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Modelos de regressão aleatória na estimação de parâmetros genéticos para produção e persistência nas características produtivas de vacas da raça holandesa / Random regression models in the genetic parameters estimation for production and persistency in the productive traits from the cows of the holstein breedBiassus, Igor de Oliveira January 2009 (has links)
Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para as produções no dia do controle e para seis medidas para a persistência nas produções de leite, de gordura e de proteína, de vacas da raça Holandesa, do Estado de Minas Gerais, foram usados 56.508, 35.091 e 8.326 registros, de 7.015, 4.476 e 1.114 vacas, filhas de 6.089, 3.875 e 984 mães e 359, 246 e 90 touros, respectivamente para as produções no dia do controle, de leite, de gordura e de proteína. Foram ajustados modelos de regressão aleatória usando-se polinômios de Legendre com a ordem de 3 a 6. As herdabilidades variaram de 0,14 a 0,31, 0,03 a 0,21 e 0,09 a 0,33 para as produções de leite, de gordura e de proteína, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,02 a 1,00, 0,34 a 1,00 e 0,42 a 1,00 e as correlações de ambiente permanente variaram de 0,02 a 0,99, -0,34 a 0,99 e -0,10 a 0,99, respectivamente para as produções de leite, de gordura e de proteína. As estimativas de herdabilidade para as persistências nas produções de leite, de gordura e de proteína variaram, respectivamente, de 0,04 a 0,32, 0,00 a 0,23 e 0,00 a 0,27. Os valores de correlações genéticas entre as medidas de persistência e as produções totais de leite, de gordura e de proteína variaram de -0,38 a 0,54, -0,39 a 0,97 e -0,78 a 0,67, respectivamente. Os modelos ajustados por polinômios de Legendre de maior ordem foram os mais adequados para as três características produtivas e a medida PS2 foi a mais apropriada para avaliação para a persistência das produções de leite, de gordura e de proteína, para animais da raça Holandesa em Minas Gerais. / With the objective to estimate genetic parameters for the test-day yields and for six measures for the persistencies for milk, fat and protein yields from the cows of the Holstein breeds, in the State of Minas Gerais, were used 56,508, 35,091 and 8,326 records, from 7,015, 4,476 and 1,114 cows, sired by 6,089, 3,875 and 984 dams and 359, 246 and 90 bulls, respectively for milk, fat and protein test-day yields. Random regression models were adjusted by using Legendre polynomial with order from 3 to 6. The heritabilities ranged from 0.14 to 0.31, 0.03 to 0.21 and 0.09 to 0.33 for the milk, fat and protein yields, respectively. The genetic correlations ranged from 0.02 to 1.00, 0.34 to 1.00 and 0.42 to 1.00 and the permanent environmental correlations ranged from 0.02 to 0.99, -0.34 to 0.99 and -0.10 to 0.99, respectively for milk, fat and protein yields. The heritability estimates for the persistencies in the milk, fat and protein yields ranged, respectively, from 0.04 to 0.32, 0.00 to 0.23 and 0.00 to 0.27. The values of the genetic correlations among persistency measures and total milk, fat and protein yields ranged from -0.38 to 0.54, -0.39 to 0.97 and -0.78 to 0.67, respectively. The models adjusted for Legendre polynomials of higher order were the most adequated for the three productive traits and the PS2 measure was the most appropriated for evaluation for the persistencies for milk, fat and protein yields, for the animals of Holstein breed in the State of Minas Gerais.
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Aproveitamento de produtos derivados de levedura (Saccharomyces spp.) para o enriquecimento nutricional de alimentos à base de mandioca (Manihot esculenta CRANTZ)Pinto, Laise Cedraz 05 March 2013 (has links)
107 f. / Submitted by Cynthia Nascimento (cyngabe@ufba.br) on 2013-03-05T10:47:31Z
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Laise Cedraz Pinto.pdf: 735458 bytes, checksum: 8197daccd62558274680435612bfc9df (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-03-05T21:00:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1
Laise Cedraz Pinto.pdf: 735458 bytes, checksum: 8197daccd62558274680435612bfc9df (MD5) / Made available in DSpace on 2013-03-05T21:00:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Laise Cedraz Pinto.pdf: 735458 bytes, checksum: 8197daccd62558274680435612bfc9df (MD5) / As leveduras (Saccharomyces spp.) são utilizadas em variados processos
fermentativos.O Brasil produz atualmente uma grande quantidade de biomassa de
levedura como subproduto das indústrias cervejeiras. No processo de produção da
cerveja, após a maturação, estes micro-organismos são retirados do mosto de
fermentação gerando excedentes de células, que são descartados no ambiente ou
utilizados, principalmente, na alimentação animal. As leveduras apresentam um
potencial nutritivo, especialmente no teor de proteínas, vitaminas do complexo B e
minerais, que, desta forma, poderiam ser aproveitadas como ingrediente nutritivo
para alimentação humana, como em alimentos regionais derivados da mandioca
(Manihot esculenta CRANTZ). A farinha de mandioca e o beiju são muito
consumidos pela população Nordestina, porém apresentam baixo teor protéico,
sendo considerados apenas como fonte energética. O objetivo deste estudo foi
avaliar o perfil nutricional e o potencial de utilização de derivados da levedura
secundária da indústria cervejeira como ingrediente nutritivo em alimentos; elaborar
farinha de mandioca e beiju adicionados de liofilizado da levedura e avaliar o
enriquecimento nutricional e a aceitação sensorial destes produtos regionais. As
amostras foram cedidas por uma cervejaria de Feira de Santana, BA, em dois
momentos (lote 1 e 2) e submetidas a um tratamento alcalino (NaOH 0,3%),
lavagens e centrifugação, com descarte do sobrenadante, para obtenção de uma
biomassa limpa e desamargada (BMT). Uma parte da amostra não foi submetida a
este tratamento para avaliação de possíveis perdas nutricionais. A biomassa foi
liofilizada para obtenção da BMNL (antes do tratamento) e BMTL (após tratamento).
A composição centesimal foi realizada, em triplicata, na biomassa úmida, nos
liofilizados e nos produtos regionais padrão (sem adição do liofilizado de levedura) e
enriquecidos com a BMTL nas concentrações de 5 e 10%. As determinações de
minerais e vitaminas do complexo B foram realizadas em triplicata, em um lote da
BMNL e BMTL. Os minerais foram determinados por espectrometria de absorção
atômica e as vitaminas do complexo B por cromatografia líquida de alta eficiência.
Análises microbiológicas foram realizadas na farinha e beiju padrão, no liofilizado e
biomassa em atendimento à legislação vigente, para garantir a segurança dos
mesmos para o consumo. O teste sensorial foi realizado por julgadores não
treinados, utilizando uma escala hedônica de 1 a 9 pontos, sendo avaliados os
atributos: cor, sabor, gosto amargo, textura e qualidade global dos produtos
enriquecidos e padrão. A intenção de compra foi avaliada por uma escala de 1 a 5
pontos. As amostras dos alimentos foram servidas como farofa e beiju colorido e
aromatizado artificialmente. Pode-se inferir que a biomassa, e principalmente, o
liofilizado se caracterizam por constituir uma importante fonte de proteínas,
respectivamente 11,4g% e 35,2g% com possibilidade de ser um ingrediente para
agregar valor nutritivo protéico em alimentos. O tratamento alcalino não influenciou
em perdas de proteínas. A BMTL apresentou excelentes teores de cálcio (699mg%),
ferro (10,59mg%), selênio (0,5mg%) e zinco (9,68mg%), e composição de vitaminas
B1 (0,45mg%); B2 (2,34mg%); B3 (0,70mg%); B6 (9,99mg%) e B9 (0,25mg%). De
forma geral, o tratamento de limpeza e desamargor influenciou em perdas
significativas de minerais e vitaminas. Os alimentos enriquecidos apresentaram
aumento significativo no teor de proteínas, em comparação com os mesmos
produtos padrão, e encontraram-se seguros para o teste sensorial, segundo as
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análises microbiológicas. As médias do teste de aceitação foram inversamente
proporcionais à adição do liofilizado de levedura. O produto enriquecido com melhor
aceitação e melhor média de intenção de compra foi a farofa com 5% de liofilizado.
O liofilizado de levedura pode ser considerado como um complemento nutricional
com potencial para ser utilizado como forma de enriquecimento de alimentos.
Técnicas para minimizar o gosto amargo neste derivado e a adição de extratos
vegetais e outros saborizantes poderiam melhorar a aceitação das preparações, e
viabilizar seu uso para aumentar o valor nutritivo, especialmente de proteínas, em
alimentos / Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Farmácia. Salvador-Ba, 2011.
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Translocação nuclear de NF-KB e de receptores de glicocorticoides em células musculares lisasScheschowitsch, Karin 26 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Farmacologia, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T05:41:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1
290486.pdf: 1666475 bytes, checksum: bb23fc6e1b917c81adfeef1749eecfa9 (MD5) / O lipopolissacarídeo (LPS) é um componente da parede de bactérias Gram-negativas capaz de induzir respostas inflamatórias sistêmicas pela capacidade de ativar o fator de transcrição nuclear .B (NF-.B). Além do LPS, a presença de citocinas como IFN-., também promovem a ativação do NF-.B. Uma vez que este fator é ativado, inúmeros genes pró-inflamatórios são transcritos, elevando a expressão de citocinas como TNF-a, IL-1, IL-6, IFN-. e a enzima NOS-2. Um dos mecanismos endógenos anti-inflamatórios mais importantes é a ativação de receptores de glicocorticoides (GR). Utilizando um modelo in vitro baseado em aspectos relevantes da sepse, uma doença de cunho inflamatório, mostrou-se que células musculares lisas (CML) de aorta de rato da linhagem A7r5 são ativadas pelo estímulo LPS/IFN produzindo NO, dosado na forma do seu metabólito, nitrito. De forma inédita, observou-se que a ativação das CML depende de um pulso inicial de NO oriundo de NOS constitutivas, uma vez que a inibição do mesmo diminui substancialmente a ativação celular. Além do pulso de NO, ocorre também uma rápida produção de EROs após estimulação das células com LPS. A caracterização e presença de GR funcionais nestas células permitiram o acompanhamento da sua dinâmica após estimulação com LPS/IFN. Surpreendentemente, a estimulação com LPS/IFN induz um aumento na translocação nuclear destes receptores de forma concomitante com a translocação nuclear do NF-.B, cuja intensidade de translocação é parcialmente regulada pelo NO. Outro fator que parece intermediar a translocação nuclear de GR e NF-.B e exercer um papel fundamental no curso da ativação celular é o peroxinitrito, que pode estar sendo formado imediatamente após a estimulação das células pela reação do pulso de NO com o ânion superóxido. Os resultados mostram que o NO e seus derivados desempenham um papel fundamental no início da ativação celular e na translocação nuclear de GR, contribuindo para o entendimento do início do processo de ativação celular.
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Expressão de genes imunológicos associados à defesa antifúngica em Litopenaeus vannamei infectados experimentalmente com Fusarium solaniGonçalves, Priscila January 2011 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento / Made available in DSpace on 2012-10-26T07:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1
299994.pdf: 1365385 bytes, checksum: 40a721590b9fe56096cc9269e3ae2ed5 (MD5) / A modulação da expressão gênica de proteínas envolvidas nas respostas antifúngicas em camarões Litopenaeus vannamei e Farfantepenaeus paulensis foi avaliada após infecção experimental com esporos de Fusarium solani. Camarões F. paulensis foram desafiados com uma dose não-letal de esporos (6 x 106 esporos/ml) e a expressão da proteína de reconhecimento de fungos, ?GBP, não foi alterada em resposta a essa infecção branda. Já camarões L. vannamei desafiados com dose letal de esporos (108 esporos/ml) de F. solani apresentaram uma queda significativa na expressão da ?GBP, da pró-fenoloxidase (proPO), dos subgrupos 2, 3 e 4 da peneidina (PEN 2, PEN 3, PEN 4) e da stylicina, indicando o envolvimento do fungo na depleção do nível de transcritos dessas moléculas de defesa. Uma superexpressão gênica da proteína que reconhece LPS e ?-1,3-glicanas (LGBP) e do fator antilipopolissacarídeo (ALF) foi também encontrada nesses animais, sugerindo o envolvimento destas proteínas na fase aguda da infecção por F. solani. Paralelamente, camarões L. vannamei injetados com dsRNA específico para a LGBP apresentaram silenciamento de 18% a 95% em 2 e 3 dias, respectivamente, após a injeção de duas doses sequenciais de dsRNA. Esses resultados, no entanto, não foram reproduzidos em animais provenientes de uma fazenda de cultivo, sugerindo que exista uma resposta diferenciada associada à ativação prévia do sistema imunológico de acordo com as condições ambientais. Os resultados deste estudo apontam para um potencial envolvimento das moléculas imunoefetoras proPO, PEN 2, PEN 3, PEN 4, ALF e stylicina na defesa antifúngica de camarões L. vannamei, e representam uma contribuição pioneira para um maior conhecimento das respostas moleculares desencadeadas por camarões frente a uma infecção por F. solani, um reconhecido patógeno oportunista dos peneídeos.
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Elaboração de um painel de marcadores de ancestralidade para estudos caso-controle e organização das informações em banco de dados localDebortoli, Guilherme January 2013 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:32:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1
322298.pdf: 5633585 bytes, checksum: 44c191bbf3514f519196e0afb76d38a8 (MD5)
Previous issue date: 2013 / A população brasileira é produto da miscigenação entre trêsprincipais grupos étnicos: Ameríndios (que já habitavam estas terras àépoca do descobrimento), Europeus (principalmente portugueses) eAfricanos (trazidos de forma forçada como mão de obra escrava).Estimar as diferentes proporções de ancestralidade em populaçõesmiscigenadas é de extrema importância para estudos genéticos quebuscam encontrar alelos de sucetibilidade a doenças, uma vez que a nãocorreção da estratificação populacional pode ocasionar desvios levandoa associações espúrias. Para o controle da estratificação populacional, autilização de marcadores informativos de ancestralidade tem sidoamplamente utilizada por apresentar um alto diferencial de frequênciaentre populações de regiões geograficamente distintas. O objetivo desteestudo foi genotipar quatro marcadores informativos de ancestralidadeadequados para amostras da população brasileira visando estender estaabordagem para entender a estruturação populacional em estudos decaso-controle, utilizando como modelo a doença psoríase. Adicional aoprincipal objetivo, um banco de dados biológico (BDB) foi diagramadoe implementado, para auxiliar na organização e armazenamento deinformações a respeito das amostras aqui utilizadas. As frequências dosquatro marcadores (AT3, Sb19.3, APO e PV92) foram estimadas emamostras de pacientes (PSR) diagnosticados com psoríase (n=100) econtroles saudáveis (PSC) sem histórico de doença (n=100, PSC)coletadas na cidade de Florianópolis - SC. Os perfis genéticos foramobtidos através de PCR convencional e eletroforese em gel de agarose.As análises estatísticas empregaram programas tais como GENEPOP,GDA e ADMIX 3. O BDB proposto foi desenvolvido e estruturado emsistema de gestão de bases de dados relacionais MySQL, e a interfacegráfica foi desenvolvida em linguagem PHP e HTML. Por meio deanálises moleculares e estatísticas, os resultados obtidos evidenciaramque os dois grupos de indivíduos aqui estudados (PSR e PSC)apresentaram semelhanças quanto a sua ancestralidade genética, nãosendo observado grandes diferenças populacionais. As estimativas demistura revelaram que as duas populações analisadas são tri-híbridas,com alta preponderância do componente europeu, seguido de africano eameríndio respectivamente. Apesar dos poucos marcadores utilizadosfoi possível discriminar a contribuição genética dos grupos ancestraisindicando que mesmo um número reduzido de marcadores pode sersuficiente, desde que apropriadamente selecionados, para responder umapergunta específica. O BDB construído e diagramado neste trabalhorecebeu o nome de LAPOGEdb (LAPOGE Database -www.lapoge.sites.ufsc) e, mostrou-se uma ferramenta eficaz para oarmazenamento estruturado de informações que variam entre dadosepidemiológicos e genéticos referentes a amostras utilizadas ao longo de19 anos de funcionamento do Laboratório de Polimorfismos Genéticosda Universidade Federal de Santa Catarina (LAPOGE-UFSC). <br> / Abstract : The Brazilian population is the product of interbreeding betweenthe three main ethnic groups: Amerindians (who inhabited these landsduring the discovery), Europeans (mainly Portuguese) and Africans(brought forcefully as slave labor). Estimating the different proportionsof ancestry in admixed populations is of utmost importance for geneticstudies that seek to find disease susceptibility alleles, since no correctionof population stratification, can cause deviations leading to spuriousassociations. To control the population stratification, the use of ancestryinformative markers have been widely used for its feature of presentinga high frequency differential between geographically distinctpopulations. The aim of this study was to genotype four ancestryinformative markers suitable for samples of the brazilian population inorder to extend this approach to understand the population structure incase-control studies, using as a model the psoriasis disease. Additionalto the main objective, a biological database (BD) was diagrammed andimplemented through programming languages, to assist in organizingand storing information about the samples used here. The frequencies ofthe four markers (AT3, Sb19.3, APO and PV92) were estimated insamples of patients (PSR) diagnosed with psoriasis (n = 100) andhealthy controls (PSC) with no history of disease (n = 100, PSC)collected in the city of Florianópolis - SC. The genetic profiles wereobtained by standard PCR and visualization with agarose gel andelectrophoresis. The statistical analysis employed programs such asGENEPOP, GDA and ADMIX 3. The proposed BD was developed andstructured in MySQL relational database management system, while thegeneral user interface (GUI) was developed in PHP and HTML. Theresults obtained from the molecular analysis and statistics, showed thatthe two groups studied here (PSR and PSC) had some similarities intheir genetic ancestry, not observing large population differences.Estimates of mixture revealed that the two populations are tri-hybrid,with high preponderance of European component, followed by Africanand Amerindian respectively. Despite the few markers used it was ableto discriminate the genetic contribution of ancestral groups indicating,that even a small number of markers may be sufficient, whenappropriately selected, to answer a specific question. The BD builtedanddiagrammed in this work was named LAPOGEdb (LAPOGE Database -www.lapoge.sites.ufsc) and proved to be an effective tool for storingstructured information, ranging from genetic and epidemiological data,related to the samples used throughout 19 years of operation of theLaboratory of Genetic Polymorphisms of the Federal University ofSanta Catarina (UFSC-LAPOGE).
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Avaliação da formação de biofilme por Staphylococcus sp. e diversidade genética de estafilococos coagulase-negativos / Evaluation of biofilm formation by Staphylococcus sp. and genetic diversity of coagulase-negative staphylococciRossatto, Fernanda Cristina Possamai January 2015 (has links)
Staphylococcus sp. é reconhecidamente causador de infecções humanas e considerado um dos principais patógenos alimentares. O objetivo deste estudo foi comparar isolados de Staphylococcus sp. quanto à formação de biofilme sob diferentes suplementações (1 %, 5 % e 10 % de glicose, 0,9 % de NaCl, 5 % de glicose com 0,9 % de NaCl e 12,5 % de plasma) e temperaturas (25 ºC, 35 ºC e 40 ºC), bem como avaliar isolados provenientes de morcilha quanto à caracterização molecular por meio da tipagem epidemiológica e produção de proteases e lipases. Um total de 102 Staphylococcus sp. (34 S. aureus clínicos, 26 estafilococos coagulase-positivos (ECP) de carne de frango, e 42 estafilococos coagulase-negativos (ECN) de morcilha) foram selecionados. Os isolados clínicos apresentaram maior formação de biofilme com adição de plasma a 35 ºC, já os alimentares com suplementação combinada de glicose e cloreto de sódio a 40 ºC. Não houve correlação entre os métodos de tipagem molecular, sendo o RAPD-PCR mais discriminatório que o rep-PCR, na análise dos ECN. Dentre os 42 isolados de morcilha, 57,14 % e 28,57 % apresentaram atividades lipolítica e proteolítica, respectivamente. Conclui-se que cada isolado apresentou um comportamento individualizado sob determinado suplemento ou temperatura de incubação, mas, de modo geral, o aumento da temperatura e a adição de glicose e NaCl favorecem a formação de biofilme, bem como a utilização de componentes da matriz do hospedeiro em isolados clínicos. A análise molecular mostrou uma elevada diversidade genética entre os isolados de morcilha. / Staphylococcus sp. is known to cause human infections and considered one of the main food pathogens. The objective of this study was to compare isolates of Staphylococcus sp. as the biofilm formation in different supplements (1 %, 5 % and 10 % glucose, 0.9 % NaCl, 5 % glucose and 0.9 % NaCl, 12.5 % plasm) and temperatures (25 °C, 35 °C and 40 °C) and isolated from black pudding evaluate their molecular characterization by epidemiological typing and production of proteases and lipases. A total of 102 Staphylococcus sp. (34 clinical S. aureus, 26 coagulase-positive staphylococci (ECP) from poultry, and 42 coagulase-negative staphylococci (ECN) from black pudding) were selected. Clinical isolates showed greater biofilm formation with the addition of plasma at 35 °C, as food isolates with combined supplementation of glucose and sodium chloride at 40 ºC. There was no correlation between the molecular typing methods, RAPD-PCR was more discriminatory than rep-PCR. Among the 42 isolates from black pudding, 57.14 % and 28.57 % had lipolytic and proteolytic activities, respectively. We conclude that each strain had an individualized behavior under specific supplement or temperature, but generally, the increase of temperature and the addition of glucose and NaCl favor the formation of biofilm, as well as the use of components of the host matrix from clinical isolates. Molecular analysis showed a high genetic diversity among the isolates from black pudding.
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Clonagem, expressão e purificação de proteínas do plasma seminal bovino relacionadas à alta congelabilidade do sêmen / Cloning, expression and purification of the proteins from bovine seminal plasma osteopontin and acidic seminal fluid protein related with semen freezabilityBustamante Filho, Ivan Cunha January 2010 (has links)
O uso da tecnologia de DNA recombinante abre portas para um estudo detalhado da estrutura e função de proteínas, e a produção de proteínas recombinantes em sistema procarioto apresenta várias vantagens. A presente tese propõe a expressão heteróloga das proteínas aSFP, proteína ácida do fluido seminal bovino de 14 kDa, e osteopontina (OPN) de 55 kDa, relacionadas à congelabilidade do sêmen. Foram construídas bibliotecas de cDNA de vesícula seminal, próstata e glândula bulbouretral. Oligonucleotideos iniciadores foram sintetizados baseados nas seqüências disponíveis no GenBank (aSFP: número de acesso NM_174616, OPN: número de acesso M66236). Os amplicons resultantes das reações de PCR foram clonados em pET23a(+). Os plasmidios pET-aSFP e pET-OPN foram transformados em linhagens eletrocompetentes de E. coli BL21, BL21 (DE3), BL21 Star, BL21 Codon Plus e BL21 pLysS. Para expressão das proteínas recombinantes foram testadas diferentes concentrações de indutor de expressão IPTG, e diferentes tempos e temperaturas de indução. A expressão recombinante foi avaliada por SDS-PAGE, usando como controle cultivo não induzido. Das cinco linhagens transformadas com pET-aSFP, somente E. coli BL21 pLysS induzida com 0,5 mM de IPTG por 3 horas a 37°C apresentou uma banda de aproximadamente 15 kDa, compatível com o tamanho esperado de aSFPr-6xHis. Por cromatografia de afinidade com metal imobilizado em condições desnaturantes foi possível um rendimento de purificação de 2,5mg/mL de aSFPr-6xHis por 10 mL de cultura bacteriana. Contudo, a expressão de OPNr-6xHis, também obtida com a linhagem de E. coli BL21 pLysS, foi de baixa eficiência, o que não permitiu sua purificação. A produção recombinante de proteínas do plasma seminal é uma das mais novas ferramentas para o estudo de suas funções. O aperfeiçoamento dos processos de expressão e purificação é fundamental no desenvolvimento desta biotecnologia, que possui grande potencial terapêutico e diagnóstico. / The use of recombinant DNA technology makes possible a deeper investigation on protein structure and function. Also the production of recombinant proteins has several advantages. The present thesis presents the recombinant expression of the 14 kDa acidic seminal fluid protein (aSFP) and osteopontin (55 kDa), both associated with bovine semen freezability. cDNA libraries from prostate, seminal vesicle and bulbouretral gland were constructed, and primers were designed based on data available on Genebank (aSFP: access number NM_174616; OPN: access number M66236). Amplicons of the target genes were cloned into pET23a(+), and the constructs pET-aSFP and pET-OPN were transformed into electrocompetent E. coli strains: BL21, BL21 (DE3), BL21 Star, BL21 Codon Plus e BL21 pLysS. For the expression trials, different concentrations of IPTG were tested, as well several different expression induction conditions. The recombinant expression was analyzed by SDS-PAGE and western blotting. The best expression for aSFPr-6xHis (15 kDa) was obtained with the strain BL21 pLysS, induced with 0.5 mM IPTG in 3 hours at 37°C. The target protein was purified by immobilized metal ion chromatography in denaturing conditions with a yield of 2.5 mg/mL per 10 mL of bacterial culture. The recombinant expression of OPNr-6xHis was also possible with the pLysS strain, however in a lower efficiency. The low amount of recombinant OPN did not allow its purification. The production of seminal plasma recombinant proteins is a new tool for the study of its functions. The improvement of expression and purification processes is important for this biotechnology which has a great potential for therapeutic and diagnose applications.
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Análise do desenvolvimento e estudo do polimorfismo de inversão cromossômica de Drosophila polymorpha (Diptera, Drosophilidae) e sua relação com genes de choque térmico (HSPs) induzidos por estresse físico/químicoWildemann, Bruna January 2014 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2014 / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:22:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2014 / O objetivo geral deste trabalho foi estudar o ciclo de vida, o polimorfismo de inversão cromossômica e a possível relação dos arranjos com genes de estresse (hsps). O material de estudo foi coletado em três diferentes unidades de conservação (UCs) de Santa Catarina: Parque estadual da Serra do Tabuleiro, Reserva Biológica da Canela Preta e Reserva Biológica do Aguaí. Primeiramente foi feito o estudo do desenvolvimento de D. polymorpha, registrando a duração média do seu ciclo de vida bem como a maturidade sexual dos machos e fêmeas. A determinação dos elementos de Müller em D. polymorpha foi realizada por homologia de bandas com a espécie D. unipunctata. A fim de determinar os arranjos mais frequentes nas regiões de coleta, foi feito o estudo do polimorfismo de inversão cromossômica. Os arranjos 2RA e 2RD, já descritos anteriormente, apresentaram alta frequência nas populações. Estes arranjos provavelmente estão fixados nestas populações e possivelmente estão sendo mantidos pela ação da seleção natural. Com o auxílio de mapa cromossômico de D. polymorpha mais atualizado, a localização de um ponto de quebra de cada uma das inversões 2RA e 2RD foi reanotada. Também descrevemos uma nova inversão no cromossomo X de Drosophila neocardini (Grupo cardini). A expressão de puffs nos cromossomos politênicos de larvas de D. polymorpha, quando submetidas a estresse, permitiu estimar os possíveis genes hsps induzidos, quando comparando sua localização nos elementos de Müller em outras espécies. Esta análise revelou conservação entre D. polymorpha e D. unipunctata, que partilham grande reorganização gênica ao longo dos elementos quando comparadas a D. melanogaster. A análise comparativa dos elementos por homologia de bandas não verificou a ocorrência de puffs em resposta aos estresses testados (choque térmico, anoxia e privação alimentar) muito próximos ou dentro das regiões de inversão. Também não verificamos diferenças marcantes entre a expressão dos mesmos entre os indivíduos com ou sem os arranjos estudados. No entanto, o gene hsp70 não está tão distante das inversões no braço cromossômico 2R, e talvez fosse interessante testar sua expressão com métodos moleculares uma vez que mudanças na expressão de hsps tem sido importantes na adaptação de outras espécies.<br> / Abstract: The general objective of this work was to study the life cycle and chromosomal inversion polymorphisms, and their possible relation with heat shock genes. The object of our study was collected in three different conserved areas in the Santa Catarina: Parque Estadual da Serra do Tabuleiro, Reserva Biológica da Canela Preta e Reserva Biológica do Aguaí. The life cycle of D. polymorpha was described, as was the age at which sexual maturity is reached for both males and females. In order to be able to determine Müller's elements for D. polymorpha, a chromosomal homology between D. polymorpha and D. unipunctata was performed. A chromosomal polymorphism was carried out in order to establish the most frequent chromosomal arrangements in D. polymorpha from the collection sites. The arrangements 2RA and 2RD showed high frequencies in the populations. These arrangements are possibly being maintained due to natural selection. They also may have preserved the new gene configuration since they can provide a suitable combination of environmental conditions in which this species is located. Furthermore, during the study of chromosomal polymorphisms, the breakpoints of inversions 2RA and 2RD were re-evaluated. Also, a new paracentric inversion was described in chromosome X in Drosophila neocardini (cardini group). The expression of puffs in the polytene chromosomes allowed for the comparative analyses of their location and hsp genes location when they are induced in different species. The analysis showed conservation between D. polymorpha and D unipunctata elements. Also, these species have in common the extensive reorganization of their elements when compared to D. melanogaster. The comparative analysis of Müller's elements through banding homology did however not confirm occurrence of puffs in response to stressors (heat shock, hypoxi, starvation) near or inside inversion loops, neither did it produce noticeable differences between their gene expression in individuals with or without the arrangements. The hsp70 gene shows a certain proximity to the inversion loops in the chromosome 2R, and the possible intervention in its expression is not totally discarded. Its expression should be tested by means of molecular tools since changes in hsps expressions have been relevant in the adaptation reported in other species.
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A evolução e o desenvolvimento do comportamento humano : pela superação da dicotomia entre natureza e criaçãoVernal, Javier Ignacio January 2015 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas, Programa de Pós-Graduação em Filosofia,Florianópolis, 2015 / Made available in DSpace on 2015-05-26T04:08:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2015 / A indagação acerca das origens dos comportamentos dos sereshumanos não é nova, diferentes áreas do conhecimento têm oferecidorespostas para essa questão. A psicologia evolucionista surgiu nas últimas décadas do século XX como uma das disciplinas que se propõe estudar o comportamento humano desde uma perspectiva evolutiva, e postula que a mente humana está composta por múltiplos módulos mentais geneticamente especificados, surgidos ao longo da evolução por seleção natural como resposta para os problemas que os ancestrais dos humanos enfrentaram no passado evolutivo. No presente trabalho visamos argumentar que não é admissível continuar colocando aos genes como a única ou a mais importante fonte de desenvolvimento, de herança e de evolução, como o faz a psicologia evolucionista, e que é preciso superar definitivamente a dicotomia entre natureza e criação no estudo do comportamento humano. Tentaremos mostrar que é necessário abandonar a classe de indagação acerca das origens dos comportamentos dos seres humanos que procura identificar fontes causais únicas, fundamentais e independentes, e que no seu lugar devem ser estudados os processos através dos quais são construídos os comportamentos. Visando cumprir tais objetivos utilizamos como marco geral deste trabalho a perspectiva da Teoria dos Sistemas Desenvolvimentais (TSD), que oferece um modo de pensar a herança, a evolução e o desenvolvimento que não se baseia na distinção entre fontes causais essenciais e fontes causais meramente secundárias, e que postula que não há lugar para elementos nem condições causalmente mais relevantes do que outros envolvidos nesses fenômenos. Assim, em primeiro lugar abordamos o surgimento e o conteúdo da TSD, para o qual fazemos uma caracterização detalhada das principais contribuições envolvidas na elaboração dessa teoria, sobretudo dos trabalhos desenvolvidos por Zing Yang Kuo, Conrad Hal Waddington, Daniel Lehrman, Gilbert Gottlieb, Richard Lewontin e Susan Oyama. Posteriormente apresentamos os principais postulados da psicologia evolucionista e os analisamos a partir da perspectiva teórica oferecida pela TSD, o que nos permite concluir que a psicologia evolucionista, por um lado, ao contrário do que seus defensores postulam, continua sustentando a dicotomia entre natureza e criação na sua abordagem do comportamento humano e, por outro lado, outorga somente aos genes um papel central na sua compreensão da evolução e da construção dos comportamentos.Finalmente, defendemos que a partir da reformulação das noções de interacionismo, informação, herança, evolução, natureza e criação operada pela TSD é possível a construção de uma nova psicologia evolutiva que vise a compreensão dos processos através dos quais são construídos os comportamentos, que considere com ênfase similar todas os elementos e condições desenvolvimentais envolvidos nesses processos e a diversidade de sistemas de herança que são capazes de transmitir fatores nos diferentes níveis da organização biológica, e que assim consiga superar definitivamente a dicotomia entre natureza e criação.<br> / Abstract: The question about the origins of the behavior of human beings isnot new, different areas of knowledge have offered answers to thisquestion. Evolutionary psychology emerged in the last decades of the twentieth century as one of the disciplines that aims to study human behavior from an evolutionary perspective, and argues that the human mind is composed of multiple mental modules genetically specified, evolved by natural selection as the solution to problems that human ancestors faced in the evolutionary past. In this work we aim to argue that it is not possible to keep considering genes as the only or the most important source of development, inheritance and evolution and that it is necessary to overcome the dichotomy between nature and nurture in the study of human behavior. We will try to show that it is necessary to abandon the question about the origins of the behavior of human beings which seeks to identify unique, fundamental and independent causal sources, and instead it must be studied the processes that build behaviors. Aiming to achieve these goals we used the perspective of the Developmenta Systems Theory (DST) as a general framework of this study, which provides a way of thinking about inheritance, evolution and development that is not based on the distinction between essential and secondary causal sources and that postulates that there is no place for elements or conditions more causally relevant than others involved in these phenomena. Firstly, we focus on the origins and content of DST, we make a detailed characterization of the main contributions involved in the development of this theory, especially the work by Zing Yang Kuo, Conrad Hal Waddington, Daniel Lehrman, Gilbert Gottlieb, Richard Lewontin and Susan Oyama. Subsequently, we present the main tenets of evolutionary psychology and analyze them from the theoretical perspective offeredby DST. We conclude that evolutionary psychology, on the one hand, contrary to what its proponents postulate, continues to uphold the dichotomy between nature and nurture in its approach to human behavior and, on the other hand, grants only to the genes a central rolein their understanding of evolution and construction of behavior. Finally, we argue that as a result of the reformulation of someterms proposed by DST - interactionism, information, inheritance, evolution, nature and nurture - it is possible to elaborate a new evolutionary psychology aiming to understand the processes that build behaviors, giving equal consideration to all the elements and developmental conditions involved in these processes and to the diversity of inheritance systems that are capable of transmitting factors at different levels of the biological organization, in order to definitely overcome the dichotomy between nature and nurture.
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Estudo de oportunidade para a promoção de rede de pesquisa estratégica no campo da saúde: o caso do Laboratório de Biologia Molecular Aplicada LBMA/IFF/Fiocruz / I study of opportunity for the strategic research net promotion in the field of the health: the case of the laboratory of Biology Molecular Applied LBMA/IFF/FiocruzCruz, Marleide Pires January 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004 / A organização em rede através da realização de alianças externas está sendo considerada um modelo emergente para o crescimento econômico. Sua importância já está afetando, profundamente, o desenho da organização e as suas principais características na lógica da inovação. A implementação do projeto proposto nesta dissertação para o Laboratório de Biologia Molecular Aplicada-LBMA do IFF/FIOCRUZ, pela adaptação do modelo de organização em rede, permite fortalecer a identificação e a integração dos diversos atores (pólo científico) que interagem nas pesquisas clínicas na área de genética do LBMA, além de constituir meios para que se promova o contato dos diferentes grupos multidisciplinares, com o objetivo de eselecer interconexões nas etapas de geração dos produtos e processos. Face ao compromisso com essa abordagem, a proposta de promoção de rede de pesquisa estratégica integrada pelo LBMA, a partir de um estudo de possibilidades locais que permita assegurar competitividade e auto-sustenilidade, objetiva mobilizar esforços em equipe de pesquisadores e especialistas devotados às pesquisas genéticas desse Instituto e, ao mesmo tempo, promover a sua interação com diversos tipos de organizações,`tais como Universidades, organizações de pesquisas pública e privada e empresas médicas e hospitalares. O que significa maior necessidade de ampliar a base de financiamento, com a prestação de serviços referenciados de forma cooperativa, que sejam orientados por uma visão competitiva e de auto-sustentação, com vistas a assegurar bons resultados do processo produtivo. Entende-se que o reconhecimento e a legitimação social, assegurados pelo caráter de aplicabilidade dos resultados, viabilizariam equacionar problemas de financiamento do LBMA.
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