Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-06T19:27:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-JeanSauvé.pdf: 1000481 bytes, checksum: ba9527b7ead65c4a43be6a94ad0aa462 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T19:27:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-JeanSauvé.pdf: 1000481 bytes, checksum: ba9527b7ead65c4a43be6a94ad0aa462 (MD5) Previous issue date: 2012 / O papilomavírus humano (HPV) é o principal agente etiológico de lesões malignas, a exemplo do câncer cervical e de suas lesões precursoras, as Neoplasias Intraepiteliais Cervicais (NICs). Investigamos se os polimorfismos de base única (SNPs) no gene da Beta-Defensina Humana 1 (DEFB1) poderiam estar associados à susceptibilidade à infecção e à progressão da lesão cervical provocadas por HPV de alto risco. Polimorfismos neste gene têm sido alvo de diversos estudos e revelaram ser de suma importância na susceptibilidade a diversas infecções. Neste estudo, os SNPs -52G/A, -44C/G e -20 G/A na região 5' UTR do gene DEFB1 foram analisados através de sequenciamento, em um grupo de 160 pacientes do sexo feminino HPV positivas e 71 indivíduos sadios. As análises estatísticas foram feitas utilizando o Teste exato de Fisher e o Teste do Qui-quadrado. Os resultados indicam que o alelo -44G e o haplótipo ACA podem estar relacionados com a susceptibilidade à infecção pelo HPV de alto risco. Os resultados não apontam diferenças significativas nas frequências alélicas e genotípicas dos outros polimorfismos entre pacientes infectados com HPV de alto risco e indivíduos sadios. Também não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas nas frequências alélicas e genotípicas nos pacientes HPV positivos quanto ao grau de lesão cervical. / Human papillomavirus (HPV) is the main etiological agent for development of cervical cancer and its precursor lesions, the cervical intraepithelial neoplasia (CINs). We investigated whether single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the human Beta-Defensin 1 gene (DEFB1) could be associated with susceptibility to infection and progression of cervical lesions caused by high-risk HPV. Polymorphisms in this gene have been the subject of several studies and proved to be extremely important in susceptibility to various infections. In this study, SNPs -52 G/A, -44 C/G and -20 G/A in the 5 'UTR of DEFB1 were analyzed by direct sequencing in a group of 160 HPV-positive female patients and 71 healthy individuals. Statistical analysis was performed using Fisher's exact Test and Chisquare. The results indicate that the -44G allele and haplotype ACA may be associated with susceptibility to infection caused by high-risk HPV. The results show no significant differences in allelic and genotypic frequencies of the other polymorphisms in patients infected with high-risk HPV and healthy individuals. We also found no statistically significant differences in allelic and genotypic frequencies in HPV-positive patients related to the progression of cervical lesion.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9457_1.pdf: 567516 bytes, checksum: 6a2c440598380b8f4276b0d42882bf4f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / O Papillomavirus humano (HPV) é responsável por afetar anualmente 500 mil mulheres com câncer cervical invasivo. Fatores de risco podem facilitar a persistência do vírus da cérvice uterina. Polimorfismos genéticos em regiões regulatórias e codificadoras de genes de citocinas estão associadas a patogênese de um vasto número de doenças humanas. Este trabalho objetivou determinar se existe relação entre os polimorfismos existentes na região -G308A do gene TNFalfa; e nas regiões -G137C e -C607A do gene IL18 na susceptibilidade a infecção pelo HPV e na progressão das lesões intraepitelial cervical. O estudo foi realizado com 122 mulheres HPV+ e 132 mulheres HPV-(controle). Os polimorfismos dos genes TNFalfa; e IL18 foram analisados pela técnica Specific Sequence Polymosphism (PCR-SSP) e analisadas em gel de agarose a 1,5%. As análises estatísticas para verificar a significância do estudo dos genótipos foram realizadas utilizando o programa BioEstat 5.0. Os resultados mostraram uma prevalência de 49,18% da infecção pelo HPV-16 e 70,49% delas apresentaram lesão cervical de alto grau. Em relação aos polimorfismos houve associação do alelo mutante na região -308A do gene TNFalfa; e -607A do gene IL18 com a susceptibilidade a infecção pelo HPV (p=0,0008; p<0,0001, respectivamente), mas não foi verificada relação destes genes com a susceptibilidade ao desenvolvimento das lesões (p>0,05). Porém não foi encontrada associação significativa em relação a região na região -137 do gene IL-18. Estes resultados sugerem dois possíveis marcadores genéticos de susceptibilidade a infecção pelo HPV na população em estudo e que estes não podem ser usados como marcadores de progressão da lesão cervical.

A leishmaniose visceral constitui grave doença infecciosa causada por um protozoário parasita intracelular obrigatório. Alguns fatores podem alterar a gravidade das manifestações clínicas, sendo um deles a predisposição genética. Este estudo investigou polimorfismos dos genes TGFB1, IL8 e IL6, que são citocinas relacionadas com o desencadeamento e a gravidade da doença, visando identificar fatores de susceptibilidade. Os polimorfismos TGFB1 -509 C/T e TGFB1 +869 T/C, IL8 -251A/T e IL6 -174G/C foram analisados por PCR-RFLP, em 198 pacientes com leishmaniose visceral (LV), 98 indivíduos com infecção assintomática (teste de hipersensibilidade tardia - DTH+) e 100 indivíduos sem evidências de infecção (DTH-). O alelo T na posição -509 do gene TGFB1 conferiu risco duas vezes maior de desenvolver LV ou ser positivo para o teste DTH (p = 0,007, OR = 1,9 [1,19-3,02]), em comparação com indivíduos DTH-. Os resultados sugerem uma associação do polimorfismo TGFB1 -509C/T com a susceptibilidade à LV, podendo contribuir para o desencadeamento da doença clínica. / Visceral leishmaniasis is a serious protozoan infectious disease caused by an obligate intracellular parasite. Some factors can affect the severity of the clinical manifestations; one of which is genetic susceptibility. This study investigated polymorphisms in the TGFB1, IL8 and IL6 genes, which are cytokines related with the onset and severity of the disease, to look for genetic susceptibility factors. Polymorphisms at TGFB1 -509C/T and +869T/C, and IL8 - 251A/T and IL6 -174G/C were analyzed by a PCR-RFLP technique, in 198 patients with Visceral Leishmaniasis (VL), 98 individuals with asymptomatic infection (positive delayed-type hypersensitivity, DTH+) and 100 individuals with no evidence of infection (DTH-). The T allele of the TGFB1 polymorphism in position -509C/T conferred a two risk fold to develop LV or to be DTH+ (p=0.007; OR=1.9 [1.19 - 3.02]) when compared with DTH- individuals. We suggest the TGFB1 -509C/T polymorphism is associated with susceptibility to LV and may contribute to development of the clinical disease.

O aborto espontâneo recorrente (AER) é caracterizado pela ocorrência de três ou mais abortos consecutivos e acomete 2-4% das mulheres em idade fértil. A etiologia está associada a vários fatores de risco, tais como anomalias uterinas, aberrações cromossômicas, autoimunidade, trombofilias, elevação na concentração de homocisteína (tHcy), porém cerca de 40% dos casos permanece sem causa definida. O metabolismo de unidades de carbono desempenha papel fundamental na disponibilidade de folato na célula, sendo essencial para o desenvolvimento placentário e fetal. Deficiência de vitaminas que regulam este metabolismo, como o ácido fólico, e polimorfismos em genes que codificam enzimas relacionadas ao metabolismo de folato (MTHFR, RFC1, GCP2 e MTHFD1) podem levar à redução das concentrações desta vitamina e ao aumento das concentrações de tHcy. Objetivo foi avaliar a associação entre polimorfismos em genes relacionados ao metabolismo do folato (RFC1, GCP2, MTHFR e MTHFD1) e o risco de se ter AER, bem como avaliar a associação entre estes polimorfismos e as alterações nas concetranções de folato, cobalamina e homocisteína. Foram constituídos três grupos: AER primário: 117 mulheres com AER e nenhum feto viável; AER secundário: 139 mulheres com AER e pelo menos um feto viável; e Controle: 264 mulheres sem história de aborto espontâneo. Nenhuma das mulheres estava grávida no momento da coleta do sangue. Amostras de sangue foram obtidas para dosagens bioquímicas (folato, Cbl, tHcy, entre outras), imunológicas e extração de DNA genômico. As genotipagens foram feitas por PCR-RFLP ou PCR em tempo real. As concentrações séricas de folato e Cbl foram maiores no AER primário e secundário (p<0,05). A distribuição dos genótipos de todos os polimorfismos foi semelhante nos três grupos. O aumento nas concentrações de folato sérico (OR: 1,05, 95% IC: 1,03 - 1,07, p<0,001), Cbl (OR: 1,00, 95% IC: 1,00 - 1,00, p= 0,016), tHcy (OR: 1,03, 95% IC: 0,97 - 1,11, p= 0,033) e T4 (OR: 1,02, 95% IC: 1,00 - 1,03, p= 0,006) e a presença de FAN reagente (1:160) (OR: 2,90, 95% IC: 1,25 - 6,75, p= 0,013) foram considerados fatores de risco para aborto primário. Para o aborto secundário, foram considerados fatores de risco o aumento nas concentrações de folato sérico (OR: 1,04, 95% IC: 1,02 - 1,05, p<0,001), Cbl (OR: 1,00, 95% IC: 1,00 - 1,00, p= 0,019) e tHcy (OR: 1,05, 95% IC: 1,00 - 1,09, p= 0,039), maiores idades (OR: 1,02, 95% IC: 0,98 - 1,06, p= 0,031), hábito de fumar (OR: 2,54, 95% IC: 1,41 - 4,60, p= 0,002) e ter maior IMC (OR:1,42, 95% IC: 1,07 - 1,88, p= 0,015). Os polimorfismos estudados não foram associados ao maior risco de se ter AER, quando analisados isoladamente, e também não foram associados a alterações nas concentrações séricas de folato, Cbl e tHcy, com exceção do genótipo MTHFR 677TT, cujas portadoras apresentaram maior concentração de tHcy, quando comparadas com as portadoras de genótipos 677CC e 677CT nos três grupos. As variáveis concentrações de folato, Cbl, tHcy e T4 e presença de FAN reagente foram associadas ao maior risco de se ter aborto primário. As variáveis idade, IMC, tabagismo, concentrações de folato, Cbl e tHcy foram associadas ao maior risco de aborto secundário. / The recurrent spontaneous abortion (RSA) is characterized by the occurrence of three or more consecutive miscarriages and affects 2-4% of women of childbearing age. The etiology is associated with several risk factors such as uterine abnormalities, chromosomal aberrations, autoimmunity, thrombophilia, increased concentration of homocysteine (tHcy). About 40% of cases remains unknown cause. The units of carbon metabolism plays an essential role in the availability of the cell folate, is essential for the placental and fetal development. A deficiency of the vitamins that regulate this metabolism, like folic acid, and polymorphisms in genes encoding enzymes related to folate metabolism (MTHFR, RFC1, and GCP2 MTHFD1) may lead to decreased concentrations of this vitamin and increased concentrations of tHcy. Objective was to evaluate the association between polymorphisms in genes related to folate metabolism (RFC1, GCP2, MTHFD1 and MTHFR) and the risk of having AER, and to evaluate the association between these polymorphisms and changes in concetranções folate, cobalamin, and homocysteine. Three groups were divided: AER primary: 117 women with RSA and no viable fetus, AER secondary: 139 women with RSA and at least one viable fetus and Control: 264 women with no history of miscarriage. None of the women was pregnant at time of blood collection. Blood samples were taken for biochemical (folate, Cbl, tHcy, etc.), immunological and genomic DNA extraction. The genotyping were carried out by PCR-RFLP or real time PCR. Serum concentrations of folate and Cbl were higher in groups 1 and 2 (p <0.05). The distribution of genotypes of MTHFR c.677C> T, MTHFR c.1298A> C, MTHFD1 c.1958G> A, RFC1 c.80G>GCP2 A and c.1561C> T was similar among the three groups. The increased concentrations of serum folate (OR: 1.05, 95% CI: 1.03 - 1.07, p <0.001), Cbl (OR: 1.00, 95% CI: 1.00 to 1.00, p = 0.016), tHcy (OR: 1.03, 95% CI: 0.97 to 1.11, p = 0.033) and T4 (OR: 1.02, 95% CI: 1.00 to 1.03, p = 0.006) and the presence of ANA (1:160) (OR: 2.90, 95% CI: 1.25 - 6.75, p = 0.013) were considered risk factors primary for abortion. For secondary abortion, were considered risk factors increased the concentrations of serum folate (OR: 1.04, 95% CI: 1.02 - 1.05, p <0.001), cobalamin (OR: 1.00, 95 % CI: 1.00 to 1.00, p = 0.019) and tHcy (OR: 1.05, 95% CI: 1.00 to 1.09, p = 0.039), higher age (OR: 1.02, 95% CI: 0.98 to 1.06, p = 0.031), cigarette smoking (OR: 2.54, 95% CI: 1.41 to 4.60, p = 0.002) and had a higher BMI (OR : 1,42,95% CI: 1.07 to 1.88, p = 0.015). The studied polymorphisms were not associated with increased risk of having RSA when analyzed separately, and were not associated with changes in serum folate, Cbl and tHcy, with the exception of the MTHFR 677TT genotype, whose patients had a higher concentration of total tHcy compared with those with 677CC and 677CT genotypes in the three groups. The variable concentrations of folate, Cbl, tHcy, and T4, presence of ANA and have been associated with increased risk for miscarriage primary. The variables age, BMI, smoking, concentrations of folate, Cbl and tHcy were associated with increased risk of secondary miscarriage.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-07-13T20:37:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rayane Mendes de Lima - 2016.pdf: 1517541 bytes, checksum: 21e56d88c3ecbe596bbba9be9f3ea87e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-07-14T13:04:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rayane Mendes de Lima - 2016.pdf: 1517541 bytes, checksum: 21e56d88c3ecbe596bbba9be9f3ea87e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-14T13:04:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Rayane Mendes de Lima - 2016.pdf: 1517541 bytes, checksum: 21e56d88c3ecbe596bbba9be9f3ea87e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-02 / Diabetic nephropathy is the leading cause of end-stage renal disease (ESRD) in developed countries and in the literature shows as oxidative stress possibly contributes to the development of the diseases. Glutathione S-transferases (GSTs) are a family of multifunctional enzymes that play an important role in the cellular detoxification and excretion of numerous substances and can also work as one of the antioxidants. The genetic polymorphism of deletion in GSTT1 and GSTM1 gene, when homozygous, show lack of activity of these isoforms, known as null genotype. Looking for a possible relationship between diabetic nephropathy and polymorphisms mentioned above, this study was made for the case-control and genotyping using real-time PCR (qPCR) and melting curve. Clinical and laboratorial data of 65 patients (diagnosed with diabetic nephropathy and were on hemodialysis) and 90 controls were collected through interviews and consultation with medical records (patients) and the results of recent surveys (controls). It was found that in the group if there is a risk associated with deletion polymorphism, where the GSTT1-null genotype (p = 0,0230) causes an increased risk of about 2,9 times in developing the disease (diabetic nephropathy) compared to carriers of the genotype GSTT1-present. There was no association of GSTM1 (p = 0.3860) with susceptibility to disease in this population. Analysis of the influence of the deletion of GSTT1 and GSTM1 about the biochemical and clinical changes in the group case did not result in a significant association in any of the clinical variables analyzed. These results suggest that the GSTM1 deletion polymorphism may be associated with risk of developing the disease, but not with the biochemical changes that were analyzed. Further studies may clarify the relationship of this polymorphism with diabetic nephropathy and help in the treatment of this disease. / A nefropatia diabética é a principal causa de Estágio Final de Doença Renal (ESRD) em países desenvolvidos e evidências tem apontado o estresse oxidativo como unificador de várias vias de dano celulares em condições de hiperglicemia, que resultaria no desenvolvimento e complicações da doença. As glutationa-S-transferases (GSTs) são uma família de enzimas multifuncionais que desempenham um papel importante na desintoxicação celular e eliminação de numerosas substâncias e também pode funcionar como um dos antioxidantes. O polimorfismo genético de deleção nos genes GSTT1 e GSTM1, quando em homozigose, apresentam ausência de atividade dessas isoformas, conhecido como genótipo nulo. Procurando estabelecer uma possível relação entre nefropatia diabética e os polimorfismos acima mencionados, foi feito um estudo por caso-controle e a genotipagem por meio de PCR em tempo real (qPCR) e curva de melting. Dados clínico-laboratoriais de 65 pacientes (diagnosticados com nefropatia diabética e que estavam em hemodiálise) e 90 controles foram coletados, por meio de entrevistas e consulta a prontuários (pacientes) e a resultados de exames recentes (controles). Foi verificado que no grupo caso existe um risco associado ao polimorfismo de deleção, onde o genótipo GSTT1-nulo (p=0,0230) provoca um risco aumentado de aproximadamente 2,9 vezes em desenvolver a doença (nefropatia diabética) em relação aos portadores do genótipo GSTT1-presente. Não houve associação de GSTM1 (p=0,3860) com a susceptibilidade a doença na população estudada. A análise da influência da deleção de GSTT1 e GSTM1 sobre as alterações bioquímicas e clínicas no grupo caso não resultou em uma associação significativa de nenhuma das variáveis clínicas analisadas. Estes resultados sugerem que o polimorfismo de deleção de GSTT1 pode estar associado ao risco de desenvolvimento da doença, mas não com as alterações bioquímicas que foram analisadas. Novos estudos poderão esclarecer a relação desse polimorfismo com a nefropatia diabética e auxiliar no tratamento desta doença.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-06T14:02:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Agostinho Tavares Semedo - 2017.pdf: 2917656 bytes, checksum: 0a4e0b9aac67ef54832262a3818baf13 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-06T14:03:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Agostinho Tavares Semedo - 2017.pdf: 2917656 bytes, checksum: 0a4e0b9aac67ef54832262a3818baf13 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T14:03:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Agostinho Tavares Semedo - 2017.pdf: 2917656 bytes, checksum: 0a4e0b9aac67ef54832262a3818baf13 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Clozapine (CLZ) has been an antipsychotic of choice in treatment refractory schizophrenia (TRS). However, around 30% of the patients do not respond appropriately to this antipsychotic, being in this way, super-refractory schizophrenia (SRS). Genetic polymorphisms from cytochrome P450 enzymes can influence the metabolism of drugs and individual variability therapeutic response. Considering CYP2C19 a polymorphic enzyme with second major participation in the metabolism of CLZ, the aim of the present study was to analyse the influence of CYP2C19*2 and *17 polymorphisms in the response to the treatment to CLZ. The present study included 69 schizophrenic patients and 137 healthy individuals as a control group. Genotyping test and analysis of polymorphisms was done using sequencing technique and enzymatic restriction (RFLP) for patients and control’s group respectively. The results showed a major distribution of CYP2C19*17 polymorphism in patients’s group in comparison to control’s group. The CYP2C19*2 polymorphism was significantly higher in patients with TRS than to patients with SRS. The CYP2C19*17 polymorphism in heterozygous (CYP2C19*1/*17) was associated to higher clozapine’s doses in polytherapy and less efficient therapeutic response in SRS patients’s group, while the CYP2C19*2 was associated to lower clozapine’s doses in monotherapy and good therapeutic response in TRS patients’s group. In addition, parameters like daily mean clozapine dose, symptons severity according to Brief Psyquiatric Rating Scale (BPRS) and female individuals were also associated to super-refractoriness response to CLZ having a major distribution in SRS patients’s group. These findings suggest that new treatment strategies must be evaluated for the patients carriers of CYP2C19*17 polymorphism with SRS, above all the female individuals. Future studies with larger sample should be relevant to give more consistence to these findings. / A clozapina (CLZ) é um antipsicótico de escolha no tratamento de esquizofrenia refratária (ER). No entanto, cerca de 30% dos pacientes não respondem adequadamente à este antipsicótico, sendo considerados super-refratários ao tratamento (ESR). Sabe-se que polimorfismos genéticos nas enzimas do citocromo P450 podem influenciar o metabolismo das drogas, interferindo na variabilidade individual de resposta terapêutica. Sendo a CYP2C19 uma enzima altamente polimórfica e com a segunda maior participação no metabolismo da CLZ, o presente estudo visou analisar as influências dos polimorfismos CYP2C19*2 e *17 na resposta ao tratamento à este antipsicótico. O estudo incluiu 69 pacientes diagnosticados com esquizofrenia e 137 indivíduos saudáveis como controle. Utilizou-se a técnica de sequenciamento na genotipagem dos pacientes e a restrição enzimática (RFLP- Restrition Fragment Length Polymorphism) para o controle. Os resultados mostraram uma maior distribuição do polimorfismo CYP2C19*17 no grupo dos pacientes em comparação ao grupo controle. O polimorfismo CYP2C19*2 teve uma maior distribuição no grupo dos pacientes com ER em comparação aos pacientes com ESR. O polimorfismo CYP2C19*17 em heterozigose (CYP2C19*1/*17) estava associado à maior dose de CLZ em politerapia e resposta terapêutica menos eficiente no grupo dos pacientes com ESR, enquanto que a CYP2C19*2 em heterozigose estava associado à menor dose de CLZ em monoterapia e à boa resposta terapêutica nos pacientes com ER. Notou-se também uma associação da média da dose diária de CLZ, da gravidade sintomatológica (BPRS) e dos indivíduos do sexo feminino à super-refratariedade de resposta ao tratamento à clozapina tendo esses parâmetros uma maior distribuição no grupo dos pacientes com esquizofrenia super-refratária. Esses achados sugerem que outras estratégias de tratamento sejam avaliadas para os pacientes portadores do polimorfismo CYP2C19*17 diagnosticados com ESR, sobretudo os do sexo feminino. Futuros estudos com amostras mais alargadas seriam relevantes para dar uma maior consistência a esses achados.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-17T11:51:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-17T11:51:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-17T11:51:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alessandro Arruda Alves - 2017.pdf: 2612408 bytes, checksum: c21fd834dc73ac66ba55f32ba689f6f3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / In Brazilian agriculture, the State of Goiás is one of the largest producers of corn, beans, cotton, sorghum, sugarcane and soybeans, with 75% of its exports composed of products related to agriculture and minerals. Thus, a large part of the economy of the State of Goiás is focused on rural activities, justifying the intense use of pesticides in the region. These pesticides will be metabolized in the liver in two main phases, the first one of bioactivation converting the original substances into more polar metabolites, through oxidation reduction reactions, hydrogenation and dehalogenation, most of the reactions are made by the cytochrome P450 (CYP) superfamily And the second phase in which conjugation reactions occur, in which metabolites are converted into non-toxic products. Agrochemicals are also known to cause various human health damage, such as cancer, cholinergic syndrome, Parkinson's disease and Alzheimer's as well as cytogenetic changes such as DNA damage and chromosome translocations. Thus, polymorphisms in enzymes acting in the path of detoxification and DNA repair may be important biomarkers of diseases in individuals exposed to pesticides. The present study sequenced 3 regions of the following genes: CYP2E1 (promoter region), CYP1A1 (exon 7) and OGG1 (intron region) of 260 individuals from Goiânia and Aparecida de Goiânia, GO. 20 ml of blood was collected, DNA was extracted using commercial kits and PCR was performed. Subsequently, the amplicons were sequenced by the automated Sanger method and compared to the 1000 Genome project. The population of this study was composed of 159 men and 101 women, mean age of 38 years. A total of 5 SNP's were found in the Goias population, being rs2031922 (change of C> T and frequency of the T allele of 0.05) of the CYP2E1 gene, rs1048943 (change of A> G and frequency of the G allele of 0.1 ) And rs1799814 (change of C> A and frequency of allele A of 0.07) of the CYP1A1 gene and rs1052133 (change of C> G and frequency of allele G of 0.2) and rs293795 (change of A> G and frequency Of the 0.18 T allele) of the OGG1 gene. All loci did not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium, nor was a statistically significant difference between age and genotype composition. The rs1048943 and rs1799814 loci of the CYP1A1 gene showed a moderate disequilibrium linkage and the rs1052133 and rs293795 loci of the OGG1 gene showed a strong disequilibrium linkage. The haplotype inference revealed a frequency of the haplotypes of loci rs1048943 and rs1799814 of A / C = 0.8, G / A = 0.12, A / A = 0.07 of the CYP1A1 gene. The haplotypes of the loci rs293795 and rs1052133 had A / G = 0.07, A / C = 0.8, G / C = 0.13. Due to the important participation in detoxification or DNA repair and relationship with pesticides, SNPs rs2031920 of the CYP2E1 gene, rs1048943 of CYP1A1 and rs1052133 of the OGG1 gene are potential biomarkers of susceptibility to disease development in individuals who have contact with these xenobiotics / Na agricultura brasileira o Estado de Goiás é um dos maiores produtores de milho, feijão, algodão, sorgo, cana-de-açúcar e soja, tendo 75% de suas exportações compostas de produtos ligados às áreas de agricultura, agropecuária e minérios. Dessa forma, grande parte da economia do Estado de Goiás é voltada para atividades rurais, justificando o intenso uso de agrotóxicos na região. Esses agrotóxicos serão metabolizados no fígado em 2 fases principais, a primeira de bioativação convertendo as substâncias originais em metabolitos mais polares, por meio de reações de oxidação redução, hidrogenação e desalogenação, grande parte das reações são feitas pela superfamília de enzimas citocromo P450 (CYP) e a segunda fase na qual ocorrem reações de conjugação, na qual metabolitos são convertidos em produtos atóxicos. Os agrotóxicos também são conhecidos por causarem diversos danos à saúde humana, tais como, câncer, síndrome colinérgica, mal de Parkinson e Alzheimer assim como alterações citogenéticas, tais como dano no DNA e translocações cromossômicas. Assim, polimorfismos nas enzimas atuantes em vias de detoxificação e reparo de DNA podem ser importantes biomarcadores de doenças em indivíduos com exposição a agrotóxicos. O presente estudo sequenciou 3 regiões dos seguintes genes: CYP2E1 (região promotora), CYP1A1 (éxon 7) e OGG1 (região de íntron) de 260 indivíduos de Goiânia e Aparecida de Goiânia, GO. Foram coletados 20 ml de sangue, o DNA foi extraído com o uso de kits comercias e foi realizada a PCR. Posteriormente, os amplicons foram sequenciados pelo método de Sanger automatizado e comparados com a população do projeto 1000 genomas. A população deste estudo foi composta por 159 homens e 101 mulheres, médias de idade de 38 anos. Foram encontrados na população goiana um total de 5 SNP’s, sendo eles rs2031922 (mudança de C>T e frequência do alelo T de 0,05) do gene CYP2E1, rs1048943 (mudança de A>G e frequência do alelo G de 0,1) e rs1799814 (mudança de C>A e frequência do alelo A de 0,07) do gene CYP1A1 e rs1052133 (mudança de C>G e frequência do alelo G de 0,2) e rs293795 (mudança de A>G e frequência do alelo T de 0,18) do gene OGG1. Todos os locos não desviaram do equilíbrio de Hardy-Weinberg, também não houve diferença estatisticamente significativa entre a idade e a composição genotípica. Os locos rs1048943 e rs1799814 do gene CYP1A1 apresentaram um desequilíbrio de ligação moderado e os locos rs1052133 e rs293795 do gene OGG1 apresentaram um desequilíbrio de ligação forte. A inferência haplotípica revelou uma frequência dos haplótipos dos locos rs1048943 e rs1799814 de A/C=0,8, G/A= 0,12, A/A=0,07 do gene CYP1A1. Os haplótipos dos locos rs293795 e rs1052133 apresentaram frequência de A/G=0,07, A/C=0,8, G/C=0,13. Devido a importante participação em vias de detoxificação ou reparo de DNA e relação com agrotóxicos, os SNP’s rs2031920 do gene CYP2E1, rs1048943 do CYP1A1 e o rs1052133 do gene OGG1 são potenciais biomarcadores de susceptibilidade ao desenvolvimento de doenças em indivíduos que possuem contato com estes xenobióticos.

Tendo em vista a possibilidade da utilização de marcadores moleculares relacionados à leptina em programas de melhoramento genético no Brasil, com o objetivo de auxiliar a seleção de bovinos da raça Nelore para características de importância econômica e, particularmente, para aquelas relacionadas ao crescimento e precocidade de acabamento, a proposta do presente trabalho foi caracterizar as freqüências gênicas e genotípicas de alguns polimorfismos e estudar seus efeitos nas características de precocidade de acabamento e crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram avaliadas as associações dos marcadores moleculares com medidas de ultra-som de área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura da picanha (EGP), peso à desmama (PD), peso ao sobreano (PS), ganho de peso da desmama ao sobreano (GPS) e circunferência escrotal ao sobreano (CE). Para a caracterização dos marcadores na população Nelore foram avaliadas as freqüências genotípicas e gênicas, testes de equilíbrio de Hardy-Weinberg, heterozigoses, diversidades alélicas e conteúdos de informação polimórfica. A análise dos efeitos dos diferentes genótipos dos marcadores moleculares foi realizada através da análise de variância, desvios de dominância, efeitos aditivos e efeitos médios de substituição. As freqüências genotípicas e gênicas demonstraram que alguns alelos de determinados marcadores moleculares se encontram em baixa freqüência na população, porém apresentam os mesmos polimorfismos já relatados em bovinos de raças européias. Os marcadores A1457G, C963T e UASMS1 apresentaram associação significativa com características avaliadas por ultra-som. Os marcadores E2JW, A59V e T945M apresentaram associação significativa com características de crescimento. O marcador E2FB apresentou associações significativas apenas pela análise de efeito médio de substituição. Estes achados reforçam o potencial de utilização dos marcadores moleculares ligados a leptina na melhoria das características economicamente importantes em animais da raça Nelore. A seleção assistida por marcadores de animais portadores de alelos favoráveis pode impactar positivamente na cadeia produtiva de bovinos de corte em todos os seus segmentos. / Considering the possibility of utilization of molecular markers linked to leptin in animal breeding programs from Brazil and aiming to aid in the selection of Nellore cattle to economic traits and particularly, for those related to growth and finishing traits, the purpose of this research was to characterize the allelic and genotypic frequencies and associate with growth and finishing in Nellore cattle. There were evaluated the associations of the molecular markers on the ultrasound Longissimus muscle area (AOL), ultrasound backfat thickness (EGS), ultrasound fat thickness in Biceps femoris muscle, weaning weight (PD), yearling weight (PS), weight gain from weaning to yearling (GPS) and yearling scrotal circumference (CE). The characterization of the molecular markers in Nellore cattle was evaluated through of the allelic and genotypic frequencies, Hardy-Weinberg equilibrium tests, heterozigosity, allelic diversity and polymorphism information content. The different genotype effects of the molecular markers were evaluated through ANOVA, dominance deviation, additive and substitution effect. The allelic and genotype frequencies shown some alleles of the molecular markers were low frequencies in Nellore cattle. However there were identified the same polymorphisms described in taurine cattle. Markers A1457G, C963T and UASMS1 demonstrated significant association with ultrasound measurement traits. The E2JW, A59V and T945M markers showed significant association with growth traits. The E2FB marker showed significant effects when it was evaluated for substitution effect. These findings emphasize the potential utilization of molecular markers linked to leptin in the improvement of economic traits in the Nellore cattle. The improvement this traits through marker assisted selection of carrier animals of desirable alleles might positively aid the whole beef cattle productive chain.

A doença de Parkinson (DP) é a segunda doença neurodegenerativa mais comum do mundo, e seu tratamento atual se baseia principalmente no uso de medicações que facilitam a transmissão dopaminérgica nos núcleos da base. A L-DOPA é a principal medicação usada no tratamento da DP, contudo seu uso crônico está associado ao surgimento de complicações motoras, como as discinesias induzidas por L-DOPA (DIL). As DIL ocorrem em cerca de 50% dos pacientes com DP que usaram LDOPA por cerca de 4 a 6 anos, e podem causar uma série de impactos negativos aos pacientes. Pela incapacidade adicional que esta complicação traz aos pacientes com DP, a definição de fatores que possam predizer o surgimento das DIL é de importância direta para o clínico que prescreve L-DOPA rotineiramente. O objetivo deste estudo foi determinar os principais fatores de risco clínicos e genéticos para o desenvolvimento de DIL em uma casuística de pacientes brasileiros com DP. Um estudo transversal foi realizado em pacientes brasileiros de dois centros (Ribeirão Preto e São Paulo) como parte do projeto \"Latin American Research Consortium on the Genetics of PD\" (LARGE-PD), incluindo apenas pacientes com DP e em uso de L-DOPA. A avaliação foi baseada em um exame neurológico completo e em uma entrevista semi-estruturada feita por um médico neurologista especialista em Distúrbios de Movimentos. A presença de DIL foi considerada se a pontuação fosse >= 1 no item 32 da Parte IV na MDS-UPDRS. Baseados em estudos prévios, nós escolhemos oito polimorfismos tipo single nucleotide polymorphism (SNP) nestes genes: COMT, MAOB, ANKK1, DRD3, DAT1, BDNF, ADORA2A and NOS1. A genotipagem foi realizada através de ensaios TaqMan SNP. Foram realizados modelos de regressão logística e análises de sobrevivência para identificarmos os fatores de risco clínicos e genéticos associados ao surgimento de DIL. Ao todo, foram analisados 199 pacientes (sexo masculino - 59%; idade média 61.8 anos), sendo 96 indivíduos (48.2%) com DIL. Através de um modelo de regressão logística multivariado com 7 variáveis independentes, o fenótipo clínico motor do tipo postural instability with gait disorder (PIGD) (OR 0.17, IC 95% 0.07-0.39; p < 0.001), longos períodos de tratamento com L-DOPA (OR 1.31, IC 95% 1.17-1.47; p < 0.001), altas doses diárias equivalentes de L-DOPA (OR 1.00, IC 95% 1.000-1.002; p = 0.04) e a início precoce dos sintomas da 11 DP (OR 1.04, IC 95% 1.01-1.07; p = 0.009) foram os fatores de risco clínicos mais associados ao surgimento de DIL. Dentre os fatores de risco genéticos, apenas o alelo T do SNP rs1799836 no gene da MAOB esteve associado ao aumento na chance de surgimento de DIL (OR 1.51, IC 95% 1.00-2.28; p = 0.05). Nossos resultados mostraram que a predição de surgimento de DIL em pacientes com DP em uso de L-DOPA pode ser feita através de alguns fatores de risco clínicos (fenótipo clínico motor, duração do tratamento com L-DOPA, dose diária equivalente de L-DOPA e idade de início de sintomas) e genéticos, como o SNPrs1799836 no gene da MAOB. Novos estudos com amostras maiores e desenhos prospectivos longitudinais são necessários para se explorar a associação entre estes preditores e o surgimento de DIL. / Parkinson\'s disease (PD) is the second most common neurodegenerative disease in the world, and its treatment is mainly based on drugs involved on dopaminergic neurotransmission in basal ganglia. L-DOPA is the major medication used on the management of PD, but its chronic use is associated with the onset of motor complications, as L-DOPA-induced dyskinesias (LID). LID occur in approximately 50% of patients using L-DOPA over 4 and 6 years, and they cause negative impacts on the quality of life of patients PD. To predict the onset of LID based on clinical and genetic risk may be an useful tool for clinicians which prescribe L-DOPA. The aim of this study was to determinate the main clinical and genetic risk factors for the onset of LID in Brazilian PD patients. A cross-sectional study was conducted with Brazilian PD patients from two centers (Ribeirao Preto and Sao Paulo) as part of the Latin American Research consortium on the Genetics of PD (LARGE-PD), which enrolled only PD patients using L-DOPA. PD patients were submitted to neurological examination and semi-structured interviews performed by movement disorders specialists. Presence of LID was confirmed if UPDRS Part IV had a score >= 1 on item 32. Based on previous studies, we chose eight Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) in the following genes: COMT, MAOB, ANKK1, DRD3, DAT1, BDNF, ADORA2A and NOS1. Genotyping was performed using TaqMan SNP genotyping assays. We performed logistic regression and survival analysis to identify clinical and genetic risk factors associated with LID onset We enrolled 199 PD patients (males - 59%; mean age 61.8 years), and 96 patients (48.2%) had LID. At a multivariate model with 7 independent variables, postural instability with gait disorder (PIGD) clinical phenotype (OR 0.17, CI 95% 0.07-0.39; p < 0.001), longer duration of L-DOPA therapy (OR 1.31, Cl 95% 1.17-1.47; p < 0.001), higher L-DOPA equivalent daily doses (OR 1.00, CI 95% 1.000-1.002; p = 0.04), as also as early onset of PD (OR 1.04, CI 95% 1.01-1.07; p = 0.009) were the clinical risk factor more associated with onset of LID. Regarding genetic risk factors, only MAOB SNP rs1799836 was associated with LID, with the T allele increasing the risk of developing LIDs (OR 1.51, CI 95% 1.00-2.28; p = 0.05). Our results showed onset of LID can be predicted based on some clinical (motor clinical phenotype, duration of L-DOPA therapy, L-DOPA equivalent daily dose and age at PD onset) and genetic risk factors, as MAOB SNP rs1799836. Further studies in larger samples, using longitudinal and prospective designs, are needed to explore the association between these predictors and onset of LID.

Introdução Hiperomocisteinemia é um fator de risco para defeitos de fechamento no tubo neural e doenças vasculares e neurodegenerativas, e possui determinantes ambientais, metabólicos e genéticos. Estudos sobre freqüência de polimorfismos relacionados ao metabolismo da homocisteína (Hcy) e sua relação com dieta, fatores do estilo de vida e concentração plasmática de Hcy na população brasileira são ainda escassos. Objetivo Investigar a frequência de polimorfismos das enzimas metilenotetraidrofolato redutase (MTHFR C677T [rs1801133] e A1298C [rs1801131]), metionina sintase (MTR A2756G [rs1805087]), metionina sintase redutase (MTRR A66G [rs1801394]) e do carreador de folato reduzido (RFC G80A [rs1051266]) e sua associação com fatores dietéticos, estilo de vida e concentrações séricas ou plasmáticas de Hcy e vitaminas B12, B6 e folato em mulheres de São Paulo. População e métodos Análise transversal de dados de 609 mulheres (21-65 anos) participantes do estudo caso-controle de base hospitalar The Brazilian Investigation into Nutrition and Cervical Cancer Prevention (BRINCA) Study, excluindo-se os casos de câncer. A ingestão alimentar habitual foi avaliada por questionário de freqüência alimentar. Amostras sangüíneas em jejum foram obtidas sob proteção da luz, com separação imediata do plasma e armazenamento a -70ºC. Concentrações séricas de ácido fólico e vitamina B12 foram analisadas por técnica de fluoroimunoensaio, enquanto concentrações plasmáticas de Hcy e vitamina B6 foram analisadas por cromatografia líquida de alta performance em fase reversa. A detecção dos polimorfismos foi realizada por técnica de reação de cadeia de polimerase. As análises estatísticas foram realizadas através do programa STATA versão 10.0, ao nível de significância p<0,05. Resultados Genótipo homozigoto polimórfico foi observado em 6,6 por cento (MTHFR 677TT), 4,4 por cento (MTHFR 1298CC), 4,5 por cento (MTR 2756GG), 17,1 por cento (MTRR 66GG) e 24,4 por cento (RFC 80AA) das mulheres analisadas. Genótipo MTHFR 677TT associou-se a maiores concentrações plasmáticas de Hcy e menores concentrações séricas de folato e vitamina B12, quando comparadas aos genótipos 677CT e 677CC (p<0,005). Em contraste, mulheres portadoras de homozigose selvagem para os polimorfismos MTHFR A1298C, MTR A2756G e MTRR A66G apresentaram maiores concentrações plasmáticas de Hcy quando comparadas às mulheres portadoras de heterozigose e/ou homozigose polimórfica (p<0,005). O efeito de maior consumo de vitamina B6 na concentração de Hcy foi mais pronunciado entre fumantes que entre não-fumantes (p da interação=0,025). Entre fumantes, valores médios de Hcy em mulheres 677TT foram 64,8 por cento e 51,8 por cento maiores quando comparadas às 677CT e 677CC, respectivamente; portadoras do genótipo 1298CC apresentaram maiores concentrações plasmáticas de Hcy em relação àquelas com genótipo 1298AA e 1298AC; entre não-fumantes, entretanto, mulheres 1298AC apresentaram menores concentrações plasmáticas de Hcy do que as mulheres 1298AA. Fumantes que reportaram ingestão de café >173 g/dia tiveram concentrações plasmáticas de Hcy 1,3 mol/L (12,7 por cento) mais altas do que as não-fumantes com consumo de café 173 g/dia (p da interação=0,042). Mulheres sem ingestão alcoólica habitual e que reportaram ser fumantes apresentaram concentrações medianas de Hcy 3,4 mol/L (35 por cento) mais elevadas do que mulheres com consumo de álcool >21,4 g/dia, mas não-fumantes (p da interação=0,008). Conclusão Nesta população de mulheres com baixa prevalência de deficiência de folato sérico (5,1 por cento), fatores do estilo de vida, sobretudo tabagismo e ingestão habitual de álcool, modificam a relação entre consumo alimentar, polimorfismos e concentrações de Hcy, reforçando as recomendações para não fumar e de consumo de álcool com moderação / Introduction Hyperomocysteinemia is a risk factor for neural tube defect and vascular and neurodegenerative diseases, and has genetic, metabolic and environmental determinants. Studies evaluating frequency of polymorphisms related to homocysteine (Hcy) metabolism and its relation with diet, lifestyle factors and plasma Hcy concentration in Brazilian population are scarce. Objectives To assess the frequency of methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T and A1298C, methionine synthase (MTR) A2756G, methionine synthase reductase (MTRR) A66G and reduced folate carrier (RFC) A80G gene polymorphisms, and examine its association with dietary factors, lifestyle and serum or plasma Hcy and vitamins B12, B6 and folate among low-income Brazilian women. Subjects and methods This cross-sectional study included 609 women (21-65 years) participating in The Brazilian Investigation into Nutrition and Cervical Cancer Prevention Study (BRINCA Study), excluding cancer cases. The dietary intakes regarding the previous year were estimated using a validated food frequency questionnaire. Fasting blood samples were taken from each study participant, protected from light, immediately separated plasma or serum and storaged at -70oC. Serum folate and vitamin B12 concentrations were measured by fluoroimmunoassay, and plasma vitamin B6 and Hcy concentrations were assessed by reverse-phase high performance liquid chromatography. Gene polymorphisms were ascertained using the protein chain reaction-based method. Statistical analyses were performed using STATA 10.0, using a statistical significance level of p<0,05. Results Frequencies for the homozygous variant genotypes were: 6.6 per cent (MTHFR 677TT), 4.4 per cent (MTHFR 1298CC), 4.5 per cent (MTR 2756GG), 17.1 per cent (MTRR 66GG) and 24.4 per cent (RFC 80AA) of the analysed women. MTHFR 677TT genotype has been associated to higher plasma Hcy concentration and lower serum folate and vitamin B12 concentration, compared to 677CT and 677CC genotypes (p<0,005). On the contrary, women carrying MTHFR A1298C, MTR A2756G and MTRR A66G wild homozygous have presented higher plasma Hcy concentrations when compared to those heterozygous and/or polymorphic homozygous (p<0,005). The effect of a higher vitamin B6 consumption on plasma Hcy concentration was more pronounciated among smokers than non-smokers (interaction p=0.025). Among smokers, mean Hcy values among 677TT subjects were 64.8 per cent and 51.8 per cent higher than 677CT and 677CC, respectively; 1298CC subjects presented higher plasma Hcy concentrations than 1298AA and 1298AC; among non-smokers, however, 1298AC subjects showed lower plasma Hcy concentrations than 1298AA subjects. Smokers who reported coffee intake >173g/d had plasma Hcy concentrations 1.3 mol/L (12.7 per cent) higher than non-smokers consuming coffee 173g/d (interaction p=0.042). Non-drinkers women who reported be smokers showed median plasma Hcy concentrations 3.4 mol/L (35 per cent) higher than those with alcohol consumption >21.4g/d, but non-smokers (interaction p=0.008). Conclusion In this women sample with low prevalence of serum folate deficiency (5.1 per cent), lifestyle factors, especially smoking and alcohol consumption, modifie the relation among food intake, polymorphisms and plasma Hcy concentration, reforcing the health recommendations to stop smoking and moderate alcohol consumption