Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-26T10:25:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 303225.pdf: 1703689 bytes, checksum: 1eb75efb773c38bf31eccc45df778d92 (MD5) / O progressivo processo de devastação da Mata Atlântica, e os efeitos ornamentais e paisagísticos das bromélias, têm ocasionado a diminuição de suas populações até ter atualmente muitas espécies sob ameaça de extinção. Assim, considerando a importância das Bromeliáceas no cenário nacional, bem como, da conservação da biodiversidade faz-se necessário continuar com os estudos de propagação destas espécies. Portanto, este trabalho objetivou avaliar os aspectos morfológicos e histoquímicos da germinação in vitro e o desenvolvimento pós-seminal em Vriesea friburgensis var. paludosa, assim como da formação de culturas nodulares (CN) a partir de sementes e explantes foliares das bromélias Vriesea friburgensis var. paludosa e Vriesea reitzii. As sementes foram coletadas de frutos maduros de V. friburgensis var. paludosa, mantidas na coleção de bromélias do Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal de Santa Catarina. Também foram utilizadas brotações jovens de Vriesea reitzii, pertencentes à Coleção de Bromélias in vitro do Laboratório de Fisiologia do Desenvolvimento e Genética Vegetal (LFDGV). O meio de cultura usado foi constituído pela formulação de nutrientes minerais de MS, adicionado de vitaminas de Morel e sacarose. Para a germinação das sementes, usou-se meio de cultura isento de reguladores de crescimento, ao contrário dos meios usados para indução de CN os quais foram suplementados com diferentes concentrações de ANA, BAP e 2IP. Entre os resultados obtidos, observou-se em V. friburgensis var. paludosa uma germinação epígea criptocotiledonar, com porcentagem acima de 97%, peso de mil sementes de 683,8 mg, e um IVG de 21,43. Suas sementes são pequenas medindo 4,4 + 0,06 mm de comprimento e 0,5 + 0,01 mm de largura, fusiformes, com apêndices plumosos e tegumento de cor castanho. Observou-se a germinação no dia 3º após a inoculação no meio. No dia 12º iniciou-se a emergência do primeiro eofilo e no dia 18º do segundo eofilo. As sementes são bitegumentadas e observou-se no seu tegumento principalmente compostos fenólicos. No citoplasma das células do endosperma observou-se o acúmulo de amido como principal composto de reserva, distribuído em amiloplastos e que junto com as proteínas mostraram uma diminuição gradual durante a formação da plântula. O endosperma esta rodeado pela camada de aleurona, com células que apresentam grande quantidade de proteínas e lipídios. Identificou-se também no endosperma uma camada de células empilhadas próximas ao embrião, indicando que também poderia desempenhar um papel na regulação do crescimento embrionário. O embrião apresentou-se pouco diferenciado na semente madura, com um cotilédone haustorial que além da função de absorver e conduzir as reserva do endosperma para o embrião, possivelmente também esteja relacionado com o fornecimento de enzimas hidrolíticas. Enquanto à maior taxa de indução de CN a partir de sementes de V. friburgensis var. paludosa, a suplementação de ANA (4?M) no meio de cultura resultou em 72%. Observou-se que primeiro o embrião inicia o processo de germinação, e após este processo dá inicio ao desenvolvimento das culturas nodulares. A partir da observação destes eventos pode-se inferir que a origem das CN a partir da semente está relacionada com os meristemas radicular e caulinar, e quando formadas a partir dos explantes foliares estão envolvidos os meristemas intercalar e marginal. Portanto, o presente estudo contribui para a ampliação da base de conhecimentos sobre as bromélias nativas da Mata Atlântica, especialmente nos processos de estabelecimento das plântulas e sobre a propagação in vitro mediante o sistema regenerativo das culturas nodulares. Estas informações constituem ferramentas úteis para estudos biológicos, taxonômicos, ecológicos e de tecnologia de sementes e também podem auxiliar o aprimoramento nos processos de micropropagação. Estes conhecimentos são importantes para o estudo aplicado à conservação, propagação e ao manejo das bromélias.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-26T10:32:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 303742.pdf: 1242925 bytes, checksum: 72ac42983c7558f57074ca7eb4ac8054 (MD5) / As populações humanas influenciam os padrões biológicos observados atualmente através da manipulação das espécies e do ambiente. A heterogeneidade da paisagem no presente, por exemplo, é o reflexo também da relação entre pessoas, plantas e o ambiente que pode ser individualizada em unidades de paisagem. A definição de unidades de paisagem individualizadas pela ação humana possibilita delinear estudos de biologia de populações de plantas para comparação entre as áreas. Neste estudo avaliaram-se as características das populações de E.edulis em diferentes unidades de paisagem localizadas na comunidade de Ribeirão Taquaras, município de Ibirama, Estado de Santa Catarina. A espécie foi escolhida como indicadora entre as diferentes unidades de paisagem em virtude da sua importância material para as comunidades inseridas na Floresta Ombrófila Densa e pela sua abundância e distribuição neste ambiente. Desta maneira, identificamos alta relevância da espécie no passado e no presente para a comunidade, sendo indentificados alguns usos atuais associados ao consumo de palmito, extração de frutos para fabricação de açaí e cultivo da espécie em quintais. As unidades de paisagem identificadas onde a espécie está presente foram a floresta secundária e os quintais, estas foram comparadas com as populações do interior de uma Unidade de Conservação (FLONA) em que o uso humano é regulado. Nestas unidades de paisagem foram avaliadas e comparadas as características populacionais e genéticas de E.edulis e observou-se que as populações possuíram características distintas de densidade nas classes de tamanho, quantidade de infrutescências e distribuição diamétrica entre as unidades de paisagem, visto que a FLONA apresentou maiores densidades de regenerantes, os quintais maiores densidades de adultos e infrutescências e as florestas secundárias maior densidade de juvenis (JII). As unidades de paisagem apresentaram semelhanças quanto aos parâmetros de diversidade genética dos adultos na floresta secundária e para o total dos quintais em comparação com a FLONA. Assim, observamos diferentes potencialidades nas unidades de paisagem quintal, floresta secundária e na Unidade de Conservação para conservação genética e populacional de E.edulis na comunidade estudada.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-26T11:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 302794.pdf: 1629810 bytes, checksum: f0c4943e3530bd914f93ffb8f74f1203 (MD5) / As sementes maduras de A. angustifolia perdem rapidamente sua qualidade após a colheita. Conhecer os fatores ligados a esse processo é necessário para promover a disponibilidade de sementes com qualidade por período prolongado após a safra anual e facilitar as ações de restauração de áreas e a conservação da espécie. Desta forma, este estudo foi desenvolvido buscando analisar as alterações fisiológicas associadas à perda da viabilidade e do vigor das sementes de A. angustifolia e relacioná-las às alterações bioquímicas durante o armazenamento. As sementes foram coletadas no município Painel (SC) e submetidas às condições de armazenamento em ambiente sem controle térmico, refrigerador (5 oC) e freezer (-18 oC), por 180 dias, sendo avaliadas quanto à viabilidade, vigor, teor dos principais metabólitos de reserva do megagametófito e metabólitos dos embriões, as mudanças no perfil protéico, atividade enzimática e integridade do DNA. A germinação das sementes após a colheita foi de 90% e manteve-se em 64% na condição de refrigerador por 180 dias, mas ocorreu perda total de viabilidade das sementes armazenadas nas demais condições. Apesar da perda total de viabilidade e elevada taxa de condutividade elétrica, as sementes armazenadas em freezer não manifestaram grandes alterações bioquímicas em relação ao teor de proteínas no embrião, teor de carboidratos solúveis e amido no megagametófito, atividade da enzima superóxido dismutase e peroxidação lipídica. Associando-se as alterações fisiológicas e bioquímicas, constatou-se que, em função da elevada viabilidade das sementes, estabilidade no perfil protéico, poucas alterações nos metabólitos presentes no megagametófito e embrião, atividade da SOD e peroxidação lipídica, o armazenamento das sementes de A. angustifolia em refrigerador é uma alternativa viável pelo período de 180 dias.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-26T11:57:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 304591.pdf: 3524501 bytes, checksum: 46bc9ee542bb9cb82d90d469646914c1 (MD5) / A maçã é a segunda fruta de maior importância econômica no Brasil, e Santa Catarina é o principal Estado produtor com 53% nacional da produção total do Brasil. A sua maçã se concentra principalmente em duas cultivares, Gala e Fuji, que representam em torno de 95% da produção. Esta concentração em poucas variedades predispõe à ocorrência de várias doenças, dentre elas aquelas conhecidas como "podridão amarga" e "mancha foliar da Glomerella" (MFG), as quais causam elevadas perdas na produção. Estas doenças são ocasionadas pelo ataque do patógeno fúngico Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz. & Sacc., responsável pela doença nos frutos e nas folhas da macieira, respectivamente. A MFG é uma doença típica de verão, podendo provocar desfolhamento superior a 75% e, como consequência, reduzir drasticamente a produção das plantas no ano seguinte. Esta doença ocorre principalmente na cv. Gala, enquanto que a cv. Fuji mostra-se resistente a ela. Recomendam-se várias medidas para controlar esta moléstia nas cvs. suscetíveis, medidas estas majoritariamente associadas ao controle com produtos químicos. Os resultados, contudo, são variáveis e pouco animadores. A incorporação de resistência nas cultivares suscetíveis para estas e outras moléstias poderá reduzir o uso de fungicidas em mais de 80%. O presente trabalho objetivou analisar o patossistema C. gloeosporioides - M. Domestica desde uma perspectiva microscópica, a qual visa analisar a dinâmica de crescimento do C. gloeosporioides ao longo do tempo (até 48 horas após a inoculação do patógeno sobre folhas de macieira cvs. Fuji e Gala) e as diferenças que apresentam os tecidos foliares das cvs, Fuji e Gala em resposta ao ataque pelo patógeno, até 48 horas da inoculação, mediante observações ao microscópio óptico e microscópio eletrônico de varredura (MEV). O trabalho objetivou também empregar metodologias associadas à proteômica, visando identificar as diferenças na expressão proteica que apresenta o tecido foliar das cvs. Fuji e Gala em resposta ao ataque pelo C. gloeosporioides, e identificar a estrutura primaria das proteínas expressadas exclusivamente em cada tratamento, para cada cultivar, até 48 horas da inoculação com o patógeno / The apple is the second most economically important fruit in Brazil, and Santa Catarina State is the main producing region with 53% of the total national production. The apple production is concentrated mainly in two cultivars Gala and Fuji, wich represent around 95% of production. This concentration in a few varieties predisposes to several diseases, among them those known as "bitter rot" and "Glomerella leaf spot" (GLS), wich cause high yield losses. These diseases are caused by the attack of the fungal pathogen Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz. & Sacc., responsible for the disease on fruits and leaves of apple trees, respectively. Bitter rot and MFG are typically summer diseases, when they can cause defoliation above 75% and, consequently, dramatically reduce the production plant next year. The MFG occurs mainly in cv. Gala, while cv. Fuji is resistant to it. It is recommended several measures to control this disease in the cvs. suscetible, mostly associated with these measures to control with chemicals. The results, however, are variable and not very encouraging. The incorporation of resistance in cultivars susceptible to these and other diseases may reduce the use of fungicides in over 80%. This study aimed at to analyze the pathosystem C.gloeosporioides - M. domestica from a structural perspective, which aimed to evaluate the growth dynamics of C. gleosporioides over time up to 48 hours after inoculation of the pathogen on leaves of apple cvs. Fuji and Gala and the differences in the the leaf tissue of cvs. Fuji and Gala in response to pathogen attack by up to 48 hours after inoculations, by optical microscopy and scanning electron microscope (SEM). The work also aimed to employ methodologies associated with proteomics, to identify differences in protein expression that has the leaf tissue of cvs. Fuji and Gala in response to the attack of C. gloeosporioides, and to identify the primary structure of proteins ocurring exclusively in each treatment in each cultivar 48 hours after inoculation with the pathogen

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2013-06-26T01:08:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 315934.pdf: 2589087 bytes, checksum: a9925564c6c1faddc7533ae8dcdffda0 (MD5) / Butia eriospatha (Martius ex Drude) Beccari (Arecaceae) é uma palmeira nativa do Sul do Brasil que está sob grande pressão antrópica. A espécie encontra-se ameaçada de extinção devido à venda ilegal de plantas adultas nos mercados local e internacional, à exploração insustentável de seus frutos, à presença do gado nas áreas de ocorrência e, à degradação e redução de seu hábitat devido aos reflorestamentos com espécies exóticas. Informações sobre os níveis de diversidade genética, bem como o conhecimento da ecologia de B. eriospatha são fundamentais e devem ser utilizadas em planos de conservação. Neste contexto, o objetivo geral deste trabalho foi estabelecer estratégias de conservação a partir de informações genéticas e ecológicas de B. eriospatha. Com base em análises de DNA nuclear, utilizando-se nove marcadores microssatélites, o presente estudo avaliou o sistema reprodutivo, a diversidade e a estrutura genética de oito populações naturais de B. eriospatha (n=920) localizadas no Estado de Santa Catarina. Análise adicional em uma coleção de indivíduos de B. eriospatha (n=50) oriundos de tráfico ilegal, localizados em residências na cidade de Florianópolis/SC, foi realizada com o intuito de comparar os níveis de diversidade genética com os observados nas populações naturais. Além das análises genéticas, aspectos ecológicos como fenologia, demografia, herbivoria e predação foram também analisados em algumas das populações de B. eriospatha. Análises do sistema reprodutivo indicaram que B. eriospatha é uma espécie que se reproduz, preferencialmente, por cruzamentos (t ?m=0,96). A espécie é auto-compatível e a reprodução pode ocorrer por geitonogamia, indicando a capacidade de populações ou mesmo de indivíduos isolados sobreviver e persisitir. Os níveis de diversidade genética foram intermediários e variaram entre as populações de B. eriosptaha (HE=0,40-0,53; HO=0,22-0,51, AR=2,67-3,67). A presença de alelos raros e privativos foram observados na maioria das populações estudadas. A divergência genética entre as populações foi elevada e significativa (FST=0,16-0,25, p<0,005), indicando existirem diferenças genéticas importantes entre as populações ao longo do Estado. A presença de alelos raros e privativos e a diferenciação genética entre as populações de B. eriospatha atestam a necessidade de conservação in situ da variabilidade genética que ainda existe. Quando comparados, os níveis de diversidade genética foram maiores nos indivíduos que foram ilegalmente comercializados (HE=0,62, AR=5,11). A presença de alelos privativos e os índices de diversidade genética observados na coleção de indivíduos em Florianópolis indicam alto potencial para a coleta de sementes e uso de mudas em projetos de restauração e enriquecimento das populações naturais de B. eriospatha. Além disto, baseado em análises Bayesianas, a maior parte dos indivíduos que foram ilegalmente comercializados e plantados em Florianópolis tiveram diferente origens. Em relação a fenologia reprodutiva, a espécie floresce entre outubro e março, frutificando entre novembro e julho. No entanto, a floração e a frutificação foi sazonal entre eventos reprodutivos. As populações de B. eriospatha, exceto uma, apresentaram estrutura demográfica bimodal, constituída por plantas adultas e plântulas. Altas taxas de herbivoria foram registradas, indicando que a estrutura demográfica observada é resultado da ação do gado sobre o componente regenerante. Isto é corroborado pela ocorrência de outros estádios ontogenéticos em uma população onde o gado não está presente. Todos esses resultados, somados ao uso insustentável dos frutos e da alta taxa de predação de sementes, refletem o grau de ameaça em que se encontram as populações de B. eriospatha. Além da relevância de se considerar várias populações em ações de conservação da espécie, mapear e monitorar as populações remanescentes, combater o comércio ilegal e impedir a entrada do gado nas populações de B. eriospatha são ações imprescindíveis para evitar que, de fato, a espécie seja perdida. / Butia eriospatha (Martius ex Drude) Beccari (Arecaceae), a palm species native to southern Brazil, is under severe pressure due to anthropogenic factors. The species is threatened with extinction because of the illegal sale of adult plants in local and international markets, unsustainable exploitation of its fruit, livestock grazing in its habitat, and the reduction and degradation of its habitat due to reforestation with exotic species. Information on the genetic diversity levels, as well as ecological knowledge of B. eriospatha, are fundamental and an essential part of conservation planning for this species. Thus, the aim of this study was to establish conservation strategies from genetic and ecological information of B. eriospatha. Based on nuclear DNA analyzes using nine microsatellite markers, the present study evaluates the reproductive system, genetic diversity and structure of eight natural populations of B. eriospatha (n = 920) located in the state of Santa Catarina, Brazil. An additional analysis of a sample of illegally-trafficked B. eriospatha (n = 50) individuals, located in residences of the city of Florianópolis, Santa Catarina, was performed in order to compare levels of genetic diversity with those observed in natural populations. Along with genetic analysis, ecological information, such as phenology, demography, herbivory and predation, were also analyzed in four of the sample populations. Analysis of the reproductive system indicates that B. eriospatha is a species that reproduces primarily through out-crossing (t ?m=0.96). However, the species is self-compatible and reproduction can occur through geitonogamy, indicating the ability of populations, or even isolated individuals, to survive and persist. The levels of genetic diversity found in this study were intermediate and ranged between populations of B. eriosptaha (HE=0.40-0.53; HO=0.22-0.51, AR=2.67-3.67). Rare alleles were observed in most of the studied populations and genetic divergence among populations was high and significant (FST=0.16-0.25, p<0.005), indicating important genetic differences between populations. The presence of rare alleles and genetic differentiation among populations of B. eriospatha attests to the need for in situ conservation of the genetic variability that remains. When compared with the natural populations, the levels of genetic diversity were greater in the individuals that were illegally marketed (HE=0.62, AR=5.11). The presence of rare alleles and high rates of genetic diversity observed in the sample from Florianópolis indicates a high potential for seed collection and the use of seedlings in restoration projects and enrichment of natural populations of B. eriospatha. Moreover, based on Bayesian analysis, the illegally-purchased individuals planted in Florianópolis come from a variety of source populations. Regarding reproductive phenology, the species blooms between October and March, and fruiting occurs from November to July. However, flowering and fruiting were seasonal between observed reproductive events. All the studied natural populations of B. eriospatha, except one, showed a bimodal population structure, consisting of mature plants and seedlings. High rates of herbivory were recorded, indicating that the observed demographic structure is mainly the result of cattle grazing on the regeneration. This conclusion is supported by the occurrence of various ontogenic stages in a population where cattle are not present. Along with the unsustainable use of the fruit and high rates of seed predation, the results discussed herein reflect the level of risk facing B. eriospatha populations. Besides the necessary conservation of the species in a variety of populations, it is important to consider activities that will help prevent the loss of this species, such as mapping and monitoring the remaining populations, combating illegal trade, and preventing cattle grazing in B. eriospatha habitats.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2013-07-16T00:34:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 260989.pdf: 556735 bytes, checksum: d4e21055c33e628d5e6ec0a6b64fcd4a (MD5) / Realizou-se bioprospecção de espécies de macroalgas marinhas e plantas aquáticas com o objetivo de encontrar pelo menos um extrato eficiente para o controle da antracnose (Colletotrichum lindemuthianum) do feijoeiro. Para tanto, foram coletadas e identificadas 17 espécies de macroalgas marinhas: Acanthophora spicifera, Bostrychia sp., Bryothamnion seaforthii, Bryothamnion triquetrum, Centroceras clavulatum, Cheilosporum sagittatum, Codium isthmocladum, Codium sp., Enteromorpha sp., Enteromorpha lingulata, Gracilaria tepocensis, Hypnea spinella, Lithophyllum sp., Petalonia sp., Sargassum stenophyllum, Ulva lactuca, Ulva fasciata; e duas espécies de plantas aquáticas: Lemna sp. e Spartina juncea. Posteriormente, o material foi seco em estufa e os compostos foram extraídos em etanol e concentrados por evaporação. Os extratos foram testados in vitro, avaliando a influência sobre o índice de velocidade de crescimento micelial (IVCM) em meio de cultura, sobre a germinação de conídios e o padrão de germinação conidial (PGC) de C. lindemuthianum, em lâminas escavadas. Em ambos os testes, a concentração utilizada foi de 50 mg peso seco/ mL. Realizaram-se também testes em casa-devegetação onde os extratos foram testados por meio de pulverizações preventivas em plantas de feijoeiro cv. Uirapuru com posterior inoculação dessas plantas com uma suspensão de C. lindemuthianum (1,2x106 conídios/ mL). Para a verificação do efeito local e residual, plantas tratadas foram inoculadas 4 horas e 7 dias após o tratamento, respectivamente, e foram avaliadas as plantas inteiras. Para a verificação do efeito sistêmico, plantas tratadas foram inoculadas 7 dias após o tratamento e somente o trifólio não tratado foi avaliado. A severidade da antracnose foi avaliada aos 5 e 11 dias após inoculação. O extrato de H. spinella apresentou forte ação sobre o crescimento vegetativo de C. lindemuthianum, reduzindo o IVCM em 74% comparado à testemunha. Os extratos de Lemna sp. e S. stenophyllum inibiram a germinação de conídios de C. lindemuthianum em 100% e 99%, respectivamente. Nos testes in vivo, verificou-se que sob efeito local o extrato de B. seaforthii reduziu 35% a severidade da antracnose aos 11 d.a.i.. Embora sem apresentar efeito local, o extrato de Ulva fasciata reduziu 24% a severidade da antracnose aos 11 d.a.i. sob efeito residual e 42% a severidade da antracnose aos 5 d.a.i. sob efeito sistêmico. A indução de resistência foi considerada para explicar a redução de doença pelo extrato de Ulva fasciata. Dados de avaliações in vitro não correlacionaram com os dados obtidos nos experimentos com plantas. bioprospecting work was performed with species of marine macroalgae and aquatic plants, in order to screen at least an extract able to control the bean anthracnose. For that, it was collected and identified 17 marine macroalgae species, i.e. Acanthophora spicifera, Bostrychia sp., Bryothamnion seaforthii, Bryothamnion triquetrum, Centroceras clavulatum, Cheilosporum sagittatum, Codium isthmocladum, Codium sp., Enteromorpha sp., Enteromorpha lingulata, Gracilaria tepocensis, Hypnea spinella, Lithophyllum sp., Petalonia sp., Sargassum stenophyllum, Ulva lactuca, Ulva fasciata as well as two aquatic plant species, i.e. Lemna sp. and Spartina juncea. Thereafter, these species were dried in a chamber and, their compounds were extracted with ethanol and concentrated by solvent evaporating. The extracts were tested in vitro for evaluating the effect of them on the mycelial growth velocity index (IVCM) in culture medium and the conidial germination as well as the pattern of conidial germination (PGC) of C. lindemuthianum in well slides. The extract concentration used in both tests was always 50 mg dry wheight/ mL. Experiments were also carried out under greenhouse conditions where bean plants cv. Uirapuru were previously sprayed with the extracts and inoculated with a conidial suspension of C. lindemuthianum (1,2x106 conidia/ mL). To verify the presence of local effect and residual effect, treated plants were inoculated 4 hours and 7 days after treatment, respectively, and whole plants were evaluated. To investigate the systemic effect, treated plants were treated 7 days after treatment, but the disease was evaluated only on the non-treated uppermost three-leaflet leaf. Anthracnose severity was determined on 5th and 11th day after inoculation (dai). The extract of H. spinella presented a strong action towards the mycelial growth of C. lindemuthianum, reducing the IVCM by 74% when compared to the control. The extracts of Lemna sp. and S. stenophyllum inhibited the fungus conidial germination by 100% and 99%, respectively. In greenhouse tests the B. seaforthii revealed local effect, reducing the disease severity by 35% on the 11 dai. Although without showing local effect, the extract of Ulva fasciata reduced the anthracnose severity on the 11th dai by 24% in whole plants and on the 5th dai systemically by 42% as well. The induction of resistance was taken in consideration to explain the disease severity reduction by the extract of Ulva fasciata. In vitro data did not correlate with those obtained from greenhouse experiments.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2013-07-16T04:07:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 280813.pdf: 3093511 bytes, checksum: 11d8705d75884caa56131666c66989c4 (MD5) / No Estado de Santa Catarina, as áreas de produção de videira (Vitis vinifera L.) var. Cabernet Sauvignon, variedade de uva mais exigente em frio, concentram-se nas regiões mais altas nos municípios de Bom Retiro, São Joaquim, Lages, Painel, Campos Novos, Tangará, Videira, Iomerê, Caçador e Água Doce. A viticultura está se tornando uma importante atividade econômica para o desenvolvimento dessas regiões. Além disto, o Estado é um dos principais produtores de uva e vinho do país. Portanto, o conhecimento do efeito dos sistemas atmosféricos e sua variabilidade e das mudanças climáticas na maturação dos frutos da videira (Vitis vinifera L.) traz segurança aos produtores e investimentos no setor. Os objetivos deste estudo foram: i) identificar e caracterizar o efeito de sistemas atmosféricos nas variáveis meteorológicas e na qualidade da uva; ii) identificar o impacto das mudanças climáticas na área potencial do cultivo da videira (Vitis vinifera L.) var. Cabernet Sauvignon no Estado de Santa Catarina. Foram utilizados dados de fenologia de cinco locais (São Joaquim, Bom Retiro, Campos Novos, Videira e Água Doce), em quatro safras diferentes (entre 2005/2006 a 2008/2009). A ocorrência dos sistemas atmosféricos e a intensidade das variáveis meteorológicas foram avaliadas para o período da maturação à colheita. Três cenários do zoneamento agroclimático foram elaborados: atual, 2050 e 2070. Para a geração dos cenários 2050 e 2070 foram utilizadas as saídas do sistema integrado de modelagem climática regional PRECIS ("Providing Regional Climates for Impacts Studies"). Na elaboração do zoneamento agrícola, foram utilizados os seguintes critérios: total anual de horas de frio ? 7,2°C e data de ocorrência de última geada. Os sistemas atmosféricos que ocorrem no período da maturação à colheita da videira (Vitis vinifera L.) var. Cabernet Sauvignon podem influenciar as variáveis meteorológicas. A ocorrência de jatos subtropicais diminui o total de precipitação, quando não estão associados às frentes frias. Os sistemas atmosféricos frentes frias e cavados invertidos aumentaram as temperaturas mínimas médias nesse período fenológico. A alta pressão aumentou o número de dias com amplitude superior a 12oC. Entretanto, não haverá efeito dos sistemas atmosféricos na quantidade de sólidos solúveis totais (oBrix). A amplitude térmica aumentou com a ocorrência de sistemas de alta pressão e essa variável teve um efeito significativo nos sólidos solúveis totais (Vitis vinifera L.) var Cabernet Sauvignon (oBrix). A variabilidade da ocorrência dos principais sistemas atmosféricos durante a fase da maturação à colheita de videira (Vitis vinifera L.) var. Cabernet Sauvignon é maior entre os anos agrícolas e menor entre as regiões no Estado. Frente fria e cavado invertido, baixa pressão, cavado e jato subtropical apresentaram diferenças nas frequências de ocorrência nos anos agrícolas. Somente o jato subtropical apresentou diferenças entre as regiões estudadas. As projeções de aumento de temperatura para os cenários 2050 e 2070 no cultivo da videira (Vitis vinifera L.), no Estado de Santa Catarina, mostraram uma drástica redução da área potencial, um deslocamento da área potencial de cultivo para áreas mais frias do Estado, uma antecipação e a redução da duração do período da maturação à colheita e uma tendência de diminuição de sólidos solúveis totais nos frutos, o que impacta na qualidade dos vinhos.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2012 / Made available in DSpace on 2013-07-16T04:28:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 314952.pdf: 2334013 bytes, checksum: 58adbde5a28f3979ffd31859887bf181 (MD5) / Além de grande importância ecológica, muitas espécies da família Orchidaceae, a mais numerosa entre as angiospermas, constituem-se em importantes recursos genéticos devido ao seu valor horticultural e apelo ornamental. O desenvolvimento de protocolos de micropropagação para estas espécies é importante, pois uma maneira eficaz de conservar determinado recurso genético se dá pela sua utilização. No entanto, estes protocolos são altamente específicos e muito escassos atualmente. Estudos visando o melhoramento genético de espécies através da fixação de ganho genético bem como estudos de ordem molecular são também altamente desejáveis. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um protocolo regenerativo baseado em estruturas semelhantes a protocormos (ESP) e emprego de biorreatores de imersão temporária (BIT) para Cattleya tigrina, espécie nativa com grande potencial ornamental e atualmente pouco encontrada in situ. Também objetivou-se a realização de estudos do genoma nuclear desta e de outras espécies nativas, com o emprego da citometria de fluxo, visando relacionar aspectos citogenéticos com sua implicação na cultura de tecidos destas espécies. A técnica da camada fina de células (TCL) e o uso de explantes foliares e radiculares cultivados em meio de cultura com diferentes concentrações de fitorreguladores foram avaliados na indução de ESP em C. tigrina. Diferentes concentrações de GA3 e sacarose, além de variações físicas e de técnicas de cultivo, foram avaliadas na multiplicação e regeneração de ESP de C. tigrina. Também foi empregada a técnica da citometria de fluxo para a análise da estabilidade citogenética dos regenerantes de C. tigrina obtidos com o protocolo proposto, bem como na quantificação do conteúdo de DNA nuclear (valor C) de outras cinco espécies nativas. A indução de ESP foi nula em explantes radiculares de C. tigrina. Não houve diferença na taxa de indução entre explantes foliares íntegros ou seccionados em TCL. A indução de ESP foi superior nos meios com maiores concentrações de TDZ, apesar desta ter ocorrido mesmo na ausência completa de fitorreguladores. A desidratação das ESP previamente a inoculação resultou em maior taxa de multiplicação, sendo essa até duas vezes maior quando da utilização de BIT. A presença de GA3 no meio de cultura favoreceu o aumento do número e tamanho de brotos obtidos a partir das ESP. As concentrações de sacarose testadas se comportaram de maneira diretamente proporcional ao incremento de massa fresca, não estando esta relacionada com o número, tamanho ou diferenciação de brotos. As análises de núcleos celulares de C. tigrina e de outras 5 espécies de orquídeas permitiu a quantificação do valor C de DNA com boa precisão, além da observação de que o tecido foliar de todas as espécies avaliadas, com exceção de C. purpurata, é polissomático, existindo grupos de células com diferentes níveis de ploidia no mesmo tecido ou órgão. A análise comparativa em citometria de fluxo dos explantes utilizados na indução de ESP e dos regenerantes obtidos com o protocolo proposto mostrou que 100% dos regenerantes avaliados possuíam o dobro da ploidia do tecido dos explantes, podendo este fato estar ligado a natureza polissomática do tecido de C. tigrina, conforme é discutido.<br> / Abstract : Besides the important ecological importance, many species of the Orchidaceae family, the biggest within the Angiosperm, are also important genetic resources due to its horticultural and ornamental value. The development of micropropagation protocols for these species is important, because one efficient way to conserve a genetic resource is by its utilization. However the protocols for micropropagation os species are highly specific and still scarce. Studies focusing the genetic improvement of species through genetic gain fixation as well as molecular studies are also highly demanded. The objective of this study was to develop a regenerative protocol based on protocorm-like bodies (PLB) and the use of temporary immersion bioreactors (TIB) to Cattleya tigrina, which is an endemic species with a high ornamental value, and currently rarely found in situ. Studies of the nuclear genome o C. tigrina as well as five other native orchids were also done to relate cytogenetic aspects with their implication on tissue culture. The thin cell layer technique (TCL) and the use of different hormone concentration media were evaluated on the induction of PLB from C. tigrina leaf and root explants. Different GA3 and sucrose concentrations, as well as physical variations and different cultivation techniques, were evaluated in the multiplication and regeneration of PLB of C. tigrina. Flow cytometry was used to analyze the genetic stability of C. tigrina regenerates obtained through the proposed protocol, as well as in the quantification of the DNA C-value of other five native species. There was no PLB induction on root explants of C. tigrina. No statistical difference on the PLB induction rate between entire and TCL explants was detected. PLB induction was higher on media containing higher TDZ concentrations, although even on fitorregulator-free medium, PLB induction was observed. The previous dehydration of PLBs resulted in higher multiplication rates, and when TIB were used the multiplication rate increased 2-fold. The presence of GA3 in the culture media favored the increase on the size and number of shoots obtained from PLBs. The sucrose concentrations tested were directly related with the fresh weight increment, but not with the shoot number or size. Through flow cytometry nuclei analysis of C. tigrina and other five orchid species, it was possible to estimate the DNA C-value with high precision, and it was also possible to observe polysomaty on the leaf tissue of all analyzed species, except on C. purpurata. The flow cytometry analysis of tissue from the explants used on PLB induction and the regenerants obtained though the proposed protocol, showed that 100% of the analyzed regenerants doubled their ploidy levels in relation with the explants, been this fact possibly linked with the polysomaty observed on C. tigrina leaf tissue, as discussed.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T22:48:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 318145.pdf: 4153829 bytes, checksum: 167f80a57b6141819ca7b7e61d1a004e (MD5) Previous issue date: 2013 / Conciliar a conservação de florestas nativas e a produção agropecuária no Brasil é um desafio complexo e urgente, pautado na demanda por conservação de habitats e de biodiversidade, na redução da emissão de gases de efeito estufa por desmatamento, assim como no potencial do país em contribuir com a demanda de produção de alimentos no mundo. Esse desafio em Santa Catarina envolve uma situação-problema em que duas questões afloram - limitações ao uso direto de recursos florestais nativos por agricultores familiares e a discordância e o descumprimento dos agricultores em relação à legislação vigente. Optou-se por analisar a adequação teórica, metodológica e as implicações práticas em se enquadrar os recursos em foco à Teoria sobre os Recursos de Uso Comum. A partir disso, definiu-se como objetivo do trabalho compreender a influência de fatores físicos, sócio-econômicos e comportamentais no manejo e conservação de florestas nativas no Corredor Ecológico Chapecó - Santa Catarina. Foram utilizados métodos e ferramentas geoespaciais, em nível de paisagem e de unidade de produção, para averiguar a relação entre os fatores analisados e a conservação de florestas. Em nível de unidade de produção foram amostradas, de forma intencional, 98 unidades de produção agropecuárias (UPAs), onde foram obtidos os limites dos imóveis rurais e realizadas entrevistas junto ao agricultor responsável a partir de métodos propostos pela Teoria das Representações Sociais e do Comportamento Planejado. Encontrou-se que o relevo tem influência sobre a conservação de florestas, sendo que imóveis com relevo acidentado possuem maior percentual de sua área coberta por florestas nativas.No entanto, o relevo não é um fator determinante, estando mais associado aos sistemas de produção, e estes, por sua vez, influenciam de diferentes formas a conservação florestal. Verificou-se também que os imóveis rurais de UPAs com agricultores sem sucessores e em idade inativa possuem maior percentual de florestas nativas (31%) em relação aqueles que possuem sucessores (23%). Verificou-se que existe também influência da dependência por recursos florestais nativos para compor a renda na conservação de florestas nativas nos imóveis rurais, com maiores percentuais para os dependentes. Ao analisar a conformidade das Áreas de Preservação Permanentes (APPs) de cursos e corpos d'água, verificou-se que existe saldo negativo de florestas nos imóveis rurais e que a maior parte desses recursos estão fora das APPs. Os agricultores entrevistados acreditam que a conservação de florestas gera benefícios relacionadosà qualidade e quantidade de água, à qualidade ambiental geral, à disponibilidade de recursos para uso, para o lazer da família, dentre outros. Percebem também custos da conservação, como o pagamento de impostos de áreas improdutivas e por isso acreditam que o principal fator de estímulo à conservação seria o pagamento pelas áreas conservadas, mas também a oferta de recursos para investir na recuperação, fácil acesso para o uso das espécies nativas, recuperar com espécies úteis e orientação técnica. Os benefícios, custos e condicionantes da conservação de florestas nos imóveis rurais são percebidos de forma diferente pelos agricultores de diferentes grupos. Ao analisar as condições atuais do Corredor Ecológico Chapecó, à partir dos princípios de instituições duradouras e auto-organizadas de recursos de uso comum, verifica-se que a gestão das florestas nativas possui muitos pontos críticos, como a falta de clareza das regras, a falta de adaptação das regras às condições locais e a fraca participação dos usuários dos recursos nas tomadas de decisões. A proposta de implementação do Corredor poderá revalorizar os recursos florestais nativos como ativos ambientais e tem potencial para criar novas instituições com forte interação local <br> / Reconciling the conservation of native forests with agricultural production in Brazil is a complex and urgent challenge, whose importance relies on habitat and biodiversity conservation, reduction of greenhouse gases emissions from deforestation, as well as realizing the potential of this country to help fulfilling the global food demand. In Santa Catarina State this challenge involves a problem situation in which two issues emerge: limitations on direct use of native forest resources impose by regulations and the disagreement and noncompliance of farmers to environmental legislation. I chose to analyze the theoretical and methodological adequacy and the practical implications to fit these resources into the Commons Resource Theory. Based on this choice, I defined the objective of this study as to understand the influence of physical, socio-economic and behavioral factors on the management and conservation of native forests in the Ecological Corridor Chapecó - Santa Catarina. I used methods and geospatial tools, at the landscape and production unit level, to investigate the relationship among such factors and forest conservation. I used the intentional sample method and selected 98 agricultural production units, for which I draw the boundaries and interviewed the farmers by using the methods proposed by the Social Representations and Behavior Planned theory. The relief has influence on forest conservation; farms with steep slopes retain a higher percentage of its area covered by native forests. However, relief is not a determining factor, being more associated to production systems, which, in turn, influence in different forms the forest conservation. Results also show that a rural property with no farmer successors and with elderly farmer has a higher percentage of native forests (31%) compared to those that have successors (23%). I also found a higher percentage of forest-covered areas in properties where there is dependence on native forest resources to compose the income. By analyzing the compliance of Permanent Preservation Areas (PPAs) along streams and around bodies of water, I found that there is a negative balance of forests in rural properties and that most of forests are in fact located out side of PPAs. Farmers interviewed believe that conservation of forests generates benefits related to the quality and quantity of water, the overall environmental quality, the availability of resources to use, opportunity of recreation for the family, among others. But they also perceive the costs of conservation, such as taxes for unproductive areas, and believe that the main way to encourage conservation would be a monetary compensation for the conserved areas, as well as the allocation of resources to invest in ecosystem restoration, easing of access to the use of native species, the use of useful species in the ecosystem reclamation initiatives and the availability of technical guidance. The benefits, costs and constraints of conservation of forests in rural properties are perceived differently by different groups of farmers. By analyzing the current conditions of the Ecological Corridor Chapecó, starting with the principles of enduring and self-organized institutions of resources of common use, among the several issues critical to the management of native forests I point out: the lack of transparency in the rules, the lack of adaptation rules to local conditions, and weak participation of resource users in decision making. The implementation of the Corridor propose by the State environmental agency may revalue the native forest resources as environmental assets and has the potential to create new institutions with strong local interaction.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2013-12-05T22:57:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 317789.pdf: 3083412 bytes, checksum: af3d617b38e38b2f316a81b4f8cfc2a2 (MD5) Previous issue date: 2013 / Azospirillum spp. são bactérias Gram-negativas de vida livre que foram isoladas na rizosfera de gramíneas e cereais tanto de climas tropicais como de climas temperados. Possuem comocaracterísticas principais a capacidade de fixar o nitrogêniogasoso e produzir fitormônios. Acredita-se que ambos osprocessos são responsáveis por favorecer o crescimento das plantas. Assim, com o intuito de avaliar como esta bactéria promotora de crescimento vegetal influencia o desenvolvimentodo milho e como a planta reage à presença da mesma, foramcomparados o número de raízes laterais, o comprimento de parteaérea e raízes e a massa fresca destas, e a expressão dos genes dos receptores de etileno, dos transportadores efluxo e influxo de auxina, dos genes envolvidos no burst oxidativo, nasíntese de giberelinas e da via de sinalização MAPK emplântulas de milho (Zea mays) inoculadas e não inoculadas coma bactéria. Para isso, foram avaliadas duas variedades de milho(DKB240 e Pioneer 30F53) 1, 4, 7 e 10 dias após a inoculação(D.A.I.) com A. brasilense FP2. Além disso, o DNA bacteriano foiquantificado em plântulas inoculadas nestes tempos de coleta.Quanto às variáveis de crescimento, dentre as variedades demilho estudadas (DKB240 e Pioneer 30F53) somente foram detectadas diferenças estatísticas entre as plântulas inoculadas e não inoculadas quanto ao comprimento da parte aérea navariedade Pioneer 30F53 10 D.A.I. . Dessa forma, a partir dasamostras de milho Pioneer 30F53, foi realizada a identificação ea quantificação de DNA de Azospirillum brasilense FP2 nas amostras de milho inoculado em todos os tempos de coleta. Foi identificada a presença de DNA de A. brasilense FP2 nas amostras de milho inoculado por PCR convencional e posterior quantificação do DNA bacteriano nas amostras inoculadas foi realizada por meio de PCR em tempo real. Os dados de quantificação indicaram um aumento na quantidade de bactérias até 7 D.A.I. e uma diminuição destas na amostra 10 D.A.I..Também foram realizadas as análises de expressão gênica e foi possível detectar diferenças entre as amostras de plântulas inoculadas e não inoculadas para os transcritos avaliados(Zmaux1, Zmrboh, Zmmpk5, Zmga20ox4, Zmko1). A expressão observada para os genes envolvidos no burst oxidativo (ZmrbohAe ZmrbohB) e para o gene envolvido na cadeia transdutora de sinal (Zmmpk5) indica que existe resposta da planta à presença da bactéria, uma vez que houve aumento dos níveis de transcrito de Zmmpk5 assim como da quantidade de DNA bacteriano nas raízes das plântulas inoculadas até 7 D.A.I e ocorreu diminuição dos níveis deste transcrito e de DNA bacteriano aos 10 D.A.I. nas amostras de plântulas inoculadas, indicando que a planta responde à interação com a bactéria.<br> / Abstract : Azospirillum spp. are Gram-negative bacteria of free-living that were isolated from the rhizosphere of grasses and cereals in both tropical and temperate climates. They have as main characteristic the ability to fix the nitrogen gas and produce phytohormones. It is believed that both processes are responsible for promoting plant growth. Thus, in order to evaluate how this plant growthpromoting bacterium influences the development of maize and how this plant reacts to the presence of the same, we compared the number of lateral roots, the length of roots and shoots and the fresh weight of them, and the expression of the ethylene gene receptor, of the genes of influx and efflux auxin transporters, of the genes involved in the oxidative burst, and in the synthesis of gibberellins, and in the MAPK signaling pathway in the maize plantlets (Zea mays) inoculated and non-inoculated with the bacteria. For this, were evaluated two maize varieties (Pioneer 30F53 and DKB240) with 1, 4, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with A. brasilense FP2. In addition, bacterial DNA was quantified in inoculated plantlets at these times. As for the growth variables among the maize varieties studied (DKB240 and Pioneer 30F53), statistical differences were found between inoculated and non-inoculated plantlets on the shoot length for the variety Pioneer 30F53 10 DAI. From the samples of maize variety Pioneer 30F53, it was performed the identification and quantification of the DNA of Azospirillum brasilense FP2 from maize samples inoculated at all sampling times. We identified, by conventional PCR, the presence DNA of A. brasilense in corn samples inoculated with this bacterium and the quantification of DNA in the inoculated samples was performed by real time PCR. The data from the quantitation indicated an increase in amount of bacteria up to 7 DAI and a decrease at 10 DAI. Were also conducted analyzes of gene expression and it was possible to detect differences between the inoculated and non-inoculated plantlets for the transcripts analyzed (Zmaux1, Zmrboh, Zmmpk5, Zmga20ox4, Zmko1). The expression observed for the genes involved in the oxidative burst (ZmrbohA and ZmrbohB) and for the gene involved in the signal transduction chain (Zmmpk5) indicates that the plant responds to the presence of the bacterium, since there was a increasing both of the levels of transcripts of the gene Zmmpk5 as of the amount of bacterial DNA in the roots of the inoculated plantlets up to 7 DAI and, with 10 DAI, there was a decrease in the levels of this transcript and in the quantity of the bacterial DNA in the inoculated plantlets, indicating that the plant responds to the interaction with the bacterium.