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Caracterização das práticas de manejo e das populações de erva-mate (Ilex paraguariensis A. Sant. Hil) nativa em exploração no planalto norte catarinense

Mattos, Andréa Gabriela 25 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-25T21:59:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 289607.pdf: 1278724 bytes, checksum: cc13c9f716576b7f20e474d08c4da591 (MD5)
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Relação entre a presença de proteínas recombinantes de milho OGM e a frequência de fenótipos anormais nas variedades de milho nativo, na região Vales Centrais, Oaxaca, México

López, Flor Rivera 26 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Curso de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T00:26:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 294753.pdf: 2554120 bytes, checksum: c56d364da119486d65613d08b059b39d (MD5) / México é o centro de origem e diversidade do milho e, portanto, seu cultivo tem grande importância no país. Apresentando uma grande riqueza genética e representando o principal alimento e tem um valor cultural muito grande, o milho significa a "carne e o sangue" "o pai, a mãe e o filho". Por isto quando Quist e Chapela comprovaram em 2001, a introgressão de DNA transgênico em variedades nativas (sinônimo de crioulas), a reação da sociedade em geral foi de forte preocupação. Assim desenvolveram-se pesquisas com a finalidade de conhecer a extensão e a intensidade do fluxo e introgressão de transgenes em variedades nativas. Um destes estudos foi o estudo realizado por organizações sociais, agricultores e indígenas pertencentes à Rede em Defesa do milho. Membros da Rede identificaram no ano 2005, deformações nas plantas do milho nunca antes constatadas e suspeitaram que estas anormalidades fossem causadas pela presença de transgenes. Assim, neste contexto, o presente estudo buscou verificar a existência de uma relação entre a presença de transgenes e a aparição de novos fenótipos anormais em milho em cinco comunidades na região de Vales Centrais de Oaxaca. Foi amostrado tecido foliar de 500 plantas de milho nativo com fenótipos anormais e 500 com fenótipos normais. A análise de detecção de proteínas recombinantes foi feita por Kits comerciais ELISA e comparou-se a frequência da presença de proteínas recombinantes entre plantas de fenótipos distintos. Obteve-se presença de pelo menos um transgene em 17,9% das plantas amostradas, sendo a proteína Cry1Ab a de maior frequência entre as três proteínas testadas. Encontrou-se uma diferença estatisticamente significativa ao comparar-se a frequência de proteínas recombinantes em fenótipos anormais (117/500) com fenótipos normais (62/500). Ao testar os resultados de frequência de presença de proteínas recombinantes nos diferentes fenótipos, com o teste chi-quadrado e o teste de comparações emparelhadas encontrou-se uma diferença estatística significativa (P<0,001). Com base nos resultados obtidos com os testes de proteínas, discute-se a pertinência de utilizar critérios de determinação de resultados positivos à presença de proteínas recombinantes, que se ajustem às caracteristicas de variedades nativas. Sugere-se mais análises de modo a validar a relação entre a presença de transgenes e a maior proporção de fenótipos anormais. / Mexico is the center of origin and diversity of maize; its cultivation, therefore, has great importance in the country. Maize in Mexico presents a great genetic richness, is the main staple food and has a great cultural value. For Mexicans maize means their "flesh and blood" and it is considered as "father, mother and child". Therefore, when Chapela e Quist in 2001, showed the DNA introgression of transgenes in landraces, the reaction in all sectors of society was one of great concern. Thus, surveys were developed aiming to ascertain the extent and intensity of transgene flow and introgression in the landraces. Among these efforts is the study conducted by social organizations, farmers and indigenous people belonging to the Network in Defense of Maize. In 2005 members of this network identified abnormalities on maize plants that have never verified seen before. They suspected that these abnormalities could be caused by the presence of transgenes. Bearing this in mind, this study aims to verify the existence of a relationship between the presence of transgenes and the appearance of new abnormal phenotypes. For this purpose, a sample of 500 plants with abnormal phenotypes and 500 with normal phenotype was collected in five communities of the Central Valley region in Oaxaca. Detection of recombinant proteins was done by ELISA commercial kits and the frequency of presence of recombinant proteins between plants of both phenotypes was compared. The presence of at least one transgene in 17.9% of the 1000 sampled plant was observed and Protein Cry1Ab showed to be most frequent among the three tested proteins. When comparing the frequency of recombinant proteins in abnormal (117/500) and normal (62/500) phenotypes a statistically significant difference was found. The results of the recombinant proteins frequencies in different phenotypes, were then tested by chi-square test and pairwise comparisons, which showed statistical significance (P <0.001). In this study we discuss the relevance of using specific criteria for determining positive results to the presence of recombinant proteins, that fit the characteristics of native varieties. This study is the first systematic approach to uncovering a relationship between the presence of transgenes and phenotypic abnormalities in Mexican maize landraces. Further analysis to validate this relationship is suggested.
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Inovações em sistemas de micropropagação in vitro do abacaxizeiro (Ananas comosus var. comosus) e caracterização genética de variedades crioulas do estado de Santa Catarina

Scherer, Ramon Felipe 26 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T04:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 291237.pdf: 5528836 bytes, checksum: 89b2d27edaf5442e5fe4329b22f651f9 (MD5) / O abacaxizeiro (Ananas comosus var. comosus) é uma espécie domesticada no norte da América do Sul, a partir da espécie selvagem A. comosus var. ananassoides. No período anterior a conquista a espécie já estava dispersa por toda América Tropical e parte da Subtropical, configurando uma planta de grande importância social para os grupos humanos. Após o contato com os europeus o abacaxizeiro foi disperso pelo globo, e hoje se configura como uma das frutas tropicais de maior importância econômica mundial. O Brasil é um dos maiores produtores mundiais de abacaxi, tendo como principal consumidor o próprio mercado interno, mesmo apresentando um baixo consumo per capita da espécie. Isto configura um potencial de crescimento da exploração comercial da fruta, tanto no mercado interno como no externo. Em Santa Catarina a baixa produção de abacaxi, aliada ao consumo médio per capita da espécie maior que o nacional, tornam a revitalização do cultivo uma potencial oportunidade para a agricultura catarinense. Porém, para revitalizar o cultivo, os agricultores devem ter acesso a mudas de alto valor genético e isentas de pragas e doenças. A presente dissertação objetivou a caracterização genética de 29 genótipos presentes na coleção de germoplasma do CCA/UFSC, através de 7 marcadores microssatélites. Os acessos conservados na coleção são, em geral, genótipos locais do estado de Santa Catarina, configurando-se de grande importância genética regional. Nesta abordagem foi possível adaptar com sucesso um protocolo de extração de DNA genômico, extraído de partes de folhas basais de plantas adultas (aproximadamente 0,5g), obtendo-se em média 3750 ng de DNA genômico para cada acesso, concentrados em 75 µL de solução estoque. Porém, entre os lócus estudados o maior polimorfismo encontrado foi de 27,58%, o maior número de alelos foi 4, o máximo número efetivo de alelos foi de 1,597 e foi encontrado 3 alelos raros, sendo que dois deles em um mesmo lócus. Isto configura baixo poder de informação, impossibilitando a análise da distância genética e índices de variabilidade genética. A abordagem quanto a qualidade fitossanitária se deu por meio da elaboração de um protocolo de alta performance de micropropagação de abacaxizeiro baseado em culturas nodulares associadas a sistemas de imersão temporária. O protocolo foi dividido em indução e multiplicação de culturas nodulares, regeneração de microbrotos, crescimento à brotos e aclimatização. Os explantes utilizados foram bases foliares retiradas de brotos desenvolvidos in vitro. A melhor combinação de fitorreguladores para a indução de culturas nodulares foi 2 µM de ANA e 8 µM de 2-iP. Para a multiplicação de culturas nodulares a combinação que gerou os melhores resultados foi a de 2 µM de ANA e 2 µM de BAP em sistema de imersão temporária por meio de frascos duplos. Esta mesma combinação de fitorreguladores mostrou-se eficiente para a regeneração de microbrotos, porém, utilizando-se sistema de imersão temporária em frascos RITA®. Posteriormente, em sistema de imersão permanente, o crescimento de microbrotos foi mais adequado em meio de cultura contendo 10 µM de AG3. Brotos acima de 2 cm foram aclimatizados com sucesso em substrato composto por mistura (1:1) de casca de arroz carbonizada e Plantmax® HT, com uma porcentagem de sobrevivência superior a 92%.
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Avaliação de indutores de resistência para o controle da sarna da macieira (Venturia inaequalis Cke.) e da cercosporiose da beterraba (Cercospora beticola Sacc.)

Felipini, Ricardo Barbosa January 2011 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T04:46:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 295333.pdf: 1281017 bytes, checksum: 8fbda3179374b21d9efd3874cd50fcb0 (MD5) / As doenças foliares podem causar importantes danos às plantas cultivadas, como a cercosporiose da beterraba (Cercospora beticola Sacc.) e a sarna da macieira (Venturia inaequalis Cke.). Neste trabalho, diferentes elicitores de defesa em plantas foram testados para o controle dessas doenças, buscando-se identificar mecanismos de ação envolvidos. Para isso, foram conduzidos ensaios em casa de vegetação e in vitro. No patossistema macieira-sarna, foram avaliados fosfito de potássio, quitosana, suspensão bruta de fermento à base de Saccharomyces cerevisiae (SBSC), filtrado da suspensão autoclavada de fermento à base de Saccharomyces cerevisiae (FASC) e suspensão da fração polissacarídica do parênquima de reserva de folhas de babosa (FPPRB) pulverizados em plantas de macieira, cv. Gala aos 3 ou 7 dias antes da inoculação do patógeno (d.a.i.). Amostras de plantas tratadas com alguns desses produtos foram coletadas para a determinação das atividades enzimáticas de peroxidases e ß-1,3 glucanases, e dos teores de flavonóides e compostos fenólicos totais. Constatou-se que o fosfito de potássio (2 µL.mL-1) reduziu a severidade da sarna nas mudas de macieira, em média de 73%. Em relação aos parâmetros bioquímicos, a aplicação de fosfito 7 d.a.i. reduziu o teor de flavonóides nas folhas suscetíveis à sarna, no momento da inoculação, enquanto a quitosana reduziu esse teor nas folhas resistentes à doença. Em geral, folhas suscetíveis à sarna apresentaram maior teor de flavonóides do que as resistentes. O teor de compostos fenólicos totais não foi alterado pela aplicação de fosfito ou quitosana, e foi similar entre folhas suscetíveis e resistentes à doença. Quanto à atividade enzimática, não houve diferença entre as plantas que receberam os produtos, porém as folhas resistentes à sarna apresentaram maior atividade de peroxidases em dois experimentos distintos. Apesar de apenas o fosfito ter reduzido a severidade da doença, ambos fosfito e quitosana reduziram a germinação de esporos do fungo in vitro. No caso do patossistema beterraba-cercosporiose, quitosana e o indutor de resistência acibenzolar-S-metílico (ASM) foram testados preventivamente, em diferentes doses e intervalos de tempo entre tratamento e inoculação. Em alguns bioensaios foram coletadas amostras de folhas para quantificar a atividade de peroxidases e ß-1,3 glucanases e também o teor de flavonóides, compostos fenólicos totais e betalaínas totais. A severidade da doença foi avaliada nas três folhas mais velhas 20 dias após a inoculação com o auxílio do programa computacional Quant v.1.0.2.. Ainda, foram conduzidos testes em lâminas de microscopia escavadas para verificar a germinação de esporos de C. beticola na presença de diferentes doses dos produtos testados. Quitosana e ASM reduziram a severidade da cercosporiose em folhas de beterraba, proporcionando maior efeito quando pulverizados 3 d.a.i. (1 mg.mL-1) para quitosana, e 7 d.a.i (50 mg.L-1) para o ASM. O polissacarídeo afetou diretamente o patógeno, inibindo significativamente o crescimento micelial e a germinação de esporos. Plantas que receberam uma aplicação de quitosana apresentaram maior atividade de enzimas oxidativas 3 dias depois, imediatamente antes da inoculação do patógeno. Em plantas tratadas por duas vezes com o polissacarídeo, as atividades de peroxidases e ß-1,3 glucanases foram maiores em relação à testemunha, antes e depois da inoculação. Esses resultados indicam que o controle da cercosporiose exercido pela quitosana pode ter sido tanto por seu efeito direto sobre o patógeno, como pela ativação de proteínas-RP. O ASM, por sua vez, apresentou pequeno efeito antimicrobiano contra C. beticola, mas promoveu os maiores aumentos nas atividades de peroxidases e ß-1,3 glucanases, indicando-se que o seu efeito na redução da severidade da doença esteja relacionado principalmente à ativação de mecanismos de defesa. Desta forma, a aplicação preventiva de fosfito de potássio é uma opção para o controle da sarna da macieira, enquanto que quitosana e o ASM podem auxiliar no manejo da cercosporiose da beterraba. / The foliar diseases such as Cercospora leaf spot (Cercospora beticola Sacc.) in beets and apple scab (Venturia inaequalis Cke.) can cause significant damage to crops. In this work, potential elicitors of plant defenses were evaluated for the control of these diseases. For this, trials were conducted inside the greenhouse and in vitro conditions. In the apple-scab pathosystem, potassium phosphite, chitosan, the crude suspension of commercial Saccharomyces cerevisiae (SBSC), the filtrate of S. cerevisiae obtained from autoclaved commercial yeast (FASC) and the suspension of polysaccharide from Aloe leaves (FPPRB) were sprayed on apple plants, cv. Gala, at 3 or 7 days before pathogen inoculation. Leaf samples from plants treated with some of these products were collected to determine the enzymatic activity of peroxidase and â-1,3 glucanases, and levels of phenolic compounds and flavonoids. Potassium phosphite (2 ìL.mL-1) reduced the severity of apple scab on seedlings, by around 73%. Regarding biochemical parameters, the application of phosphite 7 d.a.i. reduced the content of flavonoids in the scab suscetible leaves, at the time of inoculation, while the polysaccharide chitosan reduced the flavonoid content in the resistant leaves. Overall, scab suscetible leaves had higher content of flavonoids than resistant leaves. The content of phenolic compounds was not altered by application of phosphite or chitosan, and it was similar between suscetible and resistant leaves. There was not difference in the enzymatic activities among plants that received the different products, but the scab resistant leaves had higher peroxidase activity in two distinct experiments. Only the phosphite reduced the severity of the disease, but both phosphite and chitosan reduced the germination of V. inaequalis spores. In the case of Cercospora leaf spot, chitosan and the plant activator acibenzolar-S-methyl (ASM) were evaluated preventively at different doses and intervals between treatment and inoculation. In some bioassays leaf samples were collected to quantify the peroxidase and â-1,3 glucanase activities as well to determine the flavonoid, phenolic compound and betalain contents. Disease severity was assessed in the three oldest leaves 20 days after inoculation with the aid of software Quant v.1.0.2.. In addition, tests were conducted in glass slides to check the spore germination of C. beticola in the presence of different doses of the products. The polysaccharide chitosan and plant activator ASM reduced the severity of Cercospora leaf spot, and the effect was better when chitosan was sprayed 3 d.a.i. (1 mg.mL-1), or when ASM was sprayed 7 d.a.i. (50 mg.L-1). The polysaccharide affected the pathogen directly, both on the mycelial growth and spore germination. Plants that received an application of chitosan had higher oxidative enzyme activity 3 days later, just before the inoculation. In plants treated with chitosan twice, the peroxidase and â-1,3 glucanase activities were higher compared to the control, before and after the inoculation. These results indicate that the control of Cercospora leaf spot by chitosan has occurred by antibiosis and by the activation of PR-proteins. In turn, ASM had a little effect against C. beticola, but it promoted the highest levels in peroxidase and â-1,3 glucanase activities, indicating that its effect in reducing the severity of the disease is mainly related to the activation of defense mechanisms. Thus, the preventive application of potassium phosphite is an option for control of apple scab, while chitosan and ASM can help in the management of Cercospora leaf spot.
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Desenvolvimento de um mapa genético de ligação de macieira saturado para a região com resistência à mancha foliar de Glomerella (Coletotrichum gloeosporioides)

Silva, Maguida Fabiana da January 2007 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-23T07:36:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 246407.pdf: 1552649 bytes, checksum: 5547ed51e8faa1914b287981fd499edf (MD5) / Desde a década de 80, o cultivo da macieira no Brasil vem sofrendo grandes perdas devido à Mancha foliar de Glomerella (MFG) causada por Colletotrichum spp. Esta doença tem se espalhado pelos pomares do sul do Brasil, e recentemente também pelos pomares dos Estados Unidos. Devido aos prejuízos econômicos causados pela MFG é crescente a preocupação por parte da comunidade científica em buscar o entendimento dos mecanismos genéticos envolvidos na resistência a essa doença, uma vez que não existem medidas de controle químico que atendam às exigências da produção integrada (PIM). Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi desenvolver um mapa genético de ligação, em macieira, saturado para a região que contém o gene de resistência à Mancha Foliar de Glomerella (Colletotrichum gloeosporioides), visando contribuir para a eficiência na geração de novas cultivares de macieira resistentes a essa doença. Foi analisada reação à MFG em três populações de mapeamento (M-13/91 x M-46/94, M-13/91 x 'Gala' e 'Pink Lady' x 'Imperatriz'). Os resultados obtidos nos bioensaios indicaram a necessidade de se fazer ajustes de metodologia para incubação da MFG em cada caso. A reação identificada nas populações em estudo aponta para uma resistência monogênica recessiva, concordando, portanto, com os resultados encontrados na literatura. Contudo, os resultados encontrados também não permitem rejeitar a hipótese de segregação de 9:7. Assim, não se descarta a hipótese de que outro gene esteja interferindo nas respostas das plantas ao Colletotricum spp. Foi também realizada a seleção de marcadores RAPD, microssatélites e AFLP, visando mapeamento genético de macieira em duas populações segregantes. Para os marcadores RAPD a estratégia de seleção de marcadores utilizada foi o BSA. Dos 195 iniciadores RAPD testados, nenhum apresentou produto de amplificação co-segregando com o gene de resistência a MFG. No caso dos marcadores microssatélites o polimorfismo encontrado foi abundante e dos 93 iniciadores testados, 63 foram utilizados no mapeamento genético da população M-13/91 x 'Gala'. Os marcadores AFLP apresentaram uma média de 13,1 e 10,5 fragmentos polimórficos entre os parentais das duas populações em estudo. Um mapa genético de ligação foi construído para a população proveniente do cruzamento M-13/91 x 'Gala' contendo 23 grupos de ligação abrangendo 1.179,7 cM com uma média de distância entre marcadores de 8,8 cM. O gene de resistência a MFG foi mapeado no grupo de ligação 15, próximo aos microssatélites NZ02b1 (2,1 cM), CH03b06 (6,8cM) e Hi03g06 (7,5 cM). O microssatélite NZ02b1 pode ser utilizado em programas de melhoramento de macieira, visando selecionar plantas resistentes a MFG, uma vez que o mesmo encontra-se ligado ao gene de resistência a essa doença. A freqüência de recombinação relativamente baixa entre eles caracteriza este como um marcador útil para seleção indireta.
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Caracterização molecular de variedades de videira (VITIS spp.) de Santa Catarina por marcadores microssatélites (SSRs)

Schuck, Mariane Ruzza January 2007 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-23T08:02:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 246930.pdf: 1667453 bytes, checksum: 9c6854327742d0448d006ae863e79f08 (MD5) / A videira é a frutífera economicamente mais importante no mundo e é cultivada para que seus frutos produzam uvas de mesa, suco, uvas passas e vinhos. A espécie Vitis vinifera L. é cultivada pelo mundo todo e muitas variedades importantes têm sido selecionadas durante os séculos. O inventário das variedades de videira descritas na literatura revela a existência de mais de 14000 variedades. Esta grande diversidade genética foi originada pela antiga prática da propagação vegetativa. A dispersão das variedades de videira ou populações de diferentes origens por meio da migração e do comércio conduziu a um grande número de sinônimos, homônimos e ambigüidades na identificação das variedades. Deste modo, a análise genética molecular, baseada no polimorfismo de DNA detectado em locos marcadores tem sido útil no estudo de diversidade genética das coleções de germoplasma facilitando a classificação correta de amostras, bem como a identificação de sinônimos e homônimos. A coleção de germoplasma de videira do Estado de Santa Catarina mantém plantas de videiras que necessitam ser identificadas e caracterizadas corretamente a fim de evitar duplicatas ou sinonímias. Este trabalho objetivou caracterizar e identificar as variedades de videira, das coleções públicas e privadas de Santa Catarina, por marcadores microssatélites. Foram utilizados cinco painéis de marcadores microssatélites (multiplex-seqüenciador) constituídos por primers marcados com fluorocromos para a genotipagem semi-automática em seqüenciador de DNA de 246 amostras de videira, coletados em 7 regiões do Estado de Santa Catarina. Dez locos marcadores distribuídos no genoma da videira foram genotipados utilizando os painéis multiplex e os dados utilizados para identificar variedades sinônimas, de origem desconhecida e erros de identificação, e criar um banco de dados referencial informatizado das variedades de videira (Vitis spp.) de Santa Catarina. Das 246 amostras genotipadas, 181 foram identificadas com segurança e o restante (n=65) por terem amplificado em menos de 6 locos SSRs, não foram identificadas, pois pouco ou nenhum dado referente ao tamanho dos alelos foi suficiente para identifica-lás com segurança. A análise com microssatélites das 181 amostras identificadas resultou em 68 perfis moleculares únicos (68 variedades diferentes), 10 casos de variedades sinônimas (entre as variedades coletadas em Santa Catarina quando comparadas com aquelas encontradas nos 'database' e literatura internacional), identificação de 10 amostras de origem genética desconhecida, 7 casos de erro de identificação e 7 casos de variabilidade intravarietal. Um grande número de alelos pôde ser detectado, o que comprovou a natureza multialélica deste tipo de marcador e a alta eficiência na caracterização e discriminação do germoplasma de Vitis sp. a nível de variedade, gerando fingerprintings únicos para um grande número de genótipos. A metodologia de genotipagem utilizando painéis de microssatélites marcados com fluorescência e genotipados em seqüenciador automático de DNA apresentada mostrou ser um procedimento eficiente, rápido e simples na detecção de polimorfismo SSRs.
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Caracterização ambiental de uma fazenda produtora de madeira em Rio Negrinho, SC

Scariot, Eliziane Carla January 2008 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-24T00:27:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 263048.pdf: 5566472 bytes, checksum: 150f20b0b23ff52422552f69c47d9c3b (MD5) / O objetivo desta pesquisa foi realizar uma caracterização da paisagem e da vegetação nativa de uma fazenda produtora de madeira - Santa Alice, localizada no município de Rio Negrinho, visando subsidiar o processo de restauração ambiental de áreas ciliares de fazendas produtoras de madeira no Planalto Norte Catarinense. Para caracterização da paisagem foram elaborados mapas de declividade, hipsometria e cartas do uso e cobertura da terra dos anos de 1956, 1978 e 2005 e cartas de conflitos ambientais da fazenda por meio do software ArcGis 9.2. Para a caracterização florística realizou-se um levantamento da composição, estrutura e síndromes de dispersão e polinização da comunidade arbustivo-arbórea, dos elementos naturais da paisagem da fazenda (manchas e corredores de vegetação nativa), pelo método de levantamento florístico de pontos quadrantes. Foram estabelecidos quatro grupos amostrais: manchas com floresta avançada (MA), manchas de floresta intermediária (MI), corredores ciliares de floresta avançada (CA) e corredores ciliares de estrutura herbáceo-arbustiva (CHA) em processo de restauração ambiental, para a caracterização florística. A fazenda possui uma área de 1.454ha, sendo 49,4% desse total, destinado a produção de madeira e 50,6% correspondem aos fragmentos naturais com fitofisionomias herbáceo-arbustiva (13,8%), florestal (36,3%) e áreas de banhado (0,47%). A rede hidrográfica da fazenda é composta por 2 cursos d'água principais, os quais constituem uma complexa rede de corredores naturais. A dinâmica de uso e cobertura da terra mostrou que houve a substituição de áreas de vegetação nativa pelo plantio de floresta de Pinus taeda e Eucalyptus spp. entre 1956 e 1978, devido a exploração da araucária e imbuia e, posteriormente pelo desenvolvimento da silvicultura. De 1978 a 2005 observou-se uma redução de 11,4% nas áreas destinadas a produção de Pinus e Eucalipto e um aumento de 9,3% das áreas de vegetação nativa, em função das modificações que ocorreram na legislação ambiental em 1986 e 1989. As manchas e os corredores ciliares da Fazenda Santa Alice apresentaram variações quanto a composição e riqueza florística, apontando para estágios sucessionais secundários distintos. As síndromes de polinização e dispersão para as espécies identificadas nos quatro grupos amostrais foram zoofilia e zoocoria. O padrão de distribuição diamétrico e de altura confirmou a formação de três comunidades com estrutura florestal - MA, MI e CA - e uma comunidade com estrutura herbáceo-arbustiva nos corredores ciliares em processo de restauração na fazenda (CHA). A similaridade florística, agrupou os corredores ciliares (CA e CHA) e isolou as manchas (MA e MI) indicando diferenças na composição e riqueza florística entre as áreas estritamente ciliares e as manchas. A comunidade arbustivo-arbórea dos corredores ciliares (CHA) em processo de restauração natural apresentou 42 espécies arbóreas, com síndromes de polinização e dispersão predominantemente zoofílica e zoocórica. A heterogeneidade florística entre as manchas e corredores de vegetação nativa da fazenda, bem como, dentro dos corredores ciliares em processo de restauração representa um subsídio e também um alerta em programas de restauração. Como alerta, revela a complexidade dos processos sucessionais e do recrutamento de espécies dentro de uma paisagem e dentro da própria área a restaurar. Como subsídio, aponta para a necessidade conhecer melhor os processos de formação das comunidades naturais, sobretudo de áreas em processo de restauração.
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Ecologia reprodutiva de Dyckia encholirioides var. encholirioides (GAUD) Mez. (Bromeliaceae) em costões oceânicos em Florianópolis, Santa Catarina

Krieck, Cristiane January 2008 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-24T01:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 254613.pdf: 2694429 bytes, checksum: 807756d99ac336176fd0a3f2ce7e22eb (MD5) / Este estudo procurou descrever e caracterizar a ecologia reprodutiva de Dyckia encholirioides var. encholirioides (Gaud) Mez. , em Florianópolis, SC. A espécie floresce desde o final do inverno até a primavera. A floração por indivíduo dura em média de 23 dias. A antese das flores ocorreu ao longo de todo o dia e apresentou uma duração de um dia e meio. A espécie apresenta atributos florais associados à melitofilia, secretando pequenos volumes de néctar pelas flores. A freqüência de visitação das abelhas: Xylocopa brasilianorum, Apis mellifera e Trigona spinipes confirmam essa observação, porém apesar de baixa freqüência, o beija-flor Thalurania glaucopis realizou visitas legítimas as flores de D. encholirioides. Baseando-se nos resultados dos testes de polinização e na razão pólen/óvulo, pode-se concluir que a espécie presenta auto-incompatibilidade, formando frutos com sementes férteis apenas nos tratamentos de polinização cruzada e livre. Há uma interação entre a formiga cortadeira Acromyrmex aspersus com as inflorescências e infrutescências de D. encholirioides. Estas formigas cortam partes das flores e frutos em desenvolvimento e carregam para seu ninho para o cultivo de fungos e assim afetam negativamente a reprodução sexual das bromélias. The aim of this study was to describe and characterize the reproductive ecology of Dyckia encholirioides var. (Gaud) Mez. encholirioides, in Florianópolis, SC. The flowering occurs from the end of the winter until spring. The duration of the flowering in a single individual averaged 23 days. The anthesis of the flowers occurred along the day and presented a duration of 1.5 days. The species presents floral attributes linked to melittophily, producing small volume of nectar in the flowers. The frequency of visitation of bees from the species: Xylocopa brasilianorum, Apis mellifera and Trigona spinipes confirms this observation; however in spite of the low frequency of flowers visits by the hummingbird Thalurania glaucopis he made legitimate visits to the flowers of D. encholirioides. Based on the results of the treatments of pollination and the ration P/O, it can be concluded that the species presents self-incompatibility, forming fruit with fertile seeds only in treatments of cross-pollination and open pollination. There is an interaction between the ant Acromyrmex aspersus with the inflorescence and infrutescence of D. encholirioides. These ants cut to parts of the flowers and fruits in development and carrey to their nest for the culture of fungus, and thus affect negatively the sexual reproduction of the bromeliad.
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Biologia reprodutiva e diversidade genética de Dyckia distachya Hassler (Bromeliaceae) como subsídio para conservação e reintrodução de populações extintas na natureza

Wiesbauer, Manuela Boleman 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2008 / Made available in DSpace on 2012-10-24T02:12:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 274349.pdf: 6531095 bytes, checksum: 04a27b54c0f42f3e252e44027b68ed89 (MD5) / Dyckia distachya Hassler é uma bromélia exclusiva de ambientes reofíticos, como ilhas ou margens rochosas de corredeiras, ao longo do Rio Uruguai, fronteira entre Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Dentre as nove populações naturais conhecidas no Brasil, oito foram extintas localmente devido à construção das hidrelétricas de Itá, Machadinho e Barra Grande, em 2000, 2003 e 2005, respectivamente. Anteriormente ao enchimento das barragens, amostras das populações naturais foram resgatadas gerando diversas coleções e foram feitas algumas relocações experimentais. A partir do fato consumado, com a demanda de estabelecer uma estratégia de conservação para a espécie, foram realizados estudos de biologia reprodutiva e diversidade genética nas coleções das populações extintas na natureza. Os estudos de biologia reprodutiva indicaram que a espécie é auto-incompatível, possui floração anual desde setembro a janeiro; possui floração do tipo disponibilidade regular; sua morfologia floral é generalista, sendo polinizada por diversas guildas, incluindo beija-flores, abelhas e borboletas; e a polinização foi efetiva na maior parte dos locais de conservação, havendo a produção de sementes viáveis. Os indivíduos provenientes de Itá, Machadinho e Barra Grande apresentaram variações na morfologia floral, possuindo flores mais campanuladas e de coloração amarelada para Itá, flores tubulosas e avermelhadas para Barra Grande e flores de morfologia intermediária em Machadinho. A guilda de polinizadores também foi variável entre os diferentes locais de conservação e morfologias florais. Os estudos de diversidade genética indicaram que as coleções provenientes de Itá sofreram as maiores derivas genéticas, refletindo efeitos do processo histórico, em que o conhecimento técnico e as exigências de coleta foram crescentes à medida que foram sendo construídas as novas hidrelétricas. As plantas da região de Itá apresentaram as maiores divergências genéticas com relação à Machadinho e Barra Grande, que coincidiram com os dados de biologia floral. De acordo com os resultados obtidos, concluiu-se que as coleções de cada região (Itá, Machadinho e Barra Grande) não devem ser misturadas, devido à grande diferenciação natural entre elas, que poderia gerar efeitos negativos de exogâmia. As coleções de Itá e Encanadinhos (de Barra Grande) devem ser enriquecidas com coleções dos mesmos locais, visando diminuir a endogamia e aumentar a diversidade nas coleções. / Dyckia distachya Hassler is a bromeliad exclusive from rheophytic environments such as islands or rocky shores of rapids along the Uruguay River, the boundary between Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Among the nine known natural populations in Brazil, eight were locally extinct due to the construction of the hydroelectrics of Itá, Machadinho and Barra Grande in 2000, 2003 and 2005, respectively. Prior to the filling of dams, samples of natural populations were rescued generating several collections that were used to make some experimental relocations. From the "fait accompli", with the demand to establish a conservation strategy for the species, studies were performed about reproductive biology and genetic diversity in collections of populations that were extinct in the wild. Studies of reproductive biology indicated that the species is self-incompatible, has annual flowering from September to January, has flowering type of regular availability, its floral morphology is general, pollinated by several guilds, including hummingbirds, bees and butterflies, and pollination was effective in most places of conservation with the production of viable seeds. Individuals from Ita, Machadinho and Barra Grande showed variations in floral morphology, having more campanulate and yellowish flowers at Itá, tubular and red flowers at Barra Grande and intermediate flower morphology in Machadinho. The guild of pollinators also varied between the different conservation sites and floral morphologies. The genetic diversity studies indicated that the collections from Itá suffered the greatest genetic drift, reflecting effects of the historical process in which technical knowledge and gathering requirements were increasing as the new plants were being built. The plants in the region of Itá showed the largest genetic differences in relation to Machadinho and Barra Grande, which coincided with the floral biology data. According to the results, it was concluded that the collections of each region (Itá, Machadinho and Barra Grande) should not be mixed because of the large natural differentiation between them, which could generate negative effects of exogamy. Collections from Itá and Encanadinhos (Barra Grande) should be enriched with collections of the same locations in order to reduce inbreeding and increase diversity in the collections.
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Análise da diversidade genética por marcadores RAPD e SSR em Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Estado de Santa Catarina

Silva, Cristiane Maria da 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T07:27:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 274971.pdf: 2846578 bytes, checksum: f745a914e07ddeda6a34cc83417453f8 (MD5) / O Mal-do-Panamá causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC) é um dos principais problemas fitossanitários da bananicultura. Para esta doença, o uso da resistência genética é o método de controle recomendável. Porém, sua eficiência depende tanto de genes de resistência disponíveis como da presença de patótipos do patógeno. Assim este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade genética de isolados de FOC por meio de descritores morfológicos e marcadores moleculares (RAPD, SSR). Para tanto, foram avaliados 66 isolados coletados em regiões produtoras de Santa Catarina. Os resultados de patogenicidade revelaram que 100% dos isolados foram patogênicos à bananeira da cultivar Enxerto. Quanto às características morfológicas dos isolados não se observou diferenças significativas com relação à taxa de crescimento das colônias, que variaram de 4,4 a 6,6 mm.dia-1. A coloração das colônias sobre meio de cultura BDA variou de branco, salmão e roxo. Os resultados utilizando marcadores moleculares RAPD apresentaram uma variabilidade considerável entre os isolados de FOC, com estimativas de similaridade que variaram de 35 a 98%. Baseado nos 10 marcadores selecionados de RAPD, os 66 isolados foram agrupados em cinco grupos distintos, sendo que o número de indivíduos provenientes das regiões norte e sul do Estado foi igualmente distribuído no primeiro grupo, onde 58 indivíduos foram agrupados. Nos outros quatro grupos formados teve-se somente isolados provenientes do norte do Estado, os quais apresentaram uma maior distância genética quando comparados ao grupo um. A técnica de marcador molecular SSR separou os isolados em três grupos distintos. O primeiro grupo foi constituído de 59 indivíduos provenientes dos diversos municípios onde as coletas foram feitas. O segundo grupo, composto por dois isolados (CO16, JS23), caracterizou-se por apresentar alelo nulo para o marcador MB11. Já o terceiro grupo, formado por quatro isolados (JS26, SI53, SI54, SI55, SI56), apresentou um alelo extra no marcador MB02. No estudo de compatibilidade vegetativa não foi possível observar o pareamento entre os quatro isolados testados não havendo, portanto compatibilidade vegetativa entre os mesmos. Não houve associação dos agrupamentos RAPD e SSR com origens geográficas e características morfológicas da colônia de FOC, visto que os isolados foram distribuídos indistintamente nos grupos.

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