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Avaliação do efeito antiproliferativo do antagonista do peptídeo liberador de gastrina, RC-3095, e em associação com a temozolamida em modelos experimentais de gliomasOliveira, Marianne Schrader de January 2008 (has links)
Gliomas apresentam um prognóstico precário apesar das múltiplas modalidades terapêuticas como ressecção neurocirúrgica, radioterapia e quimioterapia, possivelmente pelo seu alto nível de invasividade e resistência aos tratamentos. Estudos recentes demonstraram que o peptídeo liberador de gastrina (GRP), assim como seu receptor, possui efeitos importantes no desenvolvimento de muitos tumores, inclusive de gliomas. O receptor de GRP está super expresso em linhagens celulares de glioblastomas tendo sua função relacionada com a proliferação celular, estimulando o crescimento tumoral. No presente estudo, foi investigado o efeito do RC-3095, um antagonista seletivo do receptor de GRP, como mono terapia e em associação à temozolamida (TMZ), um agente citotóxico alquilante de DNA, em modelos experimentais de células de glioma da linhagem C6 de rato in vitro e in vivo. A proliferação celular foi reduzida tanto por RC-3095 quanto por TMZ, porém quando ambos os agentes foram administrados em associação, a redução da proliferação foi significativamente mais efetiva. Nos experimentos in vivo, o grupo controle apresentou os tumores maiores (52 ± 15.5 mm3), enquanto RC-3095 reduziu o tamanho tumoral, tendo um efeito mais efetivo na dose 0.3 mg/kg (21 ± 9.7 mm3). Porém, a combinação dos dois agents produziu a maior redução no tamanho tumoral (10 ± 7.5 mm3), assim como, apresentou índices histológicos menos agressivos. Nossos resultados demonstram que a combinação de RC-3095 e temozolamida produz uma maior redução tumoral em modelos experimentais de glioma de rato indicando que RC-3095 pode ser um forte candidato para associação à temozolamida potencializando os efeitos de agentes alquilantes de DNA no tratamento de gliomas multiformes. / Malignant gliomas have a dismal prognosis despite multi-modality treatments like neurosurgical resection, radiation therapy and chemotherapy, mainly due to their high level of invasion. Recent studies demonstrated that gastrin-releasing peptide (GRP) and its receptors play a role in the development of a variety of cancers including gliomas. The GRP receptor was shown to be over-expressed on glioblastoma cell lines and its function is related with cellular growth. In the present study, we investigated the effects of RC-3095, a selective antagonist of the GRP receptor, alone and in combination with temozolomide (TMZ), a DNA alkylating agent, in vitro and in vivo using experimental rat C6 glioma models. Cellular proliferation was reduced in all treatments (TMZ, RC-3095 and TMZ + RC-3095) with the administration of TMZ together with RC-3095 being the most effective. In in vivo experiments, the control group displayed the largest tumors (52 ± 15.5 mm3), whereas RC-3095 reduced the tumor size, with the most significant effect observed at the dose of 0.3mg/kg (21 ± 9.7 mm3). The combined therapy produced the largest reduction in tumor size (10 ± 7.5 mm3), greater than with either treatment alone. Ours results show that the combination of RC-3095 and TMZ have additive effects on the in vitro and in vivo glioma growth therefore making RC-3095 a candidate drug to potentiate the effects of the DNA alkylanting agent temozolomide in the treatment of malignant gliomas.
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O conceito de gene em livros didáticos de biologia celular e molecular do ensino superiorEvangelista, Neima Alice Menezes 28 April 2016 (has links)
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Dissertação Neima Evangelista.pdf: 2019768 bytes, checksum: 7debce9b7ae044341689648611827274 (MD5) / CNPQ, CAPES, FAPESB / Apesar do papel central do conceito de gene no século XX, dúvidase controvérsiasa seu respeito têm sido frequentes nas últimas décadas, inicialmente na literatura sobre filosofia da biologia e, a partir dos anos 2000, em artigos empíricos e teóricos nas áreas de genética, biologia molecular e afins. Em particular, o que está em questão é a atual dificuldade de manter um conceito que foi e ainda é largamente usado, o chamado conceito molecular clássico, de acordo com o qual o gene éuma sequência de nucleotídeos deDNA que codifica um produto funcional, seja ele uma cadeia de polipeptídios ou uma molécula de RNA. Em vista dasdúvidas e controvérsias atuais sobre o conceito de gene na comunidade científica, nosso objetivo foi investigar como os genes são abordadosem edições recentes de livros didáticos de biologia celular e molecular amplamente utilizados em universidades ao redor do mundo. A seleção dos livros foi feita a partir de busca por ementas de disciplinas de biologia celular e molecular emtrês idiomas (inglês, português e espanhol),usando a ferramenta de buscas Google®.Cincolivros foramselecionados e submetidos aanálise categórica, com a decomposição do texto em unidades de registro, que foram entãorecompostasem categorias analíticas segundo critérios semânticos,relativos ao significado atribuído ao conceito de gene e a ideias relativas à função gênica. Os principais achados do presente trabalho mostram: (1) um predomínio do conceito molecular clássico nos livros didáticos analisados; (2) a ausência de uma abordagemhistórica e filosoficamente informada sobre os genes,que leve em conta que se está tratando de modelos e conceitos, e não da realidade em si mesma, com a consequência de quepropriedades atribuídas aos genes em diferentes conceitossão indiscriminadamente misturadas; (3) a promoção de ideias deterministas genéticas pelo modo como genes e seus papéisnos sistemas vivos são abordados nos livros, em virtude da mistura de propriedades mencionada acima; (4) uma ausência na maioria dos livros de uma discussão das consequências dos desafios ao conceito molecular clássico para nosso entendimento atual sobre genes, apesar desses desafios serem conhecidos há mais de três décadas e serem discutidos nos próprios livros; e (5) um silenciamento de visões
não deterministas sobre ospapéisdos genes nos sistemas biológicos.O modo como genes são abordadosnos livros analisados tem implicações relevantes para a formação dos estudantes, minandosua capacidade de se posicionar e atuar de maneira mais informada e crítica como cidadãosde sociedades cada vez mais marcadas pelo uso de tecnologias genéticas e de um discurso social sobre genes, ambos com um espectro de consequências éticas e políticas.
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Avaliação dos efeitos de cádmio na fisiologia e morfologia de Gracilaria domingensis (Gracilariales, Rhodophyta)Santos, Rodrigo Willamil dos 26 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T06:12:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1
290500.pdf: 429068 bytes, checksum: 36d4acf436348b27d4986c17e3725bff (MD5) / Gracilaria domingensis (Kützing) Sonder ex (Dickie) é distribuída por todo o litoral brasileiro e possui o potencial econômico para extração de polissacarídeos de parede celular sulfatados como o ágar. Considerando que existe um aumento gradativo das ações industriais que promovem a poluição de águas costeiras por metais pesados, dentre este o cádmio, verificou-se que este metal causa danos em macroalgas marinhas como decréscimo na fotossíntese e na taxa de crescimento. O presente trabalho teve como objetivo avaliar, através de bioensaio, as alterações morfológicas, ultraestruturais e fisiológicas em G. domingensis em diferentes concentrações de cádmio. As amostras foram cultivadas com irradiância fotossinteticamente ativa (PAR) ao dia de 80 µmol fótons /m- 2. A temperatura de 24 º C (±2 °C) e o fotoperíodo de 12 h, com aeração contínua, em água do mar com meio von Stosch, 4 mL por litro e salinidade de 34 ups. Foi utilizado cloreto de cádmio nas concentrações de 100 M, 200 M e 300 M, durante 16 dias. As amostras foram processadas para microscopia de luz, microscopia eletrônica de transmissão e varredura. A avaliação fisiológica foi feita através da taxa de crescimento, eficiência fotossintética e quantificação dos pigmentos. Nos tratamentos com cádmio houve decréscimo na taxa de crescimento. Observou-se despigmentação gradativa das amostras conforme aumento de concentração de cádmio, este resultado está correlacionado com a diminuição da concentração de pigmentos fotossintetizantes (FE, FC, AFC e Cl a) e decréscimo na taxa de transferência de elétrons. As células corticais foram alteradas morfologicamente quando expostas ao cádmio, onde observou-se redução de tamanho das células, aumento na espessura da parede concomitante ao aumento de carboidratos ácidos. O número de grãos de amido das florídeas, nas células corticais e subcorticais, também aumentaram nas amostras tratadas com cádmio quando comparadas ao controle. As proteínas totais, nas amostras tratadas com cádmio, nos testes histoquímicos, reagiram de forma mais intensa. O cádmio foi localizado nas células corticais e subcorticais especificamente nas paredes celulares, nos amidos e no citoplasma. A parede celular, especialmente das células corticais das amostras tratadas com cádmio, apresentou alterações na ultraestrutura com aumento da espessura e presença de granulações elétron-densas. Granulações elétron-densas também foram observadas nos vacúolos destas células. A alteração ultraestrutural mais marcante foi observada nos cloroplastos das células corticais e subcorticais, com desorganização dos tilacóides juntamente com o aumento no número de plastoglóbulos. Além disso, houve formação de corpos membranosos e inúmeras vesículas no citoplasma. Os experimentos apresentados neste trabalho forneceram subsídios para concluir que a presença de cádmio no meio ambiente irá alterar de forma significativa os produtores primários, base da cadeia alimentar, onde estão inseridas as macroalgas.
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Expressão de genes imunológicos associados à defesa antifúngica em Litopenaeus vannamei infectados experimentalmente com Fusarium solaniGonçalves, Priscila January 2011 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento / Made available in DSpace on 2012-10-26T07:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1
299994.pdf: 1365385 bytes, checksum: 40a721590b9fe56096cc9269e3ae2ed5 (MD5) / A modulação da expressão gênica de proteínas envolvidas nas respostas antifúngicas em camarões Litopenaeus vannamei e Farfantepenaeus paulensis foi avaliada após infecção experimental com esporos de Fusarium solani. Camarões F. paulensis foram desafiados com uma dose não-letal de esporos (6 x 106 esporos/ml) e a expressão da proteína de reconhecimento de fungos, ?GBP, não foi alterada em resposta a essa infecção branda. Já camarões L. vannamei desafiados com dose letal de esporos (108 esporos/ml) de F. solani apresentaram uma queda significativa na expressão da ?GBP, da pró-fenoloxidase (proPO), dos subgrupos 2, 3 e 4 da peneidina (PEN 2, PEN 3, PEN 4) e da stylicina, indicando o envolvimento do fungo na depleção do nível de transcritos dessas moléculas de defesa. Uma superexpressão gênica da proteína que reconhece LPS e ?-1,3-glicanas (LGBP) e do fator antilipopolissacarídeo (ALF) foi também encontrada nesses animais, sugerindo o envolvimento destas proteínas na fase aguda da infecção por F. solani. Paralelamente, camarões L. vannamei injetados com dsRNA específico para a LGBP apresentaram silenciamento de 18% a 95% em 2 e 3 dias, respectivamente, após a injeção de duas doses sequenciais de dsRNA. Esses resultados, no entanto, não foram reproduzidos em animais provenientes de uma fazenda de cultivo, sugerindo que exista uma resposta diferenciada associada à ativação prévia do sistema imunológico de acordo com as condições ambientais. Os resultados deste estudo apontam para um potencial envolvimento das moléculas imunoefetoras proPO, PEN 2, PEN 3, PEN 4, ALF e stylicina na defesa antifúngica de camarões L. vannamei, e representam uma contribuição pioneira para um maior conhecimento das respostas moleculares desencadeadas por camarões frente a uma infecção por F. solani, um reconhecido patógeno oportunista dos peneídeos.
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Associação de polimorfismos em genes envolvidos na regulação da atividade das células NK (Natural Killer) no desenvolvimento do câncer de mamaBack, Lia Kubelka de Carlos January 2014 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-11-10T03:02:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1
336034.pdf: 4097689 bytes, checksum: 4ba26833f45ba72a3130a8a4f6bb7fcd (MD5)
Previous issue date: 2014 / Introdução: O câncer de mama possui etiologia variada, sendo influenciada tanto por fatores genéticos quanto por fatores ambientais. Dentro do contexto genético, o papel de genes que codificam moléculas do sistema imunológico tem sido alvo de interesse pela importância que esse sistema possui para o desenvolvimento do processo tumoral. A Interleucina-18 é uma importante citocina pró-inflamatória e que possui indicações como possível alvo-terapêutico. Possui polimorfismos de um único nucleotídeo localizados na região promotora do gene e que possuem atividade funcional. As células Natural Killer (NK) fazem parte da resposta imune inata, sendo a primeira linha de defesa do organismo contra vírus, bactérias e tumores. Estas células induzem a morte da célula-alvo quando não há o reconhecimento das moléculas de antígenos leucocitários humanos (HLA) de classe I, através de seus receptores, chamados Killer cell Immunoglobulin-like. Receptor (KIR) ou os receptores NKG2D. Vários estudos demonstram o envolvimento dos genes que codificam receptores de células NK na patogênese do câncer. Objetivo: Avaliação do papel de polimorfismos em genes envolvidos na regulação da atividade das células NK e o desenvolvimento do câncer de mama em pacientes do Estado de Santa Catarina. Resultados: A presença dos genótipos variantes dos polimorfismos IL18 -607 (C/A) [rs1946518] e IL18 -137 (G/C) [rs187238] no presente estudo apresentou um risco significativo para o desenvolvimento do câncer de mama, sendo que o modelo de herança mais significativo foi o codominante para o IL18 -607 (C/A) [rs1946518] (CC vs AA, P = 0,004, OR = 2,782 95%CI [1,385-5,589]). E o recessivo para IL18 -137 (G/C) [rs187238]. Em relação à análise do polimorfismo do gene NKG2D [rs2255336], não foi encontrada uma diferença significativa na presença do alelo variante entre pacientes e indivíduos do grupo controle. Para os genes KIR foi encontrado um aumento de risco de 5,50 (P = 0,046; [1,02-33,36]) para o desenvolvimento da doença na presença do gene KIR2DL3 e de 5,62 (P ? 0,0001; [2,81- 11,33]) na presença do gene KIR2DL2. A presença desses dois genes em conjunto apresentou um risco de 6,86 (P ?0001; [2,83-13,18]). A presença do gene KIR2DL5 mostrou-se como um fator de proteção em relação ao desenvolvimento do câncer de mama (P = 0,001; [0,06-0,53]). Conclusão: Estes resultados indicam um potencial papel dos polimorfismos dos genes envolvidos na regulação da atividade das células NK na patogênese do câncer de mama, indicando que esses genes do sistema imunológico são possíveis marcadores preditivos de risco para câncer de mama na população estudada.<br> / Abstract : Introduction: Breast cancer has varied etiology, being influenced by both genetic factors and by environmental factors. Within the context of the genetic etiology, the genes that encode immune system molecules have been the target of interest because of the importance of this system in the development of tumor process. Interleukin-18 is an important pro-inflammatory cytokine and has possible indication as a therapeutic target. IL18 gene has some single nucleotide polymorphisms located in the promoter region of the gene that have functional activity on gene transcription. Natural Killer (NK) cells are part of the innate immune response, the first line of defense against viruses, bacteria and tumors. These cells induces death of the target cell when there is no recognition molecules in human leukocyte antigens (HLA) class I, through their receptors, called Killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR) or NKG2D receptors. Several studies have shown the involvement of the genes encoding receptors of NK cells in the pathogenesis of cancer. Objective: Evaluation of the role of polymorphisms in genes involved in regulating the activity of NK cells and the development of breast cancer patients in the State of Santa Catarina. Results: The presence of genotype variants of IL18 polymorphisms -607 (C / A) [rs1946518] and IL18 -137 (G / C) [rs187238] in the present study showed a significant contribution to the development of breast cancer risk, and the most significant was the codominant inheritance model for the IL18 -607 (C / A) [rs1946518] (CC vs. AA, P = 0.004, OR = 2.782, 95% CI [1.385 to 5.589]). And the recessive model was for IL18 -137 (G / C) [rs187238]. Regarding the analysis of the NKG2D polymorphism (rs2255336) gene, a significant difference was not found in the presence of the variant allele between patients and control subjects. For KIRs genes we detected an increased risk of 5.50 (P = 0.046, 95% CI [1.02 to 33.36]) for the development of the disease in the presence of KIR2DL3 gene and 5.62 (P ? 0.0001; 95% CI [2.81-11.33]) for the presence of KIR2DL2 gene. The presence of both genes together increase the risk about 6.86 (P ?0001; 95% CI [2,83-13,18]). The presence of the KIR2DL5 gene introduced a protective factor in the development of breast cancer (P = 0.001, 95% CI [0.06 to 0.53]). Conclusion: These results indicate a potential role of polymorphisms in genes involved in regulating the activity of NK cells in the pathogenesis of breast cancer, indicating that these genes of the immune system, IL18, KIR2DL2 and KIR2DL3 are possible predictive risk markers for breast cancer in this population.
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Ultraestrutura, bioquímica e fingerprint metabólico de Ulva lactuca Linnaeus (Chlorophyta) após exposição aguda ao diesel e à gasolinaPilatti, Fernanda Kokowicz January 2016 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-04-18T04:12:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016 / Os combustíveis fósseis são responsáveis por uma fração considerável da poluição que atinge os ecossistemas marinhos, sendo a gasolina e o óleo diesel são os mais consumidos no mundo. As macroalgas possuem grande importância ecológica em muitos ecossistemas marinhos, porém poucas pesquisas têm sido realizadas objetivando elucidar os efeitos de hidrocarbonetos derivados do petróleo sobre estes organismos, em comparação ao número de publicações que utilizam microalgas, invertebrados e vertebrados como objeto de estudo. Ulva lactuca (Chlorophyta) foi escolhida como modelo biológico neste estudo por ser uma espécie cosmopolita, conhecida por sua tolerância a ambientes impactados por efluentes domésticos e industriais e capacidade de bioacumular metais pesados. Os efeitos do óleo diesel e da gasolina, em combinações de concentrações (0,001%, 0,01%, 0,1%, 1,0%) e tempo de exposição (30 min, 1 h, 12 h, 24 h), foram investigados sobre a ultraestrutura, bioquímica e metabolômica de U. lactuca. A microscopia eletrônica de varredura (MEV) revelou que 1 h de exposição ao óleo diesel e à gasolina já é suficiente para provocar alterações drásticas na mucilagem dos talos, um efeito que se mantém após 12 h e 24 h de exposição. Com a análise citoquímica com Azul Brilhante de Coomassie (CBB) observou-se que a exposição à gasolina provoca desorganização e aglutinação da porção proteica citoplasmática, possivelmente atingindo sistemas enzimáticos das membranas das organelas, um efeito menos intenso nos talos expostos ao diesel. Flutuações nos conteúdos de clorofilas a e b e no perfil de carotenoides foram detectadas em talos expostos ao óleo diesel, embora tais diferenças não foram relacionadas à concentração do combustível ou ao tempo de exposição. A exposição ao diesel também causou redução no conteúdo de polifenóis em relação ao grupo controle e aumento dos conteúdos de açúcares solúveis e de amido, principalmente após 12 h. Talos expostos à gasolina também apresentaram alterações nos conteúdos de clorofilas a e b. Constatou-se que a redução dos teores de carotenóides e de polifenóis, e o aumento dos conteúdos de açúcares solúveis e de amido é função direta em relação ao tempo de exposição a este combustível. O conjunto de resultados obtidos por MEV, citoquímica e bioquímica indica que a exposição aguda de U. lactuca à gasolina causa danos mais intensos à estrutura celular do que a exposição ao diesel, possivelmente devido à alta permeabilidade dos hidrocarbonetos aromáticos e do etanol presentes na gasolina brasileira. Adicionalmente, verificou-se que os pigmentos fotossintetizantes e suas rotas biossintéticas são menos suscetíveis às agressões dos combustíveis. O aumento dos teores de açúcares solúveis e de amido nos talos expostos aos xenobióticos sugere que os hidrocarbonetos podem ser metabolizados via Ciclo do Ácido Cítrico, conferindo a esta espécie um papel importante desta espécie na biorremediação dos ecossistemas. Ademais, especula-se que os conteúdos de polifenóis, açúcares solúveis, amido, associados à citoquímica com CBB, podem ser usados em conjunto como biomarcadores para poluição por óleo diesel e gasolina em U. lactuca. O estudo do metaboloma via espectroscopia vibracional de infravermelho (FTIR) e análise multivariada de dados (HCA, PCA, k-means) permitiu discriminar a maioria das amostras segundo o xenobiótico de interesse. Quando os grupos expostos ao diesel e à gasolina foram analisados separadamente, a análise do intervalo espectral de absorbância das proteínas permitiu o melhor agrupamento das amostras. Os talos expostos ao óleo diesel foram melhor agrupados de acordo com a concentração deste xenobiótico, enquanto aqueles expostos à gasolina foram melhor discriminados de acordo com o tempo de exposição ao combustível. A abordagem analítica ao estudo do metaboloma de U. lactuca mostrou-se eficiente para discriminar alterações bioquímicas consoante à exposição aguda aos xenobióticos. Por se tratar de uma metodologia simples, rápida, sensível e barata possui potencial para desenvolvimento de protocolo de rotina a estudos de biomonitoramento.<br> / Abstract : Fossil fuels, such as gasoline and diesel oil account for substantial share of pollution that affects marine ecosystems. Seaweeds have important ecological roles in many ecosystems, but a few researches have been carried out aiming at to unravel the effects of oil derivatives on these organisms, comparatively to the observed for microalgae, invertebrates, and vertebrates. Ulva lactuca (Chlorophyta) was chosen as a biological model for this study due to its cosmopolitan habits, ability to bioaccumulate heavy metals, and tolerance to polluted environments by domestic and industrial effluents. In the present study the effects of diesel oil and gasoline, in combinations of concentrations (0,001%, 0,01%, 0,1%, and 1,0%) and times of exposure (30 min, 1 h, 12 h, and 24 h) were investigated on U. lactuca's ultrastructure, biochemistry, and metabolomics. Scanning electron microscopy (SEM) images, just after 1 h of exposure to diesel oil or to gasoline revealed drastic alterations in thalli mucilage that persist after 12 h and 24 h of exposure. Coomassie Brilliant Blue (CBB) cytochemistry analysis indicated that exposure to gasoline led to disorganization and agglutination of the cytoplasm protein fraction, possibly affecting enzymes bound to organelles' membranes. This effect was lesser intense in thalli exposed to diesel oil, which exhibited little alterations in cytoplasm. Diesel oil-exposed thalli exhibited changes in chlorophyll a and b contents and in carotenoid profile not related to diesel oil concentrations or exposure times. Diesel oil also decreased the polyphenol content and increased the soluble sugars and starch amounts, specially after 12 h exposure, followed by a decrease in these metabolites after 24 h exposure. Chlorophyll a and b contents also were altered in a way not related to concentrations or times of exposure in gasoline-treated thalli. A decrease in the carotenoid and polyphenol amounts and an increase in soluble sugars and starch contents positively correlated to time of exposure were detected in gasoline-treated groups. SEM, cytochemical, and biochemical analyzes revealed higher toxicity to U. lactuca of gasoline than diesel oil, possibly due to the high permeability of mono-aromatic hydrocarbons and ethanol from the Brazilian gasoline blend. Importantly, results also showed that photosynthetic pigments and their biosynthetic pathways resist in a certain extension to injuries caused by gasoline and diesel oil. Besides, the augmented amounts of soluble sugars and starch suggest that hydrocarbons may have been metabolized and incorporated into U. lactuca's energetic pathways, e.g. citric acid cycle. These results indicate that U. lactuca plays an important role on bioremediation of natural habitats. From these results, we suggest that polyphenols, soluble sugars, and starch contents, along with CBB cytochemistry could be used as biomarkers of diesel oil and gasoline pollution in U. lactuca. FTIR-based metabolomics studies followed by multivariate statistical analysis (HCA, PCA, k-means) efficiently discriminated most of the the exposed groups according to the xenobiotic. When diesel oil- and gasoline-exposed groups were analyzed separately, the most accurate clusters were obtained using the spectral window corresponding to the proteins absorbances. Diesel oil-exposed thalli were better clustered according to the concentration of xenobiotic, whereas gasoline-exposed thalli were better grouped according to the time of exposure to this fuel. Since the analytical approach to metabolomics showed to be simple, fast, cheap, and sensible, it is thought to have potential for further development of protocols of routine analysis in biomonitoring studies.
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Elaboração de um painel de marcadores de ancestralidade para estudos caso-controle e organização das informações em banco de dados localDebortoli, Guilherme January 2013 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:32:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2013 / A população brasileira é produto da miscigenação entre trêsprincipais grupos étnicos: Ameríndios (que já habitavam estas terras àépoca do descobrimento), Europeus (principalmente portugueses) eAfricanos (trazidos de forma forçada como mão de obra escrava).Estimar as diferentes proporções de ancestralidade em populaçõesmiscigenadas é de extrema importância para estudos genéticos quebuscam encontrar alelos de sucetibilidade a doenças, uma vez que a nãocorreção da estratificação populacional pode ocasionar desvios levandoa associações espúrias. Para o controle da estratificação populacional, autilização de marcadores informativos de ancestralidade tem sidoamplamente utilizada por apresentar um alto diferencial de frequênciaentre populações de regiões geograficamente distintas. O objetivo desteestudo foi genotipar quatro marcadores informativos de ancestralidadeadequados para amostras da população brasileira visando estender estaabordagem para entender a estruturação populacional em estudos decaso-controle, utilizando como modelo a doença psoríase. Adicional aoprincipal objetivo, um banco de dados biológico (BDB) foi diagramadoe implementado, para auxiliar na organização e armazenamento deinformações a respeito das amostras aqui utilizadas. As frequências dosquatro marcadores (AT3, Sb19.3, APO e PV92) foram estimadas emamostras de pacientes (PSR) diagnosticados com psoríase (n=100) econtroles saudáveis (PSC) sem histórico de doença (n=100, PSC)coletadas na cidade de Florianópolis - SC. Os perfis genéticos foramobtidos através de PCR convencional e eletroforese em gel de agarose.As análises estatísticas empregaram programas tais como GENEPOP,GDA e ADMIX 3. O BDB proposto foi desenvolvido e estruturado emsistema de gestão de bases de dados relacionais MySQL, e a interfacegráfica foi desenvolvida em linguagem PHP e HTML. Por meio deanálises moleculares e estatísticas, os resultados obtidos evidenciaramque os dois grupos de indivíduos aqui estudados (PSR e PSC)apresentaram semelhanças quanto a sua ancestralidade genética, nãosendo observado grandes diferenças populacionais. As estimativas demistura revelaram que as duas populações analisadas são tri-híbridas,com alta preponderância do componente europeu, seguido de africano eameríndio respectivamente. Apesar dos poucos marcadores utilizadosfoi possível discriminar a contribuição genética dos grupos ancestraisindicando que mesmo um número reduzido de marcadores pode sersuficiente, desde que apropriadamente selecionados, para responder umapergunta específica. O BDB construído e diagramado neste trabalhorecebeu o nome de LAPOGEdb (LAPOGE Database -www.lapoge.sites.ufsc) e, mostrou-se uma ferramenta eficaz para oarmazenamento estruturado de informações que variam entre dadosepidemiológicos e genéticos referentes a amostras utilizadas ao longo de19 anos de funcionamento do Laboratório de Polimorfismos Genéticosda Universidade Federal de Santa Catarina (LAPOGE-UFSC). <br> / Abstract : The Brazilian population is the product of interbreeding betweenthe three main ethnic groups: Amerindians (who inhabited these landsduring the discovery), Europeans (mainly Portuguese) and Africans(brought forcefully as slave labor). Estimating the different proportionsof ancestry in admixed populations is of utmost importance for geneticstudies that seek to find disease susceptibility alleles, since no correctionof population stratification, can cause deviations leading to spuriousassociations. To control the population stratification, the use of ancestryinformative markers have been widely used for its feature of presentinga high frequency differential between geographically distinctpopulations. The aim of this study was to genotype four ancestryinformative markers suitable for samples of the brazilian population inorder to extend this approach to understand the population structure incase-control studies, using as a model the psoriasis disease. Additionalto the main objective, a biological database (BD) was diagrammed andimplemented through programming languages, to assist in organizingand storing information about the samples used here. The frequencies ofthe four markers (AT3, Sb19.3, APO and PV92) were estimated insamples of patients (PSR) diagnosed with psoriasis (n = 100) andhealthy controls (PSC) with no history of disease (n = 100, PSC)collected in the city of Florianópolis - SC. The genetic profiles wereobtained by standard PCR and visualization with agarose gel andelectrophoresis. The statistical analysis employed programs such asGENEPOP, GDA and ADMIX 3. The proposed BD was developed andstructured in MySQL relational database management system, while thegeneral user interface (GUI) was developed in PHP and HTML. Theresults obtained from the molecular analysis and statistics, showed thatthe two groups studied here (PSR and PSC) had some similarities intheir genetic ancestry, not observing large population differences.Estimates of mixture revealed that the two populations are tri-hybrid,with high preponderance of European component, followed by Africanand Amerindian respectively. Despite the few markers used it was ableto discriminate the genetic contribution of ancestral groups indicating,that even a small number of markers may be sufficient, whenappropriately selected, to answer a specific question. The BD builtedanddiagrammed in this work was named LAPOGEdb (LAPOGE Database -www.lapoge.sites.ufsc) and proved to be an effective tool for storingstructured information, ranging from genetic and epidemiological data,related to the samples used throughout 19 years of operation of theLaboratory of Genetic Polymorphisms of the Federal University ofSanta Catarina (UFSC-LAPOGE).
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Morfologia e regimes de crescimento das linhagens celulares derivadas de melanoma murino B16F10, primário e metastático, em camundongos BALB/c / Morphology and regimes growth of cell lines derivative from murine melanoma B16F10, primary and metastatic, in BALB/c miceMendes, Rosemairy Luciene 04 August 2011 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-12-16T15:00:21Z
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Previous issue date: 2011-08-04 / Embora não esteja entre as neoplasias mais prevalentes é responsável pela quarta causa de morte entre os pacientes com câncer. A compreensão dos mecanismos envolvidos na gênese e progressão do melanoma é crucial para o seu tratamento. Modelos experimentais que representem as fases da progressão do melanoma ainda são raros, mas a cultura de células é uma ferramenta importante para tais investigações. Os objetivos deste trabalho foram: estabelecer um modelo de estudo do melanoma murino B16F10 por meio do estabelecimento de sublinhagens celulares que correspondem ao tumor primário e às metástases, após passagem dessas células in vivo em camundongos BALB/c; caracterizar morfologicamente por meio de microscopia óptica e eletrônica de transmissão (MET) e varredura (MEV) a linhagem B16F10 e as sublinhagens derivadas; e investigar as leis de escala que regem o crescimento das linhagens de células de melanoma. Nesse contexto, células de melanoma B16F10 foram injetadas subcutaneamente (sc.) em camundongo BALB/c e a linhagem derivada dos tumores primários foi denominada de B16F10B. A linhagem B16F10 e a sublinhagem B16F10B foram inoculadas endovenosamente (ev.) em camundongos BALB/c e as sublinhagens obtidas das metástases foram denominadas B16F10M e B16F10BM, respectivamente. A linhagem B16F10 e as sublinhagens B16F10B, -BM e -M foram analisadas em MO, MET e MEV, revelando uma grande heterogeneidade na morfologia dessas células e nos agregados por elas formados. As células B16F10 e B16F10B também revelaram à MET presença de partículas virais. Para a caracterização das leis de escala que regem os regimes de crescimento das células B16F10, -B, -BM e -M, as linhagens celulares foram cultivadas sobre lamínulas de vidro em placas de 24 poços e retiradas em intervalos de 24 horas, durante 7 dias. O número de células por agregado e o número total de agregados foram usados para determinar a função de distribuição de tamanho de agregados que sugerem uma transição nas funções de distribuição de um decaimento exponencial para um que segue lei de potência para as células B16F10B. As demais linhagens analisadas sempre exibiram um comportamento de lei de potência. A distribuição em leis de potência indica a ausência de um tamanho característico para os tamanhos dos agregados, podendo refletir na falta de mecanismos de controle da replicação celular aliada à estabilidade dos agregados. A transição no regime de crescimento exibido pelas células B16F10B sugere que o crescimento celular contínuo na cultura pode exercer forças seletivas que destroem os mecanismos de regulação, tais como a dependência de ancoragem e o crescimento de densidade-dependente. A caracterização morfológica, bem como do regime de crescimento das sublinhagens derivadas das células B16F10 mostrou que há diferenças e similaridades entre as mesmas, porém, para uma melhor caracterização dessas células, outras análises devem ser realizadas, tais como: resistência a drogas, integridade genômica e padrão de expressão de moléculas de adesão. / Melanoma is a malignant neoplasm derived from melanocytes, specialized pigmented cells that are found predominantly in the skin. Although it does not figure among the most prevalent cancer types, melanoma is responsible for the fourth leading cause of cancer patients death. Understanding of the mechanisms involved in the genesis and progression of melanoma is crucial for the cancer treatment. Experimental models that representing phases of melanoma progression are still rare, but the cell culture is an important tool for such investigations. The aims of the work were to determine a study model of murine melanoma B16F10 by the establishment of cell sublineages corresponding to the primary tumor and to the metastases, after passage of these cells in BALB/c mice; to characterize morphologically by optical microscopy (OM) and transmission electron (TEM) and scanning electron (SEM) the B16F10 lineage and sublineages derived from B16F10; to investigate the scaling laws that rule the growth of melanoma cell lines. In this context, B16F10 melanoma cells were injected subcutaneously (sc) in BALB/c mice and the subline derived from subcutaneous tumors was named B16F10B. The B16F10 lineage and the B16F10B sublineage were inoculated intravenous (iv) in BALB/c mice, and the sublineages of metastases obtained were named B16F10M and B16F10BM, respectively. The B16F10B lineage and the B16F10, -BM and -M sublineages were analyzed by OM, TEM and SEM, what revealed an extent heterogeneity in the morphology of these cells and clusters formed by them. B16F10 and B16F10B cells also disclosed to MET viral particles presence. To characterize the scaling laws that rule the growth regimes of the B16F10, -B, -BM and -M cells, the cells lineages were cultured on glass coverslips in 24-well plates and removed at intervals of 24 hours for 7 days. The number of cells per cluster and the total number of clusters were used to determine the cluster size functions. The results suggest distribution functions with a transition to an exponential decay that follows a power law for B16F10B cells. The other lineages analyzed always exhibits a power law behavior. The power law distribution indicates the absence of a characteristic size for the clusters sizes which, from the biological point of view, might reflect the lack of control mechanisms of cell replication allied to the stability of clusters. The transition in the growth regime exhibited by B16F10B cells suggests that the continued cell growth in culture may exert selective forces which destroy regulation mechanisms such as cell anchorage dependence and density-dependent growth.
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Fatores de risco para lesões cervicais e câncer cervical em mulheres com diagnóstico citológico de células escamosas atípicas, Maputo-Moçambique, 2013-2015 / Risk factors for cervical lesions and cervical cancer in women with cytologic diagnosis of atypical squamous cell, Maputo-Mozambique, 2013-2015Sitoe, Filomena Boaventura 31 July 2017 (has links)
SITOE, F. B. Fatores de risco para lesões cervicais e câncer cervical em mulheres com diagnóstico citológico de células escamosas atípicas, Maputo-Moçambique, 2013-2015. 2017. 90 f. Dissertação (Mestrado em Saúde Pública) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Saúde Pública (msp@ufc.br) on 2017-08-22T20:14:37Z
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Previous issue date: 2017-07-31 / Introduction: The diagnosis and screening of cervical lesions are of paramount importance. The standard screening method for cervical cancer and its precursor lesions is cytological examination using the Papanicolaou method. Objectives: To estimate the prevalence of low and high grade cervical lesions and cervical cancer in women with cytologic diagnosis of atypical squamous cells, to verify the influence of the etiological agents of diseases with the presence of cervical lesions and cervical cancer. Method: a cross-sectional study with a quantitative approach, retrospective data collection performed at the Department of Gynecology and Obstetrics, and at the Pathology Department of the Central Hospital of Maputo, Mozambique. We studied 358 medical records from January 2013 to December 2015 of women with atypical cytologic squamous cell diagnosis. The variables p <0.05 were considered statistically significant, and the frequency of diagnoses with their respective confidence intervals (95% CI) was calculated. The presence of the lesions and the degree of association between the dependent and independent variables were verified through the Pearson correlation coefficient and prevalence ratio (PR). Results: mean age was 38.1 years, median 36.6 and standard deviation 12.3. Age ranged from 17 to 71 years. The prevalence of cervical lesions was 153 cases (63%), 50 (32.7%) for <NIC2 + and 103 (67.3%) for CIN 2+. The risk factors associated with cervical lesions and cervical cancer were: age (40-49) (P = 0.001), profession (domestic) (P = 0.016), parity (+5) (P = 0.001), menopause = 0.001), HPV (P = 0.001) and Tricomonas vaginalis (P=0,001). Conclusion: The prevalence of high-grade cervical lesions in women with atypical squamous cell cytologic diagnosis was high. The risk factors associated with the most severe cervical lesions in patients with atypical squamous cell cytology were: parity age, occupation, menopause. The etiological agents of diseases that influenced the development of cervical lesions and cervical cancer were HPV and Tricomonas vaginalis. / Introdução: O diagnóstico e o rastreamento das lesões cervicais são de suma importância. O método padrão de rastreamento do câncer do colo do útero e de suas lesões precursoras é o exame citológico pelo método de Papanicolaou. Objetivos: Estimar a prevalência das lesões cervicais de baixo e alto grau e câncer cervical em mulheres com diagnóstico citológico de células escamosas atípicas, verificar a influência dos agentes etiológicos de doenças com a presença das lesões cervicais e câncer cervical. Método: estudo transversal com abordagem quantitativa, coleta de dados retrospectiva, realizado no Departamento de ginecologia e obstetrícia, e no serviço de anatomia patológica do Hospital Central de Maputo, em Moçambique. Foram estudados 358 prontuários de janeiro de 2013 a dezembro de 2015 de mulheres com diagnóstico citológico de células escamosas atípicas. Considerou-se como estatisticamente significante as variáveis p<0,05, calculou se a frequência de diagnósticos com seus respectivos intervalos de confiança (IC95%). A presença das lesões e o grau de associação entre as variáveis dependentes e independentes foi verificada através do cálculo do coeficiente de correlação de Pearson e razão de prevalência (RP). Resultados: a média da idade foi de 38,1 anos, mediana 36,6 e o desvio padrão de 12,3. A idade variou entre 17 a 71 anos. A prevalência das lesões cervicais foi de 153 casos (63%), sendo lesão de baixo grau (NIC I) 50 (32,7%) e lesão de alto grau /carcinoma invasor (NIC 2+) 103 (67,3%). Os fatores de risco associados às lesões cervicais e câncer cervical foram: idade (40-49) (P=0,001), profissão (doméstica) (P=0,016), Paridade (+de 5) (P=0,001), menopausa (P=0,001), HPV (P=0,001), e Tricomonas vaginalis (P=0,001). Conclusão: A prevalência das lesões cervicais de alto grau em mulheres com diagnóstico citológico de células escamosas atípicas foi alta. Os fatores de risco associados às lesões cervicais mais severas em pacientes com citologia de células escamosas atípicas foram: idade paridade, profissão, menopausa. Os agentes etiológicos de doenças que influenciaram no desenvolvimento das lesões cervicais e câncer cervical foram o HPV e Tricomonas vaginalis.
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Avaliação da citologia de canal anal em comparação com anuscopia magnificada com ou sem biópsia na detecção de neoplasias intra-epiteliais anaisLatorre, Guísella de January 2012 (has links)
Resumo não disponível
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