Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-13T16:46:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SoroepidemiologiaInfeccaoVirus.pdf: 1243203 bytes, checksum: 154cbb4479b043390bc9326ebef54cdc (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-28T14:52:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroepidemiologiaInfeccaoVirus.pdf: 1243203 bytes, checksum: 154cbb4479b043390bc9326ebef54cdc (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-28T14:52:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_SoroepidemiologiaInfeccaoVirus.pdf: 1243203 bytes, checksum: 154cbb4479b043390bc9326ebef54cdc (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2006 / As hepatites virais representam um importante problema de saúde pública no Brasil e no mundo. A hepatite B e a hepatite C são as de principal interesse para os profissionais da área de saúde em função do modo de transmissão e da possibilidade de aquisição ocupacional. O presente trabalho teve por principal objetivo verificar a soroprevalência da infecção pelo Vírus da Hepatite B (VHB) e pelo Vírus da Hepatite C (VHC) em cirurgiões-dentistas e relacioná-la com os fatores de risco. Participaram do estudo 97 cirurgiões-dentistas, sendo 39 do gênero masculino e 58 do gênero feminino, no período de junho a dezembro de 2005, que atuam no município de Belém, Pará, Brasil. Os dados epidemiológicos foram obtidos por meio de inquéritos e os sorológicos por um ensaio imunoenzimático para a pesquisa de antígeno e anticorpo tanto para o VHB quanto para o VHC. O teste de Tendência foi utilizado para a análise estatística dos resultados. A prevalência do VHB foi de 6,2%, enquanto do VHC foi de 3,1% entre a população estudada. Das amostras sororreativas para os marcadores da hepatite B, a prevalência foi de 1,03% (1/97) para o anti-HBc total, 5,16% (5/97) para a presença simultânea do anti-HBc total e anti-HBs e 54,61% (53/97) para o anti-HBs. Quando comparado ao encontrado na população de doadores de sangue no Estado do Pará a prevalência do VHC na população estudada foi significativamente maior, enquanto a do VHB foi semelhante. Além disso, 37,7% (36/97) relataram terem tido algum tipo de exposição ocupacional, estando o acidente com objetos pérfuro-cortante como o mais relatado (86,1%). A medida adotada após a exposição foi sempre a lavagem com água e sabão e apenas 2,8% (1/36) dos acidentados relataram à realização de testes sorológicos. O conhecimento das normas de biossegurança e a utilização de pelo menos uma barreira de proteção individual foram relatados por todos, sendo o uso de luvas e máscara a resposta mais mencionada (96,9%). Encontravam-se imunizados contra o VHB por meio de vacina 54,61% (53/97) dos cirurgiões-dentistas, enquanto que imunes por infecção natural 5,16% (5/97). O elevado percentual de ocorrência de acidentes ocupacionais, aliado a baixa soroconversão pós-exposição dentre os cirurgiões-dentistas participantes demonstra a necessidade de se conhecer a prevalência de infecções de risco ocupacional em profissionais da área de saúde para que se adotem medidas de prevenção e controle mais eficazes contra os agentes causadores. / Viral hepatitides represent an important problem of public health in Brazil and in the world. Hepatitis B and hepatitis C are the most interesting for health professionals due to the form of transmission and the possibility of occupational acquisition. The present work intended, as its main objective, to verify the seroprevalence of the infection by the Hepatitis B Virus (HBV) and by the Hepatitis C Virus (HCV) in surgeon-dentists, and to relate it to risk factors. 97 surgeon-dentists, 39 males and 58 females, who work in the city of Belém, Pará, Brazil, participated in the study, from June to December of 2005. Epidemiologic data have been obtained by inquiries and the serologic ones by an immunoenzymatic assay for research on antigen and antibody for both the HBV and the HCV. The trend test was used for statistical analysis of the results. The prevalence of the HBV was of 6,2%, and the HCV was of 3,1% among the studied population. Out of the seroreactive samples to the markers of hepatitis B, the prevalence was of 1,03% (1/97) for total anti-HBc, 5,16% (5/97) for the simultaneous presence of total anti-HBc and anti-HBs, and 54,61% (53/97) for anti-HBs. When compared to the data found in the population of blood donors in the State of Pará, the prevalence of the HCV in the studied population was significantly higher, while the prevalence of the HBV was similar. Moreover, 37,7% (36/97) reported having had some type of occupational exposition, and accidents with cutting and piercing objects was the major cause (86,1%). The procedure after the exposition was always washing the wound with water and soap, and only 2,8% (1/36) of the victims reported the accomplishment of serologic tests. Knowledge of biosafety norms and the usage of at least one barrier of individual protection were stated by all dentists. The usage of gloves and masks was the most reported reply (96,9%). 54,61% (53/97) of the surgeon-dentists were immunized by HBV vaccination; 5,16% (5/97) were immunized by natural infection. The high percentage of occupational accidents, allied with the low post-exposition seroconversion amongst the surgeon-dentists, demonstrates the need of knowing the prevalence of infections of occupational risk in health professionals so that more efficient and effective prevention and control measures against the causing agents can be adopted.

A infecção pelo HEV é reconhecida como um considerável problema de saúde pública em diversas regiões do mundo. Embora caracterizada como uma infecção benigna com um curso evolutivo autolimitado, recentes estudos têm mostrado sua evolução para cronicidade em indivíduos imunocomprometidos. Além disso, tem sido verificado que nesses indivíduos a infecção crônica pelo HEV pode evoluir para fibrose hepática progressiva, culminando com o desenvolvimento de cirrose. Não existem dados acerca da prevalência da infecção pelo HEV em pacientes infectados pelo HIV no Brasil, onde a circulação deste vírus tem sido demonstrada em diversos grupos de indivíduos imunocompetentes e, até mesmo, em alguns animais provenientes de diferentes regiões do país. Com base nisso, este trabalho teve como objetivo estimar a prevalência de marcadores sorológicos e moleculares da infecção pelo HEV, bem como a padronização de uma PCR em tempo real para a detecção e quantificação da carga viral do HEV na população de soropositivos da cidade de São Paulo. Foram incluídos neste estudo soro e plasma de pacientes infectados pelo HIV (n=354), que foram divididos em grupos de acordo com a presença ou ausência de coinfecção pelos vírus das hepatites B (HBV) e C (HCV). Essas amostras foram coletadas entre 2007 e 2013. Anticorpos anti-HEV IgM e IgG foram pesquisados pela técnica de ELISA (RecomWell HEV IgM/ IgG - MIKROGEN®), e, em alguns casos, confirmados por Immunoblotting (RecomLine HEV IgM/ IgG - MIKROGEN®). Todas as amostras foram submetidas à pesquisa de HEV RNA através da PCR em tempo real padronizada. Cerca de 72% dos indivíduos avaliados pertenciam ao sexo masculino. A média de idade entre a população analisada foi de 48,4 anos. Os anticorpos anti-HEV IgM e IgG foram encontrados em 1,4% e 10,7% dos indivíduos dessa população, respectivamente. Apenas dois pacientes apresentaram positividade simultânea para anti-HEV IgM e IgG. Não houve diferença estatisticamente relevante quanto à presença de marcadores sorológicos nos grupos de estudo. Além disso, foi detectado o HEV RNA em 10,7% das amostras analisadas, entre as quais, seis apresentaram simultaneamente algum marcador sorológico (5 anti-HEV IgG e 1 IgM). A presença deste marcador foi predominante no grupo de pacientes com coinfecção pelo HCV. Através deste trabalho pôde-se constatar, portanto, que o HEV é circulante entre a população de infectados pelo HIV em São Paulo, e que o seguimento desses pacientes se faz necessário dado a possibilidade de progressão para infecção crônica e cirrose / HEV infection is recognized as a significant public health problem in different world regions. Although initially characterized as a benign infection with selflimited course, recent studies have showing its evolution to chronicity in immunocompromised individuals. Furthermore, in these individuals the chronic infection can develop progressive liver fibrosis leading to cirrhosis. There are no data regarding prevalence of HEV infections in HIV- infected patients in Brazil, where the circulation of this virus has been demonstrated in different individuals groups and in some animals from different regions of the country. Based on this, this study aimed to assess the prevalence of serological and molecular makers of HEV infection and the standardization of real-time PCR for the detection and quantification of HEV viral load in HIV-infected individuals in São Paulo. Serum and plasma samples of HIV-infected patients (n=354), collected between 2007 and 2013, were included and organized in groups of co-infection (HIV/ HBV, HIV/HCV and HIV/ HBV/ HCV) and HIV mono-infection. Antibodies anti-HEV IgM and IgG were detected by ELISA (RecomWell HEV IgM/ IgG - MIKROGEN®), and in some cases confirmed by immunoblotting (RecomLine HEV IgM/ IgG - MIKROGEN®). All samples were submitted to research HEV RNA by real-time PCR. About 72% of the patients were male. The mean age of this population was 48.4 years. The anti-HEV IgM and IgG antibodies were found in 1.4% and 10.7%, respectively. Only two patients presented simultaneous anti-HEV IgM and anti- HEV IgG. There was no statistically significant difference in the presence of serological makers among the HIV infection groups. In addition, HEV RNA was detected in 10.7% of samples and six of these samples presented simultaneously a serological maker (5 anti-HEV IgG and 1 IgM). The presence of this maker was more frequent in the co-infection HIV/ HCV group. Through this work, we observed that HEV is circulating among the HIV-infected population in São Paulo, and the monitoring these patients is necessary because of the possibility progression to chronic infection and cirrhosis

O presente estudo realizou o sequenciamento de nova geração do vírus da hepatite C genótipo 1, incluindo os subtipos 1a (n=51) e 1b (n=49), e identificou variantes associadas com resistência (RAV) aos antivirais de ação direta em pacientes sem tratamento prévio. No subtipo 1a, foram encontradas RAV para as regiões NS3-4A, NS5A e NS5B em 10%, 22% e 8% dos pacientes, respectivamente. RAV detectadas foram: T54S (2%), V55A (2%), Q80K (4%) e R155K (2%) na protease NS3-4A; Q30H (4%), H58P (10%) e Q30H/R+Y93C/H/N (8%) na região NS5A; e A421V (8%) na polimerase NS5B. As frequências das RAV para o subtipo 1b foram 12%, 53% e 31% para as regiões NS3-4A, NS5A e NS5B, respectivamente. Foram encontradas as RAV F43I (2%), T54S (4%), Q80H (2%), D168E (2%) e M175L (2%) na região NS3-4A; L28M (2%), R30Q (2%), L31M (2%), Q54H (27%), A92T (2%), Y93H (4%), Q54H+A92T (6%), Q54H+Y93H (6%) e A92T+Y93H (2%) na região NS5A e, L159F (2%), C316N (4%), A421V (7%), L159F+C316N (9%) e S556G (9%) na polimerase. Utilizando esta metodologia, um recombinante inter-subtipo 1a/1b foi identificado. / This study performed the next-generation sequencing of the hepatitis C virus genotype 1, including subtypes 1a (n = 51) and 1b (n = 49), and identified resistance-associated variants (RAVs) to direct-acting antivirals in previously untreated patients. In subtype 1a, RAVs were found for NS3-4A, NS5A, and NS5B regions in 10%, 22% and 8% of patients, respectively. RAVs detected were: T54S (2%), V55A (2%), Q80K (4%) and R155K (2%) in NS3-4A protease; Q30H (4%), H58P (10%) and Q30H/R+Y93C/H/N (8%) in NS5A region; and A421V (8%) in NS5B polymerase. Frequencies of RAV for subtype 1b were 12%, 53% and 31% for NS3-4A, NS5A and NS5B regions, respectively. RAVs F43I (2%), T54S (4%), Q80H (2%), D168E (2%) and M175L (2%) were found in NS3-4a region; L28M (2%), R30Q (2%), L31M (2%), Q54H (27%), A92T (2%), Y93H (4%), Q54H+A92T (6%), Q54H+Y93H (6%) and A92T+Y93H (2%) in NS5A region and, L159F (2%), C316N (4%), A421V (7%), L159F+C316N (9%) and S556G (9%) in polymerase. By using this methodology, a recombinant inter-subtype 1a/1b was identified.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:55:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kerlita Kyarely Goncalves.pdf: 1802020 bytes, checksum: c89e713a3c5e49161a0f905b69790e4a (MD5) Previous issue date: 2005-02-03 / Hepatitis C (HCV) is considered to be an important problem of public health, affecting millions of people all over the world; it is the most frequent cause of a chronic evolution resulting in grave and long term consequences. Prisoners are currently considered to be an important group of risk for diseases like Hepatitis C due to the conditions of confinement, social margination, drug dependence, low social-economic level, and precarious conditions of medical assistance in the prison atmosphere. The objective of this study was to identify the prevalence of Hepatitis C among the male population of a prison complex in the State of Goiás (Brazil) to try to detect any relation between the prison atmosphere and social factors which may contribute to the risk behavior of such a population. During the period of February to September of 2004, a universe of 270 inmates answered a questionnaire, soliciting social-economic and behavioral information; they then passed through examinations for the detection of anti-HCV antibodies. The prison population sampled in the correctional facilty of Goias was composed principally of white detainees, ranging in age from 21 to 30 years of age, in legal or common-law marriages, who studied up to the fourth grade and earned an average of one minimum salary (<US$100.00) per month before prison. Of the tested prisoners, 14,8% were positive for anti-HCV antibodies; 17,5% of these presented co-infection HCV-HIV. The statistically significant risk factors observed were: age equal to or greater than 31 years of age; the use of drugs, either injected or not; tattoos; sexual relations with a drug user and the occurrence of sexually transmitted diseases. These results suggest the importance of establishment a continuous health programs to make possible measures of control and prevention of HCV infection in the prison atmosphere. / A hepatite C (HCV) é considerada um importante problema de saúde pública, afetando milhões de pessoas em todo o mundo; é a causa mais freqüente de evolução crônica resultando em graves seqüelas a longo prazo. Na atualidade, os detentos são considerados um importante grupo de risco para doenças como a hepatite C, devido às condições de confinamento, marginalização social, dependência de drogas, baixo nível sócio-econômico e precárias condições de assistência médica nesse ambiente. Este estudo teve por objetivo identificar a prevalência de hepatite C na população masculina de detentos em regime fechado de um complexo prisional de Goiás, buscando detectar a relação entre o ambiente prisional e fatores sociais que possam contribuir para o comportamento de risco de tal população. No período de fevereiro a setembro de 2004, um universo de 270 detentos, responderam uma ficha cadastro/formulário contendo informações sócio-econômicas e comportamentais; depois eles passaram por exames para a detecção de anticorpos anti-HCV. A população carcerária da Agência Prisional de Goiás se caracteriza, principalmente, por detentos brancos variando em idade de 21 a 30 anos, casados/amasiados, que estudaram por até 4 anos e recebiam antes da prisão em média 1 salário mínimo mensalmente. Foi encontrada uma prevalência de 14,8% de detentos com anticorpos anti-HCV e 17,5% destes apresentaram coinfecção HCV-HIV. Os fatores de risco estatisticamente significantes observados foram: a idade maior ou igual a 31 anos; o uso de drogas, injetáveis ou não; tatuagem; prática de sexo com usuário(a) de drogas e a ocorrência de doenças sexualmente transmissíveis. Esses resultados sugerem a importância do estabelecimento de programas de saúde contínuos a fim de possibilitar medidas de controle e prevenção dessa infecção no ambiente prisional.

Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-02-04T19:29:51Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raquel Silva Pinheiro - 2014.pdf: 1371271 bytes, checksum: b44f6cc1923da6f739d3902c7f1ab282 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-02-05T09:49:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raquel Silva Pinheiro - 2014.pdf: 1371271 bytes, checksum: b44f6cc1923da6f739d3902c7f1ab282 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-05T09:49:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Raquel Silva Pinheiro - 2014.pdf: 1371271 bytes, checksum: b44f6cc1923da6f739d3902c7f1ab282 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Hepatitis A virus (HAV) is a major cause of enterically transmitted hepatitis worldwide. Poor sanitary conditions particularly lack of safe water and sewerage systems have been associated with increased prevalence of this infection. In Brazil, there are more than 1, 200, 00 families living in rural settlements. Most of them have no access to safety water, and many had lived previously in landless camping in poor hygiene conditions. The aim of this study was to estimate the prevalence of hepatitis A among people living in rural settlements in Central Brazil. From 2008 to 2011, individuals living in rural settlement in the municipalities of Jataí and surround (n=466), Goiás/GO and Ponta Porã, Mato Grosso do Sul/MS (n= 454) were interviewed and blood samples were collected and tested for HAV antibodies (total anti-HAV) by ELISA, respectively. Globally 85.9% (95% CI: 83.5 – 88.0). Of individuals had been previously infected by HAV. None child aged less than five years was anti-HAV positive. Otherwise, almost the totality (98.7%) of individuals aged 20 years or more were exposed to HAV. Concerning individuals with 10-19 years old, the overall prevalence of HAV was 69,6%. In the settlements studied in Goiás, age, history of life in landless, number of people per household and water source were independently associated to HAV positivity (p< 0.05). The results of this study suggest intermediate infection rates for HAV infection in rural settlements in Central Brazil, ratifying the need for public health politics addressed to this population segment that presents characteristics which may favor HAV acquiring and spread. Hepatitis A vaccine should be guaranteed for rural populations. / O vírus da hepatite A (HAV) é uma das principais causas de hepatites transmitidas entericamente em todo o mundo. Condições sanitárias deficientes, particularmente, a falta de água potável e sistemas de esgoto têm sido associadas com prevalência elevada para essa infecção. No Brasil, mais de 1.200.000 famílias vivem em assentamentos rurais, e a maioria não tem acesso a água potável. Além disso, muitos relatam ter vivido anteriormente em acampamentos sob condições precárias de higiene. O objetivo deste estudo foi estimar a prevalência da infecção pelo HAV em assentamentos rurais da Região Centro-Oeste do Brasil. Trata-se de um estudo observacional, de corte transversal. De 2008 a 2011, indivíduos de assentamentos rurais dos municípios de Jataí e Entorno (n = 466), Goiás/GO e Ponta Porã, Mato Grosso do Sul/MS (n = 454) foram entrevistados e amostras de sangue foram coletadas e testadas para detecção de anticorpos anti-HAV total pelo ensaio imunoenzimático (ELISA). A prevalência global para infecção pelo HAV foi de 85,9% (IC95%: 83,5 - 88,0). Nenhuma criança com menos de cinco anos foi exposta ao HAV. Por outro lado, quase a totalidade (98,7%) dos indivíduos com idade igual ou superior a 20 anos foram anti-HAV positivos. Considerando os indivíduos na faixa etária de 10-19 anos, a prevalência global foi de 69,6%. Nos assentamentos estudados em Goiás, idade, história de vida em acampamento, número de pessoas por domicílio e origem da água consumida foram fatores independentemente associados a positividade ao anti-HAV (p<0,05). Os resultados deste estudo sugerem uma endemicidade intermediária para a infecção pelo HAV em assentamentos rurais do Brasil Central, ratificando a necessidade de políticas públicas direcionadas para esse segmento populacional, que apresenta características que favorecem a aquisição e propagação desse vírus. A vacinação contra hepatite A deve ser garantida para população rural.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-10-06T15:17:41Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Helen de Oliveira Soares - 2013.pdf: 801287 bytes, checksum: 7d8d0899bf1a66a37c47e1cc61097a1e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-10-06T15:55:38Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Helen de Oliveira Soares - 2013.pdf: 801287 bytes, checksum: 7d8d0899bf1a66a37c47e1cc61097a1e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-06T15:55:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Helen de Oliveira Soares - 2013.pdf: 801287 bytes, checksum: 7d8d0899bf1a66a37c47e1cc61097a1e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-04-29 / Hepatitis A virus (HAV) is mainly transmitted by the oral-fecal route. HAV infection prevalence is associated with socio-economic and hygienic conditions. In Brazil, hepatitis A is considered an endemic infection and some studies have shown a shift from high to intermediate endemicity pattern. Almost recyclable waste collectors have a lifestyle that is characterized by precarious social, cultural and environmental factors. The epidemiological status of HAV infections of these workers remains unknown. So, this study aimed to investigate the hepatitis A virus infection profile in recyclable waste collectors in Goiânia, Goiás. A cross-sectional survey was carried out with 431 individuals who were recruited in all 15 recycling cooperatives in Goiânia, Goiás. All individuals were interviewed and their serum samples were tested for anti-HAV total marker by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Total anti-HAV positive samples were tested for IgM anti-HAV marker by ELISA. Almost all population (429/431) was positive for total anti-HAV antibodies. By contrast, none were IgM anti-HAV positive. The seroprevalence of HAV infection among recyclable waste collectors in Goiânia-Goiás was 99,5% (IC 95%: 98,1-99,9). Unfavorable socio-economic, sanitary and house conditions (low education and family income, high number of people at home and lack of treated/filtered water), as well as risk practices (contact with contaminated waste, irregular use of gloves and eating from the garbage) were reported by a considerable percentage of participants. These findings highlight the need of actions of health promotion and diseases prevention to the population of recyclable waste collectors in Goiânia, Goiás. / O vírus da hepatite A (HAV) é transmitido principalmente pela via oral-fecal. A prevalência da infecção pelo HAV está associada às condições socioeconômicas e de higiene. No Brasil, a hepatite A é considerada uma infecção endêmica e alguns estudos têm revelado uma mudança no perfil de endemicidade de alto para intermediário. A maioria dos catadores de materiais recicláveis vive em condições sociais, culturais e ambientais precárias. A situação epidemiológica da infecção pelo HAV desses trabalhadores permanece desconhecida. Assim, este estudo teve como objetivo investigar o perfil da infecção pelo vírus da hepatite A em catadores de materiais recicláveis em Goiânia, Goiás. Constitui-se em estudo transversal realizado com 431 indivíduos recrutados nas 15 cooperativas de reciclagem em Goiânia, Goiás. Todos os participantes foram entrevistados e suas amostras de soros testadas para o marcador anti-HAV total pelo ensaio imunoenzimático (ELISA). As amostras positivas foram testadas para o marcador anti-HAV IgM também por ELISA. A quase totalidade da população (429/431) apresentou positividade para o marcador anti-HAV total, porém nenhum indivíduo foi positivo para anti-HAV IgM. A soroprevalência da infecção pelo HAV em catadores de materiais recicláveis em Goiânia-Goiás foi de 99,5% (IC 95%: 98,1-99,9). Características socioeconômicas, sanitárias e de moradia desfavoráveis (baixa escolaridade e renda familiar, número elevado de pessoas no domicílio e falta de água tratada/filtrada), bem como práticas de risco (contato com resíduos contaminados, uso irregular de luvas e ingestão de alimentos encontrados no lixo) foram relatadas por percentuais consideráveis dos participantes. Esses achados evidenciam a necessidade de ações de promoção da saúde e prevenção de doenças para a população de catadores de materiais recicláveis em Goiânia, Goiás.

Submitted by Tatiana Oliveira (tsilva@icict.fiocruz.br) on 2012-06-02T21:57:40Z No. of bitstreams: 1 debora_rl_santos_ioc_bp_0004_2010.pdf: 851931 bytes, checksum: 53ba90215d519794dc32572e27e887e9 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-02T21:57:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 debora_rl_santos_ioc_bp_0004_2010.pdf: 851931 bytes, checksum: 53ba90215d519794dc32572e27e887e9 (MD5) Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz.Instituto Oswaldo Cruz. Rio de janeiro, RJ, Brasil / Vírus da hepatite E (HEV) detectados em amostras de origem animal vêm sendo associados a casos humanos esporádicos de hepatite E aguda em regiões não endêmicas. No Brasil, a alta prevalência de anticorpos anti-HEV em suínos foi demonstrada em granjas comerciais sugerindo a grande disseminação deste vírus em rebanhos suinícolos. A fim de se comprovar a circulação do HEV no país três investigações foram conduzidas a partir de amostras obtidas de suínos, do ambiente, e de humanos. No primeiro estudo, foi realizado o acompanhamento sorológico de 26 animais desde o nascimento até a idade do abate em uma granja comercial e de 47 animais de uma fazenda modelo nos estados do Rio de Janeiro e Mato Grosso, respectivamente. Amostras de fezes foram coletadas de pocilgas de animais de diferentes faixas etárias. Ao fim deste estudo, a maioria dos animais era sororeativa para anti-HEV. Pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR), o genoma parcial do HEV foi detectado e as amostras classificadas no genótipo 3, o mesmo que circula em outras populações suínas tanto de regiões endêmicas quanto não-endêmicas. Posteriormente, para se avaliar a incidência de animais com infecção corrente durante o abate, um estudo foi conduzido em três abatedouros fiscalizados pelo Serviço de Inspeção Estadual do Rio de Janeiro (SIE). Pela técnica de PCR em tempo real, o HEV foi detectado em 9,6% das amostras obtidas de animais.Foram realizadas coletas de efluentes não tratados dos abatedouros estudados e o genoma do HEV foi detectado em três pontos de coleta de um abatedouro. A quantificação média observada foi de 101 a 105 cópias/mL para as amostras animais de bile e de 102 cópias/mL para as amostras ambientais. A detecção do genoma parcial pela técnica de nested RT-PCR foi realizada, para caracterização molecular das amostras. Estas foram classificadas no genótipo 3 subtipo 3b do HEV, agrupando-se com as amostras caracterizadas do estudo anterior sugerindo a circulação endêmica do HEV no Rio de Janeiro. Em um estudo retrospectivo realizado com pacientes agudos de hepatite não A-C atendidos no Grupo de Atendimento para Hepatites Virais do IOC/Fiocruz foi identificado o primeiro caso humano confirmado de hepatite E do Brasil. Esta amostra agrupou-se no genótipo 3 subtipo 3b, também relacionada às amostras obtidas de suínos da granja e dos abatedouros. De acordo as informações epidemiológicas do paciente, o consumo de carne de porco pode ter sido a fonte de infecção. Os estudos apresentados foram os primeiros que constataram a circulação do HEV em suínos, amostras ambientais e em humanos no Brasil. / Hepatitis E virus (HEV) detected in samples of animal origin have been associated with sporadic human cases of acute hepatitis E in non-endemic regions. In Brazil, the high prevalence of anti-HEV in pigs on commercial farms has been demonstrated suggesting the wide spread of this virus in herds suinícolos. In order to check the movement of the country HEV three investigations were conducted on samples obtained from pigs, environmental, and human. In the first study, we performed a serological monitoring of 26 animals from birth until the age of slaughter at a commercial farm and 47 animals on a model farm in the states of Rio de Janeiro and Mato Grosso, respectively. Stool samples were collected from pens of animals of different ages. At the end of this study, the majority of animals was sororeativa for anti-HEV. The technique of polymerase chain reaction (PCR), a partial genome of HEV has been detected and classified the samples with genotype 3, which runs the same in other populations of both pork and non-endemic regions endemic. Subsequently, to evaluate the incidence of infected animals during slaughter chain, a study was conducted in three slaughterhouses inspected by the State Inspection Service of Rio de Janeiro (SIE). By PCR in real time, HEV was detected in 9.6% of samples of sampled animais.Foram of untreated effluent from slaughterhouses and studied HEV genome was detected in three sampling points of a slaughterhouse. Quantification was observed mean 101-105 copies / mL for animals samples of bile and 102 copies / mL for environmental samples. The detection of partial genome by the technique of nested RT-PCR was performed for molecular characterization of the samples. These were classified as genotype 3 HEV subtype 3b, grouping with samples characterized in the previous study suggesting the endemic circulation of HEV in Rio de Janeiro. In a retrospective study of patients with acute hepatitis non-AC treated at Care Group for Viral Hepatitis of the IOC / Fiocruz was identified the first confirmed human case of hepatitis E in Brazil. This sample was grouped with genotype 3 subtype 3b, also related to the samples obtained from pigs on the farm and the slaughterhouse. According to epidemiological information of the patient, the consumption of pork may have been the source of infection. The studies presented were the first who observed the circulation of HEV in swine, human and environmental samples in Brazil.

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2014-10-29T13:42:36Z No. of bitstreams: 1 Maria Isabel Magalhães Santos Perfil das....pdf: 1133942 bytes, checksum: bcc264f7cc24ec022846c05825fd31cf (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-29T13:42:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Isabel Magalhães Santos Perfil das....pdf: 1133942 bytes, checksum: bcc264f7cc24ec022846c05825fd31cf (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Introdução: A doença causada pelo vírus da hepatite B (HBV) é um problema de saúde pública mundial. No Brasil, o sistema único de saúde (SUS) tem disponibilizado drogas antivirais para o tratamento de hepatite B crônica há mais de 10 anos, mas um sistema para o monitoramento e avaliação de resistência a estas drogas ainda não está disponível. Objetivo: Este estudo teve como objetivo determinar o perfil de mutações do HBV associadas com a resistência aos análogos de nucleos(t)ídeos entre 81 pacientes com infecção crônica pelo HBV: virgens de tratamento para hepatite B e tratados com diferentes análogos de nucleosídeos e nucleotídeos, no Hospital Professor Edgar Santos (HUPES-UFBA)- Salvador-BA. Metodologia: O HBV-DNA foi isolado de amostras de soro, amplificado por nested-PCR, utilizando-se primers deduzidos da região flaqueadora da domínio rt do gene P e sequenciados (ABI Prism 3730, Applied Biosystems, EUA). Duas a seis sequências de cada isolado foram alinhados e os sítios conflitantes foram resolvidos usando o software CLC Main Workbench v. 5.0 por inspeção visual dos eletroferogramas. As sequências consenso tinham um tamanho de 1032 pb (compreendendo os aminoácido 1-344 da rt). Estas sequências foram submetidas ao banco de dados HBVrt DB (Stanford University, EUA) para a análise de cada mutação de acordo com o genótipo e tratamento. Resultado: O genótipo A1 foi o mais prevalente (85,2%) seguido pelo genótipo A2 (4,9%) F (6,2%) e C1, D2 e D4 (1,2% cada). Seis pacientes (7 %) apresentaram mutações de resistência para LAM, ETV, TDF: dois com o padrão L180M + M204V e quatro com padrões diversos (L80I + L180M + M204I ;L80V + L180M + M204V; M204I; A194T). Todas estas mutações foram associadas ao genótipo A (quatro A1 e dois A2). Além disso, foi encontrado um paciente com HBV genótipo C típico do leste da Ásia. Destes pacientes, dois foram virgens de tratamento e quatro tinham histórico de tratamento para HIV ou HBV. Foram detectadas quatro mutações no gene S (três casos com a mutação sI195M e um a mutação sW196L) associadas às mutações do domínio rt do gene P, correspondendo à uma taxa de 6% de mutações de escape vacinal. A prevalência das mutações de resistência às drogas antivirais variou de acordo com a duração do tratamento e com o nível da barreira genética da droga utilizada. Neste estudo, foi encontrada uma forte associação entre a ocorrência de mutações de resistência do HBV e positividade para o AgHBe, co-infecção com o HIV e histórico de tratamento para HBV e/ou HIV. Conclusão: Antes da terapia ser iniciada é extremamente importante o monitoramento da carga viral e a identificação destas mutações para suportar decisões clinicas sobre o manejo dos pacientes e prevenir a emergência de vírus multi- resistentes. / Introduction: Hepatitis B virus (HBV) infection is a public health issue. The Brazilian public health system (SUS) has provided antiviral drugs for chronic hepatitis B treatment for over 10 years, but a system for monitoring for drug-related resistance mutations is not available. Objective: This study aims to determine the presence of HBV mutations associated with resistance to nucleos(t)ide analogs among 81 patients with chronic HBV infection-naïve and treated from University Hospital Professor Edgard Santos, Salvador-BA (HUPES-UFBA). Methods: Briefly, HBV-DNA was PCR amplified with primers deduced from the flanking of the rt domain at the HBV P gene and sequenced using ABI Prism 3730 (Applied Biosystems, USA). From two to six forward and reverse sequences of each isolate were assembled and conflicting sites were resolved using software CLC Main Workbench v. 5.0 by visual inspection of the electropherograms. Consensus sequence extended 1032 bp and encompassed the entire rt domain (from amino acid 1 to 344). Those sequences were submitted to the HBV drug resistance database (HBVrt DB, Stanford University, USA) to retrieve each mutation according to genotype and treatment. Results: HBV genotype A1 (85.2%) was the most prevalent followed by genotype A2 (4.9%), F (6.2%), and C1, D2 and D4 (1.2% each). Six patients (7%) exhibited resistance mutations to LAM, ETV and TDF: two with patterns L180M + M204V and four with other different patterns: L80I + L180M + M204I; L80V + L180M + M204V; M204I; A194T. All of these mutations were present in patients with genotype A (four A1 and two A2). Furthermore, this study found one patient with genotype C, common in East Asian. Of these patients, two were naïve and four had a history of treatment for HIV or HBV. In addition, four mutations in gene S (sI195M three cases with the mutation and one with the mutations W196L) associated with mutations in the rt domain of the P gene were detected, corresponding to a rate of 6% of vaccine escape mutations. Prevalence of drug-related resistance mutations varied according to treatment duration and the level of genetic barrier for the drugs used. Conclusion: In this study a strong association was found between the occurrence of HBV resistance mutations and HBeAg positivity, co-infection with HIV and a history of treatment for HBV and / or HIV. Once the drug therapy is initiated it is extremely important to monitor viral load and identify those mutations in order to support clinical decisions about patient management and also to prevent the emergence of multidrug-resistant viruses.

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2016-07-13T12:04:07Z No. of bitstreams: 1 Sidelcina Rugieri Pacheco Avaliação...2016.pdf: 1183745 bytes, checksum: cafa75f83141a4f66d07bae037fb741b (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2016-07-13T12:11:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Sidelcina Rugieri Pacheco Avaliação...2016.pdf: 1183745 bytes, checksum: cafa75f83141a4f66d07bae037fb741b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-13T12:11:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sidelcina Rugieri Pacheco Avaliação...2016.pdf: 1183745 bytes, checksum: cafa75f83141a4f66d07bae037fb741b (MD5) Previous issue date: 2016 / CAPES / CNPq / Fundação Gonçalo Moniz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / INTRODUÇÃO: A hepatite B (VHB) é uma infecção dinâmica crônica, que apesar de existir programas de imunização e tratamento antiviral disponível, existe o risco de emergência de mutações de resistência aos análogos de núcleos(t)ídeos (AN) que devem ser rastreadas, devido as suas implicações clínicas. O Brasil disponibiliza pelo SUS cinco drogas para o tratamento antiviral: IFN, LAM, ADF, ETV e TDF e um guia de conduta clínica para orientar o tratamento no território nacional, o Protocolo de Diretrizes Terapêuticas para Hepatite B e co-infecções. OBJETIVO: O objetivo do presente estudo foi avaliar as mutações de resistência aos AN, mutações de escape vacinal e genótipos circulantes em pacientes com hepatite B crônica em dois centros de referencia em Hepatites, na Bahia (região Nordeste) e no Acre (região Norte) do Brasil. MATERIAL E MÉTODOS: Foi utilizadas ferramentas de biologia molecular e bioinformática, através de nested PCR e sequenciamento direto das amostras, para rastrear as mutações de resistência, a região alvo foi a transcriptase reversa (RT) do gene P e as mutações de escape vacinal foi a região do gene S do VHB, como também os genótipos e subgenotipos do VHB. RESULTADOS: Foram incluídos 527 pacientes durante o período de 2011-2015, sendo 320 pacientes do HUPES/BA e 207 do FUNDHACRE/AC. Os pacientes que representam a região Nordeste foram 59,3 % do sexo masculino e uma média de idade de 44,75±12,4 DP, os pacientes da região Norte 42% foram do sexo masculino e a média de idade foi de 40,36±13,9 DP. Todos os pacientes incluídos apresentaram AgHBs persistente por mais de seis meses e 86,1% apresentaram AgHBe negativo. Foram sequenciadas 296 amostras dos pacientes com VHB crônica. Foram encontradas mutações de resistência aos AN na Região Norte 1,2% (2), Região Nordeste 7,4%(8) e no global 3,8%(20). Os padrões de mutações de resistência primária encontrados foram: rtA194T, (3) rtL180M+M204V, rtL180M+M204I, rtS202I, rtM204I, rtA181S, rtA181E e rtA184S. Em relação ao escape vacinal a frequencia para a Região Norte foi de 7,1% (11), Região Nordeste 8,4% (9) e no global 7,6% (20). Nos pacientes virgens de tratamento (n=189), a frequência de mutações de resistência foi de 6%, somente nas amostras da região Nordeste. Não houve diferença estatisticamente significante entre o grupo com ou sem mutação dos pacientes virgens de tratamento. Não foram encontradas mutações de resistência nas amostras da região Norte. Os genótipos circulantes nas duas regiões foram A, D e F, e a região Nordeste foi encontrada o genótipo C (C2). CONCLUSÃO: Os resultados demonstram a importância de rastrear e monitorar as mutações de resistência aos AN e de escape vacinal devido a importância epidemiológica e clínica na conduta terapêutica. / INTRODUTION: Hepatitis B virus (HBV) is a chronic dynamic infection, which although there immunization programs and antiviral therapy available, there is a risk of emergence of resistance mutations cores analogs (t) ide to be screened, because of their implications clinics. The Brazil offers the SUS five drugs for antiviral treatment: IFN, LAM, ADF, ETV and TDF and clinical guide of conduct to guide treatment in the country, the Therapeutic Guidelines Protocol for Hepatitis B and co-infections. AIM: The aim of this study was to evaluate the resistance mutations core analogues (t) ide, vaccine escape mutations and circulating genotypes in patients with chronic hepatitis B in two reference centers in Hepatitis, Bahia (Northeast) and Acre (Northern region) of Brazil. MATERIAL AND METHODS: Was used tools of molecular biology and bioinformatics by nested PCR and direct sequencing of samples to track resistance changes, the target region is the reverse transcriptase (RT) P gene and vaccine escape mutations was region of the gene S of HBV, as well as the HBV genotypes and subgenotipos. RESULTS: 527 patients were included during the period 2011-2015, with 320 patients HUPES / BA and 207 FUNDHACRE / AC. Patients representing the Northeast were 59.3% male and an average age of 44.75 ± 12.4 PD patients in the northern region 42% were male and the average age was 40, 36 ± 13.9 DP. All patients had persistent HBsAg for more than six months and 86.1% were HBeAg negative. We were sequenced 296 samples from patients with chronic HBV. the cores of similar resistance mutations were found (t) ide in the North 1.2% (2), Northeast 7.4% (8) and 3.8% overall (20). The patterns of primary resistance mutations were: rtA194T (3) rtL180M + M204V, M204I + rtL180M, rtS202I, rtM204I, rtA181S, and rtA181E rtA184S. Regarding vaccine escape the frequency for the Northern Region was 7.1% (11), Northeast 8.4% (9) and the global 7.6% (20). In treatment-naïve patients (n = 189), the frequency of resistance mutations was 6%, only the samples in the Northeast. There was no statistically significant difference between the groups with or without mutation of naive patients. There were no resistance mutations in samples from the North. Circulating genotypes in the two regions A, D and F, and the Northeast found the C genotype (C2). CONCLUSION: The results demonstrate the importance of tracking and monitoring the resistance mutations similar cores (t) ide and vaccine escape due to epidemiological and clinical importance in the therapeutic approach.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-04-14Bitstream added on 2014-06-13T18:31:21Z : No. of bitstreams: 1 yamasaki_lht_me_sjrp.pdf: 6194517 bytes, checksum: 350d37acd1e46ef2885eecc1354a317c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A infecção pelo vírus da Hepatite C (HCV) é considerada um grande problema de saúde pública, desde a sua descoberta em 1989. Entretanto a terapia mais utilizada atualmente, baseada no uso de Peginterferon, tem sucesso em aproximadamente 50% dos pacientes com o genótipo 1. Embora os mecanismos envolvidos nesta resistência viral ainda não sejam esclarecidos, sugere-se que fatores virais e do hospedeiro participam deste. A proteína não-estrutural 5A (NS5A) está envolvida em diversos processos celulares e é um componente essencial para o HCV. Entretanto, sua estrutura e função ainda não foram bem elucidadas. A partir destes fatos, os objetivos do presente estudo foram elaborar um modelo teórico da NS5A e investigar as propriedades estruturais e funcionais in silico. Foram analisadas 345 sequências da proteína NS5A do HCV de 23 pacientes infectados com o genótipo 1 ou 3. As composições de aminoácidos e de estrutura secundária demonstraram que há diferença entre os genótipos, podendo indicar que há diferenças nas interações proteína-proteína entre os genótipos, o que pode estar relacionado com a diferença da taxa de resistência ao tratamento. A análise funcional foi realizada com o ProtFun, que sugeriu que a NS5A estaria envolvida nas funções celulares de metabolismo intermediário central, tradução, crescimento, tranporte, ligação e hormônio. Estas funções variaram entre os domínios, suportando a hipótese de que a NS5A é uma proteína multifuncional. A análise pelo PROSITE indicou vários sítios de glicosilação, fosforilação e miristoilação, que são altamente conservados e podem ter função importante na estabilização da estrutura e função, sendo assim possíveis alvos de novos antivirais. Alguns deles estão em regiões relacionadas com a resposta ao tratamento. Outro... / Hepatitis C virus (HCV) infects almost 3% of people worldwide and it is considered the main cause of liver chronic diseases and transplants. Until today, there is no effective vaccine and the current most used therapy, based on Peginterferon, is successful only in 50% of patients infected by genotype 1. Although the outcomes of this treatment resistance are unclear, it is suggested host and virus factors may participate in this mechanism. Non-structural 5A (NS5A) protein is involved in several cellular and virus processes and it is a critical component of HCV. However, its structure and function are still uncertain. Regarding these facts, the present study attachments were to elaborate a model of the NS5A protein and to investigate NS5A structural and functional features, using in silico tools. It was analyzed 345 sequences of HCV NS5A protein from 23 patients infected by genotypes 1 or 3. Residues and secondary structure composition of all sequences demonstrated that there are differences between genotypes. It may indicate that there are differences in interactions between genotypes, which could be related with the distinct average of treatment resistance. In addition, among those that varied between genotypes, there were amino acids in regions that studies suggested as related with virus persistence. Functional analysis was performed with ProtFun. It suggested that NS5A is involved with central intermediary metabolism, translation, growth, transport, ligation and hormone functions in the cell. These functions vary between the domains, strengthening the hypothesis that NS5A is a multifunctional protein. Prosite motif search indicated that there are many glicosilation, fosforilation and myristoilation sites, which are highly conserved and may play an important role in structural stabilization and... (Complete abstract click electronic access below)