Selecciona las cepas que puedan ser usadas en la remoción de cadmio (Cd+2) en hidroponía, se trabajaron con cinco cepas de levaduras proporcionadas por el laboratorio de Microbiología Ambiental y Biotecnología, las cuales fueron sometidas a ensayos de resistencia, concentración letal media (CL50), cinética de crecimiento, cinética de biosorción. En base a los parámetros mencionados se seleccionaron a las cepas IM y 25.1. Debido a que se determinó que la CL50 para el Cd+2 fue de 70 ppm para ambas cepas, la biosorción en medio base (MB) con 40 ppm de Cd+2 fue de 64,2 y 52,0% respectivamente. Para los ensayos de biosorción en hidroponía, un grupo de plantas de tomate fueron inoculadas con levaduras a una concentración aproximada de 107 UFC/ml, además de ello se tuvieron dos grupos control correspondiente a plantas expuestas a 10 ppm de Cd+2 y plantas cultivadas en solución hidropónica ambos sin inóculo de levaduras. Luego de 20 días, se retiraron y se midieron el tamaño de las plantas de ambos grupos y se determinaron las concentraciones de Cd+2 acumulado en raíces, tallos y hojas mediante espectrofotometría de absorción atómica. Las levaduras IM y 25.1 disminuyeron la acumulación de Cd+2 en las plantas de tomate en 36,45% (1,49 ppm) y 29,39% (1,20 ppm) respectivamente. Además se logró evidenciar que dichas cepas estimularon el crecimiento de las plantas de tomate con respecto a los controles. Las cepas IM y 25.1 fueron identificadas molecularmente como Yarrowia lipolytica. Por tanto las levaduras presentan potencial para ser usados en procesos de biorremediación de Cd+2 y también como bioestimulantes en el crecimiento de plantas. / Universidad Nacional Mayor de San Marcos (Lima). Vicerrectorado de Investigación y Posgrado / Perú. Ministerio de la Producción. Programa Nacional de Innovación para la Competitividad y Productividad (Innóvate Perú). Fondo para la Innovación, la Ciencia y la Tecnología (FINCyT) / Tesis

Se determina la calidad microbiológica y fisicoquímica de las aguas superficiales y aguas subterráneas del Área de Conservación Regional Humedales de Ventanilla, sistema acuático sometido a intensa contaminación. Los muestreos se realizaron en 17 estaciones ubicados en el ACR (Área de Conservación Regional) Humedales de Ventanilla. Estos muestreos se llevaron a cabo entre febrero y agosto del 2015. En 15 estaciones se tomaron muestras de agua superficial y en 2 estaciones muestras de agua subterránea (piezómetro-fondo) para analizar los 3 parámetros microbiológicos y 44 parámetros fisicoquímicos. Los datos de Coliformes fecales y Escherichia coli fueron sometidos a pruebas estadísticas que determinaron una relación lineal creciente entre las variables Log (Coliformes fecales) y Log (Escherichia coli) que debería considerarse en futuros trabajos de Humedales. Para determinar el grado de contaminación en los 47 parámetros analizados, los resultados se compararon con los indicadores establecidos en los ECAs Agua 2008, 2015 y 2017 para aguas de la categoría IV (Conservación del ambiente acuático), Subcategoría E1: Lagunas y lagos que incluye a los Humedales. Los parámetros que estuvieron por encima de los límites permisibles fueron analizados con los instrumentos de gestión del ACR Humedales de Ventanilla (Plan Maestro 2009-2014, reportes de vigilancia y amenazas) para explicar qué factores antropogénicos posibles influyeron en esos resultados. Las aguas superficiales del área de estudio presentaron valores altos de coliformes totales y coliformes fecales (13000 NMP/100ml y 7900 NMP/100 ml). Se determinó la presencia de Escherichia coli, siendo mayor en la estación M-12 denominada Espejo de Agua por ser el cuerpo de agua más grande del ACR y donde anidan el mayor números de aves. Los parámetros fisicoquímicos del agua en general superaron los límites permisibles establecidos por los Estándares Nacionales de Calidad Ambiental (ECA) 2008, 2015 y 2017 del Perú (D.S. N°002-2008-MINAN, D.S. N°015-2015-MINAN y D.S. N°004-2017- MINAN). Se concluye que toda el área de estudio esta impactada por la contaminación microbiológica y fisicoquímica. Se considera de interés la afectación por metales pesados siendo el plomo el más preocupante y también As, Cu, Cd, Hg, Se, Zn y Tl. Los resultados indican una posible afectación a la biota acuática, la salud pública y la calidad del agua superficial y subterránea. Además un aporte importante fue la generación de 35 mapas de isolineas que muestran la dispersión de de los contaminantes en toda el Área de Conservación Regional Humedales de Ventanilla. / Tesis

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Enfermagem, Escola de Enfermagem, 2006. / Submitted by eloisa silva (eloisa1_silva@yahoo.com.br) on 2012-11-14T16:35:36Z No. of bitstreams: 1 cesarcosta.pdf: 536772 bytes, checksum: 522e343b4b7980c91481ee260545e9d0 (MD5) / Approved for entry into archive by Bruna Vieira(bruninha_vieira@ibest.com.br) on 2012-11-14T22:14:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 cesarcosta.pdf: 536772 bytes, checksum: 522e343b4b7980c91481ee260545e9d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-14T22:14:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cesarcosta.pdf: 536772 bytes, checksum: 522e343b4b7980c91481ee260545e9d0 (MD5) Previous issue date: 2006 / Este estudo teve, por objetivo, identificar a presença dos microrganismos patogênicos do grupo coliforme, e de outros microrganismos e parasitos humanos potencialmente patogênicos existentes nas águas que margeiam a cidade do Rio Grande/RS, bem como elaboração de uma proposta de intervenção na esfera da vigilância em saúde ambiental. Foi realizado um estudo descritivo, onde foram coletadas amostras de água em 12 pontos pré determinados, nos meses de outubro de 2004 e janeiro, abril, julho e outubro de 2005. Em cada amostra coletada procedeu-se à identificação de enterobactérias e parasitos potencialmente patogênicos de interesse humano. Na análise estatística, procedeu-se ao cálculo de freqüências absolutas e relativas dos dados obtidos. Realizou-se também o levantamento do funcionamento dos sistemas de informações em saúde ao nível local e regional para determinados agravos e, a partir dos dados encontrados, esboçaram-se algumas ações em saúde. Das 48 amostras estudadas, em 100% foi identificada a presença das bactérias Escherichia coli, Proteus, Salmonella e uma enterobactéria não identificada. Cabe salientar que Escherichia coli foi identificada em número superior a 1.000/100 ml de água; as amostras positivas para parasitos foram 17 (35,4%); oocistos de Cryptosporidium spp. encontrados em 2 amostras(4,2%); a ameba de vida livre, gênero Acanthamoeba, em 12 amostras (25%); e a ameba de vida livre, gênero Naegleria, em 3 amostras (6,3%). Nos pontos de coleta observou-se forte presença de atividade humana ou eliminação de dejetos. A análise dos sistemas de informações em saúde revelou a falta de vigilância ambiental dirigida ao objeto de estudo. Diversas ações com vistas a contribuir com o manejo da situação e a reduzir o possível agravo foram propostas, tais como: monitoramento dos pontos de coleta; instalação de sistema sentinela; ações educativas integradas; implementação da pesquisa; participação multidisciplinar e interinstitucional. Concluiu-se que a água do entorno da cidade estudada apresenta níveis significativos de enterobactérias e de parasitos potencialmente danosos para a população, tornando necessária a implementação de políticas e medidas para controlar esta situação. / This study had the purpose to identify the presence of pathogenic microorganisms from the group Coliforme, and other microorganisms and human potentially pathogenic parasites existing in the boarding waters of the city of Rio Grande-RS and to elaborate a proposal of intervention in the Vigilance of the environment health’s sphere. A descriptive study has been done where the water is collected in 12 predeterminated spots during the months of October/2004 and January, April, July and October/2005. In each collected sample an identification of enterobactéria and potentially pathogenic parasites of human interest was proceeded. In the statistic analysis, a calculation of the absolute and relative frequencies from the obtained data was made. Also a research of the work of the health local and regional information for determinated damage and some actions in heath were sketched from the obtained data. Forty eight samples were studied, 100% presented the presence of Escherichia coli, Proteus, Salmonella bacterium and non-identified enterobactéria, it’s good to set off that Escherichia coli was identified in number superior than 1000/100ml of water. The positive samples were 17(35,4%) for parasites. Oocistos of Cryptosporidium spp were found in 2 samples (4,2%), the free life Ameba, genus Acanthamoeba in 12 samples(25%) and the free life Ameba, genus Naegleria in 3 samples (6,3%). In the collecting spots was found strong presence of human activity and/or elimination of garbage. The analyses of the health information system revealed the lack of environment vigilance directed to the object of study. Several actions in order to contribute with the manage of the situation and reduce the possible damage were proposed, such as: watch the collect spots;installation of a sentinel system; integrated educative actions; encourage the research; multidiscipline participation. The conclusion is that the boarding water of the studied city presents significant level of enterobactéria and parasites potentially damaging for the population, tuning to necessary the implantation of measures to control this situation. / Este estudio tuvo, por objetivo, Identificar la presencia de los microrganismos patógenos del grupo coliforme, y de otros microrganismos y parasitos humanos potencialmente patógenos existentes en las aguas que marginan la ciudad de Rio Grande – Rs, bien como elaboración de una propuesta de intervención en la esfera de la vigilancia en salud ambiental. Fue hecho un estudio descriptivo, donde se realizaron colectas de agua en 12 puntos pre-determinados, en los meses de octubre de 2004 y enero, abril,juli y octubre de 2005. En cada muestra colectada se procedió a la identificación de enterobactérias y parasitos potencialmente patógenos de interés humano. En el análisis estadístico, se procedió al cálculo de frecuencias absolutas y relativas de los datos logrados. se realizó también el levantamiento del funcionamiento de los sistemas de informaciones en salud a nivel local y regional para determinadas situaciones y, a partir de los datos encontrados, se esbozaron algunas acciones en salud. De las 48 muestras estudiadas, en un 100% fue identificada la presencia de las bacterias Escherichia coli, Proteus, Salmonella y una enterobactéria no identificada. Cabe destacar que Escherichia coli fue identificada en número superior a 1.000/100 ml de agua; las muestras positivas para parasitos fueron 17 (35,4%); oocistos de Cryptosporidium spp fueron encontrados en 2 muestras (4,2%); la Amiba de vida libre, género Acanthamoeba, en 12 muestras (25%); y la Amiba de vida libre, género Naegleria, en 3 muestras (6,3%). En los puntos de colecta se observó fuerte presencia de actividad humana o eliminación de dejetos. El análisis de los sistemas de informaciones en salud reveló la falta de vigilancia ambiental dirigida al objeto de estudio. Diversa acciones con vistas a contribuir con el manejo de la situación y a reducir los posibles daños fueron propuestas, tales como: monitorización de los puntos de colecta; instalación de sistema centinela; acciones educativas integradas; implementación de la pesquisa; participación multidisciplinaria e interinstitucional. se concluyó que el agua del entorno de la ciudad estudiada presenta niveles significativos de enterobactérias y de parasitos potencialmente dañosos para la población, tornando necesaria la implementación de políticas y medidas para controlar esta situación.

[EN] As Hippocrates said in ancient Greece: "Let your food be your medicine". According to this thought, today's society shows a growing interest in healthy, safe and high quality nutritional and functional foods, such as fruits like watermelons and citrus. However, their fresh consumption carries the disadvantage of being perishable. Alternatively, their processing makes it possible to extend their marketability, maintaining certain characteristics of fresh products, using processes such as osmotic dehydration and elaboration of marmalades and jellies. However, one of the most important components in its formulation is sucrose, but its consumption is linked to the development of diseases such as diabetes, obesity, tooth decay, etc. For this reason, the food industry provides natural sweeteners (tagatose, isomaltulose, oligofructose and stevia) as sucrose replacers, thus offering the possibility of manufacturing low calorie or non-caloric, non-cariogenic and functional products. Considering the above, in this PhD thesis the following objectives have been raised: A) Kinetics of osmotic dehydration in orange and lemon slices, using natural sweeteners (isomaltulose, tagatose, oligofructose and aqueous extract of stevia). B) Development of marmalades, as well as jellies of watermelon and citrus, with non-cariogenic and low-glycaemic properties replacing sucrose with natural sweeteners (tagatose, isomaltulose, oligofructose) instead sucrose. Evaluation of the healthy sweeteners effect on physicochemical, optical, antioxidants, mechanical and sensory properties in marmalades and jellies, as well as their comparison with commercial products purchased at the market. Microbiological analyses over the storage period have been studied. C) Monitoring of marmalades over the storage period, by means of a Wireless Sensor Network based on a robust architecture. / [ES] Como decía Hipócrates en la Antigua Grecia: "Que tu alimento sea tu medicina". De acuerdo con este pensamiento se muestra la sociedad actual que manifiesta un interés creciente por el consumo de alimentos sanos, seguros y con una elevada calidad nutricional y funcional, siendo éste el caso de frutas como sandías y cítricos. Sin embargo, su consumo en fresco lleva consigo el inconveniente de ser perecederos. Como alternativa, su procesado consigue extender su vida útil manteniendo ciertas características del producto fresco, utilizando procesos como la deshidratación osmótica y la elaboración de mermeladas y de gelatinas. No obstante, uno de los componentes más importantes en su formulación es la sacarosa, pero su consumo, está unido al desarrollo de enfermedades como diabetes, obesidad, caries, hiperlipemias, etc. Por esta razón, la industria alimentaria, oferta edulcorantes naturales (tagatosa, isomaltulosa, oligofructosa y stevia) como sustitutos de la sacarosa, ofreciendo así, la posibilidad de fabricar productos bajos en calorías o acalóricos, no cariogénicos y funcionales. Teniendo en cuenta lo mencionado anteriormente, se han planteado en esta tesis doctoral los siguientes objetivos: A) Cinética de deshidratación osmótica de rodajas de naranja y limón, utilizando edulcorantes naturales (isomaltulosa, tagatosa, oligofructosa y extracto acuoso de stevia). B) Desarrollo de mermeladas de cítricos, así como, de gelatinas de sandía y de cítricos, con propiedades no cariogénicas y de bajo índice glicémico mediante la sustitución de sacarosa por edulcorantes naturales (tagatosa, isomaltulosa y oligofructosa). Evaluación del efecto de dichos edulcorantes sobre las propiedades físico-químicas, ópticas, antioxidantes, mecánicas y sensoriales en mermeladas y gelatinas, así como su comparación con marcas comerciales. Control de la estabilidad a lo largo del periodo de almacenamiento y análisis microbiológico. C) Monitorización de mermeladas a lo largo del periodo de almacenamiento, mediante una red de sensores inalámbricos, basada en una arquitectura robusta. / [CAT] Com deia Hipòcrates en l'Antiga Grècia: "Que el teu aliment siga la teu medicina". D'acord amb aquest pensament es mostra la societat actual que manifesta un interès creixent pel consum d'aliments sans, segurs i amb una elevada qualitat nutricional i funcional, sent aquest el cas de fruites com els melons d'Alger i els cítrics. No obstant això, el seu consum en fresc porta amb si l'inconvenient de ser peribles. Com a alternativa, el seu processat, aconsegueix estendre la seua vida útil mantenint certes característiques del producte fresc, utilitzant processos com la deshidratació osmòtica i l'elaboració de marmalades i de gelatines. Un dels components més importants en la seua formulació és la sacarosa, però el seu consum, està unit al desenrotllament de malalties com a diabetis, obesitat, càries, hiperlipèmies, etc. Per aquesta raó, la indústria alimentària, ofereix edulcorants naturals (tagatosa, isomaltulosa, oligofructosa i stevia) com a substituts de la sacarosa, oferint així, la possibilitat de fabricar productes baixos en calories o acalóricos, no cariogénicos i funcionals. Tenint en compte el que es menciona anteriorment, s'han plantejat en aquesta tesi doctoral els següents objectius: A) Cinètica de deshidratació osmòtica de rodanxes de taronja i llima, utilitzant edulcorants naturals (isomaltulosa, tagatosa, oligofructosa i extracte aquós de stevia). B) Desenrotllament de marmalades de cítrics, així com, de gelatines de meló d'Alger i de cítrics, amb propietats no cariogèniques i de baix índex glicèmic per mitjà de la substitució de sacarosa per edulcorants naturals (tagatosa, isomaltulosa i oligofructosa). Avaluació de l'efecte dels dits edulcorants sobre les propietats fisicoquímiques, òptiques, antioxidants, mecàniques i sensorials en marmalades i gelatines, així com la seua comparació amb marques comercials. Control de l'estabilitat al llarg del període d'emmagatzemament i anàlisi microbiològic. C) Monitorització de marmalades al llarg del període d'emmagatzemament, per mitjà d'una xarxa de sensors sense fil, basada en una arquitectura robusta. / Rubio Arraez, S. (2015). INCORPORACIÓN DE EDULCORANTES NO CARIOGÉNICOS Y CON BAJO ÍNDICE GLICÉMICO EN EL PROCESADO DE FRUTA (CÍTRICOS Y SANDÍA) Y MONITORIZACIÓN DE PARÁMETROS A LO LARGO DEL ALMACENAMIENTO [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/55843 / TESIS

La presencia de residuos de sustancias antimicrobianas en la leche puede ocasionar problemas desde el punto de vista de la salud pública (alergias, trastornos digestivos, resistencias a medicamentos, etc.), además de ser la causa de interferencias en procesos de fermentación de la industria láctea. Ante la posible falta de fiabilidad de los métodos para la detección de inhibidores en la leche de oveja, el escaso número de trabajos efectuados en esta especie y los inconvenientes que originan la presencia de sustancias inhibidoras, tanto en los consumidores como para los procesos tecnológicos, se planteó la necesidad de realizar un estudio sobre un método específico de cribado para la detección de inhibidores (EclipseÒ "100ov"), y la aplicación de una técnica multirresiduo (Sistema Microbiológico Multiplaca) para la identificación preliminar de residuos de antimicrobianos en la leche de oveja. El método EclipseÒ, es una técnica microbiológica de difusión en agar, en el que se encuentran esporas de Bacillus stearothermophilus var calidolactis C953, con un indicador ácido-base. La leche se coloca en los pocillos de la microplaca y tras la incubación, se procede a la interpretación del resultado. En el caso de que la leche no contenga residuos de inhibidores, se producirá el desarrollo del microorganismo y aparecerá un cambio en la coloración del indicador ácido-base presente en el medio, y el color azul inicial pasará a amarillo. Si existen inhibidores no se manifestará el cambio de coloración. El SMMP es un método microbiológico que detecta de una forma selectiva la presencia de residuos de diferentes grupos de antimicrobianos en la leche. La muestra es analizada a través de distintas placas: B. Stearothermophilus var. calidolactis C953 (betalactámicos), B. subtilis BGA a pH 8,0 (aminoglucósidos), M. luteus ATCC 9341 (macrólidos), E. coli ATCC 11303 (quinolonas), B. cereus ATCC 11778 (tetraciclinas) y B. subtilis BGA, a pH 7,0 (sulfonamidas). La presencia de residuos / Montero Alonso, A. (2004). Aplicación de métodos microbiológicos en la detección de residuos de antimicrobianos en la leche de oveja [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/1977 / Palancia

La presente tesis doctoral ahonda en dar respuesta a las exigencias de la FAO/OMS (2006) en cuanto al desarrollo de métodos bactericidas alternativos al térmico, aplicables a fórmulas infantiles reconstituidas (RPIFM) de preparados en polvo, principal vía de transmisión de un microorganismo patógeno emergente Cronobacter sakazakii. El principal objetivo sobre el que versan los estudios recogidos en la presente tesis doctoral es la aplicación de tecnologías no-térmicas de conservación, como barreras para controlar e inactivar el microorganismo C. sakazakii en RPIFM. La metodología de trabajo se basa en la aplicación de pulsos eléctricos de alta intensidad (PEAI) y altas presiones hidrostáticas (APH), mediante el uso de equipos a nivel de planta piloto. Se plantea también la adición de un ingrediente natural con capacidad antimicrobiana sobre la fórmula láctea tratada por PEAI. Además, se aplicarán herramientas de simulación para llevar a cabo una valoración de la exposición a C. sakazakii en ambiente hospitalario. Los principales resultados de la presente tesis doctoral ponen de manifiesto la efectividad de las tecnologías de PEAI y APH en el control del microorganismo alcanzando valores de inactivación que van desde [0.88-1.22] ciclos log10 a [2-7] ciclos log10 respectivamente. Ambas tecnologías dan lugar a la generación de células subletalmente dañadas, presentando éstas, una mayor sensibilidad frente a la aplicación de métodos barrera sucesivos, como en este caso, la refrigeración o la adición de un ingrediente natural con capacidad antimicrobiana. Por tanto, podemos concluir que la incorporación sucesiva de diferentes métodos de control, "tecnología de barreras", resulta eficaz para controlar e inactivar al microorganismo C. sakazakii en RPIFM. / Pina Pérez, MC. (2011). Aplicación de tecnologías no térmicas de conservación, pulsos eléctricos de alta intensidad (PEAI) y altas presiones hidrostáticas (APH), para el control de Cronobacter sakazakii en fórmulas lácteas infantiles: desarrollo de modelos predictivos y evaluación de la exposición [Tesis doctoral]. Editorial Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/14177 / Palancia

Viruses constitute the vast majority of all biological entities in the biosphere and represent one of the biggest reservoirs of undetected genetic diversity on Earth. Of all the viral particles inhabiting the ocean, phages are the most abundant and can affect the overall microbial composition of marine ecosystems and the dynamics of global biogeochemical cycles. The interaction between prokaryotic cells and their phages is among the oldest and most intertwined host-parasite relationships on the planet. It has been extensively studied by culture, molecular biology, and experimental evolution. However, due to the difficulties of culture with environmental samples, only a few studies have analyzed the mechanisms of phage-host interaction in the marine environment. Here, we have studied the genes involved in viral host recognition and their evolutionary dynamics by focusing on two species of the marine copiotrophic bacterium Alteromonas and several phages infecting them. We described the genomic and morphological characterization of the first Alteromonas phage belonging to the Myoviridae family (Alteromonas myovirus V22) that was isolated in coastal waters of the Mediterranean Sea, and we identified its receptor-binding protein (RBP) used for host recognition by combining fluorescence microscopy and spectrometry. In addition, using size-exclusion chromatography, we showed how this protein required co-expression with a downstream protein to be functional, which later was identified as a new type of intermolecular chaperone crucial for RBP maturation. We also identified a conserved host recognition module in V22 and other unrelated alterophages belonging to different viral families and with completely different morphologies, suggesting horizontal gene transfer between the ancestors of these phages. Furthermore, we described the first coevolution study of a host-parasite system performed with Alteromonas using a metagenomics-like approach. Finally, we analyzed the micro- and macrodiversity of an alterophage population that was able to survive over a long period of time and showed remarkable genomic stability, indicating stable interactions over time between phage-host recognition structures. Overall, this study has contributed to extend the knowledge of known phage-host recognition mechanisms present in the marine ecosystem and has provided a first glimpse of the evolutionary dynamics in phages infecting Alteromonas.

La industria textil libera al ambiente grandes cantidades de aguas residuales que, entre otros varios contaminantes, contienen colorantes azo en su composición, los cuales son compuestos tóxicos, carcinogénicos y mutagénicos que afectan negativamente la vida acuática y la calidad del agua. El presente estudio tuvo por objetivo caracterizar a nivel fisiológico y genómico cepas nativas con potencial de degradación de colorantes azo obtenidas de un efluente de industria textil de Lima, Perú. Se aplicó el método de la microplaca a doce aislados bacterianos para su selección en base a su respuesta positiva a la decoloración de tres colorantes azo: Azul directo 71, Rojo remazol RGB y Amarillo Oro Remazol RGB. La actividad decolorante de las cepas seleccionadas fue evaluada mediante espectrofotometría UV-Visible en medio ZZ con el colorante respectivo a 100 ppm y en condiciones de microaerofilia durante 24 horas. El secuenciamiento de los genomas se realizó utilizando la tecnología HiSeq 2500 de Illumina, el ensamblaje de novo con el software SPAdes, la extensión de los contigs y reparación de gaps a través de los programas ABACAS e IMAGE y la anotación con Prokka. Las dos cepas con mejor eficiencia de degradación correspondieron a Shewanella sp. LC-2 y Shewanella sp. LC-6, ambas identificadas mediante análisis filogenómico resultando muy cercanas al grupo filogenético de Shewanella sp. FDAARGOS_354. Las cepas mostraron una actividad decolorante frente a Azul Directo 71, Rojo Remazol y Amarillo Remazol con porcentajes de 94.42, 94.79, 91.67 para Shewanella sp. LC-2 y 94.37, 94.92, 83.24 para Shewanella sp. LC-6 a las 24 h. Asimismo, los genomas de Shewanella sp. LC-2 y LC-6 revelaron la presencia de genes que codifican azorreductasas dependientes de NADH, peroxidasas decoloradoras de tinte (DyPs), genes implicados en la desaminación, asimilación de sulfatos, reducción de nitratos y metales pesados, como también en la degradación de benzoatos, catecol y gentisato. Se concluye que las cepas Shewanella LC-2 y LC-6 tienen una actividad metabólica eficaz para la decoloración de Azul directo 71, Rojo remazol RGB y Amarillo Oro Remazol RGB, presentan versatilidad catabólica y son de potencial aplicación en la biorremediación de aguas residuales textiles. / Universidad Nacional Mayor de San Marcos (Lima). Vicerrectorado de Investigación y Posgrado / Perú. Ministerio de la Producción. Programa Nacional de Innovación para la Competitividad y Productividad (Innóvate Perú). Fondo para la Innovación, la Ciencia y la Tecnología (FINCyT) / Tesis

Submitted by Luanna Matias (lua_matias@yahoo.com.br) on 2015-02-09T13:38:03Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Erika Goulart Rodrigues - 2014.pdf: 2108349 bytes, checksum: 05c7df95766f5d5af12041646500a0a0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-02-20T11:05:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Erika Goulart Rodrigues - 2014.pdf: 2108349 bytes, checksum: 05c7df95766f5d5af12041646500a0a0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-20T11:05:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Erika Goulart Rodrigues - 2014.pdf: 2108349 bytes, checksum: 05c7df95766f5d5af12041646500a0a0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-03-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / BACKGROUND: Dressing rooms attend colonized and infected chronic wounds carriers users and the environment may be contaminated by pathogens present in these lesions during the care. The literature shows the surfaces role corroborating the infection epidemiological chain and have identified low standards of environmental hygiene. This theme has been explored with emphasis on the medium and high complexity. However, it is noted that investments directed to the primary health care are rare. OBJECTIVE: To analyze the effect of environmental surfaces and non-critical health products contamination for Staphylococcus spp. for the safety of dressing rooms workers and users in primary health care. METHODOLOGY: Cross-sectional study of microbiological nature, conducted from July to November 2013 in dressing rooms references in the treatment of chronic wounds of primary health care in Goiás, Brazil. Approved by the Federal University of Goiás Research Ethics Committee (protocol 178/2012). It is began collecting direct observation of ambience processing. Then, have been done the interview, guided by semistructured instrument. The specimens collection from environmental surfaces and noncritical health products was performed using a sterile swab, rubbed on the research site and sent to the laboratory for processing. The microbiological procedures were performed according to standard methodologies. Was used SPSS 19.0 (Statistical Package for Social Sciences for Windows®) and the data were analyzed using descriptive statistical procedures. RESULTS: 38 articles were analyzed, including 32 environmental surfaces and six noncritical health products. It was found at the microbiological testing seven (18.4%) environmental surfaces and products were contaminated by Staphylococcus spp. Eight bacteria were isolated, which of seven (87.5%) were identified as coagulase negative Staphylococcus (CoNS) and one (12.5%), as S. aureus. Staphylococcus spp. were resistant to penicillin G (87.5%) and CoNS, presented a constitutive resistance to macrolidelincosamide-streptogramin B group (MLSBc) (28.6%) and resistance to oxacillin (42.9%). All micro-organisms were resistant to at least one antimicrobial agent. Of the three units investigated, the process of cleaning and disinfection was done by 91.7% of the 12 workers in the study. Nonetheless, was at unconformity with current guidelines. CONCLUSION: The results demonstrate the presence of multidrugresistant pathogens in the ambience of the dressing rooms, which denotes failure in articles processing. These failures may be due to lack of supervision and/or the worker unpreparedness to perform the procedure. Also exposes workers and service users at risk for colonization and eventual infection by these bacterias. This situation benefits cross-contamination and spread of multiresistant microorganisms in primary health care. / INTRODUCCIÓN: Salas de curativo asisten a usuarios portadores de heridas crónicas colonizadas e infectadas y el ambiente puede contaminarse por agentes patógenos presentes en estas lesiones durante la asistencia. La literatura envidencia el papel de las superficies que corroboran la cadena epidemiológica de la infección y se han identificado bajos niveles de higiene ambiental. Este tema ha sido explorado con énfasis en media y alta complejidad. Sin embargo, se percibe que las embestidas dirigidas hacia la atención primaria de salud son escasas. OBJETIVO: Analizar el efecto de contaminación de superficies ambientales y productos de salud no críticos por Staphylococcus spp. para seguridad de trabajadores y usuarios de salas de curativo de la atención primaria de salud. METODOLOGÍA: Estudio transversal de naturaleza microbiológica, realizado entre julio y noviembre de 2013, en salas de curativo referencias en el tratamiento de heridas crónicas de la atención primaria de salud en Goiás, Brasil. Aprobado por el Comité de Ética en Investigación de la Universidad Federal de Goiás (protocolo 178/2012). Comenzó la obtención de datos por observación directa del procesamiento de ambiente. A continuación, se ha hecho la entrevista, guiada por instrumento semi-estructurado. La recolección de espécimen de superficies ambientales y productos para salud no críticos se realizó con una torunda estéril, frotado en el sitio de investigación y enviado al laboratorio para su procesamiento. Los procedimientos microbiológicos se realizaron de acuerdo con metodologías estandarizadas. Se utilizó el programa SPSS 19.0 (Statistical Package for Social Sciences para Windows®) y los datos se analizaron mediante procedimientos estadísticos descriptivos. RESULTADOS: Se analizaron 38 artefactos, incluyendo 32 superficies ambientales y seis productos para salud no críticos. Se encontró, en las pruebas microbiológicas, siete (18,4%) de las superficies ambientales y de los productos estaban contaminados por Staphylococcus spp. Se aislaron ocho bacterias, de cuales siete (87,5%) fueron identificadas como Staphylococcus coagulasa negativo (CoNS) y uno (12,5%) como S. aureus. Staphylococcus spp. eran resistentes a penicilina G (87,5%) y los CoNS, presentarón resistencia constitutiva a el grupo macrólidos, lincosamidas, estreptogramina B (MLSBc) (28,6%) y resistencia a oxacilina (42,9%). De las tres unidades investigadas, el proceso de limpieza y desinfección se realizaba por 91,7% de los 12 trabajadores en el estudio. Sin embargo, estaba en desacuerdo con las directrices actuales. CONCLUSIÓN: Los resultados demuestran la presencia de patógenos resistentes a múltiples fármacos en el ambiente de salas de curativo, que denota el fracaso en el procesamiento de los artefactos. Estas fallas pueden deberse a falta de supervisión y falta de preparación del trabajador para realizar el procedimiento. Además expone a los trabajadores y usuarios del servicio en situación de riesgo para la colonización y la infección posterior por estas bacterias. Esta situación promueve la contaminación cruzada y propagación de microorganismos multirresistentes en la atención primaria de salud. / INTRODUÇÃO: Salas de curativo atendem usuários portadores de feridas crônicas colonizadas e infectadas e a ambiência pode ser contaminada por patógenos presentes nessas lesões durante a assistência. A literatura evidencia o papel das superfícies corroborando a cadeia epidemiológica da infecção e tem identificado baixos padrões de higiene ambiental. Essa temática tem sido explorada com maior ênfase nos serviços de média e alta complexidade. Entretanto, percebe-se que os investimentos direcionados para a atenção primária à saúde são escassos. OBJETIVO: Analisar as repercussões da contaminação de superfícies ambientais e produtos para saúde não críticos por Staphylococcus spp. para a segurança de trabalhadores e usuários de salas de curativo da atenção primária à saúde. MÉTODOLOGIA: Estudo do tipo transversal de natureza microbiológica, realizado de julho a novembro de 2013 em salas de curativo referências em tratamento de feridas crônicas da atenção primária à saúde em Goiás, Brasil. Aprovado em Comitê de Ética em Pesquisa da Universidade Federal de Goiás (protocolo 178/2012). Iniciou-se a coleta com observação direta do processamento da ambiência. Em seguida, realizou-se a entrevista, norteada por formulário semiestruturado. A coleta dos espécimes de superfícies ambientais e de produtos para saúde não críticos foi realizada por meio swab estéril, friccionado sobre o sítio de investigação e enviado ao laboratório para processamento. Os procedimentos microbiológicos foram realizados conforme metodologias padronizadas. Utilizou-se o SPSS 19.0 (Statistical Package for the Social Sciences for Windows®) e os dados foram analisados mediante procedimentos de estatística descritiva. RESULTADOS: Foram analisados 38 artefatos, sendo 32 superfícies ambientais e seis produtos para saúde não críticos. Verificou-se, à análise microbiológica, que sete (18,4%) das superfícies ambientais e dos produtos estavam contaminadas por Staphylococcus spp. Foram isoladas oito bactérias, das quais sete (87,5%) foram identificadas como Staphylococcus coagulase negativos (CoNS) e uma (12,5%), como S. aureus. Os Staphylococcus spp. apresentaram resistência à penicilina G (87,5%) e os CoNS, resistência constitutiva ao grupo macrolídeo, lincosamida, estreptogramina B (MLSBc) (28,6%) e à oxacilina (42,9%). Todos os micro-organismos apresentaram resistência a, pelo menos, um antimicrobiano. Das três unidades pesquisadas, o processo de limpeza e desinfecção era realizado por 91,7% dos 12 trabalhadores do estudo. No entanto, estava em desacordo com as diretrizes vigentes. CONCLUSÃO: Os resultados demonstram presença de patógenos multirresistentes na ambiência das salas de curativo, o que denota falhas no processamento dos artefatos. Essas falhas podem ser decorrentes da falta de supervisão e/ou despreparo do trabalhador para executar o procedimento. Igualmente, expõe trabalhadores e usuários do serviço aos riscos de colonização e eventual infecção por essas bactérias. Essa situação beneficia a contaminação cruzada e disseminação de micro-organismos multirresistentes na atenção primária à saúde.

OBJETIVO: Establecer la contribución de los integrones de clase 1 a la resistencia antibiótica en aislados clínicos de enterobacterias de dos contextos epidemiológicos: zoonosis por Salmonella enterica e infección por Klebsiella pneumoniae resistente a amoxicilina/clavulánico (ACL) adquirida en un centro sociosanitario. AISLADOS: Se estudiaron (a) 92 aislados humanos de Salmonella enterica serotipo Typhimurium (ST) recuperados entre 2004 y 2006 en el laboratorio de microbiología del Hospital Verge de la Cinta de Tortosa (35 aislados adicionales de una colección de 2000-2001 para estudios de epidemiología molecular) y 382 aislados de S. enterica de otros serotipos (SNT) recuperados en ese laboratorio en 2001 y entre 2004 y 2009 (b) 45 aislados de K. pneumoniae resistentes a ACL y sensibles a cefazolina y dos resistentes a ACL con fenotipo sugestivo de AmpC plasmídica y resistencia transferible a quinolonas recuperados entre 2006 y 2008 de muestras clínicas de pacientes de un centro sociosanitario de la región sanitaria Terres de l’Ebre. RESULTADOS: (a) Salmonella enterica: El 77,2% de los aislados de ST y el 16,5% de los de SNT fueron resistentes a más de dos familias de antibióticos (MDR). El 3,3% de los aislados de ST y el 41% de los de SNT fueron resistentes a ácido nalidíxico y sólo se constató resistencia a ciprofloxacino en tres aislados de S. Kentucky. Las β-lactamasas presentes en los aislados de ST resistentes a amoxicilina (60,9%) fueron OXA-1 (52%), TEM-1 (32%) y PSE-1 (18,7%) y en los aislados resistentes de SNT (24,3%) TEM-1 (90,3%), CTX-M-9 (1 aislado de S. Virchow y 1 aislado de S. Grumpensis qnrA1 positivo), CTX-M-15 (1 aislado de S. Kapemba) y DHA-1 (1 aislado de S. Newport qnrB4 positivo); ésta es la primera descripción de β-lactamasas de espectro extendido en S. Kapemba y S. Grumpensis. 56 aislados de ST y 35 de SNT, todos excepto uno MDR, poseían integrones de clase 1. En ST los aislados predominantes fueron los que albergaban el integrón de región variable (RV) blaOXA-1-aadA1, cuya frecuencia superaba la registrada para el conjunto de España, seguidos de los aislados con el perfil de integrones aadA2 + blaPSE-1 típico de la presencia de SGI1; la mayoría de aislados con uno u otro perfil de integrones estaban relacionados clonalmente. En SNT se identificaron 11 tipos de integrones en 15 serotipos distintos (incluidos S. Kapemba, S. Mikawasima y S. ser [9,12:Iv:i:-] en los que no se habían descrito previamente), siendo los de RV dfrA1-aadA1, dfrA17-aadA5 y dfrA12-orf-aadA2 los presentes en mayor número de serotipos; en los dos aislados blaCTX-M-9 positivos, este gen estaba ubicado en un integrón complejo cuya RV 1 fue dfrA16-aadA2 en S. Virchow y aadB-aadA2 en S. Grumpnesis. Se detectaron dos variantes de integrones atípicos asociados a sul3: dfrA12-orF-aadA2-cmlA-aad1 (5 aislados de ST y 4 de S. Enteritidis) y estX-psp (2 S. Grumpensis). Este último integrón y el de RV aadA13-sat, también identificado en S. Grumpensis, no se habían descrito anteriormente en S. enterica. (b) Klebsiella pneumoniae centro socio-sanitario: Todos los aislados resistentes a ACL y sensibles a cefazolina producían una penicilinasa resistente a inhibidores, IRT-11 (n=19) u OXA-1 (n=26). Los aislados productores de IRT-11 se agrupaban en tres clones y sólo uno portaba un integrón de clase 1 (RV dfrA12-orf-aadA2); este es el segundo caso comunicado de brote nosocomial por producción de un enzima IRT. Todos los aislados productores de OXA-1 eran MDR y 23 de ellos acarreaban un integrón de clase 1, transferible por conjugación y asociado a qnrS2, de RV [aac (6’)-1b-cr- blaOXA1-catB3-arr3], que en tres aislados era defectivo en 3’. Los aislados se agrupaban en tres clones diferentes según poseyesen integrones de clase 1 convencionales, defectivos o no presentaran integrones. Un integrón de idéntica RV y vinculado a blaDHA-1 y qnrB4 en un integrón complejo de nueva estructura (Genbank GU906294) muy semejante a In37 y del que se diferenciaba por haber sufrido la deleción, por la inserción de IS26, de la región comprendida entre la primera copia de 3’CS y qnrB4, se detectó en otros dos aislados MDR de K. pneumoniae, indistinguibles genéticamente y qnrS2 positivos. / The aim of this work was to assess the contribution of class 1 integrons to antimicrobial resistance in clinical isolates of Enterobacteriaceae of human origin from two epidemiological settings: zoonosis caused by Salmonella enterica and infection due to amoxicillin-clavulanate(ACL)-resistant Klebsiella pneumoniae acquired in a chronic care center. RESULTS: (a) S. Typhimurium: 71 of the 92 isolates recovered from 2004 to 2006 at the microbiology laboratory of Hospital Verge de la Cinta (Tortosa. Catalonia. Spain) were multidrug-resistant (MDR), of which 56 carried class 1 integrons. Isolates bearing the blaOXA-1-aadA1 variable region integron were the commonest among this serovar, showing a higher frequency than that reported in other areas of Spain, followed by isolates exhibiting the integron profile typical of SGI1 (aadA2 + blaPSE-1); most isolates displaying any of these two integron profiles shared identical genotype. Five isolates possessed a sul3-associated class 1 integron whose structure was 5’CS–dfrA12–orfF–aadA2–cmlA1–aadA1–qacH–IS440–sul3. (b) Non-Typhimurium S. enterica: 16.5% of the 382 isolates recovered in 2001 and from 2004-2009 at the same laboratory were MDR and 35 carried class 1 integrons. Overall, 11 different class 1 integrons were identified in 15 distinct serotypes (including S. Kapemba, S. Mikawasima and S. ser [9,12:Iv:i:-], where they had not been previously described), being those with dfrA1-aadA1, dfrA17-aadA5 and dfrA12-orf-aadA2 variable regions the most widely distributed. Two isolates (one qnrA1 positive S. Grumpensis and one S. Virchow) bore a complex class 1 integron linked to blaCTX-M-9 and 4 S. Enteritidis and 2 S. Rissen carried atypical sul3-type integrons (5’CS–dfrA12–orfF–aadA2–cmlA1–aadA1–qacH–IS440–sul3 and 5’CS–estX-psp-IS440–sul3, respectively). The former integron and the aadA13-sat one, detected in S. Grumpensis, had never been reported before in S. enterica. (c) Klebsiella pneumoniae: 47 ACL-resistant (45 cefazolin-susceptible and 2 broad-spectrum-cephalosporin-resistant) isolates, recovered between 2006 and 2008 from patients attending a chronic care center, were investigated. All cefazolin-susceptible isolates produced an inhibitor-resistant penicillinase, IRT 11 (n= 19) or OXA-1 (n=26); 23 OXA-1-producing isolates harboured a class 1 integron, associated with qnrS2, with the aac(6’)- Ib-cr, blaOXA-1, catB3, arr3 cassette arrangement (in 3 cases the integron was defective in 3’ end). An integron with identical structure, linked to blaDHA-1 and qnrB4 within an In37-like complex class 1 integron of novel structure (Genbank GU906294), was found in two epidemiologically closely related qnrS2 positive isolates.