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Investigação dos polimorfismos nos genes FAS e FASL em indivíduos infectados pelo Vírus da imunodeficiência humana-1 (HIV-1)HERMES, Renata Bezerra 27 April 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / No presente estudo foram investigadas as freqüências dos polimorfismos nos genes FAS e FASL em um grupo de 198 indivíduos soropositivos para o HIV-1 e 191 indivíduos controles soronegativos, com o objetivo de avaliar a ocorrência de uma possível associação entre os polimorfismos nestes genes e a infecção pelo HIV-1. A
identificação dos alelos A e G do polimorfismo -670 FAS foi realizada por meio da
técnica de PCR, utilizando seqüências de iniciadores específicos e posterior digestão enzimática (RFLP) com a enzima MvaI. A identificação dos alelos A e G do polimorfismo -124 FASL, bem como T e delT do polimorfismo -169 FASL foi realizada através da técnica de ACRS, seguido de RFLP com as endonucleases de restrição FokI e HincII, respectivamente. As análises das freqüências alélicas e genotípicas dos polimorfismos analisados não mostraram qualquer diferença significativa entre
soropositivos e soronegativos. A análise da quantificação dos linfócitos T CD4<sup>+</sup> entre os
portadores dos diferentes genótipos do polimorfismo -670 FAS revelou uma associação
significativa, sugerindo que o estado de portador do alelo G, em homo ou heterozigose,
nos indivíduos infectados pelo HIV-1 pode ser um fator de proteção à depleção destas células no curso da infecção pelo HIV-1. As associações entre o número de linfócitos TCD8<sup>+</sup>, a carga viral plasmática e os polimorfismos analisados não foram
estatisticamente significantes. Desse modo, pode-se sugerir, que o polimorfismo -670
do gene FAS, influencie na apoptose dos linfócitos T CD4<sup>+</sup> no curso da infecção pelo HIV-1, assim, faz-se necessário estudos adicionais visando confirmar ou não esta
associação, uma vez que a identificação desse polimorfismo pode ser, no futuro, uma importante ferramenta a ser utilizada no acompanhamento da infecção. / The present study investigated the frequency of the polymorphisms in the
FAS and FASL gene in a sample of 198 HIV-1 seropositives individuals and 191 healthy
control individuals, in order to evaluate the occurrence of a possible association
between the polymorphisms and HIV-1 infection. The A and G alleles identification of
the -670 FAS polymorphism was performed through a PCR followed by restriction
endonucleases analyses (RFLP), with the enzyme MvaI. The identification of A and G
alleles of -124 FASL polymorphism, T and delT of the -169 FASL polymorphism was
performed using ACRS assay, followed by RFLP with the restriction endonucleases
FokI and HincII, respectively. The analysis of allele and genotype frequencies of
polymorphisms examined did not show any differences between seropositives and
seronegatives individuals. The analysis of the quantification of CD4<sup>+</sup> T lymphocytes
from individuals with different genotypes of -670 FAS polymorphism showed a
significant association, suggesting that the state of carrier of the G allele in homo or
heterozygosity in HIV-1 individuals infected may be a protection factor from depletion
of these cells in the course of HIV-1 infection. Associations between the FAS and FASL
genes polymorphisms and the number of CD8<sup>+</sup> T-cells and plasma viral load were not
statistically significant. These findings suggest that the -670 FAS gene polymorphism,
influences the apoptosis of CD4<sup>+</sup> T lymphocytes in the course of HIV-1 infection, thus
it is necessary further studies to confirm or not this association since that the
identification of this polymorphism may be in the future, an important tool to be used in
monitoring the infection.
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Perfil de MicroRNAs hepáticos pode regular apoptose, lesões vasculares e inflamação na dengue hemorrágicaOLIVEIRA, Layanna Freitas de 30 June 2016 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-07-19T12:20:29Z
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Previous issue date: 2016-06-30 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / IEC - Instituto Evandro Chagas / A dengue é a arbovirose mais prevalente no mundo, causada pelo vírus dengue (DENV) está presente em todos continentes. Por mais de três décadas tem sido um constante problema de saúde pública frequentemente fatal nos casos de dengue hemorrágica (DHF). A patogenia da dengue é intimamente relacionada à resposta imune do hospedeiro, atingindo quadros de inflamação exacerbada e autoimunidade transitória onde todos tecidos são atingidos, sendo o fígado um dos mais importantes no contexto de evolução dos quadros graves devido a intensa replicação viral nesse órgão e sua função significativa no metabolismo. O estudo de microRNAs (miRNA) como elementos regulatórios do metabolismo e da resposta imune durante a infecção é crucial para o entendimento dos mecanismos de regulação da expressão gênica durante a infecção pelo DENV, e pode auxiliar no desenvolvimento de métodos diagnósticos e terapias anti-virais. Utilizamos a abordagem de miRA-Seq, utilizando a plataforma MySeq (Illumina) para identificar o perfil de miRNAs expressos no tecido hepático parafinizado de dez casos de óbito por DHF, comparando com cinco amostras de tecido sem infecção por DENV. Oito miRNAs apresentaram expressão diferencial no fígado de pacientes com DHF, sendo o miR-126-5p (molécula de regulação da proliferação de células endoteliais), e miR-133a-3p, regulados positivamente na DHF e miR-122-5p (um miRNA hepatoespecífico), miR-146a-5p (regulador de Interferon), miR-10b-5p, miR-204-5p, miR-148a-5p, e miR-423-5p regulados negativamente. A análise funcional de vias KEGG e GO, a partir dos genes alvo preditos dos miRNAs superexpressos, identificou a maioria de vias de regulação daapoptose e da resposta imune com envolvimento de genes MAPK, RAS, CDK e FAS e da resposta imune com destaque para NF-kB, famílias CC e CX, Il e TLR. A mesma análise dos genes alvo dos miRNAs sub-expressos também identificou na maioria vias de apoptose e biossintéticas. No nosso conhecimento, essa é a primeira descrição in vivo do perfil de miRNAs no tecido hepático de pacientes com DHF. Os resultados em conjunto mostram uma provável relação dos miRNAs: miR-126-5p, miR-122-5p e miR-146a-5p com a patogenia do DENV no fígado no quadro de DHF através da regulação do reparo endotelial e permeabilidade vascular, controle da homeostase do fígado e regulação da expressão de citocinas inflamatórias. / Dengue is the most prevalent arbovirosis in the world caused by Dengue virus (DENV) and is present in all continents, for more than three decades has been a constant public health concern and often fatal by dengue hemorrhagic fever (DHF). The pathogenesis of dengue is closely related to the host immune response, reaching exacerbated inflammation and transient autoimmunity. All tissues are affected, which liver is one of the most important in severe conditions, due its intense viral replication and its significant role in metabolism. The study of microRNAs (miRNA) as regulatory elements of metabolism and immune response during infection is crucial to understanding the regulatory mechanisms of gene expression on DENV infection, and can help in diagnostic development of anti-viral therapies. We sequenced the miRNoma in MySeq platform (Illumina) to identify the miRNAs profile expressed in FFPE liver tissue, ten DHF fatal cases were compared to five control cases. Eight miRNAs exhibited differential expression in DHF liver, miR-126-5p, a regulatory molecule of endothelial cells, and miR-133a-3p are upregulated in dengue and miR-122-5p, a liver-specific miRNA, miR- 146a-5p, interferon regulator, miR-10b-5p, miR-204-5p, miR-148a-5p and miR-423-5p were downregulated. Functional analysis of KEGG pathways and GO terms with predicted target genes of overexpressed miRNAs found regulatory pathways of apoptosis and immune response, involving MAPK gene, RAS, CDK and FAS; immune response pathways showed NF- kB, CC and CX families, IL and TLR. The same analysis with target genes of downregulated miRNAs also identified in most pathways of apoptosis and biosynthetic pathways of metabolism. In our knowledge, this is the first description of the liver miRNA profile in DHF, the results together show a feasible relationship of miR-126-5p, miR-122-5p and miR-146a-5p with liver pathogenesis of DHF, through endothelial repair and vascular permeability regulation, control of homeostasis and liver expression regulation of inflammatory cytokines.
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Avaliação de biomarcadores sorológicos em um estudo de busca ativa de casos novos de hanseníase em área hiperendêmica / Serological biomarker assessment in a study of active new cases finding for leprosy in a hiperendemic areaGOBBO, Angélica Rita 07 October 2016 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-03-27T13:22:11Z
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Previous issue date: 2016-10-07 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / A hanseníase é uma doença infecciosa crônica caracterizada por alterações de sensibilidade tátil, térmica e dolorosa na pele e nervos periféricos. Devido a ausência de diagnóstico laboratorial para a hanseníase, novas ferramentas que contribuam para a identificação de casos são necessárias para permitir o tratamento dos doentes antes da progressão para incapacidades físicas. Nesse sentido, o presente estudo objetivou avaliar a contribuição de biomarcadores sorológicos para o diagnóstico precoce da hanseníase. Foi realizado um estudo de busca ativa no distrito de Mosqueiro - Belém – Pará onde todos os participantes foram examinados clinicamente por médicos hansenologistas experientes e então 5mL de sangue periférico foram coletados para posteriores quantificações dos anticorpos anti-ND-O-BSA, anti-LID-1 e anti-NDO-LID pela técnica de ELISA. A ação de busca ativa no distrito de Mosqueiro diagnosticou 104 casos novos entre 895 indivíduos avaliados (11.6%), indicando uma alta endemia oculta que coincide com a alta soroprevalência de anticorpos anti-ND-O-BSA observada entre os estudantes. Foi observada uma diferença significativa entre os pacientes com diagnóstico tardio e precoce, sobretudo nas formas multibacilares. Todos os biomarcadores testados demonstraram resultados promissores na detecção dos casos tardios, tal como relatado na literatura, no entanto para os casos precoces estas moléculas identificaram corretamente apenas 50% dos indivíduos. Nenhum dos biomarcadores avaliados apresentou sensibilidade capaz de identificar todos os casos novos de hanseníase, sejam eles precocemente ou tardiamente diagnosticados. Apesar da molécula LID-1 ter evidenciado uma baixíssima sensibilidade para o diagnóstico precoce, sua alta especificidade e acurácia sugere sua utilização como uma potencial ferramenta de triagem sorológica para a identificação de sujeitos assintomáticos com alto risco de adoecimento. Assim, concluiu-se que apesar de nenhum biomarcador ter revelado utilidade no diagnóstico sorológico, a detecção dos anticorpos anti-LID-1 apresentou uma possível aplicabilidade na triagem dos indivíduos com maior risco de desenvolver a doença, contribuindo indiretamente para o diagnóstico da hanseníase. / Leprosy is a cronic infection diasease clinically characterized by changes in tactile, thermal and painful sensitivity in skin and peripheral nerves. Due to the absence of laboratory diagnosis of leprosy, new tools that contribute for identification of cases are necessary for enable patient treatment before progression to physical disabilities. In this sense, the present study aimed evaluate serological biomarkers contribution for early diagnosis of leprosy. Was perfomed an active case finding study in Mosqueiro district, Belém – Pará. All individuals were clinically examined by experient leprologists doctors and than 5mL of peripheral blood were colleted for future titration of anti-ND-O-BSA, anti-LID-1 e anti-NDO-LID by ELISA. The action of active finding in Mosqueiro district diagnosed 104 new cases of leprosy between 895 subjects examined (11.6%), indicating a high hidden endemy that agree with the high seroprevalence between schoolchildren. Were observed a significant difference among patients with late or early diagnoses, mainly in multibacillary forms. All biomarkers tested showed promising results in detection of late cases, such as related in literature, however, for early cases those molecules identified correctly only 50% of patients. None of biomarker tested presented sufficient sensitivity to detect all leprosy patients, early or lately diagnosed. Besides, LID-1 molecule had evidenced a lower sensitivity for early cases, their high especificity and accuracy suggest their use as a potential tool for serological screening to identify assintomatic subjects with high risk of illness. Thus, we concludes that besides no biomarker had reveled utility as a serological diagnostic tool, the detection of anti-LID-1 presented a possible aplicability as a screening marker of subjects with increased risk to develop leprosy, contributing indirectly for leprosy diagnosis.
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Efeito adjuvante e potencial imunoestimulador das lectinas de Artocarpus integrifolia (KM+ e Jacalina) e Synadenium carinatum (ScLL) na imunização de camundongos contra Neospora caninumCardoso, Mariana de Resende Damas 25 February 2011 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Lectins are proteins that bind specifically to carbohydrates and have important role in
modulation of the immune response. KM+ and Jacalin (JAC) are lectins from the seeds from
jackfruit (Artocarpus integrifolia) and ScLL is a lectin from the Synadenium carinatum latex.
Neospora caninum is an apicomplexan parasite that causes neuromuscular disease in dogs and
reproductive disorders in cattle, with serious economic impact on the livestock industry. The
immunestimulatory role of plant lectins has been investigated in several parasitic infections, but
not in neosporosis. This study aimed to evaluate the adjuvant effect and the immunestimulatory
potential of KM+, JAC and ScLL in immunization of mice against neosporosis. C57BL 6 mouse
groups were subcutaneously immunized three times at 15-day intervals with Neospora lysate
antigen (NLA) associated with lectins (NLA+KM, NLA+JAC and NLA+ScLL groups), NLA
alone, lectins alone (KM, JAC and ScLL groups), and PBS group (infection control). Animals
were challenged with Nc-1 isolate (2x107 tachyzoites) and evaluated for morbidity, mortality,
specific antibody response, cytokine production by spleen cells, cerebral parasite burden and
histopathological lesions. Serological assays demonstrated higher levels of IgG to N. caninum
for NLA+KM and NLA+ScLL than NLA+JAC and NLA groups. NLA+KM group induced
higher levels of IgG2a isotype whereas NLA+ScLL induced higher levels of IgG1 isotype. In all
groups, IgG1 response was higher than IgG2a response before and after challenge, but the
IgG2a/IgG1 ratio increased after challenge in NLA+KM, NLA+ScLL and KM groups. Cytokine
production after in vitro antigenic stimulation showed that NLA+KM induced high levels of
IFN-g and IL-10, presenting the highest IFN-g/IL-10 ratio, followed by NLA+ScLL group,
indicating a pattern of immune response toward Th1 type. NLA+JAC induced low levels of
these cytokines and the lowest IFN-g/IL-10 ratio in relation to other groups, indicating a profile
of Th2 type immune response. After parasite challenge, NLA+KM mice showed the highest
survival with low brain parasite burden and moderate tissue inflammation, whereas NLA+ScLL
mice presented intermediate survival with low brain parasite burden and low scores of
morbidity and inflammation. NLA+JAC group exhibited intermediate survival, but with the
highest brain parasite burden and mild inflammation. In conclusion, KM+ and ScLL lectins
showed suitable adjuvant effect by increasing NLA immunogenicity and immunostimulatory
role by conferring partial protection of mice immunized and challenged with lethal dose of N.
caninum, while the JAC lectin showed no adequate adjuvant effect in the immunization against
neosporosis. / Lectinas são proteínas que se ligam especificamente a carboidratos e possuem
importantes papéis na modulação da resposta imune. KM+ e Jacalina (JAC) são lectinas da
semente da jaca (Artocarpus integrifolia) e ScLL é uma lectina do látex da planta Synadenium
carinatum. Neospora caninum é um parasito do filo Apicomplexa que causa doença
neuromuscular em cães e desordens reprodutivas em bovinos, causando sério impacto
econômico na indústria agropecuária. O papel imunoestimulador de lectinas de plantas tem sido
investigado em diversas infecções parasitárias, mas não na neosporose. Esse estudo teve como
objetivo avaliar o efeito adjuvante e o potencial imunoestimulador de KM+, JAC e ScLL na
imunização de camundongos contra a neosporose. Grupos de camundongos C57BL/6 foram
imunizados subcutaneamente por três vezes, em intervalos de quinze dias, com o antígeno de
lisado total de Neospora (NLA) associado com as lectinas (grupos NLA+KM, NLA+JAC,
NLA+ScLL), NLA somente, lectinas somente (KM, JAC e ScLL), além do grupo PBS (controle
da infecção). Os animais foram desafiados com isolado Nc-1 (2x107 taquizoítas) e avaliados
quanto aos escores de morbidade, mortalidade, resposta imune humoral específica, produção de
citocinas por células do baço, carga parasitária cerebral e lesões histopatológicas. Resultados
sorológicos demonstraram maiores níveis de IgG anti N. caninum produzidos pelos animais dos
grupos NLA+KM e NLA+ScLL que NLA+JAC e NLA somente. O grupo NLA+KM induziu
maiores níveis do isotipo IgG2a, enquanto NLA+ScLL induziu maiores níveis do isotipo IgG1.
Em todos os grupos, a resposta de IgG1 foi maior do que de IgG2a antes e após o desafio,
porém a razão IgG2a/IgG1 aumentou após o desafio nos grupos NLA+KM, NLA+ScLL e KM.
A produção de citocinas após o estímulo antigênico in vitro demonstrou que NLA+KM induziu
altos níveis de IFN-g e IL-10, apresentando a maior razão IFN-g/IL-10, seguido pelo grupo
NLA+ScLL, indicando um padrão de resposta imune direcionado ao perfil Th1. NLA+JAC
induziu baixos níveis destas citocinas e menor razão IFN-g/IL-10 em relação aos demais grupos,
indicando um padrão de resposta imune do tipo Th2. Após o desafio com o parasito,
camundongos do grupo NLA+KM apresentaram a maior sobrevida com baixa carga parasitária
cerebral e moderada inflamação tecidual, enquanto animais imunizados com NLA+ScLL
apresentaram sobrevida intermediária com baixa carga parasitária cerebral e baixos escores de
morbidade e inflamação. O grupo NLA+JAC exibiu sobrevida intermediária, mas com alta
carga parasitária cerebral e suave inflamação. Em conclusão, as lectinas KM+ e ScLL mostraram
ser adjuvantes satisfatórios por aumentar a imunogenicidade do NLA e apresentaram efeito
imunoestimulador por conferir proteção parcial dos camundongos imunizados e desafiados com
dose letal de N. caninum, enquanto a lectina Jacalina não produziu efeito adjuvante suficiente
na imunização contra a neosporose. / Mestre em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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Caracterização genética dos hantavírus em roedores sigmodontíneos e humanos em área endêmica de síndrome cardiopulmonar por hantavírus no estado de Minas GeraisLimongi, Jean Ezequiel 06 May 2013 (has links)
The hantaviruses are among the most important zoonotic pathogens of humans, especially due
to high fatality, those associated with Hantavirus Pulmonary Syndrome (HPS). In Brazil,
more than 1600 cases of HPS have been confirmed since 1993, with a fatality rate of 40%.
The viral genotypes associated with HPS in humans, as well as those present in wild rodents
were investigated in an endemic area of the state of Minas Gerais in this study. Furthermore,
the seroprevalence for hantaviruses, the karyotyping of rodent species captured and the
population dynamics of these animals on the Cerrado vegetation types were also evaluated in
an ecoepidemiological approach. The ELISA and / or RT-PCR were used to test sera from
human cases of SPH and wild rodents and rodent lung fragments. In our study, six patients
were evaluated, of these six (100%) were seroreactive in ELISA in six (100%) was possible to
amplify viral genetic material and in five (83.3%) was possible sequencing. Were observed in
all the viral genotype Araraquara (ARAV), but with the formation of two well-defined
clusters. The case fatality rate was 50%. Regarding rodents, 258 specimens were captured.
Nine taxa were identified to species level and seven in genus level, all belonging to the
subfamily Sigmodontinae. Necromys lasiurus was the most abundant (70.2). We observed a
greater diversity of rodents in a fitofisionomy called semi-deciduous dry forest (07 taxa in
species level and four in genus level). The winter dry season was associated with the highest
capture success (p <0.0001). There was a higher prevalence of pregnancy during the rainy
season (p <0.0001). There was a prevalence of IgG antibodies against hantavirus of 1.6%, all
specimens of N. lasiurus. Among the four seroreactive rodents, three (75%) was possible to
amplify viral genetic material and two (50%) was possible sequencing. Only ARAV viral
genotype was observed. Samples of rodents had higher phylogenetic identity with the
genotype sequenced of the human sample of Uberlândia, Minas Gerais, where the rodents
were also captured. Samples identified with ARAV analyzed in this study were distributed at
a distance of approximately 400 kilometers. Despite the geographical distance, we observed a
high phylogenetic identity between two samples 384 km distant from each other. The
environmental and demographic changes that have occurred in recent decades in the study
area affected the ecology of wild rodents and facilitated the occurrence of hantavirus
infections in humans and the emergence of HPS in this region, mainly ARAV transmitted by
N. lasiurus. The observation in this study only the genotype ARAV in specimens of N.
lasiurus and humans, does not exclude the possibility of co-circulation of other viral
genotypes in this area, beyond the possibility of the existence of other reservoirs of
hantaviruses, including non-rodents. / Os hantavírus estão entre os patógenos zoonóticos mais importantes para o homem,
especialmente devido a alta letalidade, daqueles associados à Síndrome Pulmonar por
hantavírus (SPH). No Brasil, mais de 1600 casos de SPH foram confirmados desde 1993, com
uma taxa de letalidade de 40%. Os genótipos virais associados à SPH em humanos, bem
como os presentes nos roedores silvestres foram investigados em uma área endêmica do
estado de Minas Gerais neste estudo. Além disso, a soroprevalência para hantavírus, a
cariotipagem das espécies de roedores capturadas e a dinâmica populacional destes animais
nas fitofisionomias do Cerrado também foram avaliadas em uma abordagem
ecoepidemiológica. O ELISA e/ou o RT-PCR foram utilizados para testar amostras de soro de
casos humanos suspeitos de SPH e de roedores silvestres e fragmentos de pulmão de
roedores. Em nossa casuística, seis pacientes foram avaliados, destes (100%) foram
sororreativos no ELISA, e em seis (100%) foi possível amplificar material genético viral e em
cinco (83,3%) foi possível o sequenciamento. Em todos foram observados o genótipo viral
Araraquara (ARAV), porém com a formação de dois clusters bem definidos. A taxa de
letalidade dos casos foi de 50%. Em relação aos roedores, 258 espécimes foram capturados.
Nove táxons foram identificados a nível específico e sete a nível genérico, todos pertencentes
à subfamília Sigmodontinae. Necromys lasiurus foi a espécie mais capturada (70,2). Foi
observada maior diversidade de roedores na fitofisionomia Mata seca semidecídua (07 táxons
a nível específico e quatro a nível genérico), A estação inverno seco esteve relacionada com o
maior sucesso de captura (p < 0,0001). Houve maior prevalência de prenhez durante a estação
chuvosa (p<0,0001). Observou-se uma prevalência de anticorpos IgG contra hantavírus de
1,6%, todos espécimes de N. lasiurus. Dentre os quatro roedores sororreativos, em três (75%)
foi possível amplificar material genético viral e em dois (50%) foi possível o sequenciamento.
Somente o genótipo viral ARAV foi observado. Estes tiveram maior identidade filogenética
com o genótipo viral sequenciado de uma amostra humana do município de Uberlândia-MG,
local onde também os roedores foram capturados. As amostras identificadas com ARAV
analisados no presente estudo foram distribuídas a uma distância de aproximadamente 400
quilômetros. Apesar da distância geográfica, observamos uma alta identidade filogenética
entre duas amostras distantes 384 km entre si. As alterações ambientais e demográficas
ocorridas nas últimas décadas na área de estudo afetou a ecologia dos roedores silvestres e
facilitou a ocorrência de infecções humanas por hantavírus e a emergência da SPH nesta
região, principalmente por ARAV transmitido por N. lasiurus. A observação neste estudo
apenas do genótipo ARAV em espécimes de N. lasiurus e humanos, não exclui a
possibilidade de cocirculação de outros genótipos virais nesta área, além da possibilidade da
existência de outros reservatórios de hantavírus, inclusive não roedores. / Doutor em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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Estudo epidemiológico molecular da resistência a carbapenêmicos e fluorquinolonas e sua associação com sistema de secreção tipo III em Pseudomonas aeruginosaFerreira, Melina Lorraine 29 August 2014 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Introduction: Has been observed the global spread of different variants of P. aeruginosa that is often associated with increased virulence or the emergence of new antimicrobial resistance genotypes. There are few studies describing the association of the Type III Secretion System (TTSS) with antibiotic resistance and outcome of patients with pneumonia and bacteremia. Objectives: Determine the relation among resistance to carbapenems and fluoroquinolones and the Type III Secretion System (TTSS) effector genotype and its association with the poor prognostic in patients with ventilator-associated pneumonia (VAP) and bacteremia, identify mutations in the Quinolone Resistance Determining Regions (QRDRs), Metallo-β-Lactamase genes (MβL), virulence genes (algD, lasB e toxA) and clonal spread of isolates producing MβL. Material and Methods: A retrospective cohort was conducted to determine the risk factors for 30-day mortality in patients with the first episode of bacteremia (157 patients) and VAP (60 patients) caused by P. aeruginosa. Genes blaIMP, blaVIM, blaSIM, blaGIM and blaSPM, TTSS genes (exoT, exoS, exoY, exoU ) and virulence genes (lasB, algD, toxA) were detected by PCR; the sequencing was conducted for QRDR genes (gyrA e parC) on fluoroquinolone-resistant strains and the Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) for molecular typing of positive strains for the MβL genes Results: The multivariate analysis showed that predictors independently associated with death in patients with bacteremia were inappropriate therapy and cancer. Carbapenem resistance was more frequent among strains of VAP (53.3%), however with the detection of MβL genes in one isolate (blaIMP), unlike blood, where the frequency of these genes was 16.1%, being 10.7% blaSPM genotype and 5.4% blaVIM genotype. The exoS gene was found in all blood and lung isolates and the exoU gene only in 9.4%. Substitution of threonine to isoleucine at position 83 in gyrA was the most frequent mutation among fluoroquinolone-resistant strains. It was detected a mutation at position 91 in parC gene (Glu91Lys) associated with mutation in gyrA (Thre83Ile) in a strain of extensively drug-resistant P. aeruginosa, exoT+exoS+exoU+ genotype, isolate from lung, not described in Brazil yet. Among the strains that harboring the TTSS virulence genes it was observed high resistance to gentamicin (93.7%) and low for amikacin (37.5%). The evaluation of the clonal relationship between isolates producing blaSPM, blaVIM and blaIMP genes showed similarity (more than 80%) among the blaSPM strains, which was not observed for those producing blaVIM gene. Conclusions: Our results confirm previous findings regarding the spread of blaSPM clone, with indirect evidence of its cross-spread in our hospital and polyclonal those containing the blaVIM gene. Inappropriate therapy is significant factor for poor prognosis among patients with bacteremia caused by multidrug-resistant P. aeruginosa , independent of the virulence TTSS genotype associated. / Introdução: Vem sendo observado a disseminação global de diferentes variantes de P. aeruginosa que está frequentemente associada a maior virulência ou a emergência de novos genótipos de resistência aos antimicrobianos. Há poucos estudos descrevendo a associação do Sistema de Secreção Tipo III (TTSS) com resistência aos antibióticos e evolução dos pacientes com pneumonia e bacteremia. Objetivos: Determinar a relação entre resistência a fluorquinolonas e carbapenêmicos e a virulência de Pseudomonas aeruginosa pelo Sistema de Secreção Tipo III e sua associação com pior prognóstico em pacientes com Pneumonia Associada a Ventilação Mecânica (PAV) e bacteremia, identificar mutações na Região Determinante de Resistência as Quinolonas (QRDR), genes para Metalo-β-Lactamase (MβL), genes de virulência (algD, lasB e toxA) e disseminação clonal das amostras produtoras de MβL. Material e Métodos: Foi realizada uma coorte retrospectiva para determinar os fatores de risco para mortalidade em 30 dias em pacientes com primeiro episódio de bacteremia (157 pacientes) e PAV (60 pacientes) por P. aeruginosa. Os genes blaIMP, blaVIM, blaSIM, blaGIM e blaSPM, os genes do TTSS (exoT, exoS, exoY, exoU ) e os genes de virulência (lasB, algD, toxA) foram detectados por PCR; o sequenciamento foi realizado para os genes do QRDR (gyrA e parC) nas cepas resistentes a fluorquinolonas e o Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) para tipagem molecular das amostras positivas para o gene produtor de MβL. Resultados: A análise multivariada mostrou que os preditores independentemente associados com mortalidade nos pacientes com bacteremia foram terapia antimicrobiana inapropriada e câncer. A resistência aos carbapenêmicos foi maior entre as amostras de PAV (53,3%), porém com a detecção dos genes que codificam MβL em apenas um isolado (blaIMP), ao contrário do sangue, onde a frequência desses genes foi de 16,1%, sendo 10,7% blaSPM e 5,4% blaVIM. O gene exoS foi encontrado em todas as amostras avaliadas de sangue e pulmão e o gene exoU em apenas 9,4% das mesmas. A substituição de uma treonina por isoleucina na posição 83 no gene gyrA foi a mais frequente entre as cepas resistentes a fluorquinolonas. Foi detectada uma mutação na posição 91 no gene parC (Glu91Lys) associada com a mutação em gyrA (Thre83Ile) em uma amostra de P. aeruginosa ,isolada do pulmão, extensivamente resistente, do genótipo exoT+exoS+exoU+ , ainda não descrita no Brasil. Entre as amostras que carreavam os genes de virulência TTSS observou-se alta resistência a gentamicina (93,7%) e baixa para amicacina (37,5%). A avaliação da relação clonal entre as amostras contendo os genes blaSPM, blaVIM e blaIMP , apresentou alta similaridade (maior que 80%), naquelas contendo blaSPM, o que não foi observado para as amostras contendo o gene blaVIM. Conclusões: Nossos resultados confirmam achados prévios com relação a disseminação do clone blaSPM, com evidências indiretas da sua disseminação cruzada no nosso hospital e policlonal daquelas contendo o gene blaVIM. A terapia inapropriada é fator significativo para pior prognóstico entre os pacientes com bacteremia por P. aeruginosa multirresistente, independente do genótipo de virulência TTSS associado. / Mestre em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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Seleção e aplicação de peptídeos recombinantes e sintéticos obtidos por Phage display no imunodiagnóstico da estrongiloidíase humana / Selection and application of recombinant and synthetic peptides obtained by phage display in the immunodiagnosis of human strongyloidiasisFeliciano, Nágilla Daliane 17 January 2014 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Human strongyloidiasis is an important intestinal parasitic infection worldwide, 50% of infected individuals are asymptomatic, however it can cause hyper infection and dissemination in immunocompromised hosts leading to death. Early detection of the disease prevents the development of hyper infection and dissemination syndromes, so the use of an efficient diagnostic tool has great importance to identify and control this parasitic disease. Due to the lack of efficiency in parasitological and serological tests currently available to detect human strongyloidiasis it is necessary to improve immunodiagnostic tests using recombinant and synthetic antigens once there are limitations to obtain and use homologous antigens produced from the parasite. The aim of this study was to select using phage display technology Strongyloides stercoralis mimetic peptides ligands to immunoglobulin G from patients with strongyloidiasis. The PhDTM-C7C library was used in the selection process and the DNA of the selected clones was extracted, sequenced and analyzed using bioinformatics tools. ELISA tests were done by using five distinct phage clones, which presented significant similarity with proteins from S. stercoralis, and the two synthetic peptides corresponding to the sequences displayed on two phage clones. Binding specificity of each phage clone to the pool of sera from patients with strongyloidiasis was analyzed by competitive ELISA. Sensitivity, specificity, diagnostic efficiency, area under curve and likelihood ratio were calculated for each antigen. All phage clones presented high diagnostic potential achieving area under curves higher than 0.8, the C9 clone presented reasonable sensitivity (87.5%), specificity (80%) and diagnostic efficiency (82.5%).Synthetic peptides C10 and D3 showed superior diagnostic performance, with areas under the curve greater than 0.9 and excellent sensitivity (95%, 95%), specificity (86.3%, 92.5%) and diagnostic efficiency (89 2%, 93.3%) respectively. It was concluded that the selected peptides by Phage display can mimic S. stercoralis epitopes and represent promising alternative to the currently available antigens for human strongyloidiasis diagnosis. / Estrongiloidiase humana é uma importante parasitose intestinal em todo mundo, 50% das pessoas infectadas são assintomáticas, entretanto pode haver hiperinfecção e disseminação em pacientes imunocomprometidos, levando à morte. A detecção precoce da doença previne o desenvolvimento das síndromes de hiperinfecção e disseminação, assim, o uso de uma ferramenta diagnóstica eficiente é de grande importância para identificar e controlar esta parasitose. Devido à falta de eficiência nos testes parasitológicos e sorológicos disponíveis atualmente para detectar estrongiloidiase humana é necessário aprimorar os testes imunodiagnósticos utilizando antígenos recombinantes e sintéticos, uma vez que há limitações para obter e utilizar antígenos homólogos, produzidos a partir do parasito. O objetivo deste trabalho foi selecionar por Phage display peptídeos miméticos a Strongyloides stercoralis ligantes a imunoglobulinas G de pacientes com estrongiloidiase. Uma biblioteca PhDTM-C7C foi utilizada no processo de seleção e o DNA dos clones selecionados foi extraído, sequenciado e analisado por ferramentas de bioinformática. Os testes ELISA foram feitos utilizando cinco clones de fagos distintos, os quais tiveram similaridades significantes com proteínas de S. stercoralis, e dois peptídeos sintéticos correspondentes às sequências expressas por dois clones selecionados. A especificidade de ligação de cada clone de fago ao pool de soros de pacientes com estrongiloidiase foi analisada por ELISA de competição. Sensibilidade, especificidade, eficiência diagnóstica, áreas sob a curva e razão de verossimilhança foram calculados para cada antígeno. Todos os clones de fagos analisados apresentaram alto potencial diagnóstico alcançando área sob a curva maiores que 0,8, se destacando o clone C9 com razoável sensibilidade (87,5%), especificidade (80%) e eficiência de diagnóstica (82,5%). Os peptídeos sintéticos C10 e D3 apresentaram desempenho diagnóstico superior, com áreas sob a curva maiores que 0,9 e excelente sensibilidade (95%, 95%), especificidade (86,3%, 92,5%) e eficiência de diagnóstica (89,2%, 93,3%) respectivamente. Concluiu-se que os peptídeos selecionados por Phage display podem mimetizar epitopos de S. stercoralis e representam alternativa promissora aos antígenos atualmente disponíveis para utilização no diagnóstico da estrongiloidiase humana. / Doutor em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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Fauna, sazonalidade e riquetsias de carrapatos em área do Cerrado goianoMartins, Maria Marlene 17 August 2016 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Visando contribuir com a descrição da diversidade e ecologia de carrapatos e riquétsias no Cerrado brasileiro, este estudo foi conduzido em uma fazenda particular e suas imediações em Araguapaz, Goiás. O trabalho foi realizado durante quatro anos em 11 coletas, sendo oito em estações consecutivas em três fitofisionomias distintas. Coletou-se carrapatos do ambiente, de animais domésticos, aves e pequenos mamíferos silvestres e, em uma amostra destes, procurou-se por DNA de riquétsias. No ambiente foram coletados Amblyomma sculptum, A. ovale, A. parvum, A. naponense, A. rotundatum e Ornithodoros sp. O ambiente com infestação mais intensa e diversa foi a Mata de Galeria e o carrapato A. sculptum exibiu uma distribuição sazonal bem definida com larvas e ninfas prevalecendo nas estações mais secas e adultos nas mais úmidas. Em cães foram encontrados A. sculptum, A. ovale, A. parvum e Rhipicephalus sanguineus; em equídeos A. sculptum, Dermacentor nitens e R.(Boophilus) microplus; em bovinos R. (Boophilus) microplus e A. sculptum. Nas aves silvestres foram coletadas ninfas de A. sculptum e A. nodosum. Nos pequenos roedores coletou ninfas de A. parvum, larvas de Amblyomma spp e larvas de Ornithodoros sp. Coletas fortuitas em répteis, resultaram em ninfas e adultos de A. rotundatum e larvas de Amblyomma sp. Duas espécies de riquetsias do grupo da febre maculosa foram identificadas R. amblyommii e candidatus R. andeanae ambas em A. parvum e R. bellii em A. rotundatum. O carrapato Ornithodoros sp encontrado diverge morfologicamente e geneticamente das espécies conhecidas constituindo-se em uma nova espécie. De forma global ficou evidente que os animais na área estudada são expostos a uma diversidade maior de macroparasitos (carrapatos) e microparasitos (bactérias) do que em áreas muito mais antropizadas. O papel desta diversidade maior no desenvolvimento de doenças, na prevenção destas, merece investigações adicionais. / Aiming contributing to the description of species and of the ecology of ticks and Rickettsia in the Cerrado (savannah) this research was conducted in private farm and surroundings in Araguapaz county, Goiás. Overall eleven samplings, eight in consecutive seasons in three phytofisiognomies, were done along four years. Ticks were collected from the environment, domestic animals, birds and small mammals and Rickettsia DNA was searched for in a sample of this ectoparasites. Amblyomma sculptum, A. ovale, A. parvum, A. naponense, A. rotundatum and Ornithodoros sp. were collected from the environment and gallery forests exhibited the overall highest infestation and tick species diversity. A. sculptum ticks exhibited a seasonal pattern with larvae and nymphs prevailing in the driest seasons and adults in most humid ones. Dogs were parasitized by A. sculptum, A. ovale, A. parvum and Rhipicephalus sanguineus; horses by A. sculptum, Dermacentor nitens and Rhipicephalus (Boophilus) microplus; cattle by Rhipicephalus (Boophilus) microplus, and A. sculptum. A. sculptum and A. nodosum nymphs were collected from birds and A. parvum nymphs, Amblyomma sp. and Ornithodoros sp. larvae from small mammals. Unplanned tick collections from reptiles yielded A. rotundatum nymphs and adults as well as Amblyomma sp. larvae. Two spotted fever Rickettsia species were identified; R. amblyommii and candidatus R. andeanae both in A. parvum as well as R. bellii in A. rotundatum. The Ornithodoros sp. tick found diverge both morphologically and genetically from known species and a new tick species may be supposed. Broadly it is evident that in the studied area animals are exposed to a higher macroparasite (ticks) and microparasites (bactéria) that those from more anthroposized areas. The role of such higher parasite diversity in the development or prevention of diseases should be further investigated. / Tese (Doutorado)
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Antígenos de excreção/secreção de Strongyloides venezuelensis aplicados ao diagnóstico da estrongiloidíase humana / Excretion/secretion antigens of Strongyloides venezuelensis applied to the diagnosis of human strongyloidiasisCunha, Renata Araújo 23 January 2017 (has links)
CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A estrongiloidíase humana é uma parasitose intestinal negligenciada com ampla distribuição mundial, podendo acarretar cronificação e hiperinfecção caso não seja diagnosticada precocemente. Os casos que merecem mais atenção são aqueles relacionados, principalmente, à pacientes imunocomprometidos. O diagnóstico parasitológico desta helmintose é pouco sensível devido a eliminação pequena e irregular de larvas nas fezes. Os métodos imunológicos, principalmente enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), apresentam elevada sensibilidade e especificidade. No entanto há sempre a necessidade de aprimorar e elevar a eficiência diagnóstica para evitar reatividade-cruzada e casos de resultados falsos-negativos. O objetivo deste estudo foi de produzir e padronizar antígenos de excreção/secreção (E/S) de larvas filarioides (L3) de Strongyloides venezuelensis para uso no imunodiagnóstico. As larvas L3 de S. venezuelensis foram obtidas para a produção de extrato salino total (SE), E/S no meio Roswell Park Memorial Institute (RPMI) e E/S em solução salina tamponada com fosfato (PBS). Todos os antígenos foram utilizados na detecção de IgG anti-S. stercoralis em doentes com e sem condições imunossupressoras. Utilizaram-se 150 amostras de soro humano, divididas em 5 grupos. Indivíduos imunocompetentes positivos para estrongiloidíase (n = 30) ou negativos para estrongiloidíase (n = 30); Pacientes com outros parasitas (n = 30), como ancilostomídeos, Ascaris lumbricoides, Hymenolepis nana, Giardia lamblia, Schistosoma mansoni, Enterobius vermicularis, Trichuris trichiura e Taenia sp; pacientes imunossuprimidos positivos para estrongiloidíase (N = 30), incluindo HIV, diabetes, alcoólatras, tuberculose, câncer e alcoólatras com câncer e pacientes imunossuprimidos negativos para parasitas intestinais (n = 30), incluindo HIV, diabetes, alcoolistas, tuberculose e câncer. Observou-se que todos os antígenos apresentaram frações antigênicas semelhantes com peso molecular de 62, 44, 39, 33 e 18 kDa. No entanto, quando utilizados em teste ELISA os antígenos E/S tanto em meio RPMI quanto em PBS apresentaram-se mais específicos que o SE, 94,4%, 96,7% e 77,8% respectivamente, enquanto que o antígeno E/S em PBS foi mais sensível (95,0%) que os outros dois antígenos (SE 93,3% e RPMI 86,7%). Os antígenos E/S apresentaram-se de fácil execução e o produto E/S em PBS mostrou-se mais sensível e específico que os demais antígenos em estudo. Concluiu-se que, o antígeno E/S em PBS é uma boa alternativa para diagnóstico mais sensível e específico da estrongiloidíase humana. / Human strongyloidiasis is a neglected intestinal parasitosis, with a large worldwide distribution, affecting millions of people, and may lead to chronification and hyperinfection if not diagnosed early. The cases that deserve more attention are those related, mainly, to immunocompromised patients. The parasitological diagnosis of this helminth is not very sensitive due to the small and irregular larval output in the faeces. Immunological methods, especially enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), present high sensitivity and specificity, however, there is always a need to improve and increase diagnostic efficiency to avoid cross-reactivity and cases of false-negative results. The aim of this study was to produce and standardize excretion/secretion (E/S) antigens of filarial larvae (L3) of Strongyloides venezuelensis for immunodiagnostic use. The L3 larvae of S. venezuelensis were obtained for the production of total saline extract (SE), E/S in Roswell Park Memorial Institute medium (RPMI) and E/S in phosphate-buffered saline (PBS). All antigens were used in the detection of IgG anti- S. stercoralis in patients with and without immunosuppressive conditions. A total of 150 human serum samples were used, divided into 5 groups. Immunocompetent individuals positive for strongyloidiasis (n=30) or negatives for strongyloidiasis (n=30); patients with others parasites (n=30) such as hookworms, Ascaris lumbricoides, Hymenolepis nana, Giardia lamblia, Schistosoma mansoni, Enterobius vermicularis, Trichuris trichiura and Taenia sp; immunosuppressed patients positive for strongyloidiasis (n=30), including HIV, diabetes, alcoholics, tuberculosis, cancer, and alcoholics with cancer and negative immunosuppressed patients for intestinal parasites (n=30) including HIV, diabetes, alcoholics, tuberculosis and cancer. All antigens were observed to have similar antigenic fractions having molecular weights of 62, 44, 39, 33 and 18 kDa. However, when used in the ELISA test the E/S antigens in both RPMI and PBS media were more specific than SE, 94.4%, 96.7% and 77.8%, respectively, whereas the antigen E/S in PBS was more sensitive (95.0%) than the other two antigens (SE 93.3% and RPMI 86.7%). The E/S antigens were easy to perform and the E/S product in PBS was more sensitive and specific than the other antigens in the study. It may conclude that the E/S in PBS antigen is a good alternative for a more sensitive and specific diagnosis of human strongyloidiasis. / Dissertação (Mestrado)
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Efeito da infusão de Artemisia annua cultivada em solo com aplicação de silicato de cálcio e magnésio sobre o controle de Toxoplasma gondii in vitroRostkowska, Cristina 24 August 2012 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Toxoplasmosis is an important zoonotic disease due to ability of its causal agent,
Toxoplasma gondii, to infect large number of vertebrates and to be associated with congenital
infection or opportunistic disease in immunosuppressed patients. As the traditional treatment
has shown adverse effects, low-toxicity compounds including artemisinin and its derivatives
have been researched, as well Artemisina annua tea infusion. The use of silicon in the soil of
A. annua crops and its role on artemisinin content has not been studied yet. This study aimed
to investigate the effects of silicon on A. annua plant physiology and the role of the tea
infusion obtained from these plants in the control of T. gondii infection in cell culture. The
experimental design was a completely randomized design (CRD), in which A. annua was
planted in the soil with five different doses of calcium/magnesium silicate (0, 200, 400, 800
and 1600 kg ha-1) and five replications, and maintained in a greenhouse. Analysis of foliar
macronutrients showed a significant increase only for nitrogen, in the presence of the highest
dose of silicate in the soil. The foliar micronutrient and Si concentrations as well the plant
height were not significantly changed with any silicate doses in the soil. The use of 400 kg
ha-1 of silicate induced the highest total glandular trichome area that was also associated with
the intact glandular trichomes, as observed by scanning electron microscopy, and with the
highest artemisinin content in plant leaves and tea infusion, as determined by thin layer
chromatography (TLC) and high performance liquid chromatography (HPLC), respectively.
HeLa cell treatments along with or after T. gondii infection, with infusion of A. annua grown
in the soil without or with silicate (400 kg ha-1), induced a decrease of parasite proliferation in
a dose-dependent manner, as also seen for cell treatment with pure artemisinin. In conclusion,
the use of silicon had positive effect on the glandular trichome areas and artemisinin contents,
but this outcome was not associated with a better efficacy of A. annua tea infusion on T.
gondii replication. These findings suggest that other components rather than artemisinin could
be contributing to this effect, such as flavonoids present in its leaves, which may act in
synergism with the artemisinin and improve its efficacy. / A toxoplasmose é uma zoonose importante devido à capacidade de seu agente causal,
Toxoplasma gondii, de infectar um grande número de vertebrados e ser associada com
infecção congênita ou doença oportunista em pacientes imunocomprometidos. O tratamento
tradicional mostra efeitos adversos levando à pesquisa de compostos de baixa toxicidade
como a artemisinina, seus derivados e a infusão da planta Artemisia annua. A utilização de
silício no solo de culturas de A. annua e seu papel no conteúdo de artemisinina ainda não
foram estudados. O objetivo deste estudo foi investigar os efeitos do silício sobre a fisiologia
da planta A. annua e o papel da infusão destas plantas sobre o controle da infecção de T.
gondii em cultura celular. Foi utilizado o delineamento inteiramente ao acaso (DIC), no qual
A. annua foi plantada em solo com aplicação de cinco diferentes dosagens de silicato de
cálcio/magnésio (0, 200, 400, 800 e 1600 kg ha-1), em cinco repetições e mantida em casa de
vegetação. A análise de macronutrientes foliares mostrou um aumento significativo apenas
para o nitrogênio, na presença da maior dosagem de silicato no solo. As quantidades de
micronutrientes e silício foliares bem como a altura da planta não foram significativamente
alteradas em quaisquer dosagens de silicato no solo. A aplicação de 400 kg ha-1 de silicato
induziu a maior área de tricomas glandulares totais que foi associada com os tricomas
glandulares intactos, como observado por microscopia eletrônica de varredura, e com o mais
alto conteúdo de artemisinina nas folhas e na infusão da planta, como determinado por
cromatografia em camada fina (TLC) e cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC),
respectivamente. Os tratamentos de células HeLa, simultaneamente ou após a infecção por T.
gondii, com infusão de A. annua cultivada sem ou com silicato (400 kg ha-1) aplicado ao solo,
induziram decréscimo dependente da dose na proliferação parasitária, como também
verificado para o tratamento das células com artemisinina pura. Em conclusão, o uso de silício
teve efeito positivo sobre as áreas de tricomas glandulares e seu conteúdo de artemisinina,
mas este resultado não foi associado com melhor eficácia da infusão de A. annua sobre a
replicação intracelular de T. gondii. Estes resultados sugerem que outros componentes além
da artemisinina poderiam contribuir para este efeito, como os flavonóides presentes nas folhas
de A. annua que podem atuar em sinergismo com a artemisinina e melhorar a sua eficácia. / Doutor em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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