: A maioria dos pacientes é natural do Oeste de Santa Catarina e seus familiares do Estado do Rio Grande do Sul e Região do Mediterrâneo. Aminotransferases próximas aos limites da normalidade, AgHBe negativo e VHB genótipo D caracterizam os portadores de hepatite B crônica nessa região. A maioria dos pacientes do grupo A apresentou carga viral <= 2.000 UI/mL e no grupo B carga viral > 2.000 UI/mL. / INTRODUCTION: Viral hepatitis B is one of the most prevalent infectious diseases in the world. It remains under control in countries where vaccination programs have been established; however, its prevalence is still high in atrisk populations and in countries where vertical and horizontal intra domestic transmission persists. Santa Catarina province is currently considered a region of high endemicity for hepatitis B virus (HBV), with an estimated prevalence of 1.14% HBsAg in blood donors, which is considerably higher than the estimated prevalence for the country (0.61%). In Chapecó, a city located in the western region of the province, HBsAg prevalence in blood donors was 3.2% in 1999, 1.63% in 2000 and 1.54% in 2001, values that were significantly higher than in other cities of the province. OBJECTIVES: To study the carriers of chronic hepatitis B in the city of Chapecó in order to determine the epidemiological, clinical, and laboratorial aspects of HBV infection in this high endemicity region. METHODS: Two groups of carriers in that region were studied. The first group, designated Group A, was composed of cases that had been notified in the year 1996; while the second group, designated Group B, comprised cases that had been notified in the year 2006. RESULTS: From the 352 patients that had been notified as chronic hepatitis B carriers in the years 1996 and 2006 in Chapecó, 150 were eligible for inclusion in the study according to the inclusion and exclusion criteria. The mean age at the time of notification for Group A was 29.9 yearsold (±10.3) and for Group B was 34.9 years-old (± 11.9). The main reason leading to the diagnosis was routine screening of blood donors, which was responsible for 53.6% of diagnoses in Group A and 34.8% of diagnoses in Group B. The majority of patients were born in western Santa Catarina province, most frequently in the city of Chapecó. Their relatives were mostly from Rio Grande do Sul province. HBeAg was negative in 96.4% of Group A patients and 86.4% of Group B patients. The majority of patients from both periods studied had ALT values up to twice the upper normal limit (UNL). From HBeAg negative patients of Group A, 60.2% had a viral load <= 2.000 UI/mL; while from those of Group B, 78.3 % had viral loads > 2.000 UI/mL. All of the 105 cases in which the genotype of HBV has been determined were infected by genotype D HBV. CONCLUSIONS: The majority of patients were born in western Santa Catarina, and their relatives were from Rio Grande do Sul province or from Europe Mediterranean countries. Viral hepatitis B carriers from this region characteristically had aminotransferases close to the normal limits, negative HBeAg and were infected with genotype D HBV. Most of the patients from Group A had viral loads <= 2.000 UI/mL, while most of the patients from Group B had viral loads > 2.000 UI/mL.

Utilizando dados de produtividade dos experimentos regionais de avaliação de genótipos de algodoeiro (Gossypium hirsutum) conduzidos no estado de Mato Grosso, nos anos agrícolas 1998/99, 1999/00 e 2000/01, foi realizado este trabalho, com a finalidade de estratificar e determinar o número de ambientes para avaliação de genótipos de algodão. Para isso foram avaliados oito genótipos em 1998/99, 14 em 1999/00 e 15 em 2000/01 em oito ambientes, quais sejam: Campo Novo dos Parecis, Sorriso, Primavera do Leste, Rondonópolis, Campo Verde, Sapezal, Pedra Preta e Lucas do Rio Verde. A partir das análises de variância foram aplicadas técnicas fundamentadas na análise AMMI (Additive Main effects and Multiplicative interactions). A primeira estratificação baseou-se na distância entre locais para a interação por um modelo AMMI de análise. O segundo método baseou-se na abordagem de genótipos vencedores, utilizando-se as estimativas dos modelos AMMI1 e AMMI2. As duas metodologias aplicadas permitiram a formação de estratos ambientais para todos os anos de avaliação. As matrizes de coincidências para os três anos de avaliação permitiram inferir que os estratos formados têm caráter preditivo, pois foram identificados a partir de conjuntos de genótipos diferentes em cada ano e se confirmaram nos três anos de estudo. Assim, por meio da metodologia baseada na distância para interação observou-se a formação de um estrato compreendendo Campo Verde e Lucas do Rio Verde. Entretanto a metodologia baseada em genótipos vencedores permitiu a formação de dois estratos envolvendo quatro dos oito locais avaliados, sendo o primeiro grupo constituído por Sorriso e Lucas do Rio Verde e segundo composto por Primavera do Leste e Lucas do Rio Verde. A metodologia baseada em genótipos vencedores possibilitou a formação de estratos ambientais baseados em critérios estatísticos de fácil entendimento e apresentação gráfica clara, permitindo a delimitação de estratos de forma matemática, baseada na performance dos genótipos vencedores. Ela informou de maneira integrada a recomendação de genótipos de adaptação específica para cada estrato de ambientes. / Data of yield were obtained from Regional Yield Trials of cotton (Gossypium hirsutum) genotypes carried out in Mato Grosso State, Brazil in 1998/99, 1999/00 and 2000/01, was used in this study on environmental stratification and evaluation of the minimum number of environments required for cotton genotypes assessments. Eight genotypes were evaluated in 1998/99, fourteen in 1999/00 and fifteen in 2000/01. The genotypes were planted in the following eight locations: Campo Novo dos Parecis, Sorriso, Primavera do Leste, Rondonópolis, Campo Verde, Sapezal, Pedra Preta e Lucas do Rio Verde. From the analysis of variance and the environmental means, two techniques were applied based on AMMI analysis (Additive Main effects and Multiplicative Interactions) analysis. The first method was based on an interaction distance between locations estimated by AMMI analysis. The second method was based on the winning genotypes approach, throught the interactions estimates from models AMMI1 and AMMI2. The methodologies were efficient to provide an environmental stratification at every years of evaluation. The results of the matrix of coincidences over the three years of this study suggested the formed strata have a predictive property, since their identification was based on a different set of genotypes in each year and they remained the same over the years. Then, the method based on an interaction distance between locations estimated by AMMI analysis permited to constitute one stratum involving Campo Verde and Lucas do Rio Verde. However, the method based on the winning genotypes approach has formed a two strata involving four locations; the first group was constitute by Sorriso and Lucas do Rio Verde and the second involved the locations Primavera do Leste and Lucas do Rio Verde. The methodology based on the winning genotypes approach to made possible the formation of environmental strata based on statistical criteria of easy understanding and showing graphic display. This method to allowed the demarcation of strata in a mathematical way through the performance winning genotypes; it provided an integrated understanding about the recommendation of genotypes with specific adaptation for each environmental stratum.