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Sistemática molecular e biogeografia dos Monogenoidea (Platyhelminthes: Cercomeromorpha), parasitas das brânquias de Potamotrygonidae (Condrichthyes: Rajiformes: Myliobatoidei) / Molecular Systematics and Biogeography of Monogenoidea (Platyhelminthes: Cercomeromorpha), Gill Parasites of Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Rajiformes: Myliobatoidei)Ale, Karin Hoch Fehlauer 16 September 2009 (has links)
O continente sul-americano é a única região biogeográfica onde podemos encontrar um grupo estenohalino de elasmobrânquios: as arraias da família Potamotrygonidae. Entre 19 e 21 espécies de potamotrigonídeos estão taxonomicamente organizadas em três gêneros, distribuídas pelas bacias dos rios Atrato, Magdalena, Maracaibo, Orinoco, Essequibo, Amazonas e do Prata, os quais desembocam no Oceano Atlântico e no Mar do Caribe. Diversos cenários biogeográficos postulados para explicar a presença de linhagens predominantemente marinhas nos sistemas fluviais da América do sul foram propostos. O mais aceito para a origem e diversificação de Potamotrygonidae é a de invasão de um ancestral caribenho no sistema fluvial sul-americano durante as ingressões marinhas do Mioceno inferior no noroeste do continente, seguido de isolamento por alteração dos padrões de drenagens do Orinoco e formação dos Andes. A fauna parasitária de Potamotrygonidae está representada predominantemente por membros de Cercomeromorpha, um clado composto por linhagens de platelmintos membros de Cestoda e Monogenoidea. Dois gêneros de monogenóideos parasitas branquiais podem ser encontrados em potamotrigonídeos: Potamotrygonocotyle (Monocotylidae), para o qual 12 espécies são conhecidas, e a monotípica Paraheteronchocotyle amazonense (Hexabothriidae). O objetivo desta tese é propor uma hipótese de relacionamento filogenético baseada em dados moleculares para as espécies de Potamotrygonocotyle, e discutir padrões de evolução da espécie P. aramasae e seu hospedeiro Paratrygon aiereba, distribuídos em diferentes rios amazônicos. Sequências nucleotídicas do gene mitocondrial cox1 e nuclear ITS1 foram utilizadas simultaneamente em uma busca de uma hipótese filogenética para todas as espécies conhecidas de Potamotrygonocotyle. Os resultados recuperaram o status monofilético de cinco espécies, sugeriram complexos de linhagens crípticas para três espécies nominais e revelaram relacionamentos de grupo-irmão não detectados na hipótese filogenética mais recente para o gênero, baseada em dados morfológicos. Adicionalmente, os resultados apresentados suportam decisões taxonômicas recentes envolvendo sinonímias entre espécie nominais de Potamotrygonocotyle. Finalmente, os relacionamentos filogenéticos de haplótipos de diferentes populações de P. aramasae e seu hospedeiro P. aiereba foram acessados pela análise cladística de múltiplos marcadores mitocondriais, com o objetivo de se detectar possíveis padrões filogeográficos e testá-los sob predições filogenéticas de três hipóteses de diversificação amazônica (Hidrogeológica, de Museu e Paleogeográfica). Sequências dos genes ribossomal 16S e citocromo oxidase 1 foram obtidas para espécimes de parasitas de seis sub-bacias amazônicas. Os hospedeiros foram amostrados em 10 sub-bacias amazônicas e na sub-bacia do rio Essequibo, para os quais foram obtidas sequências nucleotídicas dos genes mitocondriais citocromo oxidase 1, citocromo b e ATPase. Os resultados sugerem a ausência de padrões filogeográficos para o parasita, cujos resultados indicam um modelo de alta dispersão. Em contraste, P. aireba é caracterizada por populações bem estruturadas, de acordo com as sub-bacias amostradas. O padrão filogeográfico geral desta espécie é concordante com as predições da Hipótese de Museu (linhagens mais antigas em rios dos escudos pré-cambrianos; linhagens apicais na bacia sedimentar amazônica). / South America is the only biogeographical region in the world where is possible to find an exclusive stenohalin group of elasmobranchs: the Potamotrygonidae stingrays. Between 19 and 21 species of potamotrygonid stingrays are taxonomically organized in three genera, distributed in the Atrato, Magdalena, Maracaibo, Orinoco, Essequibo, Amazonas e la Plata river Basins, discharging in both Atlantic and Caribbean waters. Distinct biogeographical scenarios have been proposed to explain the presence of predominantly marine lineages in the south American fluvial systems. The most accepted theory for Potamotrygonidae is the invasion of a Caribbean ancestor in the south-American freshwater system during the marine ingression of the early Miocene in the northwest of the continent, followed by its isolation due alterations of Orinoco rivers drainage patterns, as well as formation of Andes. The parasitic fauna of potamotrygonids is predominantly represented by members of Cercomeromorpha, a clade composed by members of Cestoda and Monogenoidea. Two genera of gill parasites monogenoidean might be found in potamotrygonids: Potamotrygonocotyle (Monocotylidae), for which 12 species are currently recognized, and the monotypic Paraheteronchocotyle amazonense (Hexabothriidae). The goal of this study is to propose a phylogenetic hypothesis based in molecular data for members of Potamotrygonocotyle, as well as to discuss evolutionary patterns of the species P. aramasae and its host Paratrygon aiereba, distributed through different amazon rivers. Nucleotide sequences of the mitochondrial gene cox1, and the nuclear gene ITS1 were simultaneously used to infer phylogenetic sister-group relationships among allrecognized species of Potamotrygonocotyle. The results recovered the monophyletic status of five species, suggested cryptic lineages for three species complexes, and revealed sister-groups relationships not detected previously by the phylogenetic analysis of morphological data. Additionally, the results supports recent taxonomic decisions involving synonyms among nominal species within the genus. The phylogenetic relationships of haplotypes from distinct populations of the parasite P. aramasae, as well as from its host Paratrygon aiereba, were accessed by the cladistic analysis of mitochondrial markers, in an attempt of detecting possible phylogeographic patterns, and to test them against phylogenetic predictions of three amazonian bio-diversification hypotheses (Hydrogeology, Museum, Paleogeography). Sequences of the ribosomal 16S gene and cytochrome oxidase 1 were obtained from parasite specimens collected in six amazon sub-basins. The hosts were sampled in 10 amazon sub-basins, as well as in the Essequibo sub-basin, for which cythocrome oxidase 1, cythocrome b, and ATPase sequences were obtained. No clear phylogeographic patterns were revealed for theparasite haplotypes, and the results suggest a high dispersion model. In contrast, P. aiereb is characterized by strongly structured populations, according to the sub-basin sampled. The general phylogeographic pattern recovered for this species is in agreement with the Museum Hypothesis predictions (older lineages in rivers of the pre-cambrian shields; apical lineages inhabiting the sedimentary amazon basin).
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Prevenção da estenose de esôfago após dissecção endoscópica da submucosa: revisão sistemática e metanálise / Prevention of esophageal stricture after endoscopic submucosal dissecton: systematic review and meta-analysisOliveira, Joel Fernandez de 07 December 2017 (has links)
Introdução: A dissecção endoscópica submucosa (ESD) de neoplasias superficiais extensas de esôfago pode evoluir com altas taxas de estenose pós operatória, resultando em uma importante piora na qualidade de vida. Diversas terapias estão disponíveis para prevenir essa complicação. Entretanto, até o momento, nenhuma revisão sistemática e metanálise foram realizadas para avaliar esses resultados. Métodos: Uma revisão sistemática e metanálise foram realizadas utilizando as bases de dados eletrônicas Medline, Embase, Cochrane, LILACS, Scopus e CINAHL. Ensaios clínicos e estudos observacionais foram pesquisados de março de 2014 a fevereiro de 2015. Os termos pesquisados foram: endoscopy, ESD, esophageal stenosis, e esophageal stricture. Três estudos retrospectivos e quatro prospectivos (três randomizados) foram selecionados. Um total de 249 pacientes com diagnóstico de neoplasia superficial de esôfago, submetidos a ESD de pelo menos dois terços da circunferência do órgão foram incluídos. Foram selecionados estudos comparando diversas técnicas para prevenir a estenose de esôfago após extensa ESD. Resultados: Foram realizadas diferentes metanálises com ensaios clínicos randomizados (RCT), ensaios clínicos não randomizados (non- RCT) e uma análise global. Nos RCT (três estudos, n=85), a terapia preventiva diminuiu o risco de estenose (diferença de risco = - 0,36, IC 95% - 0,55 a - 0,18, p = 0,0001). Dois estudos (um randomizado e um não randomizado, n = 55) demonstraram que a terapia preventiva diminui o número médio de dilatações (diferença média = - 8,57, IC 95% - 13,88 a - 3,25, p < 0,002). Não houve diferenças significativas em três RCT em relação à taxa de complicações entre pacientes submetidos à terapia preventiva e aqueles não submetidos (diferença de risco = 0,002, IC 95% -0,09 a 0,14, p = 0,68). Conclusão: O uso da terapia preventiva após extensa ESD no esôfago, reduz o risco de estenose e o número de dilatações endoscópicas para resolução da estenose, sem aumentar o número de complicações / Background: Endoscopic submucosal dissection (ESD) of extensive superficial cancers of the esophagus may progress with high rates of postoperative stenosis, resulting in significant decrease in quality of life. Several therapies are performed to prevent this complication. However, they have not yet been compared in a systematic review. Methods: A systematic review of the literature and meta-analysis were performed using the Medline, Embase, Cochrane, LILACS, Scopus, and CINAHL databases. Clinical trials and observational studies were searched from March 2014 to February 2015. Search terms included: endoscopy, endoscopic submucosal dissection, esophageal stenosis, and esophageal stricture. Three retrospective and four prospective (3 randomized) cohort studies were selected. They involved 249 patients with superficial esophageal neoplasia who underwent ESD of at least two-thirds of the circumference. We grouped trials comparing different techniques to prevent esophageal stenosis post-ESD. Results: Were realized different meta-analyses on randomized clinical trials (RCT), non-RCT, and global analysis. In RCT (3 studies, n=85), preventive therapies decreased the risk of stenosis (risk difference = -0.36, 95% CI= -0.55 to -0.18, p = 0.0001). Two studies (1 randomized, 1 non-randomized, n = 55) showed that preventive therapies lowered the average number of endoscopy dilatations (mean difference = -8.57, 95% CI = -13.88 to -3.25, p < 0,002). There were no significant differences in the 3 RCT studies (n=85) with regards to complication rates between patients with preventive therapies and those without (risk difference = 0.02, 95% CI = -0.09 to 0.14, p = 0.68). Conclusion: The use of preventive therapies after extensive ESD of the esophagus reduces the risk of stenosis and the number of endoscopic dilatations for resolution of stenosis without increasing the number of complications
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"O geóide gravimétrico e o nível médio do mar na região do Datum altimétrico brasileiro: um estudo comparativo" / A comparative study on the gravimetric geoid and the brasilian altimetric Datum.Lopes, Alexandre Bernardino 17 May 2006 (has links)
Um estudo sobre a compatibilidade de um geóide gravimétrico recente com o nível médio do mar no Datum altimétrico do Sistema Geodésico Brasileiro (SGB), foi realizado. A metodologia usada consiste na comparação do geóide gravimétrico com o nível médio do mar, materializado pelo marégrafo de Imbituba (SC), e análise dos desníveis entre os marégrafos da costa brasileira em relação ao de Imbituba, determinados por nivelamento geométrico e dados oceanográficos. A unificação de Data altimétricos, investigada em vários centros de pesquisas geodésicas, visa homogeneizar altitudes ortométricas em escalas regional e global através de técnicas espaciais de posicionamento e modelos geoidais gravimétricos. Entre as propostas para a unificação de Data altimétricos, a utilização de modelos geoidais gravimétricos vem se mostrando adequada tanto do ponto de vista teórico como prático. Assim, foi determinada a componente sistemática no Datum de Imbituba, a partir da comparação de um geóide gravimétrico da América do Sul, obtido através da colocação por mínimos quadrados, e o geóide GPS/nivelamento, determinado através dos dados da Rede GPS do Sul/Sudeste do Brasil (RGSB). Para representar a componente sistemática no Datum altimétrico brasileiro, foram usados três formas: 1) determinação da componente sistemática na RN fundamental da RAFB (RN 4X), 2) cálculo da média ponderada da componente sistemática a partir das RNs mais próximas ao Datum, e 3) modelagem da componente sistemática usando modelo matemático da transformação de similaridade a partir de todos os dados da RGSB. Os resultados, obtidos no cálculo do nível médio do mar a partir de dados oceanográficos, mostram que as diferenças em relação ao marégrafo de Imbituba são, em grande parte, causadas por mudanças das características oceanográficas (salinidade, temperatura, densidade e pressão) ao longo da costa. A remoção da componente sistemática, obtida no Datum, diminuiu significativamente a diferença entre os geóides gravimétrico e GPS/nivelamento nas RNs da RAFB; entretanto o ajuste da componente sistemática, através da transformação de similaridade, utilizando todos os dados da RGSB, apresentou os melhores resultados na compatibilização dos geóides gravimétricos e GPS/nivelamento. ix / A study on the compatibility of a recent gravimetric geoid with the mean sea level in altimetric Datum of the Sistema Geodésico Brasileiro (SGB) was accomplished. The used methodology consists in comparing gravimetric geoid with mean sea level, at the tide gauge of Imbituba (SC), and the analysis of differences among tide gauges of Brazilian coast with respecto Imbituba, obtained by geometric levelling and oceanographic data. The unification of altimetric Data, investigated in several geodetic research centres, aiming the standardization of orthometric heights in regional and global scales by using spatial positioning techniques, and gravimetric geoid models. Among the suggestions for the altimetric Data unification, the use of gravimetric geoid models is adequate in both, theoretical and practical points of view. Thus, a systematic component at Imbituba Datum was determined by comparing a South American gravimetric geoid, obtained by least-squares collocation, and GPS/levelling geoid, determined at stations of the Rede GPS no Sul/Sudeste do Brasil (RGSB). To represent the systematic component in Brazilian altimetric Datum, three aproaches were used: 1) determining the systematic component at the fundamental benchmark of the RAFB (RN 4X); 2) computing the weighted mean from the stations closer to the Datum, and 3) modelling the systematic component by using the similarity transformation model from all stations of the RGSB, The results of mean sea level, computed from oceanographic data, show that differences with respect to Imbituba tide gauge are mostly due to oceanographic characteristics, (salinity, temperature, density, and pressure) along the coast. The removal of systematic component at Datum, has significantly reduced the difference between gravimetric and GPS/levelling geoids; however, the adjustment of systematic component by using the similarity transformation model, has shown the best results in representing the differences between gravimetric and GPS/levelling geoids.
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Tendencias de diseños metodológicos en las publicaciones indexadas sobre la satisfacción laboral del profesorado universitario / Trends in Methodological Designs in Indexed Publications on Job Satisfaction of University ProfessorsLimaymanta-Álvarez, César Halley 01 1900 (has links)
El objetivo del presente estudio es realizar una revisión sistemática de las tendencias del diseño metodológico usadas en los artículos de investigación cuya temática principal es la satisfacción laboral del profesorado universitario. Se identifican las tendencias sobre el método de investigación; la condición del instrumento de medición; las técnicas para la recolección de información, las de muestreo y las estadísticas usadas en el análisis. Luego de una búsqueda sistemática en Proquest y Redalyc (bases de datos bibliográficas), según criterios de inclusión y exclusión, se analizaron 49 artículos publicados entre el 2000 y el 2016. Esta revisión permitió identificar que casi la mitad de los artículos seleccionados pertenecen a los últimos 6 años (44.9%), lo cual revela sumo interés sobre el tema. El enfoque metodológico más frecuente es el cuantitativo (89.8%); predomina la adaptación de los instrumentos (53.1%); y se mencionan las propiedades psicométricas de validez y confiabilidad en un 42.9%. El muestreo probabilístico y no probabilístico se usa con la misma frecuencia (36.7%); asimismo, en un 83.3% se utiliza la estadística descriptiva. Sin embargo, para el análisis inferencial se evidenció un mayor uso de pruebas estadísticas paramétricas que las no paramétricas. Los resultados evidencian que existen múltiples formas para realizar el diseño metodológico, tanto en el uso del instrumento de recolección de datos como en el uso de métodos de análisis de información. / This study aims to perform a systematic review of the trends of the methodological design
used in research articles whose main theme is the job satisfaction of the university teaching staff. The
trends on the research method, the condition of the measurement instrument, the techniques for the
collection of information, the sampling techniques, and the statistical techniques used in the analysis
are identified. After a systematic search in Proquest and Redalyc (bibliographyc databases), according to
inclusion and exclusion criteria, 49 articles published between 2000 and 2016 were analyzed. This review
allowed us to identify that almost half of the articles selected belong to the last six years (44.9%), which
reveals a great interest in the subject. The most frequent methodological approach is the quantitative
one (89.8%), the adaptation of the instruments predominates (53.1%), and the psychometric properties
of validity and reliability are mentioned at 42.9%. A probabilistic and non-probabilistic sampling is used
with the same frequency (36.7%); likewise, descriptive statistics are used in 83.3%. However, for the
inferential analyses, there was greater use of parametric statistical tests than nonparametric ones. The
results show that there are multiple ways to carry out the methodological design, both in the use of the
data collection instrument and in the use of information analysis methods. / Revisón por pares
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Estudos moleculares em acipitrídeos (Aves, Accipitridae): uma perspectiva evolutiva / Molecular studies with accipitrids (Aves, Accipitridae): an evolutionary perpectiveAmaral, Fábio Sarubbi Raposo do 07 May 2008 (has links)
A família Accipitridae representa uma das maiores radiações de aves atuais, ocupando habitats diversos em grande parte do planeta. Entre as divisões propostas para a família no passado, o grupo dos gaviões buteoninos figura entre um dos poucos que se aproximam em composição a uma linhagem monofilética, de acordo com análises filogenéticas recentes. Além de ocorrer tanto no Novo Mundo como no Velho Mundo, a maior parte das espécies de gaviões buteoninos está concentrada na América do Sul e na América Central, o que os torna um modelo atrativo para a análise de padrões e processos de diversificação em escalas continental e local. Outro aspecto interessante do grupo é o grande número de espécies migratórias, padrão ainda pouco explorado sob uma perspectiva filogenética. Os principais objetivos deste trabalho foram inferir as relações filogenéticas entre as espécies de gaviões buteoninos, analisar a evolução do comportamento migratório no grupo, e inferir padrões e processos de diversificação, com ênfase na região Neotropical. Foram utilizados mais de 7.000 pares de base de DNA mitocondrial e nuclear de 51 espécies de gaviões buteoninos, compreendendo o maior estudo filogenético do grupo até o momento. Do total de seqüências utilizadas, cerca de um terço foi representado por seqüências de DNA do 12S, tRNAVal e 16S, que contém uma proporção de sítios de evolução dependente resultante da existência de uma estrutura secundária. Como forma de avaliar o impacto destes sítios nas estimativas, foram também realizadas análises alternativas que incorporaram informação de estrutura secundária. Devido à indisponibilidade de um modelo de estrutura secundária de 16S para aves, este foi aqui elaborado com base em uma análise comparativa de representantes de todas as ordens de aves atuais. Os resultados sugerem que os gêneros Buteo, Leucopternis e Buteogallus como atualmente reconhecidos não são monofiléticos, o que ressalta a falta de concordância entre a classificação atual e a histórica evolutiva do grupo. Cinco linhagens principais foram encontradas, sendo a base da árvore composta por espécies predominantemente neotropicais, e a porção mais derivada principalmente por espécies neárticas e do Velho Mundo. Este resultado, associado às estimativas de tempo de divergência, sugere um longo período de diversificação na região Neotropical (com início entre o Oligoceno Superior ou o Mioceno, e se estendendo até o Pleistoceno), com colonização e diversificação recentes na região Neártica e no Velho Mundo (com início no Mioceno Superior ou no Plioceno, se estendendo até o Pleistoceno). O comportamento migratório evoluiu diversas vezes, e pode ter contribuído para a diversificação de algumas espécies, ao possibilitar a colonização de habitats antes não ocupados e promover especiação em ilhas. Na região Neotropical, disjunções de espécies de florestas de terras baixas que ocupam áreas a leste e oeste dos Andes ocorreram quatro vezes, possivelmente em dois eventos vicariantes. As disjunções mais antigas podem ter sido causadas pelo soerguimento da cordilheira, enquanto não foi possível definir claramente os processos envolvidos nas especiações mais recentes. Foram encontradas duas linhagens distribuídas em habitats alagados e ripários. Os resultados sugerem não somente um longo processo de diversificação, de forma independente das espécies de florestas não alagadas, mas também conexões históricas entre florestas de várzea da Amazônia e habitats costeiros. Espécies florestais e de áreas abertas não são reciprocamente monofiléticas. De forma similar, em alguns casos, espécies pertencentes a um mesmo bioma não são proximamente relacionadas, o que sugere uma história complexa de diversificação na região. A utilização de dados de sítios emparelhados de seqüências de RNA não trouxe mudanças significativas nas topologias e inferências de tempo de divergência, possivelmente devido à baixa variação das hastes neste grau de divergência. / The family Accipitridae represents one of the largest radiations of modern birds, with species being found in a plethora of habitats around the world. Among the divisions proposed for the family in the past, the group of the buteonine hawks is one of the few that approximate monophyletic lineages, according to recent phylogenetic analyses. Besides occurring both in the New World and Old World, most buteonine hawk species are mainly found in Central and South America, what provides an opportunity to evaluate patterns and processes of diversification in both continental and local scales. The main goals of this work were to infer phylogenetic relationships among species of buteonine hawks, analyze the evolution of migratory behaviour, and evaluate patterns and processes of diversification, especially in the Neotropical region. We obtained more than 7.000 base pairs of mitochondrial and nuclear DNA sequences from 51 species of buteonine hawks, what comprises the largest phylogenetic analysis of the group so far. Approximately one third of the total dataset was obtained from DNA sequences of 12S, tRNAVal and 16S, which are known to have paired sites that evolve in concert due to the presence of a secondary structure. Alternative analyses incorporating such information have been performed, as a way to evaluate the effects of secondary structure in the phylogenetic analyses. Since a model of secondary structure of 16S of birds was not available so far, we build one based on comparative analysis of representatives of all modern avian orders. The results suggest that the genera Buteo, Leucopternis and Buteogallus as currently accepted are not monophyletic, what stress a lack of concordance between current classification and the evolutionary history of this group. Five main lineages were found, and the most basal part of the topology is composed by mainly neotropical species, while the majority of neartic and Old World species were positioned in the most derived part of the tree. Together with divergence time estimates, those results suggest a long period of diversification in the Neotropics (possibly beginning in the Upper Miocene or Oligocene, and extending to the Pleistocene), with a latter colonization and diversification of the Neartics and Old World (possibly beginning between the Upper Oligocene or Pliocene, and extending to the Pleistocene). Migratory behaviour evolved several times, and may have contributed to diversification by means of exploitation of previously unavailable habitats as well as promotion of speciation in islands. Lowland species disjunctions between each side of the Andes occurred four times, possible due to two vicariant events. The earliest disjunctions may have been caused by Andean orogeny, but no process could be clearly attributed to the two most recent speciations. Two lineages restricted to flooded habitats were found. The results suggest not only a long process of diversification in such habitats, independently of species of non-flooded habitats, but also a historical relationship between várzea forests in Amazonia and costal habitats. Similarly, species that occupy the same biome are not the closest relatives in several cases, what suggests a complex history of diversification in the Neotropical region. Inclusion of secondary structure information did not affect significantly phylogenetic and divergence time estimates, likely due to the low variation in stems in such level of divergence.
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Taxonomia e análise filogenética das espécies historicamente associadas a Mallodeta Butler, 1876 (Lepidoptera, Noctuidae, Arctiinae, Eurochromiina) / Taxonomy and phylogenetic analysis of the species historically associated with Mallodeta Butler, 1876 (Lepidoptera, Noctuidae, Arctiinae, Euchromiina)Pinheiro, Lívia Rodrigues 01 June 2009 (has links)
O gênero Mallodeta Butler, exclusivamente neotropical, contava, no início deste estudo, com seis espécies: M. clavata (Walker) (espécie-tipo), M. sortita (Walker), M. consors (Walker), M. sanguipuncta Druce, M. cubana Gaede e M. simplex Rothschild. Estas espécies, mais Phoenicoprocta parthenii (Fabricius), outrora também considerada integrante daquele gênero, foram estudadas quanto às suas relações filogenéticas. A hipótese de monofiletismo de Mallodeta não foi corroborada, sendo as espécies historicamente associadas ao gênero doravante consideradas pertencentes a três clados: (i) Mallodeta, composto unicamente por sua espécie-tipo; (ii) Rezia Kirby gen. reval., composto por R. sortita comb. nov., R. consors comb. nov. e R. sanguipuncta, além de R. cardinale (Hampson), R. erythrarchos (Walker) comb. nov., R. cruenta (Perty) comb. nov. e R. hanga (Herrich-Schäffer) comb. nov., previamente tratadas em Cosmosoma Hübner; (iii) Antilleana gen. nov., composto por A. parthenii comb. nov., A. jamaicensis (Schaus) comb. nov., A. capistrata (Fabricius) comb. nov. e A. carminata (Hampson) comb. nov., todas anteriormente alocadas em Phoenicoprocta Druce. Dentre as conclusões taxonômicas, M. simplex foi tratada como sin. nov. de M. clavata, Glaucopis (Erruca) deyrolii Walker, 1854 sin. nov. de Rezia sortita, Laemocharis ignicolor Ménétriés sin. nov. de Rezia erythrarchos e M. cubana sin. nov. de A. capistrata. Todas as espécies tratadas no presente estudo foram redescritas, ilustradas e tiveram sua distribuição geográfica elucidada. / At the beginning of this study the genus Mallodeta Butler, exclusively neotropical, comprised six species: M. clavata (Walker) (type species), M. sortita (Walker), M. consors (Walker), M. sanguipuncta Druce, M. cubana Gaede and M. simplex Rothschild. These species besides Phoenicoprocta parthenii (Fabricius), formerly considered part of Mallodeta, had their phylogenetic relationships elucidated. The monophyly of Mallodeta was not corroborated, and the species historicaly associated to it should be considered, from now on, belonging to three different clades: (i) Mallodeta, composed exclusively by its type species; (ii) Rezia Kirby rev. gen, comprising R. sortita n. comb., R. consors n. comb. and R. sanguipuncta, plus R. cardinale (Hampson), R. erythrarchos (Walker) n. comb., R. cruenta (Perty) n. comb. and R. hanga (Herrich-Schäffer) n. comb., previously treated in the genus Cosmosoma Hübner; (iii) Antilleana n. gen., comprised by A. parthenii n. comb., A. jamaicensis (Schaus) n. comb., A. capistrata (Fabricius) n. comb. and A. carminata (Hampson) n. comb., formerly treated in Phoenicoprocta Druce. Among taxonomic conclusions we discovered M. simplex to be a n. syn. of M. clavata, Glaucopis (Erruca) deyrolii Walker, 1854 n. syn of Rezia sortita, Laemocharis ignicolor Ménétriés n. syn of Rezia erythrarchos and M. cubana n. syn. of A. capistrata. All species studied were redescribed, illustrated and had their geographical distribution elucidated.
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Anopheles (Nyssorhynchus) lanei e Culex (Culex) dolosus (Diptera: Culicidae): duas espécies que ocorrem na região de Campos do Jordão, Serra da Mantiqueira, São Paulo, Brasil / Anopheles (Nyssorhynchus) lanei and Culex (Culex) dolosus (Diptera: Culicidae): two species that occur in Campos do Jordão region, Serra da Mantiqueira, São Paulo, BrazilSenise, Luana Valente 13 September 2007 (has links)
Introdução Anopheles (Nyssorhynchus) lanei foi descrito por Galvão e Amaral em 1938, a partir de espécimes coletados em Campos do Jordão, na Serra da Mantiqueira, Estado de São Paulo, sendo provável espécie endêmica desta região. Linthicum (1988) redescreveu An. lanei baseando-se em um espécime adulto fêmea e duas genitálias masculinas de Campos do Jordão; porém, a ilustração de genitália masculina foi feita a partir de um espécime coletado na cidade de Estância, Estado de Sergipe, Brasil. Evidências morfológicas somadas a diferenças ambientais entre estas localidades indicam que os espécimes analisados por Linthicum não correspondem a An. lanei. Culex (Culex) dolosus foi descrito por Lynch Arribálzaga em 1891 com base em espécimes coletados na Província de Buenos Aires, Argentina. O último trabalho a tratar de aspectos da morfologia de Cx. dolosus é anterior à descrição de Culex eduardoi Casal & García, espécie similar a esta. Dados de literatura apontam para a existência de formas morfológicas diferenciadas em populações de Cx. dolosus, o que parece ser o caso dos espécimes que ocorrem na região de Campos do Jordão. Objetivos Este estudo visa contribuir para o conhecimento taxonômico de espécies pertencentes aos subgêneros Nyssorhynchus e Culex, que ocorrem na Serra da Mantiqueira, por meio da redescrição de An. lanei e Cx. dolosus, e também da identificação de fauna de Culicidae associada. Métodos As redescrições foram baseadas na análise de exemplares coletados na região de Campos do Jordão e implicaram em etapas de quetotaxia das larvas e pupas, biometria dos adultos e formas imaturas e elaboração de ilustrações das estruturas anatômicas da morfologia externa. Resultados Deste trabalho resultaram redescrições morfológicas detalhadas, tabelas de quetotaxia das formas imaturas e ilustrações das larvas, pupas e estruturas das genitálias masculinas. Considerações finais - Espera-se que os resultados alcançados possam ampliar e dar continuidade a estudos taxonômicos de Culicidae e também contribuir para a correta identificação de espécies de Anopheles e Culex. / Introduction Anopheles (Nyssorhynchus) lanei was described by Galvão and Amaral in 1938, based on specimens collected in the Campos do Jordão, in Serra da Mantiqueira, State of São Paulo, being a probable endemic species from this region. Linthicum (1988) re-described An. lanei based on one adult female and two male genitalia from Campos do Jordão; however, the illustration of the male genitalia was generated from a specimen collected in Estância municipality, State of Sergipe, Brazil. Morphologic evidences, in addiction to environmental differences between both localities, suggest that the specimens examined by Linthicum (1988) do not belong to An. lanei. Culex (Culex) dolosus was described by Lynch Arribálzaga in 1891 based in exemplars from the Buenos Aires Province, in Argentina. The last work to deal with morphologic aspects of Cx. dolosus precedes the description of Culex eduardoi Casal & García, a similar species to the former. Literature records point to the existence of differentiate morphologic forms of Cx. dolosus, what seems to be the case of the specimens that occur in Campos do Jordão region. Objectives This study aim to contribute to the knowledge about species from the subgenera Nyssorhynchus and Culex, that occur in the Serra da Mantiqueira, by the re-description of An. lanei and Cx. dolosus and also by the identification of the Culicidae associated fauna. Methods The redescriptions were based in the analyzes specimens collected in the region of Campos do Jordão and implied in stages of chaetotaxy of the larvae and pupae, biometry of the adults and immature forms, and elaboration of illustrations of the anatomic structures of the external morphology. Results This work resulted in detailed morphologic redescriptions, chaetotaxy tables of the immature forms and illustrations of the larvae, pupae and male genitalia structures. Final considerations It is expected that the reached results might expand and continuity taxonomic studies on Culicidae and also contribute to the correct identification of Anopheles and Culex.
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Análise das relações taxonômicas e sistemáticas entre espécies de triatomíneos (Hemiptera: Reduviidae) de colônias mantidas pelo Serviço Especial de Saúde de Araraquara, inferida de seqüências de genes mitocondriais / Analysis of taxonomic and systematic relationships among species of Triatominae (hemiptera: reduviidae) from colonies maintened by Special Health Service of Araquara - SESACeretti Junior, Walter 18 February 2008 (has links)
Os insetos da subfamília Triatominae Jeannel, 1919 de Reduviidae (Hemiptera: Heteroptera: Reduviidae), também conhecidos como barbeiros, constituem um grupo amplamente distribuído pela região Neotropical que comporta hoje, 142 espécies ocorrentes e uma fóssil, distribuídas em 18 gêneros, são insetos hematófagos estritos em todas as fases da vida e reconhecidos vetores da Doença de Chagas. Essa enfermidade é considerada um dos mais importantes problemas de saúde na América Latina, com cerca de 12 a 14 milhões de indivíduos chagásicos, 60 milhões vivendo em risco e cerca de 20.000 caso/ano em 18 países da América do Sul e Central. Neste estudo foram analisadas seqüências de nucleotídeos dos genes 16S e CitB mitocondrial em populações de triatomíneos, dos gêneros Panstrongylus Berg, 1879, Rhodnius Stål, 1859 e Triatoma Laporte, 1832, mantidos em colônias no insetário Serviço Especial de Saúde de Araraquara (SESA) - SP, comparando-as com seqüências dos mesmos genes disponíveis no GenBank. Os fragmentos obtidos variaram de 311 a 317 pb (16S) e 393 pb (CitB). Observou-se baixa variação intra-específica entre as distâncias genéticas do gene 16S, enquanto o gene CitB mostrou-se mais polimórfico, podendo ser utilizado para estudos de populações geográficas. As seqüências geradas foram alinhadas com seqüências dos mesmos genes para outros triatomíneos e também de Arilus cristatus Linaeus, 1763 (Hemiptera: Reduviidae: Harpactorinae) (16S e CitB) e Oncerotrachelus sp. Stål, 1868 (Hemiptera: Reduviidae: Saicinae) (16S). As relações entre as espécies foram avaliadas pelos métodos de Distância (Neighbor Joining), Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança. As análises de fragmentos para os dois genes demonstraram a parafilia de Rhodniini e Triatomini, confirmando resultados anteriores. Evidenciou-se a possível origem dos "Triatomas" Neotropicais a partir de derivações de Triatomas Neárticos, verificada pela estreita relação genética de Panstrongylus e Triatoma vitticeps (Stål, 1859) com o ramo Norte-Centro Americano de Triatoma; por meio das relações com T. protracta (Uhler, 1894), Dipetalogaster maxima (Uhler, 1894) e T. dimidiata Latreille, 1811. É dada a conhecer a primeira seqüência de bases nitrogenadas de fragmentos do gene 16S para Triatoma sherlocki Papa, Jurberg, Carcavallo, Cerqueira e Barata, 2002. Os resultados mostraram a utilidade de 16S e CitB como marcadores moleculares de espécies e de populações de triatomíneos e sua importância em questões de sistemática e taxonomia, no entanto, exigem um alto grau de segurança e controle de contaminação. Há necessidade de novos estudos envolvendo outros marcadores e o uso de caracteres sistemáticos clássicos de morfologia, ecologia e comportamento, indispensáveis para decisões sistemáticas adequadas uma vez, que teriam impacto não apenas sistemático mas, para as estratégias de controle. As colônias de triatomíneos do SESA revelaram-se importante fonte de material para estudos sistemáticos de triatomíneos, pois compreendem amostras significativas de várias populações triatomínicas da América, principalmente de espécies consideradas vetores principais do mal de Chagas como Triatoma infestans (Klug, 1834), Panstrongylus megistus (Burmeister, 1835), Rhodnius prolixus Stål, 1859 e Triatoma brasiliensis Neiva, 1911. Algumas questões sistemáticas relativas a origem e relacionamento filogenético dos triatomíneos continuam em aberto; novos reagrupamentos serão necessários para que a Subfamília continue válida; Análises mais completas, com a inclusão de representantes das tribos Alberproseniini, Bolboderini e Cavernicolini, são ainda necessárias. / The insects of the Triatominae subfamily Jeannel, 1919 of Reduviidae (Hemiptera: Heteroptera), also known as triatomine bugs, constitute a widely distributed group in the Neotropical region and including 142 current species and a fossil one, distributed in 18 genera. They are strict hematophagic insects in all phases of their life cicle and recognized vectors of the Chagas disease. This disease is considered one of the most serious Health problem in Latin America, with about 12 the 14 million of chagasic individuals, 60 million people living at risk and about 20,000 cases/year in 18 Central and South American countries. In this study mitocondrial 16S and CytB nucleotide sequences were analyzed in populations of triatomine bugs of the genera Panstrongylus Berg, 1879, Rhodnius Stål, 1859 and Triatoma Laporte, 1832 from colonies maintained in the Insectary of Special Health Service of Araraquara - SESA (acronym in Portuguese), Araraquara- SP, comparing them with sequences of the same available genes deposited in the GenBank. The obtained fragments varied from 311 to 317 bp (16S gene) and 393 pb (CytB). Low intra-specific variation among the genetic distance of the 16S gene, while the CytB gene revealed a higher polymorphism, being able to be used in geographic population studies. The generated sequences were aligned with sequences of the same genes for other triatomine bugs and also with Arilus cristatus Linaeus, 1763 (16S and CytB) and Oncerotrachelus sp Stål, 1868 (16S). The relationships among the species had been evaluated by the methods of Distance (Neighbor Joining), Maximum Parsimony and Maximum Likelihood. The analyses of fragments for the two genes had demonstrated the paraphily of Rhodniini and Triatomini, confirming previous results. It was hypothesized the possible origin of the Neotropical "Triatomas" from derivations of Nearctic triatomes, verified for the narrow genetic relation of Panstrongylus and Triatoma vitticeps (Stål, 1859) with the North-Center American branch of Triatoma by the relationships with T. protracta (Uhler, 1894), D. maxima (Uhler, 1894) and T. dimidiata Latreille, 1811. It is known the first sequence of nitrogen bases of fragments of the 16S gene for Triatoma sherlocki Papa, Jurberg, Carcavallo, Cerqueira e Barata, 2002. The results had shown the utility of 16S and CytB as markers of species and of triatomine populations and their importance in systematic and taxonomy questions. However, demands one high degree of security and control of contamination. There is a necessity of new studies involving other molecular markers and the use of classic systematic characters of morphology, ecology and behavior, indispensable for systematic decisions adjusted a time, that would have not only systematic impact but, for the control strategies. The colonies of triatomine of the SESA had shown important source of material for systematic studies of this kind of insect, since they include significant samples of triatomine populations of America, mainly of species considered the main vectors of the Chagas disease such as Triatoma infestans (Klug, 1834), Panstrongylus megistus (Burmeister, 1835), Rhodnius prolixus Stål, 1859 and Triatoma brasiliensis Neiva, 1911. Some systematic questions related to the origin and phylogenetic relationship of the triatomine bugs have kept opened; new regroupings will be necessary so that the Subfamily continues valid; more complete analyses, with the inclusion of representative members of the Alberproseniini, Bolboderini and Cavernicolini tribes, are still necessary.
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SUPER ÁRVORES FILOGENÉTICAS PARA GALERUCINAE (COLEOPTERA: CHRYSOMELIDAE) E SILURIFORMES (TELEOSTEI: OSTARIOPHYSI) AGRUPANDO DADOS MORFOLÓGICOS E MOLECULARESAlmeida, Rafael Bonfim de 28 February 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A grande quantidade de dados filogenéticos que vêm sendo disponibilizados, principalmente
de caráter molecular, com os avanços de técnicas de obtenção, amplificação e sequenciamento
de moléculas de DNA, RNA e proteínas, oferece uma nova perspectiva para a resolução de
relações filogenéticas de grupos problemáticos. Porém, esta crescente quantidade de dados
necessita de estratégia de integração e análise conjunta tanto entre os dados moleculares a per
se quanto com outros dados anteriores, como dados morfológicos, citogenéticos, etológicos,
entre outros. Uma alternativa recente para essa integração e metanálise filogenética é a
abordagem de construção de super árvores, que consiste no princípio de agrupamento de
filogenias independentes menores que possuem táxons terminais em comum em uma filogenia
maior, construída com maior número de caracteres, com maior número de táxons terminais,
sendo, portanto uma importante ferramenta para inferências mais acuradas quanto à
sistemática, evolução, biologia, etologia, biogeografia e citogenética já que oferece uma
perspectiva mais ampla do grupo em estudo. Neste estudo, dois grupos problemáticos quanto
à sistemática filogenética foram escolhidos e analisados sob a perspectiva da abordagem de
construção de super árvore. Para a subfamília Galerucinae sensu lato foi realizada uma
filogenia molecular para espécies de Alticinae com ênfase na tribo Oedionychini a partir do
alinhamento das sequências do segmento de expansão 2 (D2) do gene nuclear para 28S rDNA
(28S-D2) e o gene mitocondrial para a subunidade I do Citocromo Oxidase C (COI), sendo
essa filogenia juncionada com sequências associadas a bancos de dados e utilizadas em
estudos filogenéticos anteriores. Posteriormente essa filogenia molecular foi integrada a uma
super árvore construída para Galerucinae sensu lato. A super árvore recuperou a monofilia de
Galerucinae com um grupo Alticinae parafilético. Para a ordem Siluriformes (Teleostei:
Ostariophysi) foi construída uma super árvore baseada tanto em dados morfológicos quanto
dados moleculares, contendo todas as famílias do grupo na topologia final. A topologia final
recuperou a monofilia de Siluriformes, com Diplomystidae sendo o silurídeo mais basal e
grupo-irmão do restante dos Eusiluroidei. / The large amount of phylogenetic data that are being available, with predominance of
molecular, with the recent advances in techniques to obtainment, amplification and
sequencing of DNA molecules, RNA and proteins, offer a new perspective for solving
phylogenetic relationships of problem groups. However, this increased amount of data
requires integration strategies and combined analysis of data, gathering the molecular per se
with other previous data, such as morphological, cytological, ethological, and others. A recent
alternative for this integration and phylogenetic meta-analysis is the Supertree Construction
approach, that in principle consists in a gathering of independent smaller phylogenies that
have some terminal taxa in common into a larger phylogeny, built with more characters, major
number of terminal taxa, being an important tool for more accurate inferences about the
systematics, evolution, biology, ethology, biogeography, cytogenetics, and others, once it
offers a broader perspective of the study group. In this study, two problematic groups about
their phylogenetic systematics were selected and analyzed under the perspective of the
Supertree Construction approach. For subfamily Galerucinae sensu lato was performed a
molecular phylogeny for Alticinae species with emphasis on the segment Oedionychini, based
on alignment of the sequences of expansion segment 2 (D2) of nuclear 28S rDNA gene (28SD2),
and the mitochondrial gene for the subunit I of cytochrome oxidase c (COI), being this
phylogenies gather with other data used in previous phylogenetic studies. Later, this
molecular phylogeny was incorporated into a supertree, constructed for Galerucinae sensu
lato. The supertree recovered the monophyly of a Galerucinae group, and paraphyletic
Alticinae. To order Siluriformes (Teleostei: Ostariophysi) was built a supertree based on both,
morphological and molecular data, containing all families recognized for the group. The final
topology recovered the monophyly of Siluriformes with Diplomystidae being the most basal
catfish and sister group of the rest of Eusiluroidei.
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Revisão sistemática: estratégias de intervenção fonoaudiológica em alfabetizandos com dificuldades de aprendizagem / Systematic revision: intervention speech strategies in learners with learning difficultiesLucca, Treyce Rosemary Christina Vicente De 30 July 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This Project is part in the line of research in Language and Subjectivity Of
Postgraduate Program In Speech Pathology Of Pontifícia Universidade Católica de
São Paulo (PUC-SP). It is a deployment of The Literacy Project and their Avatars,
associated to the Observatory Education Program (OBEDUC). The writing acquisition
by the child is beyond the age, since the subject, to be regarded as reader and writer,
goes through a process that includes findings, successes and failures. Are the effects
of these errors and successes that the child submit or not the rules of language and
assume a tongue. Objective: Evaluate the therapeutic speech permissive
intervention when compared with the prescriptive, optional and interdictive models of
the use of reading and writing in learners with learning difficulties. Methodology:
Type of study: A systematic review of randomized clinical trials and quasirandomized
clinical trials. Search strategy: the following databases were searched:
MEDLINE, CENTRAL, EMBASE LILACS, PSYCINFO e ERIC. Discernment for
selection studies: clinical trials that evaluated any speech therapy techniques for
learners with learning difficulties. Data collection and analysis: the extraction and
evaluation of methodological quality of included studies performed by two
independent reviewers. Results: 637 references were identified by the mean
databases, resulting in 12 studies selected. In these studies was possible evidence a
diversity regarding the efficacy of interventions. It is possible notice one or more
means of intervention at the same search. In the selected studies there is not a
significative differences concerning the sex of the research subjects. Most of the
subjects analyzed were children or teenagers between 0 to 15 years of old. This is an
expected factor, once this is the chronological age for the formation of a reader and a
writer. Conclusion: It is possible note that the interventions practices are used by
audiologists are not described of the way that are proposed by organizational model
of the language symptoms in Speech. It was observed that all interventions are
improvements related to learning, but we highlight the need for further studies to
prove the efficacy, since research was found improvements by itself, beyond the
same research suggest the need for future studies to validation of the results
obtained / Este projeto insere-se na linha de pesquisa Linguagem e Subjetividade
do Programa de Estudos Pós-Graduados em Fonoaudiologia da Pontifícia
Universidade Católica de São Paulo (PUC-SP). Trata-se de um desdobramento do
projeto A Alfabetização e seus Avatares, vinculado ao programa Observatório de
Educação (OBEDUC). A aquisição da escrita pela criança está para além da faixa
etária, dado que o sujeito, para ser considerado leitor e escritor, passa por um
processo que inclui descobertas, erros e acertos. São pelos efeitos desses erros e
acertos que a criança se submete ou não às regras da linguagem e assume uma
língua. Objetivo: Avaliar a intervenção terapêutica fonoaudiológica permissiva
quando comparada aos modelos prescritivos, facultativos e interditivos do uso da
leitura e da escrita em alfabetizandos com dificuldades de aprendizagem.
Metodologia: Tipo de estudo: Revisão sistemática de ensaios clínicos
randomizados e quase-randomizados. Estratégia de busca: Foram pesquisadas as
seguintes bases de dados: MEDLINE, CENTRAL, EMBASE LILACS, PSYCINFO e
ERIC. Critério para a seleção dos estudos: Os ensaios clínicos que avaliaram
quaisquer técnicas fonoaudiológicas em alfabetizandos com dificuldades de
aprendizagem. Análise e coleta de dados: A extração e a avaliação da qualidade
metodológica dos estudos incluídos realizada por dois revisores independentes.
Resultados: 637 referências foram identificadas pelas principais bases de dados,
resultando em 12 estudos incluídos, nos quais se constatou provável diversidade
referente às eficácias das intervenções. É possível notar um ou mais meios de
intervenção em uma mesma pesquisa. Nos estudos selecionados, não houve
diferenças significantes referentes ao sexo dos sujeitos analisados. A maioria deles
eram crianças ou adolescentes, na faixa etária de 06 a 15 anos de idade, sendo este
um fator esperado, uma vez que esta é a idade cronológica para constituição de um
leitor e escritor. Conclusão: É possível notar que as práticas de intervenção
utilizadas pelos fonoaudiólogos não são descritas da maneira como proposto pelo
modelo de organização dos sintomas de linguagem em Fonoaudiologia. Foi
observado que todas as intervenções apresentam melhoras referentes à
aprendizagem, mas destacamos a necessidade da realização de outros estudos
para comprovação de suas efetividades, uma vez que foram encontradas pesquisas
que obtiveram esta melhora, além das mesmas apontarem a necessidade de
estudos futuros para validação dos resultados obtidos
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