Orientador: Lilia F. R. de Souza Li / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-06T11:10:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Macedo_LuciaCosentinode_M.pdf: 2481805 bytes, checksum: 85ab094926dbe8ad65a47ec2c1c6fcf5 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A 1,25-dihidroxivitamina D é de fundamental importância na homeostase do cálcio. A vitamina D exerce suas ações através da interação com o seu receptor. O receptor da vitamina D (VDR) é membro da superfamília de receptores nucleares. O raquitismo é uma doença causada por mineralização deficiente na matriz óssea ou osteóide, afetando o desenvolvimento e a formação do osso na fase de crescimento. Mutações no receptor da vitamina D causam raquitismo dependente de vitamina D tipo II. Neste tipo de raquitismo ocorre hipocalcemia e as concentrações séricas de 1,25-dihidroxivitamina D3 são elevadas e, na maioria das vezes não há resposta ao tratamento com doses altas de 1,25-dihidroxivitamina D. Pacientes apresentam raquitismo grave de inicio precoce, nos primeiros meses de vida e a maior parte dos indivíduos apresenta pouco ou nenhum pêlo corporal (alopecia). O objetivo principal deste projeto foi a análise molecular do receptor de vitamina D (VDR) em quatro pacientes com raquitismo dependente de vitamina D tipo n que manifestaram raquitismo e alopecia. Amostras de DNA destes pacientes foram usadas para sequenciar o gene do VDR. Os cromatogramas gerados foram analisados em programas específicos, visando a busca de mutações. A análise mostrou 2 novas mutações pontuais que resultam em mudança de aminoácido (Q259E e G319V) e uma mutação que introduz um codon terminal (R73X). A cultura primária de fibroblasto proveniente de biópsia de pele dos pacientes foi usada para análise funcional do receptor. Extrato proteico nuclear mostrou redução de expressão de todos os receptores mutados. O receptor truncado contendo apenas parte do domínio de ligação com o DNA perdeu o epítopo de interação com o anticorpo usado, não sendo identificado no Western blot pelo anticorpo utilizado, impossibilitando a avaliação de sua expressão. Tratamento da cultura primária de fibroblasto com doses crescentes de l,25(OH)2 vitamina D demonstrou que os VDRs mutados foram incapazes de ser ativado e aumentar a expressão de 24-hidroxilase. Este trabalho identificou mutações em quatro pacientes com raquitismo dependente de vitamina D tipo II e estas mutações resultaram em comprometimento funcional do VDR / Abstract: The 1,25-dihydroxyvitamin D plays a fundamental role in the calcium homeostasis. The vitamin D exerts its actions through the interaction with its receptor. The vitamin D receptor (VDR) is a member of the superfamily of nuclear receptors. Rickets is a disease caused by deficient mineralization in the bone matrix or osteoids, affecting the development and formation of the bone during the growth stage. Mutations in the vitamin D receptor are associated to the vitamin D-dependent rickets type II. The biochemical characteristics is hypocalcemia and increase levels of 1,25-dihydroxyvitamin D3, and most of time there is no answer to the treatment with high doses of 1,25-dihydroxyvitamin D. Patients present rickets and or osteomalacia of varying severity beginning in the first months of life and most of the individuals presents little or any body hair (alopecia). The main objective of this project was the molecular analysis of the vitamin D receptor (VDR) in four patients with vitamin D-dependent rickets type II that manifested with rickets and alopecia. DNA samples of these patients were used to sequence the VDR gene. The generated chromatograms were analyzed in specific programs, aiming the search of mutations. The analysis showed two novel missense mutation that result in amino acid change (Q259E e G319V) and one nonsense mutations (R73X). Fibroblast primary culture derived from the patients' skin biopsy was carried out for functional analysis of the receptor. Nuclear protein extract showed reduction of expression of all mutant receptors. The truncated VDR receptor containing only part of the DNA binding domain lost the region containing the epitopo which the antibody was raised against and it was not identified by the Western blot analysis. Treatment of the fibroblast primary culture treatment with increasing doses of l,25(OH)2 vitamin D showed that the mutant VDR were unable to be activated and to increase the expression of the 24-hydroxylase. It was found mutations in the four patients with vitamin D-dependent rickets type II studied. Functional analysis confirmed that the mutations impaired the VDR activation / Mestrado / Mestre em Farmacologia

Orientador: Liana Maria Cardoso Verinaud / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T19:49:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souto_PaulaCristinadeSouza_D.pdf: 7669317 bytes, checksum: eeec29689d95e50ddec45928c2c76343 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: O Paracoccidioides brasiliensis é um fungo dimórfico que cresce na forma miceliar a temperatura ambiente e na forma de levedura a 35-37ºC. Recentemente, no laboratório de Imunopatologia do Departamento de Microbiologia e Imunologia do Instituto de Biologia da Unicamp, foi observado que uma amostra da cepa virulenta Pb18 crescia de forma diferente das outras. A análise preliminar desta cultura mostrou que o fungo se apresentava, exclusivamente, em formas intermediárias entre levedura e micélio. Assim, este trabalho teve como objetivo a caracterização parcial deste isolado atípico através da comparação com a cepa selvagem. Para tanto, foram analisados: a morfologia do isolado a 25 e 37ºC; a composição de proteínas de parede celular; o desenvolvimento da doença e a resposta imunológica adaptativa em camundongos BALB/c. Os resultados mostraram que este isolado não alterou a sua forma de crescimento, independente da temperatura de cultivo ou da passagem por animal. Através da análise das proteínas de parede celular observou-se ausência de expressão de algumas proteínas e baixa concentração da glicoproteína 43 (gp43) no fungo atípico quando comparado com o selvagem. A infecção causada por este isolado atípico foi mais branda do que aquela observada com a cepa virulenta Pb18, com completa resolução das lesões de disseminação. Entretanto, não foi possível determinar diferenças na avaliação da resposta imune adaptativa dos animais infectados com os diferentes isolados. Apesar da necessidade de mais estudos, estes resultados indicam que o isolado atípico pode vir a ser uma importante ferramenta para o estudo da biologia do fungo e sua relação com o hospedeiro / Abstract: P. brasiliensis is a dimorphic fungus that grows in mycelial phase at room temperature and in yeast form at 35-37°C. Recently, in the Immunopathology Laboratory of the Department of Microbiology and Immunology (Biology Institute/Unicamp), it was observed that a sample of the virulent strain Pb18 grew in a different way from other ones. Preliminary analysis of this culture showed that the isolated exhibited, exclusively, an intermediate form of pseudohyphae. That way, the objective of this work was the partial characterization of the atypical isolated (Pb18PH) through the comparison with the wild strain Pb18. For this, there were analyzed: the morphology of the isolated to 25 and 37ºC; the composition of cell wall proteins; the disease development and the adaptative immune response in BALB/c mice. The results showed that Pb18PH didn't alter their growth form, independently of the cultivation temperature or the passage through animal. By the analysis of the cell wall proteins, it was observed that Pb18PH didn't express some proteins and presented low concentration of the glicoprotein 43 (gp43) when compared with the wild one. The infection caused by this atypical isolated was softer than that observed with the virulent strain Pb18. Besides, it was noted the complete resolution of disseminated lesions. However, it was not possible to determine differences in the adaptative immune response evaluation of the animais infected with the different isolated. To despite the need of more studies about this atypical isolated, our results indicate that Pb18PH would come to be an important tool for the study of the fungus biology and their relationship with the host / Doutorado / Imunologia / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Orientadores: Edi Lucia Sartorato, Andrea Trevas Maciel-Guerra / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T16:54:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Miranda_PauloMauriciodoAmorDivino_M.pdf: 2620124 bytes, checksum: aacc629866a9ff7880f48f266f4f3743 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Nos seres humanos, a visão é o sentido que retrata com melhor fidelidade o ambiente que os cerca. A ausência do sentido da visão é definida como cegueira. As conseqüências da cegueira são problemas de saúde pública importantes, pois têm um impacto significativamente negativo sobre o desenvolvimento econômico e social dos indivíduos afetados. A perda visual pode ser resultado de lesão nos centros nervosos superiores, nas vias ópticas ou em estruturas do próprio olho. As causas vão desde traumas oculares até doenças congênitas, como: glaucoma congênito, catarata congênita e Neuropatia Óptica Hereditária de Leber (LHON). A LHON é uma doença, causada por alterações no DNA mitocondrial, caracterizada pela perda repentina da visão em ambos os olhos, devido a uma degeneração do nervo óptico. Atualmente, 17 principais mutações associadas à LHON foram registradas, onde três dessas mutações representam 95% dos casos (mutações primárias) e as 14 mutações subseqüentes representam apenas 5% do total (mutações secundárias). Não foram relatados, até o momento, estudos que definam a freqüência das mutações ou estudos populacionais de prevalência no Brasil. Desta forma, o presente estudo teve como principal objetivo definir a freqüência das mutações da LHON em pacientes brasileiros. Foram avaliados 55 pacientes com hipótese diagnóstica de LHON ou neuropatia óptica adquirida de origem desconhecida. Mutações primárias (G11778A, T14484C e G3460A) e mutações secundárias nos genes MT-ND1, MT-ND4, MT-ND4L, MT-ND5, MT-ND6 e MT-CYB foram rastreadas em todos os indivíduos estudados. O rastreamento das mutações primárias foi realizado pelo método de restrição enzimática. Para os pacientes que não apresentaram mutações primárias procedeu-se o seqüenciamento direto para rastrear mutações secundárias. O método de DHPLC foi padronizado para o rastreamento de mutações primárias. Mutações primárias foram encontradas em 19 pacientes, ou seja, em 38,2% dos casos. A freqüência dessas mutações ficou definida como: 67% da mutação G11778A (13 casos), 28% da mutação T14484C (5 casos) e 5% da mutação G3460A (apenas 1 caso). A mutação G11778A apresentou números próximos aos encontrados nas populações estudadas em outras partes do mundo, confirmando ser a principal causa de LHON também em pacientes brasileiros. A mutação T14484C, como na maioria das populações mundiais, mostrou-se como a segunda maior causa da LHON, porém mostrou uma freqüência quase duas vezes maior que o descrito na literatura. Enquanto que a mutação G3460A apresentou freqüência muito baixa se comparada as das demais populações estudadas. Não foram encontradas mutações secundárias. A ausência dessas mutações pode ser atribuída à possibilidade de haver mutações em regiões do DNA mitocondrial não rastreadas no presente estudo. Há também a possibilidade de os pacientes em que não foram localizadas mutações não serem portadores da LHON, apresentando outra anomalia com dados clínicos semelhantes. No presente estudo também foi possível, a partir do teste molecular a confirmação da hipótese diagnóstica de LHON em alguns pacientes / Abstract: The vision is the sense that best expresses the environment surrounding the mankind. The term blindness is used to define the absence of the vision. The consequences of blindness are important problems of public health concern as they cause a negative impact on the economic and social development of the affected individuals). The visual loss is characterized by congenital deprivation and it can be total or partial, permanent or temporary. Furthermore, visual loss may result from superior nerve centers damage, optic pathways lesions or physic damage of the eye itself. Thus, the visual loss causes range from trauma to ocular congenital diseases such as congenital glaucoma, congenital cataract and Leber Hereditary Optic Neuropathy (LHON). LHON is a mitochondrial disease characterized by sudden loss of vision in both eyes, due to an optic nerve degeneration. Currently, 17 main LHON associated mutations were published, three of which account for 95% of the cases (primary mutations) and the subsequent fourteen account for only 5% of the total (secondary mutations). The frequencies of mutations envolved in LHON in Brazilian patients have not been reported so far. Therefore, the aim of this study was to define the LHON mutations frequency in Brazilian patients. We evaluated 55 patients with LHON diagnosis or acquired optic neuropathy of unknown origin. Primary mutations (G11778A, T14484C and G3460A) and secondary mutations in the genes MT-ND1, MT-ND4, MT-ND4L, MT-ND5, MT-ND6 and MT-CYB were screened in all individuals studied. Screening of primary mutations was performed by the method of enzyme restriction. Patients who did not have primary mutations were screened for secondary mutations by direct sequencing. The DHPLC method was used for primary mutations screening. Primary mutations were found in 19 patients, ie 38.2% of cases. The frequency of these mutations was defined as 67% for the G11778A mutation (13 cases), 28% for the T14484C mutation (5 cases) and 5% for the G3460A mutation (only 1 case). The mutation G11778A showed numbers similar to those found in the populations studied in other parts of the world, confirming that the main cause of LHON also in Brazilian patients. The T14484C mutation, as in most world populations, showed up as the second leading cause of LHON, but it showed a frequency almost twice that reported. While the G3460A mutation frequency showed very low compared to the other populations studied. No secondary mutation was found. The absence of these mutations can be attributed to the possibility of mutations in mitochondrial DNA regions not screened in this study. There is also the possibility that patients in whom no mutations were not found to be carriers of LHON, with another anomaly with similar clinical data. This study evaluated the situation of primary and secondary mutations associated with LHON in a sample of Brazilian individuals. It was also possible, from the molecular testing to confirm the diagnosis of LHON in some patients / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-23T14:25:21Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Claudio Alexandre Figueira Gomes - 2011.pdf: 1082762 bytes, checksum: 0fadc2c1cf247e7acb3c2e502087bf6a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-23T14:27:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Claudio Alexandre Figueira Gomes - 2011.pdf: 1082762 bytes, checksum: 0fadc2c1cf247e7acb3c2e502087bf6a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-23T14:27:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Claudio Alexandre Figueira Gomes - 2011.pdf: 1082762 bytes, checksum: 0fadc2c1cf247e7acb3c2e502087bf6a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2011-10-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This dissertation is a study of the relationship between the concepts of “sense” and “impression” in Wittgenstein’s philosophy. In the Tractatus, the sense of a proposition is given by an a priori possibility of deducting its truth’s conditions. From 1929 onwards, with the publication of the article Some Remarks on Logical Form, Wittgenstein begins to explicitly conceive the ontological statute of tractarian reality as “phenomenological”. In the year 1930, Wittgenstein, surprisingly, presents a new philosophy rejecting what, perhaps, could be the Tractatus most characteristic thesis - the thesis of The Complete Determination of Sense. In this dissertation, we intent to investigate the possible reasons that would have caused this mutation and evaluate some probable consequences of the new conceptions of “sense” and “impression” for the Wittgenstein’s philosophy in the thirties. / Esta dissertação é um estudo da relação entre os conceitos de “sentido” e “impressão” na filosofia de Wittgenstein. No Tractatus, o sentido de uma proposição é dado pela possibilidade a priori de se deduzir suas condições de verdade. A partir de 1929, com a publicação do artigo Some Remarks on Logical Form, Wittgenstein passa a conceber explicitamente o estatuto ontológico da realidade tractariana como “fenomenológico”. A partir do ano de 1930, Wittgenstein, surpreendentemente, apresenta uma nova filosofia ao rejeitar o que, talvez, seja a tese mais característica do Tractatus – a Tese da Completa Determinação do Sentido. Com esta dissertação, pretendemos investigar as possíveis razões que teriam causado essa mutação e avaliar algumas prováveis consequências das novas concepções de “sentido” e de “impressão” para a filosofia de Wittgenstein na década de trinta.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-13T12:09:46Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cláudia de Jesus Silva Carvalho - 2015.pdf: 1551477 bytes, checksum: 310677b09bfb5d363c8bb56f37d3f55b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-13T12:11:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cláudia de Jesus Silva Carvalho - 2015.pdf: 1551477 bytes, checksum: 310677b09bfb5d363c8bb56f37d3f55b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-13T12:11:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cláudia de Jesus Silva Carvalho - 2015.pdf: 1551477 bytes, checksum: 310677b09bfb5d363c8bb56f37d3f55b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-03-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Abacavir (ABC), zidovudine (AZT) and lamivudine (3TC) are nucleoside reversetranscriptase inhibitors (NRTIs) widely used as the main axis of highly active antiretroviral therapy (HAART). Despite the effectiveness of combinations of NRTI in viral suppression, there is evidence to show that the genotoxic potential of NRTIs can be increased when administered in combination. In this context, this study proposed to investigate the toxic and genotoxic potential ABC induced when administered isolated and in combination with AZT and/or 3TC, using the wing SMART in Drosophila melanogaster. This test simultaneously evaluates two events related to carcinogenesis, mutation and somatic recombination, and is based on the identification of the mutants hairs resulting from lesions that lead to loss of heterozygosity in two marker genes involved in the formation of the wings of hair: mwh and flr3. In toxicity tests, groups of 100 larvae of third instar from the standard cross were treated for 48 hours with different concentrations of drugs. From the results obtained,was established a range of concentrations presenting more than 70% of survivors flies to proceed the analysis of genotoxicity. Employing the conditional binomial test, were compared the spots of mutants hair frequencies present in trans-heterozygotes and heterozygous flies for chromosome TM3 of each treated group with the respective controls. The results of investigations indicated that ABC was toxic to larvae in concentrations greater than 2 mg/ml. The combinations which contained ABC showed toxic effects similar to isolated ABC. All treatments were able to induce genetic alterations related to mutation and somatic recombination. Among all combinations, AZT/3TC was the one that showed less toxic and genotoxic potential at the concentrations tested. The potential recombinogenic both ABC isolated or in combination was relatively high, with indices of over 83.7%. / O abacavir (ABC), a zidovudina (AZT) e a lamivudina (3TC) são os inibidores da transcriptase reversa análogos de nucleosídeos (NRTIs) mais usados como eixo principal da terapia antirretroviral altamente ativa (HAART). Apesar da eficácia das combinações de NRTIs na supressão viral, há comprovações que demonstram que o potencial genotóxico dos NRTIs pode ser potencializado quando administrado em combinação. Neste contexto, este trabalho se propôs a investigar o potencial tóxico e genotóxico induzido pelo ABC quando administrado isoladamente e em combinação com a AZT e/ou a 3TC, utilizando o teste para detecção de mutação e recombinação em células somáticas de Drosophila melanogaster (SMART). O SMART avalia simultaneamente dois eventos relacionados com a carcinogênese, a mutação e a recombinação somática, e baseia-se na identificação de pelos mutantes resultantes de lesões que levam a perda de heterozigose em dois genes marcadores para forma dos pelos das asas: mwh e flr3. No teste de toxicidade, grupos de 100 larvas de terceiro estágio, provenientes do cruzamento padrão, foram tratados por 48 horas com diferentes concentrações dos fármacos. Dos resultados obtidos, foi estabelecida uma faixa de concentrações apresentando mais do que 70% de sobreviventes para proceder as análises de genotoxicidade. Empregando o teste binomial condicional, foram comparadas as frequências de manchas de pelos mutantes presentes nos indivíduos trans-heterozigotos e heterozigotos para o cromossomo TM3 de cada grupo tratado com seus respectivos controles. Os resultados dessas investigações indicaram que o ABC foi tóxico para as larvas em concentrações superiores a 2 mg/mL. As combinações que continham ABC apresentaram efeitos tóxicos semelhantes ao ABC isolado. Todos os tratamentos foram capazes de induzir alterações genéticas relacionadas com mutação e recombinação somática. Dentre todas as combinações, AZT/3TC foi a que demonstrou menor potencial tóxico e genotóxico nas concentrações testadas. O potencial recombinogênico tanto de ABC isolado quanto em combinação foi relativamente alto com índices superiores a 83,7%.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-03-21T17:16:47Z No. of bitstreams: 2 Tese - Ludimila Paula Vaz Cardoso - 2009.pdf: 2018391 bytes, checksum: a45731b4e5b612ada7fa15b35c75c521 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-03-22T14:04:38Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Ludimila Paula Vaz Cardoso - 2009.pdf: 2018391 bytes, checksum: a45731b4e5b612ada7fa15b35c75c521 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T14:04:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Ludimila Paula Vaz Cardoso - 2009.pdf: 2018391 bytes, checksum: a45731b4e5b612ada7fa15b35c75c521 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2009-08-04 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / HIV-1 resistance to antiretroviral (ARV): nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTI), non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTI), protease inhibitors (PI) and new ARV classes, like enfurvitide (T-20), represents a challenge for sustainable virological and immunologic responses. This study describes the prevalence of primary and secondary HIV-1 drug resistance and subtypes circulating in Central West Brazil. HIV-1 phylogenetic diversity and ARV resistance mutations were assessed among 97 ARV naïve patients, 48 ARV experienced patients and 77 HIV-1 pregnant women from Goiânia/GO. Protease (PR), partial reverse transcriptase (RT) and gp41 genes were amplified and sequenced from plasma RNA. HIV-1 pol subtypes were assigned by phylogenetic analysis and env/gag subtypes were identified by heteroduplex mobility analysis (HMA). ARV resistance mutations were analyzed by Stanford University Database, Internacional AIDS Society, Los Alamos Database and other sources. Among ARV naïve patients, primary drug resistance ranged from 8-10%. IP (n=2), NRTI (n=3), NRTI (n=1), IP+NRTI (n=1) e NRTI+NNRTI (n=3). Subtype B represented 82.5%, subtype F1 6.2%, subtype C 3.1%, BPR/F1RT 7.2% and one sample was F1PR/CBRT mosaic. Among ARV experienced patients, secondary drug resistance was 79%: NRTI (n=1), NNRTI (n=1), PI+NRTI or NRTI+NNRTI (n=20), PI+NRTI+NNRTI (n=16, considered multidrug resistant-MDR). In the HIV-1 pol gene, subtype B represented 79.2%, subtype F1 4.2%, subtype C 2.1%, F1PR/BRT 8.3% and BPR/F1RT 6.3%. Among MDR patients, the mosaic F1PR/BRT/F1ENV (n=1) and subtype BPR/BRT/BENV (n=13) were identified. G36E, N42T and N43S T-20 resistance mutations were observed in 3 MDR patients. In the group of pregnant women, none had primary drug resistance mutations. Among 42 ARV experienced pregnant women, 16.7% presented HIV-1 isolates with drug resistance mutations: NRTI (n=2), NRTI + NNRTI (n=2), PI + NTRI (n=2) and PI+NRTI+NNRTI (n=1). Regarding HIV-1 subtypes in env gag/PR RT genes, 66.2% were subtype B, 3.9% subtype C and 6.5% subtype F1. Our data from Central West Brazil show extensive genetic diversity with a significant proportion of distinct BF1 recombinants and the co-circulation of subtypes B, F1 and C. Moreover our data show that ARV naïve and ARV experienced patients, including pregnant women, can benefit from genotyping for ARV drug resistance, to improve clinical management and salvage therapy, which are also important to control HIV-1 transmission. / A resistência do HIV-1 aos antirretrovirais (ARV): inibidores da transcriptase reversa análogos a nucleosídeos e nucleotídeos (NRTI), inibidores da transcriptase reversa não análogos a nucleosídeos (NNRTI), inibidores da protease (IP) e novas classes de drogas antirretrovirais, como o enfurvitida (T-20), representa um desafio para a resposta virológica e imunológica dos pacientes HIV+/Aids. Este estudo descreve a prevalência de resistência primária e secundária do HIV-1 aos ARVs e os subtipos circulantes na região Centro-Oeste do Brasil. A diversidade filogenética do HIV-1 e as mutações de resistência foram avaliadas entre 97 pacientes virgens de tratamento, 48 pacientes em terapia ARV e 77 gestantes HIV+/Aids de Goiânia/GO. Os genes da protease (PR), parte da transcriptase reversa (TR) e da gp41 foram amplificados e sequenciados a partir do RNA plasmático. Os subtipos no gene pol foram avaliados através da análise filogenética e no gene env/gag foram identificados através da análise da mobilidade do heteroduplex (HMA). As mutações de resistência aos ARVs foram analisadas através do banco de dados da Universidade de Stanford, da Sociedade Internacional de Aids, de Los Alamos e outras fontes. Entre os pacientes virgens de tratamento, a prevalência de resistência primária variou de 8-10%: IP (n=2), NRTI (n=3), NRTI (n=1), IP+NRTI (n=1) e NRTI+NNRTI (n=3). O subtipo B representou 82,5%, o subtipo F1 6,2%, o subtipo C 3,1%, o mosaico BPR/F1RT 7,2% e uma amostra apresentou o mosaico F1PR/CBRT. Entre os pacientes em terapia ARV, a prevalência de resistência secundária foi de 79%: NRTI (n=1), NNRTI (n=1), IP+NRTI or NRTI+NNRTI (n=20), IP+NRTI+NNRTI (n=16, considerados multiresistentes-MDR). No gene pol do HIV-1, o subtipo B representou 79,2%, o subtipo F1 4,2%, o subtipo C 2,1%, o mosaico F1PR/BRT 8,3% e o mosaico BPR/F1RT 6,3%. Entre os pacientes MDR, foram identificados o mosaico F1PR/BRT/F1ENV (n=1) e o subtipo BPR/BRT/BENV (n=13). As mutações de resistência ao T-20, G36E, N42T e N43S, foram observadas em 3 pacientes MDR. No grupo das gestantes, nenhuma apresentou mutação de resistência primária. Entre 42 gestantes em tratamento ARV, 16,7% apresentaram isolados do HIV-1 com mutações de resistência aos ARVs: NRTI (n=2), NRTI+NNRTI (n=2), IP+NTRI (n=2) e IP+NRTI+NNRTI (n=1). Em relação aos subtipos do HIV-1 nos genes env gag/PR TR, 66,2% foram do subtipo B, 3,9% subtipo C e 6,5% subtipo F1. Nossos resultados do Centro-Oeste do Brasil mostram grande diversidade genética com significantiva proporção de recombinantes BF1 e a co-circulação de subtipos B, F1 e C. Além disso, nossos dados mostram que pacientes virgens de tratamento e em terapia ARV, incluindo gestantes, podem se beneficiar da genotipagem do HIV-1 para resistência aos ARVs, para melhorar a conduta clínica e a terapia de resgate, que também são importantes para o controle da transmissão do HIV-1.

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Subsequently, genotyping of three single nucleotide polymorphisms, TGFBI rs4669 and rs2072239 and VSX1 rs6138482, was performed through real-time polymerase chain reactions (qPCR). Single nucleotide polymorphisms were observed in both keratoconus patients and healthy subjects. For the VSX1 gene, allelic frequency and discrimination was similar for keratoconus patients and controls. Conversely, the frequency of the mutant allele was significantly higher for two SNPs on the TGFBI gene in patients with keratoconus. For the SNP rs4669, the patients with keratoconus had 15 % higher frequency of the mutated allele, while for the SNP rs2072239 the patients had 11 % higher frequency of the mutated allele compared to the controls. Individuals carrying the mutant allele had two-times more risk in developing the disease. The allelic discrimination of genotypes (homozygous and heterozygous) was also significantly different for both SNPs on the TGFBI gene. This study has demonstrated, for the first time, an association of SNP mutations and the development of keratoconus in Brazilian patients. The frequency of the mutant and potentially pathogenic allele on the TGFBI gene was significantly higher in patients compared to controls. Finally, these findings contribute to the advance of molecular knowledge of the pathogenesis, development of early diagnostic tools and therapeutics options for patients with keratoconus. / O ceratocone é uma desordem ocular caracterizada pelo afinamento central, protrusão e formato cônico da córnea. A progressão desta desordem causa diminuição significativa da acuidade visual. Existem evidências de que o ceratocone apresenta componente genético. Assim, o objetivo desse estudo foi avaliar a frequência de mutações de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) associados a ocorrência do ceratocone em pacientes brasileiros sem parentesco conehcido em comparação à voluntários saudáveis. Este foi um estudo clínico do tipo caso-controle com um total de 108 participantes, 46 pacientes com ceratocone e 62 voluntários saudáveis (controles). Amostras de sangue periférico foram coletadas e utilizadas para extração do DNA. Subsequentemente, o genótipo de três polimorfismos de nucleotídeo único, TGFBI rs4669 e rs2072239 e VSX1 rs6138482, foram determinados através de reações em cadeia polimerizada em tempo real (qPCR). Polimorfismos de nucleotídeo único foram observados em ambos os pacientes e controles. Para o gene VSX1 (SNP rs6138482) a frequência e discriminação alélica não houve diferenças estatisticamente significantes (p<0,005) em pacientes e controles. No entanto, para o gene TGFBI, existiram diferenças significativas em relação a frequência e discriminação alélica. Para o SNP rs4669 a frequência do alelo mutante foi 15 % maior e para o SNP rs2072239 uma frequência 11 % maior em pacientes com ceratocone comparado aos controles. Além disso, os indivíduos que apresentaram o alelo mutante têm um risco (razão de probabilidade) duas vezes maior de desenvolver a doença. Este estudo demostrou, pela primeira vez, que existe uma associação entre dois SNP e o desenvolvimento do ceratocone em pacientes brasileiros. A frequência do alelo mutante e potencialmente patogênico no gene TGFBI foi significativamente maior pacientes comparado aos controles. Concluindo, os resultados deste estudo contribuem para o conhecimento molecular da patogênese, o desenvolvimento de técnicas de diagnóstico precoce e consequentemente mais opções de tratamento para pacientes com ceratocone.

As distrofias musculares tipo cinturas (DMC) incluem um grupo heterogêneo de doenças genéticas, caracterizadas por degeneração progressiva da musculatura esquelética pélvica e escapular, cuja herança pode ser autossômica dominante (DMC1) ou autossômica recessiva (DMC2). As formas dominantes são relativamente raras, compreendendo menos que 10% dos casos. Até o momento foram mapeados 8 locos para DMC1, (DMC1A-H), onde 3 genes já foram identificados (DMC1A-C) e 17 locos para DMC2 (DMC2A-Q), onde 16 genes já foram identificados. No presente estudo, identificamos uma família uruguaia (família 1) com 11 indivíduos afetados por DMC, distribuídos em 3 gerações, com um padrão de herança autossômico dominante. Os objetivos desse trabalho foram: mapear e refinar o loco gênico associado a uma manifestação familiar de DMC1, verificar se há co-localização da região mapeada com outras formas de DMC1 descritas na literatura e, apontar genes candidatos na região mapeada e triar mutações. Foi realizado estudo de ligação, no qual mapeou-se o loco para essa doença na região 4q13-q24 com Lod score de valor máximo 4.78 para o marcador D4S414. A região foi delimitada entre os marcadores D4S392 e D4S1572. A análise da região redefiniu o loco em 4q21.22-21.23, com uma redução de 33 Mb para 4Mb. Esse loco compreende a DMC1G (família 2), descrita anteriormente pelo nosso grupo. A triagem de mutação, realizada em amostras de afetados das duas famílias, nos permitiu encontrar uma alteração Thr141Iso no exon 5 do gene FAM175A apenas nos pacientes da família 2. Essa mesma alteração foi encontrada em 1 dos 500 controles testados, o que não nos permite excluir esse gene como um candidato para DMC1G já vez que essa frequência foi inferior a 1%. O fato dessa alteração não ter sido vista na família 1 também não nos permite excluí-lo, pois foi sequenciada apenas a região exônica e a metodologia utilizada também não nos permite verificar deleções nem duplicações. Estudos mais detalhados precisam ser realizados a fim de elucidar: (1) se a alteração desse gene é a causadora dessas DMCs ou, (2) se excluído esse gene, poderia ser o responsável. / Limb girdle muscular dystrophy (LGMD) include a heterogeneous group of genetic diseases characterized by progressive degeneration of skeletal muscles of the pelvic and scapular girdles, whose inheritance may be autosomal dominant (LGMD1) or autosomal recessive (LGMD2). The dominant forms are relatively rare, comprising less than 10% of cases. So far eight loci were mapped for LGMD1 (LGMD1A-H), where three genes have been identified (LGMD1A-C) and 17 loci for LGMD2 (LGMD2A-Q), with 16 identified genes. In this study, we analised a family from Uruguay (family 1) with 12 individuals affected by LGMD, with an autosomal dominant pattern distributed in three generations. The objectives of this study were: to map and refine the gene locus associated with a familial DMC1, check for co-location of the mapped region to other forms of DMC1 described in the literature and, to point candidate genes mapped in the region and to screen mutations. A linkage study was conducted, and we mapped the locus for this disease in the region 4q13-q24 with a maximum Lod score of 4.78 for marker D4S414. The region was defined between markers D4S392 and D4S1572. The analysis of the region has redefined the locus to 4q21.22-in 21:23, a reduction from 33 Mb to 4 Mb. This site includes LGMD1G (family 2), previously described by our group. Mutation screening, performed on samples of affected pacients from both families, allowed us to find a modification Thr141Iso in exon 5 on FAM175A gene only in patients of family 2. This same alteration was found in one of the 500 controls tested but does not allow us to exclude this gene as a candidate for LGMD1G since that frequency was less than 1%. The fact that this change was not seen in a family 1 does not allow us to exclude it either because only the exonic region was sequenced and the methodology used does not allow us to detect deletions or duplications. More detailed studies should be conducted to elucidate: (1) whether the alteration found in this gene is the cause of these DMCs, or (2) if not this gene, which could be the one responsible.

A hemocromatose é uma desordem caracterizada por armazenamento alterado de ferro em órgãos vitais. A hemocromatose hereditária pode ser causada por mutações nos genes HFE, SLC40A1, HAMP, HJV e TfR2. A forma adquirida da doença pode ser ocasionada por sobrecarga de ferro, alcoolismo, infecção pelo vírus da hepatite C, anemias hemolíticas e doença hepática crônica. O objetivo deste estudo foi descrever as variantes do gene SLC401 em uma série de casos de pacientes em seguimento no ambulatório de Hematologia do Hospital das Clínicas da FMUSP com hemocromatose hereditária e adquirida e verificar se estas variantes poderiam estar associadas a um pior quadro de hemocromatose. No período de 2008 a 2011 foram coletadas 54 amostras de pacientes com diagnóstico prévio de hemocromatose, acompanhados no ambulatório de anemias do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Os pacientes foram separados, de acordo com a suspeita clínica, em dois grupos: 38 pacientes com Hemocromatose Hereditária e 16 pacientes com Hemocromatose Adquirida. O DNA foi extraído de sangue periférico pelo kit Qiamp Blood, e as amplificações dos exomas descrito por Wakusawa (2005). As reações de sequenciamento foram realizadas no aparelho AB 3130 e as sequências do gene editadas, alinhadas no programa Sequencer e comparadas com GenBank. Os pacientes com hemocromatose hereditária e adquirida (secundária) apresentaram uma frequência acima de 45% entre a faixa etária de 40 a 60 anos, mostrando uma sobrecarga de ferro mais tardia. O gênero masculino apresentou maior frequência em ambos os grupos (superior a 60%), já em relação à etnia/cor da pele, mais de 80% eram brancos. No diagnóstico laboratorial de ferritina, ferro, CTLF e IST dos pacientes com hemocromatose hereditária e adquirida (secundária) mostra que não houve diferenças significativas. As mutações no gene HFE nos pacientes com hemocromatose hereditária foram C282Y homozigose (21%) e na adquirida (secundária) H63D heterozigose (25%). Entre as mutações do gene HFE, não houve diferença estatística significativa nos grupos. A mutação foi identificada no éxon 3 do gene SLC40A1, no códon 80, descrita p.I80L (c.586C>A). No éxon 4 do gene SLC40A1 foram identificados 3 polimorfismos com a substituição de um nucleotídeo nas posições: c. A630G (190437579), c.648A>G (190437597), c.738Y>C (190437688). Já no éxon 6 foram identificados dois polimorfismos c.1014C>T (190430229) e c.1014Y>T (190430229). As mutações encontradas no gene HFE e SLC40A1 estão associadas com a sobrecarga férrica caracterizando a hemocromatose hereditária. Os polimorfismos encontrados no gene SLC40A1 foram identificados nos pacientes com hemocromatose hereditária e adquirida (secundária) numa frequência de 50%, semelhante aos doadores de sangue, sugerindo que este polimorfismo provavelmente não contribui para o desenvolvimento da doença. / Hemochromatosis is a disorder characterized by altered storage iron in vital organs. Hereditary hemochromatosis can be caused by mutations in the HFE gene, SLC40A1, HAMP, and HVJ TFR2. The acquired form of the disease can be caused by iron overload, alcoholism, infection by the hepatitis C virus, hemolytic anemias and chronic liver disease. The objective of this study was to describe variants of the SLC401 gene in a number of cases of patients being followed at hematology clinic Hospital das Clínicas FMUSP with hereditary hemochromatosis and acquired and verify that these variants could be associated with a worse hemochromatosis frame. In the period 2008 to 2011 were collected 54 samples from patients previously diagnosed with hemochromatosis, anemia accompanied the clinic of the Hospital das Clinicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo. The patients were divided, according to clinical suspicion, into two groups: 38 patients with Hereditary Hemochromatosis and 16 patients with Acquired Hemochromatosis. The DNA was extracted from peripheral blood by Qiamp Blood Kit, and amplifications of exomas described by Wakusawa (2005). The sequencing reactions were performed in AB 3130 apparatus and the sequences of the gene edited, aligned in Sequencer program and compared with GenBank. Patients with hereditary hemochromatosis and acquired (secondary) had a frequency above 45% between the age group 40-60 years showing a later iron overload. The males showed higher frequency in both groups (over 60%), as compared to ethnicity / skin color, over 80% were white. In the laboratory diagnosis of ferritin, iron, TIBC and STI patients with hereditary hemochromatosis and acquired (secondary) shows no significant differences. Mutations in the HFE gene in patients with hereditary hemochromatosis C282Y homozygosity were (21%) and acquired (secondary) H63D heterozygosity (25%). Between HFE mutations, there was no statistically significant difference in the groups. The mutation was identified in exon 3 of the SLC40A1 gene at codon 80, described p.I80L (c.586C> A). In exon 4 of the SLC40A1 gene were identified polymorphisms 3 with substitution of a nucleotide in position: c. A630G (190,437,579), c.648A> L (190,437,597), c.738Y> C (190 437 688). Already in exon 6 were identified two polymorphisms c.1014C> T (190 430 229) and c.1014Y> T (190 430 229). The mutations found in the HFE gene and SLC40A1 are associated with iron overload characterizing hereditary hemochromatosis. The polymorphisms found in the SLC40A1 gene have been identified in patients with hereditary hemochromatosis and acquired (secondary) at a frequency of 50%, similar to blood donors, suggesting that this polymorphism will probably not contribute to the development of the disease.

Este trabalho é uma análise crítica do tema da mutação constitucional. Buscouse a partir da revisitação de temas como o constitucionalismo e do conceito de Constituição, construir uma dogmática da mutabilidade das normas constitucionais e assim procedendo, verificar empiricamente, com base em precedentes da jurisprudência do Supremo Tribunal Federal, o acerto desta construção. Uma vez estabelecidas as bases para a verificação do fenômeno da mutação constitucional, foi possível parametrizar os limites possíveis a esta hipótese de atualização das normas constitucionais. Pois bem, nesses termos, fixado o conceito, verificado a sua aplicabilidade na jurisprudência, bem como estabelecidos os limites de sua utilização, foi possível ainda a partir da análise do contexto atual em que se insere o instituto, vislumbrar as hipóteses de sua aplicação futura. Em suma, trata-se de um trabalho no qual se tenta compreender o papel da jurisdição constitucional com respeito ao tema de mutabilidade das normas constitucionais, sobretudo diante da realidade pós-moderna circundante, que pela sua complexidade, influencia, sensivelmente, a normatividade dos preceitos legais e, notadamente, dos constitucionais, objeto principal do estudo. / This work is a critical analysis of the issue of constitutional change. We sought from revisiting issues such as constitutionalism and the concept of constitution building a dogmatic mutability of constitutional norms and in so doing, to verify empirically, based on the precedents jurisprudence of the Supreme Court, the correctness of this construction. Once established the basis for the verification of the phenomenon of constitutional change, it was possible to parameterize the possible limits to this hypothesis update of constitutional norms . Well , in these terms , the concept set, verifying their applicability in case law as well as established the limits of their use, it was still possible from the analysis of the current context in which it appears the institute, envision the chances of its future application. In short, it is a work in which one tries to understand the role of constitutional jurisdiction with respect to the theme of mutability of constitutional norms, particularly in the surrounding postmodern reality, which by their complexity, significantly influences the normativity of legal precepts and especially, constitutional, the main object of study.